| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,712,518 | (C)6→5 | 100% | intergenic (+360/‑251) | nth → / → dtpA | DNA glycosylase and apyrimidinic (AP) lyase (endonuclease III)/dipeptide and tripeptide permease A |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,712,513 | 0 | C | . | 99.0% | 474.7 / ‑2.1 | 103 | intergenic (+355/‑256) | nth/dtpA | DNA glycosylase and apyrimidinic (AP) lyase (endonuclease III)/dipeptide and tripeptide permease A |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/1); new base . (58/44); total (58/45) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.37e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.52e-01 | |||||||||||
Only 100 of 116 total aligned reads displayed.
TATTGACCTACAAAACATTACACTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCACCCCCCTCTCAGTGCAGTG‑AAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGAATGGTTGAATTCCCCGCCTCA > NC_000913/1712414‑1712608 | tatTGAGCTACAAAACATTACACTGGCTATTTTTCAGAAACTGTACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCAc < 2:2395192/100‑1 (MQ=255)tatTGACCTACAAAACATTACACTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCAc > 2:1148837/1‑100 (MQ=255) gACCTACAAAACATTACACTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCAccccc > 1:3987537/1‑100 (MQ=255) gACCTACAAAACATTACACTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCAccccc < 2:348347/100‑1 (MQ=255) gACCTACAAAACATTACACTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCAccccc < 2:3296618/100‑1 (MQ=255) gACCTACAAAACATTACACTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCAcccac > 2:3869918/1‑98 (MQ=255) aCCTACAAAACATTACACTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCAccccct > 1:905572/1‑99 (MQ=255) aCCTACAAAACATTACACTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCAcccccc < 1:3696070/100‑1 (MQ=255) ccTACAAAACATTACACTGGCTATTTTTTTTTTTTTTTACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCAccccc > 2:697512/1‑98 (MQ=255) ccTACAAAACATTACACTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCAccccctc < 1:1588989/100‑3 (MQ=255) cTACAAAACATTACACTGGCTATTTTTTTTTTTTTTTTCTATCTCAATAGTAAAAACGCTAAATATCAGAACATATCGCCGTTAAGCGATCAccccctc > 2:3654428/1‑97 (MQ=255) cTACAAAACATTACACTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCAccccctct < 1:2939720/100‑4 (MQ=255) aCAAAACATTACACTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATATCAGAACATATCGCCATTAAGCCATTActccctctc > 2:2040698/1‑95 (MQ=255) aCAAAACATTACACTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCTCTca > 2:3890549/1‑100 (MQ=255) aCAAAACATTACACTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCTCTca > 1:3125122/1‑100 (MQ=255) aCAAAACATTACACTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCTCTca > 1:1440401/1‑100 (MQ=255) aaaaCATTACACTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCTCTcagt < 2:3960395/100‑1 (MQ=255) aaaaCATTACACTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCTCTcagt < 2:3369092/100‑1 (MQ=255) aaaCATTACACTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCTCTcagtg < 2:3791678/100‑1 (MQ=255) aCATTACACTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCTCTcagtgca < 2:358852/100‑1 (MQ=255) aCATTACACTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCTCTcagtgc < 2:513788/99‑1 (MQ=255) cATTACACTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCTCTcagtgcag < 2:3259317/100‑1 (MQ=255) cATTACACTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCTCTcagtgcag < 1:1689994/100‑1 (MQ=255) aTTACACTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCTCTcagtgcagt > 1:881600/1‑100 (MQ=255) acacTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCTCTCAGTGCAGTG‑aa > 1:3009144/1‑100 (MQ=255) cacTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCTCTCAGTGCAGTG‑aaa < 1:2459279/100‑1 (MQ=255) cTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCTCTCAGTGCAGTG‑AAAAAATc < 2:3879040/99‑1 (MQ=255) cTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCTCTCAGTGCAGTG‑AAAAAATCt > 1:3241995/1‑100 (MQ=255) tATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCTCTCAGTGCAGTG‑AAAAAATCTg < 2:4049751/100‑1 (MQ=255) tttttCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCTCTCAGTGCAGTG‑AAAAAATCTGc > 2:2570863/1‑99 (MQ=255) ttCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCTCTCAGTGCAGTG‑AAAAAATCTGCCGtt > 1:1433449/1‑100 (MQ=255) cAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCTCTCAGTGCAGTG‑AAAAAATCTGCCGTTAc > 2:3639477/1‑100 (MQ=255) cAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCTCTCAGTGCAGTG‑AAAAAATCTGCCGTTAc > 2:271895/1‑100 (MQ=255) cAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCTCTCAGTGCAGTG‑AAAAAATCTGCCGTTAc > 1:1543454/1‑100 (MQ=255) aGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCTCTCAGTGCAGTG‑AAAAAATCTGCCGTTACg > 2:2802865/1‑100 (MQ=255) gAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCGAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CACACACTCACTGCAGTG‑AAAAAATCTGCCGTTACg > 2:3779605/1‑99 (MQ=255) aaCTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCCTCA‑CCCCCTCTCAATGCATTG‑AAAAAATCTGACGTTACAtt > 2:1139678/1‑99 (MQ=255) cTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAAATCTGCCGTTACGtttt > 2:1448/1‑100 (MQ=255) ggACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCTCTCAGTGCAGTG‑AAAAAATCTGCCGTTACGtttttt > 1:53797/1‑99 (MQ=255) ggACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCTCTCAGTGCAGTG‑AAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTg < 1:1109514/100‑1 (MQ=255) ggACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCTCTCAGTGCAGTG‑AAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTg < 1:52978/100‑1 (MQ=255) ggACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCTCTCAGTGCAGTG‑AAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTg < 1:885747/100‑1 (MQ=255) gACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCTCTCAGTGCAGTG‑AAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTg < 2:3987511/99‑1 (MQ=255) aCTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CACACTCTCAGTGCAGTG‑AAAAAATCTACCGTTAAGTTTTTTg < 2:623259/98‑1 (MQ=255) cTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCTCTCAGTGCAGTG‑AAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGaaa < 1:4098489/100‑1 (MQ=255) aTCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCTCTCAGTGCAGTG‑AAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGaaaa > 2:3423709/1‑99 (MQ=255) ctcACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCTCTCAGTGCAGTG‑AAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAATAAtt > 2:2615561/1‑100 (MQ=255) ctcACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCTCTCAGTGCAGTG‑AAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAAtt > 1:3298432/1‑100 (MQ=255) tcACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCTCTCAGTGAAGTG‑AAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAAttt > 2:2890426/1‑100 (MQ=255) cACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCTCTCAGTGCAGTG‑AAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTa > 1:3422072/1‑100 (MQ=255) aatAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATAGCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCTCTAAAAACAGAA‑AAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAAt < 2:838008/94‑1 (MQ=255) tAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCTCTCAGTGCAGTG‑AAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAAc > 2:1693214/1‑99 (MQ=255) gTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCTCTCAGTGCAGTG‑AAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCt > 2:1120708/1‑100 (MQ=255) gTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCTCTCAGTGCAGTG‑AAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCt < 2:790280/100‑1 (MQ=255) aaaaaCGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCTCTCAGTGCAGTG‑AAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTgg < 1:875783/100‑1 (MQ=255) aaaaaCGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCTCTCAGTGCAGTG‑AAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTgg > 1:1803441/1‑100 (MQ=255) aaaaaCGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCTCTCAGTGCAGTG‑AAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTgg < 2:1619412/100‑1 (MQ=255) aaaaaCGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCTCTCAGTGCAGTG‑AAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTgg > 1:3730906/1‑100 (MQ=255) aaaaaCGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGACATCA‑CCCCCTCTCAGTGCAGTG‑CAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGCAAAATTTAACGCTgg < 2:1219950/100‑1 (MQ=255) aaaaCGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCTCTCAGTGCAGTG‑AAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGa > 1:4106947/1‑100 (MQ=255) aaaaCGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCTCTCAGTGCAGTG‑AAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGa < 1:3402971/100‑1 (MQ=255) aaCGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCACCCCCCTCTCAGTGCAGTG‑AAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGAt < 1:1148844/100‑1 (MQ=255) cGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCTCTCAGTGCAGTG‑AAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAAc < 1:2322071/100‑1 (MQ=255) cGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCTCTCAGTGCAGTG‑AAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAAc > 1:3738092/1‑100 (MQ=255) gCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCTCTCAGTGCAGTG‑AAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAACa < 2:3749203/100‑1 (MQ=255) cTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCTCTCAGTGCAGTG‑AAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAACTTTAACGCTGGATAACAt > 2:1592813/1‑100 (MQ=255) tAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCTCTCAGTGCAGTG‑AAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAACAtt > 1:3998499/1‑100 (MQ=255) aaaTAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCTCTCAGTGCAGTG‑AAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAACAttt > 1:1050767/1‑100 (MQ=255) aaaTAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCTCTCAGTGCAGTG‑AAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAACAttt > 1:2104364/1‑100 (MQ=255) aaaTAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCTCTCAGTGCAGTG‑AAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAACAttt > 1:1947982/1‑100 (MQ=255) aaaTAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCTCTCAGTGCAGTG‑AAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAACAttt > 2:3377826/1‑100 (MQ=255) tAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCTCTCAGTGCAGTG‑AAAAAAGCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAACATTTccc < 2:2295477/100‑1 (MQ=255) aGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCTCTCAGTGCAGTG‑AAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCg > 1:595684/1‑100 (MQ=255) gCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCTCTCAGTGCAGTG‑AAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATATCATTTCCCgg > 2:2705784/1‑100 (MQ=255) gCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCTCTCAGTGCAGTG‑AAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCgg < 1:3377846/100‑1 (MQ=255) gCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCTCTCAGTGCAGTG‑AAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCgg > 1:2885229/1‑100 (MQ=255) gCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCTCTCAGTGCAGTG‑AAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCgg > 1:2356382/1‑100 (MQ=255) gCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCTCTCAGTGCAGTG‑AAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCgg > 1:3819180/1‑100 (MQ=255) cAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCTCTCAGTGCAGTG‑AAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGa < 1:1184204/100‑1 (MQ=255) gAACATATCGCCGTTAAGCCCTCA‑CCCCCTCTCCGTGCAGTG‑AAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCgg < 2:2404173/97‑1 (MQ=255) aaCATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCTCTCAGTGCAGTG‑AAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGAATg > 2:1774220/1‑100 (MQ=255) gatctCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCTCTCAGTGCAGTG‑AAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGAATGGt < 2:3202248/96‑1 (MQ=255) cATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCTCTCAGTGCAGTG‑AAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGAATGGt > 1:2968401/1‑100 (MQ=255) atatCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCTCTCAGTGCAGTG‑AAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGAATGGtt < 1:1345458/100‑1 (MQ=255) tatTGCCGTTAAGCCATCA‑ACCCCTGTCAGTGAAATG‑GAAAAATCTGCCGTTACGTTGTTTGAAAAATTGAACGCTGGATAACATTTCCCGGAATGGTTg < 2:77844/100‑1 (MQ=255) tatCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCTCTCAGTGCAGTG‑AAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGAATGGTTg < 2:1114760/100‑1 (MQ=255) tatCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCTCTCAGTGCAGTG‑AAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGAATGGTTg < 2:1114831/100‑1 (MQ=255) tatCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCTCTCAGTGCAGTG‑AAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGAATGGTTg < 1:577099/100‑1 (MQ=255) tatCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCTCTCAGTGCAGTG‑AAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGAATGGTTg > 1:3123619/1‑100 (MQ=255) atCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCTCTCAGTGCAGTG‑AAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTACCGCTGGATAACATTTCCCGGAATGGTTg > 2:1747230/1‑99 (MQ=255) atCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCTCTCAGTGCAGTG‑AAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGAATGGTTGa > 1:1242393/1‑100 (MQ=255) ngCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCTCTCAGTGCAGTG‑AAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGAATGGTTGAAt > 1:1709919/2‑100 (MQ=255) caccattAAGCCATCA‑CCCCCTCTCAGTGCAGTG‑AAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGAATGGTTGAAt < 2:1235797/95‑1 (MQ=255) cGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCTCTCAGTGCAGTG‑AAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGAATGGtagatc > 1:3202267/1‑95 (MQ=255) gCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCTCTCAGTGCAGTG‑AAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGAATGGTTGAAtt > 2:2952267/1‑100 (MQ=255) cGTTAAGCCATCA‑CCCCCTCTCAGTGCAGTG‑AAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGAATGGTTGAATTcc < 1:531445/100‑1 (MQ=255) aGCCATCA‑CCCCCTCTCAGTGCAGTG‑AAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTTTTTTTTTTTACACTGGAAAACATTTCCCGGAATGGTTTAATTcc > 2:2342759/1‑95 (MQ=255) aGCCATCA‑CCCCCTCTCAGTGCAGTG‑AAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGAATGGTTGAATTCCCCGcc < 1:3260850/100‑1 (MQ=255) cATCA‑CCCCCTCTCAGTGCAGTG‑AAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGAATGGTTGAATTCCCCGCCTCa > 1:554152/1‑100 (MQ=255) cATCA‑CCCCCTCTCAGTGCAGTG‑AAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGAATGGTTGAATTCCCCGCCTCa > 1:1067578/1‑100 (MQ=255) | TATTGACCTACAAAACATTACACTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCACCCCCCTCTCAGTGCAGTG‑AAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGAATGGTTGAATTCCCCGCCTCA > NC_000913/1712414‑1712608 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |