| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,701,585 | Δ1 bp | 100% | coding (629/1173 nt) | malY → | PLP‑dependent beta‑cystathionase and maltose regulon regulator |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,701,582 | 0 | G | . | 53.7% | 140.9 / 220.8 | 95 | coding (626/1173 nt) | malY | PLP‑dependent beta‑cystathionase and maltose regulon regulator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (20/24); new base . (27/24); total (47/48) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.39e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.16e-01 | |||||||||||
Only 100 of 102 total aligned reads displayed.
GAAAGTGTGGACGTGCGATGAGCTGGAGATCATGGCTGACCTGTGCGAGCGTCATGGTGTGCGGGTTATTTCCGATGAAATCCATATGGATATGGTTTGGGGCGAGCAGCCGCATATTCCCTGGAGTAATGTGGCTCGCGGAGACTGGGCGTTGCTAACGTCGGGCTCGAAAAGTTTCAATATTCCCGCCCTGACCGG > NC_000913/1701484‑1701681 | gAAAGTGTGGACGTGCGATGAGCTGGAGATCATGGCAGACCTGTGCGAGCGTCATGGTGTGCGGGTTATTTCCGATGAAATCCATATGGATATGGTTTgg > 1:2916415/1‑100 (MQ=255) aaGTGTGGACGTGCGATGAGCTGGAGATCATGGCTGACCTGTGCGAGCGTCATGGTGTGCGGGTTATTTCCGATGAAATCCATATGGATATGGTTTgggg < 1:1696662/100‑1 (MQ=255) aGTGTGGACGTGCGATGAGCTGGAGATCATGGCTGACCTGTGCGAGCGTCATGGTGTGCGGGTTATTTCCGATGAAATCCATATGGATATGGTTTgggcg < 1:2467336/100‑3 (MQ=255) gtgtGGACGTGCGATGAGCTGGAGATCATGGCTGACCTGTGCGAGCGTCATGGTGTGCGGGTTATTTCCGATGAAATCCATATGGATATGGTTTgggcg < 2:3464150/99‑3 (MQ=255) tgtgGACGTGCGATGAGCTGGAGATCATGGCTGACCTGTGCGAGCGTCATGGTGTGCGGGTTATTTCCGATGAAATCCATATGGATATGGTTTgggcgag > 2:3212821/1‑96 (MQ=255) tgtgGACGTGCGATGAGCTGGAGATCATGGCTGACCTGTGCGAGCGTCATGGTGTGCGGGTTATTTCCGATGAAATCCATATGGATATGGTTTgggcgag < 2:2881870/100‑5 (MQ=255) gtgGACGTGCGATGAGCTGGAGATCATGGCTGACCTGTGCGAGCGTCATGGTGTGCGGGTTATTTCCGATGAAATCCATATGGATATGGTTTGGGGCGag < 1:721367/100‑1 (MQ=255) gtgGACGTGCGATGAGCTGGAGATCATGGCTGACCTGTGCGAGCGTCATGGTGTGCGGGTTATTTCCGATGAAATCCATATGGATATGGTTTGGGGCGag < 2:2883827/100‑1 (MQ=255) gtgGACGTGCGATGAGCTGGAGATCATGGCTGACCTGTGCGAGCGTCATGGTGTGCGGGTTATTTCCGATGAAATCCATATGGATATGGTTT‑GGGCGagc < 1:2543149/100‑1 (MQ=255) gACGTGCGATGAGCTGGAGATCATGGCTGACCTGTGCGAGCGTCATGGTGTGCGGGTTATTTCCGATGAAATCCATATGGATATGGTTTGGGGCGagcag > 1:1853022/1‑100 (MQ=255) gACGTGCGATGAGCTGGAGATCATGGCTGACCTGTGCGAGCGTCATGGTGTGCGGGTTATTTCCGATGAAATCCATATGGATATGGTTT‑GGGCGagcagc < 1:90003/100‑1 (MQ=255) cGTGCGATGTGCTGGAGTTCATGGCTGACCTGTGCGAGCGTGAGGGTGTGCGGGTTATTTCCGATGAAATACATGTGGATATGGTTTGGGGCGag < 2:1471504/95‑1 (MQ=255) cGTGCGACGAGCTGGAGATCATGGCTGACCTGTGCGAGCGTCATGGTGTGCGGGTTAGTTCCGATGAAATCCATATGGATATGGTTT‑GGGCGAGCAGCCg > 2:2894609/1‑100 (MQ=255) gTGCGATGGGCTGGAGATCATGGCTGACCTGTGGGAGCGTCATGGTGTGCGGGTTATTTCCGATGAAATCCATATGGATATGGTTT‑GGGCGAGCAGCCGc < 2:1307165/100‑1 (MQ=255) gTGCGATGAGCTGGAGATCATGGCTGACCTGTGCGAGCGTCATGGTGTGCGGGTTATTTCCGATGAAATCCATATGGATATGGTTT‑GGGCGAGCAGCCGc > 1:1743964/1‑100 (MQ=255) gTGCGATGAGCTGGAGATCATGGCTGACCTGTGCGAGCGTCATGGTGTGCGGGTTATTTCCGATGAAATCCATATGGATATGGTTT‑GGGCGAGCAGCCGc > 2:3174995/1‑100 (MQ=255) tGCGATGAGCTGGAGATCATGGCTGACCTGTGCGAGCGTCATGGTGTGCGGGTTATTTCCGATGAAATCCATATGGATATGGTTT‑GGGCGAGCCGCCGCa > 2:670175/1‑100 (MQ=255) tGCGATGAGCTGGAGATCATGGCTGACCTGTGCGAGCGTCATGGTGTGCGGGTTATTTCCGATGAAATCCATATGGATATGGTTT‑GGGCGAGCAGCCGCa < 1:295013/100‑1 (MQ=255) gCGATGAGCTGGAGATCATGGCTGACCTGTGCGAGCGTCATGGTGTGCGGGTTATTTCCGATGAAATCCATATGGATATGGTTTGGGGCGAGCAGCCGCa < 1:1191715/100‑1 (MQ=255) gCGATGAGCTGGAGATCATGGCTGACCTGTGCGAGCGTCATGGTGTGCGGGTTATTTCCGATGAAATCCATATGGATATGGTTTGGGGCGAGCAGCCGCa < 2:2158534/100‑1 (MQ=255) cGATGAGCTGGAGATCATGGCTGACCTGTGCGAGCGTCATGGTGTGCGGGTTATGTCCGATGAAATCCATATGGATATGGTTTGGGGCGAGCAGCCGCat < 2:1479159/100‑1 (MQ=255) aTGAGCTGGAGATCATGGCTGACCTGTGCGAGCGTCATGGTGTGCGGGTTATTTCCGATGAAATCCATATGGATATGGTTTGGGGCGAGCAGCCGCatat > 1:3671961/1‑100 (MQ=255) aTGAGCTGGAGATCATGGCTGACCTGTGCGAGCGTCATGGTGTGCGGGTTATTTCCGATGAAATCCATATGGATATGGTTT‑GGGCGAGCAGCCGCATAtt > 1:844490/1‑100 (MQ=255) gAGCTGGAGATCATGGCTGACCTGTGCGAGCGTCATGGTGTGCGGGTTATTTCCGATGAAATCCATATGGATATGGTTTGGGGCGAGCAGCCGCATATTc < 1:605865/100‑1 (MQ=255) aGCTGGAGATCATGGCTGACCTGTGCGAGCGTCATGGTGTGCGGGTTATTTCCGATGAAATCCATATGGATATGGTTT‑GGGCGAGCAGCCGCATATTccc < 1:2688828/100‑1 (MQ=255) gCTGGAGATCATGGCTGCCCTGTGCGAGCGTCATGGTTTGCGGGTTATTTCCGATGAAATCCATATGGATATGGTTT‑GGGCGAGCAGCCGCATATTccc < 2:3590979/99‑1 (MQ=255) tGGAGATCATGGCTGACCTGTGCGAGCGTCATGGTGTGCGGGTTATTTCCGATGAAATCCATATGGATATGGTTTGGGGCGAGCAGCCGCATATTCCCTg < 2:1888618/100‑1 (MQ=255) tGGAGATCATGGCTGACCTGTGCGAGCGTCATGGTGTGCGGGTTATTTCCGATGAAATCCATATGGATATGGTTT‑GGGCGAGCAGCCGCATATTCCCTgg < 1:1575047/100‑1 (MQ=255) tGGAGATCATGGCTGACCTGTGCGAGCGTCATGGTGTGCGGGTTATTTCCGATGAAATCCATATGGATATGGTTT‑GGGCGAGCAGCCGCATATTCCCTgg < 1:3812460/100‑1 (MQ=255) gaTCATGGCTGACCTGTGCGAGCGTCATGGTGTGCGGGTTATTTCCGATGAAATCCATATGGATATGGTTTGGGGCGAGCAGCCGCATATTCCCTGGAg < 2:829504/99‑1 (MQ=255) gaTCATGGCTGACCTGTGCGAGCGTCATGGTGTGCGGGTTATTTCCGATGAAATCCATATGGATATGGTTT‑GGGCGAGCAGCCGCATATTCCCTGGAGTa > 1:182351/1‑100 (MQ=255) aTGGCTGACCTGTGCGAGCGTCATGGTGGGCGGGTTATTTCCGATGAAATCCATATGGATATGGTTT‑GGGCGAGCAGCCGCATATTCCCTGGAGTAAtgt < 2:1528824/100‑1 (MQ=255) tGGCTGACCTGTGCGAGCGTCATGGTGTGCGGGTTATTTCCGATGAAATCCATATGGATATGGTTT‑GGGCGAGCAGCCGCATATTCCCTGGAGTAAtgtg < 1:2875415/100‑1 (MQ=255) ggCTGACCTGTGCGAGCGTCATGGTGTGCGGGTTATTTCCGATGAAATCCATATGGATATGGTTT‑GGGCGAGCAGCCGCATATTCCCTGGAGTAATGTgg > 2:2987796/1‑100 (MQ=255) ggCTGACCTGTGCGAGCGTCATGGTGTGCGGGTTATTTCCGATGAAATCCATATGGATATGGTTT‑GGGCGAGCAGCCGCATATTCCCTGGAGTAATGTgg < 2:2996851/100‑1 (MQ=255) gCTGACCTGTGCGAGCGTCATGGTGTGCGGGTTATTTCCGATGAAATCCATATGGATATGGTTTGGGGCGAGCAGCCGCATATTCCCTGGAGTAATGTgg > 1:1523550/1‑100 (MQ=255) gCTGACCTGTGCGAGCGTCATGGTGTGCGGGTTATTTCCGATGAAATCCATATGGATATGGTTT‑GGGCGAGCAGCCGCATATTCCCTGGAGTAATGTGGc < 1:2191532/100‑1 (MQ=255) gCTGACCTGTGCGAGCGTCACGGTGTGCGGGTTATTTCCGATGAAATCCATATGGATATGGTTTGGGGCGAGCAGCCGCATATTCCCTGGAGTAATGTgg > 2:2523921/1‑100 (MQ=255) tGACCTGTGCGAGCGTCATGGTGTGCGGGTTATTTCCGATGAAATCCATATGGATATGGTTT‑GGGCGAGCAGCCGCATATTCCCTGGAGTAATGTGGCTc > 1:3160036/1‑100 (MQ=255) aCCTGTGCGAGCGTCATGGTGTGCGGGTTATTTCCGATGAAATCCATATGGATATGGTTT‑GGGCGAGCAGCCGCATATTCCCTGGAGTAATGTGGCTcgc > 1:1687171/1‑100 (MQ=255) ccTGTGCGAGCGTCATGGTGTGCGGGTTATTTCCGATGAAATCCATATGGATATGGTTTGGGGCGAGCAGCCGCATATTCCCTGGAGTAATGTGGCTcgc > 1:726066/1‑100 (MQ=255) tgtgCGAGCGTCATGGTGTGCGGGTTATTTCCGATGAAATCCATATGGATATGGTTT‑GGGCGAGCAGCCGCATATTCCCTGGAGTAATGTGGCTCGCGga > 2:3202092/1‑100 (MQ=255) tgCGAGCGTCATGGTGTGCGGGTTATTTCCGATGAAATCCATATGGATATGGTTTGGGGCGAGCAGCCGCATATTCCCTGGAGTAATGTGGCTCGCGga < 1:761355/99‑1 (MQ=255) tgCGAGCGTCATGGTGTGCGGGTTATTTCCGATGAAATCCATATGGATATGGTTT‑GGGCGAGCAGCCGCATATTCCCTGGAGTAATGTGGCTCGCGgaga < 2:3720946/100‑1 (MQ=255) gCGAGCGTCATGGTGTGCGGGTTATTTCCGCTGAAATCCATATGGATGTGGTTTGGGGCGAGCAGCCGCATATTCCCTGGAGTAATGTGGCTCGCGgaga > 2:14665/1‑100 (MQ=255) gCGAGCGTCATGGTGTGCGGGTTATTTCCGATGAAATCCATATGGATATGGTTTGGGGCGAGCAGCCGCATATTCCCTGGAGTAATGTGGCTCGCgg < 2:2122006/97‑1 (MQ=255) gCGAGCGTCATGGTGTGCGGGTTATTTCCGATGAAATCCATATGGATATGGTTT‑GGGCGAGCAGCCGCATATTCCCTGGAGTAATGTGGCTCGCGGAGAc < 1:1161726/100‑1 (MQ=255) gAGCGTCATGGTGTGCGGGTTATTTCCGATGAAATCCATATGGATATGGTTTGGGGCGAGCAGCCGCATATTCCCTGGAGTAATGTGGCTCGCGGAGACt < 1:1822397/100‑1 (MQ=255) gAGCGTCATGGTGTGCGGGTTATTTCCGATGAAATCCATATGGATATGGTTT‑GGGCGAGCAGCCGCATATTCCCTGGAGTAATGTGGCTCGCGGAGACTg > 1:3794337/1‑100 (MQ=255) gTCATGGTGTGCGGGTTATTTCCGATGAAATCCATATGGATATGGTTTGGGGCGAGCAGCCGCATATTCCCTGGAGTAATGTGGCTCGCGGAGACTGGGc < 1:680318/100‑1 (MQ=255) gTCATGGTGTGCGGGTTATTTCCGATGAAATCCATATGGATATGGTTT‑GGGCGAGCAGCCGCATATTCCCTGGAGTAATGTGGCTCGCGGAGACTGGGCg > 1:541347/1‑100 (MQ=255) tCATGGTGTGCGGGTTATTTCCGATGAAATCCATATGGATATGGTTTGGGGCGAGCAGCCGCATATTCCCTGGAGTAATGTGGCTCGCGGAGACTGGGCg > 1:3887686/1‑100 (MQ=255) tGGTGTGCGGGTTATTTCCGATGAAATCCATATGGATATGGTTT‑GGGCGAGCAGCCGCATATTCCCTGGAGTAATGTGGCTCGCGGAGACTGGGCGTTGc > 1:3558051/1‑100 (MQ=255) tGGTGTGCGGGTTATTTCCGATGAAATCCATATGGATATGGTTT‑GGGCGAGCAGCCGCATATTCCCTGGAGTAATGTGGCTCGCGGAGACTGGGCGTTGc > 2:1861429/1‑100 (MQ=255) tGGTGTGCGGGTTATTTCCGATGAAATCCATATGGATATGGTTT‑GGGCGAGCAGCCGCATATTCCCTGGAGTAATGTGGCTCGCGGAGACTGGGCGTTGc < 2:3046567/100‑1 (MQ=255) ggTGTGCGGGTTATTTCCGATGAAATCCATATGGGTATGGGTTGGGGCGAGCAGCCGCATATTCGCTGGAGTGATGTGGCTCGCGGAGACTGGGCGTTGc > 2:4102180/1‑100 (MQ=255) ggTGTGCGGGTTATTTCCGATGAAATCCATATGGATATGGTTTGGGGCGAGCAGCCGCATATTCCCTGGAGTAATGTGGCTCGCGGAGACTGGGCGTTGc < 2:1275362/100‑1 (MQ=255) gtgtGCGGGTTATTTCCGATGAAATCCATATGGATATGGTTTGGGGCGGGCAGCCGCATATTCCCTGGAGTAATGTGGCTCGCGGAGACTGGGCGTTGCt < 1:2498908/100‑1 (MQ=255) gtgtGCGGGTTATTTCCGATGAAATCCATATGGATATGGTTT‑GGGCGAGCAGCCGCATATTCCCTGGAGTAATGTGGCTCGCGGAGACTGGGCGTTGCTa > 1:2488732/1‑100 (MQ=255) tgtgCGGGTTATTTCCGATGAAATCCATATGGATATGGTTT‑GGGCGAGCAGCCGCATATTCCCTGGAGTAATGTGGCTCGCGGAGACTGGGCGTTGCTaa < 1:1923197/100‑1 (MQ=255) gtgCGGGTTATTTCCGATGAAATCCATATGGATATGGTTTGGGGCGCGCAGCCGCATATTCCCTGGAGTAATGTGGCTCGCGGAGACTGGGCGTTGCTaa > 2:1343348/1‑100 (MQ=255) tgCGGGTTATTTCCGATGAAATCCATATGGATATGGTTT‑GGGCGAGCAGCCGCATATTCCCTGGAGTAATGTGGCTCGCGGAGACTGGGCGTTGCTAACg > 2:148345/1‑100 (MQ=255) cGGGTTATTTCCGATGAAATCCATATGGATATGGTTTGGGGCGAGCAGCCGCATATTCCCTGGAGTAATGTGGCTCGCGGAGACTGGGCGTTGCTAACGt > 1:965680/1‑100 (MQ=255) gggTTATTTCCGATGAAATCCATATGGATATGGTTT‑GGGCGAGCAGCCGCATATTCCCTGGAGTAATGTGGCTCGCGGAGACTGGGCGTTGCTAACGTCg < 1:3087498/100‑1 (MQ=255) gggTTATTTCCGATGAAATCCATATGGATATGGTTT‑GGGCGAGCAGCCGCATATTCCCTGGAGTAATGTGGCTCGCGGAGACTGGGCGTTGCTAACGTCg < 2:1976859/100‑1 (MQ=255) ggTTATTTCCGATGAAATCCATATGGATATGGTTTGGGGCGAGCAGCCGCATATTCCCTGGAGTAATGTGGCTCGCGGAGACTGGGCGTTGCTAACGTCg > 2:285887/1‑100 (MQ=255) ggTTATTTCCGATGAAATCCATATGGATATGGTTT‑GGGCGAGCAGCCGCATATTCCCTGGAGTAATGTGGCTCGCGGAGACTGGGCGTTGCTAACGTCgg > 2:923843/1‑100 (MQ=255) ttATTTCCGATGAAATCCATATGGATATGGTTT‑GGGCGAGCAGCCGCATATTCCCTGGAGTAATGTGGCTAGCGGAGACTGGGCGTTGCTAACGTCGGGc > 2:3687378/1‑100 (MQ=255) tATTTCCGATGAAATCCATATGGCTCTGGTTTGGGGCGCGCGGCCGCATAGTCACCGGAGTAATGTGGCTCGCGGAGACTGGGCGTTGCTAACGTCGGGc < 2:2466916/100‑1 (MQ=255) aTTTCCGATGAAATCGATATGGATATGGCTCGGGGCGCGCAGCCACAGAGTCCCTGGAGTAATGTGGCTCCCGGAGACTGGGCGTCTCTAACGTCgagt < 2:813685/99‑4 (MQ=255) tttCCGATGAAATCCATATGGATATGGTTTGGGGCGAGCAGCCGCATATTCCCTGGAGTAATGTGGCTCGCGGAGACTGGGCGTTGCTAACGTCGGGCTc < 2:587865/100‑1 (MQ=255) tttCCGATGAAATCCATATGGATATGGTTT‑GGGCGAGCAGCCGCATATTCCCTGGAGTAATGTGGCTCGCGGAGACTGGGCGTTGCTAAAGTc > 2:1783830/1‑93 (MQ=255) ttCCGATGAAATCCATATGGATATGGTTT‑GGGCGAGCAGCCGCATATTCCCTGGAGTAATGTGGCTCGCGGAGACTGGGCGTTGCTAACGTCGGGCTCGa < 1:903461/100‑1 (MQ=255) ttCCGATGAAATCCATATGGATATGGTTT‑GGGCGAGCAGCCGCATATTCCCTGGAGTAATGTGGCTCGCGGAGACTGGGCGTTGCTAACGTCGGGCTCGa < 2:2964308/100‑1 (MQ=255) tCCGATGAAATCCATATGGATATGGTTT‑GGGCGAGCAGCCGCATATTCCCTGGAGTAATGTGGCTCGCGGAGACTGGGCGTTGCTAACGTCGGGCTCGaa > 1:1624411/1‑100 (MQ=255) ccGATGAAATCCATATGGATATGGTTT‑GGGCGAGCAGCCGCATATTCCCTGGAGTAATGTGGCTCGCGGAGACTGGGCGTTGCTAACGTCGGGCTCGaaa < 2:132920/100‑1 (MQ=255) ccGATGAAATCCATATGGATATGGTTT‑GGGCGAGCAGCCGCATATTCCCTGGAGTAATGTGGCTCGCGGAGAATGGGCGTTGCTAACGTCGGGCTCGaaa > 2:3402854/1‑100 (MQ=255) gATGAAATCCATATGGATATGGTTTGGGGCGAGCAGCCGCATATTCCCTGGAGTAATGTGGCTCGCGGAGACTGGGCGTTGCTAACGTCGGGCTCGaaaa < 2:1613761/100‑1 (MQ=255) aaaTCCATATGGATATGGTTTGGGGCGAGCAGCCGCATATTCCCTGGAGTAATGTGGCTCGCGGAGACTGGGCGTTGCTAACGTCGGGCTCGAAAAGttt > 2:1522150/1‑100 (MQ=255) aaaTCCATATGGATATGGTTT‑GGGCGAGCAGCCGCATATTCCCTGGAGTAATGTGGCTCGCGGAGACTGGGCGTTGCTAACGTCGGGCTCGAAAAGTTTc < 1:1861442/100‑1 (MQ=255) aaTCCATATGGATATGGTTT‑GGGCGAGCAGCCGCATATTCCCTGGAGTAATGTGGCTCGCGGAGGCTGGGCGTTGCTGACGTCGGGCTCGAAAAGTTTc > 2:3824155/1‑99 (MQ=255) aaTCCATATGGATATGGTTT‑GGGCGAGCAGCCGCATATTCCCTGGAGTAATGTGGCTCGCGGAGACTGGGCGTTGCTAACGTCGGGCTCGAAAAGTTTCa > 1:2154789/1‑100 (MQ=255) aaTCCATATGGATATGGTTT‑GGGCGAGCAGCCGCATATTCCCTGGAGTAATGTGGCTCGCGGAGACTGGGCGTTGCTAACGTCGGGCTCGAAAAGTTTCa < 1:724612/100‑1 (MQ=255) aaTCCATATGGATATGGTTT‑GGGCGAGCAGCCGCATATTCCCTGGAGTAATGTGGCTCGCGGAGACTGGGCGTTGCTAACGTCGGGCTCGAAAAGTTTCa > 1:560677/1‑100 (MQ=255) aTCCATATGGATATGGTTT‑GGGCGAGCAGCCGCATATTCCCTGGAGTAATGTGGCTCGCGGAGACTGGGCGTTGCTAACGTCGGGCTCGAAAAGTTTCaa < 1:3694209/100‑1 (MQ=255) tctggatatggTTTGGGGCGAGCAGCCGCATGTTCCCTGGAGAAATGTGGCTCGCGGAGACTGGGCGTTGCTAACGTCGGGCTCGAAAAGTTTCAATAtt > 1:2794784/3‑100 (MQ=255) tatggatatggTTTGGGGCGAGCAGCCGCATATTCCCTGGAGTAATGTGGCTCGCGGAGACTGGGCGTTGCTAACGTCGGGCTCGAAAAGTTTCAATAtt > 2:65821/1‑100 (MQ=255) atggatatggTTT‑GGGCGAGCAGCCGCATATTCCCTGGAGTAATGTGGCTCGCGGAGACTGGGCGTTGCTAACGTCGGGCTCGAAAAGTTTCAATATTcc > 1:3589583/1‑100 (MQ=255) tggatatggTTTGGGGCGAGCAGCCGCATATTCCCTGGAGTAATGTGGCTCGCGGAGACTGGGCGTTGCTAACGTCGGGCTCGAAAAGTTTCAATATTcc < 1:45979/100‑1 (MQ=255) ggatatggTTTGGGGCGAGCAGCCGCATATTCCCTGGAGTAATGTGGCTCGCGGAGACTGGGCGTTGCTAACGTCGGGCTCGAAAAGTTTCAATATTccc > 2:3627653/1‑100 (MQ=255) ggatatggTTTGGGGCGAGCAGCCGCATATTCCCTGGAGGAATGTGGCTCGCGGAGACTGGGCGTTGCTAACGTCGGGCGCGAAAAGTTTCAATAtttc > 2:3790595/1‑97 (MQ=255) gatatggTTTGGGGCGAGCAGCCGCATATTCCCTGGAGTAATGTGGCTCGCGGAGACTGGGCGTTGCTAACGTCGGGCTCGAAAAGTTTCAATATTCCCg < 2:4095563/100‑1 (MQ=255) gatatggTTT‑GGGCGAGCAGCCGCATATTCCCTGGAGTAATGTGGCTCGCGGAGACTGGGCGTTGCTAACGTCGGGCTCGAAAAGTTTCAATATTcccac > 2:2516038/1‑98 (MQ=255) tatggTTT‑GGGCGAGCAGCCGCATATTCCCTGGAGTAATGTGGCTCGCGGAGCCTGGGCGTTGCTAACGTCGGGCTCGACAAGTTTCAATACTCCCGccc > 2:1965296/1‑100 (MQ=255) atggTTTGGGGCGAGCAGCCGCATATTCCCTGGAGTAATGTGGCTCGCGGAGACTGGGCGTTGCTAACGTCGGGCTCGAAAAGTTTCAATATTCCCGcc < 2:865527/99‑1 (MQ=255) tggTTTGGGGCGAGCAGCCGCATATTCCCTGGAGTAATGTGGCTCGCGGAGACTGGGCGTTGCTAACGTCGGGCTCGAAAAGTTTCAATATTCCCGCCCt > 1:2358189/1‑100 (MQ=255) tggTTTGGGGCGAGCAGCCGCATATTCCCTGGAGTAATGTGGCTCGCGGAGACTGGGCGTTGCTAACGTCGGGCTCGAAAAGTTTCAATATTCCCGCCCt < 1:3274975/100‑1 (MQ=255) ggTTTGGGGCGAGCAGCCGCATATTCCCTGGAGGAATGTGGCTCGCGGAGACTGGGCGTTGCTAACGTCGGGCTCGAAAAGTTTCAATATTCCCGcc < 2:2924459/97‑1 (MQ=255) tttGGGGCGAGCAGCCGCATATTCCCTGGAGTAATGTGGCTCGCGGAGACTGGGCGTTGCTAACGTCGGGCTCGAAAAGTTTCAATATTCCCGCCCTGAc > 1:3685935/1‑100 (MQ=255) ggggCGAGCAGCCGCATATTCCCTGGAGTAATGTGGCTCGCGGAGACTGGGCGTTGCTAACGTCGGGCTCGAAAAGTTTCAATATTCCCGCCCTGACCgg > 2:1492790/1‑100 (MQ=255) | GAAAGTGTGGACGTGCGATGAGCTGGAGATCATGGCTGACCTGTGCGAGCGTCATGGTGTGCGGGTTATTTCCGATGAAATCCATATGGATATGGTTTGGGGCGAGCAGCCGCATATTCCCTGGAGTAATGTGGCTCGCGGAGACTGGGCGTTGCTAACGTCGGGCTCGAAAAGTTTCAATATTCCCGCCCTGACCGG > NC_000913/1701484‑1701681 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |