| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,128,973 | G→A | 23.0% | D379N (GAC→AAC) | murJ → | putative lipid II flippase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,128,973 | 0 | G | A | 23.0% | 290.7 / 82.7 | 152 | D379N (GAC→AAC) | murJ | putative lipid II flippase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (66/51); new base A (18/17); total (84/68) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.99e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.39e-01 | |||||||||||
Only 100 of 156 total aligned reads displayed.
GATGCGCTGATGACCCAGCGGGCGTTAATTGCCTACTCGGTGGGTTTGATTGGCCTGATTGTAGTGAAAGTGTTGGCTCCTGGCTTTTATTCCCGCCAGGACATTAAAACGCCAGTGAAAATTGCCATCGTTACGCTGATTTTAACGCAATTGATGAACCTGGCGTTTATTGGTCCGTTGAAACATGCCGGGCTGTCAC > NC_000913/1128874‑1129072 | aTGCGCTGATGACCCAGCGGGCGTTAATTGCCTACTCGGTGGGTTTGATTGGCCTGATTGTAGTGAAAGTGTTGGCTCCTGGCTTTTATTCCCGCCAGGa > 2:2220577/1‑100 (MQ=255) aTGCGCTGATGACCCAGCGGGCGTTAATTGCCTACTCGGTGGGTTTGATTGGCCTGATTGTAGTGAAAGTGTTGGCTCCTGGCTTTTATTCCCGCCAGGa > 1:819466/1‑100 (MQ=255) tGCGCTGATGACCCAGCGGGCGTTAATTGCCTACTCGGTGGGTTTGATTGGCCTGATTGTAGTGAAAGTGTTGGCTCCTGGCTTTTATTCCCGCCAGGAc < 2:333565/100‑1 (MQ=255) tGCGCTGATGACCCAGCGGGCGTTAATTGCCTACTCGGTGGGTTTGATTGGCCTGATTGTAGTGAAAGTGTTGGCTCCTGGCTTTTATTCCCGCCAGGAc > 1:2425381/1‑100 (MQ=255) gcTGATGACCCAGCGGGCGTTAATTGCCTACTCGGTGGGTTTGATTGGCCTGATTGTAGTGAAAGTGTTGGCTCCTGGCTTTTATTCCAGCCAGGACAtt > 1:4081196/1‑100 (MQ=255) cTGATGACCCAGCGGGCGTTAATTGCCTACTCGGTGGGTTTGATTGGCCTGATTGTAGTGAAAGTGTTGGCTCCTGGCTTTTATTCCCGCCAGGACATTa < 2:3489937/100‑1 (MQ=255) tgatgaCCCAGCGGGCGTTAATTGCCTACTCGGTGGGTTTGATTGGCCTGGTTGTAGTGAAAGTGTTGGCTCCTGGCTTTTCTTCCCGCCAGGACATTa > 1:1905983/1‑99 (MQ=255) tgaCCCAGCGGGCGTTAATTGCCTCCTCGGTGGGGTTGCTTGGCCTGCTCGTCGTGAAAGCGTTGGCTCCCGGCATTTATTCCCGCCCGGACATCaaaa > 1:1013146/1‑99 (MQ=255) aCCCAGCGGGCGTTAATTGCCTACTCGGTGGGTTTGATTGGCCTGATTGTAGTGAAAGTGTTGGCTCCTGGCTTTTATTCCCGCCAGAACATTAAAACGc > 1:2004040/1‑100 (MQ=255) cccAGCGGGCGTTAATTGCCTACTCGGTGGGTTTGATTGGCCTGATTGTAGTGAAAGTGTTGGCTCCTGGCTTTTATTCCCGCCAGGACATTAAAACGcc > 2:799716/1‑100 (MQ=255) cccAGCGGGCGTTAATTGCCTACTCGGTGGGTTTGATTGGCCTGATTGTAGTGAAAGTGTTGGCTCCTGGCTTTTATTCCCGCCAGAACATTAAAACGcc > 2:776902/1‑100 (MQ=255) aGCGGGCGTTAATTGCCTACTCGGTGGGTTTGATTGGCCTGATTGTAGTGAAAGTGTTGGCTCCTGGCTTTTATTCCCGCCAGAACATTAAAACGCCAGt > 1:4104097/1‑100 (MQ=255) gggCGTTAATTGCCTACTCGGTGGGTTTGATTGGCCTGATTGTAGTGAAAGTGTTGGCTCCTGGCTTTTATTCCCGCCAGGACATTAAAACGCCAGTGaa > 1:4108554/1‑100 (MQ=255) gCGTTAATTGCCTACTCGGTGGGTTTGATTGGCCTGATTGTAGTGAAAGTGTTGGCTCCTGGCTTTTATTCCCGCCAGGACATTAAAACGCCAGTGaaaa < 2:4040594/100‑1 (MQ=255) cGTTAATTGCCTACTCGGTGGGTTTGATTGGCCTGATTGTAGTGAAAGTGTTGGCTCCTGGCTTTTATTCCCGCCAGGACATTAAAACGCCAGTGAAAAt > 1:630555/1‑100 (MQ=255) tgaTTGCCTACTCGGTGGGTTTGATTGGCCTGATTGTAGTGAAAGTGTTGGCTCCTGGCTTTTATTCCCGCCAGGACATTAAAACGCCAGTGAAAATTGc < 2:1207963/98‑1 (MQ=255) tAATTGCCTACTCGGTGGGTTTGATTGGCCTGATTGTAGTGAAAGTGTTGGCTCCTGGCTTTTATTCCCGCCAGGACATTAAAACGCCAGTGAAAATTg > 1:459616/1‑99 (MQ=255) tAATTGCCTACTCGGTGGGTTTGATTGGCCTGATTGTAGTGAAAGTGTTGGCTCCTGGCTTTTATTCCCGCCAGGACATTAAAACGCCAGTGAAAATTGc < 2:2920160/100‑1 (MQ=255) tAATTGCCTACTCGGTGGGTTTGATTGGCCTGATTGTAGTGAAAGTGTTGGCTCCTGGCTTTTATTCCCGCCAGGACATTAAAACGCCAGTGAAAATTGc < 1:3809371/100‑1 (MQ=255) aaTTGCCTACTCGGTGGGTTTGATTGGCCTGATTGTAGTGAAAGTGTTGGCTCCTGGCTTTTATTCCCGCCAGGACATTAAAACGCCAGTGAAAATTGcc < 1:1097068/100‑1 (MQ=255) tGCCTACTCGGTGGGTTTGATTGGCCTGATTGTAGTGAAAGTGTTGGCTCCTGGCTTTTATTCCCGCCAGGACATTAAAACGCCAGTGAAAATTGCCATc > 2:1438121/1‑100 (MQ=255) tGCCTACTCGGTGGGTTTGATTGGCCTGATTGTAGTGAAAGTGTTGGCTCCTGGCTTTTATTCCCGCCAGGACATTAAAACGCCAGTGAAAATTGCCATc > 2:578022/1‑100 (MQ=255) tGCCTACTCGGTGGGTTTGATTGGCCTGATTGTAGTGAAAGTGTTGGCTCCTGGCTTTTATTCCCGCCAGAACATTAAATCGCCAGTGAAAATTGCCATc < 1:2601575/100‑1 (MQ=255) ccTACTCGGTGGGTTTGATTGGCCTGATTGTAGTGAAAGTGTTGGCTCCTGGCTTTTATTCCCGCCAGAACATTAAAACGCCAGTGAAAATTGCCATCGt < 1:1340863/100‑1 (MQ=255) tCGGTGGGTTTGATTGGCCTGATTGTAGTGAAAGTGTTGGCTCCTGGCTTTTATTCCCGCCAGGACATTAAAACGCCAGTGAAAATTGCCATCGTTACGc > 1:1304108/1‑100 (MQ=255) tCGGTGGGTTTGATTGGCCTGATTGTAGTGAAAGTGTTGGCTCCTGGCTTTTATTCCCGCCAGAACATTAAAACGCCAGTGAAAATTGCCATCGTTACGc < 2:1751107/100‑1 (MQ=255) cGGTGGGTTTGGTTGGACTGATTGTAGTGAAAGTGTTGGCTCCTGGCTTTTATTCCCGCCAGAACATTAAAACGCCAGTGAAAATTGCCATCGTTACGCt > 1:3134418/1‑100 (MQ=255) cGGTGGGTTTGATTGGCCTGATTGTAGTGAAAGTGTTGGCTCCTGGCTTTTATTCCCGCCAGAACATTAAAACGCCAGTGAAAATTGCCATCGTTACGCt < 1:639818/100‑1 (MQ=255) tGGGTTTGATTGGCCTGATTGTAGTGAAAGTGTTGGCTCCTGGCTTTTATTCCCGCCAGGACATTAAAACGCCAGTGAAAATTGCCATCGTTACGCTGAt < 1:3085667/100‑1 (MQ=255) tGGGTTTGATTGGCCTGATTGTAGTGAAAGTGTTGGCTCCTGGCTTTTATTCCCGCCAGAACATTAAAACGCCAGTGAAAATTGCCATCGTTACGCTGAt < 2:1637801/100‑1 (MQ=255) ggTTTGATTGGCCTGATTGTAGTGAAAGTGTTGGCTCCTGGCTTTTATTCCCGCCAGGACATTAAAACGCCAGTGAAAATTGCCATCGTTACGCTGAttt > 2:1096485/1‑100 (MQ=255) ggTTTGATTGGCCTGATTGTAGTGAAAGTGTTGGCTCCTGGCTTTTATTCCCGCCAGGACATTAAAACGCCAGTGAAAATTGCCATCGTTACGCTGAttt < 1:435561/100‑1 (MQ=255) gTTTGATTGGCCTGATTGTAGTGAAAGTGTTGGCTCCTGGCTTTTATTCCCGCCAGGACATTAAAACGCCAGTGAAAATTGCCATCGTTACGCTGAtttt > 1:271001/1‑100 (MQ=255) gTTTGATTGGCCTGATTGTAGTGAAAGTGTTGGCTCCTGGCTTTTATTCCCGCCAGGACATTAAAACGCCAGTGAAAATTGCCATCGTTACGCTGAtttt > 2:2779045/1‑100 (MQ=255) gTTTGATTGGCCTGATTGTAGTGAAAGTGTTGGCTCCTGGCTTTTATTCCCGCCAGGACATTAAAACGCCAGTGAAAATTGCCATCGTTACGCTGAtttt > 2:2082630/1‑100 (MQ=255) gTTTGATTGGCCTGATTGTAGTGAAAGTGTTGGCTCCTGGCTTTTATTCCCGCCAGAACATTAAAACGCCAGTGAAAATTGCCATCGTTACGCTGAtttt > 1:790550/1‑100 (MQ=255) gTTTGATTGGCCTGATTGTAGTGAAAGTGTTGGCTCCTGGCTTTTATGACTGCAAGAACATTAAAGAGACAGTGAAAATTGCCATCGTTACGCTGa > 1:1552221/1‑96 (MQ=255) ttGATTGGCCTGATTGTAGTGAAAGTGTTGGCTCCTGGCTTTTATTCCCGCCAGAACATTAAAACGCCAGTGAAAATTGCCATCGTTACGCTGATTTTaa > 1:1688182/1‑100 (MQ=255) tGATTGGCCTGATTGTAGTGAAAGTGTTGGCTCCTGGCTTTTATTCCCGCCAGGACATTAAAACGCCCGTGAAAATTGCCATCGTTACGCTGATTTTAAc > 1:1008558/1‑100 (MQ=255) gATTGGCCTGATTGTAGTGAAAGTGTTGGCTCCTGGCTTTTATTCCCGCCAGGACATTAAAACGCCAGTGAAAATTGCCATCGTTACGCTGATTTTAACg < 2:1240794/100‑1 (MQ=255) aTTGGCCTGATTGTAGTGAAAGTGTTGGCTCCTGGCTTTTATTCCCGCCAGGACATTAAAACGCCAGTGAAAATTGCCATCGTTACGCTGATTTTAACGc < 2:3955683/100‑1 (MQ=255) tGGCCTGATTGTAGTGAAAGTGTGGGCTCCTGGCTTTTATTCCCGCCAGGACATTAAAACGCCAGTGAAAATTGCCAGCGTTACGCTGATTTTAACGCa < 1:3554820/99‑1 (MQ=255) ggCCTGATTGTAGTGAAAGTGTTGGCTCCTGGCTTTTATTCCCGCCAGGACATTAAAACGCCAGTGAAAATTGCCATCGTTACGCTGATTTTAACGCaa > 2:2289834/1‑99 (MQ=255) ggCCTGATTGTAGTGAAAGTGTTGGCTCCTGGCTTTTATTCCCGCCAGGACATTAAAACGCCAGTGAAAATTGCCATCGTTACGCTGATTTTAACGCAAt > 1:2837085/1‑100 (MQ=255) gCCTGATTGTAGTGAAAGTGTTGGCTCCTGGCTTTTATTCCCGCCAGGACATTAAAACGCCAGTGAAAATTGCCATCGTTACGCTGATTTTAACGCaa > 1:2964436/1‑98 (MQ=255) gCCTGATTGTAGTGAAAGTGTTGGCTCCTGGCTTTTATTCCCGCCAGGACATTAAAACGCCAGTGAAAATTGCCATCGTTACGCTGATTTTAACGCAAtt < 2:4081218/100‑1 (MQ=255) gCCTGATTGTAGTGAAAGTGTTGGCTCCTGGCTTTTATTCCCGCCAGAACATTAAAACGCCAGTGAAAATTGCCATCGTTACGCTGATTTTAACGCaa > 1:406063/1‑98 (MQ=255) ccTGATTGTAGTGAAAGTGTTGGCTCCTGGCTTTTATTCCCGCCAGGACATTAAAACGCCAGTGAAAATTGCCATCGTTACGCTGATTTTAACGCAATtg > 1:2702946/1‑100 (MQ=255) tGATTGTAGTGAAAGTGTTGGCTCCTGGCTTTTATTCCCGCCAGGACATTAAAACGCCAGTGAAAATTGCCATCGTTACGCTGATTTTAACGCAATtgat < 2:2530001/100‑1 (MQ=255) tGATTGTAGTGAAAGTGTTGGCTCCTGGCTTTTATTCCCGCCAGAACATTAAAACGCCAGTGAAAATTGCCATCGTTACGCTGATTTTAACGCAATtgat < 2:10378/100‑1 (MQ=255) ttccgatctGAAAGTGTTGGCTCCTGGCTTTTATTCCCGCCAGGACATTAAAACGCCAGTGAAAATTGCCATCGTTACGCTGATTTTAACGCAATtgatg < 1:2196363/92‑1 (MQ=255) aTTGTAGTGAAAGTGTTGGCTCCTGGCTTTTATTCCCGCCAGGACATTAAAACGCCAGTGAAAATTGCCATCGTTACGCTGATTTTAACGCAATtgatga < 2:253435/100‑1 (MQ=255) tttAGTGTAAGTGTTGGCTCCTTGCTTTTATTCCCGCCAGGACATTAAAACGCCAGTGAAAATTGCCATCGTTACGCTGATTTTAACGCAATTGATGaa < 1:1276187/97‑1 (MQ=255) gTAGTGAAAGTGTTGGCTCCTGGCGTTTATTCCAGCCAGGACATTAAAGCGGCCGTGACAATTGCCATCGTTACGCTCATCTTAACGCAATtgatg > 1:3069864/1‑96 (MQ=255) tAGTGAAAGTGTTGGCTCCTGGCTTTTATTCCCGCCAGGACATTAAAACGCCAGTGAAAATTGCCATCGTTACGCTGATTTTAACGCAATTGATGAACCt > 1:1878022/1‑100 (MQ=255) tAGTGAAAGTGTTGGCTCCTGGCTTTTATTCCCGCCAGGACATTAAAACGCCAGTGAAAATTGCCATCGTTACGCTGATTTTAACGCAATTGATGAACCt > 1:2814886/1‑100 (MQ=255) aGTGAAAGTGTTGGCTCCTGGCTTTTATTCCCGCCAGGACATTAAAACGCCAGTGAAAATTGCCATCGTTACGCTGATTTTAACGCAATTGATGAACCTg > 2:377096/1‑100 (MQ=255) aGTGAAAGTGTTGGCTCCTGGCTTTTATTCCCGCCAGGACATTAAAACGCCAGTGAAAATTGCCATCGTTACGCTGATTTTAACGCAATTGATGAACCTg < 1:3818791/100‑1 (MQ=255) gTGAAAGTGTTGGCTCCTGGCTTTTATTCCCGCCAGGACATTAAAACGCCAGTGAAAATTGCCATCGTTACGCTGATTTTAACGCAATTGATGAACCTgg > 2:332385/1‑100 (MQ=255) gTGAAAGTGTTGGCTCCTGGCTTTTATTCCCGCCAGGACATTAAAACGCCAGTGAAAATTGCCATCGTTACGCTGATTTTAACGCAATTGATGAACCTgg > 1:1549418/1‑100 (MQ=255) gTGAAAGTGTTGGCTCCTGGCTTTTATTCCCGCCAGGACATTAAAACGCCAGTGAAAATTGCCATCGTTACGCTGATTTTAACGCAATTGATGAACCTgg > 2:82087/1‑100 (MQ=255) tGAAAGTGTTGGCTCCTGGCTTTTATTCCCGCCAGAACATTAAAACGCCAGTGAAAATTGCCATCGTTACGCTGATTTTAACGCAATTGATGAACCTGGc < 2:3154185/100‑1 (MQ=255) tGAAAGTGTTGGCTCCTGGCTTTTATTCCCGCCAGAACATTAAAACGCCAGTGAAAATTGCCATCGTTACGCTGATTTTAACGCAATTGATGAACCTGGc > 1:3700071/1‑100 (MQ=255) gAAAGTGTTGGCTCCTGGCTTTTATTCCCGCCAGGACATTAAAACGCCAGTGAAAATTGCCATCGTTACGCTGATTTTAACGCAATtgatgagatcggaa > 2:2196369/1‑92 (MQ=255) gAAAGTGTTGGCTCCTGGCTTTTATTCCCGCCAGGACATTAAAACGCCAGTGAAAATTGCCATCGTTACGCTGATTTTAACGCAATTGATGAACCTGGCg > 2:1661384/1‑100 (MQ=255) aGTGTTGGCTCCTGGCTTTTATTCCCGCCAGGACATTAAAACGCCAGTGAAAATTGCCATCGTTACGCTGATTTTAACGCAATTGATGAACCTGGCGttt > 2:2562744/1‑100 (MQ=255) gtTGGCTCCTGGCTTTTATTCCCGCCAGGACATTAAAACGCCAGTGAAAATTGCCATCGTTACGCTGATTTTAACGCAATTGATGAACCTGGCGTTTAtt < 2:1264976/100‑1 (MQ=255) gtTGGCTCCTGGCTTTTATTCCCGCCAGAACATTAAAACGCCAGTGAAAATTGCCATCGTTACGCTGATTTTAACGCAATTGATGAACCTGGCGTTTAtt > 2:2357433/1‑100 (MQ=255) ttGGCTCCTGGCTTTTATTCCCGCCAGGACATTAAAACGCCAGTGAAAATTGCCATCGTTACGCTGATTTTAACGCAATTGATGAACCTGGCGTTTATTg < 2:1060192/100‑1 (MQ=255) tGGCTCCTGGCTTTTATTCCCGCCAGGACATTAAAACGCCAGTGAAAATTGCCATCGTTACGCTGATTTTAACGCAATTGATGAACCTGGCGTTTATTgg > 1:604586/1‑100 (MQ=255) ggCTCCTGGCTTTTATTCCCGCCAGAACATTAAAACGCCAGTGAAAATTGCCATCGTTACGCTGATTTTAACGCAATTGATGAACCTGGCGTTTATTGGt > 2:1945638/1‑100 (MQ=255) cTCCTGGCTTTTATTCCCGCTAGGACATTAAAACGCCAGTGAAAATTGCCATCGTTACGCTGATTTTAACGCAATTGATGAACCTGGCGTTTATTGGTcc > 2:1933151/1‑100 (MQ=255) tCCTGGCTTTTATTCCCGCCAGGACATTAAAACGCCAGTGAAAATTGCCATCGTTACGCTGATTTTAACGCAATTGATGAACCTGGCGTTTATTGGTCCg > 2:1286824/1‑100 (MQ=255) tGGCTTTTATTCCCGCCAGGACATTAAAACGCCAGTGAATATTGCCATCGTTACGCTGATTTCAACGCAATTGATGAACCTGGCGTTTATTGGTCCGTTg < 1:2281977/100‑1 (MQ=255) ggCTTTTATTCCCGCCAGGACATTAAATCGCCAGTGAAAATTGCCATCGTTACGCTGATTTTAACGCAATTGATGAACCTGGCGTTTATTGGTCCGTTGa < 1:2274831/100‑1 (MQ=255) gCTTTTATTCCCGCCAGGACATTAAAACGCCAGTGAAAATTGCCATCGTTACGCTGATTTTAACGCAATTGATGAACCTGGCGTTTATTGGTCCGTTGaa < 2:1433760/100‑1 (MQ=255) gCTGTTATTCCCGCTAGACCATTAAAACGCCAGTGAAAATTGGCATCTGTACTCTGAGTTGATCGCAATTGATCAACCTGGCGTTTATTGGTCCGTTGaa < 1:68676/100‑1 (MQ=255) cTTTTATTCCCGCCAGAACATTAAAACGCCAGTGAAAATTGCCATCGTTACGCTGATTTTAACGCAATTGATGAACCTGGCGTTTATTGGTCCGTTGaaa > 2:1574332/1‑100 (MQ=255) ttttATTCCCGCCAGGACATTAAAACGCCAGTGAAAATTGCCATCGTTACGCTGATTTTAACGCAATTGATGAACCTGGCGTTTATTGGTCCGTTGAAAc < 1:216558/100‑1 (MQ=255) ttttATTCCCGCCAGGACATTAAAACGCCAGTGAAAATTGCCATCGTTACGCTGATTTTAACGCAATTGATGAACCTGGCGTTTATTGGTCCGTTGAAAc < 1:2198508/100‑1 (MQ=255) ttttATTCCCGCCAGGACATTAAAACGCCAGTGAAAATTGCCATCGTTACGCTGATTTTAACGCAATTGATGAACCTGGCGTTTATTGGTCCGTTGAAAc < 2:2922642/100‑1 (MQ=255) ttttATTCCCGCCAGAACATTAAAACGCCAGTGAAAATTGCCATCGTTACGCTGATTTTAACGCAATTGATGAACCTGGCGTTTATTGGTCCGTTGAAAc > 2:2386136/1‑100 (MQ=255) atctCCCGCCAGGACATTAAAACGCCAGTGAAAATTGCCATCGTTACGCTGATTTTAACGCAATTGATGAACCTGGCGTTTATTGGTCCGTTGAAACATg < 1:3547502/97‑1 (MQ=255) aTTCCCGCCAGGACATTAAAACGCCAGTGAAAATTGCCATCGTTACGCTGATTTTAACGCAATTGATGAACCTGGCGTTTATTGGTCCGTTGAAACATg > 2:1646928/1‑99 (MQ=255) ttCCCGCCAGGACATTAAAACGCCAGTGAAAATTGCCATCGTTACGCTGATTTTAACGCAATTGATGAACCTGGCGTTTATTGGTCCGTTGAAACATGcc > 1:2508737/1‑100 (MQ=255) ttCCCGCCAGGACATTAAAACGCCAGTGAAAATTGCCATCGTTACGCTGATTTTAACGCAATTGATGAACCTGGCGTTTATTGGTCCGTTGAAACATGcc > 2:1198648/1‑100 (MQ=255) tCCCGCCAGGACATTAAAACGCCAGTGAAAATTGCCATCGTTACGCTGATTTTAACGCAATTGATGAACCTGGCGTTTATTGGTCCGTTGAAACATGCCg > 1:833178/1‑100 (MQ=255) tCCCGCCAGGACATTAAAACGCCAGTGAAAATTGCCATCGTTACGCTGATTTTAACGCAATTGATGAACCTGGCATTTATTGGTCCGTTGAAACATGCCg > 2:1500267/1‑100 (MQ=255) cccGCCAGGACATTAAATCGCCAGTGAAAATTGCCATCGTTACGCTGATTTTAACGCAATTGATGAACCTGGCGTTTATTGGTCCGTTGAAACATGCCgg < 1:3188310/100‑1 (MQ=255) cccGCCAGGACATTAAAACGCCAGTGAAAATTGCCATCGTTACGCTGATTTTGACGCAATTGATGAACCTGGCGTTTATTGGTCCGTTGAAACATGCCgg > 1:93605/1‑100 (MQ=255) cccGCCAGGACATTAAAACGCCAGTGAAAATTGCCATCGTTACGCTGATTTTAACGCAATTGATGAACCTGGCGTTTATTGGTCCGTTGAAACATgagat > 2:3547515/1‑96 (MQ=255) cccGCCAGGACATTAAAACGCCAGTGAAAATTGCCATCGTTACGCTGATTTTAACGCAATTGATGAACCTGGCGTTTATTGGTCCGTTGAAACATGCCgg > 2:2128556/1‑100 (MQ=255) cccGCCAGGACATTAAAACGCCAGTGAAAATTGCCATCGTTACGCTGATTTTAACGCAATTGATGAACCTGGCGTTTATTGGTCCGTTGAAACATGCCgg < 2:604588/100‑1 (MQ=255) cccGCCAGGACATTAAAACGCCAGTGAAAATTGCCATCGTTACGCTGATTTTAACGCAATTGATGAACCTGGCGTTTATTGGTCCGTTGAAACATGCCgg < 1:328150/100‑1 (MQ=255) cGCCAGGACATTAAAACGCCAGTGAAAATTGCCATCGTTACGCTGATTTTAACGCAATTGATGAACCTGGCGTTTATTGGTCCGTTGAAACATGCCGGGc > 2:1028575/1‑100 (MQ=255) gCCAGGACATTAAAACGCCAGTGAAAATTGCCATCGTTACGCTGATTTTAACGCAATTGATGAACCTGGCGTTTATTGGTCCGTTGAAACATGCCGGGc < 1:3383197/99‑1 (MQ=255) gCCAGGACATTAAAACGCCAGTGAAAATTGCCATCGTTACGCTGATTTTAACGCAATTGATGAACCTGGCGTTTATTGGTCCGTTGAAACATGCCGGGCt < 2:3763905/100‑1 (MQ=255) ggACATTAAAACGCCAGTGAAAATTGCCATCGTTACGCTGATTTTAACGCAATTGATGAACCTGGCGTTTATTGGTCCGTTGAAACATGCCGGGCTGTCa > 2:56864/1‑100 (MQ=255) gACATTAAAACGCCAGTGAAAATTGCCATCGTTACGCTGATTTTGACGCAATTGATGAACCTGGCGTTTATTGGTCCGTTGAAACATGCCGGGCTGTCAc < 2:93605/100‑1 (MQ=255) gACATTAAAACGCCAGTGAAAATTGCCATCGTTACGCTGATTTTAACGCAATTGATGAACCTGGCGTTTATTGGTCCGTTGAAACATGCCGGGCTGTCAc > 2:1691518/1‑100 (MQ=255) | GATGCGCTGATGACCCAGCGGGCGTTAATTGCCTACTCGGTGGGTTTGATTGGCCTGATTGTAGTGAAAGTGTTGGCTCCTGGCTTTTATTCCCGCCAGGACATTAAAACGCCAGTGAAAATTGCCATCGTTACGCTGATTTTAACGCAATTGATGAACCTGGCGTTTATTGGTCCGTTGAAACATGCCGGGCTGTCAC > NC_000913/1128874‑1129072 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |