| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,759,132 | A→G | 55.5% | I50V (ATT→GTT) | yfjI → | CP4‑57 prophage; uncharacterized protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,759,132 | 0 | A | G | 55.5% | 83.1 / 225.0 | 195 | I50V (ATT→GTT) | yfjI | CP4‑57 prophage; uncharacterized protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (49/38); new base G (50/58); total (99/96) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.95e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 196 total aligned reads displayed.
AGGAATGCAATTTATGAAGTGGAACAGCATACGCAGGCCCCTCAAGGTTTGATTGCTGCTTCTGCTCTTGGGGTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGATTGATGTTTGCCGATTGAATAATCTACGTGGCCCGGTATCACTTTTCTTAATGACTCTGGCTGAATCAGGTGAACGTAAGAGTACGGTTGATAAAC > NC_000913/2759033‑2759228 | aGGAATGCAATTTATGAAGTGGAACAGCATACGCAGGCCCCTCAAGGTTTGATTGCTGCTTCTGCTCTTGGGGTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGa > 1:1487043/1‑100 (MQ=255) gAATGCAATTTATGAAGTGGAACAGCATACGCAGGCCCCTCAAGGTTTGATTGCTGCTTCTGCTCTTGGGGTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGGtt < 1:1066403/100‑1 (MQ=255) gAATGCAATTTATGAAGTGGAACAGCATACGCAGGCCCCTCAAGGTTTGATTGCTGCTTCTGCTCTTGGGGTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGGtt < 2:2080484/100‑1 (MQ=255) aTGCAATTTATGAAGTGGAACAGCCTACGCAGGCCCCTCAAGTTTTGATTGCTGCTTCTGCTCTTGGGGTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGATTGa < 2:359178/100‑1 (MQ=255) aTGCAATTTATGAAGTGGAACAGCATACGCAGGCCCCTCAAGGTTTGATTGCTGCTTCTGCTCTTGGGGTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGGTTGa > 1:1433199/1‑100 (MQ=255) tGCAATTTATGAAGTGGAACAGCATACGCAGGCCCCTCAAGGTTTGATTGCTGCTTCTGCTCTTGGGGTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGATTGAt > 2:1203410/1‑100 (MQ=255) gCAATTTATGAAGTGGAACAGCATACGCAGGCCCCTCAAGGTTTGATTGCTGCTTCTGCTCTTGGGGTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGGTTGATg > 1:461258/1‑100 (MQ=255) cAATTTATGAAGTGGAACAGCATACGCAGGCCCCTCAAGGTTTGATTGCTGCTTCTGCTCTTGGGGTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGGTTGATGt > 2:649724/1‑100 (MQ=255) cAATTTATGAAGTGGAACAGCATACGCAGGCCCCTCAAGGTTTGATTGCTGCTTCTGCTCTTGGGGTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGATTGATGt > 1:2228534/1‑100 (MQ=255) aTTTATGAAGTGGAACAGCATACGCAGGCCCCTCAAGGTTTGATTGCTGCTTCTGCTCTTGGGGTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGATTGATGttt > 2:2238931/1‑100 (MQ=255) aTTTATGAAGTGGAACAGCATACGCAGGCCCCTCAAGGTTTGATTGCTGCTTCTGCTCTTGGGGTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGATTGATGttt < 1:1228269/100‑1 (MQ=255) tATGAAGTGGAACAGCATACGCAGGCCCCTCAAGGTTTGATTGCTGCTTCTGCTCTTGGGGTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGGTTGATGTTTGcc < 2:322661/100‑1 (MQ=255) tATGAAGTGGAACAGCATACGCAGGCCCCTCAAGGTTTGATTGCTGCTTCTGCTCTTGGGGTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGGTTGATGTTTGcc < 1:3469689/100‑1 (MQ=255) tATGAAGTGGAACAGCATACGCAGGCCCCTCAAGGTTTGATTGCTGCTTCTGCTCTTGGGGTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGGTTGATGTTTGcc > 1:2584187/1‑100 (MQ=255) aTGAAGTGGAACAGCATACGCAGGCCCCTCAAGGTTTGATTGCTGCTTCTGCTCTTGGGGTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGGTTGATGTTTGCCg > 2:551385/1‑100 (MQ=255) tGAAGTGGAACAGCATACGCAGGCCCCTCAAGGTTTGATTGCTGCTTCTGCTCTTGGGGTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGGTTGATGTTTGCCGa < 1:960576/100‑1 (MQ=255) tGAAGTGGAACAGCATACGCAGGCCCCTCAAGGTTTGATTGCTGCTTCTGCTCTTGGGGTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGGTTGATGTTTGCCGa > 2:177506/1‑100 (MQ=255) gAAGTGGAACAGCATACGCAGGCCCCTCAAGGTTTGATTGCTGCTTCTGCTCTTGGGGTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGGTTGATGTTTGCCGAt > 2:3175530/1‑100 (MQ=255) aaGTGGAACAGCATACGCAGGCCCCTCAAGGTTTGATTGCTGCTTCTGCTCTTGGGGTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGGTTGATGTTTGCCGAtt > 2:3651773/1‑100 (MQ=255) aaGTGGAACAGCATACGCAGGCCCCTCAAGGTTTGATTGCTGCTTCTGCTCTTGGGGTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGATTGATGTTTGCCGAtt > 1:3328036/1‑100 (MQ=255) aGTGGAACAGCATACGCAGGCCCCTCAAGGTTTGATTGCTGCTTCTGCTCTTGGGGTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGATTGATGTTTGCCGAtt > 2:2518189/1‑99 (MQ=255) aGTGGAACAGCATACGCAGGCCCCTCAAGGTTTGATTGCTGCTTCTGCTCTTGGGGTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGATTGATGTTTGCCGATTg < 2:229306/100‑1 (MQ=255) gTGGAACAGCATACGCAGGCCCCTCAAGGTTTGATTGCTGCTTCTACTCTTGGGGTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGGTTGATGTTTGCCGATTGa > 1:3177403/1‑100 (MQ=255) gTGGAACAGCATACGCAGGCCCATCAAGGTTTGATTGCTGCTTCTGCGCTTGGGGTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGATTGATGTTTGCCGATTg < 2:3337676/99‑1 (MQ=255) tGGAACAGCATACGCAGGCCCCTCAAGGTTTGATTGCTGCTTCTGCTCTTGGGGTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGGTTGATGTTTGCCGATTg < 2:1057822/98‑1 (MQ=255) tGGAACAGCATACGCAGGCCCCTCAAGGTTTGATTGCTGCTTCTGCTCTTGGGGTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGGTTGATGTTTGCCGATTGaa < 1:3278170/100‑1 (MQ=255) tGGAACAGCATACGCAGGCCCCTCAAGGTTTGATTGCTGCTTCTGCTCTTGGGGTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGATTGATGTTTGCCGATTGaa < 2:892007/100‑1 (MQ=255) ggAACAGCATACGCAGGCCCCTCAAGGTTTGATTGCTGCTTCTGCTCTTGGGGTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGGTTGATGTTTGCCGATTGaat > 1:2190044/1‑100 (MQ=255) ggAACAGCATACGCAGGCCCCTCAAGGTTTGATTGCTGCTTCTGCTCTTGGGGTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGGTTGATGTTTGCCGATTGaat > 2:3919572/1‑100 (MQ=255) ggAACAGCATACGCAGGCCCCTCAAGGTTTGATTGCTGCTTCTGCTCTTGGGGTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGATTGATGTTTGCCGATTGaat > 1:850612/1‑100 (MQ=255) gAACAGCATACGCAGGCCCCTCAAGGTTTGATTGCTGCTTCTGCTCTTGGGGTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGATTGATGTTTGCCGATTGgata > 1:3428982/1‑100 (MQ=255) gAACAGCATACGCAGGCCCCTCAAGGTTTGATTGCTGCTTCTGCTCTTGGGGTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGATTGATGTTTGCCGATTGaata < 1:3121920/100‑1 (MQ=255) aaCAGCATACGCAGGCCCCTCAAGGTTTGATTGCTGCTTCTGCTCTTGGGGTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGGTTGATGTTTGCCGATTGaataa > 2:3804663/1‑100 (MQ=255) ncAGCATACGCAGGCCCCTCAAGGTCTGATTGCTGCTTCTGCTCTTGGGGTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGGTTGATGTTTGCCGATTGaataat > 2:1444090/2‑100 (MQ=255) aGCATACGCAGGCCCCTCAAGGTTTGATTGCTGCTTCTGCTCTTGGGGTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGATTGATGTTTGCCGATTGAATAATCt > 1:4077477/1‑100 (MQ=255) cATACGCAGGCCCCTCAAGGTTTGATTGCTGCTTCTGCTCTTGGGGTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGGTTGATGTTTGCCGATTGAATAATCTAc > 1:3845394/1‑100 (MQ=255) cATACGCAGGCCCCTCAAGGTTTGATTGCTGCTTCTGCTCTTGGGGTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGATTGATGTTTGCCGATTGAATAATCTAc > 2:1952474/1‑100 (MQ=255) aTACGCAGGCCCCTCAAGGTTTGATTGCTGCTTCTGCTCTTGGGGTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGATTGATGTTTGCCGATTGAATAATCTACg < 1:53756/100‑1 (MQ=255) tACGCAGGCCCCTCAAGGTTTGATTGCTGCTTCTGCTCTTGGGGTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGGTTGATGTTTGCCGATTGAATAATCTACGt > 2:1683094/1‑100 (MQ=255) aCGCCGGCCAATCAATGTTTGATCGCTGCTTCTGCTCTTGGGGTAATTCCTCTTGCCTCTCAGAACCGGGTTGATGTTTGCCGATTGAATAATCtg < 2:2462122/96‑2 (MQ=255) cGCAGGCCCCTCAAGGTTTGATTGCTGCTTCTGCTCTTGGGGTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGGTTGATGTTTGCCGATTGAATAATCTACGTgg > 1:3561128/1‑100 (MQ=255) cGCAGGCCCCTCAAGGTTTGATTGCTGCTTCTGCTCTTGGGGTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGGTTGATGTTTGCCGATTGAATAATCTACGTgg > 1:2263259/1‑100 (MQ=255) aGGCCCCTCAAGGTTTGATTGCTGCTTCTGCTCTTGGGGTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGGTTGATGTTTGCCGATTGAATAATCTACGTGGccc < 2:794080/100‑1 (MQ=255) gCCCCTCAAGGTTTGATTGCTGCTTCTGCTCTTGGGGTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGGTTGATGTTTGCCGATTGAATAATCTACGTGGCCCgg > 1:3667309/1‑100 (MQ=255) ccccTCAAGGTTTGATTGCTGCTTCTGCTCTTGGGGTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGATTGATGTTTGCCGATTGAATAATCTACGTGGCCCGGt > 2:1333513/1‑100 (MQ=255) cccTCAAGGTTTGATTGCTGCTTCTGCTCTTGGGGTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGATTGATGTTTGCCGATTGAATAATCTACGTGGCCCGGTa < 2:2762111/100‑1 (MQ=255) ccTCAATGTTTGATTGCTGCTTCTGCTATTGGGGTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGGTTGATGTTTGCCGATTGAATAATCTACGTGGCCCg < 2:2700374/96‑1 (MQ=255) ccTCAAGGTTTGATTGCTGCTTCTGCTCTTGGGGTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGATTGATGTTTGCCGATTGAATAATCTACGTGGCCCGGt > 2:2029308/1‑98 (MQ=255) ccTCAAGGTTTGATTGCTGCTTCTGCTCTTGGGGTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGATTGATGTTTGCCGATTGAATAATCTACGTGGCCCGGTAt > 2:1551452/1‑100 (MQ=255) cTCAACGTTTGATTGCTGCTTCTGCTCTTGGTGTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGGTTGATGTTTGCCGCTTGCATACTCTACGTGGCTCGCTAt > 2:3893249/1‑99 (MQ=255) tCAAGGTTTGATTGCTGCTTCTGCTCTTGGGGTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGGTTGATGTTTGCCGATTGAATAATCTACGTGGCCCGGTATCa > 1:1597830/1‑100 (MQ=255) aaGGTTTGATTGCTGCTTCTGCTCTTGGGGTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGATTGATGTTTGCCGATTGAATAATCTACGTGGCCCGGTATCACt > 1:2664170/1‑100 (MQ=255) ggTTTGATTGCTGCTTCTGCTCTTGGGGTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGGTTGATGTTTGCCGATTGAATAATCTACGTGGCCCGGTATCACttt > 2:338474/1‑100 (MQ=255) ggTTTGATTGCTGCTTCTGCTCTTGGGGTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGGTTGATGTTTGCCGATTGAATAATCTACGTGGCCCGGTATCACttt > 1:1177088/1‑100 (MQ=255) ggTTTGATTGCTGCTTCTGCTCTTGGGGTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGGTTGATGTTTGCCGATTGAATAATCTACGTGGCCCGGTATCACttt > 2:3463051/1‑100 (MQ=255) ggTTTGATTGCTGCTTCTGCTCTTGGGGTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGGTTGATGTTTGCCCATTGAATAATCTACGTGGCCCGGTATCACttt < 1:3919598/100‑1 (MQ=255) gTTTGATTGCTGCTTCTGCTCTTGGGGTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGGTTGATGTTTGCCGATTGAATAATCTACGTGGCCCGGTATCACtttt < 1:3255420/100‑1 (MQ=255) tttGATTGCTGCTTCTGCTCTTGGGGTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGGTTGATGTTTGCCGATTGAATAATCTACGTGGCCCGGTATCACTTTTc < 1:2140189/100‑1 (MQ=255) tGATTGCTGCTTCTGCTCTTGGGGTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGATTGATGTTTGCCGATTGAATAATCTACGTGGCCCGGTATCACTTTTCtt < 2:2657871/100‑1 (MQ=255) gATTGCTGCTTCTGCTCTTGGGGTTCTGTCTCTTGCCTGTAAGAACCGGGTTGATGTTTGCCGCTTGAATAATCTACGTGGCCCGGTATCACTTTTCTTa < 2:973396/100‑1 (MQ=255) gATTGCTGCTTCTGCTCTTGGGGTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGATTGATGTTTGCCGATTGAATAATCTACGTGTCCCGGTATCACTTTTCTTa < 2:469118/100‑1 (MQ=255) aTTGCTGCTTCTGCTCTTGGGGTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGGTTGATGTTTGCCGATTGAATAATCTACGTGGCCCGGTATCACTTTTCTTaa < 1:3463073/100‑1 (MQ=255) aTTGCTGCTTCTGCTCTTGGGGTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGATTGATGTTTGCCGATTGAATAATCTACGTGGCCCGGTATCACTTTTCTTaa > 1:3568920/1‑100 (MQ=255) tgctgcTTCTGCTCTTGGGGTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGGTTGATGTTTGCCGATTGAATAATCTACGTGGCCCGGTATCACTTTTCTTAATg < 2:1900668/100‑1 (MQ=255) tgctgcTTCTGCTCTTGGGGTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGATTGATGTTTGCCGATTGAATAATCTACGTGGCCCGGTATCACTTTTCTTAATg < 1:2317027/100‑1 (MQ=255) gctTCTGCTCTTGGGGTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGATTGATGTTTGCCGATTGAATAATCTACGTGGCCCGGTATCACTTTTCTTAATGActc < 2:864059/100‑1 (MQ=255) tGCTCTTGGGGTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGGTTGATGTTTGCCGATTGAATAATCTACGTGGCCCGGTATCACTTTTCTTAATGACTCTGGCt < 1:819738/100‑1 (MQ=255) tGCTCTTGGGGTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGGTTGATGTTTGCCGATTGAATAATCTACGTGGCCCGGTATCACTTTTCTTAATGACTCTGGCt < 1:2063820/100‑1 (MQ=255) tGCTCTTGGGGTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGGTTGATGTTTGCCGATTGAATAATCTACGTGGCCCGGTATCACTTTTCTTAATGACTCTGGCt < 2:314718/100‑1 (MQ=255) tGCTCTTGGGGTAATTTCTCTTCCCTGTCAGAACCGGGTTGATGTTTGCCGATTAAATCATCTACGTGGCCCGCTATCACTTTTCTTAATAACTCTgc > 2:800610/1‑97 (MQ=255) gCTCTTGGGGTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGGTTGATGTTTGCCGATTGAATAATCTACGTGGCCCGGTATCACTTTTCTTAATGACTCTGGCTg < 2:1177080/100‑1 (MQ=255) ctctTGGGGTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGGTTGATGTTTGCCGATTGAATAATCTACGTGGCCCGGTATCACTTTTCTTAATGACTCTGGCTg > 2:3664426/1‑99 (MQ=255) tGGGGTAATTTCTCTTGCCTGTCATAACCGGGTTGATGTTTGCCGATTGAATAATCTACGTGGCCCGGTATCACTTTTCTTAATGACTCTGGCTGAATCa < 2:628010/100‑1 (MQ=255) tGGGGTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGGTTGATGTTTGCCGATTGAATAATCTACGTGGCCCGGTATCACTTTTCTTAATGACTCTGGCTGAATCa < 1:2547912/100‑1 (MQ=255) tGGGGTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGGTTGATGTTTGCCGATTGAATAATCTACGTGGCCCGGTATCACTTTTCTTAATGACTCTGGCTGAATCa < 1:976180/100‑1 (MQ=255) tGGGGTAATTTCTCTTGACTGTCAGAACCGGATTGATGTTTGCCGATTGAATAATCTACGTGGCACGGTATCACTTTTCTTAATGACTCTGGTTGAATCa > 2:2183860/1‑100 (MQ=255) ggggTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGGTTGATGTTTGCCGATTGAATAATCTACGTGGCCCGGTATCACTTTTCTTAATGACTCTGGCTGAATCAg < 2:1057478/100‑1 (MQ=255) ggggTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGGTTGATGTTTGCCGATTGAATAATCTACGTGGCCCGGTATCACTTTTCTTAATGACTCTGGCTGAATCAg < 2:3742590/100‑1 (MQ=255) ggTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGATTGATGTTTGCCGATTGAATAATCTACGTGGCCCGGTATCACTTTTCTTAATGACTCTGGCTGAATCAGGt > 1:2004455/1‑100 (MQ=255) ggTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGATTGATGTTTGCCGATTGAATAATCTACGTGGCCCGGTATCACTTTTCTTAATGACTCTGGCTGAATCAGGt < 1:2483006/100‑1 (MQ=255) aTTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGATTGATGTTTGCCGATTGAATAATCTACGTGGCCCGGTATCACTTTTCTTAATGACTCTGGCTGAATCAGGTGAAc > 2:1641556/1‑100 (MQ=255) tttCTCTTGCCTGTCAGAACCGGGTTGATGTTTGCCGATTGAATAATCTACGTGGCCCGGTATCACTTTTCTTAATGACTCTGGCTGAATCAGGTGAACg > 1:3947663/1‑100 (MQ=255) tttCTCTTGCCTGTCAGAACCGGGTTGATGTTTGCCGATTGAATAATCTACGTGGCCCGGTATCACTTTTCTTAATGACTCTGGCTGAATCAGGTGAACg > 2:2431406/1‑100 (MQ=255) tttCTCTTGCCTGTCAGAACCGGGTTGATGTTTGCCGATTGAATAATCTACGTGGCCCGGTATCACTTTTCTTAATGACTCTGGCTGAATCAGGTGAACg < 1:2408500/100‑1 (MQ=255) tctTGCCTGTCAGAACCGGATTGATGTTTGCCGATTGAATAATCTACGTGGCCCGGTATCACTTTTCTTAATGACTCTGGCTGAATCAGGTGAACGTAag < 1:2996293/100‑1 (MQ=255) tGCCTGTCAGAACCGGGTTGATGTTTGCCGATTGAATAATCTACGTGGCCCGGTATCACTTTTCTTAATGACTCTTGCTGAATCAGGTGAACGTAAGAGt > 2:67787/1‑100 (MQ=255) tGCCTGTCAGAACCGGATTGATGTTTGCCGATTGAATACTCTACGTGGCCCGGTATCAATTTTCTTAATGACTCTGGCTGAATCAGGTGAACGTaa > 2:4050418/1‑96 (MQ=255) tGCCTGTCAGAACCGGATTGATGTTTGCCGATTGAATAATCTACGTGGCCCGGTATCACTTTTCTTAATGACTCTGGCTGAATCAGGTGAACGTAAGAGt > 1:717026/1‑100 (MQ=255) tGCCTGTCAGAACCGGATTGATGTTTGCCGATTGAATAATCTACGTGGCCCGGTATCACTTTTCTTAATGACTCTGGCTGAATCAGGTGAACGTAAGAGt > 1:1522108/1‑100 (MQ=255) tGTCAGAACCGGGTTGATGTTTGCCGATTGAATGATCTACGTGGCCCGGTATCACTTTTCTTAATGACTCTGGCTGAATCAGGTGAACGTAAGAGTACgg > 2:2734020/1‑100 (MQ=255) tGTCAGAACCGGGTTGATGTTTGCCGATTGAATAATCTACGTGGCCCGGTATCACTTTTCTTAATGACTCTGGCTGAATCAGGTGAACGTAAGAGTACgg < 1:1369666/100‑1 (MQ=255) cAGAACCGGGTTGATGTTTGCCGATTGAATAATCTACGTGGCCCGGTATCACTTTTCTTAATGACTCTGGCTGAATCAGGTGAACGTAAGAGTACGGTTg > 1:1056560/1‑100 (MQ=255) cAGAACCGGGTTGATGTTTGCCGATTGAATAATCTACGTGGCCCGGTATCACTTTTCTTAATGACTCTGGCTGAATCAGGTGAACGTAAGAGTACGGTTg < 1:605074/100‑1 (MQ=255) cAGAACCGGATTGATGTTTGCCGATTGAATAATCTACGTGGCCCGGTATCACTTTTCTTAATGACTCTGGCTGAATCAGGTGAACGTAAGAGTACGGTTg > 1:3192360/1‑100 (MQ=255) gAACCGGGTTGATGTTTGCCGATTGAATAATCTACGTGGCCCGGTATCACTTTTCTTAATGACTCTGGCTGAATCAGGTGAACGTAAGAGTACGGTTGa > 2:1616276/1‑99 (MQ=255) gAACCGGGTTGATGTTTGCCGATTGAATAATCTACGTGGCCCGGTATCACTTTTCTTAATGACTCTGGCTGAATCAGGTGAACGTAAGAGTACGGTTGAt > 2:376718/1‑100 (MQ=255) aaCCGGGTTGATGTTTGCCGATTGAATAATCTACGTGGCCCGGTATCACTTTTCTTAATGACTCTGGCTGAATCAGGTGAACGTAAGAGTACGGTTGATa < 1:1752836/100‑1 (MQ=255) ccGGGTTGATGTTTGCCGATTGAATAATCTACGTGGCCCGGTATCACTTTTCTTAATGACTCTGGCTGAATCAGGTGAACGTAAGAGTACGGTTGATaaa > 1:1864374/1‑100 (MQ=255) ccGGATTGATGTTTGCCGATTGAATAATCTACGTGGCCCGGTATCACTTTTCTTAATGACTCTGGCTGAATCAGGTGAACGTAAGAGTACGGTTGATaaa > 1:3538516/1‑100 (MQ=255) cGGGTTGATGTTTGCCGATTGAATAATCTACGTGGCCCGGTATCACTTTTCTTAATGACTCTGGCTGAATCAGGTGAACGTAAGAGTACGGTTGATAAAc < 1:659095/100‑1 (MQ=255) | AGGAATGCAATTTATGAAGTGGAACAGCATACGCAGGCCCCTCAAGGTTTGATTGCTGCTTCTGCTCTTGGGGTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGATTGATGTTTGCCGATTGAATAATCTACGTGGCCCGGTATCACTTTTCTTAATGACTCTGGCTGAATCAGGTGAACGTAAGAGTACGGTTGATAAAC > NC_000913/2759033‑2759228 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |