| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,493,774 | A→G | 27.2% | L435L (TTA→TTG) | trg → | methyl‑accepting chemotaxis protein III, ribose and galactose sensor receptor |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,493,774 | 0 | A | G | 27.2% | 217.6 / 99.4 | 143 | L435L (TTA→TTG) | trg | methyl‑accepting chemotaxis protein III, ribose and galactose sensor receptor |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (43/61); new base G (12/27); total (55/88) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.35e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.72e-01 | |||||||||||
Only 100 of 146 total aligned reads displayed.
GATTTGCCGTTGTCGCCAGCGAAGTACGGACACTCGCAAGTCGCAGCGCTCAGGCGGCGAAAGAGATTGAAGGCTTGATCAGTGAATCAGTCAGGTTAATTGACCTGGGGTCGGATGAGGTGGCAACGGCCGGGAAAACCATGAGCACTATTGTTGATGCCGTCGCGAGTGTCACACATATCATGCAGGAAATCGCC > NC_000913/1493677‑1493873 | gATTTGCCGTTGTCGCCAGCGAAGTACGGACACTCGCAAGTCGCAGCGCTCAGGCGGCGAAAGAGATTGAAGGCTTGATCAGTGAATCAGTCAGGTTAAt > 2:2623141/1‑100 (MQ=255)gATTTGCCGTTGTCGCCAGCGAAGTACGGACACTCGCAAGTCGCAGCGCTCAGGCGGCGAAAGAGATTGAAGGCTTGATCAGTGAATCAGTCAGGTTAAt > 1:3697154/1‑100 (MQ=255) aTTTGCCGTTGTCGCCAGCGAAGTACGGACACTCGCAAGTCGCAGCGCTCAGGCGGCGAAAGAGATTGAAGGCTTGATCAGTGGATCAGTCAGGTTAAtt < 2:936178/100‑1 (MQ=255) tttGCCGTTGTCGCCAGCGAAGTACGGACACTCGCAAGTCGCAGCGCTCAGGCGGCGAAAGAGATTGAAGGCTTGATCAGTGAATCAGTCAGGTTGATTg < 1:3617211/100‑1 (MQ=255) ttGCCGTTGTCGCCAGCGAAGTACGGACACTCGCAAGTCGCAGCGCTCAGGCGGCGAAAGAGATTGAAGGCTTGATCAGTGAATCAGTCAGGTTAATTGa < 2:2108297/100‑1 (MQ=255) tGCCGTTGTCGCCAGCGAAGTACGGACACTCGCAAGTCGCAGCGCTCAGGCGGCGAAAGAGATTGAAGGCTTGATCAGTGAATCAGTCAGGTTAATTGAc > 2:2380093/1‑100 (MQ=255) gCCGTTGTCGCCAGCGAAGTACGGACACTCGCAAGTCGCAGCGCTCAGGCGGCGAAAGAGATTGAAGGCTTGATCAGTGAATCAGTCAGGTTAATTGAcc > 1:2647720/1‑100 (MQ=255) gCCGTTGTCGCCAGCGAAGTACGGACACTCGCAAGTCGCAGCGCTCAGGCGGCGAAAGAGATTGAAGGCTTGATCAGTGAATCAGTCAGGTTAATTGAcc < 2:2247296/100‑1 (MQ=255) ccGCTGTCGCCAGCGAATTACGGACACTCGCAAGTCGCAGCGCTCAGGCGGCGAAAGAGATTGAAGGCTTGATCAGTGAATCACTCAGGTTAATTGAcc < 2:563626/99‑1 (MQ=255) cGTTGTCGCCAGGGAAGTAAGGACTCTCGGAAGTCGCAGCGTTCAGGCTGCGAATGAGATTGAAGGCTTGATCAGTGAATCAGTCAGGTTGATTGAcc < 2:3500427/98‑1 (MQ=255) cGTTGTCGCCAGCGAAGTACGGACACTCGCAAGTCGCAGCGCTCAGGCGGCGAAAGAGATTGAAGGCTTGATCAGTGAATCAGTCAGGTTGATTGACCTg > 2:31285/1‑100 (MQ=255) gTTGTCGCCAGCGAAGTACGGACACTCGCAAGTCGCAGCGCTCAGGCGGCGAAAGAGATTGAAGGCTTGATCAGTGAATCAGTCAGGTTAATTGACCTgg < 1:337646/100‑1 (MQ=255) gTTGTCGCCAGCGAAGTACGGACACTCGCAAGTCGCAGCGCTCAGGCGGCGAAAGAGATTGAAGGCTTGATCAGTGAATCAGTCAGGTTAATTGACCTgg > 2:2603429/1‑100 (MQ=255) gTTGTCGCCAGCGAAGTACGGACACTCGCAAGTCGCAGCGCTCAGGCGGCGAAAGAGATTGAAGGCTTGATCAGTGAATCAGTCAGGTTAATTGACCTgg < 1:3860378/100‑1 (MQ=255) tGTCGCCAGCGAAGTACGGACACTCGCAAGTCGCAGCGCTCAGGCGGCGAAAGAGATTGAAGGCTTGATCAGTGAATCAGTCAGGTCAATTAACCTgact < 1:3559279/100‑4 (MQ=255) gTCGCCAGCGAAGTACGGACACTCGCAAGTCGCAGCGCTCAGGCGGCGAAAGAGATTGAAGGCTTGATCAGTGAGTCAGTCAGGTTAATTGACCTGGGGt > 2:184929/1‑100 (MQ=255) gTCGCCAGCGAAGTACGGACACTCGCAAGTCGCAGCGCTCAGGCGGCGAAAGAGATTGAAGGCTTGATCAGTGAATCAGTCAGGTTGATTGACCTGGGGt < 1:3906578/100‑1 (MQ=255) gTCGCCAGCGAAGTACGGACACTCGCAAGTCGCAGCGCTCAGGCGGCGAAAGAGATTGAAGGCTTGATCAGTGAATCAGTCAGGTTAATTGACCTGGGGt > 1:3160645/1‑100 (MQ=255) tCGCCAGCGAAGTACGGACACTCGCAAGTCGCAGCGCTCAGGCGGCGAAAGAGATTGAAGGCTTGATCAGTGAATCAGTCAGGTTAATTGACCTGGGGTc > 2:3255482/1‑100 (MQ=255) aGCGAAGTACGGACACTCGCAAGTCGCAGCGCTCAGGCGGCGAAAGAGATTGAAGGCTTGATCCGTGAATCAGTCAGGTTAATTGACCTGGGGTCGGATg < 1:2916193/100‑1 (MQ=255) gCGAAGTACGGACACTCGCAAGTCGCAGCGCTCAGGCGGCGAAAGAGATTGAAGGCTTGATCAGTGAATCAGTCAGGTTGATTGACCTGGGGTCGGATGa > 2:3346335/1‑100 (MQ=255) gAAGTACGGACACTCGCAAGTCGCAGCGCTCAGGCGGCGAAAGAGATTGAAGGCTTGATCAGTGAATCAGTCAGGTTAATTGACCTGGGGTCGGATGAgg < 1:770763/100‑1 (MQ=255) aaGTACGGACACTCGCAAGTCGCAGCGCTCAGGCGGCGAAAGAGATTGAAGGCTTGATCAGTGAATCAGTCAGGTTGATTGACCTGGGGTCGGATGAGGt < 1:3445181/100‑1 (MQ=255) aaGTACGGACACTCGCAAGTCGCAGCGCTCAGGCGGCGAAAGAGATTGAAGGCTTGATCAGTGAATCAGTCAGGTTAATTGACCTGGGGTCGGATGAGGt < 1:85578/100‑1 (MQ=255) aGTACGGACACTCGCAAGTCGCAGCGCTCAGGCGGCGAAAGAGATTGAAGGCTTGATCAGTGAATCAGTCAGGTTGATTGACCTGGGGTCGGATGAGGTg < 1:4034644/100‑1 (MQ=255) aGTACGGACACTCGCAAGTCGCAGCGCTCAGGCGGCGAAAGAGATTGAAGGCTTGATCAGTGAATCAGTCAGGTTAATTGACCTGGGGTCGGATGAGGTg < 1:969259/100‑1 (MQ=255) gTACGGACACTCGCAAGTCGCAGCGCTCAGGCGGCGAAAGAGATTGAAGGCTTGATCAGTGAATCAGTCAGGTTGATTGACCTGGGGTCGGATGAGGTgg < 1:3686600/100‑1 (MQ=255) gTACGGACACTCGCAAGTCGCAGCGCTCAGGCGGCGAAAGAGATTGAAGGCTTGATCAGTGAATCAGTCAGGTTGATTGACCTGGGGTCGGATGAGGTgg < 1:1985579/100‑1 (MQ=255) tACGGACACTCGCAAGTCGCAGCGCTCAGGCGGCGAAAGAGATTGAAGGCTTGATCAGTGAATCAGTCAGGTTGATTGACCTGGGGTCGGATGAGGTGGc < 2:3543797/100‑1 (MQ=255) tACGGACACTCGCAAGTCGCAGCGCTCAGGCGGCGAAAGAGATTGAAGGCTTGATCAGTGAATCAGTCAGGTTAATTGACCTGGGGTCGGATGAGGTGGc < 2:2326947/100‑1 (MQ=255) aCGGACACTCGCAAGTCGCAGCGCTCAGGCGGCGAAAGAGATTGAAGGCTTGATCAGTGAATCAGTCAGGTTAATTGACCTGGGGTCGGATGAGGTGGc < 2:3921696/99‑1 (MQ=255) aCGGACACTCGCAAGTCGCAGCGCTCAGGCGGCGAAAGAGATTGAAGGCTTGATCAGTGAATCAGTCAGGTTAATTGACCTGGGGTCGGATGAGGTGGCa > 1:1592621/1‑100 (MQ=255) ggACACTCGCAAGTCGCAGCGCTCAGGCGGCGAAAGAGATTGAAGGCTTGATCAGTGAATCAGTCAGGTTAATTGACCTGGGGTCGGATGAGGTGGCAAc > 1:3070048/1‑100 (MQ=255) ggACACTCGCAAGTCGCAGCGCTCAGGCGGCGAAAGAGATTGAAGGCTTGATCAGTGAATCAGTCAGGTTAATTGACCTGGGGTCGGATGAGGTGGCAAc < 1:1886899/100‑1 (MQ=255) gACACTCGCAAGTCGCAGCGCTCAGGCGGCGAAAGAGATTGAAGGCTTGATCAGTGAATCAGTCAGGTTGATTGACCTGGGGTCGGATGAGGTGGCAAc > 1:619610/1‑99 (MQ=255) gACACTCGCAAGTCGCAGCGCTCAGGCGGCGAAAGAGATTGAAGGCTTGATCAGTGAATCAGTCAGGTTAATTGACCTGGGGTCGGATGAGGTGGCAACg > 1:2951409/1‑100 (MQ=255) cacTCGCAAGTCGCAGCGCTCAGGCGGCGAAAGAGATTGAAGGCTTGATCAGTGAATCAGTCAGGTTAATTGACCTGGGGTCGGATGAGGTGGCAACGGc < 2:3070029/100‑1 (MQ=255) acTCGCAAGTCGCAGCGCTCAGGCGGCGAAAGAGATTGAAGGCTTGATCAGTGAATCAGTCAGGTTAATTGACCTGGGGTCGGATGAGGTGGCAACGGcc < 2:1798801/100‑1 (MQ=255) cTCGCAAGTCGCAGCGCTCAGGCGGCGAAAGAGATTGAAGGCTTGATCAGTGAATCAGTCAGGTTAATTGACCTGGGGTCGGATGAGGTGGCAACGGCCg > 2:1877847/1‑100 (MQ=255) tCGCAAGTCGCAGCGCTCAGTCGGCGAAAGAGATTGAAGGCTTGATCAGTGAATCAGTCAGGGTAATTGACCTGGGGTCGGATGAGGTGGCAACGGCCgg > 2:1374434/1‑100 (MQ=255) cGCAAGTCGCAGCGCTCAGGCGGCGAAAGAGATTGAAGGCTTGATCAGTGAATCAGTCAGGTTGATTGACCTGGGGTCGGATGAGGTGGCAACGGCCggg < 1:886836/100‑1 (MQ=255) cGCAAGTCGCAGCGCTCAGGCGGCGAAAGAGATTGAAGGCTTGATCAGTGAATCAGTCAGGTTAATTGACCTGGGGTCGGATGAGGTGGCAACGGCCggg < 1:10990/100‑1 (MQ=255) cGCAAGTCGCAGCGCTCAGGCGGCGAAAGAGATTGAAGGCTTGATCAGTGAATCAGTCAGGTTAATTGACCTGGGGTCGGATGAGGTGGCAACGGCCggg < 1:2926321/100‑1 (MQ=255) gCAAGTCGCAGCGCTCAGGAAGCGAGAGTGTTTGAAGGCTGGATAAGTGAATCAGTCAGGTTAATTTACCTGGGGTCGGATAAGGTGGCAACGGCCggg < 2:2797749/99‑1 (MQ=255) cGCAGCGCTCAGGCGGCGAAAGAGATTGAAGGCTTGATCAGTGAATCAGTCAGGTTAATTGACCTGGGGTCGGATGAGGTGGCAACGGCCGGGAAAACCa > 1:3986613/1‑100 (MQ=255) cGCAGCGCTCAGGCGGCGAAAGAGATTGAAGGCTTGATCAGTGAATCAGTCAGGTTAATTGACCTGGGGTCGGATGAGGTGGCAACGGCCGGGAAAACCa < 1:788359/100‑1 (MQ=255) gCAGCGCTCAGGCGGCGAAAGAGATTGAAGGCTTGATCAGTGAATCAGTCAGGTTGATTGACCTGGGGTCGGATGAGGTGGCAACGGCCGGGAAAACCAt > 1:230588/1‑100 (MQ=255) aGCGCTCAGGCGGCGAAAGAGATTGAAGGCTTGATCAGTGAATCAGTCAGGTTGATTGACCTGGGGTCGGATGAGGTGGCAACGGCCGGGAAAACCATGa < 2:345962/100‑1 (MQ=255) cgcTCAGGCGGCGAAAGAGATTGAAGGCTTGATCAGTGAATCAGTCAGGTTGATTGACCTGGGGTCGGATGAGGTGGCAACGGCCGGGAAAACCATGAGc < 1:960552/100‑1 (MQ=255) cgcTCAGGCGGCGAAAGAGATTGAAGGCTTGATCAGTGAATCAGTCAGGTTGATTGACCTGGGGTCGGATGAGGTGGCAACGGCCGGGAAAACCATGAGc < 1:1534239/100‑1 (MQ=255) cgcTCAGGCGGCGAAAGAGATTGAAGGCTTGATCAGTGAATCAGTCAGGTTAATTGACCTGGGGTCGGATGAGGTGGCAACGGCCGGGAAAACCATGAGc < 2:3127730/100‑1 (MQ=255) gcTGAGGCGGCGAAAGAGATTGAAGGCTTGATCAGTGAATCAGTCAGGTTGATTGACCTGGGGTCGGATGAGGTGGCAACGGCCGGGAAAACCATg < 2:3843285/96‑1 (MQ=255) cAGGCGGCGAAAGAGATTGAAGGCTTGATCAGTGAATCAGTCAGGTTGATTGACCTGGGGTCGGATGAGGTGGCAACGGCCGGGAAAACCATGAGCACTa > 1:2712660/1‑100 (MQ=255) cAGGCGGCGAAAGAGATTGAAGGCTTGATCAGTGAATCAGTCAGGTTAATTGACCTGGGGTCGGATGAGGTGGCAACGGCCGGGAAAACCATGAGCACTa > 2:643411/1‑100 (MQ=255) ggcggcGAAAGAGATTGAAGGCTTGATCAGTGAATCAGTCAGGTTAATTGACCTGGGGTCGGATGAGGTGGCAACGGCCGGGAAAACCATGAGCACTAtt > 1:864080/1‑100 (MQ=255) ggcggcGAAAGAGATTGAAGGCTTGATCAGTGAATCAGTCAGGTTAATTGACCTGGGGTCGGATGAGGTGGCAACGGCCGGGAAAACCATGAGCACTAtt > 1:3357552/1‑100 (MQ=255) gcggcgAAAGAGATTGAAGGCTTGATCAGTGAATCAGTCAGGTTAATTGACCTGGGGTCGGATGAGGTGGCAACGGCCGGGAAAACCATGAGCACTAttg > 2:521260/1‑100 (MQ=255) gcgAAAGAGATTGAAGGCTTGATCAGTGAATCAGTCAGGTTGATTGACCTGGGGTCGGATGAGGTGGCAACGGCCGGGAAAACCATGAGCACTAttgttg < 1:1183102/100‑1 (MQ=255) gAAAGAGATTGAAGGCTTGATCAGTGAATCAGTCAGGTTAATTGACCTGGGGTCGGATGAGGTGGCAACGGCCCGGAAAACCATGAGCACTATTGTTGAt < 1:2518518/100‑1 (MQ=255) aaaGAGATTGAAGGCTTGATCAGTGAATCAGTCAGGTTAATTGACCTGGGGTCGGATGAGGTGGCAACGGCCGGGAAAACCATGAGCACTATTGTTGATg < 2:908253/100‑1 (MQ=255) aaaGAGATTGAAGGCTTGATCAGTGAATCAGTCAGGTTAATTGACCTGGGGTCGGATGAGGTGGCAACGGCCGGGAAAACCATGAGCACTATTGTTGATg < 1:1700557/100‑1 (MQ=255) aaGAGATTGAAGGCTTGATCAGTGAATCAGTCAAGTTAATTGACCTGGGGTCGGATGAGGTGGCAACGGCCGGGAAAACCATGAGCACTATTGTTGATGc > 2:2479448/1‑100 (MQ=255) agagATTGAAGGCTTGATCAGTGAATCAGTCAGGTTAATTGACCTGGGGTCGGATGAGGTGGCAACGGCCGGGAAAACCATGAGCACTATTGTTGATGcc < 1:2476195/100‑1 (MQ=255) agaTTGAAGGCTTGATCAGTGAATCAGTCAGGTTGATTGACCTGGGGTCGGATGAGGTGGCAACGGCCGGGAAAACCATGAGCACTATTGTTGATGCCGt > 2:1273584/1‑100 (MQ=255) ttGAAGGCTTGATCAGTGAATCAGTCAGGTTGATTGACCTGGGGTCGGATGAGGTGGCAACGGCCGGGAAAACCATGAGCACTATTGTTGATGCCGTcgc > 1:1698770/1‑100 (MQ=255) ttGAAGGCTTGATCAGTGAATCAGTCAGGTTAATTGACCTGGGGTCGGATGAGGTGGCAACGGCCGGGAAAACCATGAGCACTATTGTTGATGCCGTcgc < 1:442807/100‑1 (MQ=255) tGAAGGCTTGATCAGTGAATCAGTCAGGTTAATTGACCTGGGGTCGGATGAGGTGGCTACGGCCGGGACAACCATGAGCACTATTGTTGATGCCGTcgtg < 1:2791587/100‑3 (MQ=255) gAAGGCTTGATCAGTGAATCAGTCAGGTTAATTGACCTGGGGTCGGATGAGGTGGCAACGGCCGGGAAAACCATGAGCACTATTGTTGATGCCGTcgc > 2:2694503/1‑98 (MQ=255) gAAGGCTTGATCAGTGAATCAGTCAGGTTAATTGACCTGGGGTCGGATGAGGTGGCAACGGCCGGGAAAACCATGAGCACTATTGTTGATGCCGTCGCGa > 2:2992940/1‑100 (MQ=255) aaGGCTTGATCAGTGAATCAGTCAGGTTAATTGACCTGGGGTCGGATGAGGTGGCAACGGCCGGGAAAACCATGAGCACTATTGTTGATGCCGTCGCGAg < 1:2706501/100‑1 (MQ=255) aGGCTTGATCAGTGAATCAGTCAGGTTAATTGACCAGGGGTGGGATGAGGTGGCAACGGCCGGGAAAACCATGGGCACTATTGTTGATGCCGTCGCGAg > 1:2079487/1‑99 (MQ=255) cTTGATCAGTGAATCAGTCAGGTTAATTGACCTGGGGTCGGATGAGGTGGCAACGGCCGGGAAAACCATGAGCACTATTGTTGATGCCGTCGCGAGTGTc < 1:3690199/100‑1 (MQ=255) ttGATCAGTGAATCAGTCAGGTTAATTGACCTGGGGTCGGATGAGGTGGCAACGGCCGGGAAAACCATGAGCACTATTGTTGATGCCGTCGCGAGTGTca < 2:3197358/100‑1 (MQ=255) gATCAGTGAATCAGTCAGGTTAATTGACCTGGGGTCGGATGAGGTGGCAACGGCCGGGAAAACCATGAGCACTATTGTTGATGCCGTCGCGAGTGTcaca > 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gAATCAGTCAGGTTGATTGACCTGGGGTCGGATGAGGTGGCAACGGCCGGGAAAACCATGAGCACTATTGTTGATGCCGTCGCGAGTGTCACACATATCa < 2:2439895/100‑1 (MQ=255) aaTCAGTCAGGTTGATTGACCTGGGGTCGGATGAGGTGGCAACGGCCGGGAAAACCATGAGCACTATTGTTGATGCCGTCGCGAGTGTCACACATATCAt > 1:2616758/1‑100 (MQ=255) aaTCAGTCAGGTTAATTGACCTGGGGTCGGATGAGGTGGCAACGGCCGGGAAAACCATGAGCACTATTGTTGATGCCGTCGCGAGTGTCACACATATCAt > 1:2350773/1‑100 (MQ=255) aaTCAGTCAGGTTAAGTGGACTGGGGTCGGATGAGGTGGCAACGGGCGGGAAAACCATGAGCACTATTGTTGATGCCGTCGCGAGTGTCACACATATcgt < 2:670670/100‑3 (MQ=255) aTCAGTCAGGTTGATTGACCTGGGGTCGGATGAGGTGGCAACGGCCGGGAAAACCATGAGCACTATTGTTGATGCCGTCGCGAGTGTCACACATATCATg > 1:3434644/1‑100 (MQ=255) cagtcagGTTGATTGACCTGGGGTCGGATGAGGTGGCAACGGCCGGGAAAACCATGAGCACTATTGTTGATGCCGTCGCGAGTGTCACACATATCATGc < 2:3182136/99‑1 (MQ=255) cagtcagGTTAATTGACCTGGGGTCGGATGAGGTGGCAACGGCCGGGAAAACCATGAGCACTATTGTTGATGCCGTCGCGAGTGTCACACATATCATGCa < 1:3400746/100‑1 (MQ=255) agtcagGTTAATTGACCTGGGGTCGGATGAGGTGGCAACGGCCGGGAAAACCATGAGCACTATTGTTGATGCCGTCGCGAGTGTCACACATATCATGCAg < 1:633693/100‑1 (MQ=255) agtcagGTTAATTGACCTGGGGTCGGATGAGGTGGCAACGGCCGGGAAAACCATGAGCACTATTGTTGATGCCGTCGCGAGTGTCACACATATCATGCAg > 2:1389971/1‑100 (MQ=255) agtcagGTTAATTGACCTGGGGTCGGATGAGGTGGCAACGGCCGGGAAAACCATGAGCACTATTGTTGATGCCGTCGCGAGTGTCACACATATCATGCAg < 2:2306534/100‑1 (MQ=255) gtcagGTTGATTGACCTGGGGTCGGATGAGGTGGCAACGGCCGGGAAAACCATGAGCACTATTGTTGATGCCGTCGCGAGTGTCACACATATCATGCAgg < 1:214683/100‑1 (MQ=255) gtcagGTTAATTGACCTGGGGTCGGATGAGGTGGCAACGGCCGGGAAAACCATGAGCACTATTGTTGATGCCGTCGCGAGTGTCACACATATCATGCAgg < 2:23818/100‑1 (MQ=255) gtcagGTTAATTGACCTGGGGTCGGATGAGGTGGCAACGGCCGGGAAAACCATGAGCACTATTGTTGATGCCGTCGCGAGTGTCACACATATCATGCAgg > 1:219989/1‑100 (MQ=255) tcagGTTAATTGACCTGGGGTCGGATGAGGTGGCAACGGCCGGGAAAACCATGAGCACTATTGTTGATGCCGTCGCGAGTGTCACACATATCATGCAGGa < 2:2920658/100‑1 (MQ=255) agGTTAATTGACCTGGGGTCGGATGAGGTGGCAACGGCCGGGAAAACCATGAGCACTATTGTTGATGCCGTCGCGAGTGTCACACATATCATGCAGGaaa < 1:1600243/100‑1 (MQ=255) ggTTGATTGACCTGGGGTCGGATGAGGTGGCAACGGCCGGGAAAACCATGAGCACTATTGTTGATGCCGTCGCGAGTGTCACACATATCATGCAGGAAAt < 2:1611290/100‑1 (MQ=255) ttAATTGACCTGGGGTCGGATGAGGTGGCAACGGCCGGGAAAACCATGAGCACTATTGTTGATGCCGTCGCGAGTGTCACACATATCATGCAGGAAATcg < 2:797587/100‑1 (MQ=255) aaTTGACCTGGGGTCGGATGAGGTGGCAACGGCCGGGAAAACCATGAGCACTATTGTTGATGCCGTCGCGAGTGTCACACATATCATGCAGGAAATcgcc < 1:164024/100‑1 (MQ=255) aaTTGACCTGGGGTCGGATGAGGTGGCAACGGCCGGGAAAACCATGAGCACTATTGTTGATGCCGTCGCGAGTGTCACACATATCATGCAGGAAATcgc > 2:270446/1‑99 (MQ=255) | GATTTGCCGTTGTCGCCAGCGAAGTACGGACACTCGCAAGTCGCAGCGCTCAGGCGGCGAAAGAGATTGAAGGCTTGATCAGTGAATCAGTCAGGTTAATTGACCTGGGGTCGGATGAGGTGGCAACGGCCGGGAAAACCATGAGCACTATTGTTGATGCCGTCGCGAGTGTCACACATATCATGCAGGAAATCGCC > NC_000913/1493677‑1493873 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |