| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 4266888 = | NA (NA) | 15 (0.110) | 9/164 | NT | NA | noncoding (1/97 nt) | RIP318 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 2 REP sequences and 1 IHF site | RIP318 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 2 REP sequences and 1 IHF site |
| ? | NC_000913 | 4266918 = | NA (NA) | noncoding (31/97 nt) | RIP318 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 2 REP sequences and 1 IHF site | RIP318 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 2 REP sequences and 1 IHF site | |||||
Only 100 of 177 total aligned reads displayed.
TACGCGCCTGACTTCAAGGGTCGCGATGAAATACGTGGATTAATCGTTCTGTAATATTTGATTGTCTGTGCCGGATGCGGCGTGAATGCCTTATCCGGCCAATAAAATCCTAAAAATTCAATAAGTTGATGTTCTTTCATGCTCTTATAAAGGTCGTGCCTCTGGCGGATGTACGTTTGTCATGAGTCTCACTCTGTTG > NC_000913/4266819‑4267017 | taCGCGCCTGACTTCAAGGGTCGCGATGAAATACGTGGATTAATCGTTCTGTAATATTTGATTGTCTGTGCCGGATGCGGCGTGAATGCCTTATCCGGcc < 2:374412/100‑1 (MQ=255) cgccagaggcacgacctttataagagcatgaaagaacatcaacttattgaatttttaggattttattgGCCGGATGCGGCGTGAATGCCTTATCCGGCCa > 1:554041‑M1/69‑100 (MQ=255) cgccagaggcacgacctttataagagcatgaaagaacatcaacttattgaatttttaggattttattgGCCGGATGCGGCGTGAATGCCTTATCCGGCCa > 2:160166‑M1/69‑100 (MQ=255) gcgcCTGACTTCAAGGGTCGCGATGAAATACGTGGATTAATCGTTCTGTAATATTTGATTGTCTGTGCCGGATGCGGCGTGAATGCCTTATCCGGCCAAt < 2:1745375/100‑1 (MQ=255) gcCTGACTTCAAGGGTCCCGATGAAATACGTGGATTAATCGTTCTGTAATCTTTGACAGTGTGTGACGGAAGCGGCGTTAATGCCTTCACCGGCCCATaa > 2:3660824/1‑100 (MQ=255) gaggcacgacctttataagagcatgaaagaacatcaacttattgaatttttaggattttattgGCCGGATGCGGCGTGAATGCCTTATCCGGCCAATaaa > 1:1253132‑M1/64‑100 (MQ=255) cTGACTTCAAGGGTCGCGATGAAATACGTGGATTAATCGTTCTGTAATATTTGATTGTCTGTGCCGGATGCGGCGTGAATGCCTTATCCGGCCAATaaaa < 2:3991996/100‑1 (MQ=255) tGACTTCAAGGGTCGCGATGAAATACGTGGATTAATCGTTCTGTAATATTTGATTGTCTGTGCCGGATGCGGCGTGAATGCCTTATCCGGCCAATAAAAt < 1:2815973/100‑1 (MQ=255) gACTTCAAGGGTCGCGATGAAGTACGTGGATTAATCGTTCTGTAATATTTGATTGTCTGTGCCGGATGCGGCGTGAATGCCTTATCCGGCCAATAAAATc < 2:2955651/100‑1 (MQ=255) aCTTCAAGGGTCGCGATGAAATACGTGGATTAATCGTTCTGTAATATTTGATTGTCTGTGCCGGATGCGGCGTGAATGCCTTATCCGGCCAATAAAATcc < 1:1471531/100‑1 (MQ=255) cTTCAAGGGTCGCGATGAAATACGTGGATTAATCGTTCTGTAATATTTGATTGTCTGTGCCGGATGCGGCGTGAATGCCTTATCCGGCCAATAAAATCCt < 1:3887558/100‑1 (MQ=255) ctttataagagcatgaaagaacatcaacttattgaatttttaggatttgattgaccggataaggcattcacgctgcatccggcTAATAAAATCATaaaaa > 2:2095600‑M2/84‑100 (MQ=255) aGGGTCGCGATGAAATACGTGGATTAATCGTTCTGTAATATTTGATTGTCTGTGCCGGATGCGGCGTGAATGCCTTATCCGGCCAATAAAATCCTaaaaa > 2:886255/1‑100 (MQ=255) gggTCGCGATGAAATACGTGGATTAATCGTTCTGTAATATTTGATTGTCTGTGCCGGATGCGGCGTGAATGCCTTATCCGGCCAATAAAATCCTAAAAAt < 1:2196166/100‑1 (MQ=255) tCGAGATGAAATACGTGGATTAATGGTTCTGTAATATTTGATTGGCTGTGCCGGATGCGGCGAGAATGCCTTATCCGACCAATAAAATCCTAAAAATTc < 2:1659511/99‑1 (MQ=38) cgATGAAATACGTGGATTAATCGTTCTGTAATATTTGATTGTCTGTGCCGGATGCGGCGTGAATGCCTTATCCGGCCAATAAAATCCTAAAAATTCAATa < 1:2480653/100‑1 (MQ=255) aaTACGTGGATTAATCGTTCTGTAATATTTGATTGTCTGTGCCGGATGCGGCGTGAATGCCTTATCCGGCCAATAAAATCCTAAAAATTCAATAAGTTGa > 2:1243182/1‑100 (MQ=255) aaTACGTGGATTAATCGTTCTGTAATATTTGATGGTCTGTGCCGGATGCGGCGTGAATGCCTTATCCGGCCAATAAAATCCTAAAAATTCAATAAGTTGa < 2:735628/100‑1 (MQ=255) aTACGTGGATTAATCGTTCTGTAATATTTGATTGTCTGTGCCGGATGCGGCGTGAATGCCTTATCCGGCCAATAAAATCCTAAAAATTCAATAAGTTGAt > 1:1023011/1‑100 (MQ=255) aCGTGGATTAATCGTTCTGTAATATTTGATTGTCTGTGCCGGATGCGGCGTGAATGCCTTATCCGGCCAATAAAATCCTAAAAATTCAATAAGTTGATg < 1:1372366/99‑1 (MQ=255) ggATTAATCGTTCTGTAATATTTGATTGTCTGTGCCGGATGCGGCGTGAATGCCTTATCCGGCCAATAAAATCCTAAAAATTCAATAAGTTGATGTTCtt > 2:3152379/1‑100 (MQ=255) gATTAATCGTTCTGTAATATTTGATTGTCTGTGCCGGATGCGGCGTGAATGCCTTATCCGGCCAATAAAATCCTAAAAATTCAATAAGTTGATGTTCttt < 1:4104366/100‑1 (MQ=255) gATTAATCGTTCTGTAATATTTGATTGTCTGTGCCGGATGCGGCGTGAATGCCTTATCCGGCCAATAAAATCCTAAAAATTCAATAAGTTGATGTTCttt < 2:973242/100‑1 (MQ=255) gATTAATCGTTCTGTAATATTTGATTGTCTGTGCCGGATGCGGCGTGAATGCCTTATCCGGCCAATAAAATCCTAAAAATTCAATAAGTTGATGCTCttt > 1:1865634/1‑100 (MQ=255) aTTAATCGTTCTGTAATATTTGATTGTCTGTGCCGGATGCGGCGTGAATGCCTTATCCGGCCAATAAAATCCTAAAAATTCAATAAGTTGATGTTCTTTc < 2:1667436/100‑1 (MQ=255) aTTAATCGTTCTGTAATATTTGATTGTCTGTGCCGGATGCGGCGTGAATGCCTTATCCGGCCAATAAAATCCTAAAAATTCAATAAGTTGATGTTCTTTc < 1:1268902/100‑1 (MQ=255) aTTAATCGTTCTGTAATATTTGATTGTCTGTGCCGGATGCGGCGTGAATGCCTTATCCGGCCAATAAAATCCTAAAAATTCAATAAGTTGATGTTCTTTc < 1:3487522/100‑1 (MQ=255) aTTAATCGTTCTGTAATATTTGATTGTCTGTGCCGGATGCGGCGTGAATGCCTTATCCGGCCAATAAAATCCTAAAAATTCAATAAGTTGATGTTCTTTc > 1:3343371/1‑100 (MQ=255) tAATCGTTCTGTAATATTTGATTGTCTGTGCCGGATGCGGCGTGAATGACTTATCCGGCCAATAAAATCCTAAAAAGTCAATAAGTTGATGTTCTTTCa < 2:3865098/99‑1 (MQ=255) aaTCGTTCTGTAATATTTGATTGTCTGTGCCGGATGCGGCGTGAATGCCTTATCCGGCCAATAAAATCCTAAAAATTCAATAAGTTGATGTTCTTTCATg < 2:3571629/100‑1 (MQ=255) aaTCGTTCTGTAATATTTGAATGTCTGTGCCGGATGCGGCGTGAATGCCTTATCCGGCCAATAAAATCCTAAAAATTCAATAAGTTGATGTTCTTTCATg > 2:2527602/1‑100 (MQ=255) aTCGTTCTGTAATATTTGATTGTCTGTGCCGGATGCGGCGTGAATGCCTTATCCGGCCAATGAAATCCTAAAAATTCAATAAGTTGATGTTCTTTCATGc < 1:2342065/100‑1 (MQ=255) aTCGTTCTGTAATATTTGATTGTCTGTGCCGGATGCGGCGTGAATGCCTTATCCGGCCAATAAAATCCTAAAAATTCAATAAGTTGATGTTCTTTCAt > 2:2755427/1‑98 (MQ=255) aTCGTTCTGTAATATTTGATTGTCTGTGCCGGATGCGGCGTGAATGCCTTATCCGGCCAATAAAATCCTAAAAATTCAATAAGTTGATGTTCTTTCATGc > 1:1358866/1‑100 (MQ=255) tCGTTCTGTAATATTTGATTGTCTGTGCCGGATGCGGCGTGAATGCCTTATCCGGCCAATAAAATCCTAAAAATTCAATAAGTTGATGTTCTTTCATGct < 2:1046544/100‑1 (MQ=255) cGTTCTGTAATATTTGATTGTCTGTGCCGGATGCGGCGTGAATGCCTTATCCGGCCAATAAAATCCTAAAAATTCAATAAGTTGATGTTCTTTCATGctc < 1:2076533/100‑1 (MQ=255) cGTTCTGTAATATTTGATTGTCTGTGCCGGATGCGGCGTGAATGCCTTATCCGGCCAATAAAATCCTAAAAATTCAATAAGTTGATGTTCTTTCATGctc < 1:1161987/100‑1 (MQ=255) gTTCTGGAATATTTGATTGTCTGTGCCGGATGCGGCGTGAATGCCTTATCCGGCCAATAAAATCCTAAAAATTCAATAAGTTGATGTTCTTTCATGctct < 2:2027657/100‑1 (MQ=255) tCTGTAATATTTGATTGTCTGTGCCGGATGCGGCGTGAATGCCTTATCCGGCCAATAAAATCCTAAAAATTCAATAAGTTGATGTTCTTTCATGCTCTta < 2:3233388/100‑1 (MQ=255) tCTGTAATATTTGATTGTCTGTGCCGGATGCGGCGTGAATGCCTTATCCGGCCAATAAAATCCTAAAAATTCAATAAGTTGATGTTCTTTCATGCTCTta < 1:181339/100‑1 (MQ=255) tCTGTAATATTTGATTGGCTGTGCCAGATGCGGCGTGAATGCCTTATCCGGCCAATAAAATCCTAAAAATTCAATAAGTTGATGTTCTTTCATGCTCTta > 2:742082/1‑100 (MQ=255) cTGTAATATTTGATTGTCTGTGCCGGATGCGGCGTGAATGCCTTATCCGGCCAATAACATCCTAAAAATTCAATAAGTTGATGTTCTTTCATGCTCTta < 2:3923693/99‑1 (MQ=255) gTAATATTTGATTGTCTGTGCCGGATGCGGCGTGAATGCCTTATCCGGCCAATAAAATCCTAAAAATTCAATAAGTTGATGTTCTTTCATGCTCTtat < 2:509841/98‑1 (MQ=255) gTAATATTTGATTGTCTGTGCCGGATGCGGCGTGAATGCCTTATCCGGCCAATAAAATCCTAAAAATTCAATAAGTTGATGTTCTTTCATGCTCTTATaa < 2:424106/100‑1 (MQ=255) gTAATATTTGATTGTCTGTGCCGGATGCGGCGTGAATGCCTTATCCGGCCAATAAAATCCTAAAAATTCAATAAGTTGATGTTCTTTCATGCTCTTATaa > 1:3054290/1‑100 (MQ=255) tAATATTTGATTGTCTGTGCCGGATGCGGCGTGAATGCCTTATCCGGCCAATAAAATCCTAAAAATTCAATAAGTTGATGTTCTTTCATGCTCTTATaaa < 2:3380554/100‑1 (MQ=255) atatTTGATTGTCTGTGCCGGATGCGGCGTGAATGCCTTATCCGGCCAATAAAATCCTAAAAATTCAATAAGTTGATGTTCTTTCATGCTCTTATAAAgg < 2:2119773/100‑1 (MQ=255) atatTTGATTGTCTGTGCCGGATGCGGCGTGAATGCCTTATCCGGCCAATAAAATCCTAAAAATTCAATAAGTTGATGTTCTTTCATGCTCTTATAAAgg < 2:3209247/100‑1 (MQ=255) atTTGATTGTCTGTGCCGGATGCGGCGTGAATGCCTTATCCGGCCAATAAAATCCTAAAAATTCAATAAGTTGATGTTCTTTCATGCTCTTATAAAGGTc > 2:2532466/1‑100 (MQ=255) tttGATTGTCTGTGCCGGATGCGGCGTGAATGCCTTATCCGGCCAATAAAATCCTAAAAATTCAATAAGTTGATGTTCTTTCATGCTCTTATAAAGGTCg > 2:2767536/1‑100 (MQ=255) tttGATTGTCTGTGCCGGATGCAGCGTGAATGCCTTATCCGGCCAATAAAATCCTAAAAATTCAATAAGTTGATGTTCTTTCATGCTCTTATAAAGGTCg > 1:2602283/1‑100 (MQ=255) ttGATTGTCTGTGCCGGATGCGGCGTGAATGCCTTATCCGGCCAATAAAATCCTAAAAATTCAATAAGTTGATGTTCTTTCATGCTCTTATAAAGGTCGt > 1:2142122/1‑100 (MQ=255) tGATTGTCTGTGCCGGATGCGGCGTGAATGCCTTATCCGGCCAATAAAATCCTAAAAATTCAATAAGTTGATGTTCTTTCATGCTCTTATAAAGGTCGTg < 1:474768/100‑1 (MQ=255) tGATTGTCTGTGCCGGATGCGGCGTGAATGCCTTATCCGGCCAATAAAATCCTAAAAATTCAATAAGTTGATGTTCTTTCATGCTCTTATAAAGGTCGTg < 2:2744867/100‑1 (MQ=255) tGATTGTCTGTGCCGGATGCGGCGTGAATGCCTTATCCGGCCAATAAAATCCTAAAAATTCAATAAGTTGATGTTCTTTCATGCTCTTATAAAGGTCGTg > 1:1677802/1‑100 (MQ=255) gATTGTCTGTGCCGGATGCGGCGTGAATGCCTTATCCGGCCAATAAAATCCTAAAAATTCAATAAGTTGATGTTCTTTCATGCTCTTATAAAGGTCGTGc > 1:1638816/1‑100 (MQ=255) ttattggccggataaggcattcacgccgcatccggcCAATAAAATCCTAAAAATTCAATAAGTTGATGTTCTTTCATGCTCTTATAAAGGTCGTGCctct > 2:1305332‑M2/37‑100 (MQ=255) gTCTGTGCCGGATGCGGCGTGAATGCCTTATCCGGCCAATAAAATCCTAAAAATTCAATAAGTTGATGTTCTTTCATGCTCTTATAAAGGTCGTGCctct > 1:3589651/1‑100 (MQ=255) cTGTGCCGGATGCGGCGTGAATGCCTTATCCGGCCAATAAAATCCTAAAAATTCAATAAGTTGATGTTCTTTCATGCTCTTATAAAGGTCGTGCCTCTgg > 1:2691495/1‑100 (MQ=255) cTGTGCCGGATGCGGCGTGAATGCCTTATCCGGCCAATAAAATCCTAAAAATTCAATAAGTTGATGTTCTTTCATGCTCTTATAAAGGTCGTGCCTCTgg > 1:350522/1‑100 (MQ=255) cTGTGCCGGATGCGGCGTGAATGCCTTATCATGCCAATAAAATCCTAAAAATTCAATAAGTTGATGTTTTTTCATGCTCTTATAAAGGTCGTGCct > 2:583636/1‑96 (MQ=255) attggccggataaggcattcacgccgcatccggcCAATAAAATCCTAAAAATTCAATAAGTTGATGTTCTTTCATGCTCTTATAAAGGTCGTGCCTCTgg > 1:1753651‑M2/35‑100 (MQ=255) tggccggataaggcattcacgccgcatccggcCAATAAAATCCTAAAAATTCAATAAGTTGATGTTCTTTCATGCTCTTATAAAGGTCGTGCCTCTGGCg > 1:554041‑M2/33‑100 (MQ=255) tggccggataaggcattcacgccgcatccgacCTATAAAATCCTAAAAATTCAATAAGTTGATGTTCTTTCATGCTCTTATAAAGGTCGAGCCTCTGGCg > 2:2724974‑M2/33‑100 (MQ=255) gtgCCGGATGCGGCGTGAATGCCTTATCCGGCCAATAAAATCCTAAAAATTCAATAAGTTGATGTTCTTTCATGCTCTTATAAAGGTCGTGCCTCTGGCg < 2:705637/100‑1 (MQ=255) gccggataaggcattcacgccgcatccggcCAATAAAATCCTAAAAATTCAATAAGTTGATGTTCTTTCATGCTCTTATAAAGGTCGTGCCTCTGGc > 2:381421‑M2/31‑97 (MQ=255) gccggataaggcattcacgccgcatccggcCAATAAAATCCTAAAAATTCAATAAGTTGATGTTCTTTCATGCTCTTATAAAGGTCGTGCCTCTGGCGGa > 1:1001481‑M2/31‑100 (MQ=255) gccggataaggcattcacgccgcatccggcCAATAAAATCCTAAAAATTCAATAAGTTGATGTTCTTTCATGCTCTTATAAAGGTCGTGCCTCTGGCGGa > 2:1412408‑M2/31‑100 (MQ=255) CCGGATGCGGCGTGAATGCCTTATCCGGCCAATAAAATCCTAAAAATTCAATAAGTTGATGTTCTTTCATGCTCTTATAAAGGTCGTGCCTCTGGCGGAt > 2:2698083‑M1/1‑100 (MQ=255) CCGGATGCGGCGTGAATGCCTTATCCGGCCAATAAAATCCTAAAAATTCAATAAGTTGATGTTCTTTCATGCTCTTATAAAGGTCGTGCCTCTGGCGGAt > 2:2470956‑M1/1‑100 (MQ=255) CGGATGCGGCGTGAATGCCTTATCCGGCCAATAAAATCCTAAAAATTCAATAAGTTGATGTTCTTTCATGCTCTTATAAAGGTCGTGCCTCTGGCGGATg > 1:1289284‑M1/1‑100 (MQ=255) CGGATGCGGCGTGAATGCCTTATCCGGCCAATAAAATCCTAAAAATTCAATAAGTTGATGTTCTTTCATGCTCTTATAAAGGTCGTGCCTCTGGCGGATg > 2:1509049‑M1/1‑100 (MQ=255) GATGCGGCGTGAATGCCTTATCCGGCCAATAAAATCCTAAAAATTCAATAAGTTGATGTTCTTTCATGCTCTTATAAAGGTCGTGCCTCTGGCGGATGTa < 2:3414033‑M1/100‑1 (MQ=255) ATGCGGCGTGAATGCCTTATCCGGCCAATAAAATCCTAAAAATTCAATAAGTTGATGTTCTTTCATGCTCTTATAAAGGTCGTGCCTCTGGCGGATGTa > 1:3815802‑M1/1‑99 (MQ=255) TGCGGCGTGAATGCCTTATCCGGCCAATAAAATCCTAAAAATTCAATAAGTTGATGTTCTTTCATGCTCTTATAAAGGTCGTGCCTCTGGCGGATGTACg > 1:1896965‑M1/1‑100 (MQ=255) cggcgTGAATGCCTTATCCGGCCAATAAAATCCTAAAAATTCAATAAGTTGATGTTCTTTCATGCTCTTATAAAGGTCGTGCCTCTGGCGGATGTACGtt > 2:803355/1‑100 (MQ=255) ggcgTGAATGCCTTATCCGGCCAATAAAATCCTAAAAATTCAATAAGTTGATGTTCTTTCATGCTCTTATAAAGGTCGTGCCTCTGGCGGATGTACGttt > 2:537434/1‑100 (MQ=255) gcgTGAATGCCTTATCCGGCCAATAAAATCCTAAAAATTCAATAAGTTGATGTTCTTTCATGCTCTTATAAAGGTCGTGCCTCTGGCGGATGTACGTTTg < 2:2864605/100‑1 (MQ=255) gcgTGAATGCCTTATCCGGCCAATAAAATCCTAAAAATTCAATAAGTTGATGTTCTTTCATGCTCTTATAAAGGTCGTGCCTCTGGCGGATGTACGTTTg < 1:3890042/100‑1 (MQ=255) gcgTGAATGCCTTATCCGGCCAATAAAATCCTAAAAATTCAATAAGTTGATGTTCTTTCATGCTCTTATAAAGGTCGTGCCTCTGGCGGATGTACGTTTg < 1:3885057/100‑1 (MQ=255) cgTGAATGCCTTATCCGGCCAATAAAATCCTAAAAATTCAATAAGTTGATGTTCTTTCATGCTCTTATAAAGGTCGTGCCTCTGGCGGATGTACGTTTGt > 2:161710/1‑100 (MQ=255) tGAATTCCTTATCCAGCCAATAAAATCGTAAAAATTCAATAAGTTGATTTTCATTGATACTTTTATGAAGGGCGTTCCTCTGGCGGATTTACGTTTGt > 2:1188178/1‑98 (MQ=255) tGAATGCCTTATCCGGCCAATAAAATCCTAAAAATTCAATAAGTTGATGTTCTTTCATGCTCTTATAAAGGTCGTGCCTCTGGCGGATGTACGTTTGTCa > 2:3533049/1‑100 (MQ=255) aTGCCTTATCCGGCCAATAAAATCCTAAAAATTCAATAAGTTGATGTTCTTTCATGCTCTTATAAAGGTCGTGCCTCTGGCGGATGTACGTTTGTCATGa < 1:1299730/100‑1 (MQ=255) aTGCCTTATCCGGCCAATAAAATCCTAAAAATTCAATAAGTTGATGTTCTTTCATGCTCTTATAAAGGTCGTGCCTCTGGCGGATGTACGTTTGTCATGa > 2:129008/1‑100 (MQ=255) tGCCTTATCCGGCCAATAAAATCCTAAAAATTCAATAAGTTGATGTTCTTTCATGCTCTTATAAAGGTCGTGCCTCTGGCGGATGTACGTTTGTCATGAg < 1:1577622/100‑1 (MQ=255) tGCCTTATCCGGCAAATAAAATCCTAAAAATTCAATAAGTTGATGTTCTTTCATGCTCTTATAAAGGTCGTGCCTCTGGCGGATGTACGTTTGTCATGAg > 1:2798780/1‑100 (MQ=255) gCCTTATCCGGCCAATAAAATCCTAAAAATTCAATAAGTTGATGTTCTTTCATGCTCTTATAAAGGTCGTGCCTCTGGCGGATGTACGTTTGTCATGAGt > 1:2295638/1‑100 (MQ=255) ccTTATCCGGCCAATAAAATCCTAAAAATTCAATAAGTTGATGTTCTTTCATGCTCTTATAAAGGTCGTGCCTCTGGCGGATGTACGTTTGTCATGAGtc > 1:1255568/1‑100 (MQ=255) ccTTATCCGGCCAATAAAATCCTAAAAATTCAATAAGTTGATGTTCTTTCATGCTCTTATAAAGGTCGTGCCTCTGGCGGATGTACGTTTGTCATGAGt > 2:2354810/1‑99 (MQ=255) cTTATCCGGCCAATAAAATCCTAAAAATTCAATAAGTTGATGTTCTTTCATGCTCTTATAAAGGTCGTGCCTCTGGCGGATGTACGTTTGTCATGAGtct > 1:1516333/1‑100 (MQ=255) ttATCCGGCCAATAAAATCCTAAAAATTCAATAAGTTGATGTTCTTTCATGCTCTTATAAAGGTCGTGCCTCTGGCGGATGTACGTTTGTCATGAGtctc < 1:316332/100‑1 (MQ=255) ttATCCGGCCAATAAAATCCTAAAAATTCAATAAGTTGATGTTCTTTCATGCTCTTATAAAGGTCGTGCCTCTGGCGGATGTACGTTTGTCATGAGtctc < 2:3667829/100‑1 (MQ=255) ccggcCAATAAAATCCTAAAAATTCAATAAGTTGATGTTCTTTCATGCTCTTATAAAGGTCGTGCCTCTGGCGGATGTACGTTTGTCATGAGTCTCActc < 2:3893659‑M2/95‑1 (MQ=255) ggcCAATAAAATCCTAAAAATTCAATAAGTTGATGTTCTTTCATGCTCTTATAAAGGTCGTGCCTCTGGCGGATGTACGTTTGTCATGAGTCTCACTCTg > 1:796496‑M2/4‑100 (MQ=255) ggcCAATAAAATCCTAAAAATTCAATAAGTTGATGTTCTTTCATGCTCTTATAAAGGTCGTGCCTCTGGCGGATGTACGTTTGTCATGAGTCTCACTCTg > 1:1638078‑M2/4‑100 (MQ=255) gcCAATAAAATCCTAAAAATTCAATAAGTTGATGTTCTTTCATGCTCTTATAAAGGTCGTGCCTCTGGCGGATGTACGTTTGTCATGAGTCTCActc < 2:2266551‑M2/95‑1 (MQ=255) cCAATAAAATCGTAAAAATTCAATAAGTTGATGTTCTTTCATGCTCTTATAAAGGTCGTTCCTCTGGCTGATGTACGTTTGTCATGAGTCTCACTCTGtt < 2:1491450‑M2/99‑1 (MQ=255) cAATAAAATCCTAAAAATTCAATAAGTTGATGTTCTTTCATGCTCTTATAAAGGTCGTGCCTCTGGCGGATGTACGTTTGTCATGAGTCTCACTCTGTTg > 2:2603820/1‑100 (MQ=255) cAATAAAATCCTAAAAATTCAATAAGTTGATGTTCTTTCATGCTCTTATAAAGGTCGTGCCTCTGGCGGATGTACGTTTGTCATGAGTCTCACTCTGTTg < 1:2178450/100‑1 (MQ=255) | TACGCGCCTGACTTCAAGGGTCGCGATGAAATACGTGGATTAATCGTTCTGTAATATTTGATTGTCTGTGCCGGATGCGGCGTGAATGCCTTATCCGGCCAATAAAATCCTAAAAATTCAATAAGTTGATGTTCTTTCATGCTCTTATAAAGGTCGTGCCTCTGGCGGATGTACGTTTGTCATGAGTCTCACTCTGTTG > NC_000913/4266819‑4267017 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |