| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,688,184 | G→T | 43.6% | A65E (GCG→GAG) | fumA ← | fumarate hydratase (fumarase A), aerobic Class I |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,688,184 | 0 | G | T | 43.6% | 69.3 / 149.0 | 117 | A65E (GCG→GAG) | fumA | fumarate hydratase (fumarase A), aerobic Class I |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (28/37); new base T (29/22); total (57/60) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.90e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.73e-01 | |||||||||||
Only 100 of 124 total aligned reads displayed.
GCCGCGATGTCGGAGTTACGCAGGAATTGCAGCGCCACATATTTATCATTTTCGCTGGCCTCCGGGTCACGCAGAATGTCGGCCACCTGTTGTTGGTGCGCCGGACGCAGCATGAACGACGCATCATGAAACGCCTGGCGCGCCAACAGAGTTAACGCTTCGGGTGCGACTTTCAAAATCTCCTGCCCTTCAAATTCAG > NC_000913/1688085‑1688283 | gccgcGATGTCGGAGTTACGCAGGAATTGCAGCGCCACATATTTATCATTTTCGCTGGCCTCCGGGTCACGCAGAATGTCGGCCACCTGTTGTTGGTgcg > 2:1098496/1‑100 (MQ=255) ccgcGATGTCGGAGTTACGCAGGAATTGCAGCGCCACATATTTATCATTTTCGCTGGCCTCCGGGTCACGCAGAATGTCGGCCACCTGTTGTTGGTgcgc > 2:354623/1‑100 (MQ=255) cgcgATGTCGGAGTTACGCAGGAATTGCAGCGCCACATATTTATCATTTTCGCTGGCCTCCGGGTCACGCAGAATGTCGGCCACCTGTTGTTGGTGCTcc > 1:933590/1‑100 (MQ=255) gATGTCGGAGTTACGCAGGAATTGCAGCGCCACATATTTATCATTTTCGCTGGCCTCCGGGTCACGCAGAATGTCGGCCACCTGTTGTTGGTGCTCCGGa > 1:440075/1‑100 (MQ=255) aTGTCGGAGTTACGCAGGAATTGCAGCGCCACATATTTATCATTTTCGCTGGCCTCCGGGTCACGCAGAATGTCGGCCACCTGTTGTTGGTGCGCCGGAc < 2:3211396/100‑1 (MQ=255) gTCGGAGTTACGCAGGAATTGCAGCGCCACATATTTATCATTTTCGCTGGCCTCCGGGTCACGCAGAATGTCGGCCACCTGTTGTTGGTGCTCCGGACgc > 1:4136622/1‑100 (MQ=255) cGGAGTTACGCAGGAATTGCAGCGCCACTTATTTATCATTTTCGCTGGCCTCCGGGTCACGCAGAATGTCGGCCACCTGTTGTTGGTGCGCCGGACgca < 2:1133639/99‑1 (MQ=255) cGGAGTTACGCAGGAATTGCAGCGCCACATATTTATCATTTTCGCTGGCCTCCGGGTCACGCAGAATGTCGGCCACCTGTTGTTGGTGCGCCGGACgcag < 1:1320879/100‑1 (MQ=255) ggAGTTACGCAGGAATTGCAGCGCCACATATTTATCATTTTCGCTGGCCTCCGGGTCACGCAGAATGTCGGCCACCTGTTGTTGGTGCGCCGGACgcagc < 2:2251373/100‑1 (MQ=255) gAGTTACGCAGGAATTGCAGCGCCACATATTTATCATTTTCGCTGGCCTCCGGGTCACGCAGAATGTCGGCCACCTGTTGTTGGTGCTCCGGACgcagca > 2:3221591/1‑100 (MQ=255) gAGTTACGCAGGAATTGCAGCGCCACATATTTATCATTTTCGCTGGCCTCCGGGTCACGCAGAATGTCGGCCACCTGTTGTTGGTGCGCCGGACgcagca < 2:2446852/100‑1 (MQ=255) gTTACGCAGGAATTGCAGCGCCACATATTTATCATTTTCGCTGGCCTCCGGGTCACGCAGAATGTCGGCCACCTGTTGTTGGTGCTCCGGACGCAGCATg > 2:3073439/1‑100 (MQ=255) gTTACGCAGGAATTGCAGCGCCACATATTTATCATTTTCGCTGGCCTCCGGGTCACGCAGAATGTCGGCCACCTGTTGTTGGTGCTCCGGACGCAGCATg > 2:3814364/1‑100 (MQ=255) gTTACGCAGGAATTGCAGCGCCACATATTTATCATTTTCGCTGGCCTCCGGGTCACGCAGAATGTCGGCCACCTGTTGTTGGTGCGCCGGACGCAGTATg < 1:277924/100‑1 (MQ=255) ttACGCAGGAATTGCAGCGCCACATATTTATCATTTTCGCTGGCCTCCGGGTCACGCAGAATGTCGGCCACCTGTTGTTGGTGCTCCGGACGCAGCATg > 1:2787113/1‑99 (MQ=255) ttACGCAGGAATTGCAGCGCCACATATTTATCATTTTCGCTGGCCTCCGGGTCACGCAGAATGTCGGCCACCTGTTGTTGGTGCTCCGGACGCAGCATGa < 1:3221579/100‑1 (MQ=255) ttACGCAGGAATTGCAGCGCCACATATTTATCATTTTCGCTGGCCTCCGGGTCACGCAGAATGTCGGCCACCTGTTGTTGGTGCGCCGGACGCAGCATGa < 2:1467329/100‑1 (MQ=255) ttACGCAGGAATTGCAGCGCCACATATTTATCATTTTCGCTGGCCTCCGGGTCACGCAGAATGTCGGCCACCTGTTGTTGGTGCGCCGGACGCAGCATGa < 2:1467506/100‑1 (MQ=255) cGCAGGAATTGCAGCGCCACATATTTATCATTTTCGCTGGCCTCCGGGTCACGCAGAATGTCGGCCACCTGTTGTTGGTGCGCCGGACGCAGCATGAacg > 1:1087988/1‑100 (MQ=255) cGCAGGAATTGCAGCGCAACATATTTATCATTTTCGCTGGCCTCCGGGTCACGCAGAATGTCGGCCAAATGTTGTAGGTGCGCCGGACGCAGCATGAacg > 1:807853/1‑100 (MQ=255) gCAGGCATTGCAGCGCCAGATATTTATCGTTTTCGCTGGCCTCAGGGTCACGCAGAATGTCGGCCACCTGTTGTTGGTACTCTGGACGCAGCATg > 1:3750094/1‑95 (MQ=255) gCAGGAATTGCAGCGCCACATATTTATCATTTTCGCTGGCCTCCGGGTCACGCAGAATGTCGGCCACCTGTTGTTGGTGCTCCGGACGCAGCATGAacga > 1:4277452/1‑100 (MQ=255) gCAGGAATTGCAGCGCCACATATTTATCATTTTCGCTGGCCTCCGGGTCACGCAGAATGTCGGCCACCTGTTGTTGGTGCTCCGGACGCAGCATGAacga > 1:1499101/1‑100 (MQ=255) gCAGGAATTGCAGCGCCACATATTTATCATTTACGCTGGCCTCCGGGTCACGCAGAATGTCGGCCACCTGTTGTTGGTGCGCCGGACGCAGCATGAacga > 2:4060551/1‑100 (MQ=255) aGGAATTGCAGCGCCACATATTTATCATTTTCGCTGGCCTCCGGGTCACGCAGAATGTCGGCCACCTGTTGTTGGTGCGCCGGACGCAGCATGAacgacg < 1:3701611/100‑1 (MQ=255) gAATTGCAGCGCCACATATTTTTCATTTTCGCTCGCCTCCGGGTCACGCAGAATGTCGGCCACCTGTTGTTGGTGCGCCGGACGCAGCATGAACGACGca < 1:725417/100‑1 (MQ=255) gAATTGCAGCGCCACATATTTATCATTTTCGCTGGCCTCCGGGTCACGCAGAATGTCGGCCACCTGTTGTTGGTGCTCCGGACGCAGCATGAACGACGca < 2:800701/100‑1 (MQ=255) aaTTGCAGCGCCACATATTTATCATTTTCGCTGGCCTCCGGGTCACGCAGAATGTCGGCCACCTGTTGTTGGTGCTCCGGACGCAGCATGAACGACGcat < 2:4277476/100‑1 (MQ=255) aaTTGCAGCGCCACATATTTATCATTTTCGCTGGCCTCCGGGTCACGCAGAATGTCGGCCACCTGTTGTTGGTGCTCCGGACGCAGCATGAACGACGcat < 2:1499105/100‑1 (MQ=255) tGCAGCGCCCCATATGTATCATTTTCGCGGGCCGCCGGGTCACGCAGACTGTCGGCCACCTGTTGTTGGTGCACTGGACGCAGCATGCACGACGcatcat < 1:4196659/100‑1 (MQ=255) tGCAGCGCCACATATTTATCATTTTCGCTGGCCTCCGGGTCACGCAGAATGTCGGCCACCTGTTGTTGGTGCGCCGGACGCAGCATGAACGACGcatcat > 2:448986/1‑100 (MQ=255) tGCAGCGCCACATATTTATCATTTTCGCTGGCCTCCGGGTCACGCAGAATGTCGGCCACCTGTTGTTGGTGCGCCGGACGCAGCATGAACGACGcatcat < 1:4197154/100‑1 (MQ=255) gCAGCGCCACATATTTATCATTTTCGCTGGCCTCCGGGTCACGCAGAATGTCGGCCACCTGTTGTTGGTGCTCCGGACGCAGCATGAACGACGCATCATg > 1:1778033/1‑100 (MQ=255) gCAGCGCCACATATTTATCATTTTCGCTGGCCTCCGGGTCACGCAGAATGTCGGCCACCTGTTGTTGGTGCTCCGGACGCAGCATGAACGACGCATCATg < 2:279905/100‑1 (MQ=255) gCAGCGCCACATATTTATCAAGTTGGTTGGGCTCCGGGTCACGCCGAATGTCGGCCACATGTTGTTCATGGGCTGGACGCAAGGTCAACGACGcatc > 1:766029/1‑97 (MQ=255) cgcCACATATTTATCATTTTCGCTGGCCTCCGGGTCACGCAGAATGTCGGCCACCTGTTGTTGGTGCTCCGGACGCAGCATGAACGACGCATCATGAAAc < 1:1912210/100‑1 (MQ=255) ccACATATTTATCATTTTCGCTGGCCTCCGGGTCACGCAGAATGTCGGCCACCTGTTGTTGGTGCTCCGGACGCAGCATGAACGACGCATCATGAAACGc > 2:2146862/1‑100 (MQ=255) acaTATTTATCATTTTCGCTGGCCTCCGGGTCACGCAGAATGTCGGCCACCTGTTGTTGGTGCTCCGGACGCAGCATGAACGACGCATCATGAAACGCCt < 2:4030027/100‑1 (MQ=255) acaTATTTATCATTTTCGCTGGCCTCCGGGTCACGCAGAATGTCGGCCACCTGTTGTTGGTGCGCCGGACGCAGCATGAACGACGCATCATGAAACGCCt > 2:3039423/1‑100 (MQ=255) acaTATTTATCATTTTCGCTGGCCTCCGGGTCACGCAGAATGTCGGCCACCTGTTGTTGGTGCGCCGGACGCAGCATGAACGACGCATCATGAAACGCCt > 2:2792888/1‑100 (MQ=255) caTATTTATCATTTTCGCTGGCCTCCGGGTCACGCAGAATGTCGGCCACCTGTTGTTGGTGCTCCGGACGCAGCATGAACGACGCATCATGAAACGCCTg > 1:2827144/1‑100 (MQ=255) ttATCATTTTCGCTGGCCTCCGGGTCACGCAGAATGTCGGCCACCTGTTGTTGGTGCTCCGGACGCAGCATGAACGACGCATCATGAAACGCCTGgcgcg < 2:4184589/100‑1 (MQ=255) ttATCATTTTCGCTGGCCTCCGGGTCACGCAGAATGTCGGCCACCTGTTGTTGGTGCGCCGGACGCAGCATGAACGACGCATCATGAAACGCCTGgcgcg > 1:2794875/1‑100 (MQ=255) tATCATTTTCGCTGGCCTCCGGGTCACGCAGAATGTCGGCCACCTGTTGTTGGTGCGCCGGACGCCGCATGAACGACGCATCATGAAACGCCTGgcgcgc > 1:1309913/1‑100 (MQ=255) tATCATTTTCGCTGGCCTCCGGGTCACGCAGAATGTCGGCCACCTGTTGTTGGTGCGCCGGACGCAGCATGAACGACGCATCATGAAACGCCTGgcgcgc > 1:3979217/1‑100 (MQ=255) aTCATTTTCGCTGGCCTCCGGGTCACGCAGAATGTCGGCCACCTGTTGTTGGTGCGCCGGACGCAGCATGAACGACGCATCATGAAACGCCTGGCGCGcc > 2:2293139/1‑100 (MQ=255) aTCATTTTCGCTGGCCTCCGGGTCACGCAGAATGTCGGCCACCTGTTGTTGGTGCGCCGGACGCAGCATGAACGACGCATCATGAAACGCCTGGCGCGcc < 1:1185019/100‑1 (MQ=255) tCATTTTCGCTGGCCTCCGGGTCACGCAGAATGTCGGCCACCTGTTGTTGGTGCTCCGGACGCAGCATGAACGACGCATCATGAAACGCCTGGCGCGCCa < 2:1906449/100‑1 (MQ=255) tCATTTTCGCTGGCCTCCGGGTCACGCAGAATGTCGGCCACCTGTTGTTGGTGCGCCGGACGCAGCATGAACGACGCATCATGAAACGCCTGGCGCGCCa > 2:2588691/1‑100 (MQ=255) tttCGCTGGCCTCCGGGTCACGCAGAATGTCGGCCACCTGTTGTTGGTGCTCCGGACGCAGCATGAACGACGCATCATGAAACGCCTGGCGCGCCAACag < 1:1994689/100‑1 (MQ=255) tCGCTGGCCTCCGGGTCACGCAGAATGTCGGCCACCTGTTGTTGGTGCGCCGGACGCAGCATGAACGACGCATCATGAAACGCCTGGCGCGCCAACagag > 2:2010735/1‑100 (MQ=255) gCTGGCCTCCGGGTCACGCAGAATGTCGGCCACCTGTTGTTGGTGCGCCGGACGCAGCATGAACGACGCATCATGAAACGCCTGGCGCGCCAACAGAGt > 1:3313615/1‑99 (MQ=255) ggCCTCCGGGTCACGCAGAATGTCGGCCACCTGTTGTTGGTGCTCCGGACGCAGCATGAACGACGCATCATGAAACGCCTGGCGCGCCAACAGAGTTAAc < 2:2399188/100‑1 (MQ=255) gCCTCCGGGTCACGCAGAATGTCGGCCACCTGTTGTTGGTGCGCCGGACGCAGCATGAACGACGCATCATGAAACGCCTGGCGCGCCAACAGAGTTAACg < 2:3157196/100‑1 (MQ=255) ccTCCGGGTCACGCAGAATGTCGGCCACCTGTTGTTGGTGCTCCGGACGCAGCATGAACGACGCATCATGAAACGCCTGGCGCGCCAACAGAGTTAACGc > 2:1349935/1‑100 (MQ=255) ccGGGTCACGCAGAATGTCGGCCACCTGTTGTTGGTGCTCCGGACGCAGCATGAACGACGCATCATGAAACGCCTGGCGCGCCAACAGAGTTAACGCTTc > 1:3097127/1‑100 (MQ=255) cGGGTCACGCAGAATGTCGGCCACCTGTTGTTGGTGCGCCGGACGCAGCATGAACGACGCATCATGAAACGCCTGGCGCGCCAACAGAGTTAACGCTTCg < 2:1038870/100‑1 (MQ=255) ggTCACGCAGAATGTCGGCCACCTGTTGTTGGTGCGCCGGACGCAGCATGAACGACGCATCATGAAACGCCTGGCGCGCCAACAGAGTTAACGCTTCggg < 1:3160013/100‑1 (MQ=255) tCACGCAGAATGTCGGCCACCTGTTGTTGGTGCTCCGGACGCAGCATGAACGACGCATCATGAAACGCCTGGCGCGCCAACAGAGTTAACGCTTCGGGTg < 1:3199048/100‑1 (MQ=255) tCACGCAGAATGTCGGCCACCTGTTGTTGGTGCTCCGGACGCAGCATGAACGACGCATCATGAAACGCCTGGCGCGCCAACAGAGTTAACGCTTCGGGTg < 1:137896/100‑1 (MQ=255) cACGCAGAATGTCGGCCACCTGTTGTTGGTGCGCCGGACGCAGCATGAACGACGCATCATGTAACGCCTGGCGCGCCAACAGAGTTTACGCTTCGGGTGc < 1:2639890/100‑1 (MQ=255) cACGCAGAATGTCGGCCACCTGTTGTTGGTGCGCCGGACGCAGCATGAACGACGCATCATGAAACGCCTGGCGCGCCAACAGAGTTAACGCTTCGGGTGc > 2:894138/1‑100 (MQ=255) cGCAGAATGTCGGCCACCTGTTGTTGGTGCTCCGGACGCAGCATGAACGACGCATCATGAAACGCCTGGCGCGCCAACAGAGTTAACGCTTCGGGTGCGa > 2:714555/1‑100 (MQ=255) cGCAGAATGTCGGCCACCTGTTGTTGGTGCGCCGGACGCAGCATGAACGACGCATCATGAAACGCCTGGCGCGCCACCAGAGTTAACGCTTCGGGTGCGa < 1:1909708/100‑1 (MQ=255) gCAGAATGTCGGCCACCTGTTGTTGGTGCTCCGGACGCAGCATGAACGACGCATCATGAAACGCCTGGCGCGCCAACAGAGTTAACGCTTCGGGTGCGAc < 2:3620789/100‑1 (MQ=255) gCAGAATGTCGGCCACCTGTTGTTGGTGCGCCGGACGCAGCATGAACGACGCATCATGAAACGCCTGGCGCGCCAACAGAGTTAACGCTTCGGGTGCGAc < 1:3490353/100‑1 (MQ=255) cAGAATGTCGGCCACCTGTTGTTGGTGCTCCGGACGCAGCATGAACGACGCATCATGAAACGCCTGGCGCGCCAACAGAGTTAACGCTTCGGGTGCGACt > 1:1378059/1‑100 (MQ=255) aGAATGTCGGCCACCTGTTGTTGGTGCGCCGGACGCAGCATGAACGACGCATCATGAAACGCCTGGCGCGCCAACAGAGTTAACGCTTCGGGTGCGACtt > 2:1622074/1‑100 (MQ=255) gAATGTCGGCCACCTGTTGTTGGTGCTCCGGACGCAGCATGAACGACGCATCATGAAACGCCTGGCGCGCCAACAGAGTTAACGCTTCGGGTGCGACttt > 1:2243851/1‑100 (MQ=255) aaTGTCGGCCACCTGTTGTTGGTGCGCCGGACGCAGCATGAACGACGCATCATGAAACGCCTGGCGCGCCAACAGAGTTAACGCTTCGGGTGCGACTTTc > 2:3817797/1‑100 (MQ=255) aTGTCGGCCACCTGTTGTTGGTGCGCCGGACGCAGCATGAACGACGCATCATGAAACGCCTGGCGCGCCAACAGAGTTAACGCTTCGGGTGCGACTTTCa > 1:1409219/1‑100 (MQ=255) tCGGCCACCTGTTGTTGGTGCTCCGGACGCAGCATGAACGACGCATCATGAAACGCCTGGCGCGCCAACAGAGTTAACGCTTCGGGTGCGACTTTCaaaa < 2:4276986/100‑1 (MQ=255) tCGGCCACCTGTTGTTGGTGCGCCGGACGCAGCATGAACGACGCATCATGAAACGCCTGGCGCGCCAACAGAGTTAACGCTTCGGGTGCGACTTTCaaaa < 2:3934498/100‑1 (MQ=255) tCGGCCACCTGTTGTTGGTGCGCCGGACGCAGCATGAACGACGCATCATGAAACGCCTGGCGCGCCAACAGAGTTAACGCTTCGGGTGCGACTTTCaaaa < 2:4043494/100‑1 (MQ=255) ggCCACCTGTTGTTGGTGCTCCGGACGCAGCATGAACGACGCATCATGAAACGCCTGGCGCGCCAACAGAGTTAACGCTTCGGGTGCGACTTTCAAAAtc > 2:2771477/1‑100 (MQ=255) ggCCACCTGTTGTTGGTGCTCCGGACGCAGCATGAACGACGCATCATGAAACGCCTGGCGCGCCAACAGAGTTAACGCTTCGGGTGCGACTTTCAAAAtc > 1:450737/1‑100 (MQ=255) ggCCACCTGTTGTTGGTGCGCCGGACGCAGCATTAACGACGCATCATGAAACGCCTTGCGCGCCAACAGAGTTAACGCTTCGGGTGCGACTTTCAAAAtc < 1:4256157/100‑1 (MQ=255) ggCCACCTGTTGTTGGTGCGCCGGACGCAGCATGAACGACGCATCATGAAACGCCTGGCGCGCCAACAGAGTTAACGCTTCGGGTGCGACTTTCAAAAtc < 2:3822883/100‑1 (MQ=255) ggCCACCTGTTGTTGGTGCGCCGGACGCAGCATGAACGACGCATCATGAAACGCCTGGCGCGCCAACAGAGTTAACGCTTCGGGTGCGACTTTCAAAAt > 2:173336/1‑99 (MQ=255) ggCCACCCGTTGTTGGTGCTCCGGACGCAGCATGAACGACGCATCATGAAACGCCTGGCGCGCCAACAGAGTTAACGCTTCGGGTGCGACTTTCAAAAtc > 2:2234546/1‑100 (MQ=255) ccACCTGTTGTTGGTGCGCCGGACGCAGCATGAACGACGCATCATGAAACGCCTGGCGCGCCAACAGAGTTAAAGATTCGGGTGCGAGTTTCAAAAtctc > 1:3351032/1‑100 (MQ=255) cACCTGTTGTTGGTGCGCCGGACGCAGCATGAACGACGCATCATGAAACGCCTGGCGCGCCAACAGAGTTAACGCTTCGGGTGCGACTTTCAAAATCTcc < 2:793852/100‑1 (MQ=255) cTGTTGTTGGTGCTCCGGACGCAGCATGAACGACGCATCATGAAACGCCTGGCGCGCCAACAGAGTTAACGCTTCGGGTGCGACTTTCAAAATCTCCTGc < 2:4031315/100‑1 (MQ=255) cTGTTGTTGGTGCGCCGGACGCAGCATCAACGACGCATCATGAAACGCCTGGCGCGCCAACAGAGTTAACGCTTCGGGTGCGACTTTCAAAATCTCCTGc < 2:1357967/100‑1 (MQ=255) tgttgtTGGTGCGCCGGACGCAGCATGATCGACGCATCATGAAACGCCTGGCGCGCCAACAGAGTTAACGCTTCGGGTGCGACTTTCAAAATCTCCTGc < 1:852758/99‑1 (MQ=255) gttgttGGTGCTCCGGACGCAGCATGAACGACGCATCATGAAACGCCTGGCGCGCCAACAGAGTTAACGCTTCGGGTGCGACTTTCAAAATCTCCTGccc < 2:157690/100‑1 (MQ=255) ttgttgGTGCGCCGGACGCAGCATGAACGACGCATCATGAAACGCCTGGCGCGCCAACAGAGTTAACGCTTCGGGTGCGACTTTCAAAATCTCCTGCCCt < 2:1954758/100‑1 (MQ=255) tgttgGTGCTCCGGACGCAGCATGAACGACGCATCATGAAACGCCTGGCGCGCCAACAGAGTTAACGCTTCGGGTGCGACTTTCAAAATCTCCTGCCCtt > 1:2973225/1‑100 (MQ=255) gttgGTGCTCCGGACGCAGCATGAACGACGCATCATGAAACGCCTGGCGCGCCAACAGAGTTAACGCTTCGGGTGCGACTTTCAAAATCTCCTGCCCTTc > 2:3370794/1‑100 (MQ=255) gttgGTGCGCCGGACGCAGCATGAACGACGCATCATGAAACGCCTGGCGCGCCAACAGAGTTAACGCTTCGGGTGCGACTTTCAAAATCTCCTGCCCTTc > 2:1892114/1‑100 (MQ=255) gttgGTGCGCCGGACGCAGCATGAACGACGCATCATGAAACGCCTGGCGCGCCAACAGAGTTAACGCTTCGGGTGCGACTTTCAAAATCTCCTGCCCTTc < 1:3768432/100‑1 (MQ=255) tgGTGCGCCGGACGCAGCATGAACGACGCATCATGAAACGCCTGGCGCGCCAACAGAGTTAACGCTTCGGGTGCGACTTTCAAAATCTCCTGCCCTTCa > 1:3628793/1‑99 (MQ=255) ggTGCTCCGGACGCAGCATGAACGACGCATCATGAAACGCCTGGCGCGCCAACAGAGTTAACGCTTCGGGTGCGACTTTCAAAATCTCCTGCCCTTCaaa > 1:119013/1‑100 (MQ=255) gTGCTCCGGACGCAGCATGAACGACGCATCATGAAACGCCTGGCGCGCCAACAGAGTTAACGCTTCGGGTGCGACTTTCAAAATCTCCTGCCCTTCAAAt < 2:3049994/100‑1 (MQ=255) gTGCGCCGGACGCAGCATGAACGACTCATCATGAAACGCCTGGCGCGCCAACAGAGTTAACGCTTCGGGTGCGACTTTCAAAATCTCCTGCCCTTCAAAt < 1:3075375/100‑1 (MQ=255) tGCGCCGGACGCAGCATGAACGACGCATCATGAAACGCCTGGCGCGCCAACAGAGTTAACGCTTCGGGTGCGACTTTCAAAATCTCCTGCCCTTCAAAtt > 2:279229/1‑100 (MQ=255) cgcCGGACGCAGCATGAACGACGCATCATGAAACGCCTGGCGCGCCAACAGAGTTAACGCTTCGGGTGCGACTTTCAAAATCTCCTGCCCTTCAAATTCa < 2:2464944/100‑1 (MQ=255) gcCGGACGCAGCATGAACGACGCATCATGAAACGCCTGGCGCGCCAACAGAGTTAACGCTTCGGGTGCGACTTTCAAAATCTCCTGCCCTTCAAATTCAg > 1:2100293/1‑100 (MQ=255) gcCGGACGCAGCATGAACGACGCATCATGAAACGCCTGGCGCGCCAACAGAGTTAACGCTTCGGGTGCGACTTTCAAAATCTCCTGCCCTTCAAATTCAg > 1:491298/1‑100 (MQ=255) gcCGGACGCAGCATGAACGACGCATCATGAAACGCCTGGCGCGCCAACAGAGTTAACGCTTCGGGTGCGACTTTCAAAATCTCCTGCCCTTCAAATTCAg < 2:1261720/100‑1 (MQ=255) | GCCGCGATGTCGGAGTTACGCAGGAATTGCAGCGCCACATATTTATCATTTTCGCTGGCCTCCGGGTCACGCAGAATGTCGGCCACCTGTTGTTGGTGCGCCGGACGCAGCATGAACGACGCATCATGAAACGCCTGGCGCGCCAACAGAGTTAACGCTTCGGGTGCGACTTTCAAAATCTCCTGCCCTTCAAATTCAG > NC_000913/1688085‑1688283 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |