| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,686,929 | G→T | 50.3% | Q749K (CAG→AAG) | bcsC ← | cellulose synthase subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,686,929 | 0 | G | T | 50.3% | 3.4 / inf | 223 | Q749K (CAG→AAG) | bcsC | cellulose synthase subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (55/56); new base T (57/55); total (112/111) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.94e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 223 total aligned reads displayed.
CTGGCGATAGAGGTCCGCCGCATCGCTGCGCACGCCACGTTTCAGCCAGTCATCTTTCTCGTCGTTACGGGTCAGTCGGGTAAAGGTGTCGTTATCCTGCGGACGCGTCGTAGTCACACCGGATGCGACCATGGCGTCTTTGTAGGTTTCCAGCGCCTGCGTTGGATCGCCCGCCTGCGCTTCAAACTTCGCACCAT > NC_000913/3686831‑3687027 | ctgGCGATAGAGGTCCGCCGCATCGCTGCGCACGCCACGTTTCAGCCAGTCATCTTTCTCGTCGTTACGGGTCAGTCGGGTAAAGGTGTCGTTATCCTGc < 1:2248005/100‑1 (MQ=255)ctgGCGATAGAGGTCCGCCGCATCGCTGCGCACGCCACGTTTCAGCCAGTCATCTTTCTCGTCGTTACGGGTCAGTCGGGTAAAGGTGTCGTTATCCTGc > 2:2609644/1‑100 (MQ=255)ctgGCGATAGAGGTCCGCCGCATCGCTGCGCACGCCACGTTTCAGCCAGTCATCTTTCTCGTCGTTACGGGTCAGTCGGGTAAAGGTGTCGTTATCCTGc < 1:954810/100‑1 (MQ=255) tgGCGATAGAGGTCCGCCGCATCGCTGCGCACGCCACGTTTCAGCCAGTCATCTTTCTCGTCGTTACGGGTCAGTCGGGTAAAGGTGTCGTTATCCTTCg < 1:3552213/100‑1 (MQ=255) tgGCGATAGAGGTCCGCCGCATCGCTGCGCACGCCACGTTTCAGCCAGTCATCTTTCTCGTCGTTACGGGTCAGTCGGGTAAAGGTGTCGTTATCCTGCg > 2:3178106/1‑100 (MQ=255) ggCGATAGAGGTCCGCCGCATCGCTGCGCACGCCACGTTTCAGCCAGTCATCTTTCTCGTCGTTACGGGTCAGTCGGGTAAAGGTGTCGTTATCCTTCgg < 2:2015418/100‑1 (MQ=255) ggCGATAGAGGTCCGCCGCATCGCTGCGCACGCCACGTTTCAGCCAGTCATCTTTCTCGTCGTTACGGGTCAGTCGGGTAAAGGTGTCGTTATCCTGCgg < 1:2133937/100‑1 (MQ=255) gCGATAGAGGTCCGCCGCATCGCTGCGCACGCCACGTTTCAGCCAGTCATCTTTCTCGTCGTTACGGGTCAGTCGGGTAAAGGTGTCGTTATCCTTCGGa < 1:3955218/100‑1 (MQ=255) gCGATAGAGGTCCGCCGCATCGCTGCGCACGCCACGTTTCAGCCAGTCATCTTTCTCGTCGTTACGGGTCAGTCGGGTAAAGGTGTCGTTATCCTGCGGa < 2:3319983/100‑1 (MQ=255) tAGAGGTCCGCCGCATCGCTGCGCACGCCACGTTTCAGCCAGTCATCTTTCTCGTCGTTACGGGTCAGTCGGGTAAAGGTGTCGTTATCCTGCGGAcgcg < 1:921890/100‑1 (MQ=255) tAGAGGTCCGCCGCATCGCTGCGCACGCCACGTTTCAGCCAGACCTCTTTCTCGTCGTTACGGGTCAGTCGGGTAAAGGTGTCGTTATCCTGCGAAc > 1:1499160/1‑97 (MQ=255) gagGTCCGCCGCATCGCTGCGCACGCCACGTTTCAGCCAGTCATCTTTCTCGTCGTTACGGGTCAGTCGGGTAAAGGTGTCGTTATCCTTCGGACGcgtc > 1:4124471/1‑100 (MQ=255) gagGTCCGCCGCATCGCTGCGCACGCCACGTTTCAGCCAGTCATCTTTCTCGTCGTTACGGGTCAGTCGGGTAAAGGTGTCGTTATCCTTCGGACGcgtc < 1:1206290/100‑1 (MQ=255) gagGTCCGCCGCATCGCTGCGCACGCCACGTTTCAGCCAGTCATCTTTCTCGTCGTTACGGGTCAGTCGGGTAAAGGTGTCGTTATCCTTCGGACGcgtc > 1:502968/1‑100 (MQ=255) ntCCGCCGCATCGCTGCGCACGCCACGTTTCAGCCAGTCATCTTTCTCGTCGTTACGGGTCAGTCGGGTAAAGGTGTCGTTATCCTTCGGACGCGTCGTa > 2:3220189/2‑100 (MQ=255) gTCCGCCGCATCGCTGCGCACGCCACGTTTCAGCCAGTCATCTTTCTCGTCGTTACGGGTCAGTCGGGTAAAGGTGTCGTTATCCTTCGGACGCGTCGTa > 1:809727/1‑100 (MQ=255) gTCCGCCGCATCGCTGCGCACGCCACGTTTCAGCCAGTCATCTTTCTCGTCGTTACGGGTCAGTCGGGTAAAGGTGTCGTTATCCTTCGGACGCGTCGTa > 1:730590/1‑100 (MQ=255) gTCCGCCGCATCGCTGCGCACGCCACGTTTCAGCCAGTCATCTTTCTCGTCGTTACGGGTCAGTCGGGTAAAGGTGTCGTTATCCTGCGGCCGCGTCGTa > 1:1000356/1‑100 (MQ=255) tCCGCCGCATCGCTGCGCACGCCACGTTTCAGCCAGTCATCTTTCTCGTCGTTACGGGTCAGTCGGGTAAAGGTGTCGTTATCCTTCGGACGCGTCGTAg < 2:3487052/100‑1 (MQ=255) tCCGCCGCATCGCTGCGCACGCCACGTTTCAGCCAGTCATCTTTCTCGTCGTTACGGGTCAGTCGGGTAAAGGTGTCGTTATCCTGCGGACGCGTCGTAg < 1:3349162/100‑1 (MQ=255) ccgccgCATCGCTGCGCACGCCACGTTTCAGCCAGTCATCTTTCTCGTCGTTACGGGTCAGTCGGGTAAAGGTGTCGTTATCCTGCGGACGCGTCGTAGt > 1:1138062/1‑100 (MQ=255) ccgccgCATCGCTGCGCACGCCACGTTTAAGCCAGTCCTCTCTCTCGTCGTTACGGGTCAGGCGGGTAAAGGTGTCGTTATCCTGCGGACGAGTCGTAGt > 2:1812865/1‑100 (MQ=255) gccgcATCGCTGCGCACGCCACGTTTCAGCCAGTCATCTTTCTCGTCGTTACGGGTCAGTCGGGTAAAGGTGTCGTTATCCTTCGGACGCGTCGTAGTca > 2:51212/1‑100 (MQ=255) ccgcATCGCTGCGCACGCCACGTTTCAGCCAGTCATCTTTCTCGTCGTTACGGGTCAGTCGGGTAAAGGTGTCGTTATCCTTCGGACGCGTCGTAGTcac < 2:2026140/100‑1 (MQ=255) ccgcATCGCTGCGCACGCCACGTTTCAGCCAGTCATCTTTCTCGTCGTTACGGGTCAGTCGGGTAAAGGTGTCGTTATCCTGCGGACGCGTCGTAGTcac < 1:3756272/100‑1 (MQ=255) cgcATCGCTGCGCACGCCACGTTTCAGCCAGTCATCTTTCTCGTCGTTACGGGTCAGTCGGGTAAAGGTGTCGTTATCCTTCGGACGCGTCGTAGTcaca < 2:3941274/100‑1 (MQ=255) gcATCGCTGCGCACGCCACGTTTCAGCCAGTCATCTTTCTCGTCGTTACGGGTCAGTCGGGTAAAGGTGTCGTTATCCTGCAGACGCGTCGTAGTCacac > 2:1784953/1‑100 (MQ=255) cATCGCTGCGCACGCCACGTTTCAGCCAGTCATCTTTCTCGTCGTTACGGGTCAGTCGGGTAAAGGTGTCGTTATCCTTCGGACGCGTCGTAGTCACAcc < 1:2664928/100‑1 (MQ=255) tCGCTGCGCACGCCACGTTTCAGCCAGTCATCTTTCTCGTCGTTACGGGTCAGTCGGGTAAAGGTGTCGTTATCCTGCGGACGCGTCGTAGTCACACCgg < 2:3117853/100‑1 (MQ=255) cTGCGCACGCCACGTTTCAGCCAGTCATCTTTCTCGTCGTTACGGGTCAGTCGGGTAAAGGTGTCGTTATCCTTCGGACGCGTCGTAGTCACACCGGATg < 1:1370316/100‑1 (MQ=255) gcgcACGCCACGTTTCAGCCAGTCATCTTTCTCGTCGTTACGGGTCAGTCGGGTAAAGGTGTCGTTATCCTTCGGACGCGTCGTAGTCACACCGGATGCg < 2:3713575/100‑1 (MQ=255) cgcACGCCACGTTTCAGCCAGTCATCTTTCTCGTCGTTACGGGTCAGTCGGGTAAAGGTGTCGTTATCCTGCGGACGCGTCGTAGTCACACCGGATGCGa < 1:2817092/100‑1 (MQ=255) gcACGCCACGTTTCGGCCAGTCATCTTTCTCGTCGTTACGGGTCAGTCGGGTAAAGGTGTCGTTATCCTGCGGACGCGTCGTAGTCACGCCGGATGCGAc < 2:2161807/100‑1 (MQ=255) gcACGCCACGTTTCAGCCAGTCATCTTTCTCGTCGTTACGGGTCAGTCGGGTAAAGGTGTCGTTATCCTTCGGACGCGTCGTAGTCACACCGGATGCGAc > 2:732014/1‑100 (MQ=255) gcACGCCACGTTTCAGCCAGTCATCTTTCTCGTCGTTACGGGTCAGTCGGGTAAAGGTGTCGTTATCCTGCGGACGCGTCGTAGTCACACCGGATGCGAc > 1:2182146/1‑100 (MQ=255) ccACGTTTCAGCCAGTCATCTTTCTCGTCGTTACGGGTCAGTCGGGTAAAGGTGTCGTTATCCTGCGGACGCGTCGTAGTCACACCGGATGCGACCATgg > 1:3410455/1‑100 (MQ=255) cACGTTTCAGCCAGTCATCTTTCTCGTCGTTACGGGTCAGTCGGGTAAAGGTGTCGTTATCCTTCGGATGCGTCGTAGTCACACCGGATGCGACCATgg < 2:2709570/99‑1 (MQ=255) cACGTTTCAGCCAGTCATCTTTCTCGTCGTTACGGGTCAGTCGGGTAAAGGTGTCGTTATCCTTCGGACGCGTCGTAGTCACACCGGATGCGACCATGGc > 1:2305098/1‑100 (MQ=255) aCGTTTCAGCCAGTCATCTTTCTCGTCGTTACGGGTCAGTCGGGTAAAGGTGTCGTTATCCTGCGGACGCGTCGTAGTCACACCGGATGCGACCATGGCg < 1:3881513/100‑1 (MQ=255) cGTTTCAGCCAGTCATCTTTCTCGTCGTTACGGGTCAGTCGGGTAAAGGTGTCGTTATCCTGCGGACGCGTCGTAGTCACACCGGATGCGACCATGGCGt < 1:1272579/100‑1 (MQ=255) gTTTCAGCCAGTCATCTTTCTCGTCGTTACGGGTCAGTCGGGTAAAGGTGTCGTTATCCTTCGGACGCGTCGTAGTCACACCGGATGCGACCATGGCGTc < 1:2466356/100‑1 (MQ=255) gTTTCAGCCAGTCATCTTTCTCGTCGTTACGGGTCAGTCGGGTAAAGGTGTCGTTATCCTGCGGACGCGTCGTAGTCACACCGGATGCGACCATGGCGTc > 1:61221/1‑100 (MQ=255) tttCAGCCAGTCATCTTTCTCGTCGTTACGGGTCAGTCGGGTAAAGGTGTCGTTATCCTTCGGACGCGTCGTAGTCACACCGGATGCGACCATGGCGTCt > 2:725291/1‑100 (MQ=255) tttCAGCCAGTCATCTTTCTCGTCGTTACGGGTCAGTCGGGTAAAGGTGTCGTTATCCTGCGGACGCGTCGTAGTCACACCGGATGCGACCATGGCGTCt > 1:4042449/1‑100 (MQ=255) tCAGCCAGTCATCTTTCTCGTCGTTACGGGTCAGTCGGGTAAAGGTGTCGTTATCCTTCGGACGCGTCGTAGTCACACCGGATGCGACCATGGCGTCttt < 2:3039946/100‑1 (MQ=255) cAGCCAGTCATCTTTCTCGTCGTTACGGGTCAGTCGGGTAAAGGTGTCGTTATGCTTCGGACGCGTCGTAGTCACACCGGATGCGACCATGGCGTCTTTg > 2:3243962/1‑100 (MQ=255) cAGCCAGTCATCTTTCTCGTCGTTACGGGTCAGTCGGGTAAAGGTGTCGTTATCCTTCGGACGCGTCGTAGTCACACCGGATGCGACCATGGCGTCTTTg > 1:1015215/1‑100 (MQ=255) ccAGTCATCTTTCTCGTCGTTACGGGTCAGTCGGGTAAAGGTGTCGTTATCCTGCGGACGCGTCGTAGTCACACCGGATGCGACCATGGCGTCTTTGTAg < 1:3189057/100‑1 (MQ=255) ccAGTCATCTTTCTCGTCGTTACGGGTCAGTCGGGTAAAGGTGTCGTTATCCTGCGGACGCGTCGTAGTCACACCGGATGCGACCATGGCGTCTTTGTAg > 1:373747/1‑100 (MQ=255) aGTCATCTTTCTCGTCGTTACGGGTCAGTCGGGTAAAGGTGTCGTTATCCTTCGGACGCGTCGTAGTCACACCGGATGCGACCATGGCGTCTTTGTAGGt > 1:172880/1‑100 (MQ=255) cATCTTTCTCGTCGTTACGGGTCAGTCGGGTAAAGGTGTCGTTATCCTTCGGACGCGTCGTAGTCACACCGGATGCGACCATGGCGTCTTTGTAGGTTTc > 2:231342/1‑100 (MQ=255) cATCTTTCTCGTCGTTACGGGTCAGTAGGGTAATGGTGTCGTTTTCCTTCGGACGCGTCGTAGTTATACCGGATGCGACCATGGCGTCTTTGTAGGTTTc > 2:1287627/1‑100 (MQ=255) aTCTTTCTCGTCGTTACGGGTCAGTCGGGTAAAGGTGTCGTTATCCTTCGGACGCGTCGTAGTCACACCGGATGCGACCATGGCGTCTTTGTAGGTTTcc < 2:2986780/100‑1 (MQ=255) tctcGTCGTTACGGGTCAGTCGGGTAAAGGTGTCGTTATCCTTCGGACGCGTCGTAGTCACACCGGATGCGACCATGGCGTCTTTGTAGGTTTCCAgcgc > 2:2446548/1‑100 (MQ=255) ctcGTCGTTACGGGTCAGTCGGGTAAAGGTGTCGTTATCCTTCGGACGCGTCGTAGTCACACCGGATGCGACCATGGCGTCTTTGTAGGTTTCCAGCGcc > 1:2383067/1‑100 (MQ=255) tcgtcgTTACGGGTCAGTCGGGTAAAGGTGTCGTTATCCTTCGGACGCGTCGTAGTCACACCGGATGCGACCGTGGCGTCTTTGTAGGTTTCCAGCGCCt > 2:3089277/1‑100 (MQ=255) cgtcgtTACGGGTCAGTCGGGTAAAGGTGTCGTTATCCTGCGGACGCGTCGTAGTCACACCGGATGCGACCATGGCGTCTTTGTAGGTTTCCAGCGCCTg > 1:657931/1‑100 (MQ=255) cgtcgtTACGGGTCAGTCGGGTAAAGGTGTCGTTATCCTGCGGACGCGTCGTAGTCACACCGGATGCGACCATGGCGTCTTTGTAGGTTTCCAGCGCCTg > 1:2731955/1‑100 (MQ=255) ttACGGGTCAGTCGGGTAAAGGTGTCGTTATCCTTCGGACGCGTCGTAGTCACACCGGATGCGACCATGGCGTCTTTGTAGGTTTCCAGCGCCTGCGTTg < 2:2911675/100‑1 (MQ=255) tACGGGTCAGTCGGGTAAAGGTGTCGTTATCCTTCGGACGCGTCGTAGTCACACCGGATGCGACCATGGCGTCTTTGTAGGTTTCCAGCGCCTGCGTTgg > 2:2932360/1‑100 (MQ=255) tACGGGTCAGTCGGGTAAAGGTGTCGTTATCCTTCGGACGCGTCGTAGTCACACCGGATGCGACCATGGCGTCTTTGTAGGTTTCCAGCGCCTGCGTTgg < 2:128310/100‑1 (MQ=255) tACGGGTCAGTCGGGTAAAGGTGTCGTTATCCTGCGGACGCGTCGTAGTCACACCGGATGCGACCATGGCGTCTTTGTAGGTTTCCAGCGCCTGCGTTgg < 2:3538722/100‑1 (MQ=255) cGGGTCAGTCGGGTAAAGGTGTCGTTATCCTTCGGACGCGTCGTAGTCACACCGGATGCGACCATGGCGTCTTTGTAGGTTTCCAGCGCCTGCGTTGGAt < 1:1752858/100‑1 (MQ=255) cGGGTCAGTCGGGTAAAGGTGTCGTTATCCTGCGGACGCGTCGTAGTCACACCGGATGCGACCATGGCGTCTTTGTAGGCTTCCAGCGCCTGCGTTGGAt > 2:4031563/1‑100 (MQ=255) gggTCAGTCGGGTAAAGGTGTCGTTATCCTTCGGACGCGTCGTAGTCACACCGGATGCGACCATGGCGTCTTTGTAGGTTTCCAGCGCCTGCGTTGGATc > 1:157415/1‑100 (MQ=255) ggTCAGTCGGGTAAAGGTGTCGTTATCCTTCGGACGCGTCGTAGTCACACCGGATGCGACCATGGCGTCTTTGTAGGTTTCCAGCGCCTGCGTTGGATcg > 2:863858/1‑100 (MQ=255) ggTCAGTCGGGTAAAGGTGTCGTTATCCTTCGGACGCGTCGTAGTCACACCGGATGCGACCATGGCGTCTTTGTAGGTTTCCAGCGCCTGCGTTGGATcg < 2:2971707/100‑1 (MQ=255) ggTCAGTCGGGTAAAGGTGTCGTTATCCTGCGGACGCGTCGTAGTCACACCGGATGCGACCATGGCGTCTTTGTAGGTTTCCAGCGCCTGCGTTGGATcg < 1:899851/100‑1 (MQ=255) ggTCAGTCGGGTAAAGGTGTCGTTATCCTGCGGACGCGTCGTAGTCACACCGGATGCGACCATGGCGTCTTTGTAGGTTTCCAGCGCCTGCGTTGGATcg > 1:459461/1‑100 (MQ=255) cAGTCGGGTAAAGGTGTCGTTATCCTTCGGACGCGTCGTAGTCACACCGGATGCGACCATGGCGTCTTTGTAGGTTTCCAGCGCCTGCGTTGGATcgccc > 2:3508477/1‑100 (MQ=255) cAGTCGGGTAAAGGTGTCGTTATCCTTCGGACGCGTCGTAGTCACACCGGATGCGACCATGGCGTCTTTGTAGGTTTCCAGCGCCTGCGTTGGATcgccc < 1:3025392/100‑1 (MQ=255) cAGTCGGGTAAAGGTGTCGTCATCCTGCGGACGCGTCGTAGTCACACCGGATGCGACCATGGCGTCTTTGTAGGTTTCCAGCGCCTGCGTTGGATcgccc > 2:2519330/1‑100 (MQ=255) aGTCGGGTAAAGGTGTCGTTATCCTTCGGACGCGTCGTAGTCACACCGGATGCGACCATGGCGTCTTTGTAGGTTTCCAGCGCCTGCGTTGGATcgcccg > 1:1835067/1‑100 (MQ=255) aGTCGGGTAAAGGTGTCGTTATCCTGCGGACGCGTCGTAGTCACACCGGATGCGACCATGGCGTCTTTGTAGGTTTCCAGCGCCTGCGTTGGATcgcccg > 2:1906142/1‑100 (MQ=255) gTCGGGTAAAGGTGTCGTTATCCTGCGGACGCGTCGTAGTCACACCGGATGCGACCATGGCGTCTTTGTAGGTTTCCAGCGCCTGCGTTGGATcgcccgc < 2:2997069/100‑1 (MQ=255) tCGGGTAAAGGTGTCGTTATCCTTCGGACGCGTCGTAGTCACACCGGATGCGACCATGGCGTCTTTGTAGGTTTCCAGTGCCTGCGTTGGATcgcccgcc < 2:2639686/100‑1 (MQ=255) cGGGTAAAGGTGTCTTTCACATGCGGACGCGTCGTAGTCACACCCGATGCGACCATGGCCTCTTTGTAGGTTTCCAACGCAGGCGCTGGaaccctaaa < 2:2679398/98‑9 (MQ=255) cGGGTAAAGGTGTCGTTATCCTGCGGACGCGTCGTAGTCACACCGGATGCGACCATGGCGTCTTTGTAGGTTTCCAGCGCCTGCGTTGGATCGCCCGCCt > 1:1378142/1‑100 (MQ=255) gggTAAAGGTGTCGTTATCCTTCGGACGCGTCGTAGTCACACCGGATGCGACCATGGCGTCTTTGTAGGTTTCCAGCGCCTGCGTTGGATCGCCCGCCTg > 2:3032657/1‑100 (MQ=255) gggTAAAGGTGTCGTTATCCTTCGGACGCGTCGTAGTCACACCGGATGCGACCATGGCGTCTTTGTAGGTTTCCAGCGCCTGCGTTGGATCGCCCGCCTg < 1:3987315/100‑1 (MQ=255) tAAAGGTGTCGTTATCCTGCGGACGCGTCGTAGTCACACCGGATGCGACCATGGCGTCTTTGTAGGTTTCCAGCGCCTGCGTTGGATCGCCCGCCTgcgc > 2:663381/1‑100 (MQ=255) aaGGTGTCGTTATCCTTCGGACGCGTCGTAGTCACACCGGATGCGACCATGGCGTCTTTGTAGGTTTCCAGCGCCTGCGTTGGATCGCCCGCCTGCGCtt > 1:279193/1‑100 (MQ=255) aGGTGTCGTTATCCTGCGGACGCGTCGTAGTCACACCGGATGCGACCATGGCGTCTTTGTAGGTTTCCAGCGCCTGCGTTGGATCACCCGCCTGCGCTTc > 2:1672333/1‑100 (MQ=255) ggTGTCGTTATCCTTCGGACGCGTCGTAGTCACACCGGATGCGACCATGGCGTCTTTGTAGGTTTCCAGCGCCTGCGTTGGATCGCCCGCCTGCGCTTCa > 1:1333844/1‑100 (MQ=255) tgtCGTTATCCTGCGGACGCGTCGTAGTCACACCGGATGCGACCATGGCGTCTTTGTAGGTTTCCAGCGCCTGCGTTGGATCGCCCGCCTGCGCTTCaa > 2:411069/1‑99 (MQ=255) gtCGTTATCCTTCGGACGCGTCGTAGTCACACCGGATGCGACCATGGCGTCTTTGTAGGTTTCCAGCGCCTGCGTTGGATCGCCCGCCTGCGCTTCAAAc < 1:301476/100‑1 (MQ=255) gtCGTTATCCTTCGGACGCGTCGTAGTCACACCGGATGCGACCATGGCGTCTTTGTAGGTTTCCAGCGCCTGCGTTGGATCGCCCGCCTGCGCTTCAAAc < 1:1062876/100‑1 (MQ=255) gtCGTTATCCTTCGGACGCGTAGTAGTCACACCGGATGCGACCATGGCGTCTTTGTAGGTTTCCAGCGCCTGCGTTGGATCGCCCGCCTGCGCTTCAAAc < 1:2631693/100‑1 (MQ=255) gtCGTTATCCTGCGGACGCGTCGTAGTCACACCGGATGCGACCATGGCGTCTTTGTAGGTTTCCAGCGCCTGCGTTGGATCGCCCGCCTGCGCTTCAAAc < 2:1625921/100‑1 (MQ=255) tCGTTATCCTGCGGACGCGTCGTAGTCACACCGGATGCGACCATGGCGTCTTTGTAGGTTTCCAGCGCCTGCGTTGGATCGCCCGCCTGCGCTTCAAACt < 2:2397069/100‑1 (MQ=255) ttATCCTTCGGACGCGTCGTAGTCACACCGGATGCGACCATGGCGTCTTTGTAGGTTTCCAGCGCCTGCGTTGGATCGCCCGCCTGCGCTTCAAACTTCg < 1:2326159/100‑1 (MQ=255) ttATCCTGCGGACGCGTCGTAGTCACACCGGATGCGACCATGGCGTCTTTGTAGGTTTCCAGCGCCTGCGTTGGATCGCCCGCCTGCGCTTCAAACTTCg < 1:557322/100‑1 (MQ=255) ttATCCTGCGGACGCGTCGTAGTCACACCGGATGCGACCATGGCGTCTTTGTAGGTTTCCAGCGCCTGCGTTGGATCGCCCGCCTGCGCTTCAAACTTCg < 1:2076036/100‑1 (MQ=255) tATCCTGCGGACGCGTCGTAGTCACACCGGATGCGACCATGGCGTCTTTGTAGGTTTCCATCCCCTGCTTTGGATCGCCCGCCTGCGCTTCAAACTTCg < 2:1024963/99‑1 (MQ=255) tCCTGCGGACGCGTCGTAGTCACACCGGATGCGACCATGGCGTCTTTGTAGGTTTCCAGCGCCTGCGTTGGATCGCCCGCCTGCGCTTCAAACTTCGc < 2:1156122/98‑1 (MQ=255) tCCTGCGGACGCGTCGTAGTCACACCGGATGCGACCATGGCGTCTTTGTAGGTTTCCAGCGCCTGCGTTGGATCGCCCGCCTGCGCTTCAAACTTCGCAc > 2:2758970/1‑100 (MQ=255) cTGCGGACGCGTCGTAGTCACACCGGATGCGACCATGGCGTCTTTGTAGGTTTCCAGCGCCTGCGTTGGATCGCCCGCCTGCGCTTCAAACTTCGCACCa < 2:3590381/100‑1 (MQ=255) cTGCGGACGCGTCGTAGTCACACCGGATGCGACCATGGCGTCTTTGTAGGTTTCCAGCGCCTGCGTTGGATCGCCCGCCTGCGCTTCAAACTTCGCACCa < 2:1455178/100‑1 (MQ=255) tGCGGACGCGTCGTAGTCACACCGGATGCGACCATGGCGTCTTTGTAGGTTTCCAGCGCCTGCGTTGGATCGCCCGCCTGCGCTTCAAACTTCGCACCAt < 1:3157362/100‑1 (MQ=255) tGCGGACGCGTCGTAGTCACACCGGATGCGACCATGGCGTCTTTGTAGGTTTCCAGCGCCTGCGTTGGATCGCCCGCCTGCGCTTCAAACTTCGCACCAt < 1:3504780/100‑1 (MQ=255) | CTGGCGATAGAGGTCCGCCGCATCGCTGCGCACGCCACGTTTCAGCCAGTCATCTTTCTCGTCGTTACGGGTCAGTCGGGTAAAGGTGTCGTTATCCTGCGGACGCGTCGTAGTCACACCGGATGCGACCATGGCGTCTTTGTAGGTTTCCAGCGCCTGCGTTGGATCGCCCGCCTGCGCTTCAAACTTCGCACCAT > NC_000913/3686831‑3687027 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |