BRESEQ :: Evidence

Predicted mutation
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RA	NC_000913	720,946	C→T	intergenic (+106/+110)	ybfK → / ← kdpE	uncharacterized protein/response regulator in two‑component regulatory system with KdpD

Read alignment evidence...
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*	NC_000913	720,946	0	C	T	100.0%	437.8 / NA	122	intergenic (+106/+110)	ybfK/kdpE	uncharacterized protein/response regulator in two‑component regulatory system with KdpD
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (62/60); total (62/60)

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ggTGAAGATATTCTATCCAGGAAATACGGTTGAACTGTGAAGGTGATCAATAAAAAATGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTTAGTa                                                                                            >  1:851242/1‑100 (MQ=255)

 gTGAAGATATTCTATCCAGGAAATACGGTTGAACTGTGAAGGTGATCAATAAAAAATGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTTAGTaa                                                                                           <  1:866214/100‑1 (MQ=255)

   gAAGATATTCTATCCAGGAAATACGGTTGAACTGTGAAGGTGATCAATAAAAAATGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTTAGTAata                                                                                         <  2:1820305/100‑1 (MQ=255)

     aGATATTCTATCCAGGAAATACGGTTGAACTGTGAAGGTGATCAATAAAAAATGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTTAGTAAtata                                                                                       <  1:84183/100‑1 (MQ=255)

         atTCTATCCAGGAAATACGGTTGAACTGTGAAGGTGATCAATAAAAAATGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTTAGTAATATAAAat                                                                                   >  1:2324935/1‑100 (MQ=255)

         atTCTATCCAGGAAATACGGTTGAACTGTGAAGGTGATCAATAAAAAATGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTTAGTAATATAAAat                                                                                   >  2:241417/1‑100 (MQ=255)

           tCTATCCAGGAAATACGGTTGAACTGTGAAGGTGATCAATAAAAAATGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTTAGTAATATAAAatat                                                                                 >  1:1682770/1‑100 (MQ=255)

            cTATCCAGGAAATACGGTTGAACTGTGAAGGTGATCAATAAAAAATGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTTAGTAATATAAAATAtt                                                                                >  2:257685/1‑100 (MQ=255)

              aTCCAGGAAATACGGTTGAACTGTGAAGGTGATCAATAAAAAATGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTATTTTTTTTTATAAAATATTGa                                                                              >  2:2248878/1‑100 (MQ=255)

                 cAGGAAATACGGTTGAACTGTGAAGGTGATCAATAAAAAATGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTGAAtt                                                                           >  1:655599/1‑100 (MQ=255)

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                     aaaTACGGTTGAACTGTGAAGGTGATCAATAAAAAATGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTGAATTGTTa                                                                       >  1:954624/1‑100 (MQ=255)

                      aaTACGGTTGAACTGTGAAGGTGATCAATAAAAAATGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTGAATTGTTAt                                                                      >  1:528318/1‑100 (MQ=255)

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                                                               aTCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATttattatta                             <  1:2256987/100‑1 (MQ=255)

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                                                                                        ttttACTTAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAaggcaggc    <  2:1396679/100‑1 (MQ=255)

                                                                                        ttttACTTAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAaggcagat    >  1:1404494/1‑98 (MQ=255)

                                                                                          ttACTTAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTg  <  2:1102350/100‑1 (MQ=255)

GGTGAAGATATTCTATCCAGGAAATACGGTTGAACTGTGAAGGTGATCAATAAAAAATGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTCAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTG  >  NC_000913/720851‑721040

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): `ATCG/ATCG` `< 3 ≤` `ATCG/ATCG` `< 22 ≤` `ATCG/ATCG` `< 32 ≤` `ATCG/ATCG` `< 41 ≤` `ATCG/ATCG`
Unaligned base: `atcg` Masked matching base: `atcg` Alignment gap: `‑` Deleted base: `‑`