| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 308,054 | (C)7→6 | 100% | coding (1279/2526 nt) | ecpC ← | ECP production outer membrane protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 308,048 | 0 | C | . | 98.5% | 617.2 / 0.9 | 135 | coding (1285/2526 nt) | ecpC | ECP production outer membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/1); new base . (56/77); total (57/78) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 154 total aligned reads displayed.
CAGCGAACTAAAGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGCCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACTCAATGAGCCGG > NC_000913/307950‑308143 | caGCGAACTAAAGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGcc < 2:1161306/100‑1 (MQ=255)caGCGAACTAAAGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGcc > 2:1076514/1‑100 (MQ=255) ggCGAACTAAAGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGccc < 1:3544376/99‑1 (MQ=255) gCGAACTAAAGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGcccc > 2:1319600/1‑100 (MQ=255) gCGAACTAAAGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGcccc < 1:1793486/100‑1 (MQ=255) gCGAACTAAAGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGcccc > 1:3620272/1‑100 (MQ=255) aaCTAAAGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGcccccca < 2:3336287/100‑2 (MQ=255) aCTAAAGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGccccccaa > 1:3133198/1‑98 (MQ=255) tAACGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTACCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCAAGCATAGTTTGCAGGCTAACGTTGATCGccccccaag > 1:718172/1‑96 (MQ=255) tAAAGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTGACGTTGATCGccccccaagc < 1:2324404/100‑5 (MQ=255) aaaGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGccccccaagc < 1:1294888/99‑5 (MQ=255) aaaGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCg > 2:3010576/1‑100 (MQ=255) aaaGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCg < 2:2321528/100‑1 (MQ=255) aaaGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCg > 2:1761965/1‑100 (MQ=255) aaaGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCg > 2:3554582/1‑100 (MQ=255) aaaGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCg > 1:1728802/1‑100 (MQ=255) aGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGc > 2:892973/1‑100 (MQ=255) aGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGc < 2:1267858/100‑1 (MQ=255) gCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATAG‑CCCCCCAAGCGGCa > 2:3750517/1‑100 (MQ=255) cTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGc > 2:3181437/1‑100 (MQ=255) tCCCGGTAGAGTTGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGATCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCg < 1:2715607/100‑1 (MQ=255) cccGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGt > 2:3287565/1‑100 (MQ=255) gTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAgc < 1:1500351/100‑2 (MQ=255) agagTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACg < 2:1695505/100‑1 (MQ=255) gttGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCGCCGTGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGGTCACGTTGATCG‑CCTCCCAAGCGGCAGCGTCAGAc > 1:2847355/3‑97 (MQ=255) agTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACggg < 2:1604333/100‑1 (MQ=255) gcTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTcac < 1:2833845/100‑1 (MQ=255) cTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGCCACTGGCCGGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCAGCAGCGTCAGACGGGTTTcacc < 1:3395365/100‑1 (MQ=255) tGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTcaccc < 2:1364606/100‑1 (MQ=255) gATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCAGCAGCGTCAGACGGGTTTcacc < 1:3756754/98‑1 (MQ=255) tgctgcCGATGCTTGGCCATGAGCTTTCACTGGCCAGCAGATGTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTcacccacc < 1:3104727/100‑1 (MQ=255) gctgcCGATGCTGCTCCATGAGCGGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCg < 2:817832/100‑1 (MQ=255) ctgcCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGc > 2:2380428/1‑100 (MQ=255) ctgcCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGc > 2:2743436/1‑100 (MQ=255) tgcCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGcc < 2:15239/100‑1 (MQ=255) tgcCGATGCTCCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTCCAGGTTCACGTCGATCG‑CCCCCCACACAGCATCGGCAGACGGGTGTCACCCACCGcc > 1:551402/1‑100 (MQ=255) gcCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCt > 2:32392/1‑100 (MQ=255) ccGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTg > 2:530481/1‑100 (MQ=255) cGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGa < 2:2818528/100‑1 (MQ=255) cGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGa > 2:681187/1‑100 (MQ=255) gATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGAt < 2:1986133/100‑1 (MQ=255) aTGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGAtt < 2:642478/100‑1 (MQ=255) tgctgcTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTa < 2:3602462/100‑1 (MQ=255) tgctgcTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTa < 1:1231879/100‑1 (MQ=255) gctgctCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTAt > 2:3101088/1‑100 (MQ=255) tgctCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATcn < 1:720789/100‑2 (MQ=255) tgctCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCg < 2:1371115/100‑1 (MQ=255) tgctCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCg < 1:143660/100‑1 (MQ=255) tgctCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCg > 2:2617885/1‑100 (MQ=255) tgctCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCg < 2:1399313/100‑1 (MQ=255) tgctCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCg < 2:1012101/100‑1 (MQ=255) gctCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGATAATCG‑CCCACCAAGCGACAGCGTGAGACGGGTTTCACACAACgg > 1:1541745/1‑88 (MQ=255) ctCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTa < 1:2140486/100‑1 (MQ=255) tCCATTAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAGCGTTGAGCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTGAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCg > 1:677136/1‑97 (MQ=255) ccATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATc < 2:2715014/100‑1 (MQ=255) cATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATcc < 2:1000265/100‑1 (MQ=255) cATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATcc < 2:2120536/100‑1 (MQ=255) aTGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCa < 2:191743/100‑1 (MQ=255) tGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCat > 1:1647777/1‑100 (MQ=255) aGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCatat > 2:2189193/1‑100 (MQ=255) gCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATc < 1:105324/100‑1 (MQ=255) gCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATc > 2:454108/1‑100 (MQ=255) cTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATcc > 2:3232786/1‑100 (MQ=255) gTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCg > 1:3313236/1‑100 (MQ=255) gTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCg < 2:1593747/100‑1 (MQ=255) gTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCg > 2:2630083/1‑100 (MQ=255) gTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCg > 2:1195186/1‑100 (MQ=255) gTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCg > 2:54616/1‑100 (MQ=255) tCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGt < 1:1993191/100‑1 (MQ=255) cTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTgc > 2:2694626/1‑100 (MQ=255) cTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTgc > 2:3140067/1‑100 (MQ=255) cTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTgc > 2:1170741/1‑100 (MQ=255) cTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTgc < 2:1551024/100‑1 (MQ=255) ttgttattatatTTTGTAGTTTATCGTTGATTG‑CTTTCCTAGTGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCTTGATTATCGTATCCATATCCCGTTgct < 1:1059412/92‑2 (MQ=255) tGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTgcc < 2:2161452/100‑1 (MQ=255) ggCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTgccg > 2:2080326/1‑100 (MQ=255) gCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTgccgc < 2:750227/100‑1 (MQ=255) gCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTgccgc > 2:1342176/1‑100 (MQ=255) ccAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTgccgcc > 2:2427522/1‑100 (MQ=255) ccAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTgccgcc > 2:3358151/1‑100 (MQ=255) ccAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTgccgcc > 2:329542/1‑100 (MQ=255) cAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGccc < 1:1544205/100‑1 (MQ=255) cAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGccc < 1:1741280/100‑1 (MQ=255) cATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGc < 2:2631622/100‑1 (MQ=255) tttGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGc < 2:2590199/100‑1 (MQ=255) tttGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGc < 1:1851697/100‑1 (MQ=255) ttGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCg < 2:2815477/100‑1 (MQ=255) tggCAGGTTAACGGTGATCG‑CCCCCCGAGCGGCAGACTCAGACGGGTTTCACCCAGCGCCGGATTATCGGATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGct < 1:1086756/98‑2 (MQ=255) gCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCg < 1:3743318/98‑1 (MQ=255) cAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTAc < 2:3620300/100‑1 (MQ=255) aGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACt < 1:1076509/100‑1 (MQ=255) ggTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACTc > 2:1580547/1‑100 (MQ=255) ggTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATACCGTTGCCGCCCAGCTAGGCGTa > 1:1244620/1‑97 (MQ=255) ggTTAACGTTGATCG‑ACCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCACGTTGCCGACCAGCTAAGCGTACt > 1:2766520/1‑99 (MQ=255) gTTACCGTTGCTCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACTCa < 1:594125/100‑1 (MQ=255) tAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACTCAAt < 1:129031/100‑1 (MQ=255) aaCGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACTCAATg < 1:3598457/100‑1 (MQ=255) aaCGTTGATCG‑CCCCACAAGAGGCCGCGTCAGCCGGGTTTTACCCGCCGCCTAATTATCGTAGCCATATCGCTTTGCCGCCCATCTAAGCGTACTCAAt > 1:3555870/1‑99 (MQ=255) aaCGTTGATC‑CCCCCCCAAGCGACAGCGTCATACGGGCTTCACCCACTGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACTCAATg < 1:2563941/100‑1 (MQ=255) ttGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACTCAATGAGcc < 1:248347/100‑1 (MQ=255) | CAGCGAACTAAAGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGCCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACTCAATGAGCCGG > NC_000913/307950‑308143 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |