| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,278,298 | C→T | 100% | intergenic (‑61/+272) | yejG ← / ← bcr | uncharacterized protein/bicyclomycin/cysteine/sulfonamide efflux transporter |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,278,298 | 0 | C | T | 97.2% | 403.6 / ‑0.2 | 124 | intergenic (‑61/+272) | yejG/bcr | uncharacterized protein/bicyclomycin/cysteine/sulfonamide efflux transporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (2/2); new base T (65/55); total (67/57) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 131 total aligned reads displayed.
GCAGTCGATGGACGATTGAGAGTTGTAATGAAGTCACTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATCAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCCTCTATGGCTCTGATTTAAGTAATATCTGCGGGCGTGGTCACG > NC_000913/2278201‑2278392 | gCAGTCGATGGACGATTGAGAGTTGTAATGAAGTCACTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATtaa < 1:1923482/100‑1 (MQ=255)gCAGTCGATGGACGATTGAGAGTTGTAATGAAGTCACTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATcaa < 1:153812/100‑1 (MQ=255) cAGTCGATGGACGATTGAGAGTTGTAATGAAGTCACTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTGCATCAATTTTAACACATCATtaac > 1:742628/1‑100 (MQ=255) gTCGATGGACGATTGAGAGTTGTAATGAAGTCACTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATtaacaa > 2:3636110/1‑100 (MQ=255) cGATGGACGATTGAGAGTTGTAATGAAGTCACTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATc < 2:223673/100‑1 (MQ=255) gacggACGATTGAGAGTTGTAATGAAGTCACTTATTTTCCCCGGAATCACATACACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATcc < 2:3710347/97‑1 (MQ=255) gATGGACGATTGAGAGTTGTAATGAAGTCACTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATcc > 1:3070998/1‑100 (MQ=255) aTGGACGATTGAGAGTTGTAATGAAGTCACTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCg > 1:372779/1‑100 (MQ=255) aTGGACGATTGAGAGTTGTAATGAAGTCACTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCg > 1:3008430/1‑100 (MQ=255) tGGACGATTGAGAGTTGTAATGAAGTCACTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGt > 1:3888802/1‑100 (MQ=255) tGGACGATTGAGAGTTGTAATGAAGTCACTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGt > 2:3306940/1‑100 (MQ=255) gACGATTGAGAGTTGTAATGAAGTCACTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCt > 2:1136766/1‑100 (MQ=255) gACGATTGAGAGTTGTAATGAAGTCACTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCt > 1:2220439/1‑100 (MQ=255) gACGATTGAGAGTTGTAATGAAGTCACTTATTTTCCCCGGAAGCACATTAACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACAAATCATTAACAATCCGTc > 2:2392572/1‑99 (MQ=255) aCGATTGAGAGTTGTAATGAAGTCACTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCtt < 1:3536615/100‑1 (MQ=255) cGATTGAGAGTTGTAATGAAGTCACTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCttt > 1:120749/1‑100 (MQ=255) gATTGAGAGTTGTAATGAAGTCACTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCTGTCTTta < 1:2161001/100‑1 (MQ=255) gATTGAGAGTTGTAATGAAGTCACTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTta < 1:302530/100‑1 (MQ=255) aTTGAGAGTTGTAATGAAGTCACTTATTTTCCCCGAAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTATATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTtat < 2:1710416/100‑1 (MQ=255) tGAGAGTTGTAATGAAGTCACTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATAc < 1:2873837/100‑1 (MQ=255) gagaGTTGTAATGAAGTCACTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACa < 2:1212801/100‑1 (MQ=255) gagaGTTGTAATGAAGTCACTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACa < 1:261899/100‑1 (MQ=255) gagaGTTGTAATGAAGTCACTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACa > 1:67890/1‑100 (MQ=255) gagaGTTGTAATGAAGTCACTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACa > 2:3357881/1‑100 (MQ=255) gagaGTTGTAATGAAGTCACTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACa > 2:1340042/1‑100 (MQ=255) agagTTGTAATGAAGTCACTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAg > 1:1207488/1‑100 (MQ=255) tagTTGTAATGAAGTCACTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGa > 2:460196/2‑100 (MQ=255) gagTTGTAATGAAGTCACTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTATAACACATCATTAAAAATCAGTCTTTATACAGa > 2:2383835/1‑100 (MQ=255) agTTGTAATGAAGTCACTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGAt < 2:513543/100‑1 (MQ=255) ttGTAATGAAGTCACTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATc < 2:470343/99‑1 (MQ=255) gTAATGAAGTCACTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTa > 1:461330/1‑100 (MQ=255) tAATGAAGTCACTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACGATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTaa > 1:2796326/1‑100 (MQ=255) aTGAAGTCACTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAg > 1:2854420/1‑100 (MQ=255) tGAAGTCACTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGa < 1:2474358/100‑1 (MQ=255) tGAAGTCACTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACAAATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAg < 2:821042/99‑1 (MQ=255) aaGTCACTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGAtt > 1:3972518/1‑100 (MQ=255) gTCACTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGa > 1:3319352/1‑100 (MQ=255) cACTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACACTTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATg < 2:3501973/100‑1 (MQ=255) cACTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATg > 1:3613563/1‑100 (MQ=255) cACTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATg > 1:380559/1‑100 (MQ=255) aCTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGc > 1:3484483/1‑100 (MQ=255) cTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGcc < 2:2045280/100‑1 (MQ=255) cTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGcc < 2:3070979/100‑1 (MQ=255) cTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGcc < 2:3436976/100‑1 (MQ=255) aTTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCg < 2:1873109/100‑1 (MQ=255) tttCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGcc < 1:460200/100‑1 (MQ=255) ttCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCt > 1:1262532/1‑100 (MQ=255) ttCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCt < 2:2419872/100‑1 (MQ=255) tCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTg < 1:3665187/100‑1 (MQ=255) tcccGGAAGCACATGCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCTTAAAGATTGATGCCTCGcc > 2:608899/2‑97 (MQ=255) ccGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGt > 1:3952859/1‑100 (MQ=255) ggAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTCAAGATTGATGCCTCGCATGCGTg > 2:1428276/1‑99 (MQ=255) gAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGc > 2:1063544/1‑100 (MQ=255) gAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGc > 2:1063695/1‑100 (MQ=255) aaGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGcc < 1:3336308/100‑1 (MQ=255) gCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCctc > 1:977175/1‑100 (MQ=255) gCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCctc < 2:2316009/100‑1 (MQ=255) acaTTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCCTCTa > 1:3872166/1‑100 (MQ=255) atctacttcacAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCCTCTATg < 1:3298778/96‑1 (MQ=255) aTTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCCTCTATg > 1:1614368/1‑100 (MQ=255) aTTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCCTCTATg < 1:2730661/100‑1 (MQ=255) tcacttcacAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCCTCTATGGc < 1:3567253/100‑1 (MQ=255) tcacttcacAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCCTCTATGGc < 2:2917113/100‑1 (MQ=255) tcacttcacAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCCTCTATGGc < 1:3306960/100‑1 (MQ=255) tcacttcacAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCCTCTATGGc < 1:3453527/100‑1 (MQ=255) tcacttcacAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCCTCTATGGc < 1:2081760/100‑1 (MQ=255) cacttcacAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCCTCTATGGct > 2:569533/1‑100 (MQ=255) acttcacAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCCTCTATgagat > 2:3298758/1‑96 (MQ=255) acttcacAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCCTCTATGGctc > 2:1113021/1‑100 (MQ=255) acaATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCCTCTATGGCTCTGAtt > 2:2258314/1‑100 (MQ=255) aaTTTGTTTACATCAATGTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTGATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCCTCTATGGCGCTGAt < 2:4112982/97‑1 (MQ=255) tGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCCTCTATGGCTCTGATTTAAGTa < 2:3462174/100‑1 (MQ=255) gTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCCTCTATGGCTCTGATTTAAGTaa < 1:2653634/100‑1 (MQ=255) gTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCCTCTATGGCTCTGATTTAAGTaa > 1:320331/1‑100 (MQ=255) gTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCCTCTATGGCTCTGATTTAAGTaa > 2:1302821/1‑100 (MQ=255) tttACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCCTCTATGGCTCTGATTTAAGTAat < 2:883544/100‑1 (MQ=255) tttACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCCTCTATGGCTCTGATTTAAGTAat < 2:2821609/100‑1 (MQ=255) aCATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCCTCTATGGCTCTGATTTAAGTAATATc < 2:1822629/100‑1 (MQ=255) aCATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCCTCTATGGCTCTGATTTAAGTAATATc < 2:2854404/100‑1 (MQ=255) cATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCCTCTATGGCTCTGATTTAAGTAATATCt > 2:941971/1‑100 (MQ=255) cATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCCTCTATGGCTCTGATTTAAGTAATATCt > 2:1714762/1‑100 (MQ=255) aTCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAACGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCCTCTATGGCCCTGCTTTACGTAATATCTg > 1:3430824/1‑100 (MQ=255) aTCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCCTCTATGGCTCTGATTTAAGTAATATCTg > 1:2640903/1‑100 (MQ=255) aTCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCCTCTATGGCTCTGATTTAAGTAATATCTg > 1:2861820/1‑100 (MQ=255) cAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCCTCTATGGCTCTGATTTAAGTAATATCTGCg > 1:3886456/1‑100 (MQ=255) cAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTATACACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCCTCTATGGCTCTGATTTAAGCAATATCTGc > 2:2721058/1‑99 (MQ=255) aaTTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCCTCTATGGCTCTGATTTAAGTAATATCTGCgg > 2:1080070/1‑100 (MQ=255) aaTTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCCTCTATGGCTCTGATTTAAGTAATATCTGCgg > 1:3243603/1‑100 (MQ=255) ttttAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCCTCTATGGCTCTGATTTAAGTAATATCTGCGGGc > 2:1641906/1‑100 (MQ=255) tttAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCCTCTATGGCTCTGATTTAAGTAATATCTGCGGGCg < 2:302093/100‑1 (MQ=255) ttAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCCTCTATGGCTCTGATTTAAGTAATATCTGCGGACGt > 2:3797979/1‑100 (MQ=255) tAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCCTCTATGGCTCTGATTTAAGTAATATCTGCGGGCGTg < 1:245935/100‑1 (MQ=255) aaCACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCCTCTATGGCTCTGATTTAAGTAATATCTGCGGGCGTgg < 1:1340051/100‑1 (MQ=255) aaCACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCCTCTATGGCTCTGATTTAAGTAATATCTGCGGGCGTgg > 1:772285/1‑100 (MQ=255) acacATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGTTCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCCTCTATGGCTCTGATTTAAGTAATATCTGCGGGCGTgg < 2:2041940/99‑1 (MQ=255) acacATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCCTCTATGGCTCTGATTTAAGTAATATCTGCGGGCGTGGt < 2:3432405/100‑1 (MQ=255) acacATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCCTCTATGGCTCTGATTTAAGTAATATCTGCGGGCGTGGt > 1:1702067/1‑100 (MQ=255) caccTCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCCTCTATGGCTCTGATTTAAGTAATATCTGc > 2:2397535/1‑90 (MQ=255) acaTCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCCTCTATGGCTCTGCTTTAAGTAATATCTGCGGGCGTGGTCa > 2:1843968/1‑100 (MQ=255) catcatTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCCTCTATGGCTCTGATTTAAGTAATATCTGCGGGCGTGGTCAc > 2:2101363/1‑100 (MQ=255) | GCAGTCGATGGACGATTGAGAGTTGTAATGAAGTCACTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATCAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCCTCTATGGCTCTGATTTAAGTAATATCTGCGGGCGTGGTCACG > NC_000913/2278201‑2278392 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |