| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,111,377 | A→G | 18.8% | D172G (GAT→GGT) | opgH → | OPG biosynthetic ACP‑dependent transmembrane UDP‑glucose beta‑1,2 glycosyltransferase; nutrient‑dependent cell size regulator, FtsZ assembly antagonist |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,111,377 | 0 | A | G | 18.8% | 270.1 / 54.8 | 133 | D172G (GAT→GGT) | opgH | OPG biosynthetic ACP‑dependent transmembrane UDP‑glucose beta‑1,2 glycosyltransferase; nutrient‑dependent cell size regulator, FtsZ assembly antagonist |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (42/65); new base G (9/16); total (52/81) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.23e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.75e-01 | |||||||||||
Only 100 of 135 total aligned reads displayed.
ACATTCTGTTGATCCTGACGCTCGCGCAAACTGTCGTCGCGACCTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGATATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCGGTATCCTGATCCTCTTTGCGGTACTGTTCTGTTGGG > NC_000913/1111278‑1111475 | aaaTTCTGTTGATCCTGACGCTCGCGCAAACTGTCGTCGCGACCTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGa > 1:2783129/3‑100 (MQ=255)aCATTCTGTTGATCCTGACGCTCGCGCAAACTGTCGTCGCGACCTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGa < 1:1938877/100‑1 (MQ=255) cTGTTGATCCTGACGCTCGCGCAAACTGTCGTCGCGACCTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGATAtg > 2:886082/1‑99 (MQ=255) tGTTGATCCTGACGCTCGCGCAAACTGTCGTCGCGACCTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGATAtggt < 1:1545159/100‑1 (MQ=255) gTTGATCCTGACGCTCGCGCAAACTGTCGTCGCGACCTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTAtggtt > 1:2000982/1‑100 (MQ=255) ttGATCCTGACGCTCGCGCAAACTGTCGTCGCGACCTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGATAtggttg > 1:3235586/1‑100 (MQ=255) tGATCCTGACGCTCGCGCAAACTGTCGTCGCGACCTGGTATATGAAGACCATACTTCATTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGAGAtggttgg > 2:2996898/1‑100 (MQ=255) aTCCTGACGCTCGCGCAAACTGTCGTCGCGACCTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGATATGGTTGGTc < 1:338397/100‑1 (MQ=255) aTCCTGACGCTCGCGCAAACTGTCGTCGCGACCTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGATATGGTTGGTc > 2:3258163/1‑100 (MQ=255) tCCTGACGCTCGCGCAAACTGTCGTCGCGACCTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGATATGGTTGGTCa < 2:2929605/100‑1 (MQ=255) ccTGACGCTCGCGCAAACTGTCGTCGCGACCTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGATATGGTTGGTCAg > 2:521414/1‑100 (MQ=255) gACGCTCGCGCAAACTGTCGTCGCGACCTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGAt > 1:374104/1‑100 (MQ=255) gACGCTCGCGCAAACTGTCGTCGCGACCTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGATATGGTTGGTCAGGAt < 1:226357/100‑1 (MQ=255) tCGGGCAAACGGTCGTCGCGACCTGGTATATGAAGACCATTTTTCCTTATGAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGATATGGTTGGTCAGGATTtgtg < 2:3471694/100‑1 (MQ=255) tCGCGCAAACTGTCGTCGCGACCTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGATATGGTTGGTCAGGATTtgtg < 1:2850148/100‑1 (MQ=255) cgcgCAAACTGTCGTCGCGACGTGGTGTATGAAGACTATTCTGCATTATCAGGGTTGGGCTCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTtgtg < 2:2541095/99‑1 (MQ=255) cgcgCAAACTGTCGTCGCGACCTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGATATGGTTGGTCAGGATTTGTgg < 1:1165977/100‑1 (MQ=255) tcgcAAACTGTCGTCGCGACCTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGGTGGGCGCTGATTAATCCTATGGATATGGTTGGTCAGGATTTGTgg > 2:2630002/2‑99 (MQ=255) gcgcAAACTGTCGTCGCGACCTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTggg < 1:6017/100‑1 (MQ=255) cgcAAACTGTCGTCGCGACCTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGATATGGTTGGTCAGGATTtgagatc > 2:1110495/1‑95 (MQ=255) cgcAAACTGTCGTCGCGACCTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGATATGGTTGGTCAGGATTTGTggg > 1:2662074/1‑99 (MQ=255) gcAAACTGTCGTCGCGACCTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGATATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGtt > 2:3396120/1‑100 (MQ=255) aaCTGTCGTCGCGACCTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGATATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTcc < 1:948438/100‑1 (MQ=255) cTGTCGTCGCGACCTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCtt < 1:3363378/100‑1 (MQ=255) tcgtcgCGACCTGGTATATGAAGACTATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCTTTGGTTAATCCTATGGATATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTAt < 2:2026181/100‑1 (MQ=255) tcgtcgCGACCTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGATATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTAt < 1:3179674/100‑1 (MQ=255) cgtcgCGACCTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGATATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATg < 1:3015861/100‑1 (MQ=255) gtcgCGACCTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGc < 1:1913974/100‑1 (MQ=255) gtcgCGACCTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGATATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGc < 1:2842047/100‑1 (MQ=255) gtcgCGACCTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGATATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGc > 1:4018053/1‑100 (MQ=255) cgACCTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCt < 1:4112992/100‑1 (MQ=255) cgACCTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGATATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCt > 2:602210/1‑100 (MQ=255) caggTATATGAAGACCATTCTTCCTTATAAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCGATGGATATGGTTGGTCAGGATTTGTTAGTTCCCTTGATGCAg > 2:1782881/3‑94 (MQ=255) tGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGATATGGTTGGTCAGGCTTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGc > 2:1075983/1‑100 (MQ=255) ggTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGcc < 1:3545638/100‑1 (MQ=255) ggTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGcc < 2:847457/100‑1 (MQ=255) tataTGAAGGCGATTCTTCGTTATGAGGTTTGGGATCTGATGAATCGTGTGGAGATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCGGCTTCTGCCtt < 2:4035088/100‑1 (MQ=255) atatGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGATATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTGTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTta < 2:3258022/100‑1 (MQ=255) tatGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGATATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTtat < 1:3810413/100‑1 (MQ=255) tGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGATATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTatat > 1:886558/1‑100 (MQ=255) gAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATAtg > 1:3788752/1‑100 (MQ=255) aaGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATAtgc > 2:3013026/1‑100 (MQ=255) aaGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGATATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATAtgc < 1:1076095/100‑1 (MQ=255) aGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGATATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATAtgct < 1:2370305/100‑1 (MQ=255) gACCATTCTTCCTTCTCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATAtgctg > 2:265472/1‑100 (MQ=255) gACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGTTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATAtgctg < 1:3870293/100‑1 (MQ=255) gACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGATATGGTTGGTCAGGCTTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATAtgctg > 2:748893/1‑100 (MQ=255) gACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATCGCTATGGTTGGTCAGGATTTGTGTGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATAtgctg > 2:1776662/1‑100 (MQ=255) gACCAGTGTTCCTTATCAGGGTTGTGCTCTGATTAATCCTATGGGTTTGGTTGGTCAGGATTTTTGGGTTGCCTTGATGCAGCTACTGCCTTATAtgctg < 2:3502137/100‑1 (MQ=255) aCCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGATATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATAtgctgc < 1:1946376/100‑1 (MQ=255) ccATTCTTCCTTATCAGGCTTTGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTGTGCAGCTTCTGCCTTATAtgctgc > 2:1745710/1‑99 (MQ=255) cATTCTTCCTTATCATGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATAtgctg < 2:3502176/97‑1 (MQ=255) cATTCTTCCTTATCAGGGTTGTGCGCGGATTAATCCTATTGATATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCaa < 1:512500/100‑1 (MQ=255) cATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGATATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCaa > 2:4053596/1‑100 (MQ=255) cATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGATATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCaa > 1:2627920/1‑100 (MQ=255) tcttcCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGATATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAAcc < 1:2928860/100‑1 (MQ=255) tcttcCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGATATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAAcc < 2:2380967/100‑1 (MQ=255) tcttcCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGATATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAAcc < 1:2679549/100‑1 (MQ=255) tcttcATTTTCAGGGTGGTCAGCTAATTACTCCTATGGATATGGTTCGTCAGCAGTTGTGGGTTTCCTTCATGCAGCACCTGCCt < 2:2422933/85‑1 (MQ=255) cttcCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGATATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCg < 2:2917173/100‑1 (MQ=255) ttcCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGATATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCgg < 1:3193917/100‑1 (MQ=255) ccTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCGGTa < 2:1327929/100‑1 (MQ=255) ccTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGATATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGTAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCGGTa > 2:830700/1‑100 (MQ=255) ccTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGATATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCGGTa < 1:108372/100‑1 (MQ=255) tATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGATATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCGGTATcc < 2:1666212/100‑1 (MQ=255) tATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGATATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCGGTATcc > 2:1130504/1‑100 (MQ=255) aTCAGGCGTGGACGCTGATTAATCCTCTGGATATGCTTCGTCAGGATTTGTGCGTTGCCATTATGCAGCTTCTGCCTTATATTCTGCCCACAGGTATCCt > 2:2698993/1‑100 (MQ=255) cAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGATATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCGGTATCCTGa > 1:2021971/1‑100 (MQ=255) aGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGATATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCGGTATCCTGAt > 2:2779300/1‑100 (MQ=255) aGGGTTGGGCGCGGATTAATCCTATGGATATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCGAACCGGTATCCTGAt < 2:3908790/100‑1 (MQ=255) ggTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGATATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCGGTATCCTGATcc < 1:1753824/100‑1 (MQ=255) ggTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGATATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCGGTATCCTGATcc < 1:3431996/100‑1 (MQ=255) cgcTGATTAATCCTATGGATATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCGGTATCCTGATCCTCTTTGc > 2:1978047/1‑100 (MQ=255) cgcTGATTAATCCTATGGATATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCGGTATCCTGATCCTCTTTGc > 1:2262378/1‑100 (MQ=255) cgcTGATTAATCCTATGGATATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCGGTATCCTGATCCTCTTTGc < 1:2963206/100‑1 (MQ=255) cTGATTAATCCTATGGATATGGTTGGTCAGTATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCGGTATCCTGATCCTCTTTGc < 2:570114/98‑1 (MQ=255) cTGATTAATCCTATGGATATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAACCCGGTATCCTGATCCTCTTTGCgg < 1:4052777/100‑1 (MQ=255) cTGATTAATCCTATGGATATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCGGTATCCTGATCCTCTTTGCgg > 2:3655471/1‑100 (MQ=255) cTGATTAATCCTATGGATATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCGGTATCCTGATCCTCTTTGCg > 2:3193789/1‑99 (MQ=255) aTTAATCCTATGGATATGGTTGGTCACGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCGGTATCCTGATCCTCTTTGCGGTAc < 2:2907654/100‑1 (MQ=255) ttAATCCTATGGATATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCGGTATCCTGATCCTCTTTGCGGTAct > 2:840675/1‑100 (MQ=255) aaTCCTATTGATATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCGGTATCCTGATCCTCTTTGCGGTActgt < 2:3502571/100‑1 (MQ=255) aaTCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCGGTATCATGATCCTCTTTGCGGTActgt < 2:1219742/100‑1 (MQ=255) aTCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCGGTATCCTGATCCTCTTTGCGGTActgtt > 1:2505486/1‑100 (MQ=255) aTCCTATGGATATGGTTGGTCAGGATTTGTGAGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGACTTATATATTGCAAACCGGTATCCTGATCCTCTTTGCGGTActgtt > 2:1667794/1‑100 (MQ=255) aTCCTATGGATATGGTTGGTAAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCGGTTTCCTGATCCTCTTTGCGGTActgtt < 1:1016123/100‑1 (MQ=255) tCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCGGTATCCTGATCCTCTTTGCGGTActgttc < 2:374101/100‑1 (MQ=255) tCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCGGTATCCTGATCCTCTTTGCGGTActgttc < 2:3033325/100‑1 (MQ=255) tCCTATGGATATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCGGTATCCTGATCCTCTTTGCGGTActgttc < 2:2859046/100‑1 (MQ=255) tCCTATGGATATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCGGTATCCTGATCCTCTTTGCGGTActgttc < 1:847618/100‑1 (MQ=255) ccTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCGGTATCCTGATCCTCTTTGCGGTActgttct > 2:835661/1‑100 (MQ=255) ccTATGGATATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCGGTATCCTGATCCTCTTTGCGGTActgttct > 1:2141068/1‑100 (MQ=255) ccTATGGATATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCGGTATCCTGATCCTCTTTGCGGTActgttct > 1:2241047/1‑100 (MQ=255) aTGGATATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCGGTATCCTGATCCTCTTTGCGGTActgttctgtt > 2:2380226/1‑100 (MQ=255) aTGGATATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCGGTATCCTGATCCTCTTTGCGGTActgttctgtt < 1:63175/100‑1 (MQ=255) aTGGATATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCGGTATCCTGATCCTCTTTGCGGTActgttctgtt < 1:521419/100‑1 (MQ=255) ggATATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCGGTATCCTGATCCTCTTTGCGGTACTGTTCTGTTgg < 2:3917112/100‑1 (MQ=255) gATATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTGTATGCTGCAAACCGGTATCCTGATCCTCTTTGCGGTACTGTTCTGTTggg < 2:3663947/100‑1 (MQ=255) gATATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCGGTATCCTGATCCTCTTTGCGGTACTGTTCTGTTggg < 2:3971144/100‑1 (MQ=255) gATATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCGGTATCCTGATCCTCTTTGCGGTACTGTTCTGTTggg < 1:3258183/100‑1 (MQ=255) | ACATTCTGTTGATCCTGACGCTCGCGCAAACTGTCGTCGCGACCTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGATATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCGGTATCCTGATCCTCTTTGCGGTACTGTTCTGTTGGG > NC_000913/1111278‑1111475 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |