| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 409056 = | NA (NA) | 19 (0.140) | 8/164 | NT | NA | noncoding (5/37 nt) | REP34 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 1 REP sequences | REP34 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 1 REP sequences |
| ? | NC_000913 | 409089 = | NA (NA) | intergenic (+139/+19) | ykiA/rdgC | pseudogene/nucleoid‑associated ssDNA and dsDNA binding protein; competitive inhibitor of RecA function | |||||
Only 100 of 233 total aligned reads displayed.
ATATTGCTGCGCTAAAAATTATTGCTCGCCGTAGCGAATAATTATATGCCTGGTGTGGCTTCGTACGCCGGATAAGACGCGGCAGGCGTCGCATCCGGCATTAAAGGAAAATCAGCAATTAACGTTGTGCTTCGCCACCTAATCCTTCAATCAGGTTTTGAATTAACGCTGCCAGTTCACCAGTCATCAGGATGAAATC > NC_000913/408990‑409188 | taattcaaaacctgattgaaggattaggtggcgaagcacaacgttaattgctgattttcctttaatGCCGGATAAGACGCGGCAGGCGTCGCATCCGGCa > 2:2676387‑M1/67‑100 (MQ=255) tatTGCTGCGCTAAAAATTATTGCTCGCCGTAGCGAATAATTATATGCCTGGTGTGGCTTCGTACGCCGGATAAGACGCGGCAGGCGTCGCATCCGGCAt < 1:3594271/100‑1 (MQ=255) aattcaaaacctgattgaaggattaggtggcgaagcacaacgttaattgctgattttcctttaatGCCGGATAAGACGCGGCAGGCGTCGCATCCGGCAt > 1:2576376‑M1/66‑100 (MQ=255) attcaaaacctgattgaaggattaggtggcgaagcacaacgttaattgctgattttcctttaatGCCGGATAAGACGCGGCAGGCGTCGCATCCGGCAtt > 1:243655‑M1/65‑100 (MQ=255) atTGCTGCGCTAAAAATTATTGCTCGCCGTAGCGAATAATTATATGCCTGGTGTGGCTTCGTACGCCGGATAAGACGCGGCAGGCGTCGCATCCGGCAtt < 1:150759/100‑1 (MQ=255) atTGCTGCGCTAAAAATTATTGCTCGCCGTAGCGAATAATTATATGCCTGGTGTGGCTTCGTACGCCGGATAAGACGCGGCAGGCGTCGCATCCGGCAtt < 2:2320289/100‑1 (MQ=255) ctgcGCTAAAAATTATTGCTCGCCGTAGCGAATAATTATATGCCTGGTGTGGCTTCGTACGCCGGATAAGACGCGGCAGGCGTCGCATCCGGCATTAAAg > 1:2326673/1‑100 (MQ=255) ctgcGCTAAAAATTATTGCTCGCCGTAGCGAATAATTATATGCCTGGTGTGGCTTCGTACGCCGGATAAGACGCGGCAGGCGTCGCATCCGGCATTAAAg > 1:368345/1‑100 (MQ=255) ctgcGCTAAAAATTATTGCTCGCCGTAGCGAATAATTATATGCCTGGTGTGGCTTCGTACGCCGGATAAGACGCGGCAGGCGTCGCATCCGGCATTAAAg < 2:315230/100‑1 (MQ=255) aaaacatgattgaaggattaggtggcgaagcacaacgttaattgcttattttcctttaatGCCGGATAAGACGCGGCAGGCGTCGCATCCGGCATTAAAg > 1:689298‑M1/61‑100 (MQ=255) caaaaaaTTATAGCTCGCCGTAGCGAAAAATTAAATACCAGTTCTGGCTTCGTACGCCGCTTAAGACGAGACAAGCGTCGCGTCCGGCATTAAACGaaaa > 2:3502874/3‑100 (MQ=255) tAAAAATTATTGCTCGCCGTAGCGAATAATTATATGCCTGGTGTGGCTTCGTACGCCGGATAAGACGCGGCAGGCGTCGCATCCGGCATTAAAGGAAAAt < 1:3807350/100‑1 (MQ=255) naaaaTTATTGCTCGCCGTAGCGAATAATTATATGCCTGGTGTGTCTTCGTAAGCCGGATACGACGCGGCAGGCGTCGCATCCGGCCTTAAAAGAAAATc > 2:4063342/2‑100 (MQ=38) aaaaaTTATTGCTCGCCGTAGCGACTAATTATATGCCTGGTGTGGCTTCGTACGCCGGATAAAACGCGGCAGGAGTCGCATACGGCATTAAAGGAAAATc > 2:2793585/1‑100 (MQ=255) aaaaaTTATTGCTCGCCGTAGCGAATAATTATATGCCTGGTGTGGCTTCGTACGCCGGATAAGACGCGGCAGGCGTCGCATCCGGCATTAAAGGAAAATc < 1:2054540/100‑1 (MQ=255) aaaaaTTATTGCTCGCCGTAGCGAATAATTATATGCCTGGTGTGGCTTCGTACGCCGGATAAGACGCGGCAGGCGTCGCATCCGGCATTAAAGGAAAATc < 2:1216214/100‑1 (MQ=255) aaTTATTGCTCGCCGTAGCGAATAATTATATGCCTGGTGTGGCTTCGTACGCCGGATAAGACGCGGCAGGCGTCGCATCCGGCATTAAAGGAAAATCAGc < 1:2927142/100‑1 (MQ=255) gCTCGCCGTAGCGAATAATTATATGCCTGGTGTGGCTTCGTACGCCGGATAAGACGCGGCAGGCGTCGCATCCGGCATTAAAGGAAAATCAGCAATTAAc > 2:112710/1‑100 (MQ=255) gCTCGCCGTAGCGAATAATTATATGCCTGGTGTGGCTTCGTACGCCGGATAAGACGCGGCAGGCGTCGCATCCGGCATTAAAGGAAAATCAGCAATTAAc > 2:3522965/1‑100 (MQ=255) cTCGCCGTAGCGAATAATTATATGCCTGGTGTGGCTTCGTACGCCGGATAAGACGCGGCAGGCGTCGCATCCGGCATTAAAGGAAAATCAGCAATTAACg > 2:3030939/1‑100 (MQ=255) gCCGTAGCGAATAATTATATGCCTGGTGTGGCTTCGTACGCCGGATAAGACGCGGCAGGCGTCGCATCCGGCATTAAAGGAAAATCAGCAATTAACGTtg < 2:3845191/100‑1 (MQ=255) ccGTAGCGAATAATTATATGCCTGGTGTGGCTTCGTACGCCGGATAAGGCGCGGCAGGCGTCGCATCCGGCATTAAAGGAAAATCAGCAATTAACGTtgt < 1:1799045/100‑1 (MQ=255) ccGTAGCGAATAATTATATGCCTGGTGTGGCTTCGTACGCCGGATAAGACGCGGCAGGCGTCGCATCCGGCATTAAAGGAAAATCAGCAATTAACGTtgt < 1:719150/100‑1 (MQ=255) cGAATAATTATATGCCTGGTGTGGCTTCGTACGCCGGATAAGACGCGGCAGGCGTCGCATCCGGCATTAAAGGAAAATCAGCAATTAACGTTGTGCTTCg < 2:1528080/100‑1 (MQ=255) cGAATAATTATATGCCTGGTGTGGCTTCGTACGCCGGATAAGACGCGGCAGGCGTCGCATCCGGCATTAAAGGAAAATCAGCAATTAACGTTGTGCTTCg < 2:1786421/100‑1 (MQ=255) gAATAATTATATGCCTGGTGTGACTTCGTACGCCGGATAAGACGCGGCGGGCGTCGCATCCGGCATTAAAGGAAAATCAGCAAGTAACGTTGTGCTTCg > 2:1007596/1‑99 (MQ=255) aataatTATATGCCTGGTGTGGCTTCGTACGCCGGATAAGACGCGGCAGGCGTCGCATCCGGCATTAAAGGAAAATCAGCAATTAACGTTGTGCTTCGcc < 1:2138115/100‑1 (MQ=255) ataatTATATGCCTGGTGTGGCTTCGTACGCCGGATAAGACGCGGCAGGCGTCGCATCCGGCATTAAAGGAAAATCAGCAATTAACGTTGTGCTTCGCCa < 1:13127/100‑1 (MQ=255) aatTATATGCCTGGTGTGGCTTCGTACGCCGGATAAGACGCGGCAGGCGTCGCATCCGGCATTAAAGGAAAATCAGCAATTAACGTTGTGCTTCGCCAcc > 2:835211/1‑100 (MQ=255) atTATATGCCTGGTGTGGCTTCGTACGCCGGATAAGACGCGGCAGGCGTCGCATCCGGCATTAAAGGAAAATCAGCAATTAACGTTGTGCTTCGCCACCt > 2:2220983/1‑100 (MQ=255) tataTGCCTGGTGTGGCTTCGTACGCTGAATAATACGCGGAAGGCGTCGCATCCGGCATTAAAGGAAAATCAGCAATTAACGTTGTGCTTCGCCACCTa < 2:63587/99‑1 (MQ=255) tataTGCCTGGTGTGGCTTCGTACGCCGGATAAGACGCGGCAGGCGTCGCATCCGGCATTAAAGGAAAATCAGCAATTAACGTTGTGCTTCGCCACCTaa > 1:3375160/1‑100 (MQ=255) tataTGCCTGGTGTGGCTTCATACGCCGGATAAGACGCGGCAGGCGTCGCATCCGGCATTAAAGGAAAATCAGCAATTAACGTTGTGCTTCGCCACCTaa > 2:2521899/1‑100 (MQ=255) atatGCCTGGTGTGGCTTCGTACGCCGGATAAGACGCGACAGGCGTCGCATCCGGCATTAAAGGAAAATCAGCAATTAACGTTGTGCTTCGCCACCTAAt < 2:477535/100‑1 (MQ=255) tatGCCTGGTGTGGCTTCGTACGCCGGATAAGACGCGGCAGGCGTCGCATCCGGCATTAAAGGAAAATCAGCAATTAACGTTGTGCTTCGCCACCTAATc < 1:1549017/100‑1 (MQ=255) tGCCTGGTGTGGCTTCGTACGCCGGATAAGACGCGGCAGGCGTCGCATCTGGCATTAAAGGAAAATCAGCAATTAACGTTGTGCTTCGCCACCTAATCCt > 2:461104/1‑100 (MQ=255) ngCCTGGTGTGGCTTCGTACGCCGGATAAGACACGGCAGGCGGCGCATCCTGCATTACAGCCAAATCAGCAATTAACGTTGTGCTTCGCCACCTAATCCt > 2:1292694/2‑100 (MQ=255) gCCTGGTGTGGCTTCGTACGCCGGATAAGACGCGGCAGGCGTCGCATCCGGCATTAAAGGAAAATCAGCAATTAACGTTGTGCTTCGCCACCTAATCCtt < 1:2155913/100‑1 (MQ=255) ccTGGTGTGGCTTCGTACGCCGGATAAGACGCGGCAGGCGTCGCATCCGGCATTAAAGGAAAATCAGCAATTAACGTTGTGCTTCGCCACCTAATCCTTc < 2:181963/100‑1 (MQ=255) ccTGGTGGGGCTTCGTACGCCGGATAAGACGCGGCAGGCGTCGCATCCGGCATTAAAGGAAAATCAGCAATTAACGTTGTGCTTCGCCACCTAATCCTTc < 2:3766951/100‑1 (MQ=255) cTGGTGTGGCTTCGTACGCCGGATAAGACGCGGCAGGCGTCGCATCCGGCATTAAAGGAAAATCAGCAATTAACGTTGTGCTTCGCCACCTAATCCTTCa > 2:222653/1‑100 (MQ=255) ggTGTGGCTTCGTACGCCGGATAAGACGCGGCAGGCGTCGCATCCGGCATTAAAGGAAAATCAGCAATTAACGTTGTGCTTCGCCACCTAATCCTTCAAt > 1:564086/1‑100 (MQ=255) gtgtGGCTTCGTACGCCGGATAAGACGCGGCAGGCGTCGCATCCGGCATTAAAGGAAAATCAGCAATTAACGTTGTGCTTCGCCACCTAATCCTTCAATc < 1:4111836/100‑1 (MQ=255) cTTCGTACGCCGGATAAGACGCGGCAGGCGTCGCATCCGGCATTAAAGGAAAATCAGCAATTAACGTTGTGCTTCGCCACCTAATCCTTCAATCAGGttt < 2:1634988/100‑1 (MQ=255) cTTCGTACGCCGGATAAGACGCGGCAGGCGTCGCATCCGGCATTAAAGGAAAATCAGCAATTAACGTTGTGCTTCGCCACCTAATCCTTCAATCAGGttt > 1:343526/1‑100 (MQ=255) cTTCGTACGCCGGATAAGACGCGGCAGGCGTCGCATCCGGCATTAAAGGAAAATCAGCAATTAACGTTGTGCTTCGCCACCTAATCCTTCAATCAGGttt > 1:2495532/1‑100 (MQ=255) cTTCGTACCCCAGAGAAGACGCGGCAAGCTCCGCACCCGGCATTAAATGAAAATCAGCAATTAACGTTGTGCTTCGCCACCTAATCCTTCAATCAg < 2:3559464/96‑1 (MQ=255) ttCGTACGCCGGATAAGACGCGGCAGGCGTCGCATCCGGCATTAAAGGAAAATCAGCAATTAACGTTGTGCTTCGCCACCTAATCCTTCAATCAGGtttt < 2:3403548/100‑1 (MQ=255) ctttaatgccggatgcgacgcctgccgcgtcttatccggcATTAAAGGAAAATCAGCAATTAACGTTGTGCTTCGCCACCTAATCCTTCAATCAGGtttt > 1:3125581‑M2/41‑100 (MQ=255) tCGTACGCCGGATAAGACGCGGCAGGCGTCGCATCCGGCATTAAAGGAAAATCAGCAATTAACGTTGTGCTTCGCCACCTAATCCTTCAATCAGGTTTTg < 1:2734323/100‑1 (MQ=255) tCGTACGCCGGATAAGACGCGGCAGGCGTCGCATCCGGCATTAAAGGAAAATCAGCAATTAACGTTGTGCTTCGCCACCTAATCCTTCAATCAGGTTTTg < 1:532392/100‑1 (MQ=255) cGTACGCCGGATAAGACGCGGCAGGCGTCGCATCCGGCATTAAAGGAAAATCAGCAATTAACGTTGTGCTTCGCCACCTAATCCTTCAATCAGGTTTTGa < 1:152217/100‑1 (MQ=255) tACGCCGGATAAGACGCGGCAGGCGTCGCATCCGGCATTAAAGGAAAATCAGCAATTAACGTTGTGCTTCGCCACCTAATCCTTCAATCAGGTTTTGAAt > 2:4043163/1‑100 (MQ=255) tACGCCGGATAAGACGCGGCAGGCGTCGCATCCAGCATTAAAGGAAAATCAGCAATTAACGTTGTGCTTCGCCACCTAATCCTTCAATCAGGTTTTGAAt > 2:3451076/1‑100 (MQ=255) atgccggatgcgacgcctgccgcgtcttatccggcATTAAAGGAAAATCAGCAATTAACGTTGTGCTTCGCCACCTAATCCTTCAATCAGGTTTTGAAtt > 1:1981880‑M2/36‑100 (MQ=255) atgccggatgcgacgcctgccgcgtcttatccggcATTAAAGGAAAATCAGCAATTAACGTTGTGCTTCGCCACCTAATCCTTCAATCAGGTTTTGAAtt > 1:1584445‑M2/36‑100 (MQ=255) atgccggatgcgacgcctgccgcgtcttatccggcATTAAAGGAAAATCAGCAATTAACGTTGTGCTTCGCCACCTAATCCTTCAATCAGGTTTTGAAtt > 1:297774‑M2/36‑100 (MQ=255) aCGCCGGATAAGACGCGGCAGGCGTCGCATCTGGCATTAAAGGAAAATCAGCAATTAACGTTGTGCTTCGCCACCTAATCCTTCAATCAGGTTTTGAAtt > 2:1102223/1‑100 (MQ=255) aCGCCGGATAAGACGCGGCAGGCGTCGCATCCGGCATTAAAGGAAAATCAGCAATTAACGTTGTGCTTCGCCACCTAATCCTTCAATCAGGTTTTGAAtt > 2:2574119/1‑100 (MQ=255) cGCCGGATAAGACGCGGCAGGCGTCGCATCCGGCATTAAAGGAAAATCAGCAATTAACGTTGTGCTTCGCCACCTAATCCTTCAATCAGGCTTTGAATTa > 1:1418489/1‑100 (MQ=255) gccggatgcgacgcctgccgcgtcttatccggcATTAAAGGAAAATCAGCAATTAACGTTGTGCTTCGCCACCTAATCCTTCAATCAGGTTTTGAATTaa > 1:795012‑M2/34‑100 (MQ=255) gccggatgcgacgcctgccgcgtcttatccggcATTAAAGGAAAATCAGCAATTAACGTTGTGCTTCGCCACCTAATCCTTCAATCAGGTTTTGAATTaa > 1:2633354‑M2/34‑100 (MQ=255) gccggatgcgacgcctgccgcgtcttatccggcATTAAAGGAAAATCAGCAATTAACGTTGTGCTTCGCCACCTAATCCTTCAATCAGGTTTTGAATTaa > 1:3244684‑M2/34‑100 (MQ=255) GCCGGATAAGACGCGGCAGGCGTCGCATCCGGCATTAAAGGAAAATCAGCAATTAACGTTGTGCTTCGCCACCTAATCCTTCAATCAGGTTTTGAATTaa < 2:1953228‑M1/100‑1 (MQ=255) GCCGGATAAGACGCGGCAGGCGTCGCATCCGGCATTAAAGGAAAATCAGCAATTAACGTTGTGCTTCGCCACCTAATCCTTCAATCAGGGTTTGTATTaa < 2:3261941‑M1/100‑1 (MQ=255) ccggatgcgacgcctgacgcgtcttatccggcATTAAAGGAAAATCAGCAATTAACGTTGTGCTTCGCCACCTAATCCTTCAATCAGGTTTTGAATTAAc > 1:3628176‑M2/33‑100 (MQ=255) CCGGATAAGACGCGGCAGGCGTCGCATCCGGCATTAAAGGAAAATCAGCAATTAACGTTGTGCTTCGCCACCTAATCCTTCAATCAGGTTttgacat > 2:3715295‑M1/1‑94 (MQ=255) CCGGATAAGACGCGGCAGGCGTCGCATCCGGCATTAAAGGAAAATCAGCAATTAACGTTGTGCTTCGCCACCTAATCCTTCAATCAGGTTTTGAATTAAc < 1:352630‑M1/100‑1 (MQ=255) CCGGATAAGACGCGGCAGGCGTCGCATCCGGCATTAAAGGAAAATCAGCAATTAACGTTGTGCTTCGCCACCTAATCCTTCAATCAGGTTTTGAATTAAc > 1:1074848‑M1/1‑100 (MQ=255) CCGGATAAGACGCGGCAGGCGTCGCATCCGGCATTAAAGGAAAATCAGCAATTAACGTTGTGCTTCGCCACCTAATCCTTCAATCAGGTTTTGAATTAAc > 2:2113337‑M1/1‑100 (MQ=255) CGGATAAGACGCGGCAGGCGTCGCATCCGGCATTAAAGGAAAATCAGCAATTAACGTTGTGCTTCGCCACCTAATCCTTCAATCAGGTTTTGAATTAACg > 1:2291815‑M1/1‑100 (MQ=255) GGATAAGACGCGGCAGGCGTCGCATCCGGCATTAAAGGAAAATCAGCAATTAACGTTGTGCTTCGCCACCTAATCCTTCAATCAGGTTTTGAATTAACGc < 2:569346‑M1/100‑1 (MQ=255) ATAAGACGCGGCAGGCGTCGCATCCGGCATTAAAGGAAAATCAGCAATTAACGTTGTGCTTCGCCACCTAATCCTTCAATCAGGTTTTGAATTAACGCTg > 1:2539954‑M1/1‑100 (MQ=255) ATAAGACGCGGCAGGCGTCGCATCCGGCATTAAAGGAAAATCAGCAATTAACGTTGTGCTTCGCCACCTAATCCTTCAATCAGGTTTTGAATTAACGCTg > 1:4000562‑M1/1‑100 (MQ=255) ATAAGACGCGGCAGGCGTCGCATCCGGCATTAAAGGAAAATCAGCAATTAACGTTGTGCTTCGCCACCTAATCCTTCAATCAGGTTTTGAATTAACGCTg > 1:1229457‑M1/1‑100 (MQ=255) gcgacgcctgccgcgtcttatccggcATTAAAGGAAAATCAGCAATTAACGTTGTGCTTCGCCACCTAATCCTTCAATCAGGTTTTGAATTAACGCTGcc < 2:2454039‑M2/74‑1 (MQ=255) aGACGCGGCAGGCGTCGCATCCGGCATTAAAGGAAAATCAGCAATTAACGTTGTGCTTCGCCACCTAATCCTTCAATCAGGTTTTGAATTAACGCTGCCa > 2:3361574/1‑100 (MQ=255) gACGCGGCAGGCGTCGCATCCGGCATTAAAGGAAAATCAGCAATTAACGTTGTGCTTCGCCACCTAATCCTTCAATCAGGTTTTGAATTAACGCTGCCAg > 1:2957117/1‑100 (MQ=255) gACGCGGCAGGCGTCGCATCCGGCATTAAAGGAAAATCAGCAATTAACGTTGTGCTTCGCCACCTAATCCTTCAATCAGGTTTTGAATTAACGCTGCCAg > 1:3771687/1‑100 (MQ=255) cgcgGCAGGCGTCGCATCCGGCATTAAAGGAAAATCAGCAATTAACGTTGTGCTTCGCCACCTAATCCTTCAATCAGGTTTTGAATTAACGCTGCCAGtt > 2:2007560/1‑100 (MQ=255) gcgGCAGGCGTCGCATCCGGCATTAAAGGAAAATCAGCAATTAACGTTGTGCTTCGCCACCTAATCCTTCAATCAGGTTTTGAATTAACGCTGCCAGttn < 1:3559633/100‑2 (MQ=255) gcgGCAGGCGTCGCATCCGGCATTAAAGGAAAATCAGCAATTAACGTTGTGCTTCGCCACCTAATCCTTCAATCAGGTTTTGAATTAACGCTGCCAGTTc < 1:2040946/100‑1 (MQ=255) cAGGCGTCGCATCCGGCATTAAAGGAAAATCAGCAATTAACGTTGTGCTTCGCCACCTAATCCTTCAATCAGGTTTTGAATTAACGCTGCCAGTTCACCa < 1:2806129/100‑1 (MQ=255) cAGGCGTCGCATCCGGCATTAAAGGAAAATCAGCAATTAACGTTGTGCTTCGCCACCTAATCCTTCAATCAGGTTTTGAATTAACGCTGCCAGTTCACCa < 1:2097617/100‑1 (MQ=255) aGGCGTCGCATCCGGCATTAAAGGAAAATCAGCAATTAACGTTGTGCTTCGCCACCTAATCCTTCAATCAGGTTTTGAATTAACGCTGCCAGTTCACCAg < 1:3306059/100‑1 (MQ=255) ggCGTCGCATCCGGCATTAAAGGAAAATCAGCAATTAACGTTGTGCTTCGCCACCTAATCCTTCAATCAGGTTTTGAATTAACGCTGCCAGTTCACCAGt < 2:3578841/100‑1 (MQ=255) gCGTCGCATCCGGCATTAAAGGAAAATCAGCAATTAACGTTGTGCTTCGCCACCTAATCCTTCAATCAGGTTTTGAATTAACGCTGCCAGTTCACCAGtc > 1:190718/1‑100 (MQ=255) ntCGCATCCGGCATTAAAGGAAAATCAGCAATTAACGTTGTGCTTCGCCACCTAATCCTTCAATCAGGTTTTGAATTAACGCTGCCAGTTCACCAGtca > 1:3932980/2‑99 (MQ=255) tCGCATCCGGCATTAAAGGAAAATCAGCAATTAACGTTGTGCTTCGCCACCTAATCCTTCAATCAGGTTTTGAATTAACGCTGCCAGTTCACCAGtcatc < 2:3990035/100‑1 (MQ=255) cGCATCCGGCATTAAAGGAAAATCAGCAATTAACGTTGTGCTTCGCCACCTAATCCTTCAATCAGGTTTTGAATTAACGCTGCCAGTTCACCAGtcatca > 2:752926/1‑100 (MQ=255) gCATCCGGCATTAAAGGAAAATCAGCAATTAACGTTGTGCTTCGCCACCTAATCCTTCAATCAGGTTTTGAATTAACGCTGCCAGTTCACCAGTCATCAg > 1:3959208/1‑100 (MQ=255) gCATCCGGCATTAAAGGAAAATCAGCAATTAACGTTGTGCTTCGCCACCTAATCCTTCAATCAGGTTTTGAATTAACGCTGCCAGTTCACCAGTCATCAg < 1:2451253/100‑1 (MQ=255) cATCCGGCATTAAAGGAAAATCAGCAATTAACGTTGTGCTTCGCCACCTAATCCTTCAATCAGGTTTTGAATTAACGCTGCCCGTTCACCAGTCATCAgg > 2:2681802/1‑100 (MQ=255) atccggcATTAAAGGAAAATCAGCAATTAACGTTGTGCTTCGCCACCTAATCCTTCAATCAGGTTTTGAATTAACGCTGCCAGTTCACCAGTCATCAGGa < 1:3855255‑M2/93‑1 (MQ=255) tccggcATTAAAGGAAAATCAGCAATTAACGTTGTGCTTCGCCACCTAATCCTTCAATCAGGTTTTGAATTAACGCTGCCAGTTCACCAGTCATCAGGAt < 1:961437‑M2/94‑1 (MQ=255) ccggcATTAAAGGAAAATCAGCAATTAACGTTGTGCTTCGCCACCTAATCCTTCAATCAGGTTTTGAATTAACGCTGCCAGTTCACCAGTCATCAGGATg < 2:1988552‑M2/95‑1 (MQ=255) cggcATTAAAGGAAAATCAGCAATTAACGTTGTGCTTCGCCACCTAATCCTTCAATCTGGTTTTGAATTAACGCTGCCAGTTCACCAGTCATCAGGATGa > 2:2898098‑M2/5‑100 (MQ=255) ggcATTAAAGGAAAATCAGCAATTAACGTTGTGCTTCGCCACCTAATCCTTCAATCAGGTTTTGAATTAACGCTGCCAGTTCACCAGTCATCAGGATGaa > 1:258057‑M2/4‑100 (MQ=255) gaTTAAAGGAAAATCTGTAATGAACGTTGTGCTTCGCCACCGAATCCTTCAATCAGGTTTTGAATTAACGCTGCCAGTGCACCAGTGATCAGGAGGAAAt < 2:1849679/99‑1 (MQ=255) cATTAAAGGAAAATCAGCAATTAACGTTGTGCTTCGCCACCTAATCCTTCAATCAGGTTTTGAATTAACGCTGCCAGTTCACCAGTCATCAGGATGAAAt > 1:225994‑M2/2‑100 (MQ=255) | ATATTGCTGCGCTAAAAATTATTGCTCGCCGTAGCGAATAATTATATGCCTGGTGTGGCTTCGTACGCCGGATAAGACGCGGCAGGCGTCGCATCCGGCATTAAAGGAAAATCAGCAATTAACGTTGTGCTTCGCCACCTAATCCTTCAATCAGGTTTTGAATTAACGCTGCCAGTTCACCAGTCATCAGGATGAAATC > NC_000913/408990‑409188 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |