| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 851,094 | G→A | 25.9% | P502S (CCG→TCG) | opgE ← | OPG biosynthetic transmembrane phosphoethanolamine transferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 851,094 | 0 | G | A | 25.9% | 238.0 / 89.4 | 147 | P502S (CCG→TCG) | opgE | OPG biosynthetic transmembrane phosphoethanolamine transferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (53/55); new base A (19/19); total (73/74) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.09e-01 | |||||||||||
Only 100 of 152 total aligned reads displayed.
TCGGGGCGGATTTTTGTTTTTAAGGTTTCGGGTCGAAAATATCGGTTCCGAGATGGTTGTAATCCACCTTCTGTAACTGGAAGTTGGTGATGTATATCGGCCCGGCTTTCTTCTCAGATATAAACGGGTATTTGATGTTAATTTCCTTCGCTTTAATCCCCGTCCACTGGGAGAAAAAGCCTAAGAAGTCATTGGCTG > NC_000913/850995‑851192 | tcGGGGCGGATTTTTGTTTTTAAGGTTTCGGGTCGAAAATATCGGTTCCGAGATGGTTGTAATCCACCTTCTGTAACTGGAAGTTGGTGATGTATATCgg < 1:3111049/100‑1 (MQ=255) cGGGGCGGATTTTTGTTTTTAAGGTTTCGGGTCGAAAATATCGGTTCCGAGATGGTTGTAATCCACCTTCTGTAACTGGAAGTTGGTGATGTATATCGGc < 1:4083992/100‑1 (MQ=255) ggggCGGATTTTTGTTTTTAAGGTTTCGGGTCGAAAATATCGGTTCCGAGATGGTTGTAATCCACCTTCTGTAACTGGAAGTTGGTGATGTATATCGAcc < 1:2248946/100‑1 (MQ=255) gtgggttgttGTTTTTCAGCTTTCGGTTCGCAAATCGCGGTGCCCAGATGGTTGTAATCCACTTTCTGTACCTCGAAGTTGCTTATGTGTATCGGCCCg < 2:1220329/91‑1 (MQ=255) ngATTTTTGTTTTGAAGGTTTCGGGTCGAAAGTGTCGGTTCCTAGATGGTTGTAATCCACCTTCTGTAACTGGAAGTTGGTGATGTATATCGACCCGGCt > 1:2792208/2‑100 (MQ=255) ggATTTTTGTTTTTAAGGTTTCGGGTCGAAAATATCGGTTCCGAGATGGTTGTAATCCACCTTCTGTAACTGGAAGTTGGTGATGTATATCGACCCGGCt > 2:2844586/1‑100 (MQ=255) tttttGTTTTTAAGGTTTCGGGTCGAAAATATCGGTTCCGAGATGGTTGTAATCCACCTTCTGTAACTGGAAGTTGGTGATGTATATCGGCCCGGCTttc < 2:3056585/100‑1 (MQ=255) ttttGTTTTTAAGGTTTCGGGTCGAAAATATCGGTTCCGAGATGGTTGTAATCCACCTTCTGTAACTGGAAGTTGGTGATGTATATCGACCCGGCTttct < 1:3018127/100‑1 (MQ=255) ttGTTTTTAAGGTTTCGGGTCGAAAATATCGGTTCCGAGATGGTTGTAATCCACCTTCTGTAACTGGAAGTTGGTGATGTATATCGGCCCGGCTttcttc < 1:397620/100‑1 (MQ=255) tGTTTTTAAGGTTTCGGGTCGAAAATATCGGTTCCGAGATGGTTGTAATCCACCTTCTGTAACTGGAAGTTGGTGATGTATATCGGCCCGGCTTtcttct > 1:3962321/1‑100 (MQ=255) gTTTTTAAGGTTTCGGGTCGAAAATATCGGTTCCGAGATGGTTGTAATCCACCTTCTGTAACTGGAAGTTGGTGATGTATATCGGCCCGGCTTTCTtctc < 2:3266003/100‑1 (MQ=255) gTTTTTAAGGTTTCGGGTCGAAAATATCGGTTCCGAGATGGTTGTAATCCACCTTCTGTAACTGGAAGTTGGTGATGTATATCGGCCCGGCTTTCTtctc > 1:439702/1‑100 (MQ=255) tttttAAGGTTTCGGGTCGAAAATATCGGTTCCGAGATGGTTGTAATCCACCTTCTGTAACTGGAAGTTGGTGATGTATATCGGCCCGGCTTTCTTCTCa > 1:741055/1‑100 (MQ=255) ttttAAGGTTTCGGGTCGAAAATATCGGTTCCGAGATGGTTGTAATCCACCTTCTGTAACTGGAAGTTGGTGATGTATATCGGCCCTGCTTTCTTCTCAg < 1:1473918/100‑1 (MQ=255) ttttAAGGTTTCGGGTCGAAAATATCGGTTCCGAGATGGTTGTAATCCACCTTCTGTAACTGGAAGTTGGTGATGTATATCGACCCGGCTTTCTTCTCAg < 1:1208515/100‑1 (MQ=255) aGGTTTCGGGTCGAAAATATCGGTTCCGAGATGGTTGTAATCCACCTTCTGTAACTGGAAGTTGGTGATGTATATCGGCCCGGCTTTCTTCTCAGAtata < 1:881720/100‑1 (MQ=255) aGGTTTCGGGTCGAAAATATCGGTTCCGAGATGGTTGTAATCCACCTTCTGTAACTGGAAGTTGGTGATGTATATCGACCCGGCTTTCTTCTCAGAtata < 1:1078148/100‑1 (MQ=255) ggTTTCGGGTCGAAAATATCGGTTCCGAGATGGTTGTAATCCACCTTCTGTAACTGGAAGTTGGTGATGTATATCGGCCCGGCTTTCTTCTCAGATATaa > 2:1030815/1‑100 (MQ=255) ggTTTCGGGTCGAAAATATCGGTTCCGAGATGGTTGTAATCCACCTTCTGTAACTGGAAGTTGGTGATGTATATCGACCCGGCTTTCTTCTCAGatat > 2:3588563/1‑98 (MQ=255) ggTTTCGGGTCGAAAATATCGGTTCCGAGATGGTTGTAATCCACCTTCTGTAACTGGAAGTTGGTGATGTATATCGACCCGGCTTTCTTCTCAGAtcta > 2:381880/1‑99 (MQ=255) tttCGGGTCGAAAATATCGGTTCCGAGATGGTTGTAATCCACCTTCTGTAACTGGAAGTTGGTGATGTATATCGGCCCGGCTTTCTTCTCAGATATAAAc > 1:248369/1‑100 (MQ=255) ttCGGGTCGAAAATATCGGTTCCGATATGGTTGTAATCCACCTTCTGTAACTGGAAGTTGGTGATGTATATCGGCCCGGCTTTCTTCTCAGATATAAACg < 2:1070531/100‑1 (MQ=255) cGGGTCGAAAATATCGGTTCCGAGATGGTTGTAATCCACCTTCTGTAACTGGAAGTTGGTGATGTATATCGACCCGGCTTTCTTCTCAGATATAAACggg < 1:3390944/100‑1 (MQ=255) gggTCGAAAATATCGGTTCCGAGATGGTTGTAATCCACCTTCTGTAACTGGAAGTTGGTGATGTATATCGGCCCGGCTTTCTTCTCAGATATAAACgg > 2:2213245/1‑98 (MQ=255) gggTCGAAAATATCGGTTCCGAGATGGTTGTAATCCACCTTCTGTAACTGGAAGTTGGTGATGTATATCGGCCCGGCTTTCTTCTCAGATATAAACGGGt < 2:3881918/100‑1 (MQ=255) gTCGAAAATATCGGTTCCGAGATGGTTGTAATCCACCTTCTGTAACTGGAAGTTGGTGATGTATATCGGCCCGGCTTTCTTCTCAGATATAAACGGGTa < 2:4018004/99‑1 (MQ=255) cGAAAATATCGGTTGCGAGATGGTTGTAATCCACCTTCTGTAACTGGAAGTTGGTGATGTATATCGGCCCGGCTTTCTTCTCAGATATAAACGGGTAttt < 2:957522/100‑1 (MQ=255) cGAAAATATCGGTTCCGAGATGGTTGTAATCCACCTTCTGTAACTGGAAGTTGGTGATGTATATCGGCCCGGCTTTCTTCTCAGATATAAACGGGTAttt < 1:2884993/100‑1 (MQ=255) aaaaTATCGGTTCCGAGATGGTTGTAATCCACCTTCTGTAACTGGAAGTTGGTGATGTATATCGGCCCGGCTTTCTTCTCAGATATAAACGGGTa > 2:1212785/1‑95 (MQ=255) aaaTATCGGTTCCGAGATGGTTGTAATCCACCTTCTGTAACTGGAAGTTGGTGATGTATATCGGCCCGGCTTTCTTCTCAGATATAAACGGGTATTTGAt < 1:518605/100‑1 (MQ=255) aaTATCGGTTCCGAGATGGTTGTAATCCACCTTCTGTAACTGGAAGTTGGTGATGTATATCGGCCCGGCTTTCTTCTCAGATATAAACGGGTATTTGATg < 1:2761338/100‑1 (MQ=255) aaTATCGGTTCCGAGATGGTTGTAATCCACCTTCTGTAACTGGAAGTTGGTGATGTATATCGGCCCGGCTTTCTTCTCAGATATAAACGGGTATTTGATg < 2:516702/100‑1 (MQ=255) aaTATCGGTTCCGAGATGGTTGTAATCCACCTTCTGTAACTGGAAGTTGGTGATGTATATCGACCCGGCTTTCTTCTCAGATATAAACGGGTATTTGATg < 1:2591903/100‑1 (MQ=255) atatCGGTTCCGAGATGGTTGTAATCCACCTTCTGTAACTGGAAGTTGGTGATGTATATCGGCCCGGCTTTCTTCTCAGATATAAACGGGTATTTGATGt > 2:20844/1‑100 (MQ=255) tatCGGTTTGGAGATGGTTGTAATCCATCTTCTGTAACTGTAAGTGGGTGATGTATATCTGCCCGGCTTTCTTCTCAGATATAAACGGGTATTTCAt < 2:2454976/97‑1 (MQ=255) tatCGGTTCCGAGATGGTTGTAATCCACCTTCTGTAACTGGAAGTTGGTGATGTATATCGGCCCGGCTTTCTTCTCAGATATAAACGGGTATTTGATGtt < 1:3025373/100‑1 (MQ=255) tatCGGTTCCGAGATGGTTGTAATACACGTTCTGTAACTGGAAGTTGGTGATGTATATCGGCCCGGCTTTCTTCTCAGATATAAACGGTTATTTTCTGtt > 1:2760911/1‑100 (MQ=255) atCGGTTCCGAGATGGTTGTAATCCACCTTCTGTAACTGGAAGTTGGTGATGTATATCGACCCGGCTTTCTTCTCAGATATAAACGGGTATTTGATGTTa < 2:1764/100‑1 (MQ=255) cGGTTCCGAGATGGTTGTAATCCACCTTCTGTAACTGGAAGTTGGTGATGTATATCGGCCCGGCTTTCTTCTCAGATATAAACGGGTATTTGATGTTAAt > 2:3793598/1‑100 (MQ=255) ggTTCCGAGATGGTTGTAATCCACCTTCTGTAACTGGAAGTTGGTGATGTATATCGGCCCGGCTTTCTTCTCAGATATAAACGGGTATTTGATGTTAAtt > 2:2419404/1‑100 (MQ=255) ggTTCCGAGATGGTTGTAATCCACCTTCTGTAACTGGAAGTTGGTGATGTATATCGACCCGGCTTTCTTCTCAGATATAAACGGGTATTTGATGTTAAtt > 1:3855740/1‑100 (MQ=255) gTTCCGAGATGGTTGTAATCCACCTTCTGTAACTGGAAGTTGGTGATGTATATCGGCCCGGCTTTCTTCTCAGATATAAACGGGTATTTGATGTTAAttt < 1:347555/100‑1 (MQ=255) gTTCCGAGATGGTTGTAATCCACCTTCTGTAACTGGAAGTTGGTGATGTATATCGACCCGGCTTTCTTCTCAGATATAAACGGGTATTTGATGTTAAttt > 1:2931372/1‑100 (MQ=255) ttCCGAGATGGTTGTAATCCACCTTCTGTAACTGGAAGTTGGTGATGTATATCGGCCCGGCTTTCTTCTCAGATATAAACGGGTATTTGATGTTAATTTc > 2:4099376/1‑100 (MQ=255) tCCGAGATGGTTGTAATCCACCTTCTGTAACTGGAAGTTGGTGATGTATATCGGCCCGGCTTTCTTCTCAGATATAAACGGGTATTTGATGTTAATTTcc < 1:1070806/100‑1 (MQ=255) ccGAGATGGTTGTAATCCACCTTCTGTAACTGGAAGTTGGTGATGTATATCGGCCCGGCTTTCTTCTCAGATATAAACGGGTATTTGATGTTAATTTCCt > 1:4030457/1‑100 (MQ=255) gagaTGGTTTTAATCCACCTTCTGTACTTGTAAGTTGGTGATGTATATCGGCCCGGCTTTCTTATCAGATATAAACGGGTATTTCATGTTAATTTCCTTc < 2:2549157/100‑1 (MQ=255) gagaTGGTTGTAATCCACCTTCTGTAACTGGAAGTTGGTGATGTATATCGGCCCGGCTTTCTTCTCAGATATAAACGGGTATTTGATGTTAATTTCCTTc > 1:1952505/1‑100 (MQ=255) gaTGGTTGTAATCCACCTTCTGTAACTGGAAGTTGGTGATGTATATCGGCCCGGCTTTCTTCTCAGATATAAACGGGTATTTGATGTTAATTTCCTTCGc > 2:1935621/1‑100 (MQ=255) aTGGTTGTATTCCACCTTCTGTAATTGGAAGTTGGTGATGTATATCGGCCCGGCTTTCTTCTCAGATATAAACGGGTATTTGATGTTAATTTCCTTCGc < 2:2060805/99‑1 (MQ=255) tGGTTGTAATGCACCTTCTGTAACTGGAAGTTGGTGTTGTATATCGACCCGGCTTTCTTCTCAGATATAAACGGGTATTTGATGTTAATTTCCTTCGCt < 2:4067950/99‑1 (MQ=255) ggTTGTAATCCACCTTCTGTAACTGGAAGTTGGTGATGTATATCGGCCCGGCTTTCTTCTCAGATATAAACGGGTATTTGATGTTAATTTCCTTCGCttt < 1:3503838/100‑1 (MQ=255) ggTTGTAATCCACCTTCTGTAACTGGAAGTTGGTGATGTATATCGACCCGGCTTTCTTCTCAGATATAAACGGGTATTTGATGTTAATTTCCTTCGCttt < 1:2194105/100‑1 (MQ=255) gTTGTAATCCACCTTCTGTAACTGGAAGTTGGTGATGTATATCGGCCCGGCTTTCTTCTCAGCAATAAACGGGGATTTGATGTTAATTTCCTTCGCttt > 2:1546296/1‑99 (MQ=255) gTTGTAATCCACCTTCTGTAACTGGAAGTTGGTGATGTATATCGGCCCGGCTTTCTTCTCAGATATAAACGGGTATTTGATGTTAATTTCCTTCGCctt > 2:3274977/1‑99 (MQ=255) gTTGTAATCCACCTTCTGTAACTGGAAGTTGGTGATGTATATCGGCCCGGCTTTCTTCTCAGATATAAACGGGTATTTGATGTTAATTTCCTTCGCTTTa > 1:464869/1‑100 (MQ=255) ttGTAATCCACCTTCTGTAACTGGACGTTGGTGCTGTATATCGTCCTTGCTTTCTCTTCAGGTATCAAAGGGAGTTTGCTGTTAATTTTCtt > 2:3418877/1‑92 (MQ=255) tAATCCACCTTCTGTAACTGGAAGTTGGTGATGTATATCGGCCCGGCTTTCTTCTCAGATATAAACGGGTATTGGATGTTAATTTCCTTCGCTTTaa > 2:3409815/1‑97 (MQ=255) tAATCCACCTTCTGTAACTGGAAGTTGGTGATGTATATCGACCCGGCTTTCTTCTCAGATATAAACGGGTATTTGATGTTAATTTCCTTCGCTTTAATcc > 1:3302295/1‑100 (MQ=255) aaTCCACCTTCTGTAACTGGAAGTTGGTGATGTATATCGACCCGGCTTTCTTCTCAGATATAAACGGGTATTTGATGTTAATTTCCTTCGCTTTAATccc > 2:748558/1‑100 (MQ=255) aTCCACCTTCTGTAACTGGAAGTTGGTGATGTATATCGGCCCGGCTTTCTTCTCAGATATAAACGGGTATTTGATGTTAATTTCCTTCGCTTTAATcccc > 1:2657814/1‑100 (MQ=255) tCCACCTTCTGTAACTGGAAGTTGGTGATGTATATCGGCCCGGCTTTCTTCTCAGATATAAACGGGTATTTGATGTTAATTTCCTTCGCTTTAATCCCCg < 2:224837/100‑1 (MQ=255) cACCTTCTGTAACTGGAAGTTGGTGATGTATATCGGCCCGGCTTTCTTCTCAGATATAAACGGGTATTTGATGTTAATTTCCTTCGCTTTAATCCCCGTc > 2:3889532/1‑100 (MQ=255) cACCTTCTGTAACTGGAAGTTGGTGATGTATATCGGCCCGGCTTTCTTCTCAGATATAAACGGGTATTTGATGTTAATTTCCTTCGCTTTAATCCCCGTc > 1:2480724/1‑100 (MQ=255) aCCTTCTGTAACTGGAAGTTGGTGATGTATATCGGCCCGGCTTTCTTCTCAGATATAAACGGGTATTTGATGTTAATTTCCTTCGCTTTAATCCCCGTcc < 1:3262871/100‑1 (MQ=255) ttCTGTAACTGGAAGTTGGTGATGTATATCGGCCCGGCTTTCTTCTCAGATATGAACGGGTATTTGATGTTAATTTCCTTCGCTTTAATCCCCGTCCACt < 2:2294541/100‑1 (MQ=255) ttCTGTAACTGGAAGTTGGTGATGTATATCGGCCCGGCTTTCTTCTCAGATATAAACGGGTATTTGATGTTAATTTCCTTCGCTTTAATCCCCGTCCACt < 1:2088610/100‑1 (MQ=255) tCTGTAACTGGAAGTTGGTGATGTATATCGGCCCGGCTTTCTTCTCAGATATAAACGGGTATTTGATGTTAATTTCCTTCGCTTTAATCCCCGTCCACTg < 2:864032/100‑1 (MQ=255) tCTGTAACTGGAAGTTGGTGATGTATATCGGCCCGGCTTTCTTCTCAGATATAAACGGGTATTTGATGTTAATTTCCTTCGCTTTAATCCCCGTCCACTg < 1:733989/100‑1 (MQ=255) cTGTAACTGGAAGTTGGTGATGTATATCGGCCCGGCTTTCTTCTCAGATATACACGGGTATTTGATGTTAATTTCCTTCGCTTTAATCCCCGTCCACTgg > 1:168374/1‑100 (MQ=255) tGTAACTGGAAGTTGGTGATGTATATCGGCCCGGCTTTCTTCTCAGATATAAACGGGTATTTGATGTTAATTTCCTTCGCTTTAATCCCCGTCCACTggg > 1:3966129/1‑100 (MQ=255) gTAACTGGAATTTGGTGATGTATATCGGCCCGGCTTTCTTCTCAGATATAAACGGGTATTTGATGTGAATTTCCTTCGCTTTAATCCCCGTCCACTGGga < 2:2720009/100‑1 (MQ=255) gTAACTGGAAGTTGGTGATGTATATCGGCCCGGCTTTCTTCTCAGATATAAACGGGTATTTGATGTTAATTTCCTTCGCTTTAATCCCCGTCCACTGGga > 2:3037669/1‑100 (MQ=255) tAACTGGAAGTTGGTGATGTATATCGGCCCGGCTTTCTTCTCAGATATAAACGGGTATTTGATGTTAATTTCCTTCGCTTTAATCCCCGTCCACTGGgag < 1:331887/100‑1 (MQ=255) tAACTGGAAGTTGGTGATGTATATCGGCCCGGCTTTCTTCTCAGATATAAACGGGTATTTGATGTTAATTTCCTTCGCTTTAATCCCCGTCCACTGGgag < 1:579712/100‑1 (MQ=255) tAACTGGAAGTTGGTGATGTATATCGACCCGGCTTTCTTCTCAGATATAAACGGGTATTTGATGTTAATTTCCTTCGCTTTAATCCCCGTCCACTGGgag < 1:2611108/100‑1 (MQ=255) aaCTGGAAGTTGGTGATGTATATCGGCCCGGCTTTCTTCTCAGATATAAACGGGTATTTGATGTTAATTTCCTTCGCTTTAATCCCCGTCCACTGGgaga > 2:2139979/1‑100 (MQ=255) aaCTGGAAGTTGGTGATGTATATCGGCCCGGCTTTCTTCTCAGATATAAACGGGTATTTGATGTTAATTTCCTTCGCTTTAATCCCCGTCCACTGGgaga > 1:784102/1‑100 (MQ=255) aCTGGAAGTTGGTGATGTATATCGGCCCGGCTTTCTTCTCAGATATAAACGGGTATTTGATGTTAATTTCCTTCGCTTTAATCCCCGTCCACTGGGAGaa > 2:429070/1‑100 (MQ=255) aCTGGAAGTTGGTGATGTATATCGACCCGGCTTTCTTCTCAGATATAAACGGGTATTTGATGTTAATTTCCTTCGCTTTAATCCCCGTCCACTGGGAGaa < 2:1568875/100‑1 (MQ=255) aCTGGAAGTTGGTGATGTATATCGACCCGGCTTTCTTCTCAGATATAAACGGGTATTTGATGTTAATTTCCTTCGCTTTAATCCCCGTCCACTGGGAGaa > 1:2645354/1‑100 (MQ=255) cTGGAAGTTGGTGATGTATATCGACCCGGCTTTCTTCTCAGATATAAACGGGTATTTGATGTTAATTTCCTTCGCTTTAATCACCGTCCAGTGGGAGaa > 2:3628307/1‑99 (MQ=255) ggAAGTTGGTGATGTATATCGGCCCGGCTTTCTTCTCAGATATAAACGGGTATTTGATGTTAATTTCCTTCGCTTTAATCCCCGTCCACTGGGAGaaaaa > 2:1417122/1‑100 (MQ=255) ggAAGTTGGTGATGTATATCGGCCCGGCTTTCTTCTCAGATATAAACGGGTATTTGATGTTAATTTCCTTCGCTTTAATCCCCGTCCACTGGGAGaaaaa > 1:3251638/1‑100 (MQ=255) aaGTTGGTGATGTATATCGGCCCGGCTTTCTTCTCAGATATAAACGGGTATTTGATGTTAATTTCCTTCGCTTTAATCCCCGTCCACTGGGAGAAAAAGc < 1:3869228/100‑1 (MQ=255) aGTTGGTGATGTATATCGGCCCGGCTTTCTTCTCAGATATAAACGGGTATTTGATGTTAATTTCCTTCGCTTTAATCCCCGTCCACTGGGAGAAAAAGcc > 1:1687239/1‑100 (MQ=255) ttGGTGATGTATATCGGCCCGGCTTTCTTCTCAGATATAAACGGGTATTTGATGTTAATTTCCTTCGCTTTAATCCCCGTCCACTGGGAGAAAAAGCCTa > 1:765342/1‑100 (MQ=255) ggTGATGTATATCGACCCGGCTTTCTTCTCAGATATAAACGGGTATTTGATGTTAATTTCCTTCGCTTTAATCCCCGTCCACTGGGAGAAAAAGCCTaag > 1:2276060/1‑100 (MQ=255) gTGATGTATATCGACCCGGCTTTCTTCTCAGATATAAACGGGTATTTGATGTTAATTTCCTTCGCTTTAATCCCCGTCCACTGGGAGAAAAAGCCTaaga < 1:3116046/100‑1 (MQ=255) gATGTATATCGACCCGGCTTTCTTCTCAGATATAAACGGGAATTTGATGTTAATTAACTTCGCTTTAATCCCCGTCCACTGGGAGAAAAAGCCTaagaag > 1:3712827/1‑100 (MQ=255) aTGTATATCGGCCCGGCTTTCTTCTCAGATATAAACGGGTATTTTATGTTAATTTCCTTCGCTTTAATCCCCGTCCACTGGGAGAAAAAGCCTAAGAAGt < 2:1781273/100‑1 (MQ=255) tataTCGGCCCGGCTTTCTTCTCAGATATAAACGGGTATTTGATGTTAATTTCCTTCGCTTTAATCCCCGTCCACTGGGAGAAAAAGCCTAAGAAGTCAt > 1:2379035/1‑100 (MQ=255) atatCGGCCCGGCTTTCTTCTCAGATATAAACGGGTATTTGATGTTAATTTCCTTCGCTTTAATCCCCGTCCACTGGGAGAAAAAGCCTAAGAAGTCAtt > 1:1362706/1‑100 (MQ=255) tatCGGCCCGGCTTTCTTCTCAGATATAAACGGGTATTTGATGTTAATTTCCTTCGCTTTAATCCCCGTCCACTGGGAGAAAAAGCCTAAGAAGTCATTg < 2:4030431/100‑1 (MQ=255) atCGGCCCGGCTTTCTTCTCAGATATAAACGGGTATTTGATGTTAATTTCCTTCGCTTTAATCCCCGTCCACTGGGAGAAAAAGCCTAAGAAGTCATTgg < 2:1409344/100‑1 (MQ=255) atCGGCCCGGCTTTCTTCTCAGATATAAACGGGTATTTGATGTTAATTTCCTTCGCTTTAATACACGTCCACTGGGAGAAAAAGTCTCAGACGTCATTgg > 2:2925913/1‑100 (MQ=255) tCGACCCGGCTTTCTTCTCAGATATAAACGGGTATTTGATGTTAATTTCCTTCGCTTTAATCCCCGTCCACTGGGAGAAAAAGCCTAAGAAGTCATTGGc > 1:1028068/1‑100 (MQ=255) tCGACCCGGCTTTCTTCTCAGATATAAACGGGTATTTGATGTTAATTTCCTTCGCTTTAATCCCCGTCCACTGGGAGAAAAAGCCTAAGAAGTCATTGGc > 1:1029438/1‑100 (MQ=255) gCCCGGCTTTCTTCTCAGATATAAACGGGTATTTGATGTTAATTTCCTTCGCTTTAATCCCCGTCCACTGGGAGAAAAAGCCTAAGAAGTCATTGGCTg > 1:954837/1‑99 (MQ=255) gCCCGGCTTTCTTCTCAGATATAAACGGGGATTTGATGTTAATTTCCTTCGCTTGAATCCCCGTCCACTGGGAGAAAAAGCCTAAGAAGTCATTGGCt < 1:1455455/98‑1 (MQ=255) | TCGGGGCGGATTTTTGTTTTTAAGGTTTCGGGTCGAAAATATCGGTTCCGAGATGGTTGTAATCCACCTTCTGTAACTGGAAGTTGGTGATGTATATCGGCCCGGCTTTCTTCTCAGATATAAACGGGTATTTGATGTTAATTTCCTTCGCTTTAATCCCCGTCCACTGGGAGAAAAAGCCTAAGAAGTCATTGGCTG > NC_000913/850995‑851192 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |