| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3620116 | NA (NA) | 18 (0.130) | 5/166 | NT | 100% | coding (925/4236 nt) | rhsB | Rhs protein with DUF4329 family putative toxin domain; putative neighboring cell growth inhibitor |
| ? | NC_000913 | = 3620152 | 0 (0.000) | coding (961/4236 nt) | rhsB | Rhs protein with DUF4329 family putative toxin domain; putative neighboring cell growth inhibitor | |||||
ACAACGGCATCCGTCTGTCTGCCGTGTGGCTGACGCACGACCCGGAATACCCGGAGAATTTACCTGCCGCGCCGCTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCACGCGGCGAACTGGCGGTGGTGTATGACCGTAGTGGCAAACAGGTGCGCAGCTTTACTTACGATGATAAAT > NC_000913/3620048‑3620215 | aCAACGGCATCCGTCTGTCTGCCGTGTGGCTGACGCACGACCCGGAATACCCGGAGAATTTACCTGCCGCGCCGCTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCACG > 2:2060452‑M2/1‑100 (MQ=255)aCAACGGCATCCGTCTGTCTGCCGTGTGGCTGACGCACGACCCGGAATACCCGGAGAATTTACCTGCCGCGCCGCTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCACG < 2:4057580‑M2/100‑1 (MQ=255)aCAACGGCATCCGTCTGTCTGCCGTGTGGCTGACGCACGACCCGGAATACCCGGAGAATTTACCTGCCGCGCCGCTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCACG > 1:2448008‑M2/1‑100 (MQ=255)aCAACGGCATCCGTCTGTCTGCCGTGTGGCTGACGCACGACCCGGAATACCCGGAGAATTTACCTGCCGCGCCGCTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCACG < 1:1802571‑M2/100‑1 (MQ=255) cAACGGCATCCGTCTGTCTGCCGTGTGGCTGACGCACGACCCGGAATACCCGGAGAATTTACCTGCCGCGCCGCTGGTGCGCTATGGCTGGCCGCCACGC < 1:2929956‑M2/100‑1 (MQ=255) cAACGGCATCCGTCTGTCTGCCGTGTGGCTGACGCACGACCCGGAATACCCGGAGAATTTACCTGCCGCGCCGCTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCACGC < 1:647521‑M2/100‑1 (MQ=255) cAACGGCATCCGTCTGTCTGCCGTGTGGCTGACGCACGACCCGGAATACCCGGAGAATTTACCTGCCGCGCCGCTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCACGC < 2:4002947‑M2/100‑1 (MQ=255) cAACGGCATCCGTCTGTCTGCCGTGTGGCTGACGCACGACCCGGAATACCCGGAGAATTTACCTGCCGCGCCGCTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCACGC < 1:224114‑M2/100‑1 (MQ=255) cAACGGCATCCGTCTGTCTGCCGTGTGGCTGACGCACGACCCGGAATACCCGGAGAATTTACCTGCCGCGCCGCTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCACGC < 1:1945122‑M2/100‑1 (MQ=255) aaCGGCATCCGTCTGTCTGCCGTGTGGCTGACGCACGACCCGGAATACCCGGAGAATTTACCTGCCGCGCCGCTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCACGCG > 1:3991046‑M2/1‑100 (MQ=255) aaCGGCATCCGTCTGTCTGCCGTGTGGCTGACGCACGACCCGGAATACCCGGAGAATTTACCTGCCGCGCCGCTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCACGCG > 1:3629464‑M2/1‑100 (MQ=255) aCGGCATCCGTCTGTCTGCCGTGTGGCTGACGCACGACCCGGAATACCCGGAGAATTTACTTGCCGCACCGCTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCACGCGG < 2:2898112‑M2/100‑1 (MQ=255) aCGGCATCCGTCTGTCTGCCGTGTGGCTGACGCACGACCCGGAATACCCGGAGAATTTACCTGCCGCGCCGCTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCACGCGG < 1:595904‑M2/100‑1 (MQ=255) aCGGCATCCGTCTGTCTGCCGTGTGGCTGACGCACGACCCGGAATACCCGGAGAATTTACCTGCCGCGCCGCTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCACGCGG < 1:2528469‑M2/100‑1 (MQ=255) aCGGCATCCGTCTGTCTGCCGTGTGGCTGACGCACGACCCGGAATACCCGGAGAATTTACCTGCCGCGCCGCTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCACGCGG < 2:3243257‑M2/100‑1 (MQ=255) aCGGCATCCGTCTGTCTGCCGTGTGGCTGACGCACGACCCGGAATACCCGGAGAATTTACCTGCCGCGCCGCTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCACGCGG < 1:2970270‑M2/100‑1 (MQ=255) aCGGCATCCGTCTGTCTGCCGTGTGGCTGACGCACGACCCGGAATACCCGGAGAATTCACATGCCGCCCCGCTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCACGCGG < 2:2897721‑M2/100‑1 (MQ=255) cGGCATCCGTCTGTCTGCCGTGTGGCTGACGCACGACCCGGAATACCCGGAGAATTTACCTGCCGCGCCGCTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCACGCGGC < 1:2230550‑M2/100‑1 (MQ=255) cGGCATCCGTCTGTCTGCCGTGTGGCTGACGCACGACCCGGAATACCCGGAGAATTTACCTGCCGCGCCGCTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCACGCGGC < 1:2230807‑M2/100‑1 (MQ=255) cGGCATCCGTCTGTCTGCCGTGTGGCTGACGCACGACCCGGAATACCCGGAGAATTTACCTGCCGCGCCGCTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCACGCGGC > 1:1041035‑M2/1‑100 (MQ=255) cGGCATCCGTCTGTCTGCCGTGTGGCTGACGCACGACCCGGAATACCCGGAGAATTTACCTGCCGCGCCGCTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCACGCGGC < 2:1134500‑M2/100‑1 (MQ=255) ggCATCCGTCTGTCTGCCGTGTGGCTGACGCACGACCCGGAATACCCGGAGAATTTACCTGCCGCGCCGCTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCACGCGGCG < 1:2878895‑M2/100‑1 (MQ=255) ggCATCCGTCTGTCTGCCGTGTGGCTGACGCACGACCCGGAATACCCGGAGAATTTACCTGCCGCGCCGCTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCACGCGGCG > 1:3072732‑M2/1‑100 (MQ=255) ggCATCCGTCTGTCTGCCGTGTGGCTGACGCACGACCCGGAATACCCGGAGAATTTACCTGCCGCGCCGCTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCACGCGGCG > 1:1168252‑M2/1‑100 (MQ=255) ggCATCCGTCTGTCTGCCGTGTGGCTGACGCACGACCCGGAATACCCGGAGAATTTACCTGCCGCGCCGCTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCACGCGGCG < 1:2772142‑M2/100‑1 (MQ=255) ggCATCCGTCTGTCTGCCGTGTGGCTGACGCACGACCCGGAATACCCGGAGAATTTACCTGCCGCGCCGCTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCACGCGGCG > 1:2637572‑M2/1‑100 (MQ=255) ggCATCCGTCTGTCTGCCGTGTGGCTGACGCACGACCCGGAATACCCGGAGAATTTACCTGCCGCGCCGCTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCACGCGGCG > 1:2453165‑M2/1‑100 (MQ=255) ggCATCCGTCTGTCTGCCGTGTGGCTGACGCACGACCCGGAATACCCGGAGAATTTACCTGCCGCGCCGCTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCACGCGGCG > 1:1693882‑M2/1‑100 (MQ=255) ggCATCCGTCTGTCTGCCGTGTGGCTGACGCACGACCCGGAATACCCGGAGAATTTACCTGCCGCGCCGCTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCACGCGGCG < 1:1850322‑M2/100‑1 (MQ=255) ggCATCCGTCTGTCTGCCGTGTGGCTGACGCACGACCCGGAATACCCGGAGAATTTACCTGACGCGCCGCTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCACGCGGCG < 2:3593060‑M2/100‑1 (MQ=255) ggCATCCGGCTGTCTGCCGTGTGGCTGACGCACGACCCGGAATACCCGGAGAATTTACCTGCCGCGCCGCTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCACGCGGCG > 2:1776025‑M2/1‑100 (MQ=255) gCATCCGTCTGTCTGCCGTGTGGCTGACGCACGACCCGGAATACCCGGAGAATTTACCTGCCGCGCCGCTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCACGCGGCG < 1:3172437‑M2/99‑1 (MQ=255) cATCCGTCTGTCTGCCGTGTGGCTGACGCACGACCCGGAATACCCGGAGAATTTACCTGCAGCGCCGCTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCACGCGGCGga < 2:1331019‑M2/100‑3 (MQ=255) tgCCGTGTGGCTGACGCACGACCCGGAATACCCGGAGAATTTACCTGCCGCGCCGCTGGGGCGCTATGGCTGGACGCCCCGCCGCGcggcgggtaaatt < 2:4078996‑M2/99‑14 (MQ=255) ccTGCCGCGCCGCTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCACGCGGCggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatg < 1:1270465‑M2/100‑58 (MQ=255) ccTGCCGCGCCGCTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCACGCGGCggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggat < 2:983173‑M2/99‑57 (MQ=255) ccTGCCGCGCCGCTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCACGCGGCggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggat < 1:3210938‑M2/99‑57 (MQ=255) ccTGCCGCGCCGCTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCACGCGGCGcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagac < 1:1639998‑M2/100‑58 (MQ=255) tGCCGCGCCGCTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCCCGCGGCGcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacgg < 1:2459777‑M2/100‑60 (MQ=255) tGCCGCGCCGCTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCCCGCGGCGcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacgg < 1:1153603‑M2/100‑60 (MQ=255) tGCCGCGCCGCTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCACGCGGCGcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacgg < 2:617809‑M2/100‑60 (MQ=255) gccgcgccgcTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCATGCGGCGcggcaggtcaattctccgggtattccgggtggtgcgtcagccacacggcagacagacgga < 2:2489966‑M2/100‑61 (MQ=255) gccgcgccgcTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCACGCGGCGcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacgga < 2:1125527‑M2/100‑61 (MQ=255) gccgcgccgcTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCACGCGGCGcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacgga < 1:3181627‑M2/100‑61 (MQ=255) cgcgccgcTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCACGCGGCGcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatg < 1:3274886‑M2/100‑63 (MQ=255) cgcgccgcTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCACGCGACGcggcaggtaaattctacgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggat < 2:2891047‑M2/99‑62 (MQ=255) gcgccgcTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCCCGCGGCGcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgc < 2:1208671‑M2/100‑64 (MQ=255) gcgccgcTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCACGCGGCGcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgc < 2:2827879‑M2/100‑64 (MQ=255) gcgccgcTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCACGCGGCGcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgc < 1:980832‑M2/100‑64 (MQ=255) gcgccgcTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCACGCGGCGcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgc < 1:2815459‑M2/100‑64 (MQ=255) | ACAACGGCATCCGTCTGTCTGCCGTGTGGCTGACGCACGACCCGGAATACCCGGAGAATTTACCTGCCGCGCCGCTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCACGCGGCGAACTGGCGGTGGTGTATGACCGTAGTGGCAAACAGGTGCGCAGCTTTACTTACGATGATAAAT > NC_000913/3620048‑3620215 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |