| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,720,629 | T→C | 38.1% | T66A (ACT→GCT) | slyA ← | global transcriptional regulator |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,720,629 | 0 | T | C | 38.1% | 81.5 / 123.8 | 118 | T66A (ACT→GCT) | slyA | global transcriptional regulator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (34/39); new base C (21/24); total (55/63) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.23e-01 | |||||||||||
Only 100 of 119 total aligned reads displayed.
GGCTCTGCCTTTTCCGTCAGTTTAATACGTTTAGCCCGACGATCGCTGGCACAAGTTTGACGCGAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGTACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGACTGGTCTGGAGGTAACTGATGGATATTGTGTAACGTAACCCAATG > NC_000913/1720532‑1720728 | ggCTCTGCCTTTTCCGTCAGTTTAATACGTTTAGCCCGACGATCGCTGGCACAAGTTTGACGCGAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGTAc > 2:3150805/1‑100 (MQ=255)ggCTCTGCCTTTTCCGTCAGTTTAATACGTTTAGCCCGACGATCGCTGGCACAAGTTTGACGCGAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGCAc < 1:1154198/100‑1 (MQ=255)ggCTCTGCCTTTTCCGTCAGTTTAATACGTTTAGCCCGACGATCGCTGGCACAAGTTTGACGCGAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGCAc < 1:295468/100‑1 (MQ=255) gCTCTGCCTTTTCCGTCAGTTTAATACGTTTAGCCCGACGATCGCTGGCACAAGTTTGACGCGAAATTAGCCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGCACg > 1:1147228/1‑100 (MQ=255) ctctGCCTTTTCCGTCAGTTTAATACGTTTAGCCCGACGATCGCTGGCACAAGTTTGACGCGAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGCACgg > 1:3117688/1‑100 (MQ=255) tctGCCTTTTCCGTCAGTTTAATACGTTTAGCCCGACGATCGCTGGCACAAGTTTGACGCGAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGCACGGa < 1:1730569/100‑1 (MQ=255) tGCCTTTTCCGTCAGTTTAATACGTTTAGCCCGACGATCGCTGGCACAAGTTTGACGCGAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGTACGGAcc > 2:2566005/1‑100 (MQ=255) tGCCTTTTCCGTCAGTTTAATACGTTTAGCCCGACGATCGCTGGCACAAGTTTGACGCGAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGCACGGAcn < 1:3916727/100‑2 (MQ=255) gCCTTTTCCGTCAGTTTAATACGTTTAGCCCGACGATCGCTGGCACAAGTTTGACGCGAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGTACGGACCa > 1:103141/1‑100 (MQ=255) ccTTTTCCGTCAGTTTAATACGTTTAGCCCGACGATCGCTGGCACAAGTTTGACGCGAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGCGTACGGACCAg > 2:3562963/1‑100 (MQ=255) ccTTTTCCGTCAGTTTAATACGTTTAGCCCGACGATCGCTGGCACAAGTTTGACGCGAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGTACGGACCAg > 2:1318605/1‑100 (MQ=255) cTTTTCCGTCAGTTTAATACGTTTAGCCCGACGATCGCTGGCACAAGTTTGACGCGAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGTACGGACCAGt > 2:2967072/1‑100 (MQ=255) tCCGTCAGTTTAATACGTTTAGCCCGACGATCGCTGGCACAAGTTTGACGCGAAATTAGCCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGCACGGACCAGTGATg < 2:1147231/100‑1 (MQ=255) tCCGTCAGTTTAATACGTTTAGCCCGACGATCGCTGGCACAAGTTTGACGCGAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGCACGGACCAGTGATg > 1:106429/1‑100 (MQ=255) tCCGTCAGTTTAATACGTTTAGCCCGACGATCGCTGGCACAAGTTTGACGCGAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGCACGGACCAGTGATg < 2:1452551/100‑1 (MQ=255) ccGTCAGTTTAATACGTTTAGCCCGACGATCGCTGGCACAAGTTTGACGCGAGATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGTACGGACCAGTGATgg < 1:2895620/100‑1 (MQ=255) cGTCAGTTTAATACGTTTAGCCCGACGATCGCTGGCACAAGTTTGACGCGAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGTACGGACCAGTGATGgc < 1:28444/100‑1 (MQ=255) cGTCAGTTTAATACGTTTAGCCCGACGATCGCTGGCACAAGTTTGACGCGAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGTACGGACCAGTGATGgc > 2:2867826/1‑100 (MQ=255) cGTCAGTTTAATAAGTTTAGCCCGACGATCGCTGGCACAAGTTTGACGCGAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTAGGTCCAGAGTACGGACCAGTGATGgc < 1:628771/100‑1 (MQ=255) gTCAGTTTAATACGTTTAGCCCGACGATCGCTGGCACAAGTTTGACGCGAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGTACGGACCAGTGATGgct > 2:185499/1‑100 (MQ=255) cAGTTTAATACGTTTAGCCCGACGATCGCTGGCACAAGTTTGACGCGAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGTACGGACCAGTGATGgctgc < 2:6360/100‑1 (MQ=255) gTTTAATACGTTTAGCCCGACGATCGCTGGCACAAGTTTGACGCGAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGCACGGACCAGTGATGGCTGCTc > 2:373148/1‑100 (MQ=255) gTTTAATACGTTTAGCCCGACGATCGCTGGCACAAGTTTGACGCGAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGCACGGACCAGTGATGGCTGCTc > 2:2116910/1‑100 (MQ=255) tttAATACGTTTAGCCCGACGATCGCTGGCACAAGTTTGACGCGAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGTACGGACCAGTGATGGCTGCTCg < 1:1437348/100‑1 (MQ=255) tttAATACGTTTAGCCCGACGATCGCTGGCACAAGTTTGACGCGAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGCACGGACCAGTGATGGCTGCTCg < 2:4264004/100‑1 (MQ=255) ttAATACGTTTAGCCCGACGATCGCTGGCACAAGTTTGACGCGAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGCACGGACCAGTGATGGCTGCTCGa > 2:3067004/1‑100 (MQ=255) ttAATACGTTTAGCCCGACGATCGCTGGCACAAGTTTGACGCGAAATTAACCCTTTTTATTCCAGTTGGTCCAGAGTACGGACCAGTGATGGATGCTCGa > 2:3564934/1‑100 (MQ=255) tAATACGTTTAGCCCGACGATCGCTGGCACAAGTTTGACGCGAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGTACGGACCAGTGATGGCTGCTCGAt < 2:361889/100‑1 (MQ=255) aaTACGTTTAGCCCGACGATCGCTGGCACAAGTTTGACGCGAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGTACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATg < 1:588362/100‑1 (MQ=255) aTACGTTTAGCCCGACGATCGCTGGCACAAGTTTGACGCGAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGTACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGc > 2:3867363/1‑100 (MQ=255) aTACGTTTAGCCCGACGATCGCTGGCACAAGTTTGACGCGAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGTACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGc < 1:332185/100‑1 (MQ=255) tACGTTTAGCCCGACGATCGCTGGCACAAGTTTGACGCGAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGTACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGcc < 1:3639030/100‑1 (MQ=255) aCGTTTAGCCCGACGATCGCTGGCACAAGTTTGACGCGAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGTACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCa < 2:1222467/100‑1 (MQ=255) gTTTAGCCCGACGATCGCTGGCACAAGTTTGACGCGAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGTACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAAt < 2:889351/100‑1 (MQ=255) gTTTAGCCCGACGATCGCTGGCACAAGTTTGACGCGAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGTACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAAt < 1:1877221/100‑1 (MQ=255) ttAGCCCGACGATCGCTGGCACAAGTTTGACGCGAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGTACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCg > 2:1299504/1‑100 (MQ=255) ttAGCCCGACGATCGCTGGCACAAGTTTGACGCGAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGTACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCg < 2:2528279/100‑1 (MQ=255) aGCCCGACGATCGCTGGCACAAGTTTGACGCGAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGCACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCt > 2:3138585/1‑100 (MQ=255) gCCCGACGATCGCTGGCACAAGTTTGACGCGAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGTACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCtt > 2:1157548/1‑100 (MQ=255) gCCCGACGATCGCTGGCACAAGTTTGACGCGAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGTACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCtt > 1:3268266/1‑100 (MQ=255) gCCCGACGATCGCTGGCACAAGTTTGACGCGAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGTACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCtt > 2:2311874/1‑100 (MQ=255) gCCCGACGATCGCTGGCACAAGTTTGACGCGAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGCACGGACCAGTGATGCCTGCTCGATGCCAATCGCt > 2:1618266/1‑99 (MQ=255) ccGACGATCGCTGGCACAAGTTTGACGCGAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGTACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCtttt > 2:464432/1‑100 (MQ=255) ccGACGATCGCTGGCACAAGTTTGACGCGAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGTACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCtttt > 1:1910981/1‑100 (MQ=255) gacgaTCGCTTGCACAAGTTTGACGCGAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGTACGGAGCATTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGc < 1:2810738/100‑1 (MQ=255) acgaTCGCTGGCACAAGTTTGACGCAAAATTAACCCGTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGTACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGcc < 2:1910985/100‑1 (MQ=255) gaTCGCTGGCACAAGTTTGACGCGAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGCACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAg > 1:1087020/1‑100 (MQ=255) aTCGCTGGCACAAGTTTGACGCGAAATTAACCCTTTTTTTTCCAGTTGGTCCAGAGTAAGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGcaa > 1:3312531/1‑96 (MQ=255) tCGCTGGCACAAGTTTGACGCTCAATTAACCCTTTAGCGTCCTGTTGGTCCAGAGCACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAg < 1:1656203/98‑1 (MQ=255) cGCTGGCACAAGTTTGACGCGAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGCACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTg < 2:4241019/100‑1 (MQ=255) ggCACAAGTTTGACGCGAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGCACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAAtt < 2:90005/100‑1 (MQ=255) cacaAGTTTGACGCGAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGTACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTg < 1:2204189/100‑1 (MQ=255) cacaAGTTTGACGCGAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGCACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAAttt > 2:162027/1‑99 (MQ=255) cacaAGTTTGACGCGAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGCACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTg > 2:1639694/1‑100 (MQ=255) acaAGTTTGACGCGAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGTACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGc < 2:3814544/100‑1 (MQ=255) acaAGTTTGACGCGAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGCACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGc < 1:1580012/100‑1 (MQ=255) caAGTTTGACGCGAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGTACGGACCAGTGATGGCTTCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCg < 1:952600/100‑1 (MQ=255) caAGTTTGACGCGAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGTACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCg > 1:2002797/1‑100 (MQ=255) caAGTTTGACGCGAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGTACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCg > 2:2855242/1‑100 (MQ=255) caAGTTTGACGCGAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGTACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCg > 1:1997642/1‑100 (MQ=255) aaGTTTGACGCGAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGCACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGa > 2:2823117/1‑100 (MQ=255) aGTTTGACGCGAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGTACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGAc < 2:714287/100‑1 (MQ=255) aGTTTGACGCGAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGCACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGAc < 2:3522295/100‑1 (MQ=255) gACGCGAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGCACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGACTGGTc < 2:3753841/100‑1 (MQ=255) cgcgAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGTACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGACTGGTCTg > 2:1935177/1‑100 (MQ=255) cgcgAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGTACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGACTGGTCTg > 1:4142206/1‑100 (MQ=255) cgcgAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGCACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGACTGGTCTg > 1:1577940/1‑100 (MQ=255) cgcgAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGGCCAGAGTACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTGGCCAGTTGAATTTGGGAGTGGtgtg > 1:982938/1‑100 (MQ=255) gcgAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGCACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGACTGGTCTgg < 2:3115256/100‑1 (MQ=255) gcgAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGCACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGACTGGTCTgg < 2:3638425/100‑1 (MQ=255) gcgAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGCACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGACTGGTCTgg < 2:1980385/100‑1 (MQ=255) cgAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGTACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGACTGGTCTGGa < 2:3268278/100‑1 (MQ=255) cgAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGTACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAATTGAATTTGCGACTGGTCTGGa < 2:3847410/100‑1 (MQ=255) aaaTTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGCACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGACTGGTCTGGAgg < 2:1382510/100‑1 (MQ=255) aTTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGTACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGACTGGTCTGGAGGTa < 1:1254308/100‑1 (MQ=255) aTTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGCACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGACTGGTCTGGAGGTa < 2:3546522/100‑1 (MQ=255) aaCCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGTACGGACCAGTGATGTCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGACTGGTCTGGAGGTAACt < 1:818212/100‑1 (MQ=255) aaCCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGTACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGACTGGTCTGGAGGTAACt < 1:3867346/100‑1 (MQ=255) aaCCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGTACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGACTGGTCTGGAGGTAACt < 1:3867027/100‑1 (MQ=255) ccTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGTACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGACTGGTCTGGAGGTACCTGAt > 1:3443997/1‑100 (MQ=255) cTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGCACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGACTGGTCTGGAGGTAACTGATg > 2:1804468/1‑100 (MQ=255) tttttCTTCCAGTTGGTCCAGAGTACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGACTGGTCTGGAGGTAACTGATgg < 2:1898715/100‑1 (MQ=255) tttCTTCCAGTTGGTCCAGAGCACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGACTGGTCTGGAGGTAACTGATGGat < 2:646814/100‑1 (MQ=255) ttcttcCAGTTGGTCCAGAGCACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGACTGGTCTGGAGGTAACTGATGGata < 2:106429/100‑1 (MQ=255) ttcttcCAGTTGGTCCAGAGCACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTGGCCAGTTGAATTTGCGACTGGTCTGGAGGTAACTGATGGat < 1:1114922/99‑1 (MQ=255) tcCAGTTGGTCCAGAGTACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGACTGGTCTGGAGGTAACTGATGGATATtgt > 2:1238050/1‑100 (MQ=255) gTTGGTCCAGAGTACGGACCAGCGATGGCTGATCGATTCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGACTGGTCTGGAGGTAACTGATGGATATTGTgtaa < 1:2888904/100‑1 (MQ=255) ttGGTCCAGAGTACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGACTGGTCTGGAGGTAACTGATGGATATTGTgtaac < 1:1740284/100‑1 (MQ=255) ttGGTCCAGAGTACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGACTGGTCTGGAGGTAACTGATGGATATTGTgtaac < 2:24196/100‑1 (MQ=255) tGGTCCAGAGCACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGACTGGTCTGGAGGTAACTGATGGATATTGTgtaacg < 2:4086414/100‑1 (MQ=255) gTCCAGAGTACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGACTGGTCTGGAGGTAACTGATGGATATTGTgtaacgta > 1:2372264/1‑100 (MQ=255) gTCCAGAGTACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGACTGGTCTGGAGGTAACTGATGGATATTGTgtaacgta > 2:1309003/1‑100 (MQ=255) gTCCAGAGCACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTATTGCCAGTTGAATTTGCGACTGGTCTGGAGGTAACTGATGGATATTGTgtaacgta > 1:90746/1‑100 (MQ=255) tCCAGAGTACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGACTGGTCTGGAGGTAACTGATGGATATTGTgtaacgtaa > 2:3808934/1‑100 (MQ=255) tCCACAGTACGGCCCAGTGATCGCAGCTCGATGCCTATCGCTTTTGCCAGTTCAATTTCCTACTGGTCTGGAGGTACCTGATCGATATTGTgtaatgtc < 1:2545536/99‑2 (MQ=255) ccAGAGTACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGACTGGTCTGGAGGTAACTGATGGATATTGTgtaacgtaac < 1:1595071/100‑1 (MQ=255) agagTACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGACTGGTCTGGAGGTAACTGATGGATATTGTGTAACGTAAccc > 1:2151624/1‑100 (MQ=255) agagTACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGACTGGTCTGGAGGTAACTGATGGATATTGTGTAACGTAAccc > 2:1310402/1‑100 (MQ=255) agagCACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGACTGGTCTGGAGGTAACTGATGGATATTGTGTAACGTAAccc < 2:2061013/100‑1 (MQ=255) tACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGACTGGTCTGGAGGTAACTGATGGATATTGTGTAACGTAACCCAATg < 2:3346263/100‑1 (MQ=255) | GGCTCTGCCTTTTCCGTCAGTTTAATACGTTTAGCCCGACGATCGCTGGCACAAGTTTGACGCGAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGTACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGACTGGTCTGGAGGTAACTGATGGATATTGTGTAACGTAACCCAATG > NC_000913/1720532‑1720728 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |