| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,515,267 | A→T | 34.8% | D169V (GAT→GTT) | ydcV → | putative ABC transporter permease |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,515,267 | 0 | A | T | 34.8% | 182.1 / 154.9 | 167 | D169V (GAT→GTT) | ydcV | putative ABC transporter permease |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (51/56); new base T (37/20); total (89/78) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.81e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 169 total aligned reads displayed.
TCGTGGTCGGTCATGCGACTTTTTGTGTAGTTGTGGTGTTTAACAATGTCATCGCCCGTTTTCGCCGCACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGATCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGGCGTTACTGGCAGGAGGAATGCTGGCGTTTGCCTTGTCGTT > NC_000913/1515168‑1515366 | tCGTGGTCGGTCATGCGACTTTTTGTGTAGTTGTGGTGTTTAACAATGTCATCGCCCGTTTTCGCCGCACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGa < 2:4042108/100‑1 (MQ=255) gtcggtcATGCGACTTTTTGTGTAGTTGTGGTGTTTAACAATGTCATCGCCCGTTTTCGCCGCACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGTTCtt > 1:3929468/1‑99 (MQ=255) cggtcATGCGACTTTTTGTGTAGTTGTGGTGTTTAACAATGTCATCGCCCGTTTTCGCCGCACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGATCTTggg < 2:2355704/100‑1 (MQ=255) cggtcATGCGACTTTTTGTGTAGTTGTGGTGTTTAACAATGTCATCGCCCGTTTTCGCCGCACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGATCTTggg < 1:2267815/100‑1 (MQ=255) cggtcATGCGACTTTTTGTGTAGTTGTGGTGTTTAACAATGTCATCGCCCGTTTTCGCCGCACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGATCTTggg < 1:152532/100‑1 (MQ=255) ggtcATGCGACTTTTTGTGTAGTTGTGGTGTTTAACAATGTCATCGCCCGTTTTCGCCGCACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGATCTTgggg < 1:4053114/100‑1 (MQ=255) gtcATGCGACTTTTTTTGTAGTTGTGGTGTTTAACAATGTCATCGCCCGGTTTCGCCGCACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGGCGACAATGGATCTTGGGGc > 1:2489055/1‑100 (MQ=255) gtcATGCGACTTTTTGTGTAGTTGTGGTGTTTAACAATGTCATCGCCCGTTTTCGCCGCACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGATCTTGGGGc < 1:3415640/100‑1 (MQ=255) tGCGACTTTTTGTGTAGTTGTGGTGTTTAACAATGTCATCGCCCGTTTTCGCCGCACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGTTCTTGGGGCCAAt < 1:3099816/100‑1 (MQ=255) gCGACTTTTTGTGTAGTTGTGGTGTTTAACAATGTCATCGCCCGTTTTCGCCGCACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGATCTTGGGGCCAAtg > 1:1145353/1‑100 (MQ=255) gCGACTTTTTGTGTAGTTGTGGTGTTTAACAATGTCATCGCCCGTTTTCGCCGCACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGATCTTGGGGCCAAtg > 1:1037701/1‑100 (MQ=255) cGACTTTTTGTGTAGTTGTGGTGTTTAACAATGTCATCGCCCGTTTTCGCCGCACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGTTCTTGGGGCCAAtgg > 2:367050/1‑100 (MQ=255) gACTTTTTGTGTAGTTGTGGTGTTTAACAATGTCATCGCCCGTTTTCGCCGCACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGTTCTTGGGGCCAAtg > 1:1712467/1‑98 (MQ=255) tttttGTGTAGTTGTGGTGTTTAACAATGTCATCGCCCGTTTTCGCCGCACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGATCTTGGGGCCAAtggctgg > 2:949451/1‑100 (MQ=255) tttttGTGTAGTTGTGGTGTTTAACAATGTCATCGCCCGTTTTCGCCGCACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGATCTTGGGGCCAAtggctgg > 2:3096690/1‑100 (MQ=255) ttttGTGTAGTTGTGGTGTTTAACAATGTCATCGCCCGTTTTCGCCGCACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGTTCTTGGGGCCAAtggctggc < 1:2206269/100‑1 (MQ=255) tgtgtgTAGTTGTGGTGTTGAACAATGTCATCGCCCGTTTTCGCCGGACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGGTCTTGGGGCCAAtggctg < 1:1471361/95‑1 (MQ=255) gtgtAGTTGTGGTGTTTAACAATGTCATCGCCCGTTTTCGCCGCACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGTTCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAAc > 2:1435244/1‑100 (MQ=255) gtgtAGTTGTGGTGTTTAACAATGTCATCGCCCGTTTTCGCCGCACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGATCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAAc > 1:851886/1‑100 (MQ=255) tgtAGTTGTGGTGTTTAACAATGTCATCGCCCGTTTTCGCCGCACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGATCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAAcc > 1:3580440/1‑100 (MQ=255) aGTTGTGGTGTTTAACAATGTCATCGCCCGTTTTCGCCGCACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGATCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTc > 2:3975922/1‑100 (MQ=255) gTTGTGGTGTTTAACAATGTCATCGCCCGTTTTCGCCGCACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGATCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTcc < 2:3110169/100‑1 (MQ=255) tgtgGTGTTTAACAATGTCATCGCCCGTTTTCGCCGCACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGATCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGc < 1:1246219/100‑1 (MQ=255) tgtgGTGTTTAACAATGTCATCGCCCGTTTTCGCCGCACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGATCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGc > 2:4000654/1‑100 (MQ=255) gtggtgTTTAACAATGTCATCGCCCGTTTTCGCCGCACCTCCTGGAGTCGGGTTGAGGCGTCAATGGATCTTGGGCCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCt > 2:2816476/1‑100 (MQ=255) ggtgTTTAACAATGTCATCGCCCGTTTTCGCCGCACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGTTCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTAc > 2:3113000/1‑100 (MQ=255) ggtgTTTAACAATGTCATCGCCCGTTTTCGCCGCACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGTTCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTAc > 1:789786/1‑100 (MQ=255) ggtgTTTAACAATGTCATCGCCCGTTTTCGCCGCACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGTTCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTAc > 2:4150658/1‑100 (MQ=255) ggtgTTTAACAATGTCATCGCCCGTTTTCGCCGCACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGTTCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTAc > 1:3025918/1‑100 (MQ=255) ggtgTTTAACAATGTCATCGCCCGTTTTCGCCGCACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGTTCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTAc > 2:659140/1‑100 (MQ=255) gtgtTTAACAATGTCATCGCCCGTTTTCGCCGCACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGATCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACg > 1:3045663/1‑100 (MQ=255) tgtTTAACAATGTCATCGCCCGTTTTCGCCGCACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGATCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACg < 1:3150226/99‑1 (MQ=255) tgtTTAACAATGTCATCGCCCGTTTTCGCCGCACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGATCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGt < 2:1145356/100‑1 (MQ=255) gtTTAACAATGTCATCGCCCGTTTTCGCCGCACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGTTCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTa > 2:3742704/1‑100 (MQ=255) gtTTAACAATGTCATCGCCCGTTTTCGCCGCACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGTTCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTa > 2:4222979/1‑100 (MQ=255) gtTTAACAATGTCATCGCCCGTTTTCGCCGCACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGATCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTa > 2:3021022/1‑100 (MQ=255) ttAACAATGTCATCGCCCGTTTTCGCCGCACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGATCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTTCGCTACGTAgt > 2:3722167/1‑100 (MQ=255) ttAACAATGTCATCGCCCGTTTTCGCCGCACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGATCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAgt > 2:4009476/1‑100 (MQ=255) ttAACAATGTCATCGCCCGTTTTCGCCGCACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGATCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAgt < 1:2603702/100‑1 (MQ=255) ttAACAATGTCATCGCCCGTTTTCGCCGCACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGATCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAgt > 1:106139/1‑100 (MQ=255) aCAATGTCATCGCCCGTTTTCGCCGCACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGATCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGtt < 2:326413/100‑1 (MQ=255) aTGTCATCGCCCGTTTTCGCCGCACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGTTCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGcc > 2:3867621/1‑100 (MQ=255) cATCGCCCGTTTTCGCCGCACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGTTCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAAt > 1:3295054/1‑100 (MQ=255) cATCGCCCGTTTTCGCCGCACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGTTCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAAt > 2:1814697/1‑100 (MQ=255) tCGCCCGTTTTCGCCGCACCTCCTGTAGGCTGGTTGAGGCGTCAATGGATCTTGGCGCCATTGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAAtc < 1:4268874/99‑1 (MQ=255) cGCCCGTTTTCGCCGCACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGTTCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAAtctc > 1:2822184/1‑100 (MQ=255) cGCCCGCTTTCGCCGCCCGTCCTGGAGTCTTGTTGAGGCGTCGATGGATCTTGGGGCCAATGGCTGGGAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAAtct < 1:4139760/99‑1 (MQ=255) gCCCGTTTTCGCCGCACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGTTCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCa > 1:2698412/1‑100 (MQ=255) gCCCGTTTTCGCCGCACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGATCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCa > 1:651003/1‑100 (MQ=255) gCCCGTTTTCGCCGCACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGATCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCa > 1:3750540/1‑100 (MQ=255) cccGTTTTCGCCGCACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGTTCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAg > 2:613810/1‑100 (MQ=255) ccGTTTTCGCCGCACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGATCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGt > 1:1781190/1‑100 (MQ=255) cGTTTTCGCCGCACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGATCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGtt < 2:3445253/100‑1 (MQ=255) tttCGCCGCACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGTTCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCgg < 2:1828612/100‑1 (MQ=255) ttCGCCGCACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGTTCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGGc < 1:1939634/100‑1 (MQ=255) ttCGCCGCACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGATCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGGc < 2:2035110/100‑1 (MQ=255) ttCGCCGCACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGATCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGGc < 2:2448950/100‑1 (MQ=255) tCGCCGCACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGAGCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGGCg < 1:3069261/100‑1 (MQ=255) cgccgcACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGATCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGGCGt > 2:3628734/1‑100 (MQ=255) gccgcACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGTTCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGGCGtt > 2:3140566/1‑100 (MQ=255) gccgcACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGATCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGGCGtt < 1:1232722/100‑1 (MQ=255) ccgcACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGATCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGGCGTTa > 2:255055/1‑100 (MQ=255) cctcctGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGTTCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGGCGTTACTGGc > 1:1886039/1‑100 (MQ=255) cctcctGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGTTCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGGCGTTACTGGc < 2:3931536/100‑1 (MQ=255) cctcctGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGATCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGGCGTTACTGGc < 1:3682800/100‑1 (MQ=255) cctcctGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGATCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGGCGTTACTGGc < 2:2802946/100‑1 (MQ=255) ccttttgtttGGTTGAGGCTTCAATGGGTCTTGGGTCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGGTGTTTTTGGCagg < 1:829871/91‑1 (MQ=255) tGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGATCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGGCGTTACTGGCaggag < 2:2161031/100‑1 (MQ=255) ggAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGTTCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGGCGTTACTGGCaggagg < 1:595405/100‑1 (MQ=255) ggAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGTTCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCGACGTAGTGTTGCCGAATCACAGTGCGGCGTTACTGGCaggagg < 1:149711/100‑1 (MQ=255) ggAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGATCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGGCGTTACTGGCaggagg < 2:106139/100‑1 (MQ=255) gggtGGTTGAGGCGTGAATGGAGCGGGAGGGTGATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTGGGCGAATCGCAGTTCGGCGTTACTGGCaggag < 1:1958492/93‑1 (MQ=255) tCTGGTTGAGGCGTCAATGGATCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGGCGTTACTGGCAGGAGGAATg < 1:3975902/100‑1 (MQ=255) cTGGTTGAGGCGTCAATGGATCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGGCGTTACTGGCAGGAGGAATGc < 2:4134542/100‑1 (MQ=255) tGGTTGAGGCGTCAATGGATCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGGCGTTACTGGCAGGAGGAATGCt > 2:3169530/1‑100 (MQ=255) ggTTGAGGCGTCAATGGATCTTGGTGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGGCGTTACTGGCAGGAGGAATGCTg < 2:3469020/100‑1 (MQ=255) gTTGAGGCGTCAATGGTTCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGGCGTTACTGGCAGGAGGAATGCTgg > 2:3810244/1‑100 (MQ=255) gTTGAGGCGTCAATGGATCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGGCGTTACTGGCAGGAGGAATGCTgg < 2:1844021/100‑1 (MQ=255) ttGAGGCGTCAATGGATCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGGCGTTACTGGCAGGAGGAATGCTGGc < 2:459085/100‑1 (MQ=255) tGAGGCGTCAATGGTTCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGGCGTTACTGGCAGGAGGAATGCTGGCg < 2:1726521/100‑1 (MQ=255) gAGGCGTCAATGGATCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGGCGTTACTGGCAGGAGGAATGCTGGCGt > 1:3270297/1‑100 (MQ=255) gAGGCGTCAATGGATCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGCCGTTACTCGCAGGAGGCATGCTGGCg > 1:735811/1‑99 (MQ=255) aGGCGTCAATGGTTCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGGCGTTACTGGCAGGAGGAATGCTGGCGtt < 2:3521536/100‑1 (MQ=255) aGGCGTCAATGGCGCTTGGGGCCCATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGGCGTTACTGGCAGGAGGAATGCTGGCGtt > 1:134810/1‑100 (MQ=255) aGGCGTCAATGGATCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGGCGTTACTGGCAGGAGGAATGCTGGCGtt > 1:129742/1‑100 (MQ=255) aGGCGTCAATGGATCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGGCGTTACTGGCAGGAGGAATGCTGGCGtt > 2:7717/1‑100 (MQ=255) ggCGTCAATGGTTCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGGCGTTACTGGCAGGAGGAATGCTGGCGttt > 1:1266028/1‑100 (MQ=255) gCGTCAATGGTTCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGGCGTTACTGGCAGGAGGAATGCTGGCGTTTg < 2:2241075/100‑1 (MQ=255) cGTCAATGGTTCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGGCGTTACTGGCAGGAGGAATGCTGGCGTTTGc < 1:1291211/100‑1 (MQ=255) ttaaTGGTTCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGGCGTTACTGGCAGGAGGAATGCTGGCGTTTGcc < 2:347124/97‑1 (MQ=255) tCAATGGATCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGGCGTTACTGGCAGGGGGAATGCTGGCGTTTGCCt > 1:2768811/1‑100 (MQ=255) tCAATGGATCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGGCGTTACTGGCAGGAGGAATGCTGGCGTTTGCCt < 2:3752797/100‑1 (MQ=255) cAATGGATCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGGCGTTACTGGCAGGAGGAATGCTGGCGTTTGCCtt > 1:2871935/1‑100 (MQ=255) cAATGGATCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGGCGTTACTGGCAGGAGGAATGCTGGCGTTTGCCtt < 1:2844869/100‑1 (MQ=255) cAATGGATCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGGCGTTACTGGCAGGAGGAATGCTGGCGTTTGCCtt < 2:1538257/100‑1 (MQ=255) aaTGGATCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGGCGTTACTGGCAGGAGGAATGCTGGCGTTTGCCTTg > 1:2002702/1‑100 (MQ=255) aTGGTTCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGGCGTTACTGGCAGGAGGAATGCTGGCGTTTGCCTTGt > 1:3910131/1‑100 (MQ=255) tGGATCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGGCGTTACTGGCAGGAGGAATGCTGGCGTTTGCCTtctc > 1:4067190/1‑100 (MQ=255) ggATCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGGCGTTACTGGCAGGAGGAATGCTGGCGTTTGCCTTGTCg < 2:1215540/100‑1 (MQ=255) ggATCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGGCGTTACTGGCAGGAGGAATGCTGGCGTTTGCCTTGTCg < 2:1609269/100‑1 (MQ=255) | TCGTGGTCGGTCATGCGACTTTTTGTGTAGTTGTGGTGTTTAACAATGTCATCGCCCGTTTTCGCCGCACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGATCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGGCGTTACTGGCAGGAGGAATGCTGGCGTTTGCCTTGTCGTT > NC_000913/1515168‑1515366 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |