| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,070,609 | T→C | K212K (AAA→AAG) | fbaA ← | fructose‑bisphosphate aldolase, class II |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,070,609 | 0 | T | C | 94.7% | 184.3 / 0.6 | 57 | K212K (AAA→AAG) | fbaA | fructose‑bisphosphate aldolase, class II |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (1/2); new base C (28/26); total (29/28) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.11e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.55e-01 | |||||||||||
ACGCAGGATGGTCGGAGTCAGAACCACGTTACCCGGCTTGTAAACACCGTGTACGTTACCGAAGGACGCTGCGATGGTGAAACGCGGGCTGATTTTGCTCAGTTCGGTGTATGCGTAATCAACGTCTTCCGGCTGGGTGTACAGTGCAGAAGCGTCCATGTGGCTGTTGTCCACGCCGTCTTCTTCACCA > NC_000913/3070516‑3070705 | aCGCAGGATGGTCGGAGTCAGAACCACGTTACCCGGCTTGTAAACACCGTGTACGTTACCGAAGGACGCTGCGATGGTGAAACGCGGGCTGATCTTGCTc < 1:1200526/100‑1 (MQ=255)aCGCAGGATGGTCGGAGTCAGAACCACGTTACCCGGCTTGTAAACACCGTGTACGTTACCGAAGGACGCTGCGATGGTGAAACGCGGGCTGATCTTGCTc < 1:151235/100‑1 (MQ=255) ggATGGTCGGAGTCAGAACCACGTTACCCGGCTTGTAAACACCGTGTACGTTACCGAAGGACGCTGCGATGGTGAAACGCGGGCTGATCTTGCTCAGTTc < 2:3574/100‑1 (MQ=255) aTGGTCGGAGTCAGAACCACGTTACCCGGCTTGTAAACACCGTGTACGTTACCGAAGGACGCTGCGATGGTGAAACGCGGGCTGATCTTGCTCAGTTCgg < 2:581171/100‑1 (MQ=255) ggTCGGAGTCAGAACCACGTTACCCGGCTTGTAAACACCGTGTACGTTACCGAAGGACGCTGCGATGGTGAAACGCGGGCTGATCTTGCTCAGTTCGgtg > 2:441052/1‑100 (MQ=255) gTCGGAGTCAGAACCACGTTACCCGGCTTGTAAACACCGTGTACGTTACCGAAGGACGCTGCGATGGTGAAACGCGGGCTGATCTTGCTCAGTTCGgtgt > 2:578698/1‑100 (MQ=255) nggAGTCAGAACCACGTTACCCGGCTTGTAAACACCGTGTACGTTACCGAAGGACGCTGCGATGGTGAAACGCGGGCTGATCTTGCTCAGTTCGGTGTAt > 2:1250829/2‑100 (MQ=255) cGGAGTCAGAACCACGTTACCCGGCTTGTAAACACCGTGTACGTTACCGAAGGACGCTGCGATGGTGAAACGCGGGCTGATCTTGCTCAGTTCGGTGTAt > 2:1249698/1‑100 (MQ=255) tgAGTCAGAACCACGTTACCCGGCATGTAAACACCGTGTACGTTACCGAAGGACGCTGCGATGGTGAAACGCGGGCTGATCTTGCTCAGTTCGGTGTa > 2:214767/2‑98 (MQ=255) tCAGAACCACGTTACCCGGCTTGTAAACACCGTGTACGTTACCGAAGGACGCTGCGATGGTGAAACGCGGGCTGATTTTGCTCAGTTCGGTGTATGCGTa < 1:729310/100‑1 (MQ=255) cAGAACCACGTTACCCGGCTTGTAAACACCGTGTACGTTACCGAAGGACGCTGCGATGGTGAAACGCGGGCTGATCTTGCTCAGTTCGGTGTATGCGTaa > 1:174066/1‑100 (MQ=255) aGAACCACGTTACCCGGCTTGTAAACACCGTGTACGTTACCGAAGGACGCTGCGATGGTGAAACGCGGGCTGATCTTGCTCAGTTCGGTGTATGCGTAAt < 2:938080/100‑1 (MQ=255) ccACGTTACCCGGCTTGTAAACACCGTGTACGTTACCGAAGGACGCTGCGATGGTGAAACGCGGGCTGATTTTGCTCAGGTCGGTGTATGCGTAATCAAc < 2:948018/100‑1 (MQ=255) cACGTTACCCGGCTTGTAAACACCGTGTACGTTACCGAAGGACGCTGCGATGGTGAAACGCGGGCTGATCTTGCTCAGTTCGGTGTATGCGTAATCAACg < 1:1279604/100‑1 (MQ=255) aCCCGGCTTGTAAACACCGTGTACGTTACCGAAGGACGCTGCGATGGTGAAACGCGGGCTGATCTTGCTCAGTTCGGTGTATGCGTAATCAACGTCTTcc < 1:383352/100‑1 (MQ=255) cccGGCTTGTAAACACCGTGTACGTTACCGAAGGACGCTGCGATGGTGAAACGCGGGCTGATTTTGCTCAGTTCGGTGTATGCGTAATCAACGTCTTCCg > 2:272969/1‑100 (MQ=255) cccGGCTTGTAAACACCGTGTACGTTACCGAAGGACGCTGCGATGGTGAAACGCGGGCTGATCTTGCTCAGTTCGGTGTATGCGTAATCAACGTCTTCCg > 2:64871/1‑100 (MQ=255) cccGGCTTGTAAACACCGTGTACGTTACCGAAGGACGCTGCGATGGTGAAACGCGGGCTGATCTTGCTCAGTTCGGTGTATGCGTAATCAACGTCTTCCg > 1:536306/1‑100 (MQ=255) cccGGCTTGTAAACACCGTGTACGTTACCGAAGGACGCTGCGATGGTGAAACGCGGGCTGATCTTGCTCAGTTCGGTGTATGCGTAATCAACGTCTTCCg > 2:237654/1‑100 (MQ=255) cccGGCTTGTAAACACCGTGTACGTTACCGAAGGACGCTGCGATGGTGAAACGCGGGCTGATCTTGCTCAGTTCGGTGTATGCGTAATCAACGTCTTCCg > 1:1031252/1‑100 (MQ=255) ccGGCTTGTAAACACCGTGTACGTTACCGAAGGACGCTGCGATGGTGAAACGCGGGCTGATCTTGCTCAGTTCGGTGTATGCGTAATCAACGTCTTCAgg > 1:107615/1‑100 (MQ=255) cGGCTTGTAAACACCGTGTACGTTACCGAAGGACGCTGCGATGGTGAAACGCGGGCTGATCTTGCTCAGTTCGGTGTATGCGTAATCAACGTCTTCCGGc > 2:1121611/1‑100 (MQ=255) cGGCTTGTAAACACCGTGTACGTTACCGAAGGACGCTGCGATGGTGAAACGCGGGCTGATCTTGCTCAGTTCGGTGTATGCGTAATCAACGTCTTCCGGc < 1:1011859/100‑1 (MQ=255) gCTTGTAAACACCGTGTACGTTACCGAAGGACGCTGCGATGGTGAAACGCGGGCTGATCTTGCTCAGTTCGGTGTATGCGTAATCAACGTCTTCCGGCTg < 1:693795/100‑1 (MQ=255) gCTTGTAAACACCGTGTACGTTACCGAAGGACGCTGCGATGGTGAAACGCGGGCTGATCTTGCTCAGTTCGGTGTATGCGTAATCAACGTCTTCCGGCTg < 2:14928/100‑1 (MQ=255) ttGTAAACACCGTGTACGTTACCGAAGGACGCTGCGATGGTGAAACGCGGGCTGATCTTGCTCAGTTCGGTGTATGCGTAATCAACGTCTTCCGGCTggg < 2:216502/100‑1 (MQ=255) tGTAAACACCGTGTACGTTACCGAAGGACGCTGCGATGGTGAAACGCGGGCTGATCTTGCTCAGTTCGGTGTATGCGTAATCAACGTCTTCCGGCTGGgt > 1:113481/1‑100 (MQ=255) acacCGTGTACGTTACCGAAGGACGCTGCGATGGTGAAACGCGGGCTGATCTTGCTCAGTTCGGTGTATGCGTAATCAACGTCTTCCGGCTGGGTGTACa > 1:1190188/1‑100 (MQ=255) acCGTGTACGTTACCGAAGGACGCTGCGATGGTGAAACGCGGGCTGATCTTGCTCAGTTCGGTGTATGCGTAATCAACGTCTTCCGGCTGGGTGTACAGt < 2:493000/100‑1 (MQ=255) acCGTGTACGTTACCGAAGGACGCTGCGATGGTGAAACGCGGGCTGATCTTGCTCAGTTCGGTGTATGCGTAATCAACGTCTTCCGGCTGGGTGTACAGt < 2:493026/100‑1 (MQ=255) ccGTGTACGTTACCGAAGGACGCTGCGATGGTGAAACGCGGGCTGATCTTGCTCAGTTCGGTGTATGCGTAATCAACGTCTTCCGGCTGGGTGTACAGTg < 2:174064/100‑1 (MQ=255) cgatctcGTTACCGAAGGACGCTGCGATGGTGAAACGCGGGCTGATCTTGCTCAGTTCGGTGTATGCGTAATCAACGTCTTCCGGCTGGGTGTACAGTGc < 1:975804/94‑1 (MQ=255) tgtACGTTACCGAAGGACGCTGCGATGGTGAAACGCGGGCTGATCTTGCTCAGTTCGGTGTATGCGTAATCAACGTCTTCCGGCTGGGTGTACAGTGCAg < 1:1015502/100‑1 (MQ=255) aCGTTACCGAAGGACGCTGCGATGGTGAAACGCGGGCTGATCTTGCTCAGTTCGGTGTATGCGTAATCAACGTCTTCCGGCTGGGTGTACAGTGCAGAAg > 1:961032/1‑100 (MQ=255) cGTTACCGAAGGACGCTGCGATGGTGAAACGCGGGCTGATCTTGCTCAGTTCGGTGTATGCGTAATCAACGTCTTCCGGCTGGGTGTACAGTGCAGatcg > 2:975796/1‑97 (MQ=255) ccGAAGGACGCTGCGATGGTGAAACGCGGGCTGATCTTGCTCAGTTCGGTGTATGCGTAATCAACGTCTTCCGGCTGGGTGTACAGTGCAGatcggaaga > 2:268211/1‑92 (MQ=255) ccGAAGGACGCTGCGATGGTGAAACGCGGGCTGATCTTGCTCAGTTCGGTGTATGCGTAATCAACGTCTTCCGGCTGGGTGTACAGTGCAGAAGCGTCCa < 2:1021016/100‑1 (MQ=255) ccGAAGGACGCTGCGATGGTGAAACGCGGGCTGATCTTGCTCAGTTCGGTGTATGCGTAATCAACGTCTTCCGGCTGGGTGTACAGTGCAGAAGCGTCCa > 1:632913/1‑100 (MQ=255) ccGAAGGACGCTGCGATGGTGAAACGCGGGCTGATCTTGCTCAGTTCGGTGTATGCGTAATCAACGTCTTCCGGCTGGGTGTACAGTGCAGAAGCGTCCa > 2:82790/1‑100 (MQ=255) gAAGGACGCTGCGATGGTGAAACGCGGGCTGATCTTGCTCAGTTCGGTGTATGCGTAATCAACGTCTTCCGGCTGGGTGTACAGTGCAGAAGCGTCCAtg > 1:1234622/1‑100 (MQ=255) gAAGGACGCTGCGATGGTGAAACGCGGGCTGATCTTGCTCAGTTCGGTGTATGCGTAATCAACGTCTTCCGGCTGGGTGTACAGTGCAGAAGCGTCCAtg > 1:389320/1‑100 (MQ=255) cGCTGCGATGGTGAAACGCGGGCTGATCTTGCTCAGTTCGGTGTATGCGTAATCAACGTCTTCCGACTGGGTGTACAGTGCAGAAGCGTCCATGTGGCtg > 1:812734/1‑100 (MQ=255) cTGCGATGGTGCCACGCGGGCTGATCTTGATGCGTTAGGTGTATGCGTCCTCAGCGTATTCCGGCTGGGTGTACAGTGCAGAAGCGTCCATGTGGCtgt < 2:107613/99‑1 (MQ=255) cTGCGATGGTGAAACGCGGGCTGATCTTGCTCAGTTCGGTGTATGCGTAATCAACGTCTTCCGGCTGGGTGTACAGTGCAGAAGCGTCCATGTGGCtgtt > 1:982134/1‑100 (MQ=255) tGCGATGGTGAAACGCGGGCTGATCTTGCTCAGTTCGGTGTATGCGTAATCAACGTCTTCCGGCTGGGTGTACAGTGCAGAAGCGTCCATGTGGCtgttg < 1:840056/100‑1 (MQ=255) tGCGATGGTGAAACGCGGGCTGATCTTACTCAGTTCGGTGTATGCGTAATCAACGTCTTCCGGCTGGGTGTACAGTGCAGAAGCGTCCATGTGGCtgttg < 1:344639/100‑1 (MQ=255) cGATGGTGAAACGCGGGCTGATCTTGCTCAGTTCGGTGTATGCGTAATCAACGTCTTCCGGCTGGGTGTACAGTGCAGAAGCGTCCATGTGGCTGTTGTc > 2:1064460/1‑100 (MQ=255) tGGTGAAACGCGGGCTGATCTTGCTCAGTTCGGTGTATGCGTAATCAACGTCTTCCGGCTGGGTGTACAGTGCAGAAGCGTCCATGTGGCTGTTGTCCAc > 1:587033/1‑100 (MQ=255) tGGTGAAACGCGGGCTGATCTTGCTCAGTTCGGTGTATGCGTAATCAACGTCTTCCGGCTGGGTGTACAGTGCAGAAGCGTCCATGTGGCTGTTGTCCAc > 1:587659/1‑100 (MQ=255) ggTGAAACGCGGGCTGATCTTGCTCAGTTCGGTGTATGCGTAATCAACGTCTTCCGGCTGGGTGTACAGTGCAGAAGCGTCCATGTGGCTGTTGTCCACg > 1:680633/1‑100 (MQ=255) aaCGCGGGCTGATCTTGCTCAGTTCGGTGTATGCGTAATCAACGTCTTCCGGCTGCGTGTACAGTGCAGAAGCGTCCATGTGGCTGTTGTCCACGCCGtc < 2:362071/100‑1 (MQ=255) aCGCGGGCTGATCTTGCTCAGTTCGGTGTATGCGTAATCAACGTCTTCCGGCTGGGTGTACAGTGCAGAAGCGTCCATGTGGCTGTTGTCCACGCCGtct < 2:548204/100‑1 (MQ=255) cgcgGGCTGATCTTGCTCAGTTCGGTGTATGCGTAATCAACGTCTTCCGGCTGGGTGTACAGTGCAGAAGCGTCCATGTGGCTGTTGTCCACGCCGtctt < 1:628075/100‑1 (MQ=255) cgGGCTGATCTTGCTCAGTTCGGTGTATGCGTAATCAACGTCTTCCGGCTGGGTGTACAGTGCAGAAGCGTCCATGTGGCTGTTGTCCACGCCGtcttct < 1:223252/100‑1 (MQ=255) gggCTGATCTTGCTCAGTTCGGTGTATGCGTAATCAACGTCTTCCGGCTGGGTGTACAGTGCAGAAGCGTCCATGTGGCTGTTGTCCACGCCGTcttctt < 1:689891/100‑1 (MQ=255) ggCTGATCTTGCTCAGTTCGGTGTATGCGTAATCAACGTCTTCCGGCTGGGTGTACAGTGCAGAAGCGTCCATGTGGCTGTTGTCCACGCCGTCttcttc < 2:5702/100‑1 (MQ=255) gATCTTGCTCAGTTCGGTGTATGCGTAATCAACGTCTTCCGGCTGGGTGTACAGTGCAGAAGCGTCCATGTGGCTGTTGTCCACGCCGTCTTCTTcacca > 1:343482/1‑100 (MQ=255) | ACGCAGGATGGTCGGAGTCAGAACCACGTTACCCGGCTTGTAAACACCGTGTACGTTACCGAAGGACGCTGCGATGGTGAAACGCGGGCTGATTTTGCTCAGTTCGGTGTATGCGTAATCAACGTCTTCCGGCTGGGTGTACAGTGCAGAAGCGTCCATGTGGCTGTTGTCCACGCCGTCTTCTTCACCA > NC_000913/3070516‑3070705 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |