| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 1468668 | NA (NA) | 11 (0.110) +GCTGCCAACGTATGGTTATCGTCGGG |
7/126 | NT | NA | noncoding (573/1331 nt) | IS2 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 1650843 = | NA (NA) | noncoding (1/706 nt) | IS2 | repeat region | |||||
Only 100 of 650 total aligned reads displayed.
AGTACACTGAAAATTCAACAGGAAAAATCAGCCCGGTCATTGCTGCCATTCATCGCGAATACAAGCAGACATGGAAAACACTGGATGACGAACTGGCCTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATGCGCTGTTGCTTG > NC_000913/1650745‑1650941 | tGAAAATTCAACAGGAAAAATCAGCCCGGTCATTGCTGCCATTCATCGCGAATACAAGCAGACATGGAAAACACTGGATGACGAACTGGCCTATGGgcgc < 1:579299/100‑1 (MQ=255) ctctccgataacatggtgtatacggagaagcacatccgtatacaccatgttatcggagagctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTc > 1:2522167‑M2/86‑100 (MQ=255) aCAGGAAAAATCAGCCCGGTCATTGCTGCCATTCATCGCGAATACAAGCAGACATGGAAAACACTGGATGACGAACTGGCCTATGGGCGCTGCTTCGCAg < 1:1010828/100‑1 (MQ=255) aaaaaTCAGCCCGGTCATTGCTGCCATTCATCGCGAATACAAGCAGACATGGAAAACACTGGATGCCGAACTGGCCTATGGGCGCTGCTTAGCAGACAgg > 2:499538/1‑100 (MQ=255) aaaTCAGCCCGGTCATTGCTGCCATTCATCGCGAATACAAGCAGACATGGAAAACACTGGATGACGAACTGGCCTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCa < 1:654553/100‑1 (MQ=255) tggtgtatacggagaagcacatccgtatacaccatgttatcggagagctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGa > 1:1078947‑M2/73‑100 (MQ=255) ggtgtatacggagaagcacatccgtatacaccatgttatcggagagctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGaa > 1:395650‑M2/72‑100 (MQ=255) ggtgtatacggagaagcacatccgtatacaccaggttatcggagagctgcgaacgtatggttatagtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGGAAGGCAGaa > 2:4012790‑M2/72‑100 (MQ=255) tgtatacggagaagcacatccgtatacaccatgttatcggagagctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACt > 2:1824232‑M2/70‑100 (MQ=255) gTCATTGCTGCCATTCATCGCGAATACAAGCAGACATGGAAAACACTGGATGACGAACTGGCCTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATgg < 1:1134660/100‑1 (MQ=255) ggcagctctccgataacatggtgtatacggagagctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCCGAACTTGATGGTATg > 2:2733562‑M2/60‑100 (MQ=255) gcCATTCATCGCGAATACAAGCAGACATGGAAAACACTGGATGACGAACTGGCCTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGc < 1:2623939/100‑1 (MQ=255) tatccttatacactatgttatcggagcgccgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGc < 2:3327973‑M2/46‑1 (MQ=255) ttCATCGCGAATACAAGCAGACATGGAAAACACTGGATGACGAACTGGCCTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATc < 1:2685580/100‑1 (MQ=255) ccgtatacaccatgttatcggagagctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATc < 1:3023782‑M2/50‑1 (MQ=255) ccgtatacaccatgttatcggagagctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATc < 2:3616634‑M2/50‑1 (MQ=255) ccgtatacaccatgttatcggagagctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATc > 2:538828‑M2/51‑100 (MQ=255) ccgtatacaacatgttatcggagagctgccaacggatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATc < 1:3873985‑M2/50‑1 (MQ=255) cgtatacaccatgttatcggagagctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCa > 1:3055130‑M2/50‑100 (MQ=255) gtatacaccatgttatcggagagctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCaa > 2:2982592‑M2/49‑100 (MQ=255) tatacaccatgttatcggagagctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAAt < 1:1789672‑M2/53‑1 (MQ=255) tatacaccatgttatcggagagctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAAt < 1:1529847‑M2/53‑1 (MQ=255) tCGCGAATACAAGCAGACATGGAAAACACTGGATGACGAACTGGCCTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATg < 2:3032715/100‑1 (MQ=255) tacaccatgttatcggagagctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGc < 2:2844736‑M2/55‑1 (MQ=255) tacaccatgttatcggagagctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGc < 2:3148080‑M2/55‑1 (MQ=255) tacaccatgttatcggagagctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGc > 2:942411‑M2/46‑100 (MQ=255) gcgAATACAAGCAGACATGGAAAACACTGGATGACGAACTGGCCTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGcc < 1:2098249/100‑1 (MQ=255) acaccatgttatcggagagctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGcc > 2:1742921‑M2/45‑100 (MQ=255) acaccatgttatcggagagctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGcc > 1:2302819‑M2/45‑100 (MQ=255) acaccatgttatcggagagctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGc < 2:2964456‑M2/55‑1 (MQ=255) accatgttatcggagagctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCaa > 2:4061125‑M2/43‑100 (MQ=255) ccatgttatcggagagctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCCGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCaaa > 2:2515193‑M2/42‑100 (MQ=255) ccatgttatcggagagctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCaaa > 2:1903016‑M2/42‑100 (MQ=255) ccatgttatcggagagctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCaaa > 1:3302275‑M2/42‑100 (MQ=255) catgttatcggagagctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCGGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAAc < 2:2119628‑M2/60‑1 (MQ=255) gttatcggagagctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCTAAACgtg < 1:1751629‑M2/63‑1 (MQ=255) gttatcggagagctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACgtg < 1:3105722‑M2/63‑1 (MQ=255) gttatcggagagctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACgtg < 1:805419‑M2/63‑1 (MQ=255) gttatcggagagctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACgtg < 1:2428668‑M2/63‑1 (MQ=255) gttatcggagagctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACgtg > 1:2758501‑M2/38‑100 (MQ=255) ttatcggagagctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACgtgt > 2:660374‑M2/37‑100 (MQ=255) ttatcggagagctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACgtgt < 1:3992932‑M2/64‑1 (MQ=255) aaGCAGACATGGAAAACACTGGATGACGAACTGGCCTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACgcgt < 2:2030524/100‑1 (MQ=255) tatcggagagctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGtt > 2:367852‑M2/36‑100 (MQ=255) atcggagagctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGttt > 2:3948384‑M2/35‑100 (MQ=255) tcggagagctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTa > 1:1608927‑M2/34‑100 (MQ=255) tcggagagctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTa > 2:1518428‑M2/34‑100 (MQ=255) cggagagctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTAc > 1:1865723‑M2/33‑100 (MQ=255) ggagagctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTAcc > 2:2269612‑M2/32‑100 (MQ=255) agagctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCgg < 1:1950840‑M2/71‑1 (MQ=255) aTGGAAAACACTGGATGACGAACTGGCCTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGa > 1:2388438/1‑100 (MQ=255) agctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGAt < 1:1671881‑M2/73‑1 (MQ=255) agctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGAt < 1:54177‑M2/73‑1 (MQ=255) agctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGAt < 1:2970612‑M2/73‑1 (MQ=255) gctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGCACTTGATGGTATGCCTGCGACCAATGCCAAACGTGTTTAcc > 2:900621‑M2/27‑95 (MQ=255) gctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATc > 2:236705‑M2/27‑100 (MQ=255) gctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATc < 1:14676‑M2/74‑1 (MQ=255) gAAAACACTGGATGACGAACTGGCCTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCa > 1:1312404/1‑100 (MQ=255) ctgccaaggtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCa < 2:1131678‑M2/75‑1 (MQ=255) ctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCa > 1:2900078‑M2/26‑100 (MQ=255) ctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCa < 1:2249512‑M2/75‑1 (MQ=255) ctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCa > 1:875645‑M2/26‑100 (MQ=255) ctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGAATGCCAGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCa > 2:2788260‑M2/26‑100 (MQ=255) tgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCAt > 1:933869‑M2/25‑100 (MQ=255) ccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATgc > 2:577186‑M2/23‑100 (MQ=255) caacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATgcg < 1:2025967‑M2/79‑1 (MQ=255) caacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATgc < 2:1289487‑M2/78‑1 (MQ=255) cacTGGATGACGAACTGGCCTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATgcgc < 1:3408227/100‑1 (MQ=255) aacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATgcgc < 2:263675‑M2/80‑1 (MQ=255) acgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGcc < 1:406311‑M2/81‑1 (MQ=255) acgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGcc < 2:3282548‑M2/81‑1 (MQ=255) gtatggttatcgtcgggTTGGGGCGCTGCCTAGCAGAAAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAg < 2:419800‑M2/83‑1 (MQ=255) tggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAAt > 1:1980671‑M2/15‑100 (MQ=255) ggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATg < 1:1270677‑M2/87‑1 (MQ=255) ggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATg > 1:3163751‑M2/14‑100 (MQ=255) atcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATGCGCt > 2:2419994‑M2/10‑100 (MQ=255) atcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATGAGCt > 2:731947‑M2/10‑100 (MQ=255) tcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATGCGCTg > 1:3258693‑M2/9‑100 (MQ=255) aaCTGGCCTATGGGCGCTACTTCGCAGACAGGCCGAACTTGATGGCATGCCTGCGATCAATGCCCAACGTGTTTACCGGATCATTCCCCAGAATGAGCt > 2:1062233/1‑99 (MQ=14) cgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCTGAACTTAATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATGCGCTGt < 2:2905840‑M2/93‑1 (MQ=255) cgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATGCGCTGt < 2:3857841‑M2/93‑1 (MQ=255) cgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATGCGCTGt < 2:1669140‑M2/93‑1 (MQ=255) aCTGGCCTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATGCGCTGt < 1:3785033/100‑1 (MQ=38) gtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATGCGCTGtt > 1:3711025‑M2/7‑100 (MQ=255) gtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATGCGCTGtt > 1:3657197‑M2/7‑100 (MQ=255) gtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATGCGCTGtt > 1:481079‑M2/7‑100 (MQ=255) tcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATGCGCTGTTg < 1:3586466‑M2/95‑1 (MQ=255) tcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATGCGCTGTTg < 2:3407072‑M2/95‑1 (MQ=255) ggCCTATGGGCGCTGCGTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATGCGCTGTTGc < 2:1449602/100‑1 (MQ=18) cgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATGCGCtgttac > 2:2308544‑M2/5‑98 (MQ=255) cgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGCGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATGCGCTGTTGc > 2:2179803‑M2/5‑100 (MQ=255) nccTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGCTCATGCGCCAGAATGCGCTGTTGCt > 2:377579/2‑100 (MQ=14) gggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATGCGCTGTTGCt > 2:34795‑M2/4‑100 (MQ=255) gggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATGCGCTGTTGCt > 1:2867993‑M2/4‑100 (MQ=255) gggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATGCGCTGTTGCt > 2:835418‑M2/4‑100 (MQ=255) ggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATGCGCTGTTGCtt < 1:744319‑M2/98‑1 (MQ=255) ggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATGCGCTGTTGCtt > 2:2003249‑M2/3‑100 (MQ=255) gTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGTGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATGCGCTGTTGCTTg < 1:1426038‑M2/99‑1 (MQ=255) gTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATGCGCTGTTGCTTg < 1:2202356‑M2/99‑1 (MQ=255) gTATGGGCGCTGCTGCGCAGACAGGCAGAACTTGACGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATGCGCTGTTGCTTg < 2:1395343‑M2/99‑1 (MQ=255) | AGTACACTGAAAATTCAACAGGAAAAATCAGCCCGGTCATTGCTGCCATTCATCGCGAATACAAGCAGACATGGAAAACACTGGATGACGAACTGGCCTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATGCGCTGTTGCTTG > NC_000913/1650745‑1650941 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |