| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,434,402 | T→C | 58.8% | intergenic (‑178/+556) | ynaE ← / ← ttcC | cold shock protein, Rac prophage/pseudogene, prophage Rac integration site ttcA duplication;Phage or Prophage Related |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,434,402 | 0 | T | C | 58.8% | 29.7 / 96.3 | 90 | intergenic (‑178/+556) | ynaE/ttcC | cold shock protein, Rac prophage/pseudogene, prophage Rac integration site ttcA duplication;Phage or Prophage Related |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (20/17); new base C (33/20); total (53/37) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.16e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.86e-01 | |||||||||||
GTTTTGTCTGGGTTATTGGATATGCCAATCCCTAATTTTATTAGAGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAATTTTTATCCTGGGTGTTCTTAAAGTTCGTAGATAAACATTGTCGTTTCAGG > NC_000913/1434303‑1434501 | gTTTTGTCTGGGTTATTGGATATGCCAATCCCTAATTTTATTAGAGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGt < 1:2499792/100‑1 (MQ=255)gTTTTGTCTGGGTTATTGGATATGCCAATCCCTAATTTTATTAGAGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGt > 2:2040829/1‑100 (MQ=40) tttGTCTGGGTTATTGGATATGCCAATCCCTAATTTTATTAGAGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTc < 1:344484/100‑1 (MQ=40) tttGTCTGGGTTATTGGATATGCCAATCCCTAATTTTATTAGAGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTc < 1:3261411/100‑1 (MQ=255) tttGTCTGGGTTATTGGATATGCCAATCCCTAATTTTATTAGAGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTc > 2:1883901/1‑100 (MQ=255) ttGTCTGGGTTATTGGATATGCCAATCCCTAATTTTATTAGAGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCa < 1:1138725/100‑1 (MQ=40) tGTCTGGGTTATTGGATATGCCAATCCCTAATTTTATTAGAGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGCTCat < 2:304827/100‑1 (MQ=255) gTCTGGGTTATTGGATATGCCAATCCCTAATTTTATTAGAGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCata < 2:2578897/100‑1 (MQ=255) cTGGGTTATTGGATATGCCCATGCGTAATATTATTAGAGCGTGAACAACAATGCTGTATATGATAAGGAGCGAAATAATTATAAGTATGCTGCTCataca > 2:1555781/1‑98 (MQ=9) tGGGTTATTGGATATGCCAATCCCTAATTTTATTAGAGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGCTCAtata < 2:270357/99‑1 (MQ=255) gggTTATTGGATATGCCAATCCCTAATTTTATTAGAGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGc > 2:3496304/1‑100 (MQ=255) gggTTATTGGATATGCCAATCCCTAATTTTATTAGAGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGCTCATATAGc < 2:3947179/100‑1 (MQ=255) gggTTATTGGATATGCCAATCCCTAATTTTATTAGAGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGCTCATATAGc > 1:711040/1‑100 (MQ=255) gTTATTGGATATGCCAATCCCTAATTTTATTAGAGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGCTCATATAGCCt > 2:1293292/1‑100 (MQ=255) tATTGGATATGCCAATCCCTAATTTTATTAGAGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCg < 1:1210817/100‑1 (MQ=255) tATTGGATATGCCAATCCCTAATTTTATTAGAGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGCTCATATAGCCTCg > 1:1208766/1‑100 (MQ=255) tATTGGATATGCCAATCCCTAATTTTATTAGAGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGCTCATATAGCCTCg < 1:2328507/100‑1 (MQ=255) ggATATGCCAATCCCTAATTTTATTAGAGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAACCTCAAAtt > 2:453057/1‑100 (MQ=255) ggATATGCCAATCCCTAATTTTATTAGAGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGCTCATATAGCCTCGAAtt < 1:3452137/100‑1 (MQ=255) atatGCCAATCCCTAATTTTATTAGAGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAg < 1:3496326/100‑1 (MQ=255) tatGCCAATCGCTAATTTTATTAGAGCATGACGAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGCTCATATAGCCTCGAATTAGt < 2:3434244/100‑1 (MQ=255) tatGCCAATCCCTAATTTTATTAGAGCATGACTAAAAATGCTTAATATTATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGt < 2:3460423/100‑1 (MQ=255) tatGCCAATCCCTAATTTTATTAGAGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGt < 2:3460432/100‑1 (MQ=40) tGCCAATCCCTAATTTTATTAGAGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGCTCATATAGCCTCGAATTAGTaa > 1:1345701/1‑100 (MQ=255) tGCCAATCCCTAATTTTATTAGAGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGCTCATATAGCCTCGAATTAGTa < 1:2233416/99‑1 (MQ=255) gCCAATCCCTAATTTTATTAGAGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAAt < 2:1153132/100‑1 (MQ=40) gCCAATCCCTAATTTTATTAGAGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGCTCATATAGCCTCGAATTAGTAAt > 1:1095495/1‑100 (MQ=255) gCCAATCCCTAATTTTATTAGAGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGCTCATATAGCCTCGAATTAGTAAt > 2:3316188/1‑100 (MQ=255) gCCAATCCCTAATTTTATTAGAGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGCTCATATAGCCTCGAATTAGTAAt > 2:3813223/1‑100 (MQ=255) gCCAATCCCTAATTTTATTAGAGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGCTCATATAGCCTCGAATTAGTAAt < 2:745418/100‑1 (MQ=255) ccAATCCCTAATTTTATTAGAGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGCTCATATAGCCTCGAATTAGTAAtg > 2:2960888/1‑100 (MQ=255) ccAATCCCTAATTTTATTAGAGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGCTCATATAGCCTCGAATTAGTAAtg > 2:996452/1‑100 (MQ=255) aTCCCTAATTTTATTAGAGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATgtgt < 2:269278/100‑1 (MQ=255) ccTAATTTTATTAGAGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGCTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTtat > 2:2151440/1‑100 (MQ=255) ccTAATTTTATTAGAGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGCTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTtat > 2:1593621/1‑100 (MQ=255) cTAATTTTATTAGAGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCGGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTtata > 1:3843387/1‑100 (MQ=255) tAATTTTATTAGAGCATGACTAAATATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCTGTATGCTGCTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTtat < 2:2809819/98‑1 (MQ=255) tAATTTTATTAGAGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTtatat > 1:326585/1‑100 (MQ=255) tAATTTTATTAGAGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTtata < 2:1756334/99‑1 (MQ=40) ttttATTAGAGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGCTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATg < 2:1124373/100‑1 (MQ=255) ttattaGAGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGat < 2:1023655/100‑1 (MQ=255) tattaGAGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGata < 2:1229646/100‑1 (MQ=255) attaGAGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGatat > 1:57810/1‑100 (MQ=255) attaGAGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGCTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGatat > 1:1612053/1‑100 (MQ=255) taGAGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGCTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAg > 1:1340629/1‑100 (MQ=255) agagCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTAACAGTCTGCTGCGCATATAGCCTCGACTTAGTAATGTGTTATATATGATATAGt > 2:2981335/1‑100 (MQ=14) agCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTg < 1:2221974/100‑1 (MQ=40) aaaataaatAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGtt < 2:2435135/91‑1 (MQ=255) gCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGa > 2:3021595/1‑100 (MQ=38) gCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGCTGATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGa > 2:2642953/1‑100 (MQ=255) gCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGCTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGa > 1:3041472/1‑100 (MQ=255) gCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGCTAATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGa > 2:2643445/1‑100 (MQ=255) cATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGCTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGAc > 2:3507541/1‑100 (MQ=25) gACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAAt < 1:3109556/100‑1 (MQ=38) cTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAAttt > 2:261768/1‑100 (MQ=38) cTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGCTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAAttt > 1:3997310/1‑100 (MQ=255) cTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGCTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAAttt > 1:2760136/1‑100 (MQ=255) tAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAAtttt > 2:2050110/1‑100 (MQ=38) tAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAAtttt > 2:1100709/1‑100 (MQ=38) tAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGCTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAAtttt > 1:2373199/1‑100 (MQ=255) aaaaaTGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAAttttt > 1:1058190/1‑100 (MQ=38) aaaaTGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGCTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAATTTTTa < 1:3609747/100‑1 (MQ=255) gCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGCTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAATTTTTATcttg > 1:2217643/1‑97 (MQ=255) cTGAATATGATAAGGCGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGCTCATATTGCCTCGAATTAGTAATGTGTGATATATGATATAGTTGACAATTTTTATCTTgg < 2:3861801/100‑1 (MQ=11) cTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAATTTTTATCTTgg > 2:2683331/1‑100 (MQ=18) cTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGCTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAATTTTTATcttag > 2:2496754/1‑96 (MQ=255) tGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGCTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAATTTTTATCTTggg < 2:3286316/100‑1 (MQ=12) tGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGCTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAATTTTTATCTTggg > 1:1676227/1‑100 (MQ=255) tGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGCTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAATTTTTATCTTggg > 1:2873583/1‑100 (MQ=255) gAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAATTTTTATCTTGGgt > 1:1332736/1‑100 (MQ=18) gAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAATTTTTATCTTGGgt > 1:3205690/1‑100 (MQ=25) gAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGCTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAATTTTTATCTTGGgt > 1:641831/1‑100 (MQ=255) aaTATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATTCTGTTTATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTCGACAATTTTTATCTTGGgtg < 2:2525473/100‑1 (MQ=11) atatGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAAGTAGAAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAATTTTTATCTTGGgtgt > 2:1999815/1‑100 (MQ=255) tGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAATTTTTATCTTGGGTGTTCt > 1:3607025/1‑100 (MQ=18) tGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGCTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAATTTTTATCTTGGGTGTTCt < 1:3525301/100‑1 (MQ=255) tGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGCTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAATTTTTATCTTGGGTGTTCt < 2:2974295/100‑1 (MQ=9) tAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAATTTTTATCTTGGGTGTTCTTaa > 2:1137768/1‑100 (MQ=18) tAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAATTTTTATCTTGGGTGTTCTTaa > 2:3839308/1‑100 (MQ=17) tAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGCTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAATTTTTATCTTGGGTGTTCTTaa < 1:2180037/100‑1 (MQ=255) tAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGCTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAATTTTTATCTTGGGTGTTCTTaa < 1:1416453/100‑1 (MQ=9) aaGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAATTTTTATCTTGGGTGTTATTaaa > 2:2755112/1‑100 (MQ=12) aGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGCTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAATTTTTATCTTGGGTGTTCTTAAAg > 2:1387635/1‑100 (MQ=255) aGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGCTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAATTTTTATCTTGGGTGTTCTTAAAg < 2:1535810/100‑1 (MQ=12) ggAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGCTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGCATTCTATATGATATAATTGACAATTTTTATCTTGAGTGTTCTTaaaat > 2:429972/1‑98 (MQ=11) naGCGAAGTGATTATCAGTATTCTTTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATTTATGAATTAGTTGACAATTTTTATCTTGGGTGTTTTTATAGtt > 2:3980886/2‑100 (MQ=11) aGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGCTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAATTTTTATCTTGGGTGTTCTTAAAGtt < 1:1703362/99‑1 (MQ=9) aGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGCTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAATTTTTATCTTGGGTGTTCTTAAAGTTc > 1:2073268/1‑100 (MQ=9) gCGAAGTGATTATCAGTATGCTGCTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAATTTTTATCTTGGGTGTTCTTAAAGTTCg > 1:2826419/1‑100 (MQ=2) cGAAGTGATTATCAGTATGCTGCTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAATTTTTATCTTGGGTGTTCTTAAAGTTCGt > 2:2988026/1‑100 (MQ=0) cGAAGTGATTATCAGTATGCTGCTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAATTTTTATCTTGGGTGTTCTTAAAGTTCGt > 1:1220436/1‑100 (MQ=2) cGAAGTGATTATCAGTATGCTGCTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAATTTTTATCTTGGGTGTTCTTAAAGTTCGt < 1:1117275/100‑1 (MQ=0) ttCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAATTTTTATCCTGGGTGTTCTTAAAGTTCGTAGATAAACATTGTCGTTTCTgg > 2:1745174/1‑100 (MQ=17) | GTTTTGTCTGGGTTATTGGATATGCCAATCCCTAATTTTATTAGAGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAATTTTTATCCTGGGTGTTCTTAAAGTTCGTAGATAAACATTGTCGTTTCAGG > NC_000913/1434303‑1434501 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |