Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 3,524,413 | A→G | 29.9% | I515V (ATT→GTT) | mrcA → | penicillin‑binding protein 1a, murein transglycosylase and transpeptidase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 3,524,413 | 0 | A | G | 29.9% | 249.8 / 155.1 | 208 | I515V (ATT→GTT) | mrcA | penicillin‑binding protein 1a, murein transglycosylase and transpeptidase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (70/74); new base G (36/26); total (108/100) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.27e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.37e-01 |
Only 100 of 212 total aligned reads displayed.
CTGGCAAGTATGTTGAACGATGTGCCAATTTCTCGCTGGGATGCAAGTGCCGGTTCTGACTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAATTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACGTGGTGATGGTACGCGCAATGCGGGCGATGGGCGTCGACTACGCTGCAGAATATCTGCAACGC > NC_000913/3524314‑3524511 | cacgTATGTTGAACGATGTGCCAATTTCTCGCTCGGATGCAAGTGCCGGTTCTGACTGGCAGCCGACGAACTCACCACCGCAGTCTGCTGGTCCAAt > 2:3498173/4‑97 (MQ=255) cAAGTATGTTGAACGATGTGCCAATGTCTCGCTGGGATGCAAGTGCCGGTTCTGACTGGCAGCAGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCaa < 2:2437674/96‑1 (MQ=255) aGTATGTTGAACGATGTGCCAATTTCTCGCTGGGATGCAAGTGCCGGTTCTGACTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCt < 1:229230/100‑1 (MQ=255) aGTATGTTGAACGATGTGCCAATTTCTCGCTGGGATGCAAGTGCCGGTTCTGACTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAATTCGCt < 1:3086526/100‑1 (MQ=255) gTATGTTGAACGATGTGCCAATTTCTCGCTGGGATGCAAGTGCCGGTTCTGACTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCtt > 2:1997270/1‑100 (MQ=255) gTATGTTGAACGATGTGCCAATTTCTCGCTGGGATGCAAGTGCCGGTTCTGACTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAATTCGCtt < 2:2697865/100‑1 (MQ=255) aTGTTGAACGATGTGCCAATTTCTCGCTGTGATGCAAGTGCCGGTTCTGACTGGCAGCCGAAGAACTCACCAGCGCAGTATGCTGGTCCAATTCGCtt < 2:1499519/98‑1 (MQ=255) tGTTGAACGATGTGCCAATTTCTCGCTGGGATTCAAGTGCCGGTTCTGACTGCCAGCCGAAGAACTCACCACCTCAGTATGCTGGTCCAATTCGCTTACg < 2:3488876/100‑1 (MQ=255) tGTTGAACGATGTGCCAATTTCTCGCTGGGATGCAAGTGCCGGTTCTGACTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAATTCGCTTACg > 2:1452542/1‑100 (MQ=255) tGTTGAACGATGTGCCAATTTCTCGCTGGGATGCAAGTGCCGGTTCTGACTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAATTCGCTTACg < 2:2569753/100‑1 (MQ=255) gTTGAACGATGTGCCAATTTCTCGCTGGGATGCAAGTGCCGGTTCTGACTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAATTCGCTTACGt > 1:3365764/1‑100 (MQ=255) tGAACGATGTGCCAATTTCTCGCTGGGATGCAAGTGCCGGTTCTGACTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAATTCGCTTACGTCa < 1:589775/100‑1 (MQ=255) tGAACGATGTGCCAATTTCTCGCTGGGATGCAAGTGCCGGTTCTGACTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAATTCGCTTACGTCa > 2:2086455/1‑100 (MQ=255) aaCGATGTGCCAATTTCTCGCTGGGATGCAAGTGCCGGTTCTGACTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAgg < 2:2059904/100‑1 (MQ=255) aaCGATGTGCCAATTTCTCGCTGGGATGCAAGTGCCGGTTCTGACTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAATTCGCTTACGTCAgg < 1:1645480/100‑1 (MQ=255) cGATGTGCCAATTTCTCGCTGGGATGCAAGTGCCGGTTCTGACTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAgggg < 1:1972436/100‑1 (MQ=255) tgtgCCAATTTCTCGCTGGGATGCAAGTGCCGGTTCTGACTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAGGGGCTg < 1:2742476/100‑1 (MQ=255) gtgCCAATTTCTCGCTGGGATGCAAGTGCCGGTTCTGACTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAGGGGCTgg < 1:1654023/100‑1 (MQ=255) gtgCCAATTTCTCGCTGGGATGCAAGTGCCGGTTCTGACTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAATTCGCTTACGTCAggg > 2:3274427/1‑95 (MQ=255) tgCCAATTTCTCGCTGGGATGCAAGTGCCGGTTCTGACTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAGGGGCTggg < 1:34713/100‑1 (MQ=255) tgCCAATTTCTCGCTGGGATGCAAGTGCCGGTTCTGACTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAATTCGCTTACGTCAGGGGCTggg < 2:2230991/100‑1 (MQ=255) gCCAATTACTCGCTGGGATGCAAGTGCCGGTTCTGACTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAATTCGCTTACGTCAGGGGCTgg > 2:2167911/1‑98 (MQ=255) ccAATTTCTCGCTGGGATGCAAGTGCCGGTTCTGACTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAATTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTc > 1:1134049/1‑100 (MQ=255) cAATTTCTCGCTGGGATGCAAGTGCCGGTTCTGACTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTc < 1:1466948/99‑1 (MQ=255) cAATTTCTCGCTGGGATGCAAGTGCCGGTTCTGACTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAATTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCa > 1:1425448/1‑100 (MQ=255) cAATTTCTCGCTGGGATGCAAGTGCCGGTTCTGACTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAATTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCa > 2:112288/1‑100 (MQ=255) aaTTTCTCGCTGGGATGCAAGTGCCGGTTCTGACTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAATTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAg < 2:4049130/100‑1 (MQ=255) aaTTTCTCGCTGGGATGCAAGTGCCGGTTCTGACTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAATTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAg < 2:3070574/100‑1 (MQ=255) ttCTCGCTGGGATGCAAGTGCCGGTTCTGACTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAATTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCg < 2:1624924/100‑1 (MQ=255) tctcGCTGGGATGCAAGTGCCGGTTCTGACTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAATTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTc < 2:3698541/98‑1 (MQ=255) cGCTGGGATGCAAGTGCCGGTTCTGACTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAATTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGaaaa < 1:1314834/100‑1 (MQ=255) cTGGGATGCAAGTGCCGGTTCTGACTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAAc > 1:2884378/1‑100 (MQ=255) gggATGCAAGTGCCGGTTCTGACTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACgt > 2:1391602/1‑100 (MQ=255) ggATGCAAGTGCCGGTTCTGACTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAATTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACgtg < 1:1918614/100‑1 (MQ=255) gATGCAAGTGCCGGTTCTGACTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCACTTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGGCGAAACACgtgg > 2:1334517/1‑100 (MQ=255) gATGCAAGTGCCGGTTCTGACTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAATTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACgtgg < 2:2342737/100‑1 (MQ=255) gATGCAAGTGCCGGTTCTGACTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAATTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACgtgg > 1:2196997/1‑100 (MQ=255) gATGCAAGTGCCGGTTCTGACTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAATTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACgtgg > 1:3793756/1‑100 (MQ=255) tggacgTGCCGGTTGTGAGTGGCATGCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAAGTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTAAGTCGAAAAACg < 2:1829405/90‑1 (MQ=255) tGCAAGTGCCGGTTCTGACTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACgtggtg > 1:3663326/1‑100 (MQ=255) cAAGTGCCGGTTCTGACTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAATTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACGTGGTGAt > 1:1108556/1‑100 (MQ=255) aGTGCCGGTTCTGACTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAATTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACGTGGTGATgg < 1:1019339/100‑1 (MQ=255) gTGCCGGTTCTGACTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAATTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACGTGGTGATGGt < 1:463684/100‑1 (MQ=255) tGCCGGTTCTGACTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAATTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACGTGGTGATGGtn < 2:3065970/100‑2 (MQ=255) tGCCGGTTCTGACTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAATTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACGTGGTGATGGTa < 1:3094648/100‑1 (MQ=255) gCCGGTTCTGACTGGCAGCCGAAGAACTCACTACCGCAGCATGCTGGCCCAATTCGCTTAAGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACGTGGTGCTGGtgc > 2:2908722/1‑98 (MQ=255) ccGGTTCTGACTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAGGGACTGGGTCAGTCGAAAAACGTGGTGATGGTAcg > 1:2689296/1‑100 (MQ=255) cGGTTCTGACTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACGTGGTGATGGTAcgc < 2:434861/100‑1 (MQ=255) ggTTCTGACTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACGTGGTGATGGTAcgcg > 2:2457358/1‑100 (MQ=255) ggTTCTGACTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAATTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACGTGGTGATGGTAcgcg > 1:2409754/1‑100 (MQ=255) gTTCTGACTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACGTGGTGATGGTACgcgc < 1:3976333/100‑1 (MQ=255) gTTCTGACTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAATTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACGTGGTGATGGTACgcgc < 1:3910234/100‑1 (MQ=255) cTGACTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACGTGGTGATGGTACGCGCAAt > 2:736735/1‑100 (MQ=255) tGACTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACGTGGTGATGGTACGCGCAATg < 2:225735/100‑1 (MQ=255) gACTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAATTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACGTGGTGATGGTACGCGCAATGc > 1:2349138/1‑100 (MQ=255) ggCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAATTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACGTGGTGATGGTACGCGCAATGCGGGc > 2:1733645/1‑100 (MQ=255) ggCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAATTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACGTGGTGATGGTACGCGCAATGCGGGc < 1:1011364/100‑1 (MQ=255) cAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAATTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACGTGGTGATGGTACGCGCAATGCGGGCGa > 2:1630070/1‑100 (MQ=255) gCCGAAGAAGTCACCACCGCAGTAGGCCGGTCCAATACGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACGTGGTGATGGTACGCGCAATGCGGGCGATg < 2:1480117/100‑1 (MQ=255) gCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAATTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACGTGGTGATGGTACGCGCAATGCGGGCGacg < 1:3835964/100‑3 (MQ=255) gCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAATTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACGTGGTGATGGTACGCGCAATGCGGGCGATg > 2:3405591/1‑100 (MQ=255) cGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAATTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACGTGGTGATGGTACGCGCAATGCGGGCGATggg < 1:2843583/100‑1 (MQ=255) cGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAATTCGCTTACGTCAGGGGATGGGTCAGTCGAAAAACGTGGTGATGGTACGCGCAATGCGGGCGATggg > 2:1167401/1‑100 (MQ=255) aagaaCTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAATTCGCTTACGTCAGGGGCTGAGACAGACGAAAAACGTGGTGATGGTACGCGCAATGCGGGCGATGGGCg < 2:2809473/100‑1 (MQ=255) gaaCTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAATTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACGTGGTGATGGTACGCGCAATGCGGGCGATGGGCGTc < 1:1537102/100‑1 (MQ=255) aaCTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACGTGGTGATGGTACGCGCAATGCGGGCGATGGGCGTCg > 2:1587267/1‑100 (MQ=255) aaCTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAATTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACGTGGTGATGGTACGCGCAATGCGGGCGATGGGCGTCg < 2:2381067/100‑1 (MQ=255) aaCTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAATTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACGTGGTGATGGTACGCGCAATGCGGGCGATGGGCGTCg > 1:853538/1‑100 (MQ=255) aCTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACGTGGTGATGGTACGCGCAATGCGGGCGATGGGCGTCg > 1:3816488/1‑99 (MQ=255) aCTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACGTGGTGATGGTACGCGCAATGCGGGCGATGGGCGTCGa < 1:3034450/100‑1 (MQ=255) aCTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACGTGGTGATGGTACGCGCAATGCGGGCGATGGGCGTCGa > 1:2537058/1‑100 (MQ=255) cTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACGTGGTGATGGTACGCGCAATGCGGGCGATGGGCGTCGAc < 1:1237698/100‑1 (MQ=255) cTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAATTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACGTGGTGATGGTACGCGCAATGCGGGCGATGGGCGTCGAc > 1:2417451/1‑100 (MQ=255) cTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAATTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACGTGGTGATGGTACGCGCAATGCGGGCGATGGGCGTCGAc > 1:4122823/1‑100 (MQ=255) cTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAATTCGCTTACGTCAGGGGCTGCGTCAGTCGAAAAACGTGGTGATGGTACGCGCAATGCGGGCGATGGGCGTCGAc < 1:2577305/100‑1 (MQ=255) caccacCGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACGTGGTGATGGTACGCGCAATGCGGGCGATGGGCGTCGACTa > 2:6084/1‑100 (MQ=255) caccacCGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACGTGGTGATGGTACGCGCAATGCGGGCGATGGGCGTCGACTa > 2:69767/1‑100 (MQ=255) caccacCGCAGTATGCTGGTCCAATTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGCAAAACGTGGTGATGGTACGCGCAATGCGGGCGATGGGCGTCGACTa > 1:1786044/1‑100 (MQ=255) caccacCGCAGTATGCTGGTCCAATTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACGTGGTGATGGTACGCGCAATGCGGGCGATGGGCGTCGACTa > 1:3268101/1‑100 (MQ=255) caccacCGCAGTATGCTGGTCCAATTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACGTGGTGATGGTACGCGCAATGCGGGCGATGGGCGTCGACTa > 2:1959299/1‑100 (MQ=255) ccaccGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACGTGGTGATGGTACGCGCAATGCGGGCGATGGGCGTCGACTACg > 2:320211/1‑100 (MQ=255) accGCAGTATGCTGGTCCAATTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACGTGGTGATGGTACGCGCAATGCGGGCGATGGGCGTCGACTACGCt > 2:3802330/1‑100 (MQ=255) ccGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACGTGGTGATGGTACGCGCAATGCGGGCGATGGGCGTCGACTACGCTg > 2:4069590/1‑100 (MQ=255) ccGCAGTATGCTGGTCCAATTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACGTGGTGATGGTACGCGCAATGCGGGCGATGGGCGTCGACTACGCTg > 2:907721/1‑100 (MQ=255) ccGCAGTATGCTGGTCCAATTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACGTGGTGATGGTACGCGCAATGCGGGCGATGGGCGTCGACTACGCTg > 1:4089214/1‑100 (MQ=255) cGCAGTATGCTGGTCCAATTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACGTGGTGATGGTACGCGCAATGCGGGCGATGGGCGTCGACTACGCTGc < 2:2385972/100‑1 (MQ=255) gCAGTATGCTGGTCCAATTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACGTGGTGATGGTACGCGCAATGCGGGCGATGGGCGTCGACTACGCTGCa < 2:1816058/100‑1 (MQ=255) gCAGTATGCGGGTCCAATTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACGTGGTGATGGTACGCGCAATGCGGGCGATGGGCGTCGACTACGCTGCa < 2:1524698/100‑1 (MQ=255) gCAGTAGGCTGGTCCAGTTCGCTGACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACGGGGTGATGGTACGCGCAATGCGGGCGATGGGCGTCGACTACGCTg < 2:843352/98‑1 (MQ=255) aGTATGCTGGTCCAATTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACGTGGTGATGGTACGCTCAATGCGTGCGATGGGCGTCTACTACGCTGCAGa < 2:3945090/100‑1 (MQ=255) aGTATGCTGGTCCAATTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACGTGGTGATGGTACGCGCAATGCGGGCGATGGGCGTCGACTACGCTGCAGa > 2:2940814/1‑100 (MQ=255) gTATGCTGGTCTAGTGCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGGCGAAAAACGTGGTGATGGTACGCGCAATCCGGGCGATCGGCGTCGACTACTCTGCAg < 2:1988415/98‑1 (MQ=255) taggccggTCCAGTTCGCTTACGTCGGGGGCTGAGGCAGGCGAAAAACGTGGTGATGGTACGCGCAATGCGAGCGATGGGCGTCGACTACGCTGCAGAat < 2:3469110/94‑1 (MQ=255) aTGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACGTGGTGATGGTACGCGCAATGCGGGCGATGGGCGTCGACTACGCTGCAGAata > 1:3766380/1‑100 (MQ=255) aTGCTGGTCCAATTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACGTGGTGATGGTACGCGCAATGCGGGCGATGGGCGTCGACTACGCTGCAGAata < 1:3517580/100‑1 (MQ=255) tGCTGGTCCAATTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACGTGGTGATGGTACGCGCAATGCGGGCGATGGGCGTCGACTACGCTGCAGAatat > 1:990316/1‑100 (MQ=255) tGCTGGTCCAATTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACGTGGTGATGGTACGCGCAATGCGGGCGATGGGCGTCGACTACGCTGCAGAatat > 1:710214/1‑100 (MQ=255) tGGTCCAATTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACGTGGTGATGGTCCGCGCAATGCGTGCGATGGGCGTCGGCTACGCTGCAGAACATCTg > 2:2481151/1‑100 (MQ=255) ggTCCAATTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACGTGGTGATGGTACGCGCAATGCGGGCGATGGGCGTCGACTACGCTGCAGAATATCTGc < 1:2650343/100‑1 (MQ=255) ggccAATTGGCTTACGGCAGGGGCTGGCTCAGTCATGAAAAGTGGTGATGGTACGCGTAATGCGGGCGATGGGCGTGGACTACGCTGCAGAATATCTGCa < 2:706171/98‑1 (MQ=255) | CTGGCAAGTATGTTGAACGATGTGCCAATTTCTCGCTGGGATGCAAGTGCCGGTTCTGACTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAATTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACGTGGTGATGGTACGCGCAATGCGGGCGATGGGCGTCGACTACGCTGCAGAATATCTGCAACGC > NC_000913/3524314‑3524511 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |