| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,420,196 | T→C | 53.7% | N16D (AAC→GAC) | racR ← | Rac prophage; putative DNA‑binding transcriptional regulator |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,420,196 | 0 | T | C | 53.7% | 33.7 / 153.2 | 123 | N16D (AAC→GAC) | racR | Rac prophage; putative DNA‑binding transcriptional regulator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (30/27); new base C (24/42); total (54/69) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.01e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.60e-01 | |||||||||||
Only 100 of 129 total aligned reads displayed.
AGCCTTTCTTAATCCAGTCATAAATTGATGGTGGTTGGACTTTAAAGTGGCGTGCGACCTCCGCCTTTGATTTGACGGATCCCGATGCGATTTTTTTGTTAATGGCCTGCTCTATCGCTCGGCCTAAGTCTTTACCACTAAGCATTGCTTAATATTCTCCTATGCGCATTACATTAGGCAATCCCTACCCTTACTGCAT > NC_000913/1420097‑1420295 | agCCTTTCTTAATCCAGTCATAAATTGATGGTGGTTGGACTTTAAAGTGGCGTGCGACCTCCGCCTTTGATTTGACGGATCCCGATGCGATTTTTTTGtt < 1:3014073/100‑1 (MQ=255) cTTTCTTAATCCAGTCATAAATTGATGGTGGTTGGACTTTAAAGTGGCGTGCGACCTCCGCCTTTGATTTGACGGATCCCGATGCGATTTTTTTGTCAAt > 2:2879063/1‑100 (MQ=255) tCTTAATCCAGTCATAAATTGATGGTGGTTGGACTTTAAAGTGGCGTGCGACCTCCGCCTTTGATTTGACGGATCCCGATGCGATTTTTTTGTTAAt > 2:1510101/1‑97 (MQ=255) tCTTAATCCAGTCATAAATTGATGGTGGTTGGACTTTAAAGTGGCGTGCGACCTCCGCCTTTGATTTGACGGATCCCGATGCGATTTTTTTGTCAATGGc < 2:2264255/100‑1 (MQ=255) cTTAATCCAGTCATAAATTGATGGTGGTTGGACTTTAAAGTGGCGTGCGACCTCCGCCTTTGATTTGACGGATCCCGATGCGATTTTTTTGTCAATGGcc < 2:1009650/100‑1 (MQ=255) ttAATCCAGTCATAAATTGATGGTGGTTGGACTTTAAAGTGGCGTGCGACCTCCGCCTTTGATTTGACGGATCCCGATGCGATTTTTTTGTTAATGGCCt < 2:2863711/100‑1 (MQ=255) tAATCCAGTCATAAATTGATGGTGGTTGGACTTTAAAGTGGCGTGCGACCTCCGCCTTTGATTTGACGGATCCCGCTGCGATTTTTTTGTCAATGGCCTg > 2:575368/1‑100 (MQ=255) tAATCCAGTCATAAATTGATGGTGGTTGGACTTTAAAGTGGCGTGCGACCTCCGCCTTTGATTTGACGGATCCCGATGCGATTTTTTTGTTAATGGCCTg < 2:3547895/100‑1 (MQ=255) tAATCCAGTCATAAATTGATGGTGGTTGGACTTTAAAGTGGCGTGCGACCTCCGCCTTTGATTTGACGGATCCCGATGCGATTTTTTTGTCAATGGCCTg > 1:1532809/1‑100 (MQ=255) ccAGTCATAAATTGATGGTGGTTGGACTTTAAAGTGGCGTGCGACCTCCGCCTTTGATTTGACGGATCCCGATGCGATTTTTTTGTCAATGGCCTGctct > 1:1558730/1‑100 (MQ=255) cAGTCATAAATTGATGGTGGTTGGACTTTAAAGTGGCGTGCGACCTCCGCCTTTGATTTGACGGATCCCGATGCGATTTTTTTGTTAATGGCCTGctct > 2:2135833/1‑99 (MQ=255) gTCATAAATTGATGGTGGTTGGACTTTAAAGTGGCGTGCGACCTCCGCCTTTGATTTGACGGATCCCGATGCGATTTTTTTGTCAATGGCCTGCTCTATc < 1:3851999/100‑1 (MQ=255) aTAAATTGATGGTGGTTGGACTTTAAAGTGGCGTGCGACCTCCGCCTTTGATTTGACGGATCCCGATGCGATTTTTTTGTTAATGGCCTGCTCTATCGCt > 1:4118045/1‑100 (MQ=255) tAAATTGATGGTGGTTGGACTTTAAAGTGGCGTGCGACCTCCGCCTTTGATTTGACGGATCCCGATGCGATTTTTTTGTTAATGGCCTGCTCTATCGCTc > 2:2339326/1‑100 (MQ=255) aaTTGATGGTGGTTGGACTTTAAAGTGGCGTGCGACCTCCGCCTTTGATTTGACGGATCCCGATGCGATTTTTTTGTTAATGGCCTGCTCTATCGCTCgg < 2:1506932/100‑1 (MQ=255) aaTTGATGGTGGTTGGACTTTAAAGTGGCGTGCGACCTCCGCCTTTGATTTGACGGATCCCGATGCGATTTTTTTGTTAATGGCCTGCTCTATCGCTCgg > 1:2533312/1‑100 (MQ=255) aaTTGATGGTGGTTGGACTTTAAAGTGGCGTGCGACCTCCGCCTTTGATTTGACGGATCCCGATGCGATTTTTTTGTCAATGGCCTGCTCTATCGCTCgg > 2:1592236/1‑100 (MQ=255) aTTGATGGTGGTTGGACTTTAAAGTGGCGTGCGACCTCCGCCTTTGATTTGACGGATCCCGATGCGATTTTTTTGTTAATGGCCTGCTCTATCGCTCgg < 2:398515/99‑1 (MQ=255) ttGATGGTGGTTGGACTTTAAAGTGGCGTGCGACCTCCGCCTTTGATTTGACGGATCCCGATGCGATTTTTTTGTTAATGGCCTGCTCTATCGCTCGGcc < 1:58981/100‑1 (MQ=255) ttGATGGTGGTTGGACTTTAAAGTGGCGTGCGACCTCCGCCTTTGATTTGACGGATCCCGATGCGATTTTTTTGTCAATGGCCTGCTCTATCGCTCGGcc < 1:2057115/100‑1 (MQ=255) ttGATGGTGGTTGGACTTTAAAGTGGCGTGCGACCTCCGCCTTTGATTTGACGGATCCCGATGCGATTTTTTTGTCAATGGCCTGCTCTATCGCTCGGcc < 1:3039017/100‑1 (MQ=255) ttGATGGTGGTTGGACTTTAAAGTGGCGTGCGACCTCCGCCTTTGATTTGACGGATCCCGATGCGATTTTTTTGTCAATAGCCTGCTCTATCGCTCGGcc < 2:2517994/100‑1 (MQ=255) tGATGGTGGTTGGACTTTAAAGTGGCGTGCGACCTCCGCCTTTGATTTGACGGATCCCGATGCGATTTTTTTGTTAATGGCCTGCTCTATCGCTCGGCCt < 1:1733641/100‑1 (MQ=255) gATGGTGGTTGGACTTTAAAGTGGCGTGCGACCTCCGCCTTTGATTTGACGGATCCCGATGCGATTTTTTTGTTAATGGCCTGCTCTATCGCTCGGCCTa > 2:3507429/1‑100 (MQ=255) gATGGTGGTTGGACTTTAAAGTGGCGTGCGACCTCCGCCTTTGATTTGACGGATCCCGATGCGATTTTTTTGTCAATGGCCTGCTCTATCGCTCGGCCTa < 1:1055328/100‑1 (MQ=255) gATGGTGGTTGGACTTTAAAGTGGCGTGCGACCTCCGCCTTTGATTTGACGGATCCCGATGCGATTTTTTTGTCAATGGCCTGCTCTATCGCTCGGCCTa < 1:1843767/100‑1 (MQ=255) gATGGTGGTTGGACTTTAAAGTGGCGTGCGACCTCCGCCTTTGATTTGACGGATCCCGATGCGATTTTTTTGTCAATGGCCTGCTCTATCGCTCGGCCTa < 1:1592248/100‑1 (MQ=255) aTGGTGGTTGGACTTTAAAGTGGCGTGCGACCTCCGCCTTTGATTTGACGGATCCCGATGCGATTTTTTTGTCAATGGCCTGCTCTATCGCTCGGCCTaa > 2:2135739/1‑100 (MQ=255) tggtggTTGGACTTTAAAGTGGCGTGCGACCTCCGCCTTTGATTTGACGGATCCCGATGCGATTTTTTTGTTAATGGCCTGCTCTATCGCTCGGCCTAAg > 1:2734201/1‑100 (MQ=255) ggtggtTGGACTTTAAAGTGGCGTGCGACCTCCGCCTTTGATTTGACGGATCCCGATGCGATTTTTTTGTCAATGGCCTGCTCTATCGCTCGGCCTAAGt < 1:291010/100‑1 (MQ=255) gtggtTGGACTTTAAAGGGGCGTGCGACCGCCGCCGTGGATTTGACGGAGCCGGATGCTATTTTGGTGGTAATGGCCTGCTCTATGGCTCGGCCGAAGTc > 1:1854766/1‑100 (MQ=255) tggtTGGACTTTAAAGTGGCGTGCGACCTCCGCCTTTGATTTGACGGATCCCGATGCGATTTTTTTGTCAATGGCCTGCTCTATCGCTCGGCCTAAGTCt < 1:1856288/100‑1 (MQ=255) gtTGGACTTTAAAGTGGCGTGCGACCTCCGCCTTTGATTTGACGGATCCCGATGCGATTTTTTTGTCAATGGCCTGCTCTATCGCTCGGCCTAAGTCttt > 1:3150764/1‑100 (MQ=255) gtTGGACTTTAAAGTGGCGTGCGACCTCCGCCTTTGATTTGACGGATCCCGATGCGA‑TTTTTTGTCAATGGCCTGCTCTATCGCTCGGCCTAAGTCTTTa < 1:2235735/100‑1 (MQ=255) ttGGACTTTAAAGTGGCGTGCGACCTCCGCCTTTGATTTGACGGATCCCGATGCGATTTTTTTGTTAATGGCCTGCTCTATCGCTCGGCCTAAGTCTTTa < 1:3140573/100‑1 (MQ=255) ggACTTTAAAGTGGCGTGCGACCTCCGCCTTTGATTTGACGGATCCCGATGCGATTTTTTTGTTAATGGCCTGCTCTATCGCTCGGCCTAAGTCTTTAcc < 1:2604931/100‑1 (MQ=255) ggACTTTAAAGTGGCGTGCGACCTCCGCCTTTGATTTGACGGATCCCGATGCGATTTTTTTGTCAATGGCCTGCTCTATCGCTCGGCCTAAGTCTTTAcc < 1:2609139/100‑1 (MQ=255) ggACTTTAAAGTGGCGTGCGACCTCCGCCTTTGATTTGACGGATCCCGATGCGATTTTTTTGTCAATGGCCTGCTCTATCGCTCGGCCTAAGTCTTTAcc < 1:4116575/100‑1 (MQ=255) ggACTTTAAAGTGGCGTGCGACCTCCGCCTTTGATTTGACGGATCCCGATGCGATTTTTTTGTCAATGGCCTGCTCTATCGCTCGGCCTAAGTCTTTAcc < 2:1930244/100‑1 (MQ=255) gtcTTGAAAGTGGCGTGCGAGCTCCGCGTTTTATTTGACGGATCCCGATGCGATTTTTTTGTCAATGGCCTGCTCTATCGCTCGGCCTAAGTCTTTAc < 2:3454287/96‑1 (MQ=255) aCTTTAAAGTGGCGTGCGACCTCCGCCTTTGATTTGACGGATCCCGATGCGATTTTTTTGTCAATGGCCTGCTCTATCGCTCGGCCTAAGTCTTTACCAc < 2:3792099/100‑1 (MQ=255) cTTTAAAGTGGCGTGCGACCTCCGCCTTTGATTTGACGGATCCCGATGCGATTTTTTTGTTAATGGCCTGCTCTATCGCTCGGCCTAAGTCTTTACCACt > 2:2513219/1‑100 (MQ=255) cTTTAAAGTGGCGTGCGACCTCCGCCTTTGATTTGACGGATCCCGATGCGATTTTTTTGTCAATGGCCTGCTCTATCGCTCGGCCTAAGTCTTTACCACt > 1:711336/1‑100 (MQ=255) tttAAAGTGGCGTGCGACCTCCGCCTTTGATTTGACGGATCCCGATGCGATTTTTTTGTTAATGGCCTGCTCTATCGCTCGGCCTAAGTCTTTACCACTa < 1:3669210/100‑1 (MQ=255) ttAAAGTGGCGTGCGACCTCCGCCTTTGATTTGACGGATCCCGATGCGATTTTTTTGTTAATGGCCTGCTCTATCGCTCGGCCTAAGTCTTTACCACTaa > 2:2765750/1‑100 (MQ=255) ttAAAGTGGCGTGCGACCTCCGCCTTTGATTTGACGGATCCCGATGCGATTTTTTTGTCAATGGCCTGCTCTATCGCTCGGCCTAAGTCTTTACCACTaa > 2:1169849/1‑100 (MQ=255) ttAAAGTGGCGTGCGACCTCCGCCTTTGATTTGACGGATCCCGATGCGATTTTTTTGACAATGGCCTGCTCTATCGCTCGGCCTAAGTCTTTACCACTaa > 2:2904611/1‑100 (MQ=255) tAAAGTGGCGTGCGACCTCCGCCTTTGATTTGACGGATCCCGATGCGATTTTTTTGTTAATGGCCTGCTCTATCGCTCGGCCTAAGTCTTTACCACTAAg < 1:2856778/100‑1 (MQ=255) aaaGTGGCGTGCGACCTCCGCCTTTGATTTGACGGATCCCGATGCGATTTTTTTGTTAATGGCCTGCTCTATCGCTCGGCCTAAGTCTTTACCACTAAGc > 1:2738287/1‑100 (MQ=255) tGGCGTGCGACCTCCGCCTTTGATTTGACGGATCCCGATGCGATTTTTTTGTTAATGGCCTGCTCTATCGCTCGGCCTAAGTCTTTACCACTAAGCATTg < 1:2957384/100‑1 (MQ=255) ggCGTGCGACCTCCGCCTTTGATTTGACGGATCCCGATGCGATTTTTTTGTTAATGGCCTGCTCTATCGCTCGGCCTAAGTCTTTACCACTAAGCATTg > 1:3926896/1‑99 (MQ=255) ggCGTGCGACCTCCGCCTTTGATTTGACGGATCCCGATGCGATTTTTTTGTTAATGGCCTGCTCTATCGCTCGGCCTAAGTCTTTACCACTAAGCATTGc > 2:3730887/1‑100 (MQ=255) ggCGTGCGACCTCCGCCTTTGATTTGACGGATCCCGATGCGATTTTTTTGTCAATGGCCTGCTCTATCGCTCGGCCTAAGTCTTTACCACTAAGCATTGc < 1:2187830/100‑1 (MQ=255) gCGTGCGACCTCCGCCTTTGATTTGACGGATCCCGATGCGATTTTTTTGTTAATGGCCTGCTCTATCGCTCGGCCTAAGTCTTTACCACTAAGCATTGCt < 2:1187476/100‑1 (MQ=255) cGTGCGACCTCCGCCTTTGATTTGACGGATCCCGATGCGATTTTTTTGTTAATGGCCTGCTCTATCGCTCGGCCTAAGTCTTTACCGCTAAGCATTGCtt > 2:1535652/1‑100 (MQ=255) cGTGCGACCTCCGCCTTTGATTTGACGGATCCCGATGCGATTTTTTTGTTAATGGCCTGCTCTATCGCTCGGCCTAAGTCTTTACCACTAAGCATTGCtt > 1:3487380/1‑100 (MQ=255) gTGCGACCTCCGCCTTTGATTTGACGGATCCCGATGCGATTTTTTTGTCAATGGCCTGCTCTATCGCTCGGCCTAAGTCTTTACCACTAAGCATTGCTTa > 2:2941999/1‑100 (MQ=255) tGCGACCTCCGCCTTTGATTTGACGGATCCCGATGCGATTTTTTTGTTAATGGCCTGCTCTATCGCTCGGCCTAAGTCTTTACCACTAAGCATTGCTTaa < 1:973439/100‑1 (MQ=255) tGCGACCTCCGCCTTTGATTTGACGGATCCCGATGCGATTTTTTTGTTAATGGCCTGCTCTATCGCTCGGCCTAAGTCTTTACCACTAAGCATTGCTTaa < 1:1293017/100‑1 (MQ=255) tGCGACCTCCGCCTTTGATTTGACGGATCCCGATGCGATTTTTTTGTCAATGGCCTGCTCTATCGCTCGGCCTAAGTCTTTACCACTAAGCATTGCTTaa > 1:1045226/1‑100 (MQ=255) tGCGACCTCCGCCTTTGATTTGACGGATCCCGATGCGATTTTTTTGTCAATGGCCTGCTCTATCGCTCGGCCTAAGTCTTTACCACTAAGCATTGCTTaa < 2:3070491/100‑1 (MQ=255) gCGACCTCCGCCTTTGATTTGACGGATCCCGATGCGATTTTTTTGTCAATGGCCTGCTCTATCGCTCGGCCTAAGTCTTTACCACTAAGCATTGCTTAat < 1:1293762/100‑1 (MQ=255) cTCCGCCTTTGATTTGACGGATCCCGATGCGATTTTTTTGTCAATGGCCTGCTCTATCGCTCGGCCTAAGTCTTTACCACTAAGCATTGCTTAATATtct > 1:2604380/1‑100 (MQ=255) tCCGCCTTTGATTTGACGGATCCCGATGCGATTTTTTTGTCAATGGCCTGCTCTATCGCTCGGCCTAAGTCTTTACCACTAAGCAATGCTTagtggtaaa < 1:2739375/100‑9 (MQ=255) ccGCCTTTGATTTGACGGATCCCGATGCGATTTTTTTGTTAATGGCCTGCTCTATCGCTCGGCCTAAGTCTTTACCACTAAGCATTGCTTAATATTCTcc > 1:781211/1‑100 (MQ=255) ccGCCTTTGATTTGACGGATCCCGATGCGATTTTTTTGTCAATGGCCTGCTCTATCGCTCGGCCTACGTCTTTACCACTAAGCATTGCTTAATATTCTcc < 2:384304/100‑1 (MQ=255) cGCCTTTGATTTGACGGATCCCGATGCGATTTTTTTGTTAATGGCCTGCTCTATCGCTCGGCCTAAGTCTTTACCACTAAGCATTGCTTAATATTCTcc < 2:650018/99‑1 (MQ=255) gCCTTTGATTTGACGGATCCCGATGCGATTTTTTTGTTAATGTCCTGCTCTATATCTCGGCCTAAGTCTTTACCTCTAAGCTTTTCTTAATATTCTCCt > 2:2053286/1‑99 (MQ=255) gCCTTTGATTTGACGGATCCCGATGCGATTTTTTTGTCAATGGCCTGCTCTATCGCTCGGCCTAAGTCTTTACCACTAAGCATTGCTTAATATTCTCCTa < 1:1464699/100‑1 (MQ=255) ttgatttgaCGGATCCCGATGCGATTTTTTTGTCAATGGCCTGCTCTATCGCTCGGCCTAAGTCTTTACCACTAAGCATTGCTTAATATTCTCCTATgcg < 1:1394201/100‑1 (MQ=255) gatttgaCGGATCCCGATGCGATTTTTTTGTTAATGGCCTGCTCTATCGCTCGGCCTAAGTCTTTACCACTAAGCATTGCTTAATATTCTCCTATGCGca > 1:1650577/1‑100 (MQ=255) gatttgaCGGATCCCGATGCGATTTTTTTGTCAATGGCCTGCTCTATCGCTCGGCCTAAGTCTTTACCACTAAGCATTGCTTAATATTCTCCTATGCGca < 1:720510/100‑1 (MQ=255) atttgaCGGATCCCGATGCGATTTTTTTTTTTTTTTTTTGCTCTATCGCTCGGCCTAAGTCTTTACCACTAAGCGTTGCTTAATATTTTCCTTTTCGcat > 2:3303900/1‑100 (MQ=255) atttgaCGGATCCCGATGCGATTTTTTTGTTAATGGCCTGCTCTATCGCTCGGCCTAAGTCTTTACCACTAAGCATTGCTTAATATTCTCCTATGCGcat > 1:3125793/1‑100 (MQ=255) atttgaCGGATCCCGATGCGATTTTTTTGTCAATGGCCTGCTCTATCGCTCGGCCTAAGTCTTTACCACTAAGCATTGCTTAATATTCTCCTATGCGcat > 2:1298355/1‑100 (MQ=255) tttgaCGGATCCCGATGCGATTTTTTTGTCAATGGCCTGCTCTATCGCTCGGCCTAAGTCTTTACCACTAAGCATTGCTTAATATTCTCCTATGCGcatt < 2:1736337/100‑1 (MQ=255) tttgaCGGATCCCGATGCGATTTTTTTGTCAATGGCCTGCTCTATCGCTCGGCCTAAGTCTTTACCACTAAGCATTGCTTAATATTCTCCTATGCGcatt < 2:3122490/100‑1 (MQ=255) ttgaCGGATCCCGATGCGATTTTTTTGTTATTTTCCTGCTCTATAGCTCGGCCTTAGTATTTACCACTAAGCATTGCTTAATATTCTCCTATGCGcatt > 2:1135962/1‑99 (MQ=255) gaCGGATCCCGATGCGATTTTTTTGTTAATGGCCTGCTCTATCGCTCGGCCTAAGTCTTTACCACTAAGCATTGCTTAATATTCTCCTATGCGcattaca > 1:504895/1‑100 (MQ=255) cGGATCCCGATGCGATTTTTTTGTCAATGGCCTGCTCTATCGCTCGGCCTAAGTCTTTACCACTAAGCATTGCTTAATATTCTCCTATGCGcattacatt < 2:476150/100‑1 (MQ=255) cGGATCCCGATGCGATTTTGTTGTTAATGGCCTGCTCTATCGCTCGGCCTAAGTCTTTACCACTAAGCATTGCTTAATATTCTCCTATGCGcattacatt < 1:1366792/100‑1 (MQ=255) ggATCCCGATGCGATTTTTTTGTTAATGGCCTGCTCTATCGCTCGGCCTAAGTCTTTACCACTAAGCATTGCTTAAGATTCTCCTATGCGcattacatta < 2:3931600/100‑1 (MQ=255) gATCCCGAAGCGATTTTTTTGTCAATAATCTGCTTTATCACGCGGCGTAAGTCTTTACAACTAAGCATTGTTTAATATTCTCCTATTCGCCTTACATTAg > 2:3827784/1‑100 (MQ=255) tCCCGATGCGATTTTTTTGTTAATGGCCTGCTCTATCGCTCGGCCTAAGTCTTTACCACTAAGCATTGCTTAATATTCTCCTATGCGCATTACATTAGGc < 2:1110760/100‑1 (MQ=255) tCCCGATGCGATTTTTTTGTCAATGGCCTGCTCTATCGCTCGGCCTAAGTCTTTACCACTAAGCATTGCTTAATATTCTCCTATGCGCATTACATTAGGc < 1:3652099/100‑1 (MQ=255) tCCAGATGCGATTTTTTTGTCAATGGCCTGCTCTATCGCTCGGCCTAAGTCTTTACCACTAAGCATTGCTTAATATTCTCCTATGCGCATTACATTAGGc < 1:1688503/100‑1 (MQ=255) cccGATGCGATTTTTTTGTTAATGGCCTGCTCTATCGCTCGGCCTAAGTCTTTACCACTAAGCATTGCTTAATATTCTCCTATGCGCATTACATTAGGCa < 1:304104/100‑1 (MQ=255) cGATGCGATTTTTTTGTTAATGGCCTGCTCTATCGCTCGGCCTAAGTCTTTACCACTAAGCATTGCTTAATATTCTCCTATGCGCATTACATTAGGCa < 2:701821/98‑1 (MQ=255) cGATGCGATTTTTTTGTTAATGGCCTGCTCTATCGCTCGGCCTAAGTCTTTACCACTAAGCATTGCTTAATATTCTCCTATGCGCATTACATTAGGCAAt > 1:2933696/1‑100 (MQ=255) cGATTTTTTTGTTAATGGCCTGCTCTATCGCTCGGCCTAAGTCTTTACCACTAAGCATTGCTTAATATTCTCCTATGCGCATTACATTAGGCAATCCCTa > 1:3806766/1‑100 (MQ=255) aTTTTTTTGTCAATGGCCTGCTCTATCGCTCGGCCTAAGTCTTTACCACTAAGCATTGCTTAATATTCTCCTATGCGCATTACATTAGGCAATCCCTAcc < 1:1759468/100‑1 (MQ=255) tttttttGTCAATGGCCTGCTCTATCGCTCGGCCTAAGTCTTTACCACTAAGCATTGCTTAATATTCTCCTATGCGCATTACATTAGGCAATCCCTAccc < 1:3350093/100‑1 (MQ=255) tttttttGTCAATGGCCTGCTCTATCGCTCGGCCTAAGTCTTTACCACTAAGCATTGCTTAATATTCTCCTATGCGCATTACATTAGGCAATCCCTAccc < 2:1968196/100‑1 (MQ=255) ttttGTTAATGGCCTGCTCTATCGCTCGGCCTAAGTCTTTACCACTAAGCATTGCTTAATATTCTCCTATGCGCATTACATTAGGCAAtccctcccat > 2:1867341/1‑96 (MQ=255) tttGTTAATGGCCTGCTCTATCGCTCGGCCTAAGTCTTTACCACTAAGCATTGCTTAATATTCTCCTATGCGCATTACATTAGGCAATCCCTACCCTTAc < 2:2933680/100‑1 (MQ=255) ttGTCAATGGCCTGCTTTATCGCTCGGCCTAAGTCTTTACCACTAAGCATTGCTTAATATTCTCCTATGCGCATTACATTAGGCAATCCCTACCCTTACt < 2:2412952/100‑1 (MQ=255) ttAATGGCCTGCTCTATCGCTCGGCCTAAGTCTTTACCACTAAGCATTGCTTAATATTCTCCTATGCGCATTACATTAGGCAATCCCTACCCTTACTGCa < 2:1710293/100‑1 (MQ=255) ttAATGGCCTGCTCTATCGCTCGGCCTAAGTCTTTACCACTAAGCATTGCTTAATATTCTCCTATGCGCATTACATTAGGCAATCCCTACCCTTACTGCa < 1:1728072/100‑1 (MQ=255) tAATGGCCTGCTCTATCGCTCGGCCTAAGTCTTTACCACTAAGCATTGCTTAATATTCTCCTATGCGCATTACATTAGGCAATCCCTACCCTTACTGCAt < 2:325961/100‑1 (MQ=255) tAATGGCCTGCTCTATCGCTCGGCCTAAGTCTTTACCACTAAGCATTGCTTAATATTCTCCTATGCGCATTACATTAGGCAATCCCTACCCTTACTGCAt > 2:276074/1‑100 (MQ=255) | AGCCTTTCTTAATCCAGTCATAAATTGATGGTGGTTGGACTTTAAAGTGGCGTGCGACCTCCGCCTTTGATTTGACGGATCCCGATGCGATTTTTTTGTTAATGGCCTGCTCTATCGCTCGGCCTAAGTCTTTACCACTAAGCATTGCTTAATATTCTCCTATGCGCATTACATTAGGCAATCCCTACCCTTACTGCAT > NC_000913/1420097‑1420295 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |