Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 4,547,319 | C→A | 23.3% | R742S (CGT→AGT) | fimD → | fimbrial usher outer membrane porin protein; FimCD chaperone‑usher |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 4,547,319 | 0 | C | A | 23.3% | 439.4 / 127.5 | 217 | R742S (CGT→AGT) | fimD | fimbrial usher outer membrane porin protein; FimCD chaperone‑usher |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (78/87); new base A (24/27); total (103/114) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.02e-01 |
Only 100 of 221 total aligned reads displayed.
CGCTGGGGCAGCCGTTAAACGATACGGTGGTGCTTGTTAAAGCGCCTGGCGCAAAAGATGCAAAAGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGCGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACTGAATATCGGGAAAATAGAGTGGCGCTGGATACCAATACCCTGGCTGATAACGTCGATTTAGATAACGCGG > NC_000913/4547221‑4547418 | gCTGGGGCAGCCGTTAAACGATACGGTGGTGCTTGTTAAAGCGCCTGGCGCAAAAGATGCAAAAGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGCGt > 2:465066/1‑100 (MQ=255) gCTGGGGCAGCCGTTAAACGATACGGTGGTGCTTGTTAAAGCGCCTGGCGCAAAAGATGCAAAAGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGAGt < 1:1279070/100‑1 (MQ=255) gCTGGGGCAGCCGTTAAACGATACGGTGGTGCTTGTTAAAGCGCCTGGCGCAAAAGATGCAAAAGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGAGt < 2:2099391/100‑1 (MQ=255) tGGGGCAGCCGTTAAACGATACGGTGGTGCTTGTTAAAGCGCCTGGCGCAAAAGATGCAAAAGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGCGTgg < 2:2925586/100‑1 (MQ=255) ggCAGCCGTTAAACGATACGGTGGTGCTTGTTAAAGCGCCTGGCGCAAAAGATGCAAAAGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGCGTGGTTa < 1:3250025/100‑1 (MQ=255) ggCAGCCGTTAAACGATACGGTGGTGCTTGTTAAAGCGCCTGGCGCAAAAGATGCAAAAGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGAGTGGTTa > 2:2621404/1‑100 (MQ=255) ggCAGCCGGTAAACGATACGGTGGTGCTTGTTAAAGCGCCGGACGCGAAAGATGCAAAAGTCGAAAACCAGAGGAGGGGACGTACGGACTGGCg > 2:2462885/1‑94 (MQ=255) cAGCCGTTAACCGATACGGTAGTGCATTTTACCGCTCCCGTCGCCAAAGATGCAAAAGTCGAAAACCAGACGGCGGGGCATACCGACTGGCGTGGTTATg > 2:181059/1‑100 (MQ=255) gCCGTTAAACGATACGGTGGTGCTTGTTAAAGCGCCTGGCGCAAAAGATGCAAAAGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGTCGTGGTTATGcc < 1:2724343/100‑1 (MQ=255) gCCGTTAAACGATACGGTGGTGCTTGTTAAAGCGCCTGGCGCAAAAGATGCAAAAGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGCGTGGTTATGcc > 2:1757904/1‑100 (MQ=255) cGTTAAACGATACGGTGGTGCTTGTTAAAGCGCCTGGCGCAAAAGATGCAAAAGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGCGTGGTTATGcc > 1:900200/1‑98 (MQ=255) cGTTAAACGATACGGTGGTGCTTGTTAAAGCGCCTGGCGCAAAAGATGCAAAAGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGCGTGGTTATGCCGt > 1:792939/1‑100 (MQ=255) cGTTAAACGATACGGTGGTGCTTGTTAAAGCGCCTGGCGCAAAAGATGCAAAAGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGCGTGGTTATGCCGt > 1:570784/1‑100 (MQ=255) gTTAAACGATACGGTGGTGCTTGTTAAAGCGCCTGGCGCAAAAGATGCAAAAGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGCGTGGTTATGCCGtg > 1:1079812/1‑100 (MQ=255) ttAAACGATACGGTGGTGCTTGTTAAAGCGCCTGGCGCAAAAGATGCAAAAGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGCGTGGTTATGCCGtgc > 1:2891226/1‑100 (MQ=255) ttAAACGATACGGTGGTGCTTGTTAAAGCGCCTGGCGCAAAAGATGCAAAAGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGCGTGGTTATGCCGtgc > 2:1059803/1‑100 (MQ=255) ttAAACGATACGGTGGTGCTTGTTAAAGCGCCTGGCGCAAAAGATGCAAAAGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGAGTGGTTATGCCGtgc < 2:2136822/100‑1 (MQ=255) tAAACGATACGGTGGTGCTTGTTAAAGCGCCTGGCGCAAAAGATGCAAAAGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGCGTGGTTATGCCGtgct > 1:2614528/1‑100 (MQ=255) aaaCGATACGGTGGTGCTTGTTAAAGCGCCTGGCGCAAAAGATGCAAAAGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGAGTGGTTATGCCGtgctg < 1:1167340/100‑1 (MQ=255) aCGATACGGTGGTGCTTGTTAAAGCGCCTGGCGCAAAAGATGCAAAAGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGCGTGGTTATGCCGTGCTGcc < 1:3174045/100‑1 (MQ=255) tACGGTGGTGCTTGTTAAAGCGCCTGGCGCAAAAGATGCAAAAGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGCGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTAt < 1:2183012/100‑1 (MQ=255) tACGGTGGGGCTTGTTAAAGCGCCTGGCGCAAAAGATGCAAAAGTCGAAAACCAGAGGGGGGTGCGTACCGACTGGCGTGGTTATGCCGTGCTGCCt < 2:1850990/97‑1 (MQ=255) aCGGTGGTGCTTGTTAAAGCGCCTGGCGCAAAAGATGCAAAAGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGCGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTAt > 2:1478164/1‑99 (MQ=255) cGGTGGTGCTTGTTAAAGCACCTGGCGCAAAAGATGCAAAAGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGCGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGc < 1:3983988/100‑1 (MQ=255) ggtggtGCTTGTTAAAGCGCCTGGCGCAAAAGATGCAAAAGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGAGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGcc < 2:3109994/100‑1 (MQ=255) gtggtgCTTGTTAAAGCGCCTGGCGCAAAAGATGCAAAAGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGCGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCa < 1:2516849/100‑1 (MQ=255) gtgCTTGTTAAAGCGCCTGGCGCAAAAGATGCAAAAGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGCGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACTg < 1:2472236/100‑1 (MQ=255) gtgCTTGTTAAAGCGCCTGGCGCAAAAGATGCAAAAGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGCGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACTg < 1:3472725/100‑1 (MQ=255) gtgCTTGTTAAAGCGCCTGGCGCAAAAGATGCAAAAGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGAGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACTg < 1:4046074/100‑1 (MQ=255) tgCTTGTTAAAGCGCCTGGCGCAAAAGATGCAAAAGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGCGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACt > 2:474225/1‑98 (MQ=255) gCTTGTTAAAGCGCCTGGCGCAAAAGATGCAAAAGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGCGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACTGaa > 2:1955564/1‑100 (MQ=255) gCTTGTTAAAGCGCCTGGCGCAAAAGATGCAAAAGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGCGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACTGaa > 2:36244/1‑100 (MQ=255) gCTTGTTAAAGCGCCTGGCGCAAAAGATGCAAAAGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGCGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACTGa > 2:1303868/1‑99 (MQ=255) gCTTGTTAAAGCGCCTGGCGCAAAAGATGCAAAAGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGAGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACTGaa > 1:679333/1‑100 (MQ=255) gCTTGTTAAAGCGCCTGGCGCAAAAGATGAAAAAGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGCGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACTg < 2:2394971/98‑1 (MQ=255) tGTTAAAGCGCCTGGCGCAAAAGATGCAAAAGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGAGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACTGAatat > 2:3668912/1‑100 (MQ=255) ttAAAGCGCCTGTCGCAAAATATGCAAAAGTCGTAAACCAGACGGGGGTACGCACCGACTGGCGTGGTTCTGCCGTGCTGCCTTATGCCACTGaacgtcg > 2:2737867/1‑95 (MQ=255) ttAAAGCGCCTGGCGCAAAAGATGCAAAAGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGCGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACTGAATATCg < 1:336780/100‑1 (MQ=255) ttAAAGCGCCTGGCGCAAAAGATGCAAAAGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGAGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACTGAATATCg < 2:9535/100‑1 (MQ=255) tAAAGCGCGTGGCACAAAAGATGCAAAAGTGGAAAACCAGACGTGGGTGGGTACCGACTGTGGTGGTTATTCCGTGCGGTCTTATGCCGCTGAATATCgg > 2:3445699/1‑100 (MQ=255) tAAAGCGCCTGGCGCAAAAGATGCAAAAGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGCGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACTGAATATCgg > 1:382731/1‑100 (MQ=255) tAAAGCGCCTGGCGCAAAAGATGCAAAAGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGCGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACTGAATATCgg < 1:164185/100‑1 (MQ=255) tAAAGCGCCTGGCGCAAAAGATGCAAAAGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGCGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACTGAATATCgg < 1:3746996/100‑1 (MQ=255) tAAAGCGCCTGGCGCAAAAGATGCAAAAGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGAGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACTGAATATCgg < 1:3441231/100‑1 (MQ=255) aaaGCGCCTGGCGCAAAAGATGCAAAAGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGCGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACTGAATATCggg > 2:1826258/1‑100 (MQ=255) aaGCGCCTGGCGCAAAAGATGCAAAAGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGCGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCGACTGAATATCggg > 1:2663460/1‑99 (MQ=255) aaGCGCCTGGCGCAAAAGATGCAAAAGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGCGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACTGAATATCGGGa > 1:3001365/1‑100 (MQ=255) aaGCGCCTGGCGCAAAAGATGCAAAAGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGCGTCGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACTGAATATCGGGa < 2:2218751/100‑1 (MQ=255) aaGCGCCTGGCGCAAAAGATGCAAAAGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGAGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACTGAATATCGGGa > 2:3952109/1‑100 (MQ=255) aGCGCCTGGCGCAAAAGATGCAAAAGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGCGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACTGAATATCGGGaa > 2:648617/1‑100 (MQ=255) cgcCTGGCGCAAAAGATGCAAAAGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGCGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACTGAATATCGGGaaaa < 1:1972234/100‑1 (MQ=255) cgcCTGGCGCAAAAGATGCAAAAGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGCGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACTGAATATCGGGaaa > 2:3323957/1‑99 (MQ=255) gcCTGGCGCAAAAGATGCAAAAGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCATACCGACTGGAGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACTGAATATCGGGaaa > 2:233451/1‑98 (MQ=255) ccTGGCGCAAAAGATGCAAAAGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGCGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACTGAATATCGGGAAAATa < 2:3354600/100‑1 (MQ=255) tGGCGCAAAAGATGCAAAAGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGAGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACTGAATATCGGGAAAATaga > 2:4027053/1‑100 (MQ=255) ggCGCAAAAGATGCAAAAGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGAGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACTGAATATCGGGAAAATagag > 2:1731993/1‑100 (MQ=255) ggCGCAAAAGATGCAAAAGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGAGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACTGAATATCGGGAAAATagag < 2:4109323/100‑1 (MQ=255) ggCGCAAAAGATGCAAAAGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGAGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACTGAATATCGGGAAAATagag > 1:1930203/1‑100 (MQ=255) aaaaGATGAAAAAGTCGAAAACGAGTCGGAGGTGCGTACCGACTGGCGTGGTGATGCCGTGCTGGCTTATGCCACTGAATATCGGGAAAATagag < 2:2207780/95‑1 (MQ=255) aaaGATGCAAAAGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGCGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACTGAATATCGGGAAAATAGAGTGgcgc > 1:4131341/1‑100 (MQ=255) aGATGCAAAAGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGCGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACTGAATATCGGGAAAATAGAGTGGCGCTg > 2:2353463/1‑100 (MQ=255) gCAAAAGTCGAAAACCAGACTGGGGTGCGTACCGACTGGCGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCAACTGAATATCCGGAAAATAGACTGGTGCTGGAt < 2:2159128/99‑1 (MQ=255) gCAAAAGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGCGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACTGAATATCGGGAAAATAGAGTGGCGCTGGATa < 1:606941/100‑1 (MQ=255) gCAAAAGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGAGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACTGAATATCGGGAAAATAGAGTGGCGCTGGATa > 2:1229781/1‑100 (MQ=255) cAAAAGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGCGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACTGAATATCGGGAAAATAGAGTGGCGCTGGCTAc > 2:162614/1‑100 (MQ=255) cAAAAGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGCGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACTGAATATCGGGAAAATAGAGTGGCGCTGGATAc > 2:1420062/1‑100 (MQ=255) cAAAAGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGCGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACTGAATATCGGGAAAATAGAGTGGCGCTGGATAc > 2:2578481/1‑100 (MQ=255) cAAAAGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGAGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACTGAATATCGGGAAAATAGAGTGGCGCTGGATAc < 2:679327/100‑1 (MQ=255) cAAAAGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGAGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACTGAATATCGGGAAAATAGAGTGGCGCTGGATAc > 2:1019523/1‑100 (MQ=255) aaaaGTCGAAAACCAGCCGGGGGTGCGTACCGACTGGCGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACTGAATATCGGGAAAATAGAGTGGCGCTGGATAcc < 2:3784514/100‑1 (MQ=255) aaaaGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGCGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACTGAATATCGGGAAAATAGAGTGGCGCTAGAtcag > 2:2511201/1‑97 (MQ=255) aaaGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGCGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACTGAATATCGGGAAAATAGAGTGGCGCTGGATAc > 2:549871/1‑98 (MQ=255) aGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGCGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACTGAATATCGGGAAAATAGAGTGGCGCTGGagatcgga > 1:1858156/1‑93 (MQ=255) aGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGCGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACTGAATATCGGGAAAATAGAGTGGCGCTGGATACCAAt < 1:3109358/100‑1 (MQ=255) gTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGAGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACTGAATATCGGGAAAATAGAGTGGCGCTGGATACCAATa > 2:877020/1‑100 (MQ=255) cGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGAGAGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACTGAATATCGGGAAAATAGAGTGGCGCTGGATACCAATAcc > 2:2709255/1‑100 (MQ=255) gAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGAGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACTGAATATCGGGAAAATAGAGTGGCGCTGGATACCAATAccc > 1:145064/1‑100 (MQ=255) aaaCCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGCGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACTGAATATCGGGAAAATAGAGTGGCGCTGGATACCAATACCCTg < 1:2215649/100‑1 (MQ=255) aaCCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGCGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACTGAATATCGGGAAAATAGAGTGGCGCTGGATACCAATACCCTgg > 1:1778112/1‑100 (MQ=255) aaCCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGCGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACTGAATATCGGGAAAATAGAGTGGCGCTGGATACCAATACCCTgg < 1:3323977/100‑1 (MQ=255) aCCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGCGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACTGAATATCGGGAAAATAGAGTGGCGCTGGATACCAATACCCTGGc < 1:25643/100‑1 (MQ=255) aCCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGCGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACTGAATATCGGGAAAATAGAGTGGCGCTGGATACCAATACCCTGGc < 2:4105519/100‑1 (MQ=255) aGACGGGGGTGCGTACCGACTGGCGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACTGAATATCGGGAAAATAGAGTGGCGCTGGATACCAATACCCTGGCTGa > 1:734927/1‑100 (MQ=255) aCGGGGGTGCGTACCGACTGGCGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACTGAATATCGGGAAAATAGAGTGGCGCTGGATACCAATACCCTGGCTGATa < 2:1106991/100‑1 (MQ=255) aCGGGGGTGCGTACCGACTGGCGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACTGAATATCGGGAAAATAGAGTGGCGCTGGATACCAATACCCTGGCTGATa < 2:32485/100‑1 (MQ=255) ggggTGCGTACCGACTGGCGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACTGAATATCGGGTAAATAGCGTGGCGCTGGATACCAATACCCTGGCTGATAACg > 2:3458743/1‑100 (MQ=255) ggTGCGTACCGACTGGAGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACTGAATATCGGGAAAATAGAGTGGCGCTGGATACCAATACCCTGGCTGATAACGTc < 1:2952567/100‑1 (MQ=255) cGTACCGACTGGCGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACTGAATATCGGGAAAATAGAGTGGCGCTGGATACCAATACCCTGGCTGATAACGTCGAtt > 1:468384/1‑100 (MQ=255) tACCGACTGGCGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACTGAATATCGGGAAAATAGAGTGGCGCTGGATACCAATACCCTGGCTGATAACGTCGATTTa < 2:1517100/100‑1 (MQ=255) tACCGACTGGAGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACTGAATATTGGGAAAATAGAGTGGCGCTGGATACCAATACCCTGGCTGATAACGTCGAttt > 1:2415406/1‑99 (MQ=255) aCCGACTGGCGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACTGAATATCGGGAAAATAGAGTGGCGCTGGATACCAATACCCTGGCTGATAACGTCGATTTAg < 2:1900756/100‑1 (MQ=255) aCCGACTGGCGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACTGAATATCGGGAAAATAGAGTGGCGCTGGATACCAATACCCTGGCTGATAACGTCGATTTAg < 1:3145158/100‑1 (MQ=255) aCCGACTGGCGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACTGAATATCGGGAAAATAGAGTGGCGCTGGATACCAATACCCTGGCTGATAACGTCGATTTAg < 2:1458000/100‑1 (MQ=255) ccGACTGGCGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACTGAATATCGGGAAAATAGAGTGGCGCTGGATACCAATACCCTGGCTGATAACGTCGATTTAGa > 1:1311710/1‑100 (MQ=255) cTGGAGTGGTTATGCCGTGCTGCCTGATGACACTGAATATCCGGAAAAAAGAGGGGCGTGGGATTGCAATACCCTGGCTGATAACGTCGATTtatata < 2:1362878/98‑1 (MQ=255) ggCGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACTGAATATCGGGAAAATAGAGTGGCGCTGGATACCAATACCCTGGCTGATAACGTCGATTTAGATAAcgc > 1:2945821/1‑100 (MQ=255) ggCGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACTGAATATCGGGAAAATAGAGTGGCGCTGGATACCAATACCCTGGCTGATAACGTCGATTTAGATAAcgc < 1:2353476/100‑1 (MQ=255) gCGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACTGAATATCGGGAAAATAGAGTGGCGCTGGATACCAATACCCTGGCTGATAACGTCGATTTAGATAAcgc > 2:2701510/1‑99 (MQ=255) cGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACTGAATATCGGGAAAATAGAGTGGCGCTGGATACCAATACCCTGGCTGATAACGTCGATTTAGATAACGCgg < 1:3886426/100‑1 (MQ=255) cGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACTGAATATCGGGAAAATAGAGTGGCGCTGGATACCAATACCCTGGCTGATAACGTCGATTTAGATAACGCgg > 1:3611972/1‑100 (MQ=255) | CGCTGGGGCAGCCGTTAAACGATACGGTGGTGCTTGTTAAAGCGCCTGGCGCAAAAGATGCAAAAGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGCGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACTGAATATCGGGAAAATAGAGTGGCGCTGGATACCAATACCCTGGCTGATAACGTCGATTTAGATAACGCGG > NC_000913/4547221‑4547418 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |