| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,577,660 | C→T | 15.0% | intergenic (‑68/+71) | gntK ← / ← gntR | gluconate kinase 2/d‑gluconate inducible gluconate regulon transcriptional repressor |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,577,660 | 0 | C | T | 15.0% | 577.9 / 73.6 | 237 | intergenic (‑68/+71) | gntK/gntR | gluconate kinase 2/d‑gluconate inducible gluconate regulon transcriptional repressor |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (110/91); new base T (16/20); total (126/111) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.80e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.04e-01 | |||||||||||
Only 100 of 242 total aligned reads displayed.
TAAATGTGGTGATCATGGTTAGTCGTGCTCAAAGTGGTGCCCCCACAATACAAGAATTAAAAATGTTACGGGTAACTGTTATCGGTAACATTGTCCAGCCGGACAATATCAGAAGCAATATCCATCCATGCCTTAAGTGTATAAGTGTGAGCTACTTCAAATTTGTGGGCTTAAATAGATCCGCCCGGTGACAAGGTGA > NC_000913/3577561‑3577759 | tgtgGTGATCATGGTTAGTCGTGCTCAAAGTGGTGCCCCCACAATACAAGAATTAAAAATGTTACGGGTAACTGTTATCGGTAACATTGTCCAGCCGGAc < 1:3794135/100‑1 (MQ=255) gtggtgATCATGGTTAGTCGTGCTCAAAGTGGTGCCCCCACAATACAAGAATTAAAAATGTTACGGGTAACTGTTATCGGTAACATTGTCCAGCCGGACa < 1:1594273/100‑1 (MQ=255) ggtgATCATGGTTAGTCGTGCTCAAAGTGGTGCCCCCACAATACAAGAATTAAAAATGTTACGGGTAACTGTTATCGGTAACATTGTCCAGCCGGACAat > 1:3411583/1‑100 (MQ=255) ggtgATCATGGTTAGTCGTGCTCAAAGTGGTGCCCCCACAATACAAGAATTAAAAATGTTACGGGTAACTGTTATCGGTAACATTGTCCAGCCGGACAat > 2:614838/1‑100 (MQ=255) ntgATCATGGTTAGTCGTGCTCAAAGTGGTGCCCCCACAATACAAGAATTAAAAATGTTACGGGTAACTGTTATCGGTAACATTGTCCGGCTGGACAatg > 1:3104151/2‑99 (MQ=255) gtgATCATGGTTAGTCGTGCTCAAAGTGGTGCCCCCACAATACAAGAATTAAAAATGTTACGGGTAACTGTTATCGGTAACATTGTCCAGCCGGACAata < 1:2224669/100‑1 (MQ=255) tgATCATGGTTAGTCGTGCTCAAAGTGGTGCCCCCACAATACAAGAATTAAAAATGTTACGGGTAACTGTTATCGGTAACATTGTCCGGCTGGACAatgt < 1:3282571/100‑3 (MQ=255) tgATCATGGTTAGTCGTGCTCAAAGTGGTGCCCCCACAATACAAGAATTAAAAATGTTACGGGTAACTGTTATCGGTAACATTGTCCGGCTGGACAatgt < 1:787628/100‑3 (MQ=255) tgATCATGGTTAGTCGTGCTCAAAGTGGTGCCCCCACAATACAAGAATTAAAAATGTTACGGGTAACTGTTATCGGTAACATTGTCCAGCCGGACAatat > 2:3651642/1‑100 (MQ=255) tgATCATGGTTAGTCGTGCTCAAAGTGGTGCCCCCACAATACAAGAATTAAAAATGTTACGGGTAACTGTTATCGGTAACATTGTCCAGCCGGACAatat < 2:2002360/100‑1 (MQ=255) tgATCATGGTTAGTCGTGCTCAAAGTGGTGCCCCCACAATACAAGAATTAAAAATGTTACGGGTAACTGTTATCGGTAACATTGTCCAGCCGGACAatat > 1:3845750/1‑100 (MQ=255) aTCATTGTTAGTCGTGCTCAAATTAGTCCCCCCACAATACAATAATTAAAAATGTTACGGGTAACTGTTATCGGTAACATTGTCCAGCCGGACAatat < 2:3973497/98‑1 (MQ=255) aTCATGGTTAGTCGTGCTCAAAGTGGTGCCCCCACAATACAAGAATTAAAAATGTTACGGGTAACTGTTATCGGTAACATTGTCCGGCTGGACAatgtta < 1:2548421/100‑5 (MQ=255) tCATGGTTAGTCGTGCTCAAAGTGGTGCCCCCACAATACAAGAATTAAAAATGTCACGGGTAACTGTTATCGGTAACATTGTCCAGCCGGACAATATCAg > 1:264122/1‑100 (MQ=255) cATGGTTAGTCGTTCTCAAAGTGGTGCCCCCCCAATACAAGATTTAAAAATGTTACGGGTCACTGTTATCGGTAACATTGTCCGGCTGGACAatgttacc < 2:403175/100‑7 (MQ=255) cATGGTTAGTCGTGCTCAAAGTGGTGCCCCCACAATACAAGAATTAAAAATGTTACGGGTAACTGTTCTCGGTAACATTGTCCAGCCGGACAATATCAGa > 2:1963047/1‑100 (MQ=255) cATGGTTAGTCGTGCTCAAAGTGGTGCCCCCACAATACAAGAATTAAAAATGTTACGGGTAACTGTTATCGGTAACATTGTCCGGCTGGACAatgttacc < 2:413790/100‑7 (MQ=255) cATGGTTAGTCGTGCTCAAAGTGGTGCCCCCACAATACAAGAATTAAAAATGTTACGGGTAACTGTTATCGGTAACATTGTCCGGCTGGACAatgttacc < 1:98077/100‑7 (MQ=255) aTGGTTAGTCGTGCTCATAGTGGTGCCCCTACAATACAAGAATTAAAAATGTTATGGGTAACTGTTATCGGTAACATTGTCCGGCTGGACAatgttaccg < 2:809030/100‑8 (MQ=255) tGGTTAGTCGTGCTCAAAGTGGTGCCCCCACAATACAAGAATTAAAAATGTTACGGGTAACTGTTATCGGTAACATTGTCCAGCCGGACAATATCAGAAg > 2:4124520/1‑100 (MQ=255) tGGTTAGTCGTGCTCAAAGTGGTGCCCCCACAATACAAGAATTAAAAATGTTACGGGTAACTGTTATCGGTAACATTGTCCAGCCGGACAATATCAGAAg < 1:1125840/100‑1 (MQ=255) tGGTTAGTCGTGCTCAAAGTGGTGCCCCCACAATACAAGAATTAAAAATGTTACGGGTAACTGTTATCGGTAACATTGTCCAGCCGGACAATATCAGAAg < 1:2862658/100‑1 (MQ=255) tGGTTAGTCGTGCTCAAAGTGGTGCCCCCAAAATACAAGAATTAAAAATGTTACGGGTAACTGTTATCGGTAACATTGTCCAGCCGGACAATATCAGAAg < 2:1783889/100‑1 (MQ=255) gTTAGTCGTGCTCAAAGTGGTGCCCCCACAATACAAGAATTAAAAATGTTACGGGTAACTGTTATCGGTAACATTGTCCAGCCGGACAATATCAGAAGc > 1:4055347/1‑99 (MQ=255) gTTAGTCGTGCTCAAAGTGGTGCCCCCACAATACAAGAATTAAAAATGTTACGGGTAACTGTTATCGGTAACATTGTCCAGCCGGACAATATCAGAAGCa > 2:362310/1‑100 (MQ=255) ttAGTCGTGCTCAAAGTGGTGCCCCCACAATACAAGAATTAAAAATGTTACGGGTAACTGTTATCGGTAACATTGTCCAGCCGGACAATATCAGAAGCaa < 1:109021/100‑1 (MQ=255) gTCGTGCTCAAAGTGGTGCCCCCACAATACAAGAATTAAAAATGTTACGGGTAACTGTTATCGGTAACATTGTCCAGCCGGACAATATCAGAAGCAatat < 2:3762173/100‑1 (MQ=255) cGTGCTCAAAGTGGTGCCCCCACAATACAAGAATTAAAAATGTTACGGGTAACTGTTATCGGTAACATTGTCCAGCCGGACAATATCAGAAGCAATatcc > 1:3538221/1‑100 (MQ=255) cGTGCTCAAAGTGGTGCCCCCACAATACAAGAATTAAAAATGTTACGGGTAACTGTTATCGGTAACATTGTCCAGCCGGACAATATCAGAAGCAATatc > 1:3591069/1‑99 (MQ=255) gTGCTCAAAGTGGTGCCCCAACAATACAAGAATTAAAAATGTTACGGGTAACTGTTATCGGTAACATTGTCCAGCCGGACAATATCAGAAGCAATatcca < 2:1913261/100‑1 (MQ=255) tGCTCAAAGTGGTGCCCCCACAATACAAGAATTAAAAATGTTACGGGTAACTGTTATCGGTAACATTGTCCAGCCGGACAATATCAGAAGCAATatccat < 1:2629139/100‑1 (MQ=255) tCAAAGTGGTGCCCCCACAATACAAGAATTAAAAATGTTACGGGTAACTGTTATCGGTAACATTGTCCAGCCGGACAATATCAGAAGCAATAtccatcca > 1:1184809/1‑100 (MQ=255) tCAAAGTGGTGCCCCCACAATACAAGAATTAAAAATGTTACGGGTAACTGTTATCGGTAACATTGTCCAGCCGGACAATATCAGAAGCAATAtccatcca > 1:1289206/1‑100 (MQ=255) tCAAAGTGGTGCCCCCACAATACAAGAATTAAAAATGTTACGGGTAACTGTTATCGGTAACATTGTCCAGCCGGACAATATCAGAAGCAATAtccatcca > 2:2322938/1‑100 (MQ=255) cAAAGTGGTGCCCCCACAATACAAGAATTAAAAATGTTACGGGTAACTGTTATCGGTAACATTGTCCAGCCGGACAATATCAGAAGCAATATccatccat > 2:3385256/1‑100 (MQ=255) cAAAGTGGTGCCCCCACAATACAAGAATTAAAAATGTTACGGGTAACTGTTATCGGTAACATTGTCCAGCCGGACAATATCAGAAGCAATATccatccat > 1:2614467/1‑100 (MQ=255) aaGTGGTGCCCCCACAATACAAGAATTAAAAATGTTACGGGTAACTGTTATCGGTAACATTGTCCAGCCGGACAATATCAGAAGCAATATCCATCCATGc > 1:879565/1‑100 (MQ=255) gtggtgTCCCCACAATACAAGAATTAAAAATGTTACGGGTAACTGTTATCGGTAACATTGTCCAGCCGGACAATATCAGAAGCAATATCCATCCATGCCt > 1:608524/1‑100 (MQ=255) tggtgCCCCCACAATACAAGAATTAAAAATGTTACGGGTAACTGTTATCGGTAACATTGTCCAGCCGGACAATATCAGAAGCAATATCCATCCATGCCtt > 1:2965476/1‑100 (MQ=255) ggtgCCCCCACAATACAAGAATTAAAAATGTTACGGGTAACTGTTATCGGTAACATTGTCCAGCCGGACAATATCAGAAGCAATATCCATCCATGCCTTa < 2:3467518/100‑1 (MQ=255) ggtgCCCCCACAATACAAGAATTAAAAATGTTACGGGTAACTGTTATCGGTAACATTGTCCAGCCGGACAATATCAGAAGCAATATCCATCCATGCCTTa < 2:1317505/100‑1 (MQ=255) ggtgCCCCCACAATACAAGAATTAAAAATGTTACGGGCAACCGTTATCGGTAACATTGTCCAGCCGGACAATATCAGAAGCAATCTCCATCCATGCCTTa > 2:1970588/1‑100 (MQ=255) tgCCCCCACAATACAAGAATTAAAAATGTTACGGGTAACTGTTATCGGTAACATTGTCCAGCCGGACAATATCAGAAGCAATATCCATCCATGCCTTAAg > 1:1800352/1‑100 (MQ=255) gCCCCCACAATACAAGAATTAAAAATGTTACGGGTAACTGGTATCGGTAACATTGTCCAGCCGGACAATATCAGAAGCAATATCCATCCAGGCCATAAgt > 1:1864187/1‑100 (MQ=255) cccccACAATACAAGAATTAAAAATGTTACGGGTAACTGTTATCGGTAACATTGTCCAGCCGGACAATATCAGAAGCAATATCCATCCATGCCTTAAgtg < 1:1214677/100‑1 (MQ=255) cccccACAATACAAGAATTAAAAATGTTACGGGTAACTGTTATCGGTAACATTGTCCAGCCGGACAATATCAGAAGCAATATCCATCCATGCCTTAAgtg > 2:1603856/1‑100 (MQ=255) ccccACAATACAAGAATTAAAAATGTTACGGGTAACTGTTATCGGTAACATTGTCCAGCCGGACAATATCAGAAGCAATATCCATCCATGCCTTAAgtgt > 1:2446461/1‑100 (MQ=255) caccAAAATTCAATATTTAAATATTTTACTGTTAACTTTTATCGCTAACATTGTCCAGCCTGACAATATCATAAGCAATATCCATCCATGCCTTAAg < 2:3725410/95‑1 (MQ=255) cacaATACAAGAATTAAAAATGTTACGGGTAACTGTTATCGGTAACATTGTCCAGCCGGACAATATCAGAAGCAATATCCATCCATGCCTTAAGTGta < 2:2090669/98‑1 (MQ=255) caATACAAGAATTAAAAATGTTACGGGTAACTGTTATCGGTAACATTGTCCAGCCGGACAATATCAGAAGCAATATCCATCCATGCCTTAAGTGTATAAg < 1:55051/100‑1 (MQ=255) caATACAAGAATTAAAAATGTTACGGGTAACTGTTATCGGTAACATTGTCCAGCCGGACAATATCAGAAGCAATATCCATCCATGCCTTAAGTGTATAAg < 1:1011534/100‑1 (MQ=255) aaTACAAGAATTAAAAATGTTACGGGTAACTGTTATCGGTAACATTGTCCAGCCGGACAATATCAGAAGCAATATCCATCCATGCCTTAAGTGTATAAgt > 2:3418980/1‑100 (MQ=255) cAAGAATTAAAAATGTTACGGGTAACTGTTATCGGTAACATTGTCCAGCCGGACAATATCAGAAGCAATATCCATCCATGCCTTAAGTGTATAAGTGTGa < 1:1324576/100‑1 (MQ=255) cAAGAATTAAAAATGTTACGGGTAACTGTTATCGGTAACATTGTCCAGCCGGACAATATCAGAAGCAATATCCATCCATGCCTTAAGTGTATAAGTGTGa > 2:2977321/1‑100 (MQ=255) aaGAATTAAAGATGTTACGGGTAACTGTTATCGGTAACATTGTCCAGCCGGACAATATCAGAAGCAATATCCATCCATGCCTTAAGTGTATAAgtgt > 2:19053/1‑97 (MQ=255) aagaTTAAAAATTTTACGGGTAACTGTTATCGGGAAGATTGTCCAGCCGGACAATATCAGAAGCAATATCCATCCATGCCTTAAGGGTATAAGTGTGAGc < 2:1206824/97‑1 (MQ=255) aGAATTAAAAATGTTACGGGTAACTGTTATCGGTAACATTGTCCAGCCGGACAATATCAGAAGCAATATCCATCCATGCCTTAAGTGTATAAGTGTGAGc > 2:353082/1‑100 (MQ=255) aTTAAAAATGTTACGGGTAACTGTTATCGGTAACATTGTCCAGCCGGACAATATCAGAAGCAATATCCATCCATGCCTTAAGTGTATAAGTGTGAGCTa < 2:2563322/99‑1 (MQ=255) aTTAAAAATGTTACGGGTAACTGTTATCGGTAACATTGTCCAGCCGGACAATATCAGAAGCAATATCCATCCATGCCTTAAGTGTATAAGTGTGAGCTAc < 2:3224172/100‑1 (MQ=255) aTTAAAAATGTTACGGGTAACTGTTATCGGTAACATTGTCCAGCCGGACAATATCAGAAGCAATATCCATCCATGCCTTAAGTGTATAAGTGTGAGCTAc < 2:1427692/100‑1 (MQ=255) ttAAAAATGTTGCGGGTAACTGTTATCGGTAGCATTGTCTAGCCGGACAATATTAGAAGCAATATCCATCCATGCCTTAAGTGTATAAGTGTGAGCTa < 2:2100380/98‑1 (MQ=255) ttAAAAATGTTACGGGTAACTGTTATCGGTAACATTGTCCAGCTGGACAATATCAGAAGCAATATCCATCCATGCCTTAAGTGTATAAGTGTGAGCTACt < 1:1986325/100‑1 (MQ=255) tAAAAATGTTACGGGTAACTGTTATCGGTAACATTGTCCAGCCGGACAATATCAGAAGCAATATCCATCCATGCCTTAAGTGTATAAGTGTGAGCTACtt > 1:1899113/1‑100 (MQ=255) tAAAAATGTTACGGGTAACTGTTATCGGTAACATTGTCCAGCCGGACAATATCAGAAGCAATATCCATCCATGCCTTAAGTGTATAAGTGTGAGCTACtt > 1:902505/1‑100 (MQ=255) tAAAAATGTTACGGGTAACTGTTATCGGTAACATTGTCCAGCCGGACAATATCAGAAGCAATATCCATCCATGCCTTAAGTGTATAAGTGTGAGCTACtt > 2:3904352/1‑100 (MQ=255) aaaaaTGTTACGGGTAACTGTTATCGGTAACATTGTCCAGCCGGACAATATCAGAAGCAATATCCATCCATGCCTTAAGTGTATAAGTGTGAGCTACTTc < 1:2877767/100‑1 (MQ=255) aaaaTGTTACGGGTAACTGTTATCGGTAACATTGTCCAGCCGGACAATATCAGAAGCAATATCCATCCATGCCTTAAGTGTATAAGTGTGAGCTACTTCa > 1:150385/1‑100 (MQ=255) aTGTTACGGGTAACTGTTATCGGTAACATTGTCCAGCCGGACAATATCAGAAGCAATATCCATCCACGCCTTAAGTGTATAAGTGCGAGCTACTTc > 2:2601944/1‑96 (MQ=255) aTGTTACGGGTAACTGTTATCGGTAACATTGTCCAGCCGGACAATATCAGAAGCAATATAAATCCAGGCCTTAAATGTATAAGTGTGAGCTACTTCAAAt > 2:2456506/1‑100 (MQ=255) ttACGGGTAACTGTTATCGGTAACATTGTCCAGCCGGACAATATCAGAAGCAATATCCATCCATGCCTTAAGTGTATAAGTGTGAGCTACTTCAAATTtg < 1:746669/100‑1 (MQ=255) aCGGGTAACTGTTATCGGTAACATTGTCCAGCCGGACAATATCAGAAGCAATATCCATCCATGCCTTAAGTGTATAAGTGTGAGCTACTTCAAATTtgtg < 2:2710163/100‑1 (MQ=255) cGGGTAACTGTTATCGGTAACATTGTCCAGCCGGACAATATCAGAAGCAATATCCATCCATGCCTTAAGTGTATAAGTGTGAGCTACTTCAAATTTGTgg < 1:4060472/100‑1 (MQ=255) cGGGTAACTGTTATCGGTAACATTGTACAGCCGGACAATATCAGAAGCAATATCCATCCATGCCTTAAGTGTATAAGTGTGAGCTACTTCAAAttt > 2:3704872/1‑96 (MQ=255) gTAACTGTTATCGGTAACATTGTCCAGCCGGACAATATCAGAAGCAATATCCATCCATGCCTTAAGTGTATAAGTGTGAGCTACTTCAAATTTGTGGGCt > 1:3967901/1‑100 (MQ=255) gTAACTGTTATCGGTAACATTGTCCAGCCGGACAATATCAGAAGCAATATCCATCCATGCCTTAAGTGTATAAGTGTGAGCTACTTCAAATTTGTGGGCt > 2:407317/1‑100 (MQ=255) cTGTTATCGGTAACATTGTCCAGCCGGACAATATCAGAAGCAATATCCATCCATGCCTTAAGTGTATAAGTGTGAGCTACTTCAAATTTGTGGGCTTaaa > 1:429857/1‑100 (MQ=255) tGTTATCGGTAACATTGTCCAGCCGGACAATATCAGAAGCAATATCCATCCATGCCTTAAGTGTATAAGTGTGAGCTACTTCAAATTTGTGGGCTTAAAt < 2:1111421/100‑1 (MQ=255) tgcttctgataTTGTCCGGCTGGACAATATCAGAAGCAATATCCATCCATGCCTTAAGTGTATAAGTGTGAGCTACTTCAAATTTGTGGGCTTAAATAGa > 2:896439/11‑100 (MQ=38) gcttctgataTTGTCCGGCTGGACAATATCAGAAGCAATATCCATCCATGCCTTAAGTGTATAAGTGTGAGCTACTTCAAATTTGTGGGCTTAAATAGAt > 2:1085078/10‑100 (MQ=38) aTCGGTAACATTGTCCAGCCGGACAATATCAGAAGCAATATCCATCCATGCCTTAAGTGTATAAGTGTGAGCTACTTCAAATTTGTGGGCTTAAATAGAt > 1:3351852/1‑100 (MQ=255) tCGGTAACATTGTCCAGCCGGACAATATCAGAAGCAATATCCATCCATGCCTTAAGGGTATAAGTGTGAGCGACTTCAAATTTGTCGGCTTAAATAGa > 2:3855668/1‑98 (MQ=255) tCGCTAACATTGTCCAGGCGGATAGTATGAGATGCAATATCCATCCAAGGCTTAAGTGTATATGTGTGAGCTACTTCAAATTTGTGGGCTGAAATAGATc < 2:3498097/100‑1 (MQ=255) ttctgataTTGTCCGGCTGGACAATATCAGAAGCAATATCCATCCATGCCTTAAGTGTATAAGTGTGAGCTACTTCAAATTTGTCGGCTTAAATAGATcc > 2:138843/8‑100 (MQ=255) cGGTAACATTGTCCAGCCGGACAATATCAGAAGCAATATCCATCCATGCCTTAAGTGTATAAGTGTGAGCTACTTCAAATTTGTGGGCTTAAATAGAt > 1:1663682/1‑98 (MQ=255) tctgataTTGTCCGGCTGGACAATATCAGAAGCAATATCCATCCATGCCTTAAGTGTATAAGTGTGAGCGACTTCAAATTTGTGGGCTTAAATAGTTCCg > 2:3067869/7‑100 (MQ=255) gTAACATTGTCCAGCCGGACAATATCAGAAGCAATATCCATCCATGCCTTAAGTGTATAAGTGTGAGCTACTTCAAATTTGTGGGCTTAAATAGATCCGc > 1:3454044/1‑100 (MQ=255) gataTTGTCCGGCTGGACAATATCAGAAGCAATATCCATCCATGCCTTAAGTGTATAAGTGTGAGCTACTTCAAATTTGTGGGCTTAAATAGATCCGccc > 1:305890/4‑100 (MQ=255) gataTTGTCCGGCTGGACAATAGCAGAAGCAATATCCATCCATGCCTTAAGTGTATAAGTGTGAGATACTTCAAATTTGTGGGCTTAAATAGATcagac > 2:1684467/4‑95 (MQ=255) aaCATTGTCCAGCCGGACAATATCAGAAGCAATATCCATCCATGCCTTAAGTGTATAAGTGTGAGCTACTTCAAATTTGTGGGCTTAAATAGATCCGccc < 1:2097537/100‑1 (MQ=255) aCATTGTCCAGCCGGACAATATCAGAAGCAATATCCATCCATGCCTTAAGTGTATAAGTGTGAGCTACTTCAAATTTGTGGGCTTAAATAGATCCGCCCg < 2:316591/100‑1 (MQ=255) naTTGTCCAGCCGGACAATATCAGAAGCAATATACACCCATGCCTTAAGTGAATAAGAGTGAGCTCCCTCAAATCTGTGGACTTAAATAGAGCCGCCAgg > 2:664908/2‑100 (MQ=255) cATTGTCCAGCCGGACAATATCAGAAGCAATATCCATCCATGCCTTAAGTGTATAAGTGTGAGCTACTTCAAATTTGTGGGCTTAAATAGATCCGCCCgg > 1:3699446/1‑100 (MQ=255) aTTGTCCAGCCGGACAATATCAGAAGCAATATCCATCCATGCCTTAAGTGTATAAGTGTGAGCTACTTCAAATTTGTGGGCTTAAATAGATCCGCCCGGt < 2:2327346/100‑1 (MQ=255) aTTGTCCAGCCGGACAATATCAGAAGCAATATCCATCCATGCCTTAAGTGTATAAGTGTGAGCTACTTCAAATTTGTGGGCTTAAATAGATCCGCCCGGt > 1:3664939/1‑100 (MQ=255) gTCCAGCCGGACAATATCAGAAGCAATATCCATCCATGCCTTAAGTGTATAAGTGTGAGCTACTTCAAATTTGTGGGCTTAAATAGATCCGCCCGGTGaa > 2:2210231/1‑99 (MQ=255) gTCCAGCCGGACAATATCAGAAGCAATATCCATCCATGCCTTAAGTGTATAAGTGTGAGCTACTTCAAATTTGTGGGCTTAAATAGATCCGCCCGGTGAc > 1:1316513/1‑100 (MQ=255) gTCCAGCCGGACAATATCAGAAGCAATATCCATCCATGCCTTAAGTGTATAAGTGTGAGCTACTTCAAATTTGTGGGCTTAAATAGATCCGCCCGGTGAc > 1:343007/1‑100 (MQ=255) aGCCGGACAATATCAGAAGCAATATCCATCCATGCCTTAAGTGTATAAGTGTGAGCTACTTCAAATTTGTGGGCTTAAATAGATCCGCCCGGTGACAAgg > 1:2338003/1‑100 (MQ=255) gCCGGACAATATCAGAAGCAATATCCATCCATGCCTTAAGTGTATAAGTGTGAGCTACTTCAAATTTGTGGGCTTAAATAGATCCGCCCGGTGACAAGGt < 2:2892771/100‑1 (MQ=255) cGGACAATATCAGAAGCAATATCCATCCATGCCTTAAGTGTATAAGTGTGAGCTACTTCAAATTTGTGGGCTTAAATAGATCCGCCCGGTGACAAGGTGa > 1:169068/1‑100 (MQ=255) | TAAATGTGGTGATCATGGTTAGTCGTGCTCAAAGTGGTGCCCCCACAATACAAGAATTAAAAATGTTACGGGTAACTGTTATCGGTAACATTGTCCAGCCGGACAATATCAGAAGCAATATCCATCCATGCCTTAAGTGTATAAGTGTGAGCTACTTCAAATTTGTGGGCTTAAATAGATCCGCCCGGTGACAAGGTGA > NC_000913/3577561‑3577759 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |