| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 3012400 = | NA (NA) | 19 (0.140) | 8/166 | NT | NA | intergenic (+7/+214) | yqeA/yqeB | putative amino acid kinase/XdhC‑CoxI family protein with NAD(P)‑binding Rossman fold |
| ? | NC_000913 | 3012426 = | NA (NA) | noncoding (26/204 nt) | RIP209 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 4 REP sequences and 1 IHF site | RIP209 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 4 REP sequences and 1 IHF site | |||||
Only 100 of 200 total aligned reads displayed.
GATTACCGTATTGAGCAAAGCGAAAGAAGGGATTGAAGGCAAAACAGGAACGGTGATTTGTCAGTAATTTAAAGGCCGGGTGGGTAATACC‑ATCCGGCCAAAGATTGTCAAGTAAGTGCGCTTTGTTGATGCCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGTCCTACAAAACATCGCAAATTCAATAGATTGCAATGCACT > NC_000913/3012327‑3012524 | gATTACCGTATTGAGCAAAGCGAAAGAAGGGATTGAAGGCAAAACAGGAACGGTGATTTGTCAGTAATTTAAAGGCCGGGTGGGTAATACC‑ATCCGGCCa > 2:4112088/1‑100 (MQ=255)gATTACCGTATTGAGCAAAGCGAAAGAAGGGATTGAAGGCAAAACAGGAACGGTGATTTGTCAGTAATTTAAAGGCCGGGTGGGTAATACC‑ATCCGGCCa > 1:2760206/1‑100 (MQ=255) atgttttgtaggacggataaggcgctcgcgccgcatccggcatcaacaaagcgcacttacttgacaatctttGGCCGGGTGGGTAATACC‑ATCCGGCCaa > 1:1675477‑M1/73‑100 (MQ=255) atgttttgtaggacggataaggcgctcgcgccgcatccggcatcaacaaagcgcacttacttgacaatctttGGCCGGGTGGGTAATACC‑ATCCGGCCaa > 2:2918063‑M1/73‑100 (MQ=255) tttggtaggacggataaggcgctcgcgccgcatccggcatcaacaaagcggacttacttgacaatctttGGCCGGGTGGGTAATACC‑ATCCGGCCAAAg > 1:741338‑M1/70‑99 (MQ=255) aCCGTATTGAGCAAAGCGAAAGAAGGGATTGAAGGCAAAACAGGAACGGTGATTTGTCAGTAATTTAAAGGACGGGTGGGTAATACA‑ATCCAGACAAAg > 2:394210/1‑99 (MQ=255) cGTATTGAGCAAAGCGAAAGAAGGGATTGAAGGCAAAACAGGAACGGTGATTTGTCAGTAATTTAAAGGCCGGGTGGGTAATACC‑ATCCGGCCAAAGAtt > 2:1335191/1‑100 (MQ=255) gTATTGAGCAAAGCGAAAGAAGGGATTGAAGGCAAAACAGGAACGGTGATTTGTCAGTAATTTAAAGGCCGGGTGGGTAATACC‑ATCCGGCCAAAGATTg < 1:3948352/100‑1 (MQ=255) ttGAGCAAAGCGAAAGAAGGGATTGAAGGCAAAACAGGAACGGTGATTTGTCAGTAATTTAAAGGCCGGGTGGGTAATACC‑ATCCGGCCAAAGATTGTCa > 2:4063845/1‑100 (MQ=255) ttGAGCAAAGCGAAAGAAGGGATTGAAGGCAAAACAGGAACGGTGATTTGTCAGTAATTTAAAGGCCGGGTGGGTAATACC‑ATCCGGCCAAAGATTGTCa < 2:2185722/100‑1 (MQ=255) tGAGCAAAGCGAAAGAAGGGATTGAAGGCAAAACAGGAACGGTGATTTGTCAGTAATTTAAAGGCCGGGTGGGTAATACC‑ATCCGGCCAAAGATTGTCaa > 2:3413226/1‑100 (MQ=255) gAGCAAAGCGAAAGAAGGGATTGAAGGCAAAACAGGAACGGTGATTTGTCAGTAATTTAAAGGCCGGGTGGGTAATACC‑ATCCGGCCAAAGATTGTCaag < 1:1066994/100‑1 (MQ=255) aGCAAAGCGAAAGAAGGGATTGAAGGCAAAACAGGAACGGTGATTTGTCAGTAATTTAAAGGCCGGGTGGGTAATACC‑ATCCGGCCAAAGATTGTCaagt > 2:894205/1‑100 (MQ=255) aGCAAAGCGAAAGAAGGGATTGAAGGCAAAACAGGAACGGTGATTTGTCAGTAATTTAAAGGCCGGGTGGGTAATACC‑ATCCGGCCAAAGATTGTCaagt > 2:1174611/1‑100 (MQ=255) aGCAAAGCGAAAGAAGGGATTGAAGGCAAAACAGGAACGGTGATTTGTCAGTAATTTAAAGGCCGGGTGGGTAATACC‑ATCCGGCCAAAGATTGTCaagt > 1:1583505/1‑100 (MQ=255) gCAAAGCGAAAGAAGGGATTGAAGGCAAAACAGGAACGGTGATTTGTCAGTAATTTAAAGGCCGGGTGGGTAATACC‑ATCCGGCCAAAGATTGTCaagta > 1:3379795/1‑100 (MQ=255) gCAAAGCGAAAGAAGGGATTGAAGGCAAAACAGGAACGGTGATTTGTCAGTAATTTAAAGGCCGGGTGGGTAATACC‑ATCCGGCCAAAGATTGTCaagta < 2:2441513/100‑1 (MQ=255) aGCGAAAGAAGGGATTGAAGGCAAAACAGGAACGGTGATTTGTCAGTAATTTAAAGGCCGGGTGGGTAATACC‑ATCCGGCCAAAGATTGTCAAGTAAGTg < 1:421846/100‑1 (MQ=255) gAAAGAAGGGATTGAAGGCAAAACAGGAACGGTGATTTGTCAGTAATTTAAAGGCCGGGTGGGTAATACC‑ATCCGGCCAAAGATTGTCAAGTAAGTgcgc > 1:1826538/1‑100 (MQ=255) gAAAGAAGGGATTGAAGGCAAAACAGGAACGGTGATTTGTCAGTAATTTAAAGGCCGGGTGGGTAATACC‑ATCCGGCCAAAGATTGTCAAGTAAGTgcg > 1:1755374/1‑99 (MQ=255) gaagGGATTGAAGGCAAAACAGGAACGGTGATTTGTCAGTAATTTAAAGGCCGGGTGGGTAATACC‑ATCCGGCCAAAGATTGTCAAGTAAGTGCGCTttg < 2:1938126/100‑1 (MQ=255) aagGGATTGAAGGAAAAACAGGAACGGTGATTTGTCAGTAATTTACAGGCCGGGTGGGTAATACC‑ATCCGGCCAAAGATTGTCAAGTAAGTGCGCTttgt < 2:4124483/100‑1 (MQ=255) gggATTGAAGGCAAAACAGGAACGGTGATTTGTCAGTAATTTAAAGGCCGGGTGGGTAATACC‑ATCCGGCCAAAGATTGTCAAGTAAGTGCGCTttgttg < 1:2878356/100‑1 (MQ=255) ggATTGAAGGCAAAACAGGAACGGTGATTTGTCAGTAATTTAAAGGCCGGGTGGGTAATACC‑ATCCGGCCAAAGATTGTCAAGTAAGTGCGCTTTGTTGa < 2:3604824/100‑1 (MQ=255) gAAGGCAAAACAGGAACGGTGATTTGTCAGTAATTTAAAGGCCGGGTGGGTAATAGC‑ATCCGGCCAAAGATTGTCAAGTAAGTGCGCTTTGTTGATGcc > 1:3875698/1‑99 (MQ=255) gAAGGCAAAACAGGAACGGTGATTTGTCAGTAATTTAAAGGCCGGGTGGGTAATACC‑ATCCGGCCAACGATTGTCAAGTAAGTGCGCTTTGTTGATGCCg > 2:1402921/1‑100 (MQ=255) gAAGGCAAAACAGGAACGGTGATTTGTCAGTAATTTAAAGGCCGGGTGGGTAATACC‑ATCCGGCCAAAGATTGTCAAGTAAGTGCGCTTTGTTGATGCCg > 1:2297580/1‑100 (MQ=255) gAAGGCAAAACAGGAACGGTGATTTGTCAGTAATTTAAAGGCCGGGTGGGTAATACC‑ATCCGGCCAAAGATTGTCAAGTAAGTGCGCTTTGTTGATGCCg > 1:2584317/1‑100 (MQ=255) aGGCAAAACAGGAACGGTGATTTGTCAGTAATTTAAAGGCCGGGTGGGTAATACC‑ATCCGGCCAAAGATTGTCAAGTAAGTGCGCTTTGTTGATGCCGGa > 1:1888331/1‑100 (MQ=255) ggtaaaaCAGGAACGGTGATTTGTCAGTAATTTAAAGGCCGGGTGGGTAATACC‑ATCCGGCCAAAGATTGTCAAGTAAGTGCGCTTTGTTGATGCCGGAt > 1:3996835/4‑100 (MQ=255) ggCAAAACAGGAACGGTGATTTGTCAGTAATTTAAAGGCCGGGTGGGTAATACC‑ATCCGGCCAAAGATTGTCAAGTAAGTGCGCTTTGTTGATGCCGGAt > 1:3107479/1‑100 (MQ=255) ggCAAAACAGGAACGGTGATTTGTCAGTAATTTAAAGGCCGGGTGGGTAATACC‑ATCCGGCCAAAGATTGTCAAGTAAGTGCGCTTTGTTGATGCCGGAt < 1:4100417/100‑1 (MQ=255) ggCAAAACAGGAACGGTGATTTGTCAGTAATTTAAAGGCCGGGTGGGTAATACC‑ATCCGGCCAAAGATTGTCAAGTAAGTGCGCTTTGTTGATGCCGGAt > 1:3791824/1‑100 (MQ=255) gCAAAACAGGAACGGTGATTTGTCAGTAATTTAAAGGCCGGGTGGGTAATACC‑ATCCGGCCAAAGATTGTCAAGTAAGTGCGCTTTGTTGATGCCGGATg < 1:2510811/100‑1 (MQ=255) gCAAAACAGGAACGGTGATTTGTCAGTAATTTAAAGGCCGGGTGGGTAATACC‑ATCCGGCCAAAGATTGTCAAGTAAGTGCGCTTTGTTGATGCCGGATg < 1:4123153/100‑1 (MQ=255) aaaCAGGAACGGTGATTTGTCAGTAATTTAAAGGCCGGGTGGGTAATACC‑ATCCGGCCAAAGATTGTCAAGTAAGTGCGCTTTGTTGATGCCGGATgcgg > 2:3805795/1‑100 (MQ=255) atcaacaaagcgcacttacttgacaatctttGGCCGGGTGGGTAATACC‑ATCCGGCCAAAGATTGTCAAGTAAGTGCGCTTTGTTGATGCCGGATgcggc > 1:568973‑M1/32‑100 (MQ=255) aaCAGGAACGGTGATTTGTCAGTAATTTAAAGGCCGGGTGGGTAATACC‑ATCCGGCCAAAGATTGTCAAGTAAGTGCGCTTTGTTGATGCCGGATgcggc < 2:3552036/100‑1 (MQ=255) aCAGGAACGGTGATTTGTCAGTAATTTAAAGGCCGGGTGGGTAATACC‑ATCCGGCCAAAGATTGTCAAGTAAGTGCGCTTTGTTGATGCCGGATgcggcg < 2:2760190/100‑1 (MQ=255) aCAGGAACGGTGATTTGTCAGTAATTTAAAGGCCGGGTGGGTAATACC‑ATCCGGCCAAAGATTGTCAAGTAAGTGCGCTTTGTTGATGCCGGATgcggcg < 1:894211/100‑1 (MQ=255) aCAGGAACGGTGATTTGTCAGTAATTTAAAGGCCGGGTGGGTAATACC‑ATCCGGCCAAAGATTGTCAAGTAAGTGCGCTTTGTTGATGCCGGATgcggcg < 1:1174618/100‑1 (MQ=255) aCGGTGATTTGTCAGTAATTTAAAGGCCGGGTGGGTAATACC‑ATCCGGCCAAAGATTGTCAAGTAAGTGCGCTTTGTTGATGCCGGATGCGGCGCGAgcg < 2:732067/100‑1 (MQ=255) aCGGTGATTTGTCAGTAATTTAAAGGCCGGGTGGGTAATACC‑ATCCGGCCAAAGATTGTCAAGTAAGTGCGCTTTGTTGATGCCGGATGCGGCGCGAgcg < 1:3487439/100‑1 (MQ=255) ggTGTTTTGTCAGTAATTTAAAGGCCGGGTGGCTAATACC‑ATCCTGCCAAAGATGGTCCAGGAAGTGCGCTTCGTTGATGCCGGATAAGGCGCGAGCGcc < 2:3875673/100‑1 (MQ=255) ggTGATTTGTCAGTAATTTAAAGGCCGGGTGGGTAATACC‑ATCCGGCCAAAGATTGTCAAGTAAGTGCGCTTTGTTGATGCCGGATGCGGCGCGAgcgc > 2:1571126/1‑99 (MQ=255) ggTGATTTGTCAGTAATTTAAAGGCCGGGTGGGTAATACC‑ATCCGGCCAAAGATTGTCAAGTAAGTGCGCTTTGTTGATGCCGGATGCGGCGCGAGCGcc > 1:1009600/1‑100 (MQ=255) gATTTGTCAGTAATTTAAAGGCCGGGTGGGTAATACC‑ATCCGGCCAAAGATTGTCAAGTAAGTGCGCTTTGTTGATGCCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTa > 1:3982814/1‑100 (MQ=255) tttGTCAGTAGTTTAAAGGCCGGGTGGGTAATACC‑ATCCGGCCAAAGATTGTCAAGTAAGTGCGCTTTGTTGATGCCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATc < 1:3022229/100‑1 (MQ=255) tttGTCAGGAATTTAAAGGCCGGGTGGGTAATACC‑ATCCGGCCAAAGATTGTCAAGTAGGTGCGCTTTGTTGATGCCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATc < 2:2869886/100‑1 (MQ=255) tGTCAGTAATTTAAAGGCCGGGTGGGTAATACC‑ATCCGGCCAAAGATTGTCAAGTAAGTGCGCTTTGTTGATGCCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCg > 1:2158014/1‑100 (MQ=255) gTCAGTAATTTAAAGGCCGGGTGGGTAATACC‑ATCCGGCCAAAGATTGTCAAGTAAGTGCGCTTTGTTGATGCCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGt > 1:2674838/1‑100 (MQ=255) gTCAGTAATTTAAAGGCCGGGTGGGTAATACC‑ATCCGGCCAAAGATTGTCAAGTAAGTGCGCTTTGTTGATGCCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGt < 1:23408/100‑1 (MQ=255) cAGTAATTTAAAGGCCGGGTGGGTAATACC‑ATCCGGCCAATGTTTGTCAAGTAAGTGCTATTTGTTGCTTCCGGATGCTTCGCGAGCGCCTTTTCCg > 2:1857614/1‑97 (MQ=25) cAGTAATTTAAAGGCCGGGTGGGTAATACC‑ATCCGGCCAAAGATTGTCAAGTAAGTGCGCTTTGTTGATGCCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGTcc < 2:245842/100‑1 (MQ=255) cAGTAATTTAAAGGCCGGGTGGGTAATACC‑ATCCGGCCAAAGATTGTCAAGTAAGTGCGCTTTGTTGATGCCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGTcc < 2:4018523/100‑1 (MQ=255) aGTAATTTAAAGGCCGGGTGGGTAATACC‑ATCCGGCCAAAGATTGTCAAGTAAGTGCGCTTTGTTGATGCCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGTCCt < 1:582291/100‑1 (MQ=255) aGTAATTTAAAGGCCGGGTGGGTAATACC‑ATCCGGCCAAAGATTGTCAAGTAAGTGCGCTTTGTTGATGCCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGTCCt > 1:957805/1‑100 (MQ=255) aGTAATTTAAAGGCCGGGTGGGTAATACC‑ATCCGGCCAAAGATTGTCAAGTAAGTGCGCTTTGTTGATGCCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGTCCt < 2:3028078/100‑1 (MQ=255) aGTAATTTAAAGGCCGGGTGGGTAATACC‑ATCCGGCCAAAGATTGTCAAGTAAGTGCGCTTTGTTGATGCCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGTCCt < 1:67970/100‑1 (MQ=255) aGTAATTTAAAGGCCGGGTGGGTAATACC‑ATCCGGCCAAAGATTGTCAAGTAAGTGCGCTTTGTTGATGCCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGTCCt > 2:1662445/1‑100 (MQ=255) aGTAATTTAAAGGCCGGGTGGGTAATACC‑ATCCGGCCAAAGATTGTCAAGTAAGTGCGCTTTGTTGATGCCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGTCCt > 1:3672435/1‑100 (MQ=255) gTAATTTAAAGGCCGGGTGGGTAATACC‑ATCCGGGAAAAGAATATCAAGGAATTGCGCTATATTGATCCCGGATGCAGATCTAGCTGCTTATCCGAcc > 2:1846092/1‑98 (MQ=16) gTAATTTAAAGGCCGGGTGGGTAATACC‑ATCCGGCCAAAGATTGTCAAGTAAGTGCGCTTTGTTGATGCCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGTCCTa > 1:3647015/1‑100 (MQ=255) acaatctttGGCCGGATGG‑TATTACCCACCCGGCCAAAGATTGTCAAGTAAGTGCGCTTTGTTGATGCCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGTCCTAc < 1:2179715‑M1/91‑1 (MQ=255) aTTTAAAGGCCGGGTGGGTAATACC‑ATCCGGCCAAAGATTGTCAAGTAAGTGAGCTTTGTTGATGCCGGATGAGGCGCGAGCGCCTTATGTGTCCTACaa > 2:1283451/1‑100 (MQ=39) tttAAAGGCCGGGTGGGTAATACC‑ATCCGGCCAAAGATTGTCAAGTAAGTGCGCTTTGTTGATGCCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGTCCTACaaa > 1:3522199/1‑100 (MQ=255) ttAAAGGCCGGGTGGGTAATACC‑ATCCGGCCAAAGATTGTCAAGTAAGTGCGCTTTGTTGATGCCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGTCCTACaaaa < 1:1741826/100‑1 (MQ=255) ttAAAGGCCGGGTGGGTAATACC‑ATCCGGCCAAAGATTGTCAAGTAAGTGCGCTTCGTTGATGCCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGTCCTACaaa < 2:965042/99‑1 (MQ=255) tAAAGGCCGGGTGGGTAATACC‑ATCCGGCCAAAGATTGTCAAGTAAGTGCGCTTTGTTGATGCCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGTCCTACAAAAc > 1:3625437/1‑100 (MQ=255) aaGGCCGGGTGGGTAATACC‑ATCCGGCCAAAGATTGTCAAGTAAGTGCGCTTTGTTGATGCCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGTCCTACAAAACAt < 2:3116171/100‑1 (MQ=255) aGGCCGGGTGGGTAATACC‑ATCCGGCCAAAGATTGTCAAGTAAGTGCGCTTTGTTGATGCCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGTCCTACAAAACATc < 2:296676/100‑1 (MQ=255) aGGCCGGGTGGGTAATACC‑ATCCGGCCAAAGATTGTCAAGTAAGTGCGCTTTGTTGATGCCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGTCCTACAAAACATc < 2:3962568/100‑1 (MQ=255) tggccggatggtattacccacccggccAAAGATTGTCAAGTAAGTGCGCTTTGTTGATGCCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGTCCTACAAAACATc > 2:1576497‑M2/28‑100 (MQ=255) GGCCGGGTGGGTAATACC‑ATCCGGCCAAAGATTGTCAAGTAAGTGCGCTTTGTTGATGCCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGTCCTACAAAACATCg > 2:1502582‑M1/1‑100 (MQ=255) ggccggatggtattacccacccggccAAAGATTGTCAAGTAAGTGCGCTTTGTTGATGCCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGTCCTACAAAACATc > 1:2000315‑M2/27‑99 (MQ=255) ggccggatggtattacccacccggccAAAGATTGTCAAGTAAGTGCGCTTTGTTGATGCCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGTCCTACAAAACATCg > 1:1397473‑M2/27‑100 (MQ=255) GCCGGGTGGGTAATACC‑ATCCGGCCAAAGATTGTCAAGTAAGTGCGCTTTGTTGATGCCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGTCCTACAAAACATCGc < 2:1818648‑M1/100‑1 (MQ=255) GCCGGGTGGGTAATACC‑ATCCGGCCAAAGATTGTCAAGTAAGTGCGCTTTGTTGATGCCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGTCCTACAAAACATCGc < 2:3306731‑M1/100‑1 (MQ=255) gccggatggtattacccacccggccAAAGATTGTCAAGTGAGTGCACTTTGTTGATGCCGGATGCGGCGCGAGCGCCGTATCCGTCCTACACAACATCGc > 2:2960920‑M2/26‑100 (MQ=255) gccggatggtattacccacccggccAAAGATTGTCAAGTAAGTGCGCTTTGTTGATGCCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGTCCTACAAAACATCGc > 2:673799‑M2/26‑100 (MQ=255) gccggatggtattacccacccggccAAAGATTGTCAAGTAAGTGCGCTTTGTTGATGCCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGTCCTACAAAACATCGc > 1:2306698‑M2/26‑100 (MQ=255) gccggatggtattacccacccggccAAAGATTGTCAAGTAAGTGCGCTTTGTTGATGCCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGTCCTACAAAACATCGc > 1:1803029‑M2/26‑100 (MQ=255) gccggagggtatgacccacccggccAAAGATTGTCAAGTAAGTGCGCTCTGTTGATGCCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCGGTCCTACAAAACTTCg > 2:3725201‑M2/26‑99 (MQ=255) CGGGTGGGTAATACC‑ATCCGGCCAAAGATTGTCAAGTAAGTGCGCTTTGTTGATGCCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGTCCTACAAAACATCGCaa < 2:2256206‑M1/100‑1 (MQ=255) gtgggtAATACC‑ATCCGGCCAAAGATTGTCAAGTAAGTGCGCTTTGTTGATGCCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGTCCTACAAAACATCGCAAAtt > 2:783800/1‑100 (MQ=255) gtgggtAATACC‑AGCCGGCCAAAGATTGTCAAGTAAGTGCGCTTTGTTGATGCCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGTCCTACAAAACATCGCAAAtt < 2:2605634/100‑1 (MQ=255) tgggtAATACC‑ATCCGGCCAAAGATTGTCAAGTAAGTGCGCTTTGTTGATGCCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGTCCTACAAAACATCGCAAATTc < 1:3710932/100‑1 (MQ=255) tgggtAATACC‑ATCCGGCCAAAGATTGTCAAGTAAGTGCGCTTTGTTGATGCCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGTCCTACAAAACATCGCAAATTc < 1:1080425/100‑1 (MQ=255) tgggtAATACC‑ATCCGGCCAAAGATTGTCAAGTAAGTGCGCTTTGTTGATGCCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGTCCTACAAAACATCGCAAATTc < 1:1697803/100‑1 (MQ=255) gggtAATACC‑ATCCGGCCAAAGATTGTCAAGTAAGTGCGCTTTGTTGATGCCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGTCCTACAAAACATCGCAAATTc < 1:88305/99‑1 (MQ=255) ggtAATACC‑ATCCGGCCAAAGATTGTCAAGTAAGTGCGCTTTGTTGATGCCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGTCCTACAAAACATCGCAAATTCaa < 2:3563153/100‑1 (MQ=255) gtAATACC‑ATCCGGCCAAAGATTGTCAAGTAAGTGCGCTTTGTTGATGCCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGTCCTACAAAACATCGCAAATTCAAt < 2:3701312/100‑1 (MQ=255) tAATACC‑ATCCGGCCAAAGATTGTCAAGTAAGTGCGCTTTGTTGATGCCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGTCCTACAAAACATCGCAAATTCAATa > 1:1352318/1‑100 (MQ=255) tCCGGCCAAAGATTGTCAAGTAAGTGCGCTTTGTTGATGCCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGTCCTACAAAACATCGCAAATTCAATAGATTGCaa < 2:2683697/100‑1 (MQ=255) tCCGGCCAAAGATTGTCAAGTAAGTGCGCTTTGTTGATGCCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGTCCTACAAAACATCGCAAATTCAATAGATTGCaa > 1:753476/1‑100 (MQ=255) ggccAAAGATTGTCAAGTAAGTGCGCTTTGTTGATGCCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGTCCTACAAAACATCGCAAATTCAATAGATTGCAATGc > 2:176175‑M2/5‑100 (MQ=255) ccAAAGATTGTCAAGTAAGTGCGCTTTGTTGATGCCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGTCCTACAAAACATCGCAAATTCAATAGATTGCAATGCAc > 1:1492657‑M2/3‑100 (MQ=255) ccAAAGATTGTCAAGTAAGTGCGCTTTGTTGATGCCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGTCCTACAAAACATCGCAAATTCAATAGATTGCAATGCAc > 2:60186‑M2/3‑100 (MQ=255) ccAAAGATTGTCAAGTAAGTGCGCTTTGTTGATGCCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGTCCTACAAAACATCGCAAATTCAATAGATTGCAATGCAc < 2:807479‑M2/98‑1 (MQ=255) cAAAGATTGTCAAGTAAGTGCGCTTTGTTGATGCCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGTCCTACAAAACATCGCAAATTCAATAGATTGCAATGCACt > 1:244236‑M2/2‑100 (MQ=255) | GATTACCGTATTGAGCAAAGCGAAAGAAGGGATTGAAGGCAAAACAGGAACGGTGATTTGTCAGTAATTTAAAGGCCGGGTGGGTAATACC‑ATCCGGCCAAAGATTGTCAAGTAAGTGCGCTTTGTTGATGCCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGTCCTACAAAACATCGCAAATTCAATAGATTGCAATGCACT > NC_000913/3012327‑3012524 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |