| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,239,199 | T→C | 52.1% | N31D (AAC→GAC) | mglA ← | methyl‑galactoside ABC transporter ATPase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,239,199 | 0 | T | C | 52.1% | 25.8 / 162.0 | 126 | N31D (AAC→GAC) | mglA | methyl‑galactoside ABC transporter ATPase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (37/23); new base C (35/30); total (73/53) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.69e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 127 total aligned reads displayed.
TAAATACCAAACAGGCATTTTAATAATGTCGATTTTCCTGCACCGTTTTCCCCCATTAATGCATGGATAGAATGTGGCCGGACTTTTAAATTAACGTTATCAAGTGCCTTAACACCAGGAAAGGACTTGTTGATACCGCTCATTTCCAACAAGTATTCCCCGGAGGACGGAGTCGTTGAGCTGACCATATAATTTTA > NC_000913/2239102‑2239298 | tAAATACCAAACAGGCATTTTAATAATGTCGATTTTCCTGCACCGTTTTCCCCCATTAATGCATGGATAGAATGTGGCCGGACTTTTAAATTAACGTCAt > 1:3570866/1‑100 (MQ=255) aaaTACCAAACAGGCATTTTAATAATGTCGATTTTCCTGCACCGTTTTCCCCCATTAATGCATGGATAGAATGTGGCCGGACTTTTAAATTAACGTTATc < 1:2949532/100‑1 (MQ=255) aCCAAACAGGCATTTTAATAATGTCGATTTTCCTGCACCGTTTTCCCCCATTAATGCATGGATAGAATGTGGCCGGACTTTTAAATTAACGTCATCAAGt > 1:2148688/1‑100 (MQ=255) ccAAACAGGCATTTTAATAATGTCGCTTTTCCTGCAACGTTTTCCCACATTAATACATGGATAGAATGTGGCCGGACATTTAAAGTAACGCTATCAAGTg > 2:3889241/1‑100 (MQ=255) ccAAACAGGCATTTGAATAATGTCGATTTTCCTGCACCGTTTTCCCCCATTAACGCATGGATGGAAGTTGGACGGACTTTTAATTTAACGTGATCAAGTg > 2:1011197/1‑100 (MQ=255) aaaCAGGCATTTTAATAATGTCGATTTTCCTGCACCGTTTTCCCCCATTAATGCATGGATAGAATGTGGCCGGACTTTTAAATTAACGTTATCAAGTGcc < 2:3841456/100‑1 (MQ=255) aCAGGCATTTTAATAATGTCGATTTTCCTGCACCGTTTTCCCCCATTAATGCATGGATAGAATGTGGCCGGACTTTTAAATTAACGTTATCAAGTGCCtt < 1:1250512/100‑1 (MQ=255) cAGGCATTTTAATAATGTCGATTTTCCTGCACCGTTTTCCCCCATTAATGCATGGATAGAATGTGGCCGGACTTTTAAATTAACGTTATCAAGTGCCTTa > 1:3523986/1‑100 (MQ=255) cAGGCATTTTAATAATGTCGATTTTCCTGCACCGTTTTCCCCCATTAATGCATGGATAGAATGTGGCCGGACTTTTAAATTAACGTTATCAAGTGCCTTa > 1:3318420/1‑100 (MQ=255) ggCATTTTAATAATGTCGATTTTCCTGCACCGTTTTCCCCCATTAATGCATGGATAGAATGTGGCCGGACTTTTAAATTAACGTCATCAAGTGCCTTAac > 1:2995577/1‑100 (MQ=255) gCATTTTAATAATGTCGATTTTCCTGCACCGTTTTCCCCCATTAATGCATGGATAGAATGTGGCCGGACTTTTAAATTAACGTTATCAAGTGCCTTAac < 2:3477697/99‑1 (MQ=255) gCATTTTAATAATGTCGATTTTCCTGCACCGTTTTCCCCCATTAATGCATGGATAGAATGTGGCCGGACTTTTAAATTAACGTCATCAAGTGCCTTAaca < 1:2481667/100‑1 (MQ=255) cATTTTAATAATGTCGATTTTCCTGCACCGTTTTCCCCCATTAATGCATTGATAGAATGTGGCCGGACTTTTAAATTAAGGTTATCAAGTGACTTaa > 2:516984/1‑97 (MQ=255) cATTTTAATAATGTCGATTTTCCTGCACCGTTTTCCCCCATTAATGCATGGATAGAATGTGGCCGGACTTTTAAATTAACGTTATCAAGTGCCTTAacac > 2:3112327/1‑100 (MQ=255) cATTTTAATAATGTCGATTTTCCTGCACCGTTTTCCCCCATTAATGCATGGATAGAATGTGGCCGGACTTTTAAATTAACGTCATCAAGTGCCTTAacac > 1:2052189/1‑100 (MQ=255) cATTTTAATAATGTCGATTTTCCTGCACCGTTTTCCCCCATTAATGCATGGATAGAATGTGGCCGGACTTTTAAATTAACGTCATCAAGTGCCTTAaca < 2:228545/99‑1 (MQ=255) ttAATAATGTCGATTTTCCTGCACCGTTTTCCCCCATTAATGCATGGATAGAATGTGGCCGGACTTTTAAATTAACGTCATCAAGTGCCTTAACACCAgg < 1:1052391/100‑1 (MQ=255) taataaTCTCGATTTTCCTGCACAGTGTTACCCCTTTCCTGAATTGATAGACTGTGGCCGGACTTTTAAATTAACGTTATCAAGTGCCTTAACACCa < 2:3341984/97‑1 (MQ=255) aataatGTCGATTTTCCTGCACCGTTTTCCCCCATTAATGCATGGATAGAATGTGGCCGGACTTTTAAATTAACGTTATCAAGTGCCTTAACACCAGGaa > 2:1351396/1‑100 (MQ=255) aataatGTCGATTTTCCTGCACCGTTTTCCCCCATTAATGCATGGATAGAATGTGGCCGGACTTTTAAATTAACGTCATCAAGTGCCTTAACACCAGGaa < 2:1358455/100‑1 (MQ=255) ataatGTCGATTTTCCTGCACCGTTTTCCCCCATTAATGCATGGATAGAATGTGGCCGGACTTTTAAATTAACGTTATCAAGTGCCTTAACACCAGGaaa > 2:1310412/1‑100 (MQ=255) taatGTCGATTTTCCTGCACCATTTTCCCCCATTAATGCATGGATAGAATGTGGCCGGACTTTTAAATTAACGTCATCAAGTGCCTTAACACCAGGAAAg < 2:184067/100‑1 (MQ=255) tGTCGATTTTCCTGCACCGTTTTCCCCCATTAATGCATGGATAGAATGTGGCCGGACTTTTAAATTAACGTTATCAAGTGCCTTAACACCAGGAAAGGAc > 1:1601750/1‑100 (MQ=255) gATTTTCCTGCACCGTTTTCCCCCATTAATGCATGGATAGAATGTGGCCGGACTTTTAAATTAACGTTATCAAGTGCCTTAACACCAGGAAAGGACttgt < 1:426164/100‑1 (MQ=255) gATTTTCCTGCACCGTTTTCCCCCATTAATGCATGGATAGAATGTGGCCGGACTTTTAAATTAACGTCATCAAGTGCCTTAACACCAGGAAAGGACttgt > 2:1226072/1‑100 (MQ=255) gATTTTCCTGCACCGTTTTCCCCCATTAATGCATGGATAGAATGTGGCCGGACTTTTAAATTAACGTCATCAAGTGCCTTAACACCAGGAAAGGACt < 2:142006/97‑1 (MQ=255) gATGTTCCTGCACCGTTTTCCCCCATTAATGCATGGATAGAATGTGGCCGGACTTTTAAATTAACGTCATCAAGTGCCTTAACACCAGGAAAGGACttgt < 2:801885/100‑1 (MQ=255) ttCCTGCACCGTTTTCCCCCATTAATGCATGGATAGAATGTGGCCGGACTTTTAAATTAACGTCATCAAGTGCCTTAACACCAGGAAAGGACTTGTTGAt < 1:1174666/100‑1 (MQ=255) tCCTGCACCGTTTTCCCCCATTAATGCATGGATAGAATGTGGCCGGACTTTTAAATTAACGTTATCAAGTGCCTTAACACCAGGAAAGGACTTGTTGATa > 2:1525673/1‑100 (MQ=255) tCCTGCACCGTTTTCCCCCATTAATGCATGGATAGAATGTGGCCGGACTTTTAAATTAACGTCATCAAGTGCCTTAACACCAGGAAAGGACTTGTTGATa > 1:3717505/1‑100 (MQ=255) tCCTGCACCGTTTTCCCCCATTAATGCATGGATAGAATGTGGCCGGACTTTTAAATTAACGTCATCAAGTGCCTTAACACCAGGAAAGGACTTGTTGATa < 1:453532/100‑1 (MQ=255) cTGCACCGTTTTCCCCCATTAATGCATGGATAGAATGTGGCCGGACTTTTAAATTAACGTTATCAAGTGCCTTAACACCAGGAAAGGACTTGTTGATAcc > 2:277363/1‑100 (MQ=255) cTGCACCGTTTTCCCCCATTAATGCATGGATAGAATGTGGCCGGACTTTTAAATTAACGTCATCAAGTGCCTTAACACCAGGAAAGGACTTGTTGATAcc > 2:592411/1‑100 (MQ=255) cTGCACCGTTTTCCCCCATTAATGCATGGATAGAATGTGGCCGGACTTTTAAATTAACGTCATCAAGTGCCTTAACACCAGGAAAGGACTTGTTGATAcc < 1:404309/100‑1 (MQ=255) tGCACCGTTTTCCCCCATTAATGCATGGATAGAATGTGGCCGGACTTTTAAATTAACGTTATCAAGTGCCTTAACACCAGGAAAGGACTTGTTGATACCg > 1:2855365/1‑100 (MQ=255) gCACCGTTTTCCCCCATTAATGCATGGATAGAATGTGGCCGGACTTTTAAATTAACGTCATCAAGTGCCTTAACACCAGGAAAGGACTTGTTGATACCGc > 1:3868786/1‑100 (MQ=255) gCACCGTTTTCCCCCATTAATGAATGGATAAAATGTGGCAGGACTTTTAAAGTAACGTCATCAAGTGCCTTAACACCCGGAAAGGACTAGTTGATACCGc > 2:1738230/1‑100 (MQ=255) cACCGTTTTCCCCCATTAATGCATGGATAGAATGTGGCCGGACTTTTAAATTAACGTCATCAAGTGCCTTAACACCAGGAAAGGACTTGTTGATACCGCt < 1:3905878/100‑1 (MQ=255) ccGTTTTCCCCCATTAATGCATGGATAGAATGTGGCCGGACTTTTAAATTAACGTCATCAAGTGCCTTAACACCAGGAAAGGACTTGTTGATACCGCTCa < 1:1662854/100‑1 (MQ=255) ccGTTTTCCCCCATTAATGCATGGATAGAATGTGGCCGGACTTTTAAATTAACGTCATCAAGTGCCTTAACACCAGGAAAGGACTTGTTGATACCGCTCa > 2:2636923/1‑100 (MQ=255) tttCCCCCATTAATGCATGGATAGAATGTGGCCGGACTTTTAAATTAACGTTATCAAGTGCCTTAACACCAGGAAAGGACTTGTTGATACCGCTCATTTc > 2:4032427/1‑100 (MQ=255) tCCCCCATTAATGCATGGATAGAATGTGGCCGGACTTTTAAATTAACGTTATCAAGTGCCTTAACACCAGGAAAGGACTTGTTGATACCGCTCATTTCca > 2:715885/1‑100 (MQ=255) tCCCCCATTAATGCATGGATAGAATGTGGCCGGACTTTTAAATTAACGTCATCAAGTGCCTTAACACCAGGAAAGGACTTGTTGATACCGCTCATTTCca < 1:894086/100‑1 (MQ=255) cccccATTAATGCATGGATAGAATGTGGCCGGACTTTTAAATTAACGTCATCAAGTGCCTTAACACCAGGAAAGGACTTGTTGATACCGCTCATTTCcaa > 1:1633178/1‑100 (MQ=255) ccccATTAATGCATGGATAGAATGTGGCCGGACTTTTAAATTAACGTTATCAAGTGCCTTAACACCAGGAAAGGACTTGTTGATACCGCTCATTTCcaac > 1:3368714/1‑100 (MQ=255) ccccATTAATGCATGGATAGAATGTGGCCGGACTTTTAAATTAACGTTATCAAGTGCCTTAACACCAGGAAAGGACTTGTTGATACCGCTCATTTCcaac > 1:168649/1‑100 (MQ=255) ccccATTAATGCATGGATAGAATGTGGCCGGACTTTTAAATTAACGTTATCAAGTGCCTTAACACCAGGAAAGGACTTGTTGATACCGCTCATTTCcaac < 2:2300443/100‑1 (MQ=255) ccccATTAATGCATGGATAGAATGTGGCCGGACTTTTAAATTAACGTTATCAAGTGCCTTAACACCAGGAAAGGACTTGTTGATACCGCTCATTTCcaac < 1:3368128/100‑1 (MQ=255) ccccATTAATGCATGGATAGAATGTGGCCGGACTTTTAAATTAACGTCATCAAGTGCCTTAACACCAGGAAAGGACTTGTTGATACCGCTCATTTCcaac > 1:614822/1‑100 (MQ=255) ccccATTAATGCATGGATAGAATGTGGCCGGACTTTTAAATTAACGTCATCAAGTGCCTTAACACCAGGAAAGGACTTGTTGATACCGCTCATTTCcaac < 1:1328933/100‑1 (MQ=255) cccATTAATGCATGGAGAGAATGTGGCCGGACTTTTAAATGTACGTTAGCAAGTGCCTTGACACCAGGAATGGACTGGTTGATACCGCTCATGTCcatca > 1:829132/1‑100 (MQ=255) aTTAATGCATGGATAGAATGTGGCCGGACTTTTAAATTAACGTCATCAAGTGCCTTAACACCAGGAAAGGACTTGTTGATACCGCTCATTTCCAACAAg < 2:1395495/99‑1 (MQ=255) ttAATGCATGGATAGAATGTGGCCGGACTTTTAAATTAACGTTATCAAGTGCCTTAACACCATGAAAGGACTTGTTGATACCGCTCATTTCCAACAAGTa < 2:2014860/100‑1 (MQ=255) ttAATGCATGGATAGAATGTGGCCGGACTTTTAAATTAACGTCATCAAGTGCCTTAACACCAGGAAAGGACTTGTTGATACCGCTCATTTCCAACAAGTa < 2:1542981/100‑1 (MQ=255) aaTGCATGGATAGAATGTGGCCGGACTTTTAAATTAACGTTATCAAGTGCCTTAACACCAGGAAAGGACTTGTTGATACCGCTCATTTCCAACAAGTAtt < 2:3481216/100‑1 (MQ=255) aaTGCATGGATAGAATGTGGCCGGACTTTTAAATTAACGTTATCAAGTGCCTTAACACCAGGAAAGGACTTGTTGATACCGCTCATTTCCAACAAGTAtt > 2:2676613/1‑100 (MQ=255) atgcagttaTAGAATGCGGCCGTAGTTTTAAAATATCGGTATCAAGGGCCTGAACCCCAGGAAAGGACTTGTTGATACCGCTCATTTCcaacaa < 2:3700043/86‑1 (MQ=255) gCATGGATAGAATGTGGCCGGACTTTTAAATTAACGTTATCAAGTGCCTTAACACCAGGAAAGGACTTGTTGATACCGCTCATTTCCAACAAGTATTccc > 1:690066/1‑100 (MQ=255) gCATGGATAGAATGTGGCCGGACTTTTAAATTAACGTTATCAAGTGCCTTAACACCAGGAAAGGACTTGTTGATACCGCTCATTTCCAACAAGTATTcc > 1:2769174/1‑99 (MQ=255) cATGGATAGAATGTGGCCGGACTTTTAAATTAACGTTATCAAGTGCCTTAACACCAGGAAAGGACTTGTTGATACCGCTCATTTCCAACAAGTATTcccc > 1:1839638/1‑100 (MQ=255) cATGGATAGAATGTGGCCGGACTTTTAAATTAACGTTATCAAGTGCCTTAACACCAGGAAAGGACTTGTTGATACCGCTCATTTCCAACAAGTATTccc < 2:3570391/99‑1 (MQ=255) tGGATAGAATGTGGCCGGACTTTTAAATTAACGTTATCAAGTGCCTTAACACCAGGAAAGGACTTGTTGATACCGCTCATTTCCAACAAGTATTCCCCgg < 1:353908/100‑1 (MQ=255) gATAGAATGTGGCCGGACTTTTAAATTAACGTTATCAAGTGCCTTAACACCAGGAAAGGACTTGTTGATACCGCTCATTTCCAACAAGTATTCCCCggag > 1:2439041/1‑100 (MQ=255) gATAGAATGTGGCCGGACTTTTAAATTAACGTTATCAAGTGCCTTAACACCAGGAAAGGACTTGTTGATACCGCTCATTTCCAACAAGTATTCCCCggag > 1:624716/1‑100 (MQ=255) aGAATGTGGCCGGACTTTTAAATTAACGTCATCAAGTGCCTTAACACCAGGAAAGGACTTGTTGATACCGCTCATTTCCAACAAGTATTCCCCGGAGGAc > 2:2288433/1‑100 (MQ=255) gAATGTGGCCGGACTTTTAAATTAACGTCATCAAGTGCCTTAACACCAGGAAAGGACTTGTTGATACCGCTCATTTCCAACAAGTATTCCCCGGAGGACg > 2:1803393/1‑100 (MQ=255) gAATGTGGCCGGACTTTTAAATTAACGTCATCAAGTGCCTTAACACCAGGAAAGGACTTGTTGATACCGCTCATTTCCAACAAGTATTCCCCGGAGGACg > 2:1913158/1‑100 (MQ=255) gAATGTGGCCGGACTTTTAAATTAACGTCATCAAGTGCCTTAACACCAGGAAAGGACTTGTTGATACCGCTCATTTCCAACAAGTATTCCCCGGAGGACg > 1:2955908/1‑100 (MQ=255) gAATGTGGCCGGACTTTTAAATTAACGTCATCAAGTGCCTTAACACCAGGAAAGGACTTGTTGATACCGCTCATTTCCAACAAGTATTCCCCGGAGGACg < 2:2130460/100‑1 (MQ=255) aaTGTGGCCGGACTTTTAAATTAACGTTATCAAGTGCCTTAACACCAGGAAAGGACTTGTTGATACCGCTCATTTCCAACAAGTATTCCCCGGAGGACgg < 2:1601738/100‑1 (MQ=255) aTGTGGCCGGACTTTTAAATTAACGTTATCAAGTGCCTTAACACCAGGAAAGGACTTGTTGATACCGCTCATTTCCAACAAGTATTCCCCGGAGGACGGa < 1:1362268/100‑1 (MQ=255) tgGCCGGACTTTTAAATTAACGTTATCAAGTGCCTTAACACCAGGAAAGGACTTGTTGATACCGCTCATTTCCAACAAGTATTCCCCGGAGGACGGAGTc > 2:3345988/1‑100 (MQ=255) tgGCCGGACTTTTAAATTAACGTCATCAAGTGCCTTAACACCAGGAAAGGACTTGTTGATACCGCTCATTTCCAACAAGTATTCCCCGGAGGACGGAGTc < 2:143936/100‑1 (MQ=255) gCCGGACTTTTAAATTAACGTTATCAAGTGCCTTAACACCAGGAAAGGACTTGTTGATACCGCTCATTTCCAACAAGTATTCCCCGGAGGACGGAGTCGt > 2:1820815/1‑100 (MQ=255) ccGGACTTTTAAATTAACGTCATCAAGTGCCTTAACACCAGGAAAGGACTTGTTGATACCGCTCATTTCCAACAAGTATTCCCCGGAGGACGGAGTCGtt > 1:382562/1‑100 (MQ=255) ccGGACTTTTAAATTAACGTCATCAAGTGCCTTAACACCAGGAAAGGACTTGTTGATACCGCTCATTTACAACAAGTATTCCCCGGTGGACGGAGTcat > 1:730530/1‑97 (MQ=255) cGGACTTTTAAATTAACGTCATCAAGTGCCTTAACACCAGGAAAGGACTTGTTGATACCGCTCATTTCCAACAAGTATTCCCCGGAGGACGGAGTCGTTg < 2:155352/100‑1 (MQ=255) gACTTTTAAATTAACGTTATCAAGTGCCTTAACACCAGGAAAGGACTTGTTGATACCGCTCATTTCCAACAAGTATTCCCCGGAGGACGGAGTCGTTGAg < 1:489287/100‑1 (MQ=255) aCTTTTAAATTAACGTCATCAAGTGCCTTAACACCAGGAAAGGACTTGTTGATACCGCTCATTTCCAACAAGTATTCCCCGGAGGACGGAGTCGTTGAGc < 2:161572/100‑1 (MQ=255) aCTTTTAAATTAACGTCATCAAGTGCCTTAACACCAGGAAAGGACTTGTTGATACCGCTCATTTCCAACAAGTATTCCCCGGAGGACGGAGTCGTTGAGc < 1:1556288/100‑1 (MQ=255) cTTTTAAATTAACGTCATCAAGTTCCTTTACACCAGCACAGCACTTGTTGATACCGCTCATTTCCAACAAGTCTTCCCCGGAGGACGGAGTCTTTGAGCt > 2:1832630/1‑100 (MQ=255) cTTTTAAATTAACGTCATCAAGTGCCTTAACACCATGAAAGGACTTGTTGATACCGCTCATTTCCAACAAGTATTCCCCGGAGGACGGAGTCGTTGAGCt < 1:3802435/100‑1 (MQ=255) cTTTTAAATTAACGTCATCAAGTGCCTTAACACCAGGAAAGGACTTGTTGATACCGCTCATTTCCAACAAGTATTCCCCGGAGGACGGAGTCGTTGAGCt > 2:1255149/1‑100 (MQ=255) ttttAAATTAACGTTATCAAGTGCCTTAACACCAGGAAAGGACTTGTTGATACCGCTCATTTCCAACAAGTATTCCCCGGAGGACGGAGTCGTTGAGCTg > 2:2842417/1‑100 (MQ=255) ttttAAATTAACGTCATCAAGTGCCTTAACACCAGGAAAGTACTTGTTGATACCGCTCATTTCCAACAAGTATTCCCCGGAGGACGGAGTCATTGAGCTg > 2:4004606/1‑100 (MQ=255) ttttAAATTAACGTCATCAAGTGCCTTAACACCAGGAAAGGACTTGTTGATACCGCTCATTTCCAACAAGTATTCCCCGGAGGACGGAGTCGTTGAGCTg < 2:3772412/100‑1 (MQ=255) ttAAATTAACTTTATCAAGTGCCTTAACACCAGGAAAGGACTTGTTGATACCGCTCATTTCCAACAAGTATTCCCCGGAGGACGGAGTCGTTGAGCTGAc < 1:306869/100‑1 (MQ=255) ttAAATTAACGTTATCAAGTGCCTTAACACCAGGTAAGGAATTGTTGATACCGCTCATTTCCAACAAGTATTCCCCGGAGGACGGAGTCGTTGAGCTGAc > 2:3380916/1‑100 (MQ=255) ttAAATTAACGTTATCAAGTGCCTTAACACCAGGAAAGGACTTGTTGATACCGCTCATTTCCAACAAGTATTCCCCGGAGGACGGAGTCGTTGAGCTGAc < 1:171578/100‑1 (MQ=255) ttAAATTAACGTCATCAAGTGCCTTAACACCAGGAAAGGACTTGTTGATACCGCTCATTTCCAACAAGTATTCCCCGGAGGACGGAGTCGTTGAGCTGAc < 1:3611008/100‑1 (MQ=255) tAAATTAACGTTATCAAGTGCCTTAACACCAGGAAAGGACTTGTTGATACCGCTCATTTCCAACAAGTATTCCCCGGAGGACGGAGTCGTTGAGCTGAcc < 2:3401011/100‑1 (MQ=255) aaTTAACGTTATCAAGTGCCTTAACACCAGGAAAGGACTTGTTGATACCGCTCATTTCCAACAAGTATTCCCCGGAGGACGGAGTCGTTGAGCTGACCat > 2:1068342/1‑100 (MQ=255) aaTTAACGTTATCAAGTGCCTTAACACCAGGAAAGGACTTGTTGATACCGCTCATTTCCAACAAGTATTCCCCGGAGGACGGAGTCGTTGAGCTGACCat > 2:3103237/1‑100 (MQ=255) aaTTAACGTTATCAAGTGCCTTAACACCAGGAAAGGACTTGTTGATACCGCTCATTTCCAACAAGTATTCCCCGGAGGACGGAGTCGTTGAGCTGACCat > 2:708051/1‑100 (MQ=255) aaCGTTATCAAGTGCCTTAACACCAGGAAAGGACTTGTTGATACCGCTCATTTCCAACAAGTATTCCCCGGAGAACGGAGTCGTTGAGCTGACCATATaa > 1:23287/1‑100 (MQ=255) aCGTCATCAAGTGCCTTAACACCAGGAAAGGACTTGTTGATACCGCTCATTTCCAACAAGTATTCCCCGGAGGACGGAGTCGTTGAGCTGACCATATAAt > 1:1236260/1‑100 (MQ=255) cGTTATCAAGTGCCTTAACACCAGGAAAGGACTTGTTGATACCGCTCATTTCCAACAAGTATTCCCCGGAGGACGGAGTCGTTGAGCTGACCATATAAtt > 2:1962056/1‑100 (MQ=255) cGTTATCAAGTGCCTTAACACCAGGAAAGGACTTGTTGATACCGCTCATTTCCAACAAGTATTCCCCGGAGGACGGAGTCGTTGAGCTGACCATATAAtt > 2:2430129/1‑100 (MQ=255) cGTCATCAAGTGCCTTAACACCAGGAAAGGACTTGTTGATACCGCTCATTTCCAACAAGTATTCCACGGAGGACGGAGTCGTTGAGCTGACCATATAAtt < 2:2999671/100‑1 (MQ=255) tATCAAGTGCCTTAACACCAGGAAAGGACTTGTTGATACCGCTCATTTCCAACAAGTATTCCCCGGAGGACGGAGTCGTTGAGCTGACCATATAATTTTa < 1:2044097/100‑1 (MQ=255) | TAAATACCAAACAGGCATTTTAATAATGTCGATTTTCCTGCACCGTTTTCCCCCATTAATGCATGGATAGAATGTGGCCGGACTTTTAAATTAACGTTATCAAGTGCCTTAACACCAGGAAAGGACTTGTTGATACCGCTCATTTCCAACAAGTATTCCCCGGAGGACGGAGTCGTTGAGCTGACCATATAATTTTA > NC_000913/2239102‑2239298 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |