New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 1396316 = | NA (NA) | 23 (0.170) | 12/164 | NT | 17.0% | noncoding (273/1195 nt) | IS5 | repeat region |
? | NC_000913 | = 1428549 | 122 (0.830) | noncoding (246/1196 nt) | IS5 | repeat region |
Only 100 of 270 total aligned reads displayed.
TCGGGCAAACAGGCGCATGGAGGCGATTTCGTACAGGGCATCTTCCATGGCACCGTCGCTCAGGTTGTACCAATGCTGCATGCAGTGAATACGCAGCATGGTCTCCAGCGGATAGGGCCGTCGGCCATTGCCCGCCTTGGGATAAAACGGCTCGATGACAGCGGTCATATTCTGCCATGGCAGAATCTGCTCCATGCG > NC_000913/1428451‑1428648 | tCGGGCAAACAGGCGCATGGAGGCGATTTCGTACAGGGCATCTTCCATGGCACCGTCGCTCAGGTTGTACCAATGCTGCCTGCAGTGAATACGCAGCATg < 2:3926788/100‑1 (MQ=255) cGGGCAAACAGGCGCATGGAGGCGATTTCGTACAGGGCATCTTCCATGGCACCGTCGCTCAGGTTGTACCAATGCTGCATGCAGTGAATACGCAGCATgg < 2:2278513/100‑1 (MQ=255) gggCAAACAGGCGCATGGAGGCGATTTCGTACAGGGCATCTTCCATGGCACCGTCGCTCAGGTTGTACCAATGCTGCATGCAGTGAATACGCAGCATGGt > 1:2058046/1‑100 (MQ=255) aaaCAGGCGCATGGAGGCGATTTCGTACAGGGCATCTTCCATGGCACCGTCGCTCAGGTTGTACCAATGCTGCATGCAGTGAATACGCAGCATGGTCTcc < 1:101038/100‑1 (MQ=255) acacGCGCATGGAGCCCAGCGCGTCCAGGGCATCTTCCATGGCACCGTCGCTCAGGTTGTACCAATGCTGCATGCAGCGAATACGCAGCATGGTCTCCa < 2:794160/99‑1 (MQ=18) cAGGCGCATGGAGGCGATTTCGTACAGGGCATCTTCCATGGCACCGTCGCTCAGGTTGTACCAATGCTGCATGCAGTGAATACGCAGCATGGTCTCCAGc < 2:1512174/100‑1 (MQ=255) aGGCGCATGGAGGCGATTTCGTACAGGGCATCTTCCATGGCACCGTCGCTCAGGCTGTACCAATGCTGCATGCAGTGAATACGCAGCATGGTCTCCAGCg < 1:3106657/100‑1 (MQ=255) ggCGGATGGAGGCGATTTCGTACAGGGCATCTTCCATGGCACCGTCGCTCAGGTTGGACCAATGCTGCATGCAGTGAATACGCAGCATGGTCTCCAGCgg < 2:1457962/100‑1 (MQ=255) ggCGCATGGAGGCGATTTCGTACAGGGCATCTTCCATGGCACCGTCGCTCAGGTTGTACCAATGCTGCATGCAGTGAATACGCAGCATGGTCTCCAGCgg > 2:3828278/1‑100 (MQ=255) gcATGGAGGCGATTTCGTACAGGGCATCTTCCATGGCACCGTCGCTCAGGTTGTACCAATGCTGCATGCAGTGAATACGCAGCATGGTCTCCAGCGGATa < 1:3041868/100‑1 (MQ=255) cATGGAGGCGATTTCGTACAGGGCATCTTCCATGGCACCGTCGCTCAGGTTGTACCAATGCTGCATGCAGTGAATACGCAGCATGGTCTCCAGCGGATAg > 1:908978/1‑100 (MQ=255) tGGAGGCGATTTCGTACAGGGCATCTTCCATGGCACCGTCGCTCAGGTTGTACCAATGCTGCATGCAGTGAATACGCAGCATGGTCTCCAGCGGATAggg > 1:2374788/1‑100 (MQ=255) ggAGGCGATTTCGTACAGGGCATCTTCCATGGCACCGTCGCTCAGGTTGTACCAATGCTGCATGCAGTGAATACGCAGCATGGTCTCCAGCGGATAGGGc < 1:1078689/100‑1 (MQ=255) ggAGGCGATTTCGTACAGGGCATCTTCCATGGCACCGTCGCTCAGGTTGTACCAATGCTGCATGCAGTGAATACGCAGCATGGTCTCCAGCGGATAGGGc < 1:4114310/100‑1 (MQ=255) gAGGCGATTTCGTACAGGGCATCTTCCATGGCACCGTCGCTCAGGTTGTACCAATGCTGCATGCAGTGAATACGCAGCATGGTCTCCAGCGGATAGGGcc > 1:2661860/1‑100 (MQ=255) gCGATTTCGTACAGGGCATCTTCCATGGCACCGTCGCTCAGGTTGTACCAATGCTGCATGCAGTGAATACGCAGCATGGTCTCCAGCGGATAGGgtcgtc > 2:3410114/1‑100 (MQ=255) cGATTTCGTACAGGGCATCTTCCATGGCACCGTCGCTCAGGTTGTACCAATGCTGCATGCAGTGAATACGCAGCATGGTCTCCAGCGGATAGGGCCGTCg > 2:282497/1‑100 (MQ=255) ttCGTACAGGGCATCTTCCATGGCACCGTCGCTCAGGTTGTACCAATGCTGCATGCAGTGAATACGCAGCATGGTCTCCAGCGGATAGGGCCGTCGGCCa < 1:1220034/100‑1 (MQ=255) cGTACAGGGCATCTTCCATGGCACCGTCGCTCAGGTTGTACCAATGCTGCATGCAGTGAATACGCAGCATGGTCTCCAGCGGATAGGGCCGTCGGCCAtt < 1:505538/100‑1 (MQ=255) cGTACAGGGCATCTTCCATGGCACCGTCGCTCAGGTTGTACCAATGCTGCATGCAGTGAATACGCAGCATGGTCTCCAGCGGATAGGGCCGTCGGCCAtt > 1:216273/1‑100 (MQ=255) gTACAGGGCATCTTCCATGGCACCGTCGCTCAGGTTGTACCAATGCTGCATGCAGTGAATACGCAGCATGGTCTCCAGCGGATAGGGCCGTCGGCCATTg < 1:3634672/100‑1 (MQ=255) gTACAGGGCATCTTCCATGGCACCGTCGCTCAGGTTGTACCAATGCTGCATGCAGTGAATACGCAGCATGGTCTCCAGCGGATAGGGCCGTCGGCCATTg < 2:3206745/100‑1 (MQ=255) cAGGGCATCTTCCATGGCACCGTCGCTCAGGTTGTACCAATGCTGCATGCAGTGAATACGCAGCATGGTCTCCAGCGGATAGGGCCGTCGGCCATTGccc > 1:2877357/1‑100 (MQ=255) aGGGCATCTTCCATGGCACCGTCGCTCAGGTTGTACCAATGCTGCATGCAGTGAATACGCAGCATGGTCTCCAGCGGATAGGGCCGTCGGCCATTGCCCg < 2:3628834/100‑1 (MQ=255) gggCATCTTCCATGGCACCGTCGCTCAGGTTGTACCAATGCTGCATGCAGTGAATACGCAGCATGGTCTCCAGCGGATAGGGCCGTCGGCCATTGCCCGc > 1:2333375/1‑100 (MQ=255) gggCATCTTCCATGGCACCGTCGCTCAGGTTGTACCAATGCTGCATGCAGTGAATACGCAGCATGGTCTCCAGCGGATAGGGCCGTCGGCCATTGCCCGc < 1:3562270/100‑1 (MQ=255) ggCATCTTCCATGGCACCGTCGCTCAGGTTGTACCAATGCTGCATGCAGTGAATACGCAGCATGGTCTCCAGCGGATAGGGCCGTCGGCCATTGCCCGcc < 2:1127573/100‑1 (MQ=255) gCATCTTCCATGGCACCGTCGCTCAGGTTGTACCAATGCTGCATGCAGTGAATACGCAGCATGGTCTCCAGCGGATAGGGCCGTCGGCCATTGCCCGCCt > 2:18436/1‑100 (MQ=255) cTTCCATGGCACCGTCGCTCAGGTTGTACCAATGCTGCATGCAGTGAATACGCAGCATGGTCTCCAGCGGATAGGGCCGTCGGCCATTGCCCGCCTTggg < 1:3451046/100‑1 (MQ=255) cTTCCATGGCACCGTCGCTCAGGTTGTACCAATGCTGCATGCAGTGAATACGCAGCATGGTCTCCAGCGGATAGGGCCGTCGGCCATTGCCCGCCTTggg > 2:2660216/1‑100 (MQ=255) tCCATGGCACCGTCGCTCAGGTTGTACCAATGCTGCATGCAGTGAATACGCAGCATGGTCTCCAGCGGATAGGGCCGTCGGCCATTGCCCGCCTTGGGAt > 1:1420645/1‑100 (MQ=255) ccATGGCACCGTCGCTCAGGTTGTACCAATGCTGCATGCAGTGAATACGCAGCATGGTCTCCAGCGGATAGGGCCGTCGGCCATTGCCCGCCTTGGGATa < 1:3253277/100‑1 (MQ=255) ggCACCGTCGCTCAGGTTGTACCAATGCTGCATGCAGTGAATACGCAGCATGGTCTCCAGCGGATAGGGCCGTCGGCCATTGCCCGCCTTGGGATAAAAc < 1:263279/100‑1 (MQ=255) gCACCGTCGCTCAGGTTGTACCAATGCTGCATGCAGTGAATACGCAGCATGGTCTCCAGCGGATAGGGCCGTCGGCCATTGCCCGCCTTGGGATAAAAcn < 2:4063449/100‑2 (MQ=255) gCACCGTCGCTCAGGTTGTACCAATGCTGCATGCAGTGAATACGCAGCATGGTCTCCAGCGGATAGGGCCGTCGGCCATTGCCCGCCTTGGGATAAAACg < 2:3677745/100‑1 (MQ=255) tCAGGTTGTACCAATGCTGCATGCAGTGAATACGCAGCATGGTCTCCAGCGGATAGGGCCGTCGGCCATTGCCCGCCTTGGGATAAAACGGCTCGATGAc > 1:3704274/1‑100 (MQ=255) ggTTGTACCAATGCTGCATGCAGTGAATACGCAGCATGGTCTCCAGCGGATAGGGCCGTCGGCCATTGCCCGCCTTGGGATAAAACGGCTCGATGACAGc > 2:3589115/1‑100 (MQ=255) ttGTACCAATGCTGCATGCAGTGAATACGCAGCATGGTCTCCAGCGGATAGGGCCGTCGGCCATTGCCCGCCTTGGGATAAAACGGCTCGATGACAGCgg < 1:3203993/100‑1 (MQ=255) ttGTACCAATGCTGCATGCAGTGAATACGCAGCATGGTCTCCAGCGGATAGGGCCGTCGGCCATTGCCCGCCTTGGGATAAAACGGCTCGATGACAGCgg < 2:1778215/100‑1 (MQ=255) aCCAATGCTGCATGCAGTGAATGCGTAGCATtggtacaacctgagcgatggcgcgatggaagatgctctgtacgaaatcgcctccatgcgtctgtttgcc < 2:2446015‑M2/100‑70 (MQ=255) aCCAATGCTGCATGCAGTGAATGCGTAGCATtggcacaacctgagcgatggcgcgatggaagatgctctgtacgaaatcgcctccatgcgtctgtttccc < 2:1635859‑M2/100‑70 (MQ=255) aCCAATGCTGCATGCAGTGAATACGCAGCATGGTCTCCAGCGGATAGGGCCGTCGGCCATTGCCCGCCTTGGGATAAAACGGCTCGATGACAGCGGTCa < 2:1206829/99‑1 (MQ=255) ccAATGCTGCATGCAGTGAATACGCAGCATtggtacaacctgagcgacggtgccatggaagatgccctgtacgaaatcgcctccatgcgcctgtttgccc < 1:797694‑M2/100‑71 (MQ=255) ccAATGCTGCATGCAGTGAATACGCAGCATtggtacaacctgagcgacggtgccatggaagatgccctgtacgaaatcgcctccatgcgcctgtttgccc < 1:2568216‑M2/100‑71 (MQ=255) ccAATGCTGCATGCAGTGAATACGCAGCATGGTCTCCAGCGGATAGGGCCGTCGGCCATTGCCCGCCTTGGGATAAAACGGCTCGATGACAGCGGTCata < 2:2374774/100‑1 (MQ=255) aTGCTGCATGCAGTGAAT‑‑GCAGCATtggtacaacctgagcgatggcgcgatggaagatgctctgtacgaaatcgcctccatgcgtctgtttgcccggtt < 2:627604‑M2/99‑75 (MQ=255) ctgcATGCAGTGAATACGCAGCATGGTCTCCAGCGGATAGGGCCGTCGGCCATTGCCCGCCTTGGGATAAAACGGCTCGATGACAGCGGTCATATTCTGc > 1:3535156/1‑100 (MQ=255) atgcaGTGAATACGCAGCATGGTCTCCAGCGGATAGGGCCGTCGGCCATTGCCCGCCTTGGGATAAAACGGCTCGATGACAGCGGTCATATTCTGCCATg < 2:2926820/100‑1 (MQ=255) gcaGTGAATACGCAGCATGGTCTCCAGCGGATAGGGCCGTCGGCCATTGCCCGCCTTGGGATAAAACGGCTCGATGACAGCGGTCATATTCTGCCATGGc < 2:2075774/100‑1 (MQ=255) gTGAATACGCAGCATGGTCTCCAGCGGATAGGGCCGTCGGCCATTGCCCGCCTTGGGATAAAACGGCTCGATGACAGCGGTCATATTCTGCCATGGCAGa > 1:838768/1‑100 (MQ=255) gTGAATACGCAGCATGGTCTCCAGCGGATAGGGCCGTCGGCCATTGCCCGCCTTGGGATAAAACGGCTCGATGACAGCGGTCATATTCCGCCATGGCAGa > 2:434548/1‑100 (MQ=255) aaTACGCAGCATGGTCTCCAGCGGATAGGGCCGTCGGCCATTGCCCGCCTTGGGATAAAACGGCTCGATGACAGCGGTCATATTCTGCCATGGCAGAAta < 2:2341547/100‑2 (MQ=255) aTACGCAGCATGGTCTCCAGCGGATAGGGCCGTCGGCCATTGCCCGCCTTGGGATAAAACGGCTCGATGACAGCGGTCATATTCTGCCATGGCAGAATCt > 1:380660/1‑100 (MQ=255) tACGCAGCATGGTCTCCAGCGGATAGGGCCGTCGGCCATTGCCCGCCTTGGGATAAAACGGCTCGATGACAGCGGTCATATTCTGCCATGGCAGAATCTg < 1:1707627/100‑1 (MQ=255) gcagcaTtggtacaacctgagcgatggcgcgatggaagatgctctgtacgaaatcgcctccatgcgtctgtttgcccggttatccctggatagcgccttg > 1:2254496‑M2/1‑7 (MQ=255) gcagcaTtggtacaacctgagcgatggcgcgatggaagatgctctgtacgaaatcgcctccatgcgtctgtttgcccggttatccctggatagcgccttg < 1:2963352‑M2/100‑94 (MQ=255) gcagcaTtggtacaacctgagcgatggcgcgatggaagatgctctgtacgaaatcgcctccatgcgtctgtttgcccggttatccctagatagcgccttg < 2:2263427‑M2/100‑94 (MQ=255) gcagcaTtggtacaacctgagcgatggcgcgatggaagatgctctgtacgaaatcgcccccatgcgtctgtttgcccggttatccctggatagcgccttg > 1:3851808‑M2/1‑7 (MQ=255) gcagcaTGGTCTCCAGCGGATAGGGCCGTCGGCCATTGCCCGCCTTGGGATAAAACGGCTCGATGACAGCGGTCATATTCTGCCATGGCAGAATCTGCTc > 2:4011818/1‑100 (MQ=255) cagcaTtggtacaacctgagcgatggcgcgatggaagatgctctgtacgaaatcgcctccatgggtctgtttgcccggttatccctggatagcgccttgc > 1:2918605‑M2/1‑6 (MQ=255) cagcaTtggtacaacctgagcgatggcgcgatggaagatgctctgtacgaaatcgcctccatgcgtctgtttgcccggttatccctggatagcgccttgc < 2:2967388‑M2/100‑95 (MQ=255) cagcaTtggtacaacctgagcgatggcgcgatggaagatgctctgtacgaaatcgcctccatgcgtctgtttgcccggttatccctggatagcgccttgc < 2:1687707‑M2/100‑95 (MQ=255) cagcaTtggtacaacctgagcgatggcgcgatggaagatgctctgtacgaaatcgcctccatgcgtctgtttgcccggttatccctggatagcgccttgc < 2:1299933‑M2/100‑95 (MQ=255) cagcaTtggtacaacctgagcgatggcgcgatggaagatgctctgtacgaaatcgcctccatgcgtctgtttgcccggttatccctggatagcgccttgc < 1:1953595‑M2/100‑95 (MQ=255) cagcaTtggtacaacctgagcgatggcgcgatggaagatgctctgtacgaaatcgcctccatgcgtctgtttgcccggttatccctggatagcgccttgc < 2:485261‑M2/100‑95 (MQ=255) cagcaTtggtacaacctgagcgatggcgcgatggaagatgctctgtacgaaatcgcctccatgcgtctgtttgcccggttatccctggatagcgccttgc < 2:3620412‑M2/100‑95 (MQ=255) agcaTtggtacaacctgagcgatggcgcgatggaagatgctctgtacgaaatcgcctccatgcgtctgtttgcccggttatccctggatagcgccttgcc > 1:2995558‑M2/1‑5 (MQ=255) agcaTtggtacaacctgagcgatggcgcgatggaagatgctctgtacgaaatcgcctccatgcgtctgtttgcccggttatccctggatagcgccttgcc > 1:2442‑M2/1‑5 (MQ=255) agcaTtggtacaacctgagcgatggcgcgatggaagatgctctgtacgaaatcgcctccatgcgtctgtttgcccggttatccctggatagcgccttgcc < 2:3595888‑M2/100‑96 (MQ=255) agcaTtggtacaacctgagcgatggcgcgatggaagatgctctgtacgaaatcgcctccatgcgtctgtttgcccggttatccctggatagcgccttgcc > 2:2744579‑M2/1‑5 (MQ=255) agcaTtggtacaacctgagcgatggcgcgatggaagatgctctgtacgaaatcgcctccatgcgtctgtttgcccggttatccctggatagcgccttgcc < 1:2409647‑M2/100‑96 (MQ=255) agcaTtggtacaacctgagcgatggcgcgatggaagatgctctgtacgaaatcgcctccatgcgtctgtttgcccggttatccctggatagcgccttgcc > 2:3256048‑M2/1‑5 (MQ=255) agcaTtggtacaacctgagcgatggcgcgatggaagatgctctgtacgaaatcgcctccatgcgtctgtttgcccggttatccctggatagcgccttgcc > 2:1590503‑M2/1‑5 (MQ=255) agcaTtggtacaacctgagcgatggcgcgatggaagatgctctgtacgaaatcgcctccatgcgtctgtttgcccggttatccctggatagcgccttgcc > 1:4022015‑M2/1‑5 (MQ=255) agcaTGGTCTCCAGCGGATAGGGCCGTCGGCCATTGCCCGCCTTGGGATAAAACGGCTCGGTGCCAGCGGTCATATTCTGCCATGGCAGAATCTGCtac > 2:2521580/1‑97 (MQ=255) gcaTtggtacaacctgagcgatggcgctatggaagatgctctgtacgaaatcgcctccatgcgtctgtttgcccggttatccctggatagcgccttgccg > 1:719495‑M2/1‑4 (MQ=255) gcaTtggtacaacctgagcgatggcgcgatggaagatgctctgtacgaaatcgcctccatgcgtctgtttgcccggttatccctggatagcgccttgccg > 1:1890984‑M2/1‑4 (MQ=255) gcaTtggtacaacctgagcgatggcgcgatggaagatgctctgtacgaaatcgcctccatgcgtctgtttgcccggttatccctggatagcgccttgccg > 2:904217‑M2/1‑4 (MQ=255) gcaTtggtacaacctgagcgatggcgcgatggaagatgctctgtacgaaatcgcctccatgcgtctgtttgcccggttatccctggatagcgccttgccg < 1:1642427‑M2/100‑97 (MQ=255) gcaTtggtacaacctgagcgatggcgcgatggaagatgctctgtacgaaatcgcctccatgcgtctgtttgcccggttatccctggatagcgccttgccg > 1:154191‑M2/1‑4 (MQ=255) gcaTtggtacaacctgagcgatggcgcgatggaagatgctctgtacgaaatcgcctccatgcgtctgtttgcccggttatccctggatagcgccttgccg > 2:674821‑M2/1‑4 (MQ=255) gcaTtggtacaacctgagcgatggcgcgatggaagatgctctgtacgaaatcgcctccatgcgtctgtttgcccggttatccctggatagcgccttgccg > 1:1440783‑M2/1‑4 (MQ=255) gcaTtggtacaacctgagcgatggcgcgatggaagatgctctgtacgaaatcgcctccatgcgtctgtttgcccggttatccctggatagcgccttgccg > 2:3030697‑M2/1‑4 (MQ=255) gcaTtggtacaacctgagcgatggcgcgatggaagatgctctgtacgaaatcgcctccatgcgtctgtttgcccggttatccctggatagcgccttgccg > 2:1752275‑M2/1‑4 (MQ=255) gcaTtggtacaacctgagcgatggcgcgatggaagatgctctgtacgaaatcgcctccatgcgtctgtttgcccggttatccctggatagcgccttgccg < 1:3823846‑M2/100‑97 (MQ=255) caTtggtacaacctgagcgatggcgcgatggaagatgctctgtacgaaatcgcctccctgcgtctgtttgcccggttatccctggatagcgccttgccgg < 1:246254‑M2/100‑98 (MQ=255) caTtggtacaacctgagcgatggcgcgatggaagatgctctgtacgaaatcgcctccatgcgtctgtttgcccggttatccctggatagcgccttgccgg < 1:3974551‑M2/100‑98 (MQ=255) caTtggtacaacctgagcgatggcgcgatggaagatgctctgtacgaaatcgcctccatgcgtctgtttgcccggttatccctggatagcgccttgccgg > 2:3116712‑M2/1‑3 (MQ=255) caTtggtacaacctgagcgatggcgcgatggaagatgctctgtacgaaatcgcctccatgcgtctgtttgcccggttatccctggatagcgccttgccgg < 1:546401‑M2/100‑98 (MQ=255) caTtggtacaacctgagcgatggcgcgatggaagatgctctgtacgaaatcgcctccatgcgtctgtttgcccggttatccctggatagcgccttgccgg < 1:1794755‑M2/100‑98 (MQ=255) caTtggtacaacctgagcgatggcgcgatggaagatgctctgtacgaaatcgcctccatgcgtctgtttgcccggttatccctggatagcgccttgccgg > 1:3265794‑M2/1‑3 (MQ=255) caTtggtacaacctgagcgatggcgcgatggaagatgctctgtacgaaatcgcctccatgcgtctgtttgcccggttatccctggatagcgccttgccgg > 1:3419975‑M2/1‑3 (MQ=255) caTtggtacaacctgagcgatggcgcgatggaagatgctctgtacgaaatcgcctccatgcgtctgtttgcccggttatccctggatagcgccttgccgg > 1:592541‑M2/1‑3 (MQ=255) caTtggtacaacctgagcgatggcgcgatggaagatgctctgtacgaaatagcctccatgcgtctgtttgcccggttatccctggatagcgccttgccgg < 1:3683433‑M2/100‑98 (MQ=255) aTtggtacaacctgagcgatggcgcgatggaagatgctctgtacgaaatcgcctccatgcgtctgtttgcccggttatccctggatagcgccttgccgga < 2:3906980‑M2/100‑99 (MQ=255) ttggtccaaccggagcgatggcgcgatggaagatgctctgtacgacatcgcctccatgcttctgtttgcccggttatccctggatagcgccttgccgga > 2:3474604‑M2/1‑1 (MQ=255) ttggtacaacctgagcgatggcgcgatggaagatgctctgtacgcaatcgcctccatgcgtctgtttgcccggttatccctggatagcgccttgccggac > 1:3876277‑M2/1‑1 (MQ=255) ttggtacaacctgagcgatggcgcgatggaagatgctctgtacgaaatcgcctccatgcgtctgtttgcccggttatccctggatagcgccttgccggac > 2:221691‑M2/1‑1 (MQ=255) ttggtacaacctgagcgatggcgcgatggaagatgctctgtacgaaatcgcctccatgcgtctgtttgcccggttatccctggatagcgccttgccggac > 2:3314980‑M2/1‑1 (MQ=255) ttggtacaacctgagcgatggcgcgatggaagatgctctgtacgaaatcgcctccatgcgtctgtttgcccggttatccctggatagcgccttgccggac > 1:4055688‑M2/1‑1 (MQ=255) | TCGGGCAAACAGGCGCATGGAGGCGATTTCGTACAGGGCATCTTCCATGGCACCGTCGCTCAGGTTGTACCAATGCTGCATGCAGTGAATACGCAGCATGGTCTCCAGCGGATAGGGCCGTCGGCCATTGCCCGCCTTGGGATAAAACGGCTCGATGACAGCGGTCATATTCTGCCATGGCAGAATCTGCTCCATGCG > NC_000913/1428451‑1428648 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |