| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,034,326 | A→G | 57.2% | N358S (AAC→AGC) | hyaB → | hydrogenase 1, large subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,034,326 | 0 | A | G | 57.2% | 85.8 / 164.5 | 147 | N358S (AAC→AGC) | hyaB | hydrogenase 1, large subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (31/32); new base G (49/35); total (80/67) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.17e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.90e-01 | |||||||||||
Only 100 of 150 total aligned reads displayed.
CGGTGATTAACGGCGACTTCAACAATGTGCTGCCAGTGGATTTGGTTGATCCGCAGCAGGTGCAGGAGTTTGTCGACCACGCCTGGTATCGATATCCCAACGATCAGGTCGGGCGTCATCCGTTCGATGGCATCACCGACCCGTGGTACAACCCCGGCGATGTCAAAGGCAGCGATACCAACATTCAGCAGCTGAATGA > NC_000913/1034227‑1034425 | cgGTGATTAACGGCGACTTCAACAATGTGCTGCCAGTGGATTTGGTTGATCCGCAGCAGGTGCAGGAGTTTGTCGACCACGCCTGGTATCGATATCCCaa < 1:2308000/100‑1 (MQ=255) gATTAACGGCGACTTCAACACTGTGCTGCCAGTGGATTGGGTTGATCCGCAGCAGGTGCAGGAGTTTGTCGACCACGCCTGGTATCGATATCCCaa < 2:2175499/96‑1 (MQ=255) ttAACGGCGACTTCAACAATGTGCTGCCAGTGGATTTGGTTGATCCGCAGCAGGTGCAGGAGTTTGTCGACCACGCCTGGTATCGATATCCCAGCGATCa < 1:1754266/100‑1 (MQ=255) ttAACGGCGACTTCAACAATGTGCTGCCAGTGGATTTGGTTGATCCGCAGCAGGTGCAGGAGTTTGTCGACCACGCCTGGTATCGATATCCCAACGATcn < 1:2988407/100‑2 (MQ=255) ttAACGGCGACTTCAACAATGTGCTGCCAGTGGATTTGGTTGATCCGCAGCAGGTGCAGGAGTTTGTCGACCACGCCTGGTATCGATATCCCAACGATCa < 1:3523510/100‑1 (MQ=255) ttAACGGCGACTTCAACAATGTGCTGCCAGTGGATTTGGTTGATCCGCAGCAGGTGCAGGAGTTTGTCGACCACGCCTGGTATCGATATCCCAACGATCa < 2:2711331/100‑1 (MQ=255) aaCGGCGACTTCAACAATGTGCTGCCAGTGGATTTGGTTGATCCGCAGCAGGTGCAGGAGTTTGTCGACCACGCCTGGTATCGATATCCCAGCGATCAgg > 1:1285882/1‑100 (MQ=255) aCGGCGACTTCAACAATGTGCTGCCAGTGGATTTGGTTGATCCGCAGCAGGTGCAGGAGTTTGTCGACCACGCCTGGTATCGATATCCCAACGATCAGGt > 2:1534421/1‑100 (MQ=255) aCGGCGACTTCAACAATGTGCTGCCAGTGGATTTGGTCGATCCGCAGCAGGTGCAGGAGTTTGTCGACCACGCCTGGTATCGATATCCCCGCGATCAGGt > 2:1618528/1‑100 (MQ=255) cGGCGACTTCAACAATGTGCTGCCAGTGGATTTGGTTGATCCGCAGCAGGTGCAGGAGTTTGTCGACCACGCCTGGTATCGATATCCCAGCGATCAGGTc > 1:2933979/1‑100 (MQ=255) aCTTCAACAATGTGCTGCCAGTGGATTTGGTTGATCCGCAGCAGGTGCAGGAGTTTGTCGACCACGCCTGGTATCGATATCCCAGCGATCAGGTCGGGCg < 2:3153688/100‑1 (MQ=255) aCTTCAACAATGTGCTGCCAGTGGATTTGGTTGATCCGCAGCAGGTGCAGGAGTTTGTCGACCACGCCTGGTATCGATATCCCAGCGATCAGGTCGGGCg < 1:1437354/100‑1 (MQ=255) aCTTCAACAATGTGCTGCCAGTGGATTTGGTTGATCCGCAGCAGGTGCAGGAGTTTGTCGACCACGCCTGGTATCGATATCCCAGCGATCAGGTCGGGCg < 2:1738473/100‑1 (MQ=255) aCTTCAACAATGTGCTGCCAGTGGATTTGGTTGATCCGCAGCAGGTGCAGGAGTTTGTCGACCACGCCTGGTATCGATATCCCAACGATCAGGTCGGGCg < 1:2533394/100‑1 (MQ=255) cTTCAACAATGTGCTGCCAGTGGATTTGGTTGATCCGCAGCAGGTGCAGGAGTTTGTCGACCACGCCTGGTATCGATATCCCAGCGATCAGGTCGGGCGt > 2:885831/1‑100 (MQ=255) cTTCAACAATGTGCTGCCAGTGGATTTGGTTGATCCGCAGCAGGTGCAGGAGTTTGTCGACCACGCCTGGTATCGATATCCCAGCGATCAGGTCGGGCGt > 2:3569796/1‑100 (MQ=255) cTTCAACAATGTGCTGCCAGTGGATTTGGTTGATCCGCAGCAGGTGCAGGAGTTTGTCGACCACGCCTGGTATCGATATCCCAACGATCAGGTCGGGCGt > 2:2982245/1‑100 (MQ=255) cTTCAACAATGTGCTGCCAGTGGATTTGGTTGATCCGCAGCAGGTGCAGGAGTTTGTCGACCACGCCTGGTATCGATATCCCAACGATCAGGTCGGGCGt > 1:356805/1‑100 (MQ=255) tCAACAATGTGCTGCCAGTGGATTTGGTTGATCCGCAGCAGGTGCAGGAGTTTGTCGACCACGCCTGGTATCGATATCCCAACGATCAGGTCGGGCGTCa > 1:2099187/1‑100 (MQ=255) acaaTGTGCTGCCAGTGGATTTGGTTGATCCGCAGCAGGTGCAGGAGTTTGTCGACCACGCCTGGTATCGATATCCCAGCGATCAGGTCGGGCGTCATcc < 1:407906/100‑1 (MQ=255) tgtgCTGCCAGTGGATTTGGTTGATCCGCAGCAGGTGCAGGAGTTTGTCGACCACGCCTGGTATCGATATCCCAGCGATCAGGTCGGGCGTCATCCGTTc > 2:3337181/1‑100 (MQ=255) tgtgCTGCCAGTGGATTTGGTTGATCCGCAGCAGGTGCAGGAGTCTGTCGACCACGCCTGGTATCGATATCCCAACGATCAGGTCGGGCGTCATCCGTTc < 1:3386882/100‑1 (MQ=255) ctgcCAGTGGATTTGGTTGATCCGCAGCAGGTGCAGGAGTTTGTCGACCACGCCTGGTATCGATATCCCAACGATCAGGTCGGGCGTCATCCGTTCGATg < 2:213636/100‑1 (MQ=255) ctgcCAGTGGATTTGGTTGATCCGCAGCAGGTGCAGGAGTTTGTCGACCACGCCTGGTATCGATATCCCAACGATCAGGTCGGGCGTCATCCGTTCGATg < 1:129030/100‑1 (MQ=255) tgcCAGTGGATTTGGTTGATCCGCAGCAGGTGCAGGAGTTTGTCGACCACGCCTGGTATCGATATCCCAGCGATCAGGTCGGGCGTCATCCGTTCGATgg < 1:1912097/100‑1 (MQ=255) tgcCAGTGGATTTGGTTGATCCGCAGCAGGTGCAGGAGTTTGTCGACCACGCCTGGTATCGATATCCCAACGATCAGGTCGGGCGTCATCCGTTCGATgg < 2:3829425/100‑1 (MQ=255) tgcCAGTGGACGTGGTTGATCCGCAGCAGGTGCAGGAGTTTGTCGACCACGCCTGGTATCGATATCCCAGCGATCAGGTCGGGCGTCATCCGTTCGAt < 2:3149351/98‑1 (MQ=255) gcCAGTGGATTTGGTTGATCCGCAGCAGGTGCAGGAGTTTGTCGACCACGCCTGGTATCGATATCCCAACGATCAGGTCGGGCGTCATCCGTTCGATGGc > 1:1231577/1‑100 (MQ=255) ccAGTGGATTTGGTTGATCCGCAGCATGTGCAGGAGTTTGTCGACCACGCCTGGTATCGATATCCCAACGATCAGGTCGGGCGTCATCCGTTCGATGGCa < 1:584821/100‑1 (MQ=255) ccAGTGGATTTGGTTGATCCGCAGCAGGTGCAGGAGTTTGTCGACCACGCCTGGTATCGATATCCCAACGATCAGGTCGGGCGTCATCCGTTCGATGGCa > 2:1498598/1‑100 (MQ=255) cAGTGGATTTGGTTGATCCGCAGCAGGTGCAGGAGTTTGTCGACCACGCCTGGTATCGATATCCCAACGATCAGGTCGGGCGTCATCCGTTCGATGGCAt < 2:4053711/100‑1 (MQ=255) aGTGGATTTGGTTGATCCGCAGCAGGTGCAGGAGTTTGTCGACCACGCCTGGTATCGATATCCCAGCGATCAGGTCGGGCGTCATCCGTTCGATGGCATc > 2:3121965/1‑100 (MQ=255) aGTGGATTTGGTTGATCCGCAGCAGGTGCAGGAGTTTGTCGACCACGCCTGGTATCGATATCCCAGCGATCAGGTCGGGCGTCATCCGTTCGATGGCATc < 1:3412117/100‑1 (MQ=255) gTGGATTTGGTTGATCCGCAGCAGGTGCAGGAGTTTGTCGACCACGCCTGGTATCGATATCCCAGCGATCAGGTCGGGCGTCATCCGTTCGATGGCATCa < 1:305451/100‑1 (MQ=255) ggATTTGGTTGATCCGCAGCAGGTGCAGGAGTTTGTCGACCACGCCTGGTATCGATATCCCAGCGATCAGGTCGGGCGTCATCCGTTCGATGGCATCAcc < 2:149316/100‑1 (MQ=255) ggATTTGGTTGATCCGCAGCAGGTGCAGGAGTTTGTCGACCACGCCTGGTATCGATATCCCAGCGATCAGGTCGGGCGTCATCCGTTCGATGGCATCAcc < 1:2498593/100‑1 (MQ=255) ggATTTGGTTGATCCGCAGCAGGTGCAGGAGTTTGTCGACCACGCCTGGTATCGATATCCCAGCGATCAGGTCGGGCGTCATCCGTTCGATGGCATCAcc < 2:149315/100‑1 (MQ=255) gATTTGGTTGATCCGCAGCAGGTGCAGGAGTTTGTCGACCACGCCTGGTATCGATATCCCAGCGATCAGGTCGGGCGTCATCCGTTCGATGGCATCACCg > 2:2619172/1‑100 (MQ=255) ttGGTTGATCCGCAGCAGGTGCAGGAGTTTGTCGACCACGCCTGGTATCGATATCCCAGCGATCAGGTCGGGCGTCATCCGTTCGATGGCATCACCGAcc < 1:2619188/100‑1 (MQ=255) ttGGTTGATCCGCAGCAGGTGCAGGAGTTTGTCGACCACGCCTGGTATCGATATCCCAGCGATCAGGTCGGGCGTCATCCGTTCGATGGCATCACCGAcc < 1:45783/100‑1 (MQ=255) ggTTGATCCGCAGCAGGTGCAGGAGTTTGTCGACCACGCCTGGTATCGATATCCCAACGATCAGGTCGGGCGTCATCCGTTCGATGGCATCACCGACCCg > 1:867866/1‑100 (MQ=255) ggTTGATCCGCAGCAGGTGCAGGAGTTTGTCGACCACGCCTGGTATCGATATCCCAACGATCAGGTCGGGCGTCATCCGTTCGATGGCATCACCGACCCg > 1:2697591/1‑100 (MQ=255) ttGATCCGCAGCAGGTGCAGGAGTTTGTCGACCACGCCTGGTATCGATATCCCAGCGATCAGGTCGGGCGTCATCCGTTCGATGGCATCACCGACCCGTg > 2:837886/1‑100 (MQ=255) tGATCCGCAGCAGGTGCAGGAGTTTGTCGACCACGCCTGGTATCGATATCCCAGCGATCAGGTCGGGCGTCATCCGTTCGATGGCATCACCGACCCgggg > 1:51805/1‑100 (MQ=255) tGATCCGCAGCAGGTGCAGGAGTTTGTCGACCACGCCTGGTATCGATATCCCAGCGATCAGGTCGGGCGTCATCCGTTCGATGGCATCACCGACCCGTgg > 1:3584067/1‑100 (MQ=255) tGATCCGCAGCAGGTGCAGGAGTTTGTCGACCACGCCTGGTATCGATATCCCAGCGATCAGGTCGGGCGTCATCCGTTCGATGGCATCACCGACCCGTgg > 2:3885422/1‑100 (MQ=255) tGATCCGCAGCAGGTGCAGGAGTTTGTCGACCACGCCTGGTATCGATATCCCAGCGATCAGGTCGGGCGTCATCCGTTCGATGGCATCACCGACCCGTgg > 1:1298623/1‑100 (MQ=255) tGATCCGCAGCAGGTGCAGGAGTTTGTCGACCACGCCTGGTATCGATATCCCAGCGATCAGGTCGGGCGTCATCCGTTCGATGGCATCACCGACCCGTgg < 1:3062603/100‑1 (MQ=255) tGATCCGCAGCAGGTGCAGGAGTTTGTCGACCACGCCTGGTATCGATATCCCAACGATCAGGTCGGGCGTCATCCGTTCGATGGCATCACCGACCCGTgg > 1:1691579/1‑100 (MQ=255) gATCCGCAGCAGGTGCAGGAGTTTGTCGACCACGCCTGGTCTCGATATCCCAGCGATCAGGTCGGCCGTCATCCGTTCGATGGCATCACCGCCCCGTGGt > 2:1013132/1‑100 (MQ=255) gATCCGCAGCAGGTGCAGGAGTTTGTCGACCACGCCTGGTATCGATATCCCAACGATCAGGTCGGGCGTCATCCGTTCGATGGCATCACCGACCCGTGGt < 1:279063/100‑1 (MQ=255) aTCCGCAGCAGGTGCAGGAGTTTGTCGACCACGCCTGGTATCGATATCCCAGCGATCAGGTCGGGCGTCATCCGTTCGATGGCATCACCGACCCGTGGTa < 1:2586542/100‑1 (MQ=255) aTCCGCAGCAGGTGCAGGAGTTTGTCGACCACGCCTGGTATCGATATCCCAGCGATCAGGTCGGGCGTCATCCGTTCGATGGCATCACCGACCCGTGGTa > 1:3910810/1‑100 (MQ=255) tCCGCAGCAGGTGCAGGAGTTTGTCGACCACGCCTGGTATCGATATCCCAGCGATCAGGTCGGGCGTCATCCGTTCGATGGCATCACCGACCCGTGGTAc > 1:1409343/1‑100 (MQ=255) cGCAGCAGGTGCAGGAGTTTGTCGACCACGCCTGGTATCGATATCCCAGCGATCAGGTCGGGCGTCATCCGTTCGATGGCATCACCGACCCGTGGTACaa > 2:3361012/1‑100 (MQ=255) cGCAGCAGGTGCAGGAGTTTGTCGACCACGCCTGGTATCGATATCCCAGAGATCAAGTCGGGCGTCATCCGTTCGATGGCATCACCGACCCGTGGTACaa > 2:3765882/1‑100 (MQ=255) gcagcaGGTGCAGGAGTTTGTCGACCACGCCTGGTATCGATATCCCAACGATCAGGTCGGGCGTCATCCGTTCGATGGCATCACCGACCCGTGGTACAAc > 2:3749187/1‑100 (MQ=255) cagcagGTGCAGGAGTTTGTCGACCACGCCTGGTATCGATATCCCAACGATCAGGTCGGGCGTCATCCGTTCGATGGCATCACCGACCCGTGGTACAAcc < 2:2753792/100‑1 (MQ=255) gcagGTGCAGGAGTTTGTCGACCACGCCTGGTATCGATATCCCAGCGATCAGGTCGGGCGTCATCCGTTCGATGGCATCACCGACCCGTGGTACAAcccc > 1:3616739/1‑100 (MQ=255) ggTGCAGGGGTTTGTCGTCCCCGCCTGGTATCGATATCCCAACGATCAGGGCGGGCGTCATCCGTTCGACGGCATCACCGACCCGTGGTACAACCCCGGc < 2:3261810/100‑1 (MQ=255) tGCAGGAGTTTGTCGACCACGCCTGGTATCGATATCCCAGCGATCAGGTCGGGCGTCATCCGTTCGATGGCATCACCGACCCGTGGTACAACCCCGGCGa > 2:687280/1‑100 (MQ=255) gCAGGAGTTTGTCGACCACGCCTGGTATCGATATCCCAGCGATCAGGTCGGGCGTCATCCGTTCGATGGCATCACCGACCCGTGGTACAACCCCGGCGAt > 2:3028451/1‑100 (MQ=255) cAGGAGTTTGTCGACCACGCCTGGTATCGATATCCCAGCGATCAGGTCGGGCGTCATCCGTTCGATGGCATCACCGACCCGTGGTACAACCCCGGCGATg < 1:2198275/100‑1 (MQ=255) cAGGAGTTTGTCGACCACGCCTGGTATCGATATCCCAACGATCAGGTCGGGCGTCATCCGTTCGATGGCATCACCGACCCGTGGTACAACCCCGGCGATg > 2:3463359/1‑100 (MQ=255) aGGAGTTTGTCGACCACGCCTGGTATCGATATCCCAACGATCAGGTCGGGCGTCATCCGTTCGATGGCATCACCGACCCGTGGTACAACCCCGGCGATGt > 1:2183821/1‑100 (MQ=255) aGGAGTTTGTCGACCACGCATGGTATCGATATAGCAGCGATGACATCGGGCGTCATCCGTTCGATGGCCACACCGACCCGTGGTACAACCCCGGCgtgg > 2:4128673/1‑96 (MQ=255) agAGTTTGTCGACCACGCCGGGTATCGAGATCCCAACGATCAGGTCGGGCGTCAGCCGTTCGATGGCATCACCGACCCGTGGTACAACCCCGGCGAt < 2:2851026/96‑1 (MQ=255) gAGTTTGTCGACCACGCCTGGTATCGATATCCCAGCGATCAGGTCGGGCGTCATCCGTTCGATGGCATCACCGACCCGTGGTACAACCCCGGCGATGTCa < 1:3121984/100‑1 (MQ=255) aGTTTGTCGACCACGCCTGGTATCGATATCCCAACGATCAGGTCGGGCGTCATCCGTTCGATGGCATCACCGACCCGTGGTACAACCCCGGCGATGTCaa > 1:2970031/1‑100 (MQ=255) gTTTGTCGACCACGCCTGGTATCGATATCCCAGCGATCAGGTCGGGCGTCATCCGTTCGATGGCATCACCGACCCGTGGTACAACCCCGGCGATGTCaaa > 1:3953570/1‑100 (MQ=255) tttGTCGACCACGCCTGGTATCGATATCCCAACGATCAGGTCGGGCGTCATCCGTTCGATGGCATCACCGACCCGTGGTACAACCCCGGCGATGTCAAAg < 2:1177287/100‑1 (MQ=255) gTCGACCACGCCTGGTATCGATATCCCAACGATCAGGTCGGGCGTCATCCGTTCGATGGCATCACCGACCCGTGGTACAACCCCGGCGATGTCAAAGGCa > 2:1433988/1‑100 (MQ=255) ccgatctaCGCCTGGTATCGATATCCCAGCGATCAGGTCGGGCGTCATCCGTTCGATGGCATCACCGACCCGTGGTACAACCCCGGCGATGTCAAAGGCa < 1:2087694/93‑1 (MQ=255) gACCACGCCTGGTATCGATATCCCAGCGATCAGGTCGGGCGTCATCCGTTCGATGGCATCACCGACCCGTGGTACAACCCCGGCGATGTCAAAGGCAGCg < 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gCCTGGTATCGATATCCCAGCGATCAGGTCGGGCGTCATCCGTTCGATGGCATCACCGACCCGTGGTACAACCCCGGCGATGTCAAAGGCAGCGATACCa > 1:1863119/1‑100 (MQ=255) gCCTGGTATCGATACCCCAGCGATCAGGGCGGGCGTCAGCCGTTCGATGGCATCACCGACCCGTCGCACAACCCCGGCGATGTCAAAGGCAGCGCTAcaa > 2:1183852/1‑98 (MQ=255) ccTGGTATCGATATCCCAACGATCAGGTCGGGCGTCATCCGTTCGATGGCATCACCGACCCGTGGTACAACCCCGGCGATGTCAAAGGCAGCGATACCaa > 1:1747606/1‑100 (MQ=255) cgggTATCGATATCCCAACGATCAGGTCGGGCGTCATCCGTTCGATGGCATCACCGACCCGTGGTACAACCCCGGCGATGTCAAAGGCAGCGATACCAAc < 1:624796/98‑1 (MQ=255) gTATCGATATCCAAACGATCAGGTCGGGCGTCATCCGTTCGATGGCATCACCGACGCGTGGTACAACCCCGGCGATGTCAAAGGCAGAGATACCAACa > 2:2040459/1‑98 (MQ=255) tATCGATATCCCAGCGATCAGGTCGGGCGTCATCCGTTCGATGGCATCACCGACCCGTGGTACAACCCCGGCGATGTCAAAGGCAGCGATACCAACATTc > 1:4099751/1‑100 (MQ=255) tATCGATATCCCAACGATCAGGTCGGGCGTCATCCGTTCGATGGCATCACCGACCCGTGGTACAACCCCGGCGATGTCAAAGGCAGCGATACCAACATTc < 2:101718/100‑1 (MQ=255) tATCGATATCCCAACGATCAGGTCGGGCGTCATCCGTTCGATGGCATCACCGACCCGTGGTACAACCCCGGCGATGTCAAAGGCAGCGATACCAACATTc < 1:3749211/100‑1 (MQ=255) tCGATATCCCAGCGATCAGGTCGGGCGTCATCCGTTCGATGGCATCACCGACCCGTGGTACAACCCCGGCGATGTCAAAGGCAGCGATACCAACATTcag > 2:3838115/1‑100 (MQ=255) gATATCCCAGCGATCAGGTCGGGCGTCATCCGTTCGATGGCATCACCGACCCGTGGTACAACCCCGGCGATGTCAAAGGCAGCGATACCAACATTcagc > 2:2926705/1‑99 (MQ=255) tatCCCAACGATCAGGTCGGGCGTCATCCGTTCGATGGCATCACCGACCCGTGGTACAACCCCGGCGATGTCAAAGGCAGCGATACCAACATTCagcagc < 2:516760/100‑1 (MQ=255) atCCCAGCGATCAGGTCGGGCGTCATCCGTTCGATGGCATCACCGACCCGTGGTACAACCCCGGCGATGTCAAAGGCAGCGATACCAACATTCAGCAGCt > 1:1486418/1‑100 (MQ=255) tCCCAGCGATCAGGTCGGGCGTCATCCGTTCGATGGCATCACCGACCCGTGGTACAACCCCGGCGATGTCAAAGGCAGCGATACCAACATTCAGCAGCtg < 1:2310658/100‑1 (MQ=255) tCCCAGCGATCAGGTCGGGCGTCATCCGTTCGATGGCATCACCGACCCGTGGTACAACCCCGGCGATGTCAAAGGCAGCGATACCAACATTCAGCAGCtg < 1:3628453/100‑1 (MQ=255) tCCCAACGATCAGGTCGGGCGTCATCCGTTCGATGGCATCACCGACCCGTGGTACAACCCCGGCGATGTCAAAGGCAGCGATACCAACATTCAGCAGCtg < 1:1006540/100‑1 (MQ=255) tcAACGATCAGGTCGGGCGTCATCCGTTCGATGGCATCACCGACCCGTGGTACAACCCCGGCGATGTCAAAGGCAGCGATACCAACATTCAGCAGCtgaa < 1:3138154/99‑1 (MQ=255) ccAGCGATCAGGTCGGGCGTCATCCGTTCGATGGCATCACCGACCCGTGGTACAACCCCGGCGATGTCAAAGGCAGCGATACCAACATTCAGCAGCtgaa > 2:2473375/1‑100 (MQ=255) ccAACGATCAGGTCGGGCGTCATCCGTTCGATGGCATCACCGACCCGTGGTACAACCCCGGCGATGTCAAAGGCAGCGATACCAACATTCAGCAGCtgaa > 1:15832/1‑100 (MQ=255) cAACGATCAGGTCGGGCGTCATGCGTTCGATGGCATCACCGACCCGTGGTACAACCCCGGCGATGTCAAAGGCAGCGCTACCAACATTCAGCAGCtgaat < 2:2402839/100‑1 (MQ=255) | CGGTGATTAACGGCGACTTCAACAATGTGCTGCCAGTGGATTTGGTTGATCCGCAGCAGGTGCAGGAGTTTGTCGACCACGCCTGGTATCGATATCCCAACGATCAGGTCGGGCGTCATCCGTTCGATGGCATCACCGACCCGTGGTACAACCCCGGCGATGTCAAAGGCAGCGATACCAACATTCAGCAGCTGAATGA > NC_000913/1034227‑1034425 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |