| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 721,009 | T→A | 18.5% | intergenic (+169/+47) | ybfK → / ← kdpE | uncharacterized protein/response regulator in two‑component regulatory system with KdpD |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 721,009 | 0 | T | A | 18.5% | 371.5 / 68.0 | 150 | intergenic (+169/+47) | ybfK/kdpE | uncharacterized protein/response regulator in two‑component regulatory system with KdpD |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (56/66); new base A (16/12); total (72/78) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.02e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 157 total aligned reads displayed.
ATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTCAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCAATACCGGTTTCAGTAATGAAATGGCGTGGGC > NC_000913/720910‑721108 | aTCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGtatttatt < 1:2323442/100‑1 (MQ=255) cTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACg < 1:2804534/100‑1 (MQ=255) cTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACg < 2:866270/100‑1 (MQ=255) tAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGc > 1:2082005/1‑100 (MQ=255) tAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGc > 1:1322392/1‑100 (MQ=255) atttatttAATGATGAGCTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCtt < 1:874371/100‑1 (MQ=255) tttatttaATGATGAGCTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCttt > 1:1768455/1‑100 (MQ=255) ttatttaATGATGAGCTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTAATAATAAATACGGCtttt < 2:685491/100‑2 (MQ=38) tttaATGATTAGTTTTTTACTTAGTAATTTAAAATATAGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTAATAATAAATACGGCtttt < 2:3268449/97‑2 (MQ=25) tttaATGATGAGCTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTttaatt < 1:951674/100‑1 (MQ=255) tttaATGATGAGCTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTttaatt < 2:2072970/100‑1 (MQ=255) ttaATGATGAGCTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTttaatta < 2:3393693/100‑1 (MQ=255) taATGATGAGCTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTttaattaa < 2:3681405/100‑1 (MQ=255) taATGATGAGCTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTAATAATAAATACGGCtttttatct < 1:2045797/100‑7 (MQ=25) taATCATGTGCTTTTTACATAGTAATATAAAATATTTATTTGTTGTTTTTGTGTGTTGTGTCTGATACAGAGCCCTACTTTTTATTACGGCTttaattga < 2:3024111/100‑3 (MQ=255) aaTGATGAGCTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCTTATTTATTATTACGGCTTtaattaat < 1:2513465/100‑1 (MQ=255) aaTGATGAGCTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTtaattaat < 1:3155074/100‑1 (MQ=255) aaTGATGAGCTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTAATAATAAATACGGCtttttatctt < 2:3094922/100‑8 (MQ=25) atgattAGCTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTTTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTAGTACGGCTTTAATtagta < 2:3910556/100‑1 (MQ=255) atgatgAGCTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATtaata < 1:3841850/100‑1 (MQ=255) atgatgAGCTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATtaata > 1:1155716/1‑100 (MQ=255) tgatgaGCTTTTTCCTTAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATtaataa > 1:3258969/1‑100 (MQ=255) tgaGCTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCAGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAag > 2:56313/1‑100 (MQ=255) gaGCTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAagg > 1:2474767/1‑100 (MQ=255) aGCTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTTTTTTTTGTTTAATATAAAAAGCCGTATTTATTATTAATGCTTTAATTAATAAAag > 2:2146071/1‑98 (MQ=255) gCTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAaggca < 1:1217243/100‑1 (MQ=255) cTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAaggcag > 1:1553393/1‑100 (MQ=255) cTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAaggcag < 2:1645189/100‑1 (MQ=255) tttttACTTAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAaggcagg < 2:779298/100‑1 (MQ=255) ttttACTTAGTAATATAAAATATTGCATCGCTATTTTTGTGTTCTTTTAAAGATAAAAAGCCGTCTTTATTATTACTGCTTTAATTAATAAAaggcagtc > 2:2573159/1‑98 (MQ=255) ttttACTTAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAaggcaggc < 1:3302847/100‑1 (MQ=255) tACTTAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGt < 1:1031481/100‑1 (MQ=255) aCTTAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTa > 2:3994749/1‑100 (MQ=255) ttaGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTAt < 2:3965297/97‑1 (MQ=255) taGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGTCTGTATTa > 2:1728212/2‑100 (MQ=255) taGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTa > 1:576273/2‑100 (MQ=255) taGTAATATAAAATATTGAAGTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTAGTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTAtt < 2:1664735/98‑1 (MQ=255) gTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTaaa < 2:2081992/100‑1 (MQ=255) aaTATAAAATTTTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGTTTATAGGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAAt < 1:1309864/100‑1 (MQ=255) aaTATAAAATATTGAGTTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCATCCTGTATTAAAAt > 2:1576925/1‑100 (MQ=255) aaTATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTCTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATAATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAAt < 2:928879/100‑1 (MQ=255) tataAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAATATTa < 2:1385387/100‑1 (MQ=255) taAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTATATTAAAATTAat > 2:1504539/1‑100 (MQ=255) aaaaTATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAata < 1:2744427/100‑1 (MQ=255) aaaaTATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAACATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAata > 2:3480445/1‑100 (MQ=255) aaaTATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAatat < 1:183699/100‑1 (MQ=255) atTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCaa < 1:2730547/100‑1 (MQ=255) ttGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCaa > 1:1377283/1‑99 (MQ=255) tGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAAATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAg < 2:2667603/100‑1 (MQ=255) gAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGc < 1:1741658/100‑1 (MQ=255) gAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGc < 1:1457840/100‑1 (MQ=255) gAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAACGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGc > 2:1369333/1‑100 (MQ=255) aaTTTTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATATAAAGCTGTATTTATTATTAGGGCTTTAATTAATAAAGGGCAGGCGGTTTTAATATTAATATTCAAAg < 2:848374/98‑1 (MQ=255) aaTTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCa > 1:2975562/1‑100 (MQ=255) aaTTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCa > 1:2445185/1‑100 (MQ=255) aTTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCAt > 2:2046988/1‑100 (MQ=255) ttGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATa > 1:570909/1‑100 (MQ=255) gttgttTTTGTGTGTTGTGTAAAATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGTCTTTAATTAAAAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCaaa < 2:3699688/93‑1 (MQ=255) gTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATaaa > 2:177697/1‑100 (MQ=255) gTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATaaa > 2:1990484/1‑100 (MQ=255) ttATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAAc < 2:2430702/100‑1 (MQ=255) ttATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAAc < 2:3379354/100‑1 (MQ=255) tATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAAcc > 1:437589/1‑100 (MQ=255) tATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGAAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAAc > 2:463741/1‑99 (MQ=255) ttGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGATTTAATTAATAAAAGGAAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAg < 2:1439336/100‑1 (MQ=255) gtgtgtTGTTTAAGATAAAAAGTCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGcc < 2:1883244/100‑1 (MQ=255) gtgtTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCaa > 1:1929098/1‑100 (MQ=255) tgttgtTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCAAt < 2:1553381/100‑1 (MQ=255) gttgttTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCAATa > 1:1536184/1‑100 (MQ=255) tgttTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCAATAc > 2:1189246/1‑99 (MQ=255) gttTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCAATACCg > 1:542197/1‑100 (MQ=255) gttTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCAATACCg > 1:1362585/1‑100 (MQ=255) gttTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCAATACCg < 2:3099271/100‑1 (MQ=255) tttattaattaaaGCCGTAATAATAAATACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCAATACCgg > 1:3583058/11‑100 (MQ=25) tttattaattaaaGCCGTAATAATAAATACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCAATACCgg > 2:1249096/11‑100 (MQ=25) tttAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCAATACCgg < 1:3158601/100‑1 (MQ=255) tttAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGACTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCAATACCgn < 2:305770/100‑2 (MQ=255) ttAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCAATACCGGt > 2:2341995/1‑100 (MQ=255) ttAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCAATACCGGt > 2:2116149/1‑100 (MQ=255) tAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCAATACCGGtt > 2:1763361/1‑100 (MQ=255) tAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCAATACCGGtt > 1:1096559/1‑100 (MQ=255) tAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATAGTCAAAGCATAAACCGATCGCCAATACCGGtt < 1:2782372/100‑1 (MQ=255) aGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCAATACCGGTTTc < 2:2694598/100‑1 (MQ=255) aGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCAATACCGGTTTc < 2:1102960/100‑1 (MQ=255) aGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCAATACCGGTTTc < 1:2343850/100‑1 (MQ=255) gATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCAATACCGGTTTc < 2:618896/99‑1 (MQ=255) aTAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCAATACCGGTTTCAg < 2:4124461/100‑1 (MQ=255) tAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCAATACCGGTTTCAGt < 2:2610278/100‑1 (MQ=255) tAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCAATACCGGTTTCAGt > 1:3015112/1‑100 (MQ=255) attaaaGCCGTAATAATAAATACGGCTTTAATTAATACAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCAATACCGGTTTCAGt > 2:2216471/4‑100 (MQ=37) attaaaGCCGTAATAATAAATACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCAATACCGGTTTCAGt > 1:2999198/4‑100 (MQ=37) aaaaaGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCAATACCGGTTTCAGTa > 2:229280/1‑100 (MQ=255) taaaGCCGTAATAATAAATACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCAATACCGGTTTCAGTaa > 2:2277106/2‑100 (MQ=37) aaaGCCGTAATAATAAATACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCAATACCGGTTTCAGTAAt > 1:2206954/1‑100 (MQ=37) ccGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCAATACCGGTTTCAGTAATGaaa > 2:3897541/1‑100 (MQ=255) cGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCAATACCGGTTTCAGTAATGaaa < 2:4086079/99‑1 (MQ=255) gTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCAATACCGGTTTCATTACTGaaacc < 1:3604395/100‑3 (MQ=255) tatttattATTACGGCTTTTATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCAATACCGGTTTCAGTAATGAAATgg > 2:2122228/1‑100 (MQ=255) ttattaCGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCAATACCGGTTTCAGTAATGAAATAGCGt > 2:3520834/1‑97 (MQ=255) tattaCGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCAATACCGGTTTCAGTAATGAAATGGCGTgggc > 2:3810730/1‑100 (MQ=255) | ATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTCAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCAATACCGGTTTCAGTAATGAAATGGCGTGGGC > NC_000913/720910‑721108 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |