| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,727,880 | T→C | 54.7% | intergenic (‑132/+37) | yiaB ← / ← xylB | YiaAB family inner membrane protein/xylulokinase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,727,880 | 0 | T | C | 54.7% | 44.9 / 187.5 | 155 | intergenic (‑132/+37) | yiaB/xylB | YiaAB family inner membrane protein/xylulokinase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (34/36); new base C (36/48); total (71/84) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.18e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.88e-01 | |||||||||||
Only 100 of 159 total aligned reads displayed.
GAGTAACCAACGAAAGACAAAACTGAAAAATGCCATTAACAAATGATTTTCAGAATAAATTCATACTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGTGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGTTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTGATAGAGGCGACGGAACGTTTCTCGTCGTGGCTGA > NC_000913/3727781‑3727977 | gAGTAACCAACGAAAGACAAAACTGAAAAATGCCATTAACAAATGATTTTCAGAATAAATTCATACTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGAtgt > 2:3076429/1‑100 (MQ=255) tAACCAACGAAAGACAAAACTGAAAAATGCCATTAACAAATGATTTTCAGAATAAATTCATACTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGCGaa < 1:1686544/100‑1 (MQ=255) aaCCAACGAAAGACAAAACTGAAAAATGCCATTAACAAATGATTTTCAGAATAAATTCATACTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGCGAAt < 2:232465/100‑1 (MQ=255) aaCCAACGAAAGACAAAACTGAAAAATGCCATTAACAAATGATTTTCAGAATAAATTCATACTAAATATTAATTAATTACTAAGATATATAGATGTGa > 2:3687964/1‑98 (MQ=255) ccAACGAAAGACAAAACTGAAAAATGCCATTAACAAATGATTTTCAGAATAAATTCATACTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGCGAATTa > 1:2711903/1‑100 (MQ=255) aaCGAAAGACAAAACTGAAAAATGCCCTTAACAAAAGATTTTCCGAATAAATGCATACTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGTGAATTATc > 1:3196283/1‑100 (MQ=255) aaCGAAAGACAAAACTGAAAAATGCCATTAACAAATGATTTTCAGAATAAATTCATACTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGTGAATTATc > 1:32120/1‑100 (MQ=255) aCGAAAGACAAAACTGAAAAATGCCATTAACAAATGATTTTCAGAATAAATTCATACTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGTGAATTATcc > 1:2071722/1‑100 (MQ=255) cGAAAGACAAAACTGAAAAATGCCATTAACAAATGATTTTCAGAATAAATTCATACTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGCGAATTATctc < 1:2809909/100‑3 (MQ=255) aaGACAAAACTAAAAAATTCCAATAACAAATAATTTTCAGAATAAATTCACACTATATAATAAGTAATTACTGTGATTTATATAGGCGAATTAGcccc < 2:2459742/98‑1 (MQ=255) aGACAAAACTGAAAAATGCCATTAACAAATGATTTTCAGAATAAATTCATACTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGCGAATTATCCCCCAc < 1:2216605/100‑1 (MQ=255) aCAAAACTGAAAAATGCCATTAACAAATGATTTTCAGAATAAATTCATACTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGCGAATTATCCCCCAccc > 1:1547981/1‑100 (MQ=255) aaaaCTGAAAAATGCCATTAACAAATGATTTTCAGAATAAATTCATACTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGTGAATTATCCCCCACCCgg < 2:503390/100‑1 (MQ=255) aaaCTGAAAAATGCCATTAACAAATGATTTTCAGAATAAATTCATACTAAATGTTAATTAATTACTGAGATATATAGATGCGAATTATCCCCCACCCGGt > 1:3549511/1‑100 (MQ=255) aaaCTGAAAAATGCCATTAACAAATGATTTTCAGAATAAATTCATACTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGTGAATTATCCCCCACCCGGt > 2:4090898/1‑100 (MQ=255) aaaCTGAAAAATGCCATTAACAAATGATTTTCAGAATAAATTCATACTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGTGAATTATCCCCCACCCGGt > 2:534506/1‑100 (MQ=255) aaCTGAAAAATGCCATTAACAAATGATTTTCAGAATAAATTCATACTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGCGAATTATCCCCCACCCGGTc > 2:1682542/1‑100 (MQ=255) aCTGAAAAATGCCATTAACAAATGATTTTCAGAATAAATTCATACTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGTGAATTATCCCCCACCCGGTca < 1:593926/100‑1 (MQ=255) cTGAAAAATGCCATTAACAAATGATTTTCAGAATAAATTCATACTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGCGAATTATCCCCCACCCGGTcag > 1:3927071/1‑100 (MQ=255) cTGAAAAATGCCATTAACAAATGATTTTCAGAATAAATTCATACTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGCGAATTATCCCCCACCCGGTcag < 1:7634/100‑1 (MQ=255) cTGAAAAATGCCATTAACAAATGATTTTCAGAATAAATTCATACTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGCGAATTATCCCCCACCCGGTcag > 1:3719442/1‑100 (MQ=255) cTGAAAAATGCCATTAACAAATGATTTTCAGAATAAATTCATACTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGAGAATTATCCCCCACACGGTcag > 1:3867064/1‑100 (MQ=255) tGAAAAATGCCATTAACAAATGATTTTCAGAATAAATTCATACTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGTGAATTATCCCCCACCCGGTcagg > 1:867368/1‑100 (MQ=255) tGAAAAATGCCATTAACAAATGATTTTCAGAATAAATTCATACTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGTGAATTATCCCCCACCCGGTcagg < 1:1158694/100‑1 (MQ=255) tGAAAAATGCCATTAACAAATGATTTTCAGAATAAATTCATACTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGCGAATTATCCCCCACCCGGTcagg > 1:615504/1‑100 (MQ=255) gAAAAATGCCATTAAAAAATGATTTTCAGAATAAATTCATACTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATATATGCGAATTATCCACCACACGGTcag > 2:1610539/1‑98 (MQ=255) aaTGCCATTAACAAATGATTTTCAGAATAAATTCATACTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGCGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAggg < 1:3021631/100‑1 (MQ=255) aaTGCCATTAACAAATGATTTTCAGAATAAATTCATACTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGCGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAggg < 2:1046516/100‑1 (MQ=255) aaTGCCATTAACAAATGATTTTCAGAATAAATTCATACTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGCGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAggg < 1:482669/100‑1 (MQ=255) aTGCCATTAACAAATGATTTTCAGAATAAATTCATACTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGTGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAgggg < 2:2184177/100‑1 (MQ=255) aTGCCATTAACAAATGATTTTCAGAATAAATTCATACTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGTGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAgggg > 1:1133106/1‑100 (MQ=255) aTGCCATTAACAAATGATTTTCAGAATAAATTCATACTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGCGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAgggg > 1:1852515/1‑100 (MQ=255) tGCCATTAACAAATGATTTTCAGAATAAATTCATACTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGTGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGa < 2:2035743/100‑1 (MQ=255) ccATTAACAAATGATTTTCAGAATAAATTCATACTTAATATTAATTAATTCCTGAGAAATATAGATTTAATTTATCCCCCACCCTGTCAGCCATGGGAt > 2:1591654/1‑99 (MQ=255) aaCAAATGATTTTCAGAATAAATTCATACTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGCGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGtt > 2:1488805/1‑100 (MQ=255) aaCAAATGATTTTCAGAATAAATTCATACTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGCGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGtt > 2:1078072/1‑100 (MQ=255) cAAATGATTTTCAGAATAAATTCATACTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGCGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGTAGGGGATAACGTTTa > 1:3516415/1‑100 (MQ=255) cAAATGATTTTCAGAATAAATTCATACTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGCGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGTTTa > 1:1754236/1‑100 (MQ=255) cAAATGATTTTCAGAATAAATTCATACTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGCGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGTTTa > 1:806412/1‑100 (MQ=255) aaTGATTTTCAGAATAAATTCATACTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGCGAATAATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGTTTACg > 1:2905457/1‑100 (MQ=255) aTGATTTTCAGAATAAATTCATACTACATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGCGAATTATCACCCACCCGGTCAGTCAGGGGATAACGTTTACGc > 2:3035819/1‑100 (MQ=255) aTGATTTTCAGAATAAATTCATACTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGCGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGTTTAcn < 2:1520234/99‑2 (MQ=255) aTTTTCAGAATAAGTTCATACTAATTATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGTGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGTTTACGCCAt < 1:3261470/100‑1 (MQ=255) aTTTTCAGAATAAATTCATACTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGCGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGTTTACGCCAt < 2:2854514/100‑1 (MQ=255) ttCAGAATAAATTCATACTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGTGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGTTTTCGCCAtt > 2:309504/1‑98 (MQ=255) tCAGAATAAATTCATACTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGTGAATTATCCCCAACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGTTTACGCCATTAAt > 2:1550480/1‑100 (MQ=255) tCAGAATAAATTCATACTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGCGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGTTTACGCCATTAAt > 1:2918892/1‑100 (MQ=255) cAGAATAAATTCATACTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGCGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGTTTACGCCATTAATg < 2:70638/100‑1 (MQ=255) aGAATAAATTCATACTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATATATTTGAATTATAACCCACACTGTTAAGCAGAGGATAACGTTTAAGCCATTAAtag > 2:3806122/1‑98 (MQ=255) gAATAAATTCATACTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGCGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGTTTACGCCATTAATGGc > 2:2069154/1‑100 (MQ=255) gAATAAATTCATACTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGCGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGTTTACGCCATTAATGGc > 1:798354/1‑100 (MQ=255) gAATAAATTCATACTAAATATTAATTAATTACGGAGATATATAGATGTGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGTGTACGCCATTAATGGc < 2:393706/100‑1 (MQ=255) aaTCAATTCATACTACATATTAATTAATTACTGAGATATTTAGATACGAATTATACACCAGCCTGTTAGGCAGCGGATGAATTTTACGCCATTaa > 2:1959245/1‑95 (MQ=255) aaTAAATTCATACTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGTGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGTTTACGCCATTAATGGc > 1:1362898/1‑99 (MQ=255) aaTAAATTCATACTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGCGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGTTTACGCCATTAATGGc < 2:2624499/99‑1 (MQ=255) aaTAAATTCATACTAAATATAAATTAATTACTGACATATATAGATGTGATTTATCCCCCACCCGGTAAGGCAGGGGATAACGTATACGTCATTAATgg < 2:1906608/98‑1 (MQ=255) aTAAATTCATACTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGTGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGTTTACGCCATTAATGGCAg < 2:1329459/100‑1 (MQ=255) aTAAATTCATACTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGCGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGTTTACGCCATTAATGGCAg < 2:1054436/100‑1 (MQ=255) aaaTTCATACTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGTGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGTTTACGCCATTAATGGCAGaa < 2:186351/100‑1 (MQ=255) aaTTCATACTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGTGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGGAGGGGATAACGTTTACGCCATTAATGGCAGAAg > 2:2667383/1‑100 (MQ=255) tCATACTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGTGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGTTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTg < 2:690799/100‑1 (MQ=255) cATACTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGTGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGTTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGc < 2:4049009/100‑1 (MQ=255) aTACTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGTGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGTTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGc < 1:4109204/99‑1 (MQ=255) aTACTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGCGAATGATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGTTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCt < 1:346275/100‑1 (MQ=255) aCTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGCGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGTTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTGa < 1:513742/100‑1 (MQ=255) aCTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGCGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGTTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTGa < 1:1259277/100‑1 (MQ=255) tAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGTGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGTTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTGATa > 2:1547766/1‑100 (MQ=255) tAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGAGGCGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGTGGATAACGTTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTGAt < 2:814916/99‑1 (MQ=255) aaTATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGCGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGTTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTGATaga < 1:3584097/100‑1 (MQ=255) atatTAATTAATTACTGAGATATATAGATGTGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGTTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTGATagag < 1:2814456/100‑1 (MQ=255) tatTAATTAATTACTGAGATATATAGATGTGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGTTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTGATAGAgg > 2:3982254/1‑100 (MQ=255) attaattaattaCTGAGATATATAGATGTGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGTTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTGATAGAGGc < 1:3767592/100‑1 (MQ=255) atgaattaattaCTGAGATATATAGATGTGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGTTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTGATAGAGGc < 2:1152848/97‑1 (MQ=255) ttaattaattaCTGAGATATATAGATGCGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGTTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTGATAGAGGCg < 1:3275805/100‑1 (MQ=255) aattaattaCTGAGATATATAGATGTGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGGAGGGGATAACGTTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTGATAGAGGCGAc < 1:2667399/100‑1 (MQ=255) aattaattaCTGAGATATATAGATGTGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGTTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTGATAGAGGCGAc < 1:2386763/100‑1 (MQ=255) aattaattaCTGAGATATATAGATGTGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGTTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTGATAGAGGCGAc < 2:1670045/100‑1 (MQ=255) aattaattaCTGAGATATATAGATGCGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGTTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTGATAGAGGCGAc < 2:65260/100‑1 (MQ=255) attaattaCTGAGATATATAGATGTGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGTTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTGATAGAGGCGACg > 2:3640253/1‑100 (MQ=255) attaattaCTGAGATATATAGATGTGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGAGGATAACGTTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTGATAGAGGCGACg < 2:3391182/100‑1 (MQ=255) attaattaCTGAGATATATAGATGCGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGTTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTGATAGAGGCGACg > 1:496314/1‑100 (MQ=255) taattaCTGAGATATATAGATGTGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGTTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTGATAGAGGCGACGGa < 1:1093591/100‑1 (MQ=255) taattaCTGAGATATATAGATGCGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGTTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTGATAGAGGCGACGGa > 1:4047081/1‑100 (MQ=255) cTGAGATATATAGATGTGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGTTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTGATAGAGGCGACGGAACGttt > 1:842297/1‑100 (MQ=255) tGAGATATATAGATGTGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGTTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTGATAGAGGCGACGGAACGTTtc < 2:1161495/100‑1 (MQ=255) gagaTATATAGATGTGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGTTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTGATAGAGGCGACGGAACGTTtct > 1:1794830/1‑100 (MQ=255) gagaTATATAGATGCGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGTTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTGATAGAGGCGACGGAACGTTtct < 1:2069167/100‑1 (MQ=255) gaTATATAGATGTGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGTTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTGATAGAGGCGACGGAACGTTTCtcg < 2:32120/100‑1 (MQ=255) gaTATATAGATGCGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGTTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTGATAGAGGCGACGGAACGTTTCtcg < 2:798348/100‑1 (MQ=255) tatataGATGTGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGTTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTGATAGAGGCGACGGAACGTTTCtcgtc > 1:1441578/1‑100 (MQ=255) tatataGATGCGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGTTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTGATAGAGGCGACGGAACGTTTCtcgtc > 1:2351358/1‑100 (MQ=255) atataGATGCGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGTATAACGTTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTGATAGAGGCGACGGAACGTTTCtcgtcg < 2:3477152/100‑1 (MQ=255) tataGATGTGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGTTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTGATAGAGGCGACGGAACGTTTCTcgtcgt < 2:3253024/100‑1 (MQ=255) tataGATGCGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGTTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTGATAGAGGCGACGGAACGTTTCTcgtcgt < 1:1894145/100‑1 (MQ=255) ctaGATGTGAATTATCCCCCACACGGTCAGGCAGGGGATAACGTTTACGCCCTTAATGGCAGAAGTTGCCGAAAGAGGCGACGAAACGTTCCtcgcagtg > 2:1422389/2‑95 (MQ=255) taGATGTGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGTTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTGATAGAGGCGACGGAACGTTTCTCGTCGTgg < 2:1309442/100‑1 (MQ=255) taGATGTGAATTATCCCCCACCCCGTCAGGCAGGGGATAACGTCTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTGATAGAGGCGACCGAACGTTTCTCGTCGTgg < 2:2770286/100‑1 (MQ=255) aGATGTGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGTTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTGATAGAGGCGACGGAACGTTTCTCGTCGTGGc > 2:4133072/1‑100 (MQ=255) gATGTGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGTTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTGATAGAGGCGACGGAACGTTTCTCGTCGTGGc < 2:1582984/99‑1 (MQ=255) tgtgAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGTTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTGATAGAGGCGACGGAACGTTTCTCGTCGTGGCTGa > 2:953852/1‑100 (MQ=255) | GAGTAACCAACGAAAGACAAAACTGAAAAATGCCATTAACAAATGATTTTCAGAATAAATTCATACTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGTGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGTTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTGATAGAGGCGACGGAACGTTTCTCGTCGTGGCTGA > NC_000913/3727781‑3727977 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |