| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,979,513 | T→C | intergenic (‑298/‑240) | insA ← / → uspC | IS1 repressor TnpA/universal stress protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,979,513 | 0 | T | C | 99.1% | 401.8 / ‑4.8 | 110 | intergenic (‑298/‑240) | insA/uspC | IS1 repressor TnpA/universal stress protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/1); new base C (62/47); total (62/48) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.36e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.98e-01 | |||||||||||
Only 100 of 114 total aligned reads displayed.
CTATAAATAATCACTTTCATGCAATACCAGATAAGCTATTTTTAAACAGACACTTACCGCACAACAAACTAATTAAATACAAAGAAAGGCAACAATCAACTTAATGTTAATGAAATGTTTTACATATATTAACCACTTGTTTAATGCGGAGAATCAGTACACTATTTTCTTATAATTACATTTGAAATTATA > NC_000913/1979418‑1979609 | tataAATAATCACTTTCATGCAATACCAGATAAGCTATTTTTAAACAGACACTTACCGCACAACAAACTAATTAAATACAAAGAAAGGCAACAACCAACt < 2:1551224/100‑1 (MQ=255) tataAATAATCACTTTCATGCAATACCAGATAAGCTATTTTTAAACAGACACTTACCGCACAACAAACTAATTAAATACAAAGAAAGGCAACAACCAACt < 2:1053234/100‑1 (MQ=255) ataaataaTCACTTTCATGCAATACCAGATAAGCTATTTTTAAACAGACACTTACCGCACAACAAACTAATTAAATACAAAGAAAGGCAACAACCAACtt > 2:271705/1‑100 (MQ=255) ataaataaTCACTTTCATGCAATACCAGATAAGCTATTTTTAAACAGACACTTACCGCACAACAAACTAATTAAATACAAAGAAAGGCAACAACCAACtt < 2:437075/100‑1 (MQ=255) taatCACTTTCATGCAATACCAGATAAGCTATTTTTAAACAGACACTTACCGCACAACAAACTAATTAAATACAAAGAAAGGCAACAACCAACttaatgt < 1:282118/100‑1 (MQ=255) atCACTTTCATGCAATACCAGATAAGCTATTTTTAAACAGACACTTACCGCACAACAAACTAATTAAATACAAAGAAAGGCAACAACCAACttaatgtta > 1:1131434/1‑100 (MQ=255) aCTTTCATGCAATACCAGATAAGCTATTTTTAAACAGACACTTTCCGCACAACAAACTAATTAAATACAAAGAAAGGCAACAACCAACttaatgttaatg < 2:1493771/100‑1 (MQ=255) aCTTTCATGCAATACCAGATAAGCTATTTTTAAACAGACACTTCCCGCACAACAAACTAATTAAATACAAAGAAAGGCAACAACCAACttaatgttaatn < 2:1491481/100‑2 (MQ=255) aCTTTCATGCAATACCAGATAAGCTATTTTTAAACAGACACTTACCGCACAACAAACTAATTAAATACAAAGAAAGGCAACAACCAACttaatgttaatg < 2:2030307/100‑1 (MQ=255) aCTTTCATGCAATACCAGATAAGCTATTTTTAAACAGACACTTACCGCACAACAAACTAATTAAATACAAAGAAAGGCAACAACCAACttaatgttaatg < 2:900239/100‑1 (MQ=255) aCTTTCATGCAATACCAGATAAGCTATTTTTAAACAGACACTTACCGCACAACAAACTAATTAAATACAAAGAAAGGCAACAACCAACttaatgttaatg < 2:939567/100‑1 (MQ=255) cTTTCATGCAATACCAGATAAGCTATTTTTAAACAGACACTTACCGCACAACAAACTAATTAAATACAAAGAAAGGCAACAACCAACTTAATGTTAATGa > 1:2334326/1‑100 (MQ=255) cTTTCATGCAATACCAGATAAGCTATTTTTAAACAGACACTTACCGCACAACAAACTAATTAAATACAAAGAAAGGCAACAACCAACTTAATGTTAATGa > 1:1853106/1‑100 (MQ=255) tGCAATACCAGATAAGCTATTTTTAAACAGACACTTACCGCACAACAAACTAATTAAATACAAAGAAAGGCAACAACCAACTTAATGTTAATGAAATGtt > 1:2286685/1‑100 (MQ=255) tGCAATACCAGATAAGCTATTTTTAAACAGACACTTACCGCACAACAAACTAATTAAATACAAAGAAAGGCAACAACCAACTTAATGTTAATGAAATGtt > 1:1128661/1‑100 (MQ=255) tGCAATACCAGATAAGCTATTTTTAAACAGACACTTACCGCACAACAAACTAATTAAATACAAAGAAAGGCAACAACCAACTTAATGTTAATGAAATGtt > 2:992734/1‑100 (MQ=255) gCAATACCAGATAAGCTATTTTTAAACAGACACTTACCGCACAACAAACTAATTAAATACAAAGAAAGGCAACAACCAACTTAATGTTAATGAAATGttt < 1:1954961/100‑1 (MQ=255) aTACCAGATAAGCTATTTTTAAACAGACACTTACCGCACAACAAACTAATTAAATACAAAGAAAGGCAACAACCAACTTAATGTTAATGAAATGTTTTAc > 2:529711/1‑100 (MQ=255) aTACCAGATAAGCTATTTTTAAACAGACACTTACCGCACAACAAACTAATTAAATACAAAGAAAGGCAACAACCAACTTAATGTTAATGAAATGTTTTAc > 2:293297/1‑100 (MQ=255) tACCAGATAAGCTATTTTTAAACAGACACTTACCGCACAACAAACTAATTAAATACAAAGAAAGGCAACAACCAACTTAATGTTAATGAAATGTTTTACa < 2:2146587/100‑1 (MQ=255) aCCAGATAAGCTATTTTTAAACAGACACTTACTGCACAACAAACTAATTAAATACAAAGAAAGGCAACAACCAACTTAATGTTAATGAAATGTTTTACat > 1:2213563/1‑100 (MQ=255) cAGATAAGCTATTTTTAAACAGACACTTACCGCACAACAAACTAATTAAATACAAAGAAAGGCAACAACCAACTTAATGTTAATGAAATGTTTTACatat > 2:1014109/1‑100 (MQ=255) cAGATAAGCTATTTTTAAACAGACACTTACCGCACAACAAACTAATTAAATACAAAGAAAGGCAACAACCAACTTAATGTTAATGAAATGTTTTACatat < 1:753882/100‑1 (MQ=255) aGATAAGCTATTTTTAAACAGACACTTACCGCACAACAAACTAATTAAATACAAAGAAAGGCAACAACCAACTTAATGTTAATGAAATGTTTTACatata < 1:2307556/100‑1 (MQ=255) aGATAAGCTATTTTTAAACAGACACTTACCGCACAACAAACTAATTAAATACAAAGAAAGGCAACAACCAACTTAATGTTAATGAAATGTTTTACatata > 1:1028650/1‑100 (MQ=255) aGATAAGCTATTTTTAAACAGACACTTACCGCACAACAAACTAATTAAATACAAAGAAAGGCAACAACCAACTTAATGTTAATGAAATGTTTTACatata > 1:1022660/1‑100 (MQ=255) aGATAAGCTATTTTTAAACAGACACTTACCGCACAACAAACTAATTAAATACAAAGAAAGGCAACAACCAACTTAATGTTAATGAAATGTTTTACatata < 1:920605/100‑1 (MQ=255) gATAAGCTATTTTTAAACAGACACTTACCGCACAACAAACTAATTAAATACAAAGAAAGGCAACAACCAACTTAATGTTAATGAAATGTTTTACatatat < 1:1695438/100‑1 (MQ=255) tAAGCTATTTTTAAACAGACACTTACCGCACAACAAACTAATTAAATACAAAGAAAGGCAACAACCAACTTAATGTTAATGAAATGTTTTACATATATTa < 2:1022658/100‑1 (MQ=255) gCTATTTTTAAACAGACACTTACCGCACAACAAACTAATTAAATACAAAGAAAGGCAACAACCAACTTAATGTTAATGACATGTTTTACATATATTCAcc > 1:1951615/1‑100 (MQ=255) gCTATTTTTAAACAGACACTTACCGCACAACAAACTAATTAAATACAAAGAAAGGCAACAACCAACTTAATGTTAATGAAATGTTTTACATATATTAAcc > 2:2262366/1‑100 (MQ=255) gCTATTTTTAAACAGACACTTACCGCACAACAAACTAATTAAATACAAAGAAAGGCAACAACCAACTTAATGTTAATGAAATGTTTTACATATATTAAcc > 2:242820/1‑100 (MQ=255) gCTATTTTTAAACAGACACTTACCGCACAACAAACTAATTAAATACAAAGAAAGGCAACAACCAACTTAATGTTAATGAAATGTTTTACATATATTAAc > 1:891562/1‑99 (MQ=255) cTATTTTTAAACAGACACTTACCGCACAACAAACTAATTAAATACAAAGAAAGGCAACAACCAACTTAATGTTAATGAAATGTTTTACATATATTAACCa > 2:246656/1‑100 (MQ=255) cTATTTTTAAACAAACACTTACCGCACAACAAACTAATTAAATACAAAGAAAGGCAACAACCAACTTAATGTTAATGAAATGTTTTACATATATTAAcc < 2:1237006/99‑1 (MQ=255) tATTTTTAAACAGACACTTACCGCACAACAAACTAATTAAATACAAAGAAAGGCAACAACCAACTTAATGTTAATGAAATGTTTGACATATATTAACCAc > 1:2302440/1‑100 (MQ=255) atctttAAACAGACACTTACCGCACAACAAACTAATTAAATACAAAGAAAGGCAACAACCAACTTAATGTTAATGAAATGTTTTACATATATTAACCACt < 1:911429/97‑1 (MQ=255) ttttAAACAGACACTTACCGCACAACAAACTAATTAAATACAAAGAAAGGCAACAACCAACTTAATGTTAATGAAATGTTTTACATATATTAACCACTTg < 2:2085889/100‑1 (MQ=255) tttAAACAGACACTTACCGCACAACAAACTAATTAAATACAAAGAAAGGCAACAACCAACTTAATGTTAATGAAATGTTTTACATATATTAACCACTTGt < 2:252396/100‑1 (MQ=255) ttAAACAGACACTTACCGCACAACAAACTAATTAAATACAAAGAAAGGCAACAACCAACTTAATGTTAATGAAATGTTTTACATATATTAACCACtagat > 2:911427/1‑96 (MQ=255) tAAACAGACACTTACCGCACAACAAACTAATTAAATACAAAGAAAGGCAACAACCAACTTAATGTTAATGAAATGTTTTACATATATTAACCACTTGttt > 2:1021105/1‑100 (MQ=255) aaCAGACACTTACCGCACAACAAACTAATTAAATACAAAGAAAGGCAACAACCAACTTAATGTTAATGAAATGTTTTACATATATTAACCACTTGTTTaa > 2:1632031/1‑100 (MQ=255) cAGACACTTACCGCACAACAAACTAATTAAATACAAAGAAAGGCAACAACCAACTTAATGTTAATGAAATGTTTTACATATATTAACCACTTGTTTAATg > 2:539467/1‑100 (MQ=255) cAGACACTTACCGCACAACAAACTAATTAAATACAAAGAAAGGCAACAACCAACTTAATGTTAATGAAATGTTTTACATATATTAACCACTTGTTTAATg > 2:539643/1‑100 (MQ=255) gACACTTACCGCACAACAAACTAATTAAATACAAAGAAAGGCAACAACCAACTTAATGTTAATGAAATGTTTTACATATATTAACCACTTGTTTAATGCg < 2:1322719/100‑1 (MQ=255) cacTTACCGCACAACAAACTAATTAAATACAAAGAAAGGCAACAACCAACTTAATGTTAATGAAATGTTTTACATATATTAACCACTTGTTTAATGCGga > 2:1397951/1‑100 (MQ=255) cacTTACCGCACAACAAACTAATTAAATACAAAGAAAGGCAACAACCAACTTAATGTTAATGAAATGTTTTACATATATTAACAACTTGTTTAATGCGga > 2:1397785/1‑100 (MQ=255) acTTACCGCACAACAAACTAATTAAATACAAAGAAAGGCAACAACCAACTTAATGTTAATGAAATGTTTTACATATATTAACCACTTGTTTAATGCGgag < 2:856112/100‑1 (MQ=255) acTTACCGCACAACAAACTAATTAAATACAAAGAAAGGCAACAACCAACTTAATGTTAATGAAATGTTTTACATATATTAACCACTTGTTTAATGCGgag < 2:1853101/100‑1 (MQ=255) acTTACCGCACAACAAACTAATTAAATACAAAGAAAGGCAACAACCAACTTAATGTTAATGAAATGTTTTACATATATTAACCACTTGTTTAATGCGgag < 2:19951/100‑1 (MQ=255) cTTACCGCACAACAAACTAATTAAATACAAAGAAAGGCAACAACCAACTTAATGTTAATGAAATGTTTTACATATATTAACCACTTGTTTAATGCGgaga > 1:1276094/1‑100 (MQ=255) ttccgatctcaaACTAATTAAATACAAAGAAAGGCAACAACCAACTTAATGTTAATGAAATGTTTTACATATATTAACCACTTGTTTAATGCGGAGAATc < 1:2042971/91‑1 (MQ=255) aCCGCACAACAAACTAATTAAATACAAAGAAAGGCAACAACCAACTTAATGTTAATGAAATGTTTTACATATATTAACCACTTGTTTAATGCGGAGAATc < 2:2191439/100‑1 (MQ=255) aCCGCACAACAAACTAATTAAATACAAAGAAAGGCAACAACCAACTTAATGTTAATGAAATGTTTTACATATATTAACCACTTGTTTAATGCGGAGAATc < 1:1014111/100‑1 (MQ=255) aCCGCACAACAAACTAATTAAATACAAAGAAAGGCAACAACCAACTTAATGTTAATGAAATGTTTTACATATATTAACCACTTGTTTAATGCGGAGAATc < 2:2233668/100‑1 (MQ=255) ccGCACAACAAACTAATTAAATACAAAGAAAGGCAACAACCAACTTAATGTTAATGAAATGTTTTACATATATTAACCACTTGTTTAATGCGGAGAATCa < 2:1002267/100‑1 (MQ=255) ccGCACAACAAACTAATTAAATACAAAGAAAGGCAACAACCAACTTAATGTTAATGAAATGTTTTACATATATTAACCACTTGTTTAATGCGGAGAATCa > 2:1702587/1‑100 (MQ=255) cGCACAACAAACTAATTAAATACAAAGAAAGGCAACAACCAACTTAATGTTAATGAAATGTTTTACATATATTAACCACTTGTTTAATGCGGAGAATCAg > 1:472864/1‑100 (MQ=255) cGCACAACAAACTAATTAAATACAAAGAAAGGCAACAACCAACTTAATGTTAATGAAATGATTTACATATATTAACCACTTGTTTAATGCGGAGAATCAg > 2:2216037/1‑100 (MQ=255) gCACAACAAACTAATTAAATACAAAGAAAGGCAACAACCAACTTAATGTTAATGAAATGTTTTACATATATTAACCACTTGTTTAATGCGGAGAATCAGt < 2:226951/100‑1 (MQ=255) gCACAACAAACTAATTAAATACAAAGAAAGGCAACAACCAACTTAATGTTAATGAAATGTTTTACATATATTAACCACTTGTTTAATGCGGAGAATCAGt > 1:2003327/1‑100 (MQ=255) gCACAACAAACTAATTAAATACAAAGAAAGGCAACAACCAACTTAATGTTAATGAAATGTTTTACATATATTAACCACTTGTTTAATGCGGAGAATCAGt < 1:1969049/100‑1 (MQ=255) tccgatcTAATTAAATACAAAGAAAGGCAACAACCAACTTAATGTTAATGAAATGTTTTACATATATTAACCACTTGTTTAATGCGGAGAATCAGTacac < 2:2216926/94‑1 (MQ=255) aacaaACTAATTAAATACAAAGAAAGGCAACAACCAACTTAATGTTAATGAAATGTTTTACATATATTAACCACTTGTTTAATGCGGAGAATCAGTacac > 1:1590030/1‑100 (MQ=255) acaaACTAATTAAATACAAAGAAAGGCAACAACCAACTTAATGTTAATGAAATGTTTTACATATATTAACCACTTGTTTAATGCGGAGAATCAGTACACt < 2:408869/100‑1 (MQ=255) acaaACTAATTAAATACAAAGAAAGGCAACAACCAACTTAATGTTAATGAAATGTTTTACATATATTAACCACTTGTTTAATGCGGAGAATCAGTACACt > 1:1152663/1‑100 (MQ=255) caaACTAATTAAATACAAAGAAAGGCAACAACCAACTTAATGTTAATGAAATGTTTTACATATATTAATCACTTGTTTAATGCGGAGAATCAGTACACTa > 1:288907/1‑100 (MQ=255) caaACTAATTAAATACAAAGAAAGGCAACAACCAACTTAATGTTAATGAAATGTTTTACATATATTAACCACTTGTTTAATGCGGAGAATCAgatcggaa > 2:2042964/1‑93 (MQ=255) caaACTAATTAAATACAAAGAAAGGCAACAACCAACTTAATGTTAATGAAATGTTTTACATATATTAACCACTTGTTTAATGCGGAGAATCAGTACACTa < 2:1127625/100‑1 (MQ=255) aaCTAATTAAATACAAAGAAAGGCAACAACCAACTTAATGTTAATGAAATGTTTTACATATATTAACCACTTGTTTAATGCGGAGAATCAGTACACTAtt > 2:1550350/1‑100 (MQ=255) cTAATTAAATACAAAGAAAGGCAACAACCAACTTAATGTTAATGAAATGTTTTACATATATTAACCACTTGTTTAATGCGGAGAATCAGTACACTAtttt > 2:974660/1‑100 (MQ=255) tAATTAAATACAAAGAAAGGCAACAATCAACTTAATGTTAATGAAATGTTTTACATATATTAACCACTTGTTTAATGCGGAGAATCAGTACACTATTTTc < 2:135587/100‑1 (MQ=255) aaTTAAATACAAAGAAAGGCAACAACCAACTTAATGTTAATGAAATGTTTTACATATATTAATCACTTGTTTAATGCGGAGAATCAGTACACTATTTTCt < 2:288905/100‑1 (MQ=255) aaTTAAATACAAAGAAAGGCAACAACCAACTTAATGTTAATGAAATGTTTTACATATATTAACCACTTGTTTAATGCGGAGAATCAGTacacagatcgga > 1:2216934/1‑92 (MQ=255) aaTTAAATACAAAGAAAGGCAACAACCAACTTAATGTTAATGAAATGTTTTACATATATTAACCACTTGTTTAATGCGGAGAATCAGTACACTATTTTCt < 1:783686/100‑1 (MQ=255) tctAAATACAAAGAAAGGCAACAACCAACTTAATGTTAATGAAATGTTTTACATATATTAACCACTTGTTTAATGCGGAGAATCAGTACACTATTTTCtt < 2:1982759/98‑1 (MQ=255) aTTAAATACAAAGAAAGGCAACAACCAACTTAATGTTAATGAAATGTTTTACATATATTAACCACTTGTTTAATGCGGAGAATCAGTACACTATTTTCtt > 2:1903215/1‑100 (MQ=255) ttAAATACAAAGAAAGGCAACAACCAACTTAATGTTAATGAAATGTTTTACATATATTAACCACTTGTTTAATGCGGAGAATCAGTACACTATTTTCTta < 2:2286676/100‑1 (MQ=255) tAAATACAAAGAAAGGCAACAACCAACTTAATGTTAATGAAATGTTTTACATATATTAACCACTTGTTTAATGCGGAGAATCAGTACACTATTTTCTtat < 1:1908218/100‑1 (MQ=255) aaaTACAAAGAAAGGCAACAACCAACTTAATGTTAATGAAATGTTTTACATATATTAACCACTTGTTTAATGCGGAGAATCAGTACACTATTTTCTtata > 2:992853/1‑100 (MQ=255) aaaTACAAAGAAAGGCAACAACCAACTTAATGTTAATGAAATGTTTTACATATATTAACCACTTGTTTAATGCGGAGAATCAGTACACTATTTTCTtaga > 1:1982766/1‑98 (MQ=255) cttccgatctgCAACAACCAACTTAATGTTAATGAAATGTTTTACATATATTAACCACTTGTTTAATGCGGAGAATCAGTACACTATTTTCTTATAATTa < 1:1774735/90‑1 (MQ=255) aCAAAGAAAGGCAACAACCAACTTAATGTTAATGAAATGTTTTACATATATTAACCACTTGTTTAATGCGGAGAATCAGTACACTATTTTCTTATAATTa > 2:1003908/1‑100 (MQ=255) aCAAAGAAAGGCAACAACCAACTTAATGTTAATGAAATGTTTTACATATATTAACCACTTGTTTAATGCGGAGAATCAGTACACTATTTTCTTATAATTa < 2:363283/100‑1 (MQ=255) cAAAGAAAGGCAACAACCAACTTAATGTTAATGAAATGTTTTACATATATTAACCACTTGTTTAATGCGGAGAATCAGTACACTATTTTCTTATAATTAc > 1:2263116/1‑100 (MQ=255) aagaaagGCAACAACCAACTTAATGTTAATGAAATGTTTTACATATATTAACCACTTGTTTAATGCGGAGAATCAGTACACTATTTTCTTATAATTACa > 1:1951619/1‑99 (MQ=255) aagaaagGCAACAACCAACTTAATGTTAATGAAATGTTTTACATATATTAACCACTTGTTTAATGCGGAGAATCAGTACACTATTTTCTTATAATTACAt < 2:240076/100‑1 (MQ=255) aagaaagGCAACAACCAACTTAATGTTAATGAAATGTTTTACATATATTAACCACTTGTTTAATGCGGAGAATCAGTACACTATTTTCTTATAATTACAt > 1:112617/1‑100 (MQ=255) aagaaagGCAACAACCAACTTAATGTTAATGAAATGTTTTACATATATTAACCACTTGTTTAATGCGGAGAATCAGTACACTATTTTCTTATAATTACAt < 1:271707/100‑1 (MQ=255) agaaagGCAACAACCAACTTAATGTTAATGAAATGTTTTACATATATTAACCACTTGTTTAATGCGGAGAATCAGTACACTATTTTCTTATAATTACAtt < 2:2213555/100‑1 (MQ=255) agaaagGCAACAACCAACTTAATGTTAATGAAATGTTTTACATATATTAACCACTTGTTTAATGCGGAGAATCAGTACACTATTTCCTTATAATTACAtt < 1:1632036/100‑1 (MQ=255) gaaagGCAACAACCAACTTAATGTTAATGAAATGTTTTACATATATTAACCACTTGATTAATGCGGAGAATCAGTACACTATTTTCTTATAATTACAttt > 1:715622/1‑100 (MQ=255) aaagGCAACAACCAACTTAATGTTAATGAAATGTTTTACATATATTAACCACTTGTTTAATGCGGAGAATCAGTACACTATTTTCTTATAATTACATTTg > 2:1548329/1‑100 (MQ=255) aagGCAACAACCAACTTAATGTTAATGAAATGTTTTACATATATTAACCACTTGTTTAATGCGGAGAATCAGTACACTATTTTCTTATAATTACATTTGa > 1:1678763/1‑100 (MQ=255) gCAACAACCAACTTAATGTTAATGAAATGTTTTACATATATTAACCACTTGTTTAATGCGGAGAATCAGTACACTATTTTCTTATAATTaagatcggaag > 2:1774730/1‑90 (MQ=255) gCAACAACCAACTTAATGTTAATGAAATGTTTTACATATATTAACCACTTGTTTAATGCGGAGAATCAGTACACTATTTTCTTATAATTACATTTGAAAt > 2:59672/1‑100 (MQ=255) caacaaCCAACTTAATGTTAATGAAATGTTTTACATATATTAACCACTTGTTTAATGCGGAGAATCAGTACACTATTTTCTTATAATTACATTTGAAAtt > 1:855978/1‑100 (MQ=255) caacaaCCAACTTAATGTTAATGAAATGTTTTACATATATTAACCACTTGTTTAATGCGGAGAATCAGTACACTATTTTCTTATAATTACATTTGAAAtt > 1:481978/1‑100 (MQ=255) acaaCCAACTTAATGTTAATGAAATGTTTTACATATATTAACCACTTGTTTAATGCGGAGAATCAGTACACTATTTTCTTATAATTACATTTGAAATtat > 1:367669/1‑100 (MQ=255) caaccaacTTAATGTTAATGAAATGTTTTACATATATTAACCACTTGTTTAATGCGGAGAATCAGTACACTATTTTCTTATAATTACATTTGAAATtata > 1:312438/1‑100 (MQ=255) | CTATAAATAATCACTTTCATGCAATACCAGATAAGCTATTTTTAAACAGACACTTACCGCACAACAAACTAATTAAATACAAAGAAAGGCAACAATCAACTTAATGTTAATGAAATGTTTTACATATATTAACCACTTGTTTAATGCGGAGAATCAGTACACTATTTTCTTATAATTACATTTGAAATTATA > NC_000913/1979418‑1979609 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |