| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 3620227 = | NA (NA) | 8 (0.060) | 7/166 | NT | 100% | coding (1036/4236 nt) | rhsB | Rhs protein with DUF4329 family putative toxin domain; putative neighboring cell growth inhibitor |
| ? | NC_000913 | 3620250 = | 0 (0.000) | coding (1059/4236 nt) | rhsB | Rhs protein with DUF4329 family putative toxin domain; putative neighboring cell growth inhibitor | |||||
CGAACTGGCGGTGGTGTATGACCGTAGTGGCAAACAGGTGCGCAGCTTTACTTACGATGATAAATACCGGGGCCGGATGGTGGCGCACCGTCACACGGGCCGGCCGGAAATCCGTTACCGTTACGACAGCGACGGGCGGGTGACAGAACAGCTAAACCCGGCAGGCTTAAGCTACACGTATCAGTATGAGAAAGACCGC > NC_000913/3620151‑3620349 | gtagcttaagcctgccgggtttagctgttctgtcacccgcccgtcgctgtcgtaacggtaacggatttccggccggcccgtgtgacggtgcgccaccatc > 2:1120244‑M2/100‑100 (MQ=255)gtagcttaagcctgccgggtttagctgttctgtcacccgcccgtcgctgtcgtaacggtaacggatttccggccggcccgtgtgacggtgcgccaccatc > 2:3045917‑M2/100‑100 (MQ=255)gtagcttaagcctgccgggtttagctgttctgtcacccgcccgtcgctgtcgtaacggtaacggatttccggccggcccgtgtgacggtgcgccaccatc > 1:1905964‑M2/100‑100 (MQ=255)cGAACTGGCGGTGGTGTATGACCGTAGTGGCAAACAGGTTCGCAGCTTTACTTACGATGATAAATACCGGGGCCGGATGGTGGCGCACCGTCACACGGGC < 2:1813274‑M2/100‑1 (MQ=255)cGAACTGGCGGTGGTGTATGACCGTAGTGGCAAACAGGTGCGCAGCTTTACTTACGATGATAAATACCGGGGCCGGATGGTGGCGCACCGTCACACGGGC < 1:52781‑M2/100‑1 (MQ=255)cGAACTGGCGGTGGTGTATGACCGTAGTGGCAAACAGGTGCGCAGCTTTACTTACGATGATAAATACCGGGGCCGGATGGTGGCGCACCGTCACACGGGC > 1:2964460‑M2/1‑100 (MQ=255)cGAACTGGCGGTGGTGTATGACCGTAGTGGCAAACAGGTGCGCAGCTTTACTTACGATGATAAATACCGGGGCCGGATGGTGGCGCACCGTCACACGGGC > 2:3618686‑M2/1‑100 (MQ=255) tagcttaagcctgccgggtttagctgttctgtcacccgcccgtcgctgtcgtaacggtaacggatttccggccggcccgtgtgacggtgcgccaccatcc < 2:1935604‑M2/2‑1 (MQ=255) tagcttaagcctgccgggtttagctgttctgtcacccgcccgtcgctgtcgtaacggtaacggatttccggccggcccgtgtgacggtgcgccaccatcc > 1:269959‑M2/99‑100 (MQ=255) tagctgaagcctgccgggtttagctgttctgtcacccgcccgtcgctgtcgtaacggtaacggatttccggccggcccgtgtgacggtgcgccaccatcc < 2:1027039‑M2/2‑1 (MQ=255) ggactGGCGGTGGAGTATGACCGTAGTGGCAAACAGGTGCGCCGCTTTACTTACGATGATAAATACCGGGGCCGGATGGTGGCGCACCGTCACACGGGCC < 1:2788167‑M2/98‑1 (MQ=255) gAACTGGCGGTGGTGTATGACCGTAGTGGCAAACAGGTGCGCAGCTTTACTTACGATGATAAATACCGGGGCCGGATGGTGGCGCACCGTCACACGGGCC > 1:1920937‑M2/1‑100 (MQ=255) gAACTGGCGGTGGTGTATGACCGTAGTGGCAAACAGGTGCGCAGCTTTACTTACGATGATAAATACCGGGGCCGGATGGTGGCGCACCGTCACACGGGCC > 1:351866‑M2/1‑100 (MQ=255) gAACTGGCGGTGGTGTATGACCGTAGTGGCAAACAGGTGCGCAGCTTTACTTACGATGATAAATACCGGGGCCGGATGGTGGCGCACCGTCACACGGGCC < 2:42164‑M2/100‑1 (MQ=255) gAACTGGCGGTGGTGTATGACCGTAGTGGCAAACAGGTGCGCAGCTTTACTTACGATGATAAATACCGGGGCCGGATGGTGGCGCACCGTCACACGGGCC < 2:3913162‑M2/100‑1 (MQ=255) gAACTGGCGGTGGTGTATGACCGTAGTGGCAAACAGGTGCGCAGCTTTACTTACGATGATAAATACCGGGGCCGGATGGTGGCGCACCGTCACACGGGCC < 2:490241‑M2/100‑1 (MQ=255) gAACTGGCGGTGGTGTATGACCGTAGTGGCAAACAGGTGCGCAGCTTTACTGACGGTTATTAATCCCGGGGCCGGATGGTGGCGCACCGTCACACGGGCC > 2:2285299‑M2/1‑100 (MQ=255) agcttaagcctgccgggtttagctgttctgtcacccgcccgtcgctgtcgtaacggtaacggatttccggccggcccgtgtgacggtgcgccaccatccg > 1:2064313‑M2/98‑100 (MQ=255) agcttaagcctgccgggtttagctgttctgtcacccgcccgtcgctgtcgtaacggtaacggatttccggccggcccgtgtgacggtgcgccaccatccg < 1:2626021‑M2/3‑1 (MQ=255) agcttaagcctgccgggtttagctgttctgtcacccgcccgtcgctgtcgtaacggtaacggatttccggccggcccgtgtgacggtgcgccaccatccg < 1:2728866‑M2/3‑1 (MQ=255) agcttaagcctgccgggtttagctgttctgtcacccgcccgtcgctgtcgtaacggtaacggatttccggccggcccgtgtgacggtgcgccaccatccg < 1:3496227‑M2/3‑1 (MQ=255) aaCTGGCGGTGGTGTATGGCCGTAGTGGCGAACAGGTGCGTAGCTTTACTTACGATGATAAATACCGGGGCCGGATGGTGGCGCACCGTCACACGGGCCG > 2:1827584‑M2/1‑100 (MQ=255) tcttaagcctgccgggtttagctgttctgtcacccgcccgtcgctgtcgtaacggtaacggatttccggccggcccgtgtgacggtgcgccaccatccgg < 2:2237665‑M2/4‑1 (MQ=255) gcttaagcctgccgggtttagctgttctgtcacccgcccgtcgctgtcgtaacggtaacggatttccggccggcccgtgtgacggtgcgccaccatccgg < 1:769502‑M2/4‑1 (MQ=255) gcttaagcctgccgggtttagctgttctgtcacccgcccgtcgctgtcgtaacggtaacggatttccggccggcccgtgtgacggtgcgccaccatccgg > 1:554727‑M2/97‑100 (MQ=255) gcttaagcctgccgggtttagctgttctgtcacccgcccgtcgctgtcgtaacggtaacggatttccggccggcccgtgtgacggtgcgccaccatccgg < 1:977104‑M2/4‑1 (MQ=255) gcttaagcctgccgggtttagctgttctgtcacccgcccgtcgctgtcgtaacggtaacggatttccggccggcccgtgtgacggtgcgccaccatccgg > 1:4057607‑M2/97‑100 (MQ=255) gcttaagcctgccgggtttagctgttctgtcacccgcccgtcgctgtcgtaacggtaacggatttccggccggcccgtgtgacggtgcgccaccatccgg > 1:4011507‑M2/97‑100 (MQ=255) gcttaagcctgccgggtttagctgttctgtcacccgcccgtcgctgtcgtaacggtaacggatttccggccggcccgtgtgacggtgcgccaccatccgg > 1:1010715‑M2/97‑100 (MQ=255) gcttaagcctgccgggtttagctgttctgtcacccgcccgtcgctgtcgtaacggtaacggatttccggccggcccgtgtgacggtgcgccaccatccgg > 2:265210‑M2/97‑100 (MQ=255) gcttaagcctgccgggtttagctgttctgtcacccgcccgtcgctgtcgtaacggtaacggatttccggccggcccgtgtgacggtgcgccaccatccgg > 1:2831374‑M2/97‑100 (MQ=255) gcttaagcctgccgggtttagctgttctgtcacccgcccgtcgctgtcgtaacggtaacggatttccggccggcccgtgtgacggtgcgccaccatccgg > 2:311809‑M2/97‑100 (MQ=255) aCTGGCGGTGGTGTATGACCGTAGTGGCAAACAGGTGCGCAGCTTTACTTACGATGATAAATACCGGGGCCGGATGGTGGCGCACCGTCACATGGGCCGG > 1:2162167‑M2/1‑100 (MQ=255) aCTGGCGGTGGTGTATGACCGTAGTGGCAAACAGGTGCGCAGCTTTACTTACGATGATAAATACCGGGGCCGGATGGTGGCGCACCGTCACACGGGCCGG > 2:2911964‑M2/1‑100 (MQ=255) aCTGGCGGTGGTGTATGACCGTAGTGGCAAACAGGTGCGCAGCTTTACTTACGATGATAAATACCGGGGCCGGATGGTGGCGCACCGTCACACGGGCCGG > 1:2825749‑M2/1‑100 (MQ=255) aCTGGCGGTGGTGTATGACCGTAGTGGCAAACAGGTGCGCAGCTTTACTTACGATGATAAATACCGGGGCCGGATGGTGGCGCACCGTCACACGGGCCGG < 2:3894873‑M2/100‑1 (MQ=255) aCTGGCGGTGGTGTATGACCGTAGTGGCAAACAGGTGCGCAGCTTTACTTACGATGATAAATACCGGGGCCGGATGGTGGCGCACCGTCACACGGGCCGG < 2:461150‑M2/100‑1 (MQ=255) aCTGGCGGTGGTGTATGACCGTAGTGGCAAACAGGTGCGCAGCTTTACTTACGATGATAAATACCGGGGCCGGATGGTGGCGCACCGTCACACGGGCC < 2:3974005‑M2/98‑1 (MQ=255) cttaagcctgccgggtttagctgttctgtcacccgcccgtcgctgtcgtaacggtaacggatttccggccggcccgtgtgacggtgcgccaccatccggc > 1:2573055‑M2/96‑100 (MQ=255) cttaagcctgccgggtttagctgttctgtcacccgcccgtcgctgtcgtaacggtaacggatttccggccggcccgtgtgacggtgcgccaccatccggc > 1:1375828‑M2/96‑100 (MQ=255) cttaagcctgccgggtttagctgttctgtcacccgcccgtcgctgtcgtaacggtaacggatttccggccggcccgtgtgacggtgcgccaccatccggc > 2:1855801‑M2/96‑100 (MQ=255) cttaagcctgccgggtttagctgttctgtcacccgcccgtcgctgtcgtaacggtaacggatttccggccggcccgtgtgacggtgcgccaccatccggc > 2:3666503‑M2/96‑100 (MQ=255) cttaagcctgccgggtttagctgttctgtcacccgcccgtcgctgtcgtaacggtaacggatttccggccggcccgtgtgacggtgcgccaccatccggc < 2:507356‑M2/5‑1 (MQ=255) cttaagcctgccgggtttagctgttctgtcacccgcccgtcgctgtcgtaacggtaacggatttccggccggcccgtgtgacggtgcgccaccatccggc < 2:162889‑M2/5‑1 (MQ=255) cttaagcctgccgggtttagctgttctgtcacccgcccgtcgctgtcgtaacggtaacggatttccggccggcccgtgtgacggtgcgccaccatccggc > 1:18299‑M2/96‑100 (MQ=255) cTGGCGGTGGTGTATGACCGTAGTGGCAAACAGGTGCGCAGCTTTACTTACGATGATAAATACCGGGGCCGGATGGTGGCGCACCGTCACACGGGCCGGC < 2:2925176‑M2/100‑1 (MQ=255) cTGGCGGTGGTGTATGACCGTAGTGGCAAACAGGTGCGCAGCTTTACTTACGATGATAAATACCGGGGCCGGATGGTGGCGCACCGTCACACGGGCCGGC > 1:362486‑M2/1‑100 (MQ=255) cTGGCGGTGGTGTATGACCGTAGTGGCAAACAGGTGCGCAGCTTTACCTACAATGATAACTACCGGGGCCGGATGGTCGCGCACCGCCACACGGGCCGG > 2:2184534‑M2/1‑99 (MQ=255) ttaagcctgccgggtttagctgttctgtcacccgcccgtcgctgtcgtaacggtaacggatttccggccggcccgtgtgacggtgcgccaccatccggcc < 1:2222036‑M2/6‑1 (MQ=255) tGGCGGTGGTGTATGACCGTAGTGGCAAACAGGTGCGCAGCTTTACTTACGATGATAAATACTGGGGCCGGATTGTGGCGCACCGTCACACGGGCCGGCC > 1:976906‑M2/1‑100 (MQ=255) tGGCGGTGGTGTATGACCGTAGTGGCAAACAGGTGCGCAGCTTTACTTACGATGATAAATACCGGGGCGGGATGGTGGCGCACCGTCACACGGGCCGGCC > 2:191430‑M2/1‑100 (MQ=255) tGGCGGTGGTGTATGACCGTAGTGGCAAACAGGTGCGCAGCTTTACTTACGATGATAAATACCGGGGCCGGATGGTGGCGCACCGTCACACGGGCCGGCC < 2:1343712‑M2/100‑1 (MQ=255) tGGCGGTGGTGTATGACCGTAGTGGCAAACAGGTGCGCAGCTTTACTTACGATGATAAATACCGGGGCCGGATGGTGGCGCACCGTCACACGGGCCGGCC > 1:650829‑M2/1‑100 (MQ=255) taagcctgccgggtttagctgttctgtcacccgcccgtcgctgtcgtaacggtaacggatttccggccggcccgtgtgacggtgcgccaccatccggaga > 1:2237678‑M2/94‑97 (MQ=255) gcctgccgggtgtagctgctatgtcgcccgcccgtcgctgtcgtaacggtaacggatttccggccgggccgtgtgacggtgcgccaccatccggc < 2:891203‑M2/5‑1 (MQ=255) ctgtcacccgcccgtcgctgtcgtaacggtaacggatttccggccggcccgtgtgacggtgcgccaccatCCGGCCGGAAATCCGTTACCGTTACGACAg > 1:1922150‑M2/71‑100 (MQ=255) tttACTTACGATGATAAATACCGGGGCCGGATGGTGGCTCACCGTCACACGGGCCGGCCccggtatttatcatcgtaagtaaagctgcgcacctgtttgc < 2:3029077‑M2/100‑42 (MQ=255) gatgatAAATACCGGGGCCGGATGGTGGCGCACCGTCACACGGGCCGGCCccggtatttatcatcgtaagtaaagctgcgcacctgtttgccactacggt < 1:3384820‑M2/100‑51 (MQ=255) tAAATACCGGGGCCGGATGGTGGCGCACCGTCACACGGGCCGGCCccggtatttatcatcgtcagtaaagctgcgcacctgtttgccactacggtcatac < 2:1049574‑M2/100‑56 (MQ=255) acggatttccggccggcccgtgtgacggtgcgccaccatCCGGCCGGAAATCCGTTACCGTTACGACAGCGACGGGCGGGTGACAGAACAGCTAAACCCg > 1:1201232‑M2/40‑100 (MQ=255) cggatttccggccggcccgtgtgacggtgcgccaccatCCGGCCGGAAATCCGTTACCGTTACGACAGCGACGGGCGGGTGACAGAACAGCTAAACCCgg > 1:1076575‑M2/39‑100 (MQ=255) cggatttccggccggcccgtgtgacggtgcgccaccatCCGGCCGGAAATCCGTTACCGTTACGACAGCGACGGGCGGGTGACAGAACAGCTAAACCCgg > 2:2090305‑M2/39‑100 (MQ=255) aTACCGGGGCCGGATGGTGGCGCACCGTCACACGGGCCGGCCccggtatttatcatcgtaagtaaagctgcgcacctgtttgccactacggtcatacacc < 1:1004653‑M2/100‑59 (MQ=255) tACCGGGGCCGGATGGTGGCGCACCGTCACACGGGCCGGCCccggtatttatcatcgtaagtaaagctgcgcacctgtttgccactacggtcatacacca < 2:1240915‑M2/100‑60 (MQ=255) tttccggccggcccgtgtgacggtgcgccaccatCCGGCCGGAAATCCGTTACCGTTACGACAGCGACGGGCGGGTGACAGAACAGCTAAACCCGGCAgg > 1:3378211‑M2/35‑100 (MQ=255) ccGGGGCCGGATGGTGGCGCACCGTCACACGGGCCGGCCccggtatttatcatcgtatgtaaagctgcgcacctgtttgccactacggtcatacaccacc < 2:2904248‑M2/100‑62 (MQ=255) ccGGGGCCGGATGGTGGCGCACCGTCACACGGGCCGGCCccggtatttatcatcgtaagtaaagctgcgcacctgtttgccactacggtcatacaccacc < 2:1814680‑M2/100‑62 (MQ=255) ccGGGGCCGGATGGTGGCGCACCGTCACACGGGCCGGCCccggtatttatcatcgtaagtaaagctgcgcacctgtttgccactacggtcatacaccacc < 2:519598‑M2/100‑62 (MQ=255) ccGGGGCCGGATGGTGGCGCACCGTCACACGGGCCGGCCccggtatttatcatcgtaagtaaagctgcgcacctgtttgccactacggtcatacaccacc < 2:2944733‑M2/100‑62 (MQ=255) ccGGGGCCGGATGGTGGCGCACCGTCACACGGGCCGGCCccggtatttatcatcgtaagtaaagctgcgcacctgtttgccactacggtcatacaccacc < 1:2286329‑M2/100‑62 (MQ=255) ccGGGGCCGGATGGTGGCGCACCGTCACACGGGCCGGCCccggtatttatcatcgtaagtaaagctgcgcaactgtttgccactacggtcatacaccacc < 1:1103520‑M2/100‑62 (MQ=255) tccggccggcccgtgtgacggtgcgccaccatCCGGCCGGAAATCCGTTACCGTTACGACAGCGACGGGCGGGTGACAGAACAGCTAAACCCGGCAGGc > 2:1914104‑M2/33‑99 (MQ=255) ggggCCGGATGGTGGCGCACCGTCACACGGGCCGGCCccggtatttatcatcgtaagtaaagctgcgcacctgtttgccactacggtcataccccaccgc < 2:1402164‑M2/100‑64 (MQ=255) ggggCCGGATGGTGGCGCACCGTCACACGGGCCGGCCccggtatttatcatcgtaagtaaagctgcgcacctgtttgccactacggtcatacaccaccgc < 1:2318975‑M2/100‑64 (MQ=255) ccggccggcccgtgtgacggtgcgccaccatCCGGCCGGAAATCCGTTACCGTTACGACAGCGACGGGCGGGTGACAGAACAGCTAAACCCGGCAGGCtt > 1:627120‑M2/32‑100 (MQ=255) gggCCGGATGGTGGCGCACCGTCACACGGGCCGGCCccggtatttatcatcgtaagtaaagctgcgcacctgtttgccactacggtcatacaccaccgcc < 1:1038385‑M2/100‑65 (MQ=255) gggCCGGATGGTGGCGCACCGTCACACGGGCCGGCCccggtatttatcatcgtaagtaaagctgcgcacctgtttgccactacggtcatacaccaccgcc < 2:775627‑M2/100‑65 (MQ=255) gggCCGGATGGTGGCGCACCGTCACACGGGCCGGCCccggtatttatcatcgtaagtaaagctgcgcacctgtttgccactacggtcatacaccaccgcc < 1:2360268‑M2/100‑65 (MQ=255) gggCCGGATGGTGGCGCACCGTCACACGGGCCGGCCccggtatttatcatcgtaagtaaagctgcgcacctgtttgccactacggtcatacaccaccgcc < 1:3282850‑M2/100‑65 (MQ=255) cggccggcgcgtgtgacggtgcgccaccatCCGGCCGGAAATCCGTTACCGTTACGACAGCGACGGGCGGGTGACAGAACAGCTAAACCCGGCAGGCtt > 2:2909080‑M2/31‑99 (MQ=255) ggCCGGATGGTGGCGCACCGTCACACGGGCCGGCCccggtatttatcatcgtaagtaaagctgcgcacctgtttgccactacggtcatacaccaccgcca < 1:3034623‑M2/100‑66 (MQ=255) gATGGTGGCGCACCGTCAC‑CAT‑CCGGCCccggtatttatcatcgtaggtaaagctgcgcacctgtttgccactacggtcatacaccaccgccagttcgcc < 2:978860‑M2/100‑73 (MQ=255) ccggccccggtatttatcatcgtaagtaaagctgcgcacctgtttgccactacggtcatacaccaccgccagttcgccgcgtggcgtccagccatagcgc < 1:1272204‑M2/100‑95 (MQ=255) ccggccccggtatttatcatcgtaagtaaagctgcgcacctgtttgccactacggtcatacaccaccgccagttcgccgcgtggcgtccagccatagcgc > 1:1424842‑M2/1‑6 (MQ=255) ccggccccggtatttatcatcgtaagtaaagctgcgcacctgtttgccactacggtcatacaccaccgccagttcgccgcgtggcgtccagccatagcgc > 1:713640‑M2/1‑6 (MQ=255) ccggccccggtatttatcatcgtaagtaaagctgcgcacctgtttgccactacggtcatacaccaccgccagttcgccgcgtggcgtccagccatagcgc > 2:1122109‑M2/1‑6 (MQ=255) ccggccccggtatttatcatcgtaagtaaagctgcgcacctgtttgccactacggtcatacaccaccgccagttcgccgcgtggcgtccagccatagcg > 1:1566642‑M2/1‑6 (MQ=255) ccggccccggtatttatcatcgtaagtaaagctgcgcacctgtttgccactacggtcatacaccaccgccagttcgccgcgtggcgtccagccatagcg > 2:3136198‑M2/1‑6 (MQ=255) ccggccccggtatttatcatcgtaagtaaagctgcgcacctgtttgccactacggtcatacaccaccgccagttcgccgcgtggcgtccagccatagcg > 1:4137922‑M2/1‑6 (MQ=255) CCGGCCGGAAATCCGTTACCGTTACGACAGCGACGGGCGGGTGACAGAACAGCTAAACCCGGCAGGCTTAAGCTACACGTATCAGTATGAGAAAGACCGc < 2:2991030‑M2/100‑1 (MQ=255) CCGGCCGGAAATCCGTTACCGTTACGACAGCGACGGGCGGGTGACAGAACAGCTAAACCCGGCAGGCTTAAGCTACACGTATCAGTATGAGAAAGACCGc < 2:2922395‑M2/100‑1 (MQ=255) | CGAACTGGCGGTGGTGTATGACCGTAGTGGCAAACAGGTGCGCAGCTTTACTTACGATGATAAATACCGGGGCCGGATGGTGGCGCACCGTCACACGGGCCGGCCGGAAATCCGTTACCGTTACGACAGCGACGGGCGGGTGACAGAACAGCTAAACCCGGCAGGCTTAAGCTACACGTATCAGTATGAGAAAGACCGC > NC_000913/3620151‑3620349 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |