| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,852,356 | T→A | 100% | L74Q (CTG→CAG) | hypD → | hydrogenase maturation protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,852,356 | 0 | T | A | 98.8% | 583.1 / ‑2.5 | 174 | L74Q (CTG→CAG) | hypD | hydrogenase maturation protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (2/0); new base A (98/73); total (100/74) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.09e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.13e-01 | |||||||||||
Only 100 of 174 total aligned reads displayed.
GGCGGTCATACCCACGCTATCTTTAAATTCGGCCTCGACCAGTTACTGCCGGAAAACGTTGAGTTTATCCACGGTCCGGGGTGCCCGGTGTGCGTACTGCCGATGGGTAGAATCGACACCTGCGTGGAGATTGCCAGCCATCCGGAAGTCATCTTCTGTACCTTTGGCGACGCCATGCGCGTGCCGGGGAAAC > NC_000913/2852259‑2852451 | ggCGGTCATACCCACGCTATCTTTAAATTCGGCCTCGACCAGTTACTGCCGGAAAACGTTGAGTTTATCCACGGTCCGGGGTGCCCGGTGTGCGTACAGc < 1:1569162/100‑1 (MQ=255) gCGGTCATACCCACGCTATCTTTAAATTCGGCCTCGACCAGTTACTGCCGGAAAACGTTGAGTTTATCCACGGTCCGGGGTGCCCGGTGTGCGTACAGcc < 2:2582116/100‑1 (MQ=255) ggTCATACCCACGCTATCTTTAAATTCGGCCTCGACCAGTTACTGCCGGAAAACGTTGAGTTTACCCACGGTCCGGGGTGCCCGGTGTGCGTACAGCCGa > 1:1014110/1‑100 (MQ=255) gTCATACCCACGCTATCTTTAAATTCGGCCTCGACCAGTTACTGCCGGAAAACGTTGCGTTTATCCACGGTCCGGGGTGCCCGGTGTGCGTACAGCCGAt > 2:3096280/1‑100 (MQ=255) gTCATACCCACGCTATCTTTAAATTCGGCCTCGACCAGTTACTGCCGGAAAACGTTGAGTTTATCCACGGTCCGGGGTGCCCGGTGTGCGTACAGCCGAt < 1:543579/100‑1 (MQ=255) gTCATACCCACGCTATCTTTAAATTCGGCCTCGACCAGTTACTGCCGGAAAACGTTGAGTTTATCCACGGTCCGGGGTGCCCGGTGTGCGTACAGCCGAt < 1:232753/100‑1 (MQ=255) tCATACCCACGCTATCTTTAAATTCGGCCTCGACCAGTTACTGCCGGAAAACGTTGAGTTTATCCACGGTCCGGGGTGCCCGGTGTGCGTACAGCCGATg < 1:3119977/100‑1 (MQ=255) cATACCCACGCTATCTTTAAATTCGGCCTCGACCAGTTACTGCCGGAAAACGTTGAGTTTATCCACGGTCCGGGGTGCCCGGTGTGCGTACAGCCGATgg > 2:3101030/1‑100 (MQ=255) aTACCCACGCTATCTTTAAATTCGGCCTCGACCAGTTACTGCCGGAAAACGTTGAGTTTATCCACGGTCCGGGGTGCCCGGTGTGCGTACAGCCGATggg < 1:346386/100‑1 (MQ=255) aTACCCACGCTATCTTTAAATTCGGCCTCGACCAGTTACTGCCGGAAAACGTTGAGTTTATCCACGGTCCGGGGTGCCCGGTGTGCGTACAGCCGATggg < 1:228721/100‑1 (MQ=255) aTACCCACGCTATCTTTAAATTCGGCCTCGACCAGTTACTGCCGGAAAACGTTGAGTTTATCCACGGTCCGGGGTGCCCGGTGTGCGTACAGCCGATggg < 2:2818698/100‑1 (MQ=255) aTACCCACGCTATCGTTAAAGTCGGCCTCGACCAGTTACTGCCGGAAAGCGTTACGTTTATCCACGGTCCGGGGTGCCCGGTGGGCGTACAGCCGATggg < 2:734222/100‑1 (MQ=255) tACCCACGCTATCTTTAAATTCGGCCTCGACCAGTTACTGCCGGAAAACGTTGAGTTTATCCACGGTCCGGGGTGCCCGGTGTGCGTACAGCCGATGGGt > 1:3595228/1‑100 (MQ=255) gCTATCTTTAAATTCGGCCTCGACCAGTTACTGCCGGAAAACGTTGAGTTTATCCACGGTCCGGGGTGCCCGGTGTGCGTACAGCCGATGGGTAGAATCg < 1:1705504/100‑1 (MQ=255) cTATCTTTAAATTCGGCCTCGACCAGTTACTGCCGGAAAACGTTGAGTTTATCCACGGTCCGGGGTGCCCGGTGTGCGTACAGCCGATGGGTAGAATCGa > 1:1803073/1‑100 (MQ=255) cTTTAAATTCGGCCTCGACCAGTTACTGCCGGAAAACGTTGAGTTTATCCACGGTCCGGGGTGCCCGGTGTGCGTACAGCCGATGGGTAGAATCGACAcc < 1:3582189/100‑1 (MQ=255) cTTTAAATTCGGCCTCGACCAGTTACTGCCGGAAAACGTTGAGTTTATCCACGGTCCGGGGTGCCCGGTGTGCGTACAGCCGATGGGTAGAATCGACAcc > 1:1938242/1‑100 (MQ=255) cTTTAAATTCGGCCTCGACCAGTTACTGCCGGAAAACGTTGAGTTTATCCACGGTCCGGGGTGCCCGGTGTGCGTACAGCCGATGGGTAGAATCGACAcc > 1:3960259/1‑100 (MQ=255) tttAAATTCGGCCTCGACCAGTTACTGCCGGAAAACGTTGAGTTTATCCACGGTCCGGGGTGCCCGGTGTGCGTACAGCCGATGGGTAGAATCGACAcc < 2:2320266/99‑1 (MQ=255) tttAAATTCGGCCTCGACCAGTTACTGCCGGAAAACGTTGAGTTTATCCACGGTCCGGGGTGCCCGGTGTGCGTACAGCCGATGGGTAGAATCGACACCt > 2:2918774/1‑100 (MQ=255) ttAAATTCGGCCTCGACCAGTTACTGCCGGAAAACGTTGAGTTTATCCACGGTCCGGGGTGCCCGGTGTGCGTACAGCCGATGGGTAGAATCGacacaga > 1:3002176/1‑97 (MQ=255) aaaTTCGGCCTCGACCAGTTACTGCCGGAAAACGTTGAGTTTATCCACGGTCCGGGGTGCCCGGTGTGCGTACAGCCGATGGGTAGAATCGACACCTGCg < 2:1720417/100‑1 (MQ=255) aTTCGGCCTCGACCAGTTACTGCCGGAAAACGTTGAGTTTATCCACGGTCCGGGGTGCCCGGTGTGCGTACAGCCGATGGGTAGAATCGACACCTGCGTg < 2:1475905/100‑1 (MQ=255) aTTCGGCCTCGACCAGTTACTGCCGGAAAACGTTGAGTTTATCCACGGTCCGGGGTGCCCGGTGTGCGTACAGCCGATGGGTAGAATCGACACCTGCGTg > 2:3621819/1‑100 (MQ=255) aTTCGGCCTCGACCAGTTACTGCCGGAAAACGTTGAGTTTATCCACGGTCCGGGGTGCCCGGTGTGCGTACAGCCGATGGGTAGAATCGACACCTGCGTg < 1:1394929/100‑1 (MQ=255) aTTCGGCCTCGACCAGTTACTGCCGGAAAACGTTGAATTTATCCACGGTCCGGGGTGCCCGGTGTGCGTACAGCCGATGGGTAGAATCGACACCTGCGTg > 1:2913321/1‑100 (MQ=255) tCGGCCTCGACCAGTTACTGCCGGAAAACGTTGAGTTTATCCACGGTCCGGGGTGCCCGGTGTGCGTACAGCCGATGGGTAGAATCGACACCTGCGTGga < 2:2087530/100‑1 (MQ=255) tCGGCCTCGACCAGTTACTGCCGGAAAACGTTGAGTTTATCCACGGTCCGGGGTGCCCGGTGTGCGTACAGCCGATGGGTAGAATCGACACCTGCGTGga < 2:1177785/100‑1 (MQ=255) tCGGCCTCGACCAGTTACTGCCGGAAAACGTTGAGTTTATCCACGGTCCGGGGTGCCCGGTGTGCGTACAGCCGATGGGTAGAATCGACACCTGCGTGga < 1:573145/100‑1 (MQ=255) gCCTCGCCCAGTTACTGCCGGAAAACGTTGAGTTTATCCTCGGTGCGGGGTGCGCGGTGTGCGTACAGCCGATGGGTAGGATCGACACCTGCGTgg < 2:2882968/96‑1 (MQ=255) gCCTCGACCAGTTACTGCCGGAAAACGTTGAGTTTATCCACGGTCCGGGGTGCCCGGTGTGCGTACAGCCGATGGGTAGAATCGACACCTGCGTGGAGAt > 1:1235997/1‑100 (MQ=255) gCCTCGACCAGTTACTGCCGGAAAACGTTGAGTTTATCCACGGTCCGGGGTGCCCGGTGTGCGTACAGCCGATGGGTAGAATCGACACCTGCGTGGAGAt > 1:1515511/1‑100 (MQ=255) ccTCGACCAGTTACTGCCGGAAAACGTTGAGTTTATCCACGGTCCGGGGTGCCCGGTGTGCGTACAGCCGATGGGTAGAATCGACACCTGCGTGGAGAtt > 1:1958009/1‑100 (MQ=255) ccTCGACCAGTTACTGCCGGAAAACGTTGAGTTTATCCACGGTCCGGGGTGCCCGGTGTGCGTACAGCCGATGGGTAGAATCGACACCTGCGTGGAGAtt > 1:3486630/1‑100 (MQ=255) ccTCGACCAGTTACTGCCGGAAAACGTTGAGTTTATCCACGGTCCGGGGTGCCCGGTGTGCGTACAGCCGATGGGTAGAATCGACACCTGCGTGGAGAtt > 1:3378185/1‑100 (MQ=255) cGACCAGTTACTGCCGGAAAACGTTTAGTTTATCCACGGTCCGGGGTGCCCCGTGTGCGTACAGCCGATGGGTAGAATCGACACCTGCGTGGAGATTgcc < 2:1806954/100‑1 (MQ=255) cgaGTTACTGCCGGAAAACGTGGCGTTAATCCACGGTCCGCGGTGCCCGGTGTGCGTACAGCCGATGGGTAGAATCGCCACCTGCGTGGAGATTgccag < 2:208759/97‑1 (MQ=255) ccAGTTACTGCCGGAAAACGTTGAGTTTATCCACGGTCCGGGGTGCCCGGTGTGCGTACAGCCGATGGGTAGAATCGACACCTGCGTGGAGATTgccagc < 1:987607/100‑1 (MQ=255) gTTACTGCCGGAAAACGTTGAGTTTATCCACGGTCCGGGGTGCCCGGTGTGCGTACAGCCGATGGGTAGAATCGACACCTGCGTGGAGATTGCCAGCCAt > 2:453828/1‑100 (MQ=255) cTGCCGGAAAACGTTGAGTTTATCCACGGTCCGGGGTGCCCGGTGTGCGTACAGCCGATGGGTAGAATCGACACCTGCGTGGAGATTGCCAGCCATCCgg > 2:3018165/1‑100 (MQ=255) tGCCGGAAAACGTTGAGTTTATCCACGGTCCGGGGTGCCCGGTGTGCGTACAGCCGATGGGTAGAATCGACACCTGCGTGGAGATTGCCAGCCATCCGGa > 2:3951729/1‑100 (MQ=255) gCCGGAAAACGTTGAGTTTATCCACGGTCCGGGGTGCCCGGTGTGCGTACAGCCGATGGGTAGAATCGACACCTGCGTGGAGATTgccagcca > 2:643020/1‑93 (MQ=255) gCCGGAAAACGTTGAGTTTATCCACGGTCCGGGGTGCCCGGTGTGCGTACAGCCGATGGGTAGAATCGACACCTGCGTGGAGATTGCCAGCCATCCGGaa > 1:3717154/1‑100 (MQ=255) gCCGGAAAACGTTGAGTTTATCCACGGTCCGGGGTGCCCGGTGTGCGTACAGCCGATGGGTAGAATCGACACCTGCGTGGAGATTGCCAGCCATCCGGaa > 2:3784449/1‑100 (MQ=255) gCCGGAAAACGTTGAGGTTATCCAGGGTCCGGGGTGCGCGGTGTGCGTACAGCCGATGGGTAGAATCGACACCTGCGTGGAGATTGCCAGCCATCCg > 2:1069043/1‑97 (MQ=255) gCCGGAAAACGTAGAGTTTATCCACGGTCCGGGGTGCCCGGTCTGCGTAAAGCCGATGGGTAGAATCGACACCTGCGTGGAGATTGCCAGCCATCCCGaa > 2:1201437/1‑100 (MQ=255) ccGGAAAACGTTGAGTTTATCCACGGTCCGGGGTGCCCGGTGTGCGTACAGCCGATGGGTAGAATCGACACCTGCGTGGAGATTGCCAGCCATCCGGaan < 1:3411160/100‑2 (MQ=255) ccGGAAAACGTTGAGTTTATCCACGGTCCGGGGTGCCCGGTGTGCGTACAGCCGATGGGTAGAATCGACACCTGCGTGGAGATTGCCAGCCATCCGGAAg < 2:2076248/100‑1 (MQ=255) cGGAAAACGTTGAGTTTATCCACGGTCCGGGGTGCCCGGTGTGCGTACAGCCGATGGGTAGAATCGACACCTGCGTGGAGATTGCCAGCCATCCGGAAGt > 1:1982455/1‑100 (MQ=255) ggAAAACGTTGAGTTTATCCACGGTCTGGGGTGCCCGGTGTGCGTACAGCCGATGGGTAGAATCGACACCTGCGTGGAGATTGCCAGCCATCCGGAAGTc > 1:2518709/1‑100 (MQ=255) ggAAAACGTTGAGTTTATCCACGGTCCGGGGTGCCCGGTGTGCGTACAGCCGATGGGTAGAATCGACACCTGCGTGGAGATTGCCAGCCATCCGGAAGt > 2:1153906/1‑99 (MQ=255) ggAAAACGTTGAGTTTATCCACGGTCCGGGGTGCCCGGTGTGCGTACAGCCGATGGGTAGAATCGACACCTGCGTGGAGATTGCCAGCCATCCGGAAGTc > 2:2138703/1‑100 (MQ=255) ggAAAACGTTGAGTTTATCCACGGTCCGGGGTGCCCGGTGTGCGTACAGCCGATGGGTAGAATCGACACCTGCGTGGAGATTGCCAGCCATCCGGAAGTc > 1:825005/1‑100 (MQ=255) gAAAACGTTGAGTTTATCCACGGTCCGGGGTGCCCGGTGTGCGTACAGCCGATGGGTAGAATCGACACCTGCGTGGAGATTGCCAGCCATCCGGAAGTCa > 1:292497/1‑100 (MQ=255) aaaaCGTTGAGTTTATCCACGGTCCGGGGTGCCCGGTGTGCGTACAGCCGATGGGTAGAATCGACACCTGCGTGGAGATTGCCAGCCATCCGGAAGTCAt > 2:1291804/1‑100 (MQ=255) aaaaCGTTGAGTTTATCCACGGTCCGGGGTGCCCGGTGTGCGTACAGCCGATGGGTAGAATCGACACCTGCGTGGAGATTGCCAGCCATCCGGAAGTCAt > 1:1322265/1‑100 (MQ=255) aaCGTTGAGTTTATCCACGGTCCGGGGTGCCCGGTGTGCGTACAGCCGATGGGTAGAATCGACACCTGCGTGGAGATTGCCAGCCATCCGGAAGTCAtct > 2:3697131/1‑100 (MQ=255) aCGTTGAGTTTATCCACGGTCCGGGGTGCCCGGTGTGCGTACAGCCGATGGGTAGAATCGACACCTGCGTGGAGATTGCCAGCCATCCGGAAGTCAtctt > 2:2738645/1‑100 (MQ=255) gTTGAGTTTATCCACGGTCCGGGGTGCCCGGTGTGCGTACAACCGATGGGTAGAATCGACACCTGCGTGGAGATTGCCAGCCATCCGGAAGTCAtcttct < 1:1888883/100‑1 (MQ=255) ttaaGTTTATCCACGGTCCGGGGTGCCCGGTGTGCGTACAGCCGATGGGTAGAATCGACACCTGCGTGGAGATTGCCAGCCATCCGGAAGTCATCTTCTg > 1:459579/4‑100 (MQ=255) ttGAGTTTATCCACGGTCCGGGGTGCCCGGTGTGCGTACAGCCGATGGGTAGAATCGACACCTGCGTGGAGCTTGCCAGCCCTCCGGAAGTCAtcttc > 2:813701/1‑98 (MQ=255) ttGAGTTTATCCACGGTCCGGGGTGCCCGGTGTGCGTACAGCCGATGGGTAGAATCCACACCTGCGTGGAGATTGCCAGCCATCCGGAAGTCATCTTCTg > 2:2641537/1‑100 (MQ=255) tGAGTTTATCCACGGTCCGGGGTGCCCGGTGGGCGTACGGCCGATGGGTAGAATCGACACCTGCGTGGAGATTGCCAGCCATCCGGAAGTCATCTTCTg < 2:1036689/99‑1 (MQ=255) gAGTTTATCCACGGTCCGGGGTGCCCGGTGTGCGTACAGCCGATGGGTAGAATCGACACCTGCGTGGAGATTGCCAGCCATCCGGAAGTCATCTTCTGTa > 2:3206252/1‑100 (MQ=255) aGTTTATCCACGGTCCGGGGTGCCCGGTGTGCGTACAGCCGATGGGTAGAGTCGACACCTGCGTGGAGATTGCCAGCCATCCGGAAGTCATCTTCTGTa > 2:3452254/1‑99 (MQ=255) aGTTTATCCACGGTCCGGGGTGCCCGGTGTGCGTACAGCCGATGGGTAGAATCGACACCTGCGTGGAGATTGCCAGCCATCCGGAAGTCATCTTCTGTAc > 1:3271651/1‑100 (MQ=255) aGTTTATCCACGGTCCGGGGTGCCCGGTGTGCGTACAGCCGATGGGTAGAATCGACACCTGCGTGGAGATTGCCAGCCATCCGGAAGTCATCTTCTGTAc < 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ccACGGTCCGGCGTGCCCGGTGTGCGTAAAGCCTATGGGTAGAATCGACACCTGCGTGGATATTGCCAGCCATCCGGAAGTCATCTTCTGTACCTTTGGc < 2:3460179/100‑1 (MQ=255) cACGGTCCGGGGTGCCCGGTGTGCGTACAGCCGATGGGTAGAATCGACACCTGCGTGGAGATTGCCAGCCATCCGGAAGTCATCTTCTGTACCTTTGGCg > 1:2665973/1‑100 (MQ=255) cACGGTCCGGGGTGCCCGGTGTGCGTACAGCCGATGGGTAGAATCGACACCTGCGTGGAGATTGCCAGCCATCCGGAAGTCATCTTCTGTACCTTTGGCg > 2:2956564/1‑100 (MQ=255) cACGGTCCGGGGTGCCCGGTGTGCGTACAGCCGATGGGTAGAATCGACACCTGCGTGGAGATTGCCAGCCATCCGGAAGTCATCTTCTGTACCTTTGGCg < 2:4008481/100‑1 (MQ=255) cGGTCCGGGGTGCCCGGTGTGCGTACAGCCGATGGGTAGAATCGACACCTGCGTGGAGATTGCCAGCCATCCGGAAGTCATCTTCTGTACCTTTGGCGAc < 1:3705515/100‑1 (MQ=255) tCCGGGGTGCCCGGTGTGCGTACAGCCGATGGGTAGAATCGACACCTGCGTGGAGATTGCCAGCCATCCGGAAGTCATCTTCTGTACCTTTGGCGACGcc < 1:71234/100‑1 (MQ=255) ccGGGGTGCCCGGTGTGCGTACAGCCGATGGGTAGAATCGACACCTGCGTGGAGATTGCCAGCCATCCGGAAGTCATCTTCTGTACCTTTGGCGACGCCa > 2:1692538/1‑100 (MQ=255) cGGGGTGCCCGGTGTGCGTACAGCTGAGGGGTAGAATCGACACCTGCGTGGAGATTGCCAGCCATCCGGAAGTCATCTTCTGTACCTTTGGCGACGCCa < 2:3378165/99‑1 (MQ=255) gTGCCCGGTGTGCGTACAGCCGATGGGTAGAATCGACACCTGCGTGGAGATTGCCAGCCATCCGGAAGTCATCTTCTGTACCTTTGGCGACGCCATgcgc < 1:1095306/100‑1 (MQ=255) tGCCCGGTGTGCGTACAGCCGATGGGTAGAATCGACACCTGCGTGGAGATTGCCAGCCATCCGGAAGTCATCTTCTGTACCTTTGGCGACGCCATGcgcg < 2:3595205/100‑1 (MQ=255) gCCCGGTGTGCGTACAGCCGATGGGTAGAATCGACACCTGCGTGGAGATTGCCAGCCATCCGGAAGTCATCTTCTGTACCTTTGGCGACGCCATGCGCGt > 2:2933959/1‑100 (MQ=255) cccGGTGTGCGTACAGCCGATGGGTAGAATCGACACCTGCGTGGAGATTGCCAGCCATCCGGAAGTCATCTTCTGTACCTTTGGCGCCGCCATGCGCGTg > 2:3342850/1‑100 (MQ=255) cccGGTGTGCGTACAGCCGATGGGTAGAATCGACACCTGCGTGGAGATTGCCAGCCATCCGGAAGTCATCTTCTGTACCTTTGGCGACGCCATGCGCGt > 2:16866/1‑99 (MQ=255) ccGGTGTGCGTACAGCCGATGGGTAGAATCGACACCTGCGTGGAGATTGCCAGCCATCCGGAAGTCATCTTCTGTACCTTTGGCGACGCCATGCGCGTGc > 2:3053424/1‑100 (MQ=255) cGGGGTGCGTACAGCCGATGGGGAGGATCGACGCGTGCGGGGAGATTGCCAGCCATCCGGAAGACATTTTGTGTACCTTTGGGGAAGCCATGTGGGTGcc < 2:602896/100‑1 (MQ=255) tgtgCGTACTGCCGATGGGTAGAATCGACACCTGCGTGGAGATTGCCAGCCATCCGGAAGTCATCTTCTGTACCTTTGGCGACGCCATGCGCGTGCCgg > 1:2434093/1‑99 (MQ=255) tgtgCGTACAGCCGATGGGTAGAATCGACACCTGCGTGGAGATTGCCAGCCATCCGGAAGTCATCTTCTGTACCTTTGGCGACGCCATGCGCGTGCCggg < 1:1235268/100‑1 (MQ=255) gtgCGTACAGCCGATGGGTAGAATCGACCCCTGCGTGGAGATTGCCAGCCATCCGGAAGTCATCTTCTGTACCTTTGGCAACGCCATGCGCGTGCCgggg < 2:2532703/100‑1 (MQ=255) gtgCGTACAGCCGATGGGTAGAATCGACACCTGCGTGGAGATTGCCAGCCATCCGGAAGTCATCTTCTGTACCTTTGGCGACGCCATGCGCGTGCCgggg > 1:1677945/1‑100 (MQ=255) gtgCGTACAGCCGATGGGTAGAATCGACACCTGCGTGGAGATTGCCAGCCATCCGGAAGTCATCTTCTGTACCTTTGGCGACGCCATGCGCGTGCCgggg < 1:226389/100‑1 (MQ=255) gCGTACAGCCGATGGGTAGAATCGACACCTGCGTGGAGATTGCCAGCCATCCGGAAGTCATCTTCTGTACCTTTGGCGACGCCATGCGCGTGCCGGGGaa < 1:2690326/100‑1 (MQ=255) gCGTACAGCCGATGGGTAGAATCGACACCTGCGTGGAGATTGCCAGCCATCCGGAAGTCATCTTCTGTACCTTTGGCGACGCCATGCGCGTGCCGGGGaa > 1:3217952/1‑100 (MQ=255) cGTACAGCCGATGGGTAGAATCGACACCTGCGTGGAGATTGCCAGCCATCCGGAAGTCATCTTCTGTACCTTTGGCGACGCCATGCGCGTGCCGGGGaaa > 1:1001801/1‑100 (MQ=255) cGTACAGCCGATGGGTAGAATCGACACCTGCGTGGAGATTGCCAGCCATCCGGAAGTCATCTTCTGTACCTTTGGCGACGCCATGCGCGTGCCGGGGaaa > 1:1248969/1‑100 (MQ=255) gTACAGCCGATGGGTAGAATCGACACCTGCGTGGAGATTGCCAGCCATCCGGAAGTCATCTTCTGTACCTTTGGCGACGCCATGCGCGTGCCGGGGAAAc < 2:1874000/100‑1 (MQ=255) gTACAGCCGATGGGTAGAATCGACACCTGCGTGGAGATTGCCAGCCATCCGGAAGTCATCTTCTGTACCTTTGGCGACGCCATGCGCGTGCCGGGGAAAc < 1:3245825/100‑1 (MQ=255) | GGCGGTCATACCCACGCTATCTTTAAATTCGGCCTCGACCAGTTACTGCCGGAAAACGTTGAGTTTATCCACGGTCCGGGGTGCCCGGTGTGCGTACTGCCGATGGGTAGAATCGACACCTGCGTGGAGATTGCCAGCCATCCGGAAGTCATCTTCTGTACCTTTGGCGACGCCATGCGCGTGCCGGGGAAAC > NC_000913/2852259‑2852451 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |