| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,161,946 | A→G | 26.4% | A161A (GCA→GCG) | iceT → | putative citrate/iron‑citrate/zinc‑citrate efflux transporter |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,161,946 | 0 | A | G | 26.4% | 209.1 / 89.4 | 140 | A161A (GCA→GCG) | iceT | putative citrate/iron‑citrate/zinc‑citrate efflux transporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (55/47); new base G (14/23); total (69/71) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.25e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.17e-01 | |||||||||||
Only 100 of 144 total aligned reads displayed.
GCGCGAGCAATATATGGCGGCGATGACCTTTGTCACGTTACCCGGTCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCATCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCTGTTAATGCCGAACTACACCATGCAGACGCGGCGC > NC_000913/2161847‑2162045 | gcgcgAGCAATATATGGCGGCGATGACCTTTGTCACGTTACCCGGTCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCa < 2:99361/100‑1 (MQ=255) cgAGCAATATATGGCGGCGATGACCTTTGTCACGTTACCCGGTCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCATCg > 1:4082845/1‑100 (MQ=255) gAGCAATATATGGCGGCGATGACCTTTGTCACGTTACCCGGTCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGcgtcgt > 2:3652264/1‑100 (MQ=255) aGCAATATATGGCGGCGATGACCTTTGTCACGTTACCCGGTCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCATCGTg > 2:734431/1‑100 (MQ=255) cgatgtatGGCGGCGATGACCGTTGTCACGTTACCCGTTCAGGTCGGTCCGGTGCTCGGTCCGGCGCGCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCATCGTGGc < 2:2883339/95‑1 (MQ=255) atatatGGCGGCGATGACCTTTGTCACGTTACCCGGTCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCATCGTGGCAc < 1:3074074/100‑1 (MQ=255) tatatGGCGGCGATGACCTTTGTCGCGTTACCCGGTCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCATCGTGGCACt < 2:3098588/100‑1 (MQ=255) tatatGGCGGCGATGACCTTTGTCACGTTACCCGGTCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTTCGGCGCTCGGTGGTCTGCTGGTGGAGTATGCATCGTGGCatt < 1:2789981/100‑3 (MQ=255) tatatGGCGGCGATGACCTTTGTCACGTTACCCGGTCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACt > 2:3908042/1‑100 (MQ=255) tatatGGCGGCGATGACCTTTGTCACGTTACCCGGTCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCATCGTGGCACt < 1:1268961/100‑1 (MQ=255) agatGGCGGGGGTGGCCTGTGCCTCGTTGCCAGGGCGGGGCGGTGCGCGGCTCGGCCCGGCGCTCGACAGTCTGATGTTGGAGTACGCATCGTGGCAc < 2:2348791/96‑1 (MQ=255) ggcggcGATGACCTTTGTCACGTTACCCGGTCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCATCGTGGCACTGGATc < 1:3777377/100‑1 (MQ=255) gcgATGACCTTTGTCACGTTCCCCGGTCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCtttt < 2:860926/100‑1 (MQ=255) gcgATGACCTTTGTCACGTTACCCGGTCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGGGTACGCATCGTGGCACTGGATCtttt < 2:37104/100‑1 (MQ=255) gcgATGACCTTTGTCACGTTACCCGGTCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCtttt < 2:1665294/100‑1 (MQ=255) cgATGACCTTTGTCACGTTACCCGGTCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCttttt < 1:2498551/100‑1 (MQ=255) cgATGACCTTTGTCACGTTACCCGGTCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCttttt < 1:2794468/100‑1 (MQ=255) cgATGACCTTTGTCACGTTACCCGGTCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCATCGTGGCACTGGATCttttt < 1:101494/100‑1 (MQ=255) cgATGACCTTTGTCACGTTACCCGGTCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCATCGTGGCACTGGATCttttt < 1:2398900/100‑1 (MQ=255) cgATGACCTTTGTCACGTTACCCGGGCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCATCGTGGCACTGGATCttttt > 1:1854793/1‑100 (MQ=255) ccaTGGCCTTTGTCACGTTCTCTGGTTAGTTCGGTCCGCTGCGCGGTCCGGGGCTCGGCCGTCTGCTGGTGGTTTACGCATCGTGGCACTGGATCttttt < 2:354850/98‑1 (MQ=255) gATGACCTTTGTCACGTTACCCGGTCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCATCGTGGCACTGGATCTTTTTg < 2:2626509/100‑1 (MQ=255) aCCTTTGTCACGTTACCCGGTCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCATCGTGGCACTGCATCTTTTTGATCa < 1:2810670/100‑1 (MQ=255) ccTTTGTCACGTTACCCGGTCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCATCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCaa > 1:863896/1‑100 (MQ=255) ccTTTGTCACGTTACCCGGTCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCATCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCaa > 1:538123/1‑100 (MQ=255) ccTTTGTCACGTTACCCGGGCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCATCGTGGCACTGGATCTTTTTg > 2:3748184/1‑95 (MQ=255) cTTTGTCACGTTACCCGGTCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCATCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAAc < 1:3742657/100‑1 (MQ=255) gttaCGTTATCCGGTCAGGTCGGTCCGCTGCTGGGTCCGGCGCTGGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGAGCAACAttg < 2:3502118/97‑2 (MQ=255) gTCACGTTACCCGGTCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCATCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTc > 1:362773/1‑100 (MQ=255) gTCACGTTACCCGGTCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCATCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTc > 2:1838967/1‑100 (MQ=255) cACGTTACCCGGTCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGGGGAGTACGCATCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCg > 2:1138397/1‑100 (MQ=255) cGTTACCCGGTCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGt > 1:2748155/1‑100 (MQ=255) cccGGTCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTgggg > 2:3282238/1‑99 (MQ=255) cccGGTCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCATCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTgggg > 2:3497076/1‑99 (MQ=255) cccGGTCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCATCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGa > 2:3389932/1‑100 (MQ=255) cccGGTCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCATCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGa > 1:3474692/1‑100 (MQ=255) cGGTCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCATCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGAtt > 2:2878935/1‑100 (MQ=255) ggTCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCATCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTa > 1:213569/1‑100 (MQ=255) gtttggttCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTAGGCATCGGGGCACTGGATCGTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCgg < 2:1798495/95‑1 (MQ=255) ggtcggtgCGCAGCCTGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGCGGAGTACGCATCGCGTCCCTGGAGCTTGTTGATTAATCTTCCTGTgggggctagtgtt > 2:2176785/1‑91 (MQ=255) ggtcggtcCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCATCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGt > 2:2618682/1‑100 (MQ=255) gtcggtcCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTg < 1:1647977/100‑1 (MQ=255) gtcggtcCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTg < 1:96402/100‑1 (MQ=255) gtcggtcCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCATCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTg > 2:1602587/1‑100 (MQ=255) gtcggtcCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCATCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTg > 1:3088540/1‑100 (MQ=255) cggtcCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCATCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCTGTGGGGATTATCGGTGCg < 2:1618455/100‑1 (MQ=255) gtcCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGAt > 1:681197/1‑100 (MQ=255) gtcCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCATCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGAt > 1:3514110/1‑100 (MQ=255) tcCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCATCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATc < 1:683639/100‑1 (MQ=255) tcCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCATCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATc > 1:3382856/1‑100 (MQ=255) tcCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCATCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATc < 1:456977/100‑1 (MQ=255) cGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTTTGCTGGTGGAGTACGCAGCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAATATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCg < 2:124410/99‑1 (MQ=255) cGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGc > 2:3520287/1‑100 (MQ=255) cGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCATCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGc < 1:3393586/100‑1 (MQ=255) gctgctCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGcc < 1:724896/100‑1 (MQ=255) gctgctCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCATCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGagatcg > 1:3880168/1‑95 (MQ=255) ctCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCcaca < 2:3194915/99‑1 (MQ=255) ctCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCATCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACAt < 1:4002240/100‑1 (MQ=255) tCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACAtt > 1:3677245/1‑100 (MQ=255) cGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCATCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTg > 1:2980494/1‑100 (MQ=255) ttgggCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCTg < 2:493675/97‑1 (MQ=255) tCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCATCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCTg < 1:3664037/100‑1 (MQ=255) ccGGCTCTCGGCGGTGTGCTGGGGGAGTCTGGCCCGGGGCGCCGGATCTGTTTGATCAACATTCCTGTGGGGATGATCGGTGCGATCGCCACATTGCTGt < 2:158737/100‑1 (MQ=255) ccGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCATCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCTGt < 1:2609744/100‑1 (MQ=255) cGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCTGtt < 1:515089/100‑1 (MQ=255) cGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCATCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCTGtt > 1:593029/1‑100 (MQ=255) ggCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGGGTACGCGTGGTGGCACTGGATCTTTTTGAGCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCTGtt < 2:2171390/99‑1 (MQ=255) ggCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCATCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCTGTTa < 2:251915/100‑1 (MQ=255) ggCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCATCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCTGTTa > 2:3412728/1‑100 (MQ=255) gcgcTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCTGTTaa < 2:1469385/100‑1 (MQ=255) cgcTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCTGTTAAt < 1:3087446/100‑1 (MQ=255) cgcTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCATCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCTGTTAAt > 1:3284984/1‑100 (MQ=255) cgcTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCATCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCTGTTAAt < 1:3497098/100‑1 (MQ=255) gcTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCATCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCTGTTAATg > 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tgctgGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGCTCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCTGTTAATGCCGAACTac > 2:2448437/1‑98 (MQ=255) tgctgGTGGAGTACGCATCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCTGTTAATGCCGAACTacac < 1:3537325/100‑1 (MQ=255) ggtggAGTACGCATCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCTGTTAATGCCGAACTACACCATg > 2:1383822/1‑100 (MQ=255) ggtggAGTACGCATCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCTGTTAATGCCGAACTACACCATg > 1:775134/1‑100 (MQ=255) gtggAGTACGCATCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATAGGTGCGATCGCCACATTGCTGTTAATGCCGAACTACACCCTGc > 2:2663375/1‑100 (MQ=255) tggAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCTGTTAATGCCGAACTACACCATGCa < 2:681191/100‑1 (MQ=255) tggAGTACGCATCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCTGTTAATGCCGAACTACACCATGCa > 1:2153993/1‑100 (MQ=255) tggAGTACGCATCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCTGTTAATGCCGAACTACACCATGCa < 2:2046865/100‑1 (MQ=255) gAGTACGCATCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATGCCGGTGGGGCTTATCGGTGCGATCGCCACATTGCTGTTAATCCCGAACTACACCATGcn < 2:1966191/98‑2 (MQ=255) ngTACGCATCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCTGTTAATGCCGAACTACACCATGCAGAc > 1:189444/2‑100 (MQ=255) aGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCTGTTAATGCCGAACTACACCATGCAGAc > 2:2975877/1‑100 (MQ=255) aGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCTGTTAATGCCGAACTACACCATGCAGAc < 1:2776861/100‑1 (MQ=255) aGTACGCATCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCTGTTAATGCCGAACTACACCATGCAGAc > 1:1558242/1‑100 (MQ=255) tACGCATCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCTGTTAATGCCGAACTACACCATGCAGAcgc > 2:472990/1‑100 (MQ=255) gCATCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCTGTTAATGCCGAACTACACCATGCAGACgcggc < 1:20617/100‑1 (MQ=255) cATCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCTGTTAATGCCGAACTACCCCATGCAGAcgccgc > 2:932364/1‑99 (MQ=255) cATCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCTGTTAATGCCGAACTACACCATGCAGACgcggcg > 1:731226/1‑100 (MQ=255) aTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCTGTTAATTCCGAACTACACCATGCAGACGCGgcgc > 2:3506327/1‑100 (MQ=255) aTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCTGTTAATGCCGAACTACACCATGCAGACGCGgcgc > 1:3605287/1‑100 (MQ=255) | GCGCGAGCAATATATGGCGGCGATGACCTTTGTCACGTTACCCGGTCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCATCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCTGTTAATGCCGAACTACACCATGCAGACGCGGCGC > NC_000913/2161847‑2162045 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |