| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,165,590 | Δ1 bp | 100% | intergenic (+69/‑78) | yegP → / → yegQ | UPF0339 family protein/putative peptidase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,165,588 | 0 | C | . | 59.3% | 73.9 / 283.0 | 140 | intergenic (+67/‑80) | yegP/yegQ | UPF0339 family protein/putative peptidase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (22/35); new base . (35/48); total (57/83) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.28e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.38e-01 | |||||||||||
Only 100 of 151 total aligned reads displayed.
GGCACAAGCCAGACGGTGAAAGACAATACGTAATTACGATGCCGGGCGTGGGTTGTTGGCGTCCGGCGCTTTACCAGAGCCCCCCACAGCGCTACAATGCCCGCCCTTAAAGTGGGGGCACTCCCCTAACCGCTTCATCAGGTGAAGCGGATCTGACCTGTCATCAGAACGAGAGAATTATGTTTAAACCGGAACTCC > NC_000913/2165489‑2165686 | gCACAAGCCAGACGGTGAAAGACAATACGTAATTACGATGCCGGGCGTGGGTTGTTGGCGTCCGGCGCTTTACCAGAGCCCCCCACAGCGCTACAATgcc > 1:3318434/1‑100 (MQ=255) cacaAGCCAGACGGTGAAAGACAATACGTAATTACGATGCCGGGCGTGGGTTGTTGGCGTCCGGCGCTTTACCAGAGCCCCCCACAGCGCTACAATgccc > 1:1904809/1‑100 (MQ=255) cacaAGCCAGACGGTGAAAGACAATACGTAATTACGATGCCGGGCGTGGGTTGTTGGCGTCCGGCGCTTTACCAGAGCCCCCCACAGCGCTACAATgccc > 1:3593024/1‑100 (MQ=255) acaAGCCAGACGGTGAAAGACAATACGTAATTACGATGCCGGGCGTGGGTTGTTGGCGTCCGGCGCTTTACCAGAGCCCCCCACAGCGCTACAATgcccg < 1:1288873/100‑1 (MQ=255) acaAGCCAGACGGTGAAAGACAATACGTAATTACGATGCCGGGCGGGGGTTGTTGGCGTCCGGCGCTTTACCAGAGCCCCCCACAGCGCTACAATgccgc > 2:1122564/1‑98 (MQ=255) caAGCCAGACGGTGAAAGACAATACGTAATTACGATGCCGGGCGTGGGTGGTTGGCGTCCGGCGCTTTACCAGAGCCCCCCACAGCGCTACAATgccgc > 2:2666683/1‑97 (MQ=255) ccAGACGGTGAAAGACAATACGTAATTACGATGCCGGGCGTGGGTTGTTGGCGTCCGGCGCTTTACCAGAGCCCCCCACAGCGCTACAATG‑CCGCCCTTa > 2:2790622/1‑100 (MQ=255) cAGACGGTGAAAGACAATACGTAATTACGATGCCGGGCGTGGGTTGTTGGCGTCCGGCGCTTTACCAGAGCCCCCCACAGCGCTACAATGCCCGCCCTTa < 1:1582142/100‑1 (MQ=255) cAGACGGTGAAAGACAATACGTAATTACGATGCCGGGCGTGGGTTGTTGGCGTCCGGCGCTTTACCAGAGCCCCCCACAGCGCTACAATG‑CCGCCCTTaa > 2:1464296/1‑100 (MQ=255) gACGGTGAAAGACAATACGTAATTACGATGCCGGGCGTGGGTTGTTGGCGTCCGGCGCTTTACCAGAGCCCCCCACAGCGCTACAATGCCCGCCCTTaaa > 1:3949231/1‑100 (MQ=255) gACGGTGAAAGACAATACGTAATTACGATGCCGGGCGTGGGTTGTTGGCGTCCGGCGCTTTACCAGAGCCCCCCACAGCGCTACAATG‑CCGCCCTTAAAg > 2:3055689/1‑100 (MQ=255) aCGGTGAAAGACAATACGTAATTACGATGCCGGGCGTGGGTTGTTGGCGTCCGGCGCTTTACCAGAGCCCCCCACAGCGCTACAATG‑CCGCCCTTAAAGt < 2:3850568/100‑1 (MQ=255) cGGTGAAAGACAATACGTAATTACGATGCCGGGCGTGGGTTGTTGGCGTCCGGCGCTTTACCAGAGCCCCCCACAGCGCTACAATG‑CCGCCCTTAAAGTg > 1:2588813/1‑100 (MQ=255) ggTGAAAGTCAATACGTAATTACGATGCCGGGCGTGGGTTGTTGGCGTCCGGCGCTTTACCAGAGCCCCCCACAGCGCTACAATG‑CCGCCCTTAAAGTgg < 2:1226877/100‑1 (MQ=255) ggTGAAAGACAATACGTAATTACGATGCCGGGCGTGGGTTGTTGGCGTCCGGCGCTTTACCAGAGCCCCCCACAGCGCTACAATG‑CCGCCCTTAAAGTgg > 1:2814566/1‑100 (MQ=255) gTGAAAGACAATACGTAATTACGATGCCGGGCGTGGGTTGTTGGCGTCCGGCGCTTTACCAGAGCCCCCCACAGCGCTACAATG‑CCGCCCTTAAAGTggg < 2:3952245/100‑1 (MQ=255) tGAAAGACAATACGTAATTACGATGCCGGGCGTGGGTTGTTGGCGTCCGGCGCTTTACCAGAGCCCCCCACAGCGCTACAATGCCCGCCCTTAAAGTggg < 1:1415817/100‑1 (MQ=255) tGAAAGACAATACGTAATTACGATGCCGGGCGTGGGTTGTTGGCGTCCGGCGCTTTACCAGAGCCCCCCACAGCGCTACAATG‑CCGCCCTTAAAGTgggg < 1:1977238/100‑1 (MQ=255) gAAAGACAATACGTAATTACGATGCCGGGCGTGGGTTGTTGGCGTCCGGCGCTTTACCAGAGCCCCCCACAGCGCTACAATGCCCGCCCTTAAAGTgggg < 2:1282798/100‑1 (MQ=255) gAAAGACAATACGTAATTACGATGCCGGGCGTGGGTTGTTGGCGTCCGGCGCTTTACCAGAGCCCCCCACAGCGCTACAATG‑CCGCCCTTAAAGTggggg < 1:3241390/100‑1 (MQ=255) aaaGACAATACGTAATTACGATGCCGGGCGTGGGTTGTTGGCGTCCGGCGCTTTACCAGAGCCCCCCACAGCGCTACAATG‑CCGCCCTTAAAGTGGGGGc > 1:259234/1‑100 (MQ=255) aaaGACAATACGTAATTACGATGCCGGGCGTGGGTTGTTGGCGTCCGGCGCTTTACCAGAGCCCCCCACAGCGCTACAATG‑CCGCCCTTAAAGTGGGGGc < 2:4133638/100‑1 (MQ=255) aaGACAATACGTAATTACGATGCCGGGCGTGGGTTGTTGGCGTCCGGCGCTTTACCAGAGCCCCCCACAGCGCTACAATGCCCGCCCTTAAAGTGGGGGc < 1:3229381/100‑1 (MQ=255) aaGACAATACGTAATTACGATGCCGGGCGTGGGTTGTTGGCGTCCGGCGCTTTACCAGAGCCCCCCACAGCGCTACAATGCCCGCCCTTAAAGTGGGGGc < 1:1202436/100‑1 (MQ=255) aGACAATACGTAATTACGATGCCGGGCGTGGGTTGTTGGCGTCCGGCGCTTTACCAGAGCCCCCCACAGCGCTACAATG‑CCGCCCTTAAAGTGGGGGCAc < 2:3659275/100‑1 (MQ=255) aaTACGTAATTACGATGCCGGGCGTGGGTTGTTGGCGTCCGGCGCTTTACCAGAGCCCCCCACAGCGCTACAATG‑CCGCCCTTAAAGTGGGGGCACTccc < 2:1808208/100‑1 (MQ=255) aaTACCTAATTACGATGCCGGGCGTGGGTTGTTGGCGTCCGGCGCTTTACCAGAGCCGCCCACAGCGCTACAAGGCCCGCCCTTAAAGTGGGGGc < 2:1031430/95‑1 (MQ=255) aTACGTAATTACGATGCCGGGCGTGGGTTGTTGGCGTCCGGCGCTTTACCAGAGCCCCCCACAGCGCTACAATG‑CCGCCCTTAAAGTGGGGGCACTcccc < 1:84998/100‑1 (MQ=255) tACGTAATTACGATGCCGGGCGTGGGTTGTTGGCGTCCGGCGCTTTACCAGAGCCCCCCACAGCGCTACAATGCCCGCCCTTAAAGTGGGGGCACTcccc < 2:768698/100‑1 (MQ=255) tACGTAATTACGATGCCGGGCGTGGGTTGTTGGCGTCCGGCGCTTTACCAGAGCCCCCCACAGCGCTACAATGCCCGCCCTTAAAGTGGGGGCACTcccc < 2:775955/100‑1 (MQ=255) cGTAATTACGATGCCGGGCGTGGGTTGTTGGCGTCCGGCGCTTTACCAGAGCCCCCCACAGCGCTACAATGCCCGCCCTTAAAGTGGGGGCACTCCCCTa < 1:3215032/100‑1 (MQ=255) aaTTACGATGCCGGGCGTGGGTTGTTGGCGTCCGGCGCTTTACCAGAGCCCCCCACAGCGCTACAATG‑CCGCCCTTAAAGTGGGGGCACTCCCCTAAcc < 1:4039295/99‑1 (MQ=255) aaTTACGATGCCGGGCGTGGGTTGTTGGCGTCCGGCGCTTTACCAGAGCCCCCCACAGCGCTACAATG‑CCGCCCTTAAAGTGGGGGCACTCCCCTAACCg > 1:2666623/1‑100 (MQ=255) aaTTACGATGCCGGGCGTGGGTTGTTGGCGTCCGGCGCTTTACCAGAGCCCCCCACAGCGCTACAATG‑CCGCCCTTAAAGTGGGGGCACTCCCCTAACCg > 1:3615355/1‑100 (MQ=255) aTTACGATGCCGGGCGTGGGTTGTTGGCGTCCGGCGCTTTACCAGAGCCCCCCACAGCGCTACAATGCCCGCCCTTAAAGTGGGGGCACTCCCCTAACCg > 1:2488826/1‑100 (MQ=255) aTTACGATGCCGGGCGTGGGTTGTTGGCGTCCGGCGCTTTACCAGAGCCCCCCACAGCGCTACAATG‑CCGCCCTTAAAGTGGGGGCACTCCCCTAACCGc < 1:469936/100‑1 (MQ=255) tACGATGCCGGGCGTGGGTTGTTGGCGTCCGGCGCTTTACCAGAGCCCCCCACAGCGCTACAATGCCCGCCCTTAAAGTGGGGGCACTCCCCTAACCGCt < 2:3571680/100‑1 (MQ=255) tACGATGCCGGGCGTGGGTTGTTGGCGTCCGGCGCTTTACCAGAGCCCCCCACAGCGCTACAATGCCCGCCCTTAAAGTGGGGGCACTCCCCTAACCGCt < 1:1651751/100‑1 (MQ=255) tACGATGCCGGGCGTGGGTTGTTGGCGTCCGGCGCTTTACCAGAGCCCCCCACAGCGCTACAATG‑CCGCCCTTAAAGTGGGGGCACTCCCCTAACCGCtt > 1:920562/1‑100 (MQ=255) aCGATGCCGGGCGTGGGTTGTTGGCGTCCGGCGCTTTACCAGAGCCCCCCACAGCGCTACAATG‑CCGCCCTTAAAGTGGGGGCACTCCCCTAACCGCTtc > 1:1996223/1‑100 (MQ=255) cGATGCCGGGCGTTGGTTGTTGGCGTCCGGCGCTTTACCAGAGCCCCCCACAGCGCTACAATGCCCGCCCTTAAAGTGGGGGCACTCCCCTAACCGCTtc < 2:1359096/100‑1 (MQ=255) cGATGCCGGGCGTGGGTTGTTGGCGTCCGGCGCTTTACCAGAGCCCCCCACAGCGCTACAATG‑CCGCCCTTAAAGTGGGGGCACTCCCCTAACCGCTtca > 2:3429901/1‑100 (MQ=255) gATGCCGGGCGTGGGTTGTTGGCGTCCGGCGCTTTACCAGAGCCCCCCACAGCGCTACAATGCCCGCCCTTAAAGTGGGGGCACTCCCCTAACCGCTtca < 1:539874/100‑1 (MQ=255) aTGCCGGGCGTGGGTTGTTGGCGTCCGGCGCTTTACCAGAGCCCCCCACAGCGCTACAATG‑CCGCCCTTAAAGTGGGGGCACTCCCCTAACCGCTtcatc < 2:3298291/100‑1 (MQ=255) tGCCGGGCGTGGGTTGTTGGCGTCCGGCGCTTTACCAGAGCCCCCCACAGCGCTACAATG‑CCGCCCTTAAAGTGGGGGCACTCCCCTAACCGCTtcatca < 1:3159681/100‑1 (MQ=255) tGCCGGGCGTGGGTTGTGGGCGGCCGGCGCTTTACCAGAGCCCCCCACAGCGCTACAATGCCCGCCCTTAAAGTGGGGGCACTCCCCTAACCGCTtcatc < 1:1850806/100‑1 (MQ=255) gCCGGGCGTGGGTTGTTGGCGTCCGGCGCTTTACCAGAGCCCCCCACAGCGCTACAATG‑CCGCCCTTAAAGTGGGGGCACTCCCCTAACCGCTTCATCAg < 1:844185/100‑1 (MQ=255) ccGGGCGTGGGTTGTTGGCGTCCGGCGCTTTACCAGAGCCCCCCACAGCGCTACAATG‑CCGCCCTTAAAGTGGGGGCACTCCCCTAACCGCTTCATCAgg > 2:2662384/1‑100 (MQ=255) cGGGCGTGGGTTGTTGGCGTCCGGCGCTTTACCAGAGCCCCCCACCGCGCTACACTG‑CCGCCCTTAAAGTGGGTGCACTCCCCTAACCGCTtcacctga < 2:3491553/99‑6 (MQ=255) gcctGGGTTGTTGGCGTCCGGCGCTTTACCAGATCCCCCCACAGCGCTACAATG‑CCGCCCTTAAAGTGGGGGCACTCCCCTAACCGCTTCATCAGGTGa < 2:1841753/96‑1 (MQ=255) gggTTGTTGGCGTCCGGCGCTTTACCAGAGCCCCCCACAGCGCTACAATGCCCGCCCTTAAAGTGGGGGCACTCCCCTAACCGCTTCATCAGGTGAAGCg < 2:241774/100‑1 (MQ=255) gggTTGTTGGCGTCCGGCGCTTTACCAGAGCCCCCCACAGCGCTACAATGCCCGCCCTTAAAGTGGGGGCACTCCCCTAACCGCTTCATCAGGTGAAGCg < 2:4071509/100‑1 (MQ=255) ggTTGTTGGCGTCCGGCGCTTTACCAGAGCCCCCCACAGCGCTACAATG‑CCGCCCTTAAAGTGGGGGCACTCCCCTAACCGCTTCATCAGGTGAAGCGGa > 1:1127915/1‑100 (MQ=255) ggTTGTTGGCGTCCGGCGCTTTACCAGAGCCCCCCACAGCGCTACAATG‑CCGCCCTTAAAGTGGGGGCACTCCCCTAACCGCTTCATCAGGTGAAGCGGa > 1:1079500/1‑100 (MQ=255) gttgttGGCGTCCGGCGCTTTACCAGAGCCCCCCACAGCGCTACAATGCCCGCCCTTAAAGTGGGGGCACTCCCCTAACCGCTTCATCAGGTGAAGCGGa > 1:1814943/1‑100 (MQ=255) ttgttgGCGTCCGGCGCTTTACCAGAGCCCCCCACAGCGCTACAATG‑CCGCCCTTAAAGTGGGGGCACTCCCCTAACCGCTTCATCAGGTGAAGCGGATc < 1:994330/100‑1 (MQ=255) ttgttgGCGTCCGGCGCTTTACCAGAGCCCCCCACAGCGCTACAATG‑CCGCCCTTAAAGTGGGGGCACTCCCCTAACCGCTTCATCAGGTGAAGCGGATc > 1:2355347/1‑100 (MQ=255) ttggtgtcttCCGGTGCTTTACCAGAGCCCCGGACAGCTCTACAATG‑CCGCGCTTAAAGTTGGGGTACTCCCCTATCCGCTTCATCATGTGAAGCGGATc < 2:394952/91‑1 (MQ=255) tgttgGCGTCCGGCGCTTTACCAGAGCCCCCCACAGCGCTACAATGCCCGCCCTTAAAGTGGGGGCACTCCCCTAACCGCTTCATCAGGTGAAGCGGATc < 2:4046790/100‑1 (MQ=255) tgttgGCGTCCGGCGCTTTACCAGAGCCCCCCACAGCGCTACAATG‑CCGCCCTTCAAGTGGGGGCACTCCCCTAACCGCTTCATCAGGTGCAGCGGATc > 2:2872903/1‑99 (MQ=255) tggtgGCGTGCGGCGCTTTACCAGGGCCCCCCACAGCGCTACAATGCCCGCCGTTAAAGTGGGTGCACTCCCCTATCCGCTTCATCCGGTGAAGCGGATc < 2:2561159/97‑1 (MQ=255) gttgGCGTCCGGCGCTTTACCAGAGCCCCCCACAGCGCTACAATG‑CCGCCCTTAAAGTGGGGGCACTCCCCTAACCGCTTCACCTGATGAAGCggttagg < 2:4134550/100‑6 (MQ=38) ggCGTCCGGCGCTTTACCAGAGCCCCCCACAGCGCTACAATGCCCGCCCTTAAAGTGGGGGCACTCCCCTAACCGCTTCATCAGGTGAAGCGGATCTGAc < 2:3331615/100‑1 (MQ=255) ggCGTCAGGCTCTTTCCCAGCGCGCCCCACTGCCCTACAATG‑CCGCCCTTAAAGTGGGGGCACTCCCCTAACCGCTTCATCAGGTGAAGCGGATCTGAcc < 2:3660060/100‑1 (MQ=255) cGTCCGGCGCTTTACCAGAGCCCCCCACAGCGCTACAATG‑CCGCCCTTAAAGTGGGGGCACTCCCCTAACCGCTTCATCAGGTGAAGCGGATCTGACCTg < 1:2721838/100‑1 (MQ=255) gTCCGGCGCTTTACCAGAGCCCCCCACAGCGCTACAATG‑CCGCCCTTAAAGTGGGGGCACTCCCCTAACCGCTTCATCAGGTGAAGCGGATCTGACCTGt > 1:3909160/1‑100 (MQ=255) tCCGGCGCTTTACCAGAGCCCCCCACAGCGCTACAATG‑CCGCCCTTAAAGTGGGGGCACTCCCCTAACCGCTTCATCAGGTGAAGCGGATCTGACCTGtc < 1:1843134/100‑1 (MQ=255) ccGGCGCTTTACCAGAGCCCCCCACAGCGCTACAATG‑CCGCCCTTAAAGTGGGGGCACTCCCCTATCCGCTTCATCAGGTGAAGCGGATCTGACCTGtca > 2:2179532/1‑100 (MQ=255) ggCGCTTTACCAGAGCCCCCCACAGCGCTACAATGCCCGCCCTTAAAGTGGGGGCACTCCCCTAACCGCTTCATCAGGTGAAGCGGATCTGACCTGtcat > 1:1559327/1‑100 (MQ=255) gcgcTTTACCAGAGCCCCCCACAGCGCTACAATGCCCGCCCTTAAAGTGGGGGCACTCCCCTAACCGCTTCATCAGGTGAAGCGGATCTGACCTGtcatc < 1:4104712/100‑1 (MQ=255) cgcTTTACCAGAGCCCCCCACAGCGCTACAATG‑CCGCCCTTAAAGTGGGGGCACTCCCCTAACCGCTTCATCAGGTGAAGCGGATCTGACCTGTCATCAg < 2:3297474/100‑1 (MQ=255) cTTTACCAGAGCCCCCCACAGCGCTACAATGCCCGCCCTTAAAGTGGGGGCACTCCCCTAACCGCTTCATCAGGTGAAGCGGATCTGACCTGTCATCAGa > 1:3406708/1‑100 (MQ=255) tACCAGAGCCCCCCACAGCGCTACAATGCCCGCCCTTAAAGTGGGGGCACTCCCCTAACCGCTTCATCAGGTGAAGCGGATCTGACCTGTCATCAGAACg > 2:2727049/1‑100 (MQ=255) tACCAGAGCCCCCCACAGCGCTACAATG‑CCGCCCTTAAAGTGGGGGCACTCCCCTAACCGCTTCATCAGGTGAAGCGGATCTGACCTGTCATCAGAACga > 1:3431261/1‑100 (MQ=255) ccAGAGCCCCCCACAGCGCTACAATG‑CCGCCCTTAAAGTGGGGGCACTCCCCTAACCGCTTCATCAGGTGAAGCGGATCTGACCTGTCATCAGAACgaga < 2:1672394/100‑1 (MQ=255) ccAGAGCCCCCCACAGCGCTACAATG‑CCGCCCTTAAAGGGGGGGCACGCCCCTAACCGCTTCATCAGGTGAAGCGGATCTGACCTGTCATCAGAACgag < 1:1056807/99‑1 (MQ=255) cAGAGCCCCCCACAGCGCTACAATG‑CCGCCCTTAAAGTGGGGGCACTCCCCTAACCGCTTCATCAGGTGAAGCGGATCTGACCTGTCATCAGAACgagag > 1:2323908/1‑100 (MQ=255) cAGAGCCCCCCACAGCGCTACAATG‑CCGCCCTTAAAGTGGGGGCACTCCCCTAACCGCTTCATCAGGTGAAGCGGATCTGACCTGTCATCAGAACgagag < 2:1996210/100‑1 (MQ=255) agagCGCCCCACAGCGCTACAATG‑CCGCCCTTAAAGTGGGGGCACTCCCCTAACCGCTTCATCCGGTGAAGCGGATCTGACCTGTCATCAGAACgagaga > 2:2158022/1‑100 (MQ=255) agCCCCCCACAGCGCTACAATG‑CCGCCCTTAAAGTGGGGGCACTCCCCTAACCGCTTCATCAGGTGAAGCGGATCTGACCTGTCATCAGAACGAGAGAAt < 2:3470486/100‑1 (MQ=255) gCCCCCCACAGCGCTACAATG‑CCGCCCTTAAAGTGGGGGCACTCCCCTAACCGCTTCATCAGGTGAAGCGGATCTGACCTGTCATCAGAACGAGAGAAtt > 1:2658637/1‑100 (MQ=255) cccccACAGCGCTACAATG‑CCGCCCTTAAAGTGGGGGCACTCCCCTAACCGCTTCATCAGGTGAAGCGGATCTGACCTGTCATCAGAACGAGAGAATTAt > 1:279041/1‑100 (MQ=255) ccccACAGTGCTACCACTCCCTTCCTTAAAGGTGGAGCACTCCCCTAACCTCTTCATCAAGTGTAGCAGATCTGACCTGTCATCAGAACgagag < 2:3931502/94‑1 (MQ=255) cccACAGCGCTACAATGCCCGCCCTTAAAGTGGGGGCACTCCCCTAACCGCTTCATCAGGTGAAGCGGATCTGACCTGTCATCAGAACGAGAGAATTATg > 2:2351767/1‑100 (MQ=255) ccACAGCGCTACAATG‑CCGCCCTTAAAGTGGGGGCACTCCCCTAACCGCTTCATCAGGTGAAGCGGATCTGACCTGTCATCAGAACGAGAGAATTATGtt < 1:2165605/100‑1 (MQ=255) cacaGCGCTACAATGCCCGCCCTTAAAGTGGGGGCACTCCCCTAACCGCTTCATCAGGTGAAGCGGATCTGACCTGTCATCAGAACGAGAGAATTATGtt < 1:239699/100‑1 (MQ=255) cacaGCGCTACAATG‑CCGCCCTTAAAGTGGGGGCACTCCCCTAACCGCTTCATCAGGTGAAGCGGATCTGACCTGTCATCAGAACGAGAGAATTATGttt < 1:2928438/100‑1 (MQ=255) caGCGCTACAATGCCCGCCCTTAAAGTGGGGGCACTCCCCTAACCGCTTCATCAGGTGAAGCGGATCTGACCTGTCATCAGAACGAGAGAATTATGTTTa > 2:3155845/1‑100 (MQ=255) cgcTACAATG‑CCGCCCTTAAAGTGGGGGCACTCCCCTAACCGCTTCATCAGGTGAAGCGGATCTGACCTGTCATCAGAACGAGAGAATTATGTTTAAAcc < 1:1553466/100‑1 (MQ=255) cgcTACAATG‑CCGCCCTTAAAGTGGGGGCACTCCCCTAACCGCTTCATCAGGTGAAGCGGATCTGACCTGTCATCAGAACGAGAGAATTATGTTTAAAcc < 2:1340175/100‑1 (MQ=255) gcTACAATGCCCGCCCTTAAAGTGGGGGCACTCCCCTAACCGCTTCATCAGGTGAAGCGGATCTGACCTGTCATCAGAACGAGAGAATTATGTTTAAAcc > 2:2921181/1‑100 (MQ=255) gcTACAATGCCCGCCCTTAAAGTGGGGGCACTCCCCTAACCGCTTCATCAGGTGAAGCGGATCTGACCTGTCATCAGAACGAGAGAATTATGTTTAAAcc > 1:2193044/1‑100 (MQ=255) cTACAATGCCCGCCCTTAAAGTGGGGGCACTCCCCTAACCGCTTCATCAGGTGAAGCGGATCTGACCTGTCATCAGAACGAGAGAATTATGTTTAAACCg > 1:3141495/1‑100 (MQ=255) cTACAATG‑CCGCCCTTAAAGTGGGGGCACTCCCCTAACCGCTTCATCAGGTGAAGCGGATCTGACCTGTCAGCAGAACGAGAGAATTATGTTTAAACCgg < 2:808580/100‑1 (MQ=255) tACAATG‑CCGCCCTTAAAGTGGGGGCACTCCCCTAACCGCTTCATCAGGTGAAGCGGATCTGACCTGTCATCAGAACGAGAGAATTATGTTTAAACCGGa < 1:898532/100‑1 (MQ=255) aCAATG‑CCGCCCTTAAAGTGGGGGCACTCCCCTAACCGCGTCATCAGGTGAAGCGGATCTGACCTGTCATCAGAACGAGAGAATTATGTTTAAACCGGa < 2:3811372/99‑1 (MQ=255) cAATGCCCGCCCTTAAAGTGGGGGCACTCCCCTAACCGCTTCCTCAGCTGAACCGGATCTGACCTGTCATCAGAACGAGAGAATTATGTTTAAAcacgaa > 2:2281040/1‑95 (MQ=255) aTGCCCGCCCTTAAAGTGGGGGCACTCCCCTAACCGCTTCATCAGGTGAAGCGGATCTGACCTGTCATCAGAACGAGAGAATTATGTTTAAACCGGAACt > 2:3920888/1‑100 (MQ=255) tGCCCGCCCTTAAAGTGGGGGCACTCCCCTAACCGCTTCATCAGGTGAAGCGGATCTGACCTGTCATCAGAACGAGAGAATTATGTTTAAACCGGAACTc < 2:1603849/100‑1 (MQ=255) gcccgcccTTAAAGTGGGGGCACTCCCCTAACCGCTTCATCAGGTGAAGCGGATCTGACCTGTCATCAGAACGAGAGAATTATGTTTAAACCGGAACTcc < 2:3593001/100‑1 (MQ=255) | GGCACAAGCCAGACGGTGAAAGACAATACGTAATTACGATGCCGGGCGTGGGTTGTTGGCGTCCGGCGCTTTACCAGAGCCCCCCACAGCGCTACAATGCCCGCCCTTAAAGTGGGGGCACTCCCCTAACCGCTTCATCAGGTGAAGCGGATCTGACCTGTCATCAGAACGAGAGAATTATGTTTAAACCGGAACTCC > NC_000913/2165489‑2165686 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |