Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 2,044,638 | C→A | 64.3% | intergenic (+14/‑300) | asnT → / → yeeJ | tRNA‑Asn/putative adhesin |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 2,044,638 | 0 | C | A | 64.3% | 97.0 / 121.3 | 109 | intergenic (+14/‑300) | asnT/yeeJ | tRNA‑Asn/putative adhesin |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (24/15); new base A (30/40); total (54/55) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.38e-02 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.19e-01 |
Only 100 of 111 total aligned reads displayed.
ACACGATTCCTCTGTAGTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCTAAAAATTCGCTTTTTTAGCGCAATGTCACTGACCTTAGTTGAACATTGTTTTTTAACGGATAGCGGGTTTTTAACATCTTAAGCGCCCTCGACCTTTATGGTTGAGG > NC_000913/2044542‑2044737 | acacGATTCCTCTGTAGTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCTAAAAATTCGCt > 2:2046288/1‑100 (MQ=40) cacGATTCCTCTGTAGTTCAGTCAGTAGAATGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGCGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCTAAAAATTAGCt > 2:3672553/1‑99 (MQ=11) acGATTCCTCTGTAGTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCTAAAAATTCGCttt > 2:316845/1‑100 (MQ=255) cGATTCCTCTGTAGTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCTAAAAATTCGCtttt < 1:3195487/100‑1 (MQ=255) gATTCCTCTGTAGTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCTAAAAATTCGCtttt < 2:3849406/99‑1 (MQ=255) aTTCCTCTGTAGTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCTAAAAATTAGCtttttt < 1:161840/100‑1 (MQ=255) ccTCTGTAGTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCTAAAAATTCGCTTTTTTAgc < 2:464292/100‑1 (MQ=255) ctctGTAGTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCTAAAAATTCGCTTTTTTAgcg < 2:2082673/100‑1 (MQ=255) ctctGTAGTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCTAAAAATTAGCTTTTTTAgcg > 1:850975/1‑100 (MQ=255) ctctGTAGTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCTAAAAATTAGCTTTTTTAgcg < 2:3006244/100‑1 (MQ=255) tctGAAGTTCAGTCGGTAGAACGGCGTACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTTAGAGGAGCCAAAATCTAAAAATTCGCTTTTTTAgcg < 2:1712151/99‑1 (MQ=17) ctGTAGTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCTAAAAATTCGCTTTTTTAGCGCa > 1:1115503/1‑100 (MQ=255) gTAGTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCTAAAAATTCGCTTTTTTAGCGCAAt > 1:3902237/1‑100 (MQ=255) gTAGTTCAGTAGGTAGAACGGCGGAGTGTTAATCCGTATGTTACTGGTTTGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCTAAAAATTAGCTTTTTTAGCGCAAt < 2:4079225/100‑1 (MQ=17) aGTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTAAGAGGAGCCAAATTCTAAAAATTAGCTTTTTTAGCGCAATGt > 2:2893627/1‑100 (MQ=255) gctCAGTCGGTAGAACGGCTGACTGTTAATCCGTGTGTCACTGTTTTGAGTGCAGTCCGAGGAGCCAAATTCTACAAATTAGCTTTTGTAGCGCTATGTc > 2:2466005/3‑100 (MQ=17) gTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCTAAAAATTAGCTTTTTTAGCGCAATGTc < 1:2159634/100‑1 (MQ=255) cAGACGCTAGAACGGCGAATTATGAATCCGTATGACTCTGGTCCGTGTCTTGTAAGAGGAGCCAAATTCGAAAAATTCGCTTTCTTTGCTCAATGTCACt > 2:1213678/1‑100 (MQ=12) aGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCTAAAAATTAGCTTTTTTAGCGCAATGTCACTg < 2:923731/100‑1 (MQ=255) gTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTCTGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCTAAAAATTCGCGTTTTTAGCGCAATGTCACTg > 2:3524354/1‑99 (MQ=255) tCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCTAAAAATTAGCTTTTTTAGCGCAATGTCACTGAc < 1:1020289/100‑1 (MQ=255) gTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCTAAAAATTCGCTTTTTTAGCGCAATGTCACTGACCtt < 1:3715222/100‑1 (MQ=255) gTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCTAAAAATTCGCTTTTTTAGCGCAATGTCACTGACCtt > 1:3044856/1‑100 (MQ=255) gTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCTAAAAATTAGCTTTTTTAGCGCAATGTCACTGACCtt < 1:3252825/100‑1 (MQ=255) aGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCTAAAAATTAGCTTTTTTAGCGCAATGTCACTGACCTTAg < 2:963413/100‑1 (MQ=255) gAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCTAAAAATTAGCTTTTTTAGCGCAATGTCACTGACCTTAGt > 1:3636124/1‑100 (MQ=255) aaCGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCTAAAAATTAGCTTTTTTAGCGCAATGTCACTGACCTTAGtt > 1:68311/1‑100 (MQ=255) aaCGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCTAAAAATTAGCTTTTTTAGCGCAATGTCACTGACCTTAGtt < 1:3573642/100‑1 (MQ=255) aaCGGCCGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCTAAAAATTCGCTTTTTTAGCGCAATGTCACTGACCTTAGtt < 2:2569291/100‑1 (MQ=255) ggcggACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCTAAAAATTAGCTTTTTTAGCGCAATGTCACTGACCTTAGTTGaa < 2:19080/100‑1 (MQ=255) gcggACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCTAAAAATTCGCTTTTTTAGCGCAATGTCACTGACCTTAGTTGAAc > 1:3791167/1‑100 (MQ=255) gcggACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCTAAAAATTAGCTTTTTTAGCGCAATGTCACTGACCTTAGTTGAAc > 1:241695/1‑100 (MQ=255) ggACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCTAAAAATTAGCTTTTTTAGCGCAATGTCACTGACCTTAGTTGAACAt > 2:3923618/1‑100 (MQ=255) aCTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCTAAAAATTCGCTTTTTTAGCGCAATGTCACTGACCTTAGTTGAACATTg > 1:2695732/1‑100 (MQ=255) cTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCTAAAAATTAGCTTTTTTAGCGCAATGTCACTGACCTTAGTTGAACATTGt > 2:291860/1‑100 (MQ=255) tGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCTAAAAATTCGCTTTTTTAGCGCAATGTCACTGACCTTAGTTGAACATTGtt > 1:3478155/1‑100 (MQ=255) gTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCTAAAAATTAGCTTTTTTAGCGCAATGTCACTGACCTTAGTTGAACATTGttt > 1:2291987/1‑100 (MQ=255) ttAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCTAAAAATTAGCTTTTTTAGCGCAATGTCACTGACCTTAGTTGAACATTGtttt < 1:24584/100‑1 (MQ=255) tAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCTAAAAATTAGCTTTTTTAGCGCAATGTCACTGACCTTAGTTGAACATTGttttt < 2:3392559/100‑1 (MQ=255) aaTCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCTAAAAATTAGCTTTTTTAGCGCAATGTCACTGACCTTAGTTGAACATTGtttttt < 1:1548194/100‑1 (MQ=255) tCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCTAAAAATTAGCTTTTTTAGCGCAATGTCACTGACCTTAGTTGAACATTGTTTTTTaa < 1:1000363/100‑1 (MQ=255) ccGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCTAAAAATTAGCTTTTTTAGCGCAATGTCACTGACCTTAGTTGAACATTGTTTTTTAAc < 2:1689359/100‑1 (MQ=255) cGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCTAAAAATTAGCTTTTTTAGCGCAATGTCACTGACCTTAGTTGAACATTGTTTTTTAACg < 2:1789758/100‑1 (MQ=255) atatcatttgTTTGAGTCTTGTCAGAGGAGAAAAAAAAAAAAAATTAGCTTTTTTAGCGCAATGTCACTGACCTTAGTTGAACATTGTTTTTTAACGGa < 2:3806544/90‑1 (MQ=255) aTGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCTAAAAATTCGCTTTTTTAGCGCAATGTCACTGACCTTAGTTGAACATTGTTTTTTAACGGAt < 1:2307367/100‑1 (MQ=255) gTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCTAAAAATTAGCTTTTTTAGCGCAATGTCACTGACCTTAGTTGAACATTGTTTTTTAACGGATAg > 1:1132033/1‑100 (MQ=255) gTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCTAAAAATTAGCTTTTTTAGCGCAATGTCACTGACCTTAGTTGAACATTGTTTTTTAACGGATAg > 2:1468386/1‑100 (MQ=255) gTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCTAAAAATTAGCTTTTTTAGCGCAATGTCACTGACCTTAGTTGAACATTGTTTTTTAACGGATAg > 1:899529/1‑100 (MQ=255) tCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCTAAAAATTAGCTTTTTTAGCGCAATGTCACTGACCTTAGTTGAACATTGTTTTTTAACGGATAGc < 2:3770379/100‑1 (MQ=255) cACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCTAAAAATTCGCTTTTTTAGCGCAATGTCACTGACCTTAGTTGAACATTGTTTTTTAACGGATAGCg > 2:1006966/1‑100 (MQ=255) cACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCTAAAAATTAGCTTTTTTAGCGCAATGTCACTGACCTTAGTTGAACATTGTTTTTTAACGGATAGCg > 2:1301910/1‑100 (MQ=255) cACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCTAAAAATTAGCTTTTTTAGCGCAATGTCACTGACCTTAGTTGAACATTGTTTTTTAACGGATAGCg > 2:3222402/1‑100 (MQ=255) cACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCTAAAAATTAGCTTTTTTAGCGCAATGTCACTGACCTTAGTTGAACATTGTTTTTTAACGGATAGCg < 2:3143449/100‑1 (MQ=255) ggTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCTAAAAATTCGCTTTTTTAGCGCAATGTCACTGACCTTAGTTGAACATTGTTTTTTAACGGATAGCGGGtt > 2:2673600/1‑100 (MQ=255) ggTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCTAAAAATTCGCTTTTTTAGCGCAATGTCACTGACCTTAGTTGAACATTGTTTTTTAACGGATAGCGGGtt > 1:2863170/1‑100 (MQ=255) ggTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCTAAAAATTAGCTTTTTTAGCGCAATGTCACTGACCTTAGTTGAACATTGTTTTTTAACGGATAGCGGGtt > 2:2735345/1‑100 (MQ=255) ggTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCTAAAAATTAGCTTTTTTAGCGCAATGTCACTGACCTTAGTTGAACATTGTTTTTTAACGGATAGCGGGtt > 2:3017978/1‑100 (MQ=255) ggTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCTAAAAATTAGCTTTTTTAGCGCAATGTCACTGACCTTAGTTGAACATTGTTTTTTAACGGATAGCGGGtt > 1:4026363/1‑100 (MQ=255) gTTCGAGTTCAGTCAGAGGAGCCAAATTCTAAAAATTCGCTTTTTTAGCGCAATGTCACTGACCTTAGTTGAACATTGTTTTTTAACGGATAGCGGGttt < 2:3588405/100‑1 (MQ=255) gTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCTAAAAATTCGCTTTTTTAGCGCAATGTCACTGACCTTAGTTGAACATTGTTTTTTAACGGATAGCGGGttt > 1:1718315/1‑100 (MQ=255) ttCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCTAAAAATTCGCTTTTTTAGCGCAATGTCACTGACCTTAGTTGAACATTGTTTTTTAACGGATAGCGGGttt > 2:1547776/1‑99 (MQ=255) ttCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCTAAAAATTCGCTTTTTTAGCGCAATGTCACTGACCTTAGCTGAACATTGTTTTTTAACGGATAGCGGGtttt < 1:3926184/100‑1 (MQ=255) ttCGAGTCCAATCAGAGGAGCCAAATTCTAAAAATTAGCTTTTTTAGCGCAATGTCACTGACCTTAGTTGAACATTGTTTTTTAACGGATAGCGGGtttt < 1:1648371/100‑1 (MQ=255) cGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCTAAAAATTCGCTTTTTTAGCGCAATGTCACTGACCTTAGTTGAACATTGTTTTTTAACGGATAGCGGGTTTTTa < 1:2146228/100‑1 (MQ=255) cGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCTAAAAATTCGCTTTTTTAGCGCAATGTCACTGACCTTAGTTGAACATTGTTTTTTAACGGATAGCGGGTTTTTa > 1:3400230/1‑100 (MQ=255) cGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCTAAAAATTAGCTTTTTTAGCGCAATGTCACTGACCTTAGTTGAACATTGTTTTTTAACGGATAGCGGGTTTTTa > 2:3386673/1‑100 (MQ=255) cGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCTAAAAATTAGCTTTTTTAGCGCAATGTCACTGACCTTAGTTGAACATTGTTTTTTAACGGATAGCGGGTTTTTa < 1:2442021/100‑1 (MQ=255) gAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCTAAAAATTAGCTTTTTTAGCGCAATGTCACTGACCTTAGTTGAACATTGTTTTTTAACGGATAGAGGGttttt > 2:2608242/1‑98 (MQ=255) aGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCTAAAAATTCGCTTTTTTAGCGCAATGTCACTGACCTTAGTTGATCATTGTTTTTTAACGGATAGCGGGTTTTTAAc < 1:3925903/100‑1 (MQ=255) aGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCTAAAAATTCGCTTTTTTAGCGCAATGTCACTGACCTTAGTTGAACATTGTTTTTTAACGGATAGCGGGTTTTTAAc < 2:1111887/100‑1 (MQ=255) aGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCTAAAAATTCGCTTTTTTAGCGCAATGTCACTGACCTTAGTTGAACATTGTTTTTTAACGGATAGCGGGTTTTTAAc > 1:730598/1‑100 (MQ=255) aGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCTAAAAATTCGCTTTTTTAGCGCAATGTCACTGACCTTAGTTGAACATTGTTTTTTAACGGATAGCGGGTTTTTAAc > 1:301407/1‑100 (MQ=255) aGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCTAAAAATTAGCTTTTTTAGCGCAATGTCACTGACCTTAGTTGAACATTGTTTTTTAACGGATAGCGGGTTTTTAAc < 1:411017/100‑1 (MQ=255) aGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCTAAAAATTAGCTTTTTTAGCGCAATGTCACTGACCTTAGTTGAACATTGTTTTTTAACGGATAGCGGGTTTTTAAc < 2:315389/100‑1 (MQ=255) gTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCTAAAAATTCGCTTTTTTAGCGCAATGTCACTGACCTTAGTTGAACATTGTTTTTTAACGGATAGCGGGTTTTTAACa > 2:1405037/1‑100 (MQ=255) gTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCTAAAAATTAGCTTTTTTAGCGCAATGTCACTGACCTTAGTTGAACATTGTTTTTTAACGGATAGCGGGTTTTTAACa > 2:1213179/1‑100 (MQ=255) gTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCTAAAAATTAGCTTTTTTAGCGCAATGTCACTGACCTTAGTTGAACATTGTTTTTTAACGGATAGCGGGTGTTTAAc > 1:1161554/1‑99 (MQ=255) tCCTGTTAGAGCAGCCAAATTCTAAATATTAGCTTTTTTAGCGCAATGTCACTGACCTTAGTTGAACATTGTTTTTTAACGGATAGCGGGTTTTTAAc < 2:3497463/98‑1 (MQ=255) aGTCAGAGGAGCCAAATTCTAAAAATTAGCTTTTTTAGCGCAATGTCACTGACCTTAGTTGAACATTGTTTTTTAACGGATAGCGGGTTTTTAACATCtt > 1:724868/1‑100 (MQ=255) tCAGAGGAGCCAAATTCTAAAAATTAGCTTTTTTAGCGCAATGTCACTGACCTTAGTTGAACATTGTTTTTTAACGGATAGCGGGTTTTTAACATCTTaa < 1:670400/100‑1 (MQ=255) cAGAGGAGCCAAATTCTAAAAATTAGCTTTTTTAGCGCAATGTCACTGACCTTAGTTGAACATTGTTTTTTAACGGATAGCGGGTTTTTAACATCTTAAg < 2:3035006/100‑1 (MQ=255) agagGAGCCAAATTCTAAAAATTAGCTTTTTTAGCGCAATGTCACTGACCTTAGTTGAACATTGTTTTTTAACGGATAGCGGGTTTTTAACATCTTAAgc < 1:2160265/100‑1 (MQ=255) gaggagCCAAATTCTAAAAATTAGCTTTTTTAGCGCAATGTCACTGACCTTAGTTGAACATTGTTTTTTAACGGATAGCGGGTTTTTAACATCTTAAgcg < 1:2893643/100‑1 (MQ=255) gaggagCCAAATTCTAAAAATTAGCTTTTTTAGCGCAATGTCACTGACCTTAGTTGAACATTGTTTTTTAACGGATAGCGGGTTTTTAACATCTTAAgcg < 1:455764/100‑1 (MQ=255) gagCCAAATTCTAAAAATTAGCTTTTTTAGCGCAATGTCACTGACCTTAGTTGAACATTGTTTTTTAACGGATAGCGGGTTTTTAACATCTTAAGCGccn < 2:2599210/100‑2 (MQ=255) agCCAAATTCTAAAAATTCGCTTTTTTAGCGCAATGTCACTGACCTTAGTTGAACATTGTTTTTTAACGGATAGCGGGTTTTTAACATCTTAAGCGCCCt > 1:416210/1‑100 (MQ=255) agCCAAATTCTAAAAATTAGCTTTTTTAGCGCAATGTCACTGACCTTAGTTGAACATTGTTTTTTAACGGATAGCGGGTTTTTAACAGCTTaatttccc > 2:3822696/1‑93 (MQ=255) gCCAAATTCTAAAAATTCGCTTTTTTAGCGCAATGTCACTGACCTTAGTTGAACATTGTTTTTTAACGGATAGCGGGTTTTTAACATCTTAAGCGCCCTc > 1:2768243/1‑100 (MQ=255) ccAAATTCTAAAAATTAGCTTTTTTAGCGCAATGTCACTGACCTTAGTTGAACATTGTTTTTTAACGGATAGCGGGTTTTTAACATCTTAAGCGCCCTCg > 2:1179344/1‑100 (MQ=255) ccAAATTCTAAAAATTAGCTTTTTTAGCGCAATGTCACTGACCTTAGTTGAACATTGTTTTTTAACGGATAGCGGGTTTTTAACATCTTAAGCGCCCTCg < 1:1149165/100‑1 (MQ=255) aaTTCTAAAAATTAGCTTTTTTAGCGCAATGTCACTGACCTTAGTTGAACATTGTTTTTTAACGGATAGCGGGTTTTTAACATCTTAAGCGCCCTCGAcc < 1:2347438/100‑1 (MQ=255) attagaaagaTTAGCTTGTTGAGCGCAGTGGCACTGGCCTTAGTTGAACATTGTTTTTTAACGGATAGCGGGTTTTGAACATCTTAAGCGCCCTCGAcc < 2:3313442/94‑1 (MQ=255) cTAAAAATTAGCTTTTTTAGCGCAATGTCACTGACATTAGTTGAAAATTGTTTTATAACGGATAGCGGGTTTTTAACATCTTAAGCGCCCTCGACCTTTa > 1:957929/1‑100 (MQ=255) tAAAAATTAGCTTTTTTAGCGCAATGTCACTGGCCTTAGTTGAACATTGTTTTTTAACGGATAGCGGGTTTTTAACATCTTAAGCGCCCTCGACCTTTAt < 2:1100408/100‑1 (MQ=255) tAAAAATTAGCTTTTTTAGCGCAATGTCACTGACCTTAGTTGAACATTGTTTTTTAACGGATAGCGGGTTTTTAACATCTTAAGCGCCCTCGACCTTTAt > 1:775406/1‑100 (MQ=255) aaaaTTAGCTTTTTTAGCGCAATGTCACTGACCTTAGTTGAACATTGTTTTTTAACGGATAGCGGGTTTTTAACATCTTAAGCGCCCTCGACCTTTATgg < 1:2490203/100‑1 (MQ=255) aaTTCGCTTTTTTAGCGCAATGTCACTGACCTTAGTTGAACATTGTTTTTTAACGGATAGCGGGTTTTTAACATCTTAAGCGCCCTCGACCTTTATGGtt < 2:691354/100‑1 (MQ=255) aaTTAGCTTTTTTAGCGCAATGTCACTGACCTTAGTTGAACATTGTTTTTTAACGGATAGCGAGTTTTTAACATCTTAAGCGCCCTCGACCTTTATGGt < 2:821542/99‑1 (MQ=255) cGCTTTTTTAGCGCAATGTCACTGACCTTGGTGGACCATTGCTTTGTAACGGATAACGGGTTTTTCAACTCTTAGACGCCCTCGACCTTTATGGTTGAgg > 2:2766255/1‑100 (MQ=255) cGCTTTTTTAGCGCAATGTCACTGACCTTAGTTGAACATTGTTTTTTAACGGATAGCGGGTTTTTAACATCTTAAGCGCCCTCGACCTTTATGGTTGAgg > 2:1820937/1‑100 (MQ=255) | ACACGATTCCTCTGTAGTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCTAAAAATTCGCTTTTTTAGCGCAATGTCACTGACCTTAGTTGAACATTGTTTTTTAACGGATAGCGGGTTTTTAACATCTTAAGCGCCCTCGACCTTTATGGTTGAGG > NC_000913/2044542‑2044737 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |