| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,281,967 | T→C | 53.7% | Q370R (CAG→CGG) | yjcF ← | pentapeptide repeats protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,281,967 | 0 | T | C | 53.7% | 37.3 / 281.1 | 222 | Q370R (CAG→CGG) | yjcF | pentapeptide repeats protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (53/49); new base C (65/53); total (119/103) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.85e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.69e-02 | |||||||||||
Only 100 of 227 total aligned reads displayed.
GTGGCACAATCTTCTTCAAAGAATTTCTGTAGTGTTACCAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGAAATGGCAATTGCTTAAATTGG > NC_000913/4281868‑4282066 | ggCACAATCTTGTTAAAAGAATTTCTGTAGTGTTACCAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTACTTAGCACGTAGAATGGTAATAACGATTCCCt > 2:3465728/1‑98 (MQ=255) ggCACAATCTTCTTCAAAGAATTTCTGTAGTGTTACCAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTgg < 1:1335723/100‑1 (MQ=255) acaATCTTCTTCAAAGAATTTCTGTAGTGTTACCAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCCGGACg > 2:1490274/1‑100 (MQ=255) aaTCTTCTTCAAAGAATTTCTGTAGTGTTACCAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCCGGACGCt > 1:2586220/1‑100 (MQ=255) tcttctTCAAAGAATTTCTGTAGTGTTACCAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCCGGACGCTAg < 1:750645/100‑1 (MQ=255) tcttctTCAAAGAATTTCTGTAGTGTTACCAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCCGGACGCTAg > 1:926502/1‑100 (MQ=255) cttcttCAAAGAATTTCTGTAGTGTTACCAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGc > 1:1205831/1‑100 (MQ=255) cttcttCAAAGAATTTCTGTAGTGTTACCAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGc < 1:1436009/100‑1 (MQ=255) ttcttcAAAGAATTTCTGTAGTGTTACCAGGATATCACTATTAATGGAGATCTTTTCCTCACAACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCCGGACGCTAGcc < 2:2208892/100‑1 (MQ=255) tcttcAAAGAATTTCTGTAGTGTTACCAGGCTATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCCGGACGCTAGCCt > 2:766145/1‑100 (MQ=255) ttcAAAGAATTTCTGTAGTGTTACCAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCCGGACGCTAGCCTcc < 2:2680228/100‑2 (MQ=255) ttcAAAGAATTTCTGTAGTGTTACCAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCCGGACGCTAGCCTCa > 1:3414449/1‑100 (MQ=255) ttcAAAGAATTTCTGTAGTGTTACCAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCCGGACGCTAGCCTCa > 2:3071130/1‑100 (MQ=255) tcAAAGAATTTCTGTAGTGTTACCAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCAt > 1:2348593/1‑100 (MQ=255) cAAAGAATTTCTGTAGTGTTACCAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCCGGACGCTAGCCTCATc < 1:4133733/100‑1 (MQ=255) aaaGAATTTCTGTAGTGTTACCAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCg > 1:1132559/1‑100 (MQ=255) aaaGAATTTCTGTAGTGTTACCAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCCGGACGCTAGCCTCATCg > 1:525087/1‑100 (MQ=255) gAATTTCTGTAGTGTTACCAGGATATCACTATTAATTGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCCGGACGCTAGCCTCATCGaaa < 2:1697767/100‑1 (MQ=255) gAATTTCTGTAGTGTTACCAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGTAGAATGGTAATACCCATTCTCCGGACGCTAGCCTCATCGaa > 2:1393788/1‑99 (MQ=255) aTTTCTGTAGTGTTACCAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAAtt < 1:1590339/100‑1 (MQ=255) aTTTCTGTAGTGTTACCAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCCGGACGCTAGCCTCATCGAAAtt < 1:4101638/100‑1 (MQ=255) cTGTAGTGTTACCAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCCGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAaca < 1:79406/100‑1 (MQ=255) tGTAGTGTTACCAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAacac < 1:1039787/100‑1 (MQ=255) ngTAGTGTTACCAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAacac > 2:1335804/2‑100 (MQ=255) gTAGTGTTACCAGGCTATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGTTAATACCCATTCCCTGTACGCTAGCCTCATCGAAATTAacac > 2:3586012/1‑99 (MQ=255) gTAGTGTTACCAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCCGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACg > 2:3824705/1‑100 (MQ=255) aGTGTTACCAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCCGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGAt < 2:1748962/100‑1 (MQ=255) gtgtTACCAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCCGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATa < 1:2260974/100‑1 (MQ=255) tgtTACCAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATag < 2:1942349/100‑1 (MQ=255) tcttccccggACATCATTACTAATGGAGATACTTTCCTCACCACGCCGACTAGTAATACCCATCCCCCGTACCCTACCCTCATAGAAATTAACACGAt > 2:1829528/9‑98 (MQ=255) tACCAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAgaga > 1:661705/1‑100 (MQ=255) tACCAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCCGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAgaga > 1:2294992/1‑100 (MQ=255) tACCAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCCGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAgaga > 2:2851825/1‑100 (MQ=255) aCCAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCCGAACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGAc > 2:2179626/1‑100 (MQ=255) ccAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATATCCATTCCCCGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACg < 2:642260/100‑1 (MQ=255) ccAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCTCCGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACg < 2:3408438/100‑1 (MQ=255) ccAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACg > 1:573372/1‑100 (MQ=255) ccAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACg < 2:97455/100‑1 (MQ=255) ccAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACg > 1:1834532/1‑100 (MQ=255) cAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCACCGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACgg > 2:3641809/1‑100 (MQ=255) gATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCCGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGa < 2:493623/98‑1 (MQ=255) atatCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCCGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGatat > 1:3870223/1‑100 (MQ=255) cACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCCGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTaaa > 1:3786859/1‑100 (MQ=255) cTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACa > 1:3503666/1‑100 (MQ=255) aTTAATGTAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATCGTAATACCCATTCCCCTGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATc < 2:4052542/100‑1 (MQ=255) aTGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCCGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAgg > 1:3719099/1‑100 (MQ=255) aTGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCCGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAgg < 1:3071149/100‑1 (MQ=255) tGGAGATATTTGCCTCACCACGGAGAATGGTAATAACCATTCCCCGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGc < 2:3645415/100‑1 (MQ=255) ggAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCCGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCt > 1:3216138/1‑100 (MQ=255) tatTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGt < 1:2461200/100‑1 (MQ=255) tatTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCCGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGt > 1:3470712/1‑100 (MQ=255) tatTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCCGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCAAGGCTTTTGt > 2:37295/1‑100 (MQ=255) atTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCCGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGtt < 2:2694978/100‑1 (MQ=255) cTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAaaca < 1:1468213/100‑1 (MQ=255) tCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAaacag > 1:148896/1‑100 (MQ=255) tCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAaacag > 1:2762004/1‑100 (MQ=255) tCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAaacag < 1:2120067/100‑1 (MQ=255) tCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAaacag > 1:1957282/1‑100 (MQ=255) caccacGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAaacaga < 2:1677301/100‑1 (MQ=255) accacGGAGAATGGTAATACCCATTCCCCGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAaacagaa < 1:390418/100‑1 (MQ=255) accacGGAGAATGGTAATACCCATTCCCCGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAaacagaa < 2:1451673/100‑1 (MQ=255) accacGGAGAATGGTAATACCCATTCCCCGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAaacagaa < 1:3429477/100‑1 (MQ=255) ccacGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAaacagaac < 2:3702741/100‑1 (MQ=255) ccacGGAGAATGGTAATACCCATTCCCCGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAaacagaa < 2:885558/99‑1 (MQ=255) acttagaATGGTAATACCCAATCCCCAGAAGATAGCCTCATCGAAGTTAATACGATAGAGACGGAGATTAAACAGCCAGGCTTTTGTTAAaacagaacag < 2:2154753/96‑1 (MQ=255) gtgggctGGGAATAGCCATACTCCGGACGCGTTCCTCATCGTAAGTACCACGATAGCGACTAATATTAGACATCCAGGCTTTTGTTAAaacagaac < 2:3930641/90‑1 (MQ=255) ggAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACCGtt > 2:1150090/1‑100 (MQ=255) ggAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGtt > 2:1873988/1‑100 (MQ=255) gagaATGGTAATACCCATTGCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTg < 2:2102015/100‑1 (MQ=255) gagaATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTg > 1:819122/1‑100 (MQ=255) gagaATGGTAATACCCATTCCCCGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATGGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTg < 2:2294979/100‑1 (MQ=255) gagaATGGTAATACCCATTCCCCGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTg < 2:776570/100‑1 (MQ=255) gaATGGTAATACCGATTCCCCGGACGCTAGCCTCATCAAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGaa > 1:2807134/1‑100 (MQ=255) gaATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGaa < 1:3364444/100‑1 (MQ=255) aaTGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGaaa < 2:4096819/100‑1 (MQ=255) aaTGGTAATACCCATTCCCCGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGaaa > 2:3119613/1‑100 (MQ=255) aaTGGTAATACCCATTCCCCGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGaaa < 1:1865208/100‑1 (MQ=255) tGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGAAATg > 1:3439833/1‑100 (MQ=255) tGGTAATACCCATTCCCCGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGAAATg < 1:2510733/100‑1 (MQ=255) gTAATACCCATTCCCTGTACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGATACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGAAATGGc > 2:344714/1‑100 (MQ=255) gTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGAAATGGc > 1:2211400/1‑100 (MQ=255) gTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGAAATGGc > 2:614435/1‑100 (MQ=255) gTAATACCCATTCCCCGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGAAATggn < 2:910274/100‑2 (MQ=255) tAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGAAATGGCa < 2:3503644/100‑1 (MQ=255) tAATACCCATTCCCCGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGAAATGGc > 1:3586591/1‑99 (MQ=255) aaTACCCATTCCCCGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGAAATGGCaa > 1:862578/1‑100 (MQ=255) aaTACCCATTCCCCGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGAAATGGCaa > 1:3389408/1‑100 (MQ=255) aaTACCCATTCCCCGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGAAATGGCaa > 1:472499/1‑100 (MQ=255) cccATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGAAATGGCAATTGc > 2:3424799/1‑100 (MQ=255) cccATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGAAATGGCAATTGc < 2:1971672/100‑1 (MQ=255) cccATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGAAATGGCAATTGc > 1:1825571/1‑100 (MQ=255) cccATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATGAACACGATAGATACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGAAATGGCAATTGc > 2:1636341/1‑100 (MQ=255) cccATTCCCCGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACATGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGAAATGGCAATTGc < 1:2905725/100‑1 (MQ=255) ccATTCCCCGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGAAATGGCAATTGCt > 2:2603692/1‑100 (MQ=255) cATTCCCCGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGAAATGGCAATTGCtt > 1:3171321/1‑100 (MQ=255) aTTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTCTTAAAACAGAACAGTTGAAATGGCAATTGCTTa < 2:2474048/100‑1 (MQ=255) ttCCCCGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGAAATGGCAATTGCTTaa < 2:3206460/100‑1 (MQ=255) tCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGAAATGGCAATTGCTTaaa < 2:2348580/100‑1 (MQ=255) ccccGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGAAATGGCAATTGCTTAAAt > 2:1088694/1‑100 (MQ=255) cTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGAAATGGCAATTGCTTAAATTg < 1:3223597/100‑1 (MQ=255) | GTGGCACAATCTTCTTCAAAGAATTTCTGTAGTGTTACCAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGAAATGGCAATTGCTTAAATTGG > NC_000913/4281868‑4282066 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |