| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 850,998 | G→A | 16.5% | intergenic (+33/+16) | ompX → / ← opgE | outer membrane protein X/OPG biosynthetic transmembrane phosphoethanolamine transferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 850,998 | 0 | G | A | 16.5% | 343.5 / 47.5 | 150 | intergenic (+33/+16) | ompX/opgE | outer membrane protein X/OPG biosynthetic transmembrane phosphoethanolamine transferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (62/63); new base A (9/16); total (71/79) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.74e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.58e-01 | |||||||||||
Only 100 of 156 total aligned reads displayed.
CGAGCAGAGCCGTATTCGTAGCGTTGACGTAGGCACCTGGATTGCCGGTGTTGGTTACCGCTTCTAATCACTTTGGTGATATAAAAAATCCGCCTCTCGGGGCGGATTTTTGTTTTTAAGGTTTCGGGTCGAAAATATCGGTTCCGAGATGGTTGTAATCCACCTTCTGTAACTGGAAGTTGGTGATGTATATCGGCCC > NC_000913/850899‑851097 | aGCAGAGCCGTATTCGTAGCGTTGACGTAGGCACCTGGATTGCCGGTGTTGGTTACCGCTTCTAATCACTTTGGTGATATAAAAAATCCGCCTCTCgggg > 1:3656490/1‑100 (MQ=255) gCCGTATTCGTAGCGTTGACGTAGGCACCTGGATTGCCGGTGTTGGTTACCGCTTCTAATCACTTTGGTGATATAAAAAATCCGCCTCTCGGGGCGGAtt > 2:3956455/1‑100 (MQ=255) gCCGTATTCGTAGCGTGGACGTAGGCACCTGGATTGCCGGTGTTGGTTACCGCGTCTAATCGCTTTGGTGATATAAAAAATCGGCCTTTCGGGGCgg < 2:3757293/97‑1 (MQ=255) ccGTAGTCGTAGCGTTGACGTAGGCACCTGGATTGCCGGTGTTGGTTACCGCTTCGAATCACTTTGGTGATATAAAAAATCCGCCCCGAGAGGCGGAttt < 2:599512/100‑1 (MQ=38) cGTATTCGTAGCGTTGACGTAGGCACCTGGATTGCCGGTGTTGGTTACCGCTTCTAATCACTTTGGTGATATAAAAAATCCGCCCCGAGAGGCGGAtttt < 1:2961465/100‑1 (MQ=38) tATTCGTAGCGTTGACGTAGGCACCTGGATTGCCGGTGTTGGTTACCGCTTCTAATCACTTTGGTGATATAAAAAATCCGCCTCTCGGGGCGGATTTTTg < 2:1239147/100‑1 (MQ=255) tATTCGTAGCGTTGACGTAGGCACCTGGATTGCCGGTGTTGGTTACCGCTTCTAATCACTTTGGTGATATAAAAAATCCGCCCCGAGAGGCGGAtttttt < 2:3417820/100‑2 (MQ=38) aTTCGTAGCGTTGACGTAGGCACCTGGATTGCCGGTGTTGGTTACCGCTTCTAATCACTTTGGTGATATAAAAAATCCGCCCCGAGAGGCGGAtttttta < 1:3090097/100‑3 (MQ=38) aTTCGTAGCGTTGACGTAGGCACCTGGATTGCCGGTGTTGGTTACCGCTTCTAATCACTTTGGTGATATAAAAAATCCGCCCCGAGAGGCGGAtttttta < 1:2266655/100‑3 (MQ=38) ttCGTAGCGTTGACGTAGGCACCTGGATTGCCGGTGTTGGTTACCGCTTCTAATCACTTTGGTGATATAAAAAATCCGCCTCTCGGGGCGGATTTTTGtt < 2:1788437/100‑1 (MQ=255) ttCGTAGCGTTGACGTAGGCACCTGGATTGCCGGTGTTGGTTACCGCTTCTAATCACTTTGGTGATATAAAAAATCCGCCCCGAGAGGCGGAttttttat < 2:3652017/100‑4 (MQ=37) tCGTAGCGTTGACGTAGGCACCTGGATTGCCGGTGTTGGTTACCGCTTCTAATCACTTTGGTGATATAAAAAATCCGCCTCTCGGTGCGGATTTTTGttt < 2:1477072/100‑1 (MQ=255) tCGTAGCGTTGACGTAGGCACCTGGATTGCCGGTGTTGGTTACCGCTTCTAATCACTTTGGTGATATAAAAAATCCGCCTCTCGGGGCGGATTTTTGttt < 2:4099901/100‑1 (MQ=255) tCGTAGCGTTGACGTAGGCACCTGGATTGCCGGTGTTGGTTACCGCTTCTAATCACTTTGGTGATATAAAAAATCCGCCCCGAGAGGCGGAttttttata < 1:1548061/100‑5 (MQ=37) cGTAGCGTTGACGTAGGCACCTGGATTGCCGGTGTTGGTTACCGCTTCTAATCACTTTGGTGATATAAAAAATCCGCCTCTCGGGGCGGATTTTTGtttt < 1:74203/100‑1 (MQ=255) cGTAGCGTTGACGTAGGCACCTGGATTGCCGGTGTTGGTTACCGCTTCTAATCACTTTGGTGATATAAAAAATCCGCCTCTCGGGGCGGATTTTTGtttt < 1:3974861/100‑1 (MQ=255) gTAGCGTTGACGTAGGCACCTGGATTGCCGGTGTTGGTTACCGCTTCTAATCACTTTGGTGATATAAAAAATCCGCCTCTCGGGGCGGATTTTTGttttt > 2:3111030/1‑100 (MQ=255) gTAGCGTTGACGTAGGCACCTGGATTGCCGGTGTTGGTTACCGCTTCTAATCACTTTGGTGATATAAAAAATCCGCCTCTCGGGGCGGATTTTTGttttt > 1:2597784/1‑100 (MQ=255) gTAGCGTTGACGTAGGCACCTGGATTGCCGGTGTTGGTTACCGCTTCTAATCACTTTGGTGATATAAAAAATCCGCCCCGAGAGGCGGAttttttatatc < 1:916260/100‑7 (MQ=37) tAGCTTTGACGTAGGCACCTGGATTTCCGATATTGGTTACCGCGTCTAATCACTTTGGTGATATAAAAAATCCGCCCCGAGAGGCGGAttttttatat < 2:240465/98‑6 (MQ=21) aGCGTTGACGTAGGCACCTGGATTGCCGGTGTTGGTTACCGCTTCTAATCACTTTGGTGATATAAAAAATCCGCCCCGAGAGGCGGAttttttatatcac < 1:1318247/100‑9 (MQ=25) gCGTTGACGTAGGCACCTGGATTGCCGGTGTTGGTTACCGCTTCTAATCACTTTGGTGATATAAAAAATCCGCCTCTCGGGGCGGATTTTTGTTTTTAAg < 1:3025129/100‑1 (MQ=255) gCGTTGACGTAGGCACCTGGATTGCCGGTGTTGGTTACCGCTTCTAATCACTTTGGTGATATAAAAAATCCGCCTCTCGGGGCGGATTTTTGTTTTTAAg < 1:4094432/100‑1 (MQ=255) gCGTTGACGTAGGCACCTGGATTGCCGGTGTTGGTTACCGCTTCTAATCACTTTGGTGATATAAAAAATCCGCCTCTCGGGGCGGATTTTTGTTTTTAAg < 2:1870751/100‑1 (MQ=255) gCGTTGACGTAGGCACCTGGATTGCCGGTGTTGGTTACCGCTTCTAATCACTTTGGTGATATAAAAAATCCGCCCCGAGAGGCGGAttttttatatcacc < 1:707268/100‑10 (MQ=25) gCGTTGACGTAGGCACCTGGATTGCCGGTGTTGGTTACCGCTTCTAATCACTTGGGTGATATAAAAAATACGCCTCTCGGGGCGGATTTTTGTTTTGaa > 2:3065790/1‑99 (MQ=255) cGTTGACGTAGGCACCTGGATTGCCGGTGTTGGTTACCGCTTCTAATCACTTTGGTGATATAAAAAATCCGCCTCTCGGGGCGGATTTTTGTTTTTAAgg > 2:3307766/1‑100 (MQ=255) cGTTGACGTAGGCACCTGGATTGCCGGTGTTGGTTACCGCTTCTAATCACTTTGGTGATATAAAAAATCCGCCTCTCGGGGCGGATTTTTGTTTTTAAgg < 1:1082493/100‑1 (MQ=255) gTAGGCACCTAGATTGCCGGTGTTGGTTACCGCTTCTAATCCCTTTGGTGATCTAAAAAATCGGGCTCTGGGGGCGGATTTTTGTTTTTTAGGTTTCg > 2:1763170/1‑98 (MQ=255) tgtgCACCTTGATTGGCGGTTTTGGTTACCTCTTCTAATTTCTTTGGTTATATAAAAGATTCGCCTCTCTGGGCGGATTGTTGTTTTTAAGGTTTCggg < 2:2604173/96‑1 (MQ=255) tAGGCACCTGGATTGCCGGTGTTGGTTACCGCTTCTAATCACTTTGGTGATATAAAAAATCCGCCTCTCGGGGCGGATTTTTGTTTTTAAGGTTTCGGGt > 1:152615/1‑100 (MQ=255) tAGGCACCTGGATTGCCGGTGTTGGTTACCGCTTCTAATCACTTTGGTGATATAAAAAATCCGCCTCTCGGGGCGGATTTTTGTTTTTAAGGTTTCGGGt > 1:3697317/1‑100 (MQ=255) ggCACCTGGATTGCCGGTGTTGGTTACCGCTTCTAATCACTTTGGTGATATAAAAAATCCGCCTCTCGGGGCGGATTTTTGTTTTTAAGGTTTCGGGTCg < 1:1878215/100‑1 (MQ=255) ggATTGCCGGTGTTGGATACCGCTTCTAATAACTTTGGTGATATAAAAAATCCGCCTCTCGGGGCGGATTTTTGTTTTTAAGGTTTCGGGTCGAAAatat > 2:19384/1‑100 (MQ=255) gATTGCCGGTGTTGGTTACCGCTTCTAATCACTTTGGTGATATAAAAAATCCGCCTCTCGGGGCGGATTTTTGTTTTTAAGGTTTCGGGTCGAAAATATc < 2:2123079/100‑1 (MQ=255) gATTGCCGGTGTTGGTTACCGCTTCTAATCACTTTGGTGATATAAAAAATCCGCCTCTCGAGGCGGATTTTTGTTTTTAAGGTTTCGGGTCGAAAATATc < 2:389199/100‑1 (MQ=255) gATTGCCGGTGTTGGTTACCGCTTCTAATCACTGTGGTGATATAAAAAATCCGCCTCTCGGGGCGGATTTTTGTTTTTAAGGTGTCGGGTCGAAAATATc > 1:186675/1‑100 (MQ=255) aTTGCCGGTGTTGGTTACCGCTTCTAATCACTTTGGTGATATAAAAAATCCGCCTCTCGGGGCGGATTTTTGTTTTTAAGGTTTCGGGTCGAAAATATCg < 1:2742328/100‑1 (MQ=255) aTTGCCGGTGTTGGTTACCGCTTCTAATCACTTTGGTGATATAAAAAATCCGCCTCTCGGGGCGGATTTTTGTTTTTAAGGTTTCGGGTCGAAAATATCg < 2:1952396/100‑1 (MQ=255) ttGCCGGTGTTGGTTACCGCTTCTAATCACTTTGGTGATATAAAAAATCCGCCTCTCGGGGCGGATTTTTGTTTTTAAGGTTTCGGGTCGAAAATATCgg < 2:1817908/100‑1 (MQ=255) gCCGGTGTTGGTTACCGCTTCTAATCACTTTGGTGATATAAAAAATCCGCCTCTCGGGGCGGGTTTTTGTTTTTAAGGTTTCGGGTCGAAAATATCGGtt > 1:2039848/1‑100 (MQ=255) gCCGGTGTTGGTTACCGCTTCTAATCACTTTGGTGATATAAAAAATCCGCCTCTCGGGGCGGATTTTTGTTTTTAAGGTTTCGGGTCGAAAATATCGGtt > 1:2294554/1‑100 (MQ=255) gCCGGTGTTGGTTACCGCTTCTAATCACTTTGGTGATATAAAAAATCCGCCTCTCGGGGCGGATTTTTGTTTTTAAGGTTTCGGGTCGAAAATATCGGtt > 2:3791099/1‑100 (MQ=255) ggTGTTGGTTACCGCTTCTAATCACTTTGGTGATATAAAAAATCCGCCTCTCGGGGCGGATTTTTGTTTTTAAGGTTTCGGGTCGAAAATATCGGTTCCg > 2:1931882/1‑100 (MQ=255) tgtTGGTTACCGCTTCTAATCACTTTGGTGATATAAAAAATCCGCCTCTCGGGGCGGATTTTTGTTTTTAAGGTTTCGGGTCGAAAATATCGGTTCCgag < 1:2885958/100‑1 (MQ=255) ttGGTTACCGCTTCTAATCACTTTGGTGTTATAAAAAATCCGCCTCTCGGGGCGGATTGTTGTTTTTAAGGTTTCGGGTCGAAAATATCGGTTCCGAGAt < 1:221504/100‑1 (MQ=255) tGGTTACCGCTTCTAATCACTTTGGTGATATAAAAAATCGGCCTCTCGGGGCGGATTTTTGTTTTTAAGGTTTCGGGTCGAAAATATCGGTTCCGAGATg > 2:1791842/1‑100 (MQ=255) ggTTACCGCTTCTAATCACTTTGGTGATATAAAAAATCCGCCTCTCGGGGCGGATTTTTGTTTTTAAGGTTTCGGGTCGAAAATATCGGTTCCGAGATgg > 1:2472202/1‑100 (MQ=255) ggTTACCGCTTCTAATCACTTTGGTGATATAAAAAATCCGCCTCTCGGGGCGGATTTTTGTTTTTAAGGTTTCGGGTCGAAAATATCGGTTCCGAGATgg > 1:2319597/1‑100 (MQ=255) ggTTACCGCTTCTAATCACTTTGGTGATATAAAAAATCCGCCTCTCGGGGCGGATTTTTGTTTTTAAGGTTTCGGGTCGAAAATATCGGTTCCGAGATgg < 2:1612106/100‑1 (MQ=255) ggTTACCGCTTCTAATCACTTTGGTGATATAAAAAATCCGCCTCTCGGGGCGGATTTTTGTTTTTAAGGTTTCGGGTCGAAAATATCGGTTCCGAGATgg > 1:1724966/1‑100 (MQ=255) ttACCGCTTCTAATCACTTTGGTGATATAAAAAATCCGCCTCTCGGGGCGGATTTTTGTTTTTAAGGTTTCGGGTCGAAAATATCGGTTCCGAGATGGtt > 2:1646969/1‑100 (MQ=255) tACCGCTTCTAATCACTTTGGTGATATAAAAAATCCGCCTCTCGGGGCGGATTTTTGTTTTTAAGGTTTCGGGTCGAAAATATCGGTTCCGAGATGGTTg < 1:156491/100‑1 (MQ=255) tACCGCTTCTAATCACTTTGGTGATATAAAAAATCCGCCTCTCGGGGCGGATTTTTGTTTTTAAGGTTTCGGGTCGAAAATATCGGTTCCGAGATGGTTg > 1:864038/1‑100 (MQ=255) tACCGCTTCTAATCACTTTGGTGATATAAAAAATCCGCCTCTCGGGGCGGATTTTTGTTTTTAAGGTTTCGGGTCGAAAATATCGGTTCCGAGATGGTTg < 1:3956481/100‑1 (MQ=255) ttCTAATCACTTTGGTGATATAAAAAATCCGCCTCTCGGGGCGGATTTTTGTTTTTAAGGTTTCGGGTCGAAAATATCGGTTCCGAGATGGTTGTAATcc < 1:1486129/100‑1 (MQ=255) ttCTAATCACTTTGGTGATATAAAAAATCCGCCTCTCGGGGCGGATTTTTGTTTTTAAGGTTTCGGGTCGAAAATATCGGTTCCGAGATGGTTGTAATcc > 2:1292492/1‑100 (MQ=255) ttCTAATCACTTTGGTGATATAAAAAATCCGCCTCTCGGGGCGGATTTTTGTTTTTAAGGTTTCGGGTCGAAAATATCGGTTCCGAGATGGTTGTAATcc < 1:2978513/100‑1 (MQ=255) tAATCACTTTGGTGATATAAAAAATCCGCCTCTCGGGGCGGATTTTTGTTTTTAAGGTTTCGGGTCGAAAATATCGGTTCCGAGATGGTTGTAATCCAcc > 2:3116084/1‑100 (MQ=255) tAATCACTTTGGTGATATAAAAAATCCGCCTCTCGGGGCGGATTTTTGTTTTTAAGGTTTCGGGTCGAAAATATCGGTTCCGAGATGGTTGTAATCCAcc > 1:3132348/1‑100 (MQ=255) aaTCACTTTGGTGATATAAAAAATCCGCCTCTCGGGGCGGATTTTTGTTTTTAAGGTTTCGGGTCGAAAATATCGGTTCCGAGATGGTTGTAATCCACCt < 2:2932779/100‑1 (MQ=255) aTCACTTTGGTGATATAAAAAATCCGCCTCTCGGGGCGGATTTTTGTTTTTAAGGTTTCGGGTCGAAAATATCGGTTCCGAGATGGTTGTAATCCACCtt > 2:331884/1‑100 (MQ=255) tttGGTGATATAAAAAATCCGCTTCTCGGGGTGGATTCTTGTTTTTATGGTTTCGGGTCGAAAATATCGGTTCCGAGATGGTTGTAATCCACCTTCTGTa < 2:2790969/100‑1 (MQ=255) tttGGTGATATAAAAAATCCGCCTCTCGGGGCGGATTTTTGTTTTTAAGGTTTCGGGTCGAAAATATCGGTTCCGAGATGGTTGTAATCCACCTTCTGTa < 1:1074101/100‑1 (MQ=255) ttGGTGATATAAAAAATCCGCCTCTCGGGGCGGATTTTTGTTTTTAAGGTTTCGGGTCGAAAATATCGGTTCCGAGATGGTTGTAATCCACCTTCTGTaa > 2:102008/1‑100 (MQ=255) ttGGTGATATAAAAAATCCGCCTCTCGGGGCGGATTTTTGTTTTTAAAGTTTCGGGTCGAAAATATCGGCTCCGAGATGGTTGTAATCCACCTTCTGTa > 2:2105263/1‑99 (MQ=255) tGGTGATATAAAAAATCCGCCTCTCGGGGCGGATTTTTGTTTTTAAGGTTTCGGGTCGAAAATATCGGTTCCGAGATGGTTGTAATCCACCTTCTGTAAc > 1:516707/1‑100 (MQ=255) tGGTGATATAAAAAATCCGCCTCTCGGGGCGGATTTTTGTTTTTAAGGTTTCGGGTCGAAAATATCGGTTCCGAGATGGTTGTAATCCACCTTCTGTAAc > 1:2645188/1‑100 (MQ=255) cttaaaaacaaaaaTCCGCCTCTCGGGGCGGATTTTTGTTTTTAAGGTTTCGGGTCGAAAATATCGGTTCCGAGATGGTTGTAATCCACCTTCTGTAACt > 1:1172907/10‑100 (MQ=255) gTGATATAAAAAATCCGCCTCTCGGGGCGGATTTTTGTTTTTAAGGTTTCGGGTCGAAAATATCGGTTCCGAGATGGTTGTAATCCACCTTCTGTAACTg > 1:957483/1‑100 (MQ=255) tataAAAAATCCGCCTCTCGGGGCGGATTTTTGTTTTTAAGGTTTCGGGTCGAAAATATCGGTTCCGAGATGGTTGTAATCCACCTTCTGTAACTGGAAg > 1:577989/1‑100 (MQ=255) tataAAAAATCCGCCTCTCGGGGCGGATTTTTGTTTTTAAGGTTTCGGGTCGAAAATATCGGTTCCGAGATGGTTGTAATCCACCTTCTGTAACTGGAAg < 2:385263/100‑1 (MQ=255) aaacaaaaaTCCGCCCCGAGAGGCGGATTTTTGTTTTTAAGGTTTCGGGTCGAAAATATCGGTTCCTAGATGGTTGTAATCCACCTTCTGTAACTGGAAg > 2:1411810/5‑100 (MQ=37) ataAAAAATCCGCCTCTCGGGGCGGATTTTTGTTTTTAAGGTTTCGGGTCGAAAATATAGGGTCCGAGATGGTTGTAATCCACCTTCTGTAACTGGAAGt > 2:553617/1‑100 (MQ=255) ataAAAAATCCGCCTCTCGGGGCGGATTTTTGTTTTTAAGGTTTCGGGCCGAAACTATCGGTTCCGAGATGGTTGTAATCCACCTTCTGTAACTGGGAg > 2:234626/1‑99 (MQ=255) taAAAAATCCGCCTCTCGGGGCGGATTTTTGTTTTTAAGGTTTCGGGTCGAAAATATCGGTTCCGAGATGGTTGTAATCCACCTTCTGTAACTGGAAGtt > 1:3801289/1‑100 (MQ=255) acaaaaaTCCGCCCCGAGAGGCGGATTTTTGTTTTTAAGGTTTCGGGTCGAAAATATCGGTTCCGAGATGGTTGTAATCCACCTTCTGTAACTGGAAGtt > 1:3399683/3‑100 (MQ=38) caaaaaTCCGCCCCGAGAGGCGGATTTTTGTTTTTAAGGTTTCGGGTCGAAAATATCGGTTCCGAGCTGGTTGTAATCCACCTTCTGTAACTGGAAGTTg > 1:3448923/2‑100 (MQ=38) caaaaaTCCGCCCCGAGAGGCGGATTTTTGTTTTTAAGGTTTCGGGTCGAAAATATCGGTTCCGAGATGGTTGTAATCCACCTTCTGTAACTGGAAGTTg > 1:2811521/2‑100 (MQ=38) aaaaaTCCGCCTCTCGGGGCGGATTTTTGTTTTTAAGGTTTCGGGTCGAAAATATCGGTTCCGAGATGGTTGTAATCCACCTTCTGTAACTGGAAGTTgg > 1:2948069/1‑100 (MQ=255) aaaaaTCCGCCTCTCGGGGCGGATTTTTGTTTTTAAGGTTTCGGGTCGAAAATATCGGTTCCGAGATGGTTGTAATCCACCTTCTGTAACTGGAAGTTgg < 1:46221/100‑1 (MQ=255) aaaaaTCCGCCCCGAGAGGCGGATTTTTGTTTTTAAGGTTTCGGGTCGAAAATATCGGTTCCGAGATGGTTGTAATCCACCTTCTGTAACTGGAAGTTgg > 1:4097801/1‑100 (MQ=38) aaaaaTCCGCCCCGAGAGGCGGATTTTTGTTTTTAAGGTTTCGGGTCGAAAATATCGGTTCCGAGATGGTTGTAATCCACCTTCTGTAACTGGAAGTTgg > 1:528822/1‑100 (MQ=38) aaaaTCCTCCTCTCGGGGTGGATTTTTGTTTTTAAGGTTTCGGGTCGAAAATATCGGTTCCGAGATGGTTGTAATCCACCTTCTGTAACTGGAAGTTGGt < 2:2834879/100‑1 (MQ=255) aaaaTCCGCCTCTCGGGGCGGATTTTTGTTTTTAAGGTTTCGGGTCGAAAATATCGGTTCCGAGATGGTTGTAATCCACCTTCTGTAACTGGAAGTTGGt > 1:3105637/1‑100 (MQ=255) aaaTCCGCCTCTCGGGGCGGATTTTTGTTTTTAAGGTTTCGGGTCGAAAATATCGGTTCCGAGATGGTTGTAATCCACCTTCTGTAACTGGAAGTTgg < 2:270480/98‑1 (MQ=255) aaaTCCGCCTCTCGGGGCGGATTTTTGTTTTTAAGGTTTCGGGTCGAAAATATCGGTTCCGAGATGGTTGTAATCCACCTTCTGTAACTGGAAGTTGGTg > 1:3426592/1‑100 (MQ=255) aaTCCGCCTCTCGGGGCGGATTTTTGTTTTTAAGGTTTCGGGTCGAAAATATCGGTTCCGAGATGGTTGTAATCCACCTTCTGTAACTGGAAGTTGGTGa > 1:1734357/1‑100 (MQ=255) aTCCGCTACCCGGTGCGGATTTTTGTTTTTAAGGTTTCGGGTCGAAAATCTAGGTTCCGGGATGGTTCGAATCCACCTTCTGTAACTGGAAGTTGGt < 2:3627661/97‑1 (MQ=255) aTCCGCCTCTCGGGGCGGATTTTTGTTTTTAAGGTTTCGGGTCGAAAATATCGGTTCCGAGATGGTTGTAATCCACCTTCTGTAACTGGAAGTTGGTGAt > 1:43516/1‑100 (MQ=255) tCCGCCTCTCGGGGCGGATTTTTGTTTTTAAGGTTTCGGGTCGAAAATATCGGTTCCGAGATGGTTGTAATCCACCTTCTGTAACTGGAAGTTGGTGATg < 1:3568139/100‑1 (MQ=255) cGCCTCTCGGGGCGGATTTTTGTTTTTAAGGTTTCGGGTCGAAAATATCGGTTCCGAGATGGTTGTAATCCACCTTCTGTAACTGGAAGTTGGTGATGta < 2:964088/100‑1 (MQ=255) cGCCTCTCGGGGCGGATTTTTGTTTTTAAGGTTTCGGGTCGAAAATATCGGTTCCGAGATGGTTGTAATCCACCTTCTGTAACTGGAAGTTGGTGATGta < 1:2686632/100‑1 (MQ=255) cGCCTCTCGGGGCGGATTTTTGTTTTTAAGGTTTCGGGTCGAAAATATCGGTTCCGAGATGGTTGTAATCCACCTTCTGTAACTGGAAGTTGGTGATGta > 2:3161180/1‑100 (MQ=255) cGCCTCTCGGGGCGGATTTTTGTTTTTAAGGTTTCGGGTCGAAAATATCGGTTCCGAGATGGTTGTAATCCACCTTCTGTAACTGGAAGTTGGTGATGt < 2:3429031/99‑1 (MQ=255) gCCTCTCGGGGCGGATTTTTGTTTTTAAGGTTTCGGGTCGAAAATATCGGTTCCGAGATGGTTGTAATCCACCTTCTGTAACTGGAAGTTGGTGATGtat > 2:273507/1‑100 (MQ=255) tctcGGGGCGGATTTTTGTTTTTAAGGTTTCGGGTCGAAAATATCGGTTCCGAGATGGTTGTAATCCACCTTCTGTAACTGGAAGTTGGTGATGTATATc < 1:3157946/100‑1 (MQ=255) ggggCGGATTTTTGTTTTTAAGGTTTCGGGTCGAAAATATCGGTTCCGAGATGGTTGTAATCCACCTTCTGTAACTGGAAGTTGGTGATGTATATCGAcc < 1:2248946/100‑1 (MQ=255) ggggCGGATGTTTGTTTTTAAGGTTTCGGGTCGAAAATATCGGTTCCGAGATGCTTGTAATCCACCTTCTGTAAATGGAAGATTGTCATGtgta > 2:3895103/1‑94 (MQ=255) gggCGGATTTTTGTTTTTAAGGTTTCGGGGCGAAAATATCGGTTGCGAGATGGTTGTAATCCACCTTCTGTAACTGGAAGTTGGTGATGTATATCGAccc > 1:3292998/1‑100 (MQ=255) | CGAGCAGAGCCGTATTCGTAGCGTTGACGTAGGCACCTGGATTGCCGGTGTTGGTTACCGCTTCTAATCACTTTGGTGATATAAAAAATCCGCCTCTCGGGGCGGATTTTTGTTTTTAAGGTTTCGGGTCGAAAATATCGGTTCCGAGATGGTTGTAATCCACCTTCTGTAACTGGAAGTTGGTGATGTATATCGGCCC > NC_000913/850899‑851097 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |