New junction evidence
  seq id position reads (cov) reads (cov) score skew freq annotation gene product
* ? NC_000913 730180 =NA (NA)12 (0.080) 9/172 NT 19.9% coding (598/4194 nt) rhsC Rhs protein with putative toxin domain; putative neighboring cell growth inhibitor
?NC_000913 730240 = 50 (0.340)coding (658/4194 nt) rhsC Rhs protein with putative toxin domain; putative neighboring cell growth inhibitor

Only 100 of 107 total aligned reads displayed.

CGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAG  >  NC_000913/730081‑730242
                                                                                                   |                                                              
cGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGtgctgc                                                                >  2:4001631/1‑100 (MQ=33)
 gCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGctgcc                                                               <  1:2262975/100‑1 (MQ=33)
 gCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGctgcc                                                               <  1:998890/100‑1 (MQ=32)
 gCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGctgcc                                                               <  1:638357/100‑1 (MQ=33)
    tAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGctgcctgc                                                            <  1:3035069/100‑1 (MQ=33)
    tAAGTCCGCAGCGTTATGGGGCGACAAACAGTCCGAAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGAGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGCGctgcctgc                                                            >  2:2228225/1‑100 (MQ=11)
     aaGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTgcg                                                           <  2:2928225/100‑1 (MQ=33)
      aGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTgcgc                                                          >  1:138779/1‑100 (MQ=33)
      aGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTgcgc                                                          >  1:30503/1‑100 (MQ=33)
       ggccGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGcgcc                                                         <  2:1321538/98‑1 (MQ=18)
       gTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGcgcc                                                         >  2:1442195/1‑100 (MQ=33)
       gTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGcgcc                                                         >  2:3062902/1‑100 (MQ=33)
        tCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCGGTGGTGGCTGATGGGCTGGTGTGAGCGGGAGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGTCTgcgctg                                                        >  2:659210/1‑98 (MQ=11)
        tCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGcgccg                                                        >  2:3186573/1‑100 (MQ=33)
         ccGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGcgccgc                                                       <  2:2427873/100‑1 (MQ=33)
          cGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCt                                                      >  2:3268083/1‑100 (MQ=32)
           gCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTTCCTGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTg                                                     <  2:2720874/100‑1 (MQ=16)
           gCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTg                                                     <  1:2387366/100‑1 (MQ=33)
               cGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGCGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTgccgc                                                 <  2:3247685/100‑1 (MQ=18)
                gTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTgccgcc                                                >  1:3777795/1‑100 (MQ=33)
                gTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTgccgcc                                                >  2:3946209/1‑100 (MQ=32)
                  tATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGt                                              >  2:732484/1‑100 (MQ=32)
                    tCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGt                                              <  2:1928727/98‑1 (MQ=33)
                     cTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTAcc                                           <  1:2315145/100‑1 (MQ=33)
                     cTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTAcc                                           <  2:3625383/100‑1 (MQ=33)
                      tGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCg                                          >  1:3015019/1‑100 (MQ=33)
                      tGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCg                                          >  1:1896313/1‑100 (MQ=33)
                      tGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCg                                          >  2:434912/1‑100 (MQ=33)
                       ggCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCgg                                         >  1:1748952/1‑100 (MQ=33)
                       ggCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCgg                                         <  1:2137040/100‑1 (MQ=33)
                        gCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGGTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCgg                                         <  2:882547/99‑1 (MQ=17)
                        gCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCggg                                        <  1:4065153/100‑1 (MQ=33)
                         cGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGt                                       >  1:2376410/1‑100 (MQ=33)
                         cGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGt                                       >  1:1103584/1‑100 (MQ=33)
                         cGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGt                                       <  2:3276378/100‑1 (MQ=33)
                         cGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGt                                       <  1:3164833/100‑1 (MQ=32)
                         cGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGt                                       <  1:3035178/100‑1 (MQ=33)
                         cGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGt                                       <  1:3086928/100‑1 (MQ=33)
                          gACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTa                                      <  1:1261986/100‑1 (MQ=33)
                           aCAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTAc                                     <  2:755233/100‑1 (MQ=33)
                           aCAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTAc                                     <  1:3067398/100‑1 (MQ=33)
                            cAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACt                                    <  2:3577421/100‑1 (MQ=32)
                            cAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACt                                    >  1:1479617/1‑100 (MQ=33)
                            cAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCGGCCGCCGTACCGGGTAc                                     >  2:4136375/1‑99 (MQ=18)
                            cAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGGGGGCGGGCGCCGGACGCGGGTGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACt                                    >  2:3987488/1‑100 (MQ=11)
                             aaaCAGTCCGAAGGGGCCGTGGTGGCTCCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTAc                                     <  2:3444703/98‑1 (MQ=12)
                               aCAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGGGCCGGAAGCGGACGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTCCTGa                                  >  2:4080213/1‑99 (MQ=255)
                                cAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGAcc                                <  1:1095895/100‑1 (MQ=32)
                                cAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCGGCCGCCGTACCGGGTACTGAc                                 <  2:2945497/99‑1 (MQ=17)
                                  gTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGCAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCg                               >  2:1738523/1‑99 (MQ=18)
                                  gTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCgg                              <  1:1012007/100‑1 (MQ=33)
                                  gTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCgg                              >  2:3480987/1‑100 (MQ=33)
                                  gTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCgg                              <  2:1382373/100‑1 (MQ=32)
                                  gTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCgg                              >  2:1012001/1‑100 (MQ=33)
                                  gTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCgg                              <  1:3385409/100‑1 (MQ=33)
                                   tCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCggg                             <  1:2215893/100‑1 (MQ=33)
                                   tCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCggg                             >  1:1791421/1‑100 (MQ=33)
                                    ccGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGc                            >  2:151062/1‑100 (MQ=33)
                                    ccGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGc                            >  2:70656/1‑100 (MQ=33)
                                     cGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCt                           >  1:1039393/1‑100 (MQ=33)
                                     cGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCt                           >  2:1575363/1‑100 (MQ=32)
                                      gCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCtg                          >  1:1892697/1‑100 (MQ=33)
                                        aGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCtggt                        <  2:3453222/100‑1 (MQ=33)
                                        aGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCtggt                        <  1:949942/100‑1 (MQ=33)
                                         ggggCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCtggtg                       >  1:690199/1‑100 (MQ=33)
                                         ggggCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGGGTGGGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCGTGCGGCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGTCCGGGCtgg                         <  2:886670/98‑1 (MQ=11)
                                         ggggCCGCGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGACGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCtggtg                       <  2:186352/100‑1 (MQ=12)
                                          gggCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCtggtgg                      <  1:2584389/100‑1 (MQ=33)
                                          gggCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCtggtgg                      <  1:753738/100‑1 (MQ=33)
                                          gggCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCtggtgg                      <  1:752763/100‑1 (MQ=32)
                                          gggCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCtggtgg                      <  1:3888421/100‑1 (MQ=33)
                                          gggCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCtggtgg                      >  2:3266655/1‑100 (MQ=33)
                                           ggCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTTCCGGGTACTGACCGGGCCGGTGGa                     >  2:2727546/1‑100 (MQ=12)
                                           ggCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGa                     <  2:519462/100‑1 (MQ=33)
                                             ccGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGAcc                   <  1:1079005/100‑1 (MQ=33)
                                              cGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCg                  <  1:1442205/100‑1 (MQ=33)
                                                 ggtggCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCtt               >  2:1634839/1‑100 (MQ=33)
                                                 ggtggCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCtt               >  1:1889536/1‑100 (MQ=33)
                                                 ggtggCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCt                >  2:1422038/1‑99 (MQ=33)
                                                   tggCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCg             >  2:3772204/1‑100 (MQ=33)
                                                    ggCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGGACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCgg            <  2:3981926/100‑1 (MQ=17)
                                                    ggCTGCTCGGCTGGAGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCgg            <  2:2812298/100‑1 (MQ=17)
                                                     gctgctCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCggg           <  1:356046/100‑1 (MQ=32)
                                                     gctgctCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCggg           <  1:3881462/100‑1 (MQ=33)
                                                      ctgctCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGgc          >  2:2834419/1‑100 (MQ=33)
                                                       tgctCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGgcg         <  1:2294302/100‑1 (MQ=33)
                                                        gctCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGgcg         >  2:3846604/1‑99 (MQ=33)
                                                         ctCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGca       >  1:2278194/1‑100 (MQ=33)
                                                         ctCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGca       >  1:2137049/1‑100 (MQ=33)
                                                         ctCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGca       >  1:2051415/1‑100 (MQ=33)
                                                         ctCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGca       >  1:197389/1‑100 (MQ=32)
                                                         ctCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGca       >  2:2091169/1‑100 (MQ=32)
                                                         ctCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGca       >  1:1176168/1‑100 (MQ=33)
                                                          tCGGCTGGTGTGCGCGGGAGCCGGGAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTGCCTGGCACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTCCGCGCCcac      >  2:2871207/1‑100 (MQ=11)
                                                          tCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGcac      <  1:2589695/100‑1 (MQ=32)
                                                          tCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGcac      <  1:3352685/100‑1 (MQ=33)
                                                           cGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGcaca     >  1:2671493/1‑100 (MQ=32)
                                                            ggttgtagtgAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGGGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGcacac    <  2:3190597/93‑1 (MQ=0)
                                                            ggCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAGGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGcacac    >  1:3409655/1‑100 (MQ=17)
                                                              cTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAg  >  2:3398264/1‑100 (MQ=11)
                                                                                                   |                                                              
CGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAG  >  NC_000913/730081‑730242

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑
Reads not counted as support for junction
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint.
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication.