| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,461,483 | G→T | 55.4% | A60S (GCA→TCA) | fadL → | long‑chain fatty acid outer membrane transporter |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,461,483 | 0 | G | T | 55.4% | 30.6 / 199.9 | 141 | A60S (GCA→TCA) | fadL | long‑chain fatty acid outer membrane transporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (32/31); new base T (34/44); total (66/75) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.03e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.31e-01 | |||||||||||
Only 100 of 143 total aligned reads displayed.
GGCTTTCAGTTAAACGAATTTTCTTCCTCTGGCCTGGGCCGGGCTTATTCAGGGGAAGGCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGTAACCCCGCATTGATTACTATGTTTGACCGCCCGACATTTTCTGCGGGTGCGGTTTATATTGACCCGGATGTAAATATCAGCGGAACGTCTCCATCTGGTCGTAGCC > NC_000913/2461384‑2461582 | ggCTTTCAGTTAAACGAATTTTCTTCCTCTGGCCTGGGCCGGGCTTATTCAGGGGAAGGCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGTAACCCCg > 2:712757/1‑100 (MQ=255) tttCAGTTAAACGAATTTTCTTCCTCTGGCCTGGGCCGGGCTTATTCAGGGGAAGGCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGTAACCCCGCAt < 1:3264129/100‑1 (MQ=255) ttCAGTTAAACGAATTTTCTTCCTCTGGCCTGGGCCGGGCTTATTCAGGGGAAGGCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGTAACCCCTCAtt < 1:473595/100‑1 (MQ=255) cAGTTAAACGAATTTTCTTCCTCTGGCCTGGGCCGGGCTTATTCAGGGGAAGGCGCAATTGCCGATGAGGCAGGTAACGTCAGCCGTAACCCCGCATTGa > 2:879146/1‑100 (MQ=255) aGTTAAACGAATTTTCTTCCTCTGGCCTGGGCCGGGCTTATTCAGGGGAAGGCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGTAACCCCGCATTGAt < 2:2449961/100‑1 (MQ=255) gTTAAACGAATTTTCTTCCTCTGGCCTGGGCCGGGCTTATTCAGGGGAAGGCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGTAACCCCTCATTGAtt > 2:2607502/1‑100 (MQ=255) gTTAAACGAATTTTCTTCCTCTGGCCTGGGCCGGGCTTATTCAGGGGAAGGCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGTAACCCCGCATTGAtt < 2:1596947/100‑1 (MQ=255) gTTAAACGAATTTTCTTCCTCTGGCCTGGGCCGGGCTTATTCAGGGGAAGGCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGTAACCCCGCATTGAtt < 1:1433957/100‑1 (MQ=255) gTTAAACGAATTTTCTTCCTCTAGCCTGGGCCGGGCTTATTCAGGTGAAGGCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGTAACCCCTCATTGAtt > 2:473061/1‑100 (MQ=255) ttAAACGAATTTTCTTCCTCTGGCCTGGGCCGGGCTTATTCAGGGGAAGGCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCCGCCGCAACCCCTCATCGAtt < 2:829705/99‑1 (MQ=255) tAAACGAATTTTCTTCCTCTGGCCTGGGCCGGGCTTATTCAGGGGAAGGCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGTAACCCCTCATTGATTAc < 1:2464344/100‑1 (MQ=255) tAAACGAATTTTCTTCCTCTGGCCTGGGCCGGGCTTATTCAGGGGAAGGCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGTAACCCCGCATTGATTAc > 2:1871994/1‑100 (MQ=255) aaaCGAATTTTCTTCCTCTGGCCTGGGCCGGGCTTCTTCAGGGGAAGGCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGTAACCCCTCATTGATTACt > 1:2964890/1‑100 (MQ=255) aaCGAATTTTCTTCCTCTGGCCTGGGCCGGGCTTATTCAGGGGAAGGCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGTAACCCCTCATTGATTACTa < 2:3576104/100‑1 (MQ=255) aaCGAATTTTCTTCCTCTGGCCTGGGCCGGGCTTATTCAGGGGAAGGCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGTAACCCCGCATTGATTACTa > 2:2800609/1‑100 (MQ=255) aCGAATTTTCTTCCTCTGGCCTGGGCCGGGCTTATTCAGGGGAAGGCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGTAACCCCGCATTGATTACTAt > 2:4101787/1‑100 (MQ=255) aCGAATTTTCTTCCTCTGGCCTGGGCCGGGCTTATTCAGGGGAAGGCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGTAACCCCGCATTGATTACTAt > 2:230109/1‑100 (MQ=255) gAATTTTCTTCCTCTGGCCTGGGCCGGGCTTATTCAGGGGAAGGCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGTAACCCCGCATTGATTACTATGt > 1:2104131/1‑100 (MQ=255) aaTTTTCTTCCTCTGGCCTGGGCCGGGCTTATTCAGGGGAAGGCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGTAACCCCTCATTGATTACTATGtt < 2:72286/100‑1 (MQ=255) aTTTTCTTCCTCTGGCCTGGGCCGGGCTTATTCAGGGGAAGGCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGTAACCCCTCATTGATTACTATGttt < 1:2607518/100‑1 (MQ=255) tcttcCTCTGGCCTGGGCCGGGCTTATTCAGGGGAAGGCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGTAACCCCGCATTGATTACTATGTTTGAcc < 2:2429310/100‑1 (MQ=255) cttcCTCTGGCCTGGGCCGGGCTTATTCAGGGGAAGGCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGTAACCCCTCATTGATTACTATGTTTGACCg > 1:3951007/1‑100 (MQ=255) cttcCTCTGGCCTGGGCCGGGCTTATTCAGGGGAAGGCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGTAACCCCTCATTGATTACTATGTTTGACCg > 1:2956385/1‑100 (MQ=255) cttcCTCTGGCCTGGGCCGGGCTTATTCAGGGGAAGGCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGTAACCCCTCATTGATTACTATGTTTGACCg < 1:119250/100‑1 (MQ=255) tcCTCTGGCCTGGGCCGGGCTTATTCAGGGGAAGGCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGTAACCCCTCATTGATTACTATGTTTGACCGcc < 1:2340877/100‑1 (MQ=255) ccTCTGGCCTGGGCCGGGCTTATTCAGGGGAAGGCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGTAACCCCTCATTGATTACTATGTTTGACCGccc < 1:1814700/100‑1 (MQ=255) ccTCTGGCCTGGGCCGGGCTTATTCAGGGGAAGGCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGTAACCCCGCATTGATTACTATGTTTGACCGccc > 2:1903887/1‑100 (MQ=255) ctctGGCCTGGGCCGGGCTTATTCAGGGGAAGGCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGTAACCCCTCATTGATTACTATGTTTGACCGCCCg < 1:1143016/100‑1 (MQ=255) ctctGGCCTGCGCCGGGCTTACTCAGGGGAAGGCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGTAACCCCTCATTGATTACTATGTTTCACCGccc > 2:1220251/1‑99 (MQ=255) aggCCTGAGCAGGGCTTATTCAGGGTAAGGCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGTAACCCCTCATTGATTACTATGTTTGACCGCCCGAc > 2:623124/2‑99 (MQ=255) ggCCTGGGCCGGGCTTATTCAGGGGAAGGCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGTAACCCCTCATTGATTACTATGTTTGACCGCCCGACAt > 1:1059532/1‑100 (MQ=255) gCCTGGGCCGGGCTTATTCAGGGGAAGGCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGTAACCCCGCATTGATTACTATGTTTGACCGCCCGACAtt > 1:1023159/1‑100 (MQ=255) ccTGGGCCGGGCTTATTCAGGGGAAGGCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGTAACCCCGCATTGATTACTATGTTTGACCGCCCGACAttt < 1:4043541/100‑1 (MQ=255) gggCCGGGCTTATTCAGGGGAAGGCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGTAACCCCGCATTGATTACTATGTTTGACCGCCCGACATTTTCt > 1:307014/1‑100 (MQ=255) gCCGGGCTTATTCAGGGGAAGGCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGTAACCCCTCATTGATTACTATGTTTGACCGCCCGACATTTTCTGc < 1:3816862/100‑1 (MQ=255) gCCGGGCTTATTCAGGGGAAGGCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGTAACCCCTCATTGATTACTATGTTTGACCGCCCGACATTTTCTGc > 1:1327589/1‑100 (MQ=255) ccGGGCTTATTCAGGGGAAGGCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGTAACCCCTCATTGATTACTATGTTTGACCGCCCGACATTTTCTGCg > 1:1474955/1‑100 (MQ=255) ccGGGCTTATTCAGGGGAAGGCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGTAACCCCGCATTGATTACTATGTTTGACCGCCCGACATTTTCTGCg < 1:198282/100‑1 (MQ=255) cgagCTTATTCAGGGGAAGACGCAAGTGCCGATGATGCAGATAACGTCAGCCGTAACTCCGCATTGATTACTATGTTTGACCGCCCGACATTTTCTg < 2:364468/94‑1 (MQ=255) cGGGCTTATTCAGGGGAAGTCGCAATTGCAGATGATGCAGGTAACGGCAGCCGTAACCCCTCATGGATTACTATGTTGGACCGCCCGACATTTTCTGCgg < 2:1998716/100‑1 (MQ=255) gttggtATTCAGGGGAAGGCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGTAACCCCTCATTGATTACTATGTTTGACCGCCCGACATTTTCTGCggg < 1:3143732/95‑1 (MQ=255) tATTCAGGGGAAGGCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGTAACCCCTCATTGATTACTATGTTTGACCGCCCGACATTTTCTGCGGGTGCgg > 2:3083810/1‑100 (MQ=255) aTTCAGGGGAAGGCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGTAACCCCTCATTGATTACTATGTTTGACCGCCCGACATTTTCTGCGGGTGCGGt > 1:2491400/1‑100 (MQ=255) ttCAGGGGAAGGCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGTAACCCCGCATTGATTACTATGTTTGACCGCCCGACATTTTCTGCGGGTGCGGtt > 2:3548090/1‑100 (MQ=255) cAGGGGAAGGCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAGCGTCAGCCGTAACCCCGCATTGATTACTATGTTTGAGCGCCCGACATTTTCTGCGGGTGCGGTTta > 2:2482166/1‑100 (MQ=255) cAGGGGAAGGCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGTAACCCCTCATTGATTACTATGTTTGACCGCCCGACATTTTCTGCGGGTGCGGTTta < 1:2648371/100‑1 (MQ=255) aGGGGAAGGCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGTAACCCCTCATTGATTACTATGTTTGACCGCCCGACATTTTCTGCGGGTGCGGTTtat < 1:2956515/100‑1 (MQ=255) gggAAGGCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGTAACCCCTCATTGATTACTATGTTTGACCGCCCGACATTTTCTGCGGGTGCGGTTTatat < 1:4028147/100‑1 (MQ=255) gggaGGCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGTAACCCCGCATTGATTACTATGTTTGACCGCCCGACATTTTCTGCGGGTGCGGTTTATAtt < 1:1544158/97‑1 (MQ=255) aGGCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGTAACCCCTCATTGATTACTATGTTTGACCGCCCGACATTTTCTGCGGGTGCGGTTTATATTGAc < 1:405295/100‑1 (MQ=255) aGGCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGTAACCCCTCATTGATTACTATGTTTGACCGCCCGACATTTTCTGCGGGTGCGGTTTATATTGAc < 1:405323/100‑1 (MQ=255) ggCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGTAACCCCTCATTGATTACTATGTTTGACCGCCCGACATTTTCTGCGGGTGCGGTTTATATTGAcc > 2:1306583/1‑100 (MQ=255) ggCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGTAACCCCGCATTGATTACTCTGTTTGACCGCCCGACGTTTTCTGCGGGTGCGGTTTATATTGAcc > 1:995272/1‑100 (MQ=255) ggCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGTAACCCCGCATTGATTACTATGTTTGACCGCCCGACATTTTCTGCGGGTGCGGTTTATATTGAcc < 1:1665244/100‑1 (MQ=255) cgcAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGTAACCCCGCATTGATTACTATGTTTGACCGCCCGACATTTTCTGCGGGTGCGGTTTATATTGACCCg < 1:3196955/100‑1 (MQ=255) cAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGTAACCCCGCATTGATTACTATGTTTGCCCGCCCGACATTTTCTGCGGGTGCGGTTTATATTGACCCGGa < 1:3034201/100‑1 (MQ=255) aaTTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGTAACCCCTCATTGATTACTATGTTTGACCGCCCGACATTTTCTGCGGGTGCGGTTTATATTGACCCGGAt < 1:3030366/100‑1 (MQ=255) aaTTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGTAACCCCTCATTGATTACTATGTTTGACCGCCCGACATTTTCTGCGGGTGCGGTTTATATTGACCCGGAt < 1:1585819/100‑1 (MQ=255) aaTTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGTAACCCCGCATTGATTACTATGTTTGACCGCCCGACATTTTCTGCGGGTGCGGTTTATATTGACCCGGAt < 2:3908135/100‑1 (MQ=255) aTTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGTAACCCCTCATTGATTACTATGTTTGACCGCCCGACATTTTCTGCGGGTGCGGTTTATATTGACCCGGATg < 1:858647/100‑1 (MQ=255) aTTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGTAACCCCTCATTGATTACTATGTTTGACCGCCCGACATTTTCTGCGGGTGCGGTTTATATTGACCCGGATg < 1:1015950/100‑1 (MQ=255) tGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGTAACCCCTCATTGATTACTATGTTTGACCGCCCGACATTTTCTGCGGGTGCGGTTTATATTGACCCGGATGTa > 2:2152037/1‑100 (MQ=255) gCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGTAACCCCTCATTGATTACTATGTTTGACCGCCCGACATTTTCTGCGGGTGCGGTTTATATTGACCCGGATGTaa > 2:1137405/1‑100 (MQ=255) ccGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGTAACCCCTCATTGATTACTATGTTTGACCGCCCGACATTTTCTGCGGGTGCGGTTTATATTGACCCGGATGTaaa < 1:1231293/100‑1 (MQ=255) ccGATGATGCAGATAACGTCAGCCGTAACCCCGCATTGATTACTATGTTTGACCGCCCGACATTTTCTGCGGGTGCGGTTTATATTGACCCGGATGTaaa > 1:2713347/1‑100 (MQ=255) cGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGTAACCCCGCATTGATTACTATGTTTGACCGCCCGACATTTTCTGCGGGTGCGGTTTATATTGACCCGGATGTAAat < 2:1488368/100‑1 (MQ=255) gatgatGCAGGTAACGTCAGCCGTAACCCCGCATTGATTACTATGTTTGACCGCCCGACATTTTCTGCGGGTGCGGTTTATATTGACCCGGATGTAAata < 2:1606333/100‑1 (MQ=255) gatgatGCAGGTAACGTCAGCCGTAACCCCGCATTGATTACTATGTTTGACCGCCCGACATTTTCTGCGGGTGCGGTTTATATTGACCCGGATGTAAata > 2:3647887/1‑100 (MQ=255) atgatgCAGGTAACGTCAGCCGTAGCTCCGCATTGGGTACTGTGTTGGCCCGCCCGACATTTGCTGCGGGTGCGGTTTATATTGACCCGGATGTAAatct < 2:1854385/100‑3 (MQ=255) atgCAGGTAACGTCAGCCGTAACCCCTCATTGATTACTATGTTTGACCGCCCGACATTTTCTGCGGGTGCGGTTTATATTGACCCGGATGTAAATATCAg > 2:3660718/1‑100 (MQ=255) atgCAGGTAACGTCAGCCGTAACCCCGCATTGATTACTATGTTTGACCGCCCGACATTTTCTACGGGTGCGGTTTATATTGACCCGGATGTAAATATCAg > 1:2409094/1‑100 (MQ=255) gCAGGTAACGTCAGCCGTAACCACTCATTGATTACTATGTTTGACCGTCCGACATTTTCTGCGGGTGCGGTTTATATTGACCCGGATGTAAATATCAGCg < 2:2795731/100‑1 (MQ=255) cAGGTAACGTCAGCCGTAACCCCTCATTGATTACTATGTTTGACCGCCCGACATTTTCTGCGGGTGCGGTTTATATTGACCCGGATGTAAATATCAGCgg < 1:331178/100‑1 (MQ=255) cAGGTAACGTCAGCCGTAACCCCGCATTGATTACTATGTTTGACCGCCCGACATTTTCTGCGGGTGCGGTTTATATTGACCCGGATGTAAATATCAGCgg < 1:869406/100‑1 (MQ=255) gTAACGTCAGCCGTAACCCCTCATTGATTACTATGTTTGACCGCCCGACATTTTCTGCGGGTGCGGTTTATATTGACCCGGATGTAAATATCAGCGGAAc > 2:1675713/1‑100 (MQ=255) gTAACGTCAGCCGTAACCCCGCATTGATTACTATGTTTGACCGCCCGACATTTTCTGCGGGTGCGGTTTATATTGACCCGGATGTAAATATCAGCGGAAc < 1:1423271/100‑1 (MQ=255) aaCGTCAGCCGTAACCCCTCATTGATTACTATGTTTGACCGCCCGACATTTTCTGCGGGTGCGGTTTATATTGACCCGGATGTAAATATCAGCGGAACGt < 1:2457840/100‑1 (MQ=255) aCGTCAGCCGTAACCCCTCATTGATTACTATGTTTGACCGCCCGACATTTTCTGCGGGTGCCGTTTATATTGACCCGGATGTAAATTTCAGCGGAACGtc < 2:2550542/100‑1 (MQ=255) cGTCAGCCGTAACCCCTCATTGATTACTATGTTTGACCGCCCGACATTTTCTGCGGGTGCGGTTTATATTGACCCGGATGTAAATATCAGCGGAACGtct < 2:4018306/100‑1 (MQ=255) cGTCAGCCGTAACCCCTCATTGATTACTATGTTTGACCGCCCGACATTTTCTGCGGGTGCGGTTTATATTGACCCGGATGTAAATATCAGCGGAACGtct < 2:2013464/100‑1 (MQ=255) gTCAGCCGTAACCCCTCATTGATTACTATGTTTGACCGCCCGACATTTTCTGCGGGTGCGGTTTATATTGACCCGGATGTAAATATCAGCGGAACGtctc > 1:1701348/1‑100 (MQ=255) gTCAGCCGTAACCCCGCATTGATTACTATGTTTGACCGCCCGACATTTTCTGCGGGTGCGGTTTATATTGACCCGGATGTAAATATCAGCGGAACGtctc > 2:3364765/1‑100 (MQ=255) gTCAGCCGTAACCCCGCATTGATTACTATGTTTGACCGCCCGACATTTTCTGCGGGTGCGGTTTATATTGACCCGGATGTAAATATCAGCGGAACGtctc > 2:3364898/1‑100 (MQ=255) gTCAGCCGTAACCCCGCATTGATTACTATGTTTGACCGCCCGACATTTTCTGCGAGTGCGGTTTATATTGACCCGGATGTAAACATCAGCGGAACGtctc > 2:3833716/1‑100 (MQ=255) tCAGCCGTAACCCCTCATTGATTACTATGTTTGACCGCCCGACATTTTCTGCGGGTGCGGTTTATATTGACCCGGATGTAAATATCAGCGGAACGTCTcc < 1:805329/100‑1 (MQ=255) tCAGCCGTAACCCCGCATTGATTACTATGTTTGACCGCCCGACATTTTCTGCGGGTGCGGTTTATATTGACCCGGATGTAAATATCAGCGGAACGTCTcc < 1:1894575/100‑1 (MQ=255) cAGCCGTAACCCCTCATTGATTACTATGTTTGACCGCCCGACATTTTCTGCGGGTGCGGTTTATATTGACCCGGATGTAAATATCAGCGGAACGTCTCCa < 1:3524252/100‑1 (MQ=255) cAGCCGTAACCCCTCATTGATTACTATGTTTGACCGCCCGACATTTTCTGCGGGTGCGGTTTATATTGACCCGGATGTAAATATCAGCGGAACGTCTCCa > 2:651159/1‑100 (MQ=255) cAGCCGTAACCCCGCATTGATTACTATGTTTGACCGCCCGACATTTTCTTCGGGTGCGGTTTATATTGACCCGGATGTAAATATCCGCGGAACGTCTcc > 2:925131/1‑99 (MQ=255) gCCGTAACCCCGCCTTGATTACTATGTTTGACCGCCCGACATTTTCTGCGGGTGCGGGTGATATTGACCGGGCTGTAAATATCAGCGGAACGTCTCCATc > 1:483797/1‑100 (MQ=255) gCCGTAACCCCGCATTGATTACTATGTTTGACCGCCCGACATTTTCTGCGGGTGCGGTTTATATTGACCCGGATGTAAATATCAGCGGAACGTCTCCATc > 2:1389080/1‑100 (MQ=255) cGTAACCCCTCATTGATTACTATGTTTGACCGCCCGACATTTTCTGCGGGTGCGGTTTATATTGACCCGGATGTAAATATCAGCGGAACGTCTCCATCTg > 2:1725533/1‑100 (MQ=255) cGTAACCCCGCATTGATTACTATGTTTGACCGCCCGACATTTTCTGCGGGTGCGGTTTATATTGACCCGGATGTAAATATCAGCGGAACGTCTCCATCTg > 1:857287/1‑100 (MQ=255) gTAACCCCTCATTGATTACTATGTTTGACCGCCCGACATTTTCTGCGGGTGCGGTTTATATTGACCCGGATGTAAATATCAGCGGAACGTCTCCATCTgg < 2:140158/100‑1 (MQ=255) tAACCCCTCATTGATTACTATGTGTGACCGCCCGACATTTTCTGCGGGTGCGGTTTATATTGACCCGGATGTAAATATCAGCGGAACGTCTCCATCTGGt < 1:782828/100‑1 (MQ=255) agccccTCATTGTTTACTACGTTTGACCGCCCGACATTTTCTGCGGCGGTGGTTTATATTGGCCCGGATGTAAATATCAGCCGAACGTCTCCATCTGGTc < 2:323158/98‑1 (MQ=255) cccGCATTGATTACTATGTTTGACCGCCCGACATTTTCTGCGGGTGCGGTTTATATTGACCCGGATGTAAATATCAGCGGAACGTCTCCATCTGGTCGTa > 2:3079784/1‑100 (MQ=255) cccGCATTGATTACTATGTTTGACCGCCCGACATTTTCTGCGGGTGCGGTTTATATTGACCCGGATGTAAATATCAGCGGAACGTCTCCATCTGGTCGTa > 1:2202744/1‑100 (MQ=255) cccGCATTGATTACTATGTTTGACCGCCCGACATTTTCTGCGGGTGCGGTTTATATTGACCCGGATGTAAATATCAGCGGAACGTCTCCATCTGGTCGTa > 1:2901252/1‑100 (MQ=255) gCATTGATTACTATGTTTGACCGCCCGACATTTTCTGCGGGTGCGGTTTATATTGCCCCGGATGTAAATATCAGCGGAACGTCTCCATCTGGTCGTAGcc < 2:9103/100‑1 (MQ=255) | GGCTTTCAGTTAAACGAATTTTCTTCCTCTGGCCTGGGCCGGGCTTATTCAGGGGAAGGCGCAATTGCCGATGATGCAGGTAACGTCAGCCGTAACCCCGCATTGATTACTATGTTTGACCGCCCGACATTTTCTGCGGGTGCGGTTTATATTGACCCGGATGTAAATATCAGCGGAACGTCTCCATCTGGTCGTAGCC > NC_000913/2461384‑2461582 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |