| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,190,398 | T→G | 51.5% | M173R (ATG→AGG) | yqiH → | putative periplasmic pilin chaperone |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,190,398 | 0 | T | G | 51.5% | 24.9 / 269.7 | 186 | M173R (ATG→AGG) | yqiH | putative periplasmic pilin chaperone |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (48/42); new base G (45/51); total (93/93) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.63e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.10e-01 | |||||||||||
Only 100 of 188 total aligned reads displayed.
GGCCAAAAGCCATTGAATTAGAAGACGATGGGGTAATGACTTACGAAAAAGTTGAAATCATTCGTAGAAATGACGGTTCGATCCGCTTTAACAATAAGATGCCTTATCACGTTACGCTGGGTTATATCGGAACAAATGGGGTAACGATGTTACCACAAACGCAAAGCTTAATGGTAACCCCTTTTAGCTATGCAAAT > NC_000913/3190299‑3190495 | ggcCAAAAGCCATTGAATTAGAAGACGATGGGGTAATGACTTACGAAAAAGTTGAAATCATTCGTAGAAATGACGGTTCGATCCGCTTTAACAATAAGAt < 1:1633777/100‑1 (MQ=255) cAAAAGCCATTGAATTAGAAGACGATGGGGTAATGACTTACGAAAATGTTGAAATCATTCGTAGAAATGACGGTTCGATCCGCTTTAACAATAAGAGGc > 2:2290091/1‑99 (MQ=255) cAAAAGCCATTGAATTAGAAGACGATGGGGTAATGACTTACGAAAAAGTTGAAATCATTCGTAGAAATGACGGTTCGATCCGCTTTAACAATAAGATg < 1:1806033/98‑1 (MQ=255) cAAAAGCCATTGAATTAGAAGACGATGGGGTAATGACTTACGAAAAAGTTGAAATCATTCGTAGAAATGACGGTTCGATCCGCTTTAACAATAAGATGcc < 1:2751998/100‑1 (MQ=255) cAAAAGCCATTGAATTAGAAGACGATGGGGTAATGACTTACGAAAAAGTTGAAATCATTCGTAGAAATGACGGTTCGATCCGCTTTAACAATAAGATGcc < 1:2416651/100‑1 (MQ=255) cAAAAGCCATTGAATTAGAAGACGATGGGGTAATGACTTACGAAAAAGTTGAAATCATTCGTAGAAATGACGGTTCGATCCGCTTTAACAATAAGAGGc > 2:1925957/1‑99 (MQ=255) aaaaGCCATTGAATTAGAAGACGATGGGGTAATGACTTACGAAAAAGTTGAAATCATTCGTAGAAATGACGGTTCGATCCGCTTTAACAATAAGAGGCCt > 2:1805148/1‑100 (MQ=255) aaaaGCCATTGAATTAGAAGACGATGGGGTAATGACTTACGAAAAAGTTGAAATCATTCGTAGAAATGACGGTTCGATCCGCTTTAACAATAAGAGGCCt < 1:3366729/100‑1 (MQ=255) aaaGCCATTGAATTAGAAGACGATGGGGTAATGACTTACGAAAAAGTTGAAATCATTCGTAGAAATGACGGTTCGATCCGCTTTAACAATAAGAGGCCtt < 2:9804/100‑1 (MQ=255) aaGCCATTGAATTAGAAGACGATGGGGTAATGACTTACGAAAAAGTTGAAATCATTCGTAGAAATGACGGTTCGATCCGCTTTAACAATAAGATGCCTTa < 1:4131687/100‑1 (MQ=255) aaGCCATTGAATTAGAAGACGATGGGGTAATGACTTACGAAAAAGTTGAAATCATTCGTAGAAATGACGGTTCGATCCGCTTTAACAATAAGAGGCCTTa < 2:3470363/100‑1 (MQ=255) aGCCATTGAATTAGAAGACGATGGGGTAATGACTTACGAAAAAGTTGAAATCATTCGTAGAAATGACGGTTCGATCCGCTTTAACAATAAGAGGCCTTAt < 2:1967311/100‑1 (MQ=255) ccATTGAATTAGAAGACGATGGGGTAATGACTTACGAAAAAGTTGAAATCATTCGTAGAAATGACGGTTCGATCCGCTTTAACAATAAGATGCCTTATCa < 1:3811913/100‑1 (MQ=255) ccATTGAATTAGAAGACGATGGGGTAATGACTTACGAAAAAGTTGAAATCATTCGTAGAAATGACGGTTCGATCCGCTTTAACAATAAGAGGCCTTATCa < 1:2445004/100‑1 (MQ=255) cATTGAATTAGAAGACGATGGGGTAATGACTTACGAAAAAGTTGAAATCATTCGTAGAAATGACGGTTCGATCCGCTTTAACAATAAGATGCCTTATCAc > 1:3078849/1‑100 (MQ=255) cATTGAATTAGAAGACGATGGGGTAATGACTTACGAAAAAGTTGAAATCATTCGTAGAAATGACGGTTCGATCAGCTTTAACAATAAGAGGCCTTATAAc > 2:2009581/1‑100 (MQ=255) aTTGAATTAGAAGACGATGGGGTAATGACTTACGAAAAAGTTGAAATCATTCGTAGAAATGACGGTTCGATCCGCTTTAACAATAAGAGGCCTTATCACg > 1:775715/1‑100 (MQ=255) gAATTAGAAGGGGATGGGGTAATGACTTACGAAATAGTTGATGTCATTCGTAGAAATGACGGTTCGATCTGCTTTAACAATAAGATGCCTTATCACGTTa < 2:2406770/100‑1 (MQ=255) gAATTAGAAGACGATGGGGTAATGACTTACGAAAAAGTTGAAATCATTCGTAGAAATGACGGTTCGATCCGCTTTAACAATAAGAGGCCTTATCACGTTa > 1:3402111/1‑100 (MQ=255) aTTAGAAGACGATGGGGTAATGACTTACGAAAAAGTTGAAATCATTCGTAGAAATGACGGTTCGATCCGCTTTAACAATAAGAGGCCTTATCACGTTACg > 1:2076421/1‑100 (MQ=255) ttAGACGACGATGGGGTAATGACTTACGAAAAAGTTGAACTCATTCGTAGAAATGATGGTTCGATCCGCTTTAACAATAAGAGGCCTTATCACGTTACGc > 2:3638822/1‑100 (MQ=255) agacgaCGATAGGGTAATGACTTACGAAAAATTTGAAGTCATTAGTAGAAATGACGCTTCGATCAGCTTTAACAATAAGATACCTTATCACGGTagacg > 2:3833182/1‑95 (MQ=255) agaagaCGATGGGGTAATGACTTACGAAAAAGTTGAAATCATTCGTAGAAATGACGGTTCGATCCGCTTTAACAATAAGATGCCTTATCACGTTACGCTg > 2:4025247/1‑100 (MQ=255) agaagaCGATGGGGTAATGACTTACGAAAAAGTTGAAATCATTCGTAGAAATGACGGTTCGATCCGCTTTAACAATAAGAGGCCTTATCACGTTACGCTg < 1:1529924/100‑1 (MQ=255) agaCGATGGGGTAATGACTTACGAAAAAGTTGAAATCATTCGTAGAAATGACGGTTCGATCCGCTTTAACAATAAGATGCCTTATCACGTTACGCTGGGt < 1:1087853/100‑1 (MQ=255) agaCGATGGGGTAATGACTTACGAAAAAGTTGAAATCATTCGTAGAAATGACGGTTCGATCCGCTTTAACAATAAGAGGCCTTATCACGTTACGCTGGGt < 1:892334/100‑1 (MQ=255) agaCGATGGGGTAATGACTTACGAAAAAGTTGAAATCATTCGTAGAAATGACGGTTCGATCCGCTTTAACAATAAGAGGCCTTATCACGTTACGCTGGGt < 1:3514880/100‑1 (MQ=255) aCGATGGGGTAATGACTTACGAAAAAGTTGAAATCATTCGTAGAAATGACGGTTCGATCCGCTTTAACAATAAGAGGCCTTATCACGTTACGCTGGGTta < 1:2604297/100‑1 (MQ=255) gATGGGGTAATGACTTACGAAAAAGTTGAAATCATTCGTAGAAATGACGGTTCGATCCGCTTTAACAATAAGATGCCTTATCACGTTACGCTGGGTtata > 2:3148965/1‑100 (MQ=255) tGGGGTAATGACTTACGAAAAAGTTGAAATCATTCGTAGAAATGACGGTTCGATCCGCTTTAACAATAAGATGCCTTATCACGTTACGCTGGGTTATATc < 1:642186/100‑1 (MQ=255) gggTAATGACTTACGAAAAAGTTGAAATCATTCGTAGAAATGACGGTTCGATCCGCTTTAACAATAAGAGGCCTTATCACGTTACGCTGGGTTATATCgg > 2:4117112/1‑100 (MQ=255) ggTAATGACTTACGAAAAAGTTGAAATCATTCGTAGAAATGACGGTTCGATCCGCTTTAACAATAAGAGGCCTTATCACGTTACGCTGGGTTATATCGGa > 1:383801/1‑100 (MQ=255) ggTAATGACTTACGAAAAAGTTGAAATCATTCGTAGAAATGACGGTTCGATCCGCTTTAACAATAAGAGGCCTTATCACGTTACGCTGGGTTATATCGGa > 1:184313/1‑100 (MQ=255) ggTAAGGACTTACGAAAAAGTTGAAATCATTCGGAGAAATGACGGTTCGATCCGCTTTAACAATAAGATGCCTTATCACGTTACGCTGGGTTATATCgg < 2:3079243/99‑1 (MQ=255) gTAATGACTTACGAAAAAGTTGAAATCATTCGTAGAAATGACGGTTCGATCCGCTTTAACAATAAGAGGCCTTATCACGTTACGCTGGGTTATATCGGaa > 2:3886993/1‑100 (MQ=255) gTAATGACTTACGAAAAAGTTGAAATCATTCGTAGAAATGACGGTTCGATCCGCTTTAACAATAAGAGGCCTTATCACGTTACGCTGGGTTATATCGGaa > 2:3496765/1‑100 (MQ=255) aaTGACTTACGAAAAAGTTGAAATCATTCGTAGAAATGACGGTTCGATCCGCTTTAACAATAAGATGCCTTATCACGTTACGCTGGGTTATATCGGAACa > 2:4113681/1‑100 (MQ=255) aaTGACTTACGAAAAAGTTGAAATCATTCGTAGAAATGACGGTTCGATCCGCTTTAACAATAAGATGCCTTATCACGTTACGCTGGGTTATATCGGAACa > 2:2574666/1‑100 (MQ=255) aaTGACTTACGAAAAAGTTGAAATCATTCGTAGAAATGACGGTTCGATCCGCTTTAACAATAAGAGGCCTTATCACGTTACGCTGGGTTATATCGGAACa < 2:744740/100‑1 (MQ=255) aaTGACTTACGAAAAAGTTGAAATCATTCGTAGAAATGACGGTTCGATCCGCTTTAACAATAAGAGGCCTTATCACGTTACGCTGGGTTATATCGGAACa < 2:847033/100‑1 (MQ=255) gACTTACGAAAAAGTTGAAATCATTCGTAGCAAGGACGGTTCGATCCGCTTTAACAATAAGATGCCTTATCACGTTACGCTGGGTTATACCGGAACAAAt > 2:2726015/1‑100 (MQ=255) cTTACGAAAAAGTTGAAATCATTCGTAGAAATGACGGTTCGATCCGCTTTAACAATAAGATGCCTTATCACGTTACGCTGGGTTATATCGGAACAAATgg < 1:2860230/100‑1 (MQ=255) cTTACGAAAAAGTTGAAATCATTCGTAGAAATGACGGTTCGATCCGCTTTAACAATAAGAGGCCTTATCACGTTACGCTGGGTTATATCGGAACAAATgg > 1:977501/1‑100 (MQ=255) cTTACGAAAAAGTTGAAATCATTCGTAGAAATGACGGTTCGATCCGCTTTAACAATAAGAGGCCTTATCACGTTACGCTGGGTTATATCGGAACAAATgg > 1:3249546/1‑100 (MQ=255) tACGAAAAAGTTGAAATCATTCGTAGAAATGACGGTTCGATCCGCTTTAACAATAAGATGCCTTATCACGTTACGCTGGGTTATATCGGAACAAATgggg < 1:721859/100‑1 (MQ=255) tACGAAAAAGTTGAAATCATTCGTAGAAATGACGGTTCGATCCGCTTTAACAATAAGAGGCCTTATCACGTTACGCTGGGTTATATCGGAACAAATgggg < 2:1202077/100‑1 (MQ=255) aCGAAAAAGTTGAAATCATTCGTAGAAATGACGGTTCGATCCGCTTTAACAATAAGATGCCTTATCACGTTACGCTGGGTTATATCGGAACAAATGGGGt > 2:1693346/1‑100 (MQ=255) cGAAAAAGTTGAAATCATTCGTAGAAATGACGGTTCGATCCGCTTTAACAATAAGATGCCTTATCACGTTACGCTGGGTTATATCGGAACAAATGGGGTa > 1:473590/1‑100 (MQ=255) cGAAAAAGTTGAAATCATTCGTAGAAATGACGGTTCGATCCGCTTTAACAATAAGATGCCTTATCACGTTACGCTGGGTTATATCGGAACAAATGGGGTa > 2:1339276/1‑100 (MQ=255) aaaaGTTGAAATCATTCGTAGAAATGACGGTTCGATCCGCTTTAACAATAAGAGGCCTTATCACGTTACGCTGGGTTATATCGGAACAAATGGGGTAACg < 1:3778397/100‑1 (MQ=255) aaaGTTGAAATCATTCGTAGAAATGACGGTTCGATCAGCTTTAACAATAAGATGCCTTATCACGTTACGCTGGGTTATATCGGAACAAATGGGGTAACGa < 2:906013/100‑1 (MQ=255) aaGTTGAAATCATTCGTAGAAATGACGGTTCGATCCGCTTTAACAATAAGATGCCTTATCACGTTACGCTGGGTTATATCGGAACAAATGGGGTAACGAt > 1:1214076/1‑100 (MQ=255) aGTTGAATTCATTCGTAGAAATGACGGTTCGATCCGCTTTAACAATAAGAGGCCTTATCACGTTACGCTGGGTTATATCGGAACAAATGGGGTAACGATg < 1:567743/100‑1 (MQ=255) aGTTGAAATCATTCGTAGAAATGACGGTTCGATCCGCTTTAACAATAAGATGCCTTATCACGTTACGCTGGGTTATATCGGAACAAATGGGGTAACGATg > 1:1141235/1‑100 (MQ=255) aGTTGAAATCATTCGTAGAAATGACGGTTCGATCCGCTTTAACAATAAGAGGCCTTATCACGTTACGCTGGGTTATATCGGAACAAATGGGGTAACGATg < 2:3402091/100‑1 (MQ=255) gAAATCATTCGTAGAAATGACGGTTCGATCCGCTTTAACAATAAGATGCCTTATCACGTTACGCTGGGTTATATCGGAACAAATGGGGTAACGATGTTAc > 1:2188382/1‑100 (MQ=255) gAAATCATTCGTAGAAATGACGGTTCGATCCGCTTTAACAATAAGATGCCTTATCACGTTACGCTGGGTTATATCGGAACAAATGGGGTAACGATGTTAc < 1:1468694/100‑1 (MQ=255) gAAATCATTCGTAGAAATGACGGTTCGATCCGCTTTAACAATAAGAGGCCTTATCACGTTACGCTGGGTTATATCGGAACAAATGGGGTAAcatcgttac > 1:3551493/1‑92 (MQ=255) aaTCATTCGTAGAAATGACGGTTCGATCCGCTTTAACAATAAGATGCCTTATCACGTTACGCTGGGTTATATCGGAACAAATGGGGTAACGATGTTACca > 1:3029998/1‑100 (MQ=255) aaTCATTCGTAGAAATGACGGTTCGATCCGCTTTAACAATAAGAGGCCTTATCACGTTACGCTGGGTTATATCGGAACAAATGGGGTAACGATGTTACca > 1:2731303/1‑100 (MQ=255) ttCGTAGAAATGACGGTTCGATCCGCTTTAACAATAAGATGCCTTATCACGTTACGCTGGGTTATATCGGAACAAATGGGGTAACGATGTTACCACAAAc < 2:109696/100‑1 (MQ=255) ttCGTAGAAATGACGGTTCGATCCGCTTTAACAATAAGAGGCCTTATCACGTTACGCTGGGTTATATCGGAACAAATGGGGTAACGATGTTACCACAAAc < 1:738320/100‑1 (MQ=255) ttCGTAGAAATGACGGTTCGATCCGCTTTAACAATAAGAGGCCTTATCACGTTACGCTGGGTTATATCGGAACAAATGGGGTAACGATGTTACCACAAAc < 1:2184368/100‑1 (MQ=255) cGTAGAAATGACGGTTCGATCCGCTTTAACAATAAGAGGCCTTATCACGTTACGCTGGGTTATATCGGAACAAATGGGGTAACGATGTTACCACAAACGc > 1:3895805/1‑100 (MQ=255) cGTAGAAATGACGGTTCGATCCGCTTTAACAATAAGAGCCCTTATCACGTTACGCTGGGTTATATCGGAACAAATGGGGTAACGATGTTACCACAAACGc < 1:3089960/100‑1 (MQ=255) gTAGAAATGACGGTTCGATCCGCTTTAACAATAAGATGCCTTATCACGTTACGCTGGGTTATATCGGAACAAATGGGGTAACGATGTTACCACAAACGCa > 2:1311426/1‑100 (MQ=255) gTAGAAATGACGGTTCGATCCGCTTTAACAATAAGATGCCTTATCACGTTACGCTGGGTTATATCGGAACAAATGGGGTAACGATGTTACCACAAACGCa > 2:3732603/1‑100 (MQ=255) gAAATGACGGTTCGATCCGCTTTAACAATAAGATGCCTTATCACGTTACGCTGGGTTATATCGGAACAAATGGGGTAACGATGTTACCACAAACGCAAAg > 1:2060046/1‑100 (MQ=255) gAAATGACGGTTCGATCCGCTTTAACAATAAGAGGCCTTATCACGTTACGCTGGGTTATATCGGAACAAATGGGGTAACGATGTTACCACAAACGCAAAg < 1:3481524/100‑1 (MQ=255) aTGACGGTTCGATCCGCTTTAACAATAAGAGGCCTTATCACGTTACGCTGGGTTATATCGGAACAAATGGGGTAACGATGTTACCACAAACGCAAAGCtt < 1:1673148/100‑1 (MQ=255) aCGGTTCGATCCGCTTTAACAATAAGAGGCCTTATCACGTTACGCTGGGTTATATCGGAACAAATGGGGTAACGATGTTACCACAAACGCAAAGCTTAAt < 1:1391528/100‑1 (MQ=255) cGGTTCGATCCGCTTTAACAATAAGATGCCTTATCACGTTACGCTGGGTTATATCGGAACAAATGGGGTAACGATGTTACCACAAACACAAAGCTTAATg < 1:2523071/100‑1 (MQ=255) cGGTTCGATCCGCTTTAACAATAAGATGCCGTATAACGTTACGCTGGGTTATATCGGAACAAATGGGGTAACGATGTTACCACAAACGCAAAGCTTAATg < 1:1975556/100‑1 (MQ=255) gTTCGATCCGCTTTAACAATAAGATGCCTTATCACGTTACGCTGGGTTATATCGGAACAAATGGGGTAACGATGTTACCACAAACGCAAAGCTTAATGGt < 2:3754397/100‑1 (MQ=255) gTTCGATCCGCTTTAACAATAAGATGCCTTATCACGTTACGCTGGGTTATATCGGAACAAATGGGGTAACGATGTTACCACAAACGCAAAGCTTAATGGt < 1:1334493/100‑1 (MQ=255) gTTCGATCCGCTTTAACAATAAGATGCCTTATCACGTTACGCTGGGTTATATCGGAACAAATGGGGTAACGATGTTACCACAAACGCAAAGCTTAATGGt > 1:4041227/1‑100 (MQ=255) tCGATCCGCTTTAACAATAAGAGGCCTTATCACGTTACGCTGGGTTATATCGGAACAAATGGGGTAACGATGTTACCACAAACGCAAAGCTTGATGGTaa < 2:3537121/100‑1 (MQ=255) cGATCCGCTTTAACAATAAGATGCCTTATCACGTTACGCTGGGTTATATCGGAACAAATGGGGTAACGATGTTACCACAAACGCAAAGCTTAATGGTAAc > 2:53527/1‑100 (MQ=255) cGATCCGCTTTAACAATAAGAGGCCTTATCACGTTACGCTGGGTTATATCGGAACAAATGGGGTAACGATGTTACCACAAACGCAAAGCTTAATGGTAAc < 1:2322066/100‑1 (MQ=255) gATCCGCTTTAACAATAAGAGGCCTTATCACGTTACGCTGGGTTATATCGGAACAAATGGGGTAACGATGTTACCACAAACGCAAAGCTTAATGGTAAcc < 2:478199/100‑1 (MQ=255) aTCCGCTTTAACAATAAGATGCCTTATCACGTTACGCTGGGTTATATCGGAACAAATGGGGTAACGATGTTACCACAAACGCAAAGCTTAATGGTAAccc > 1:850565/1‑100 (MQ=255) aTCCGCTTTAACAATAAGAGGCCTTATCACGTTACGCTGGGTTATATCGGAACAAATGGGGTAACGATGTTACCACAAACGCAAAGCTTAATGGTAAccc > 2:1747113/1‑100 (MQ=255) aTCCGCTTTAACAATAAGAGGCCTTATCACGTTACGCTGGGTTATATCGGAACAAATGGGGTAACGATGTTACCACAAACGCAAAGCTTAATGGTAAcc < 2:2465690/99‑1 (MQ=255) aTCCGCTTTAACAATAAGAGGCCTTATAACGTTACGCTGGGGTATACCGGAACAAATGGGGTAACGATGTTACCACAAACGCAAAGCTTAATGGTAAcc < 2:401403/99‑1 (MQ=255) cGCTTTAACAATAAGATGCCTTATCACGTTACGCTGGGTTATATCGGAACAAATGGGGTAACGATGTTACCACAAACGCAAAGCTTAATGGTAACCCCtt > 1:3647653/1‑100 (MQ=255) gCTTTAACAATAAGAGGCCTTATCACGTTACGCTGGGTTATATCGGAACAAATGGGGTAACGATGTTACCACAAACGCAAAGCTTAATGGTAACCCCttt > 1:1997379/1‑100 (MQ=255) tttAACAATAAGATGCCTTATCACGTTACGCTGGGTTATATCGGAACAAATGGGGTAACGATGTTACCACAAACGCAAAGCTTAATGGTAACCCCTTTTa < 2:147538/100‑1 (MQ=255) tttAACAATAAGAGGCCTTATCACGTTACGCTGGGTTATATCGGAACAAATGGGGTAACGATGTTACCACAAACGCAAAGCTTAATGGTAACCCCTTTTa < 2:507317/100‑1 (MQ=255) ttAACAATAAGAGGCCTTATCACGTTACGCTGGGTTATATCGGAACAAATGGGGTAACGATGTTACCACAAACGCAAAGCTTAATGGTAACCCCTTTTAg < 1:4007797/100‑1 (MQ=255) aaCAATAAGATGCCTTATCACGTTACGCTGGGTTATATCGGAACAAATGGGGTAACGATGTTACCACAAACGCAAAGCTTAATGGTAACCCCTTTTAGCt > 2:1308976/1‑100 (MQ=255) aCAATAAGAGGCCTTATCACGTTACGCTGGGTTATATCGGAACAAATGGGGTAACGATGTTACCACAAACGCAAAGCTTAATGGTAACCCCTTTTAGCTa > 2:1609647/1‑100 (MQ=255) cAATAAGATGCCTTATCACGTTACGCTGGGTTATATCGGAACAAATGGGGTAACGATGTTACCACAAACGCAAAGCTTAATGGTAACCCCTTTTAGCTAt > 1:2659375/1‑100 (MQ=255) cAATAAGAGGCCTTATCCCGTTACTCTGGGTTATATCGTAACAAATGGGGTAACGATGTTACCACAAACGCAAAGCTTAATGGTATCCCCTTTTAGCt < 2:3670314/98‑1 (MQ=255) aaTAAGATGCCTTATCACGTTACGCTGGGTTATATCGGAACAAATGGGGTAACGATGTTACCACAAACGCAAAGCTTAATGGTAACCCCTTTTAGCTATg < 1:1288902/100‑1 (MQ=255) aTAAGATGCCTTATCACGTTACGCTGGGTTATATCGGAACAAATGGGGTAACGATGTTACCACAAACGCAAAGCTTAATGGTAACCCCTTTTAGCTATGc < 2:2122205/100‑1 (MQ=255) aTAAGATGCCTTATCACGTTACGCTGGGTTATATCGGAACAAATGGGGTAACGATGTTACCACAAACGCAAAGCTTAATGGTAACCCCTTTTAGCTATGc > 2:2314170/1‑100 (MQ=255) aTAAGATGCCTTATCACGTTACGCTGGGTTATATCGGAACAAATGGGGTAACGATGTTACCACAAACGCAAAGCTTAATGGTAACCCCTTTTAGCTATGc > 1:2705203/1‑100 (MQ=255) aTAAGATGCCTGATCACGTTACGCTGGGTTATATCGGAACAAATGGGGTAACGATGTTACCACAAACGCAAAGCTTAATGGTAACCCCTTTTAGCTATGc < 1:4043966/100‑1 (MQ=255) tAAGATGCCTTATCACGTTACGCTGGGTTATATCGGAACAAATGGGGTAACGATGTTACCACAAACGCAAAGCTTAATGGTAACCCCTTTTAGCTATGCa > 1:3392162/1‑100 (MQ=255) gATGCCTTATCACGTTACGCTGGGATATATTGGAACAAATGGGGTAACGATGTTACCACAAACGCAAAGCTTAATGGTAACCCCTTTTAGATATGCa > 2:2819916/1‑97 (MQ=255) | GGCCAAAAGCCATTGAATTAGAAGACGATGGGGTAATGACTTACGAAAAAGTTGAAATCATTCGTAGAAATGACGGTTCGATCCGCTTTAACAATAAGATGCCTTATCACGTTACGCTGGGTTATATCGGAACAAATGGGGTAACGATGTTACCACAAACGCAAAGCTTAATGGTAACCCCTTTTAGCTATGCAAAT > NC_000913/3190299‑3190495 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |