| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,767,507:1 | (C)7→8 | 100% | intergenic (+152/‑203) | rnlB → / → yfjP | CP4‑57 prophage; uncharacterized protein/CP4‑57 prophage; 50S ribosome‑binding GTPase family protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,767,500 | 1 | . | C | 82.0% | 332.0 / 74.5 | 122 | intergenic (+145/‑210) | rnlB/yfjP | CP4‑57 prophage; uncharacterized protein/CP4‑57 prophage; 50S ribosome‑binding GTPase family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (12/10); new base C (36/62); total (49/73) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.51e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.96e-01 | |||||||||||
Only 100 of 132 total aligned reads displayed.
ATGATATTAACTTGTCCAATATGATCAAATAGCATTAACCCCCCCTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAA‑TT‑T‑‑C‑C‑C‑C‑C‑C‑CTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTAAATGGTGCTGTGAGTTCAGAAAGATTCT > NC_000913/2767401‑2767594 | aTGATATTAACTTGTCCAATATGATCAAATAGCATTAACCCCCCCTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAA‑tt‑t < 2:707708/100‑1 (MQ=255) tGATATTAACTTGTCCAATATGATCAAATAGCATTAACCCCCCCTCAGTAGGTCCTGCATAGGGAAAACGTTTTCCCCTATGCACCCACGACTAAA‑tt‑t > 2:2830619/1‑99 (MQ=255) atatTAACTTGTCCAATATGATCAAATAGCATTAACCCCCCCTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAA‑TT‑T‑‑c‑c < 1:3055673/99‑1 (MQ=255) tatTAACTTGTCCAATATGATCAAATAGCATTAATCCCCCCTCACAACATCCTGCATAGGGACCACGTTTTCCCCCGTGCACCCACCACCAAA‑TT‑T‑‑c‑c‑c‑c > 1:1396344/1‑100 (MQ=255) aaCTTGTCCAATATGATCAAATAGCATTAACCCCCCCTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAA‑TT‑T‑‑c‑c‑c‑c‑c‑c‑cc < 2:3530946/100‑2 (MQ=255) aaCTTGTCCAATATGATCAAATAGCATTAACCCCCCCTCACAACGTCCTGCATAAGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAA‑TT‑T‑‑c‑c‑c‑c‑c‑c‑cc < 1:2205826/100‑2 (MQ=255) cTTGTCCAATATGATCAAATAGCATTAACACCCCCTCATAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTGTCCCCTGTACACCCACGTCTAAA‑TT‑T‑‑c‑c‑c‑c‑c‑c > 1:1709605/1‑96 (MQ=255) ttGTCCAATATGATCAAATAGCATTAACCCCCCCTCACAACGTGCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTCCACCCACGACTAAA‑TT‑T‑‑C‑C‑C‑CTC‑C‑Cttt > 1:2252328/1‑100 (MQ=255) tGTCCAATATGATCAAATAGCATTAACCCCCCCTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAA‑TT‑T‑‑C‑C‑C‑C‑C‑C‑Ccttta < 2:2214556/100‑3 (MQ=255) gTCCAATATGATCAAATAGCATTAACCCCCCCTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAA‑TT‑TC‑C‑C‑C‑C‑C‑C‑CTTTaa < 1:3453443/100‑1 (MQ=255) gTCCAATATGATCAAATAGCATTAACCCCCCCTCACAACATCATACATAGGGAACAAGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAA‑TT‑T‑‑C‑C‑C‑C‑C‑C‑CCTTtaa > 1:2295134/1‑100 (MQ=255) gTCCAATATGATCAAATAGCATTAACAACCCCCCAAAACTTCCTGCATAGGCGCCACGTTATCCCCTGTGCACCCACGAATAAA‑TT‑T‑‑g‑c‑cacaccgttaa > 2:1538886/1‑90 (MQ=255) ccACTATGATCAAGTAGCAGTACCCCCCCCTCACAACGTCCGGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACGAAA‑TT‑T‑‑C‑C‑C‑C‑C‑C‑Cctt < 1:1617198/95‑1 (MQ=255) ccAATATGATCAAATAGCATTAACCCCCCCTCGCAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAA‑TT‑TC‑C‑C‑C‑C‑C‑C‑CTTTAAAc < 1:128813/100‑1 (MQ=255) ccAATATGATCAAATAGCATTAACCCCCCCTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAA‑TT‑TC‑C‑C‑C‑C‑C‑C‑CTTTAAAc < 2:2710296/100‑1 (MQ=255) ccAATATGATCAAATAGCATTAACCCCCCCTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAA‑TT‑TC‑C‑C‑C‑C‑C‑C‑CTTTAAAc < 2:791270/100‑1 (MQ=255) ccAATATGATCAAATAGCATTAACCCCCCCTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAA‑TT‑TC‑C‑C‑C‑C‑C‑C‑CTTTAAAc < 1:2314188/100‑1 (MQ=255) atatGATCAAATAGCATTAACCCCCCCTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAA‑TT‑TC‑C‑C‑C‑C‑C‑C‑CTTTAAACTtc < 1:3385411/100‑1 (MQ=255) atatGATCAAATAGCATTAACCCCCCCTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAA‑TT‑TC‑C‑C‑C‑C‑C‑C‑CTTTAAACTtc < 1:3020289/100‑1 (MQ=255) atatGATCAAATAGCATTAACCCCCCCTCACAACGGCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAA‑TT‑TC‑C‑C‑C‑C‑C‑C‑CTTTAAACTtc < 2:1046181/100‑1 (MQ=255) tatGATCAAATAGCATTAACCCCCCCTCACAACGTCCTGCATAGGTAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAA‑TT‑TCCC‑C‑C‑C‑C‑C‑CTTTAAACTtc < 1:1957688/100‑1 (MQ=255) atGATCAAATAGCATTAACCACCCCTAGAAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTATCCACTGTGCACCCAGGACTCCA‑TT‑T‑‑C‑C‑C‑C‑CAC‑CATTAAACTtcac > 2:2016773/1‑98 (MQ=255) gATCAAATAGCATTACCCCCCCCTCACAACGGCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAA‑TT‑TC‑C‑C‑C‑C‑C‑C‑CTTTAAACTTCTCa < 1:3273028/99‑1 (MQ=255) gATCAAATAGCATTAACCCCCCCTCACAACGTCCTGCATAAGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAA‑TT‑TC‑C‑C‑C‑C‑C‑C‑CCTTAAACTTCTCaa > 1:2241930/1‑100 (MQ=255) tCAAATAGCATTACCCCCCCCTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAA‑TT‑TC‑C‑C‑C‑C‑C‑C‑CTTTAAACTTCTCaata < 1:323431/100‑1 (MQ=255) aaTAGCATTAACGCCCCCTCACCACGTCCTACAGCGGGCACACGTTTTCCCCTGTGGACCCCCGAATAAA‑TT‑TG‑C‑T‑C‑C‑C‑C‑CTTTAAACTGCTCaataa > 1:2501418/1‑98 (MQ=255) aTAGCATTAACCCCTACTGCCAACATCCTGCATATGGTACACGTTTACCCCTGTTCACCCACGACTCAA‑CT‑T‑‑CTC‑A‑C‑C‑C‑CGTTAACATCTTCAATAATGt > 1:1118602/1‑100 (MQ=255) tAGCGTTAACCCCCCCTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAA‑TT‑TC‑C‑C‑C‑C‑C‑C‑CTTTAAACTTCTCAATAATGTc < 1:3079672/100‑1 (MQ=255) aGCATTAACCCCCCCTCACAACGTCCTACAAAAGAAACACATTATCCACAGAGCACACACTACTAAA‑TTCC‑‑C‑C‑C‑C‑C‑C‑CTTTAACCATCTCAATAATGTCa < 1:368839/100‑1 (MQ=255) gCATTAA‑CCCCCCTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAA‑TT‑TC‑C‑C‑C‑C‑C‑C‑CTTTAAACTTCTCAATAATGTCAcc < 2:849950/100‑1 (MQ=255) cATTCACCCCCCCTCACAACGTCCTGCATAGAGACCACGTTCTCCCCTGTGCACCCACGACTAAA‑TT‑T‑‑C‑CAC‑C‑C‑C‑CTTTAAACTTCTCAATAATGTCAcc < 1:3599632/100‑1 (MQ=255) tAACCCCCCCTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAA‑TT‑TC‑C‑C‑C‑C‑C‑C‑CTTTCAACTTCTAAATAATGTCACCa > 1:609595/1‑98 (MQ=255) tAACCCCCCCTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAA‑TT‑TC‑C‑C‑C‑C‑C‑C‑CTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAAt < 2:3194572/100‑1 (MQ=255) ccccccTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAA‑TT‑TC‑C‑C‑C‑C‑C‑C‑CTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTc < 1:3624617/100‑1 (MQ=255) ccccccTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAA‑TT‑T‑‑C‑C‑C‑CAC‑C‑CTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCACTtctc > 2:3065384/1‑100 (MQ=255) cccccTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAA‑TT‑TC‑C‑C‑C‑C‑C‑C‑CTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCt > 2:2281298/1‑100 (MQ=255) cccccTCACAAAGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAA‑TT‑T‑‑C‑C‑C‑CAC‑C‑CCTTAAACTTCCCAATAATTTCACCAATTTTCt > 2:3219048/1‑100 (MQ=255) ccccTCACAACTTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAA‑TT‑TC‑C‑C‑C‑C‑C‑C‑CTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTg < 1:42172/100‑1 (MQ=255) ccccTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAA‑TT‑TC‑C‑C‑C‑C‑C‑C‑CTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTg > 1:102487/1‑100 (MQ=255) ccccTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAA‑TT‑TC‑C‑C‑C‑C‑C‑C‑CTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTg < 1:3567380/100‑1 (MQ=255) cccTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATTT‑T‑‑C‑C‑C‑C‑C‑C‑CTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTg < 1:3202756/99‑1 (MQ=255) cccTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAA‑TT‑TC‑C‑C‑C‑C‑C‑C‑CTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTgg > 2:1777397/1‑100 (MQ=255) cccTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAA‑TT‑TC‑C‑C‑C‑C‑C‑C‑CTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTgg < 1:3349095/100‑1 (MQ=255) cccTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAA‑TT‑TC‑C‑C‑C‑C‑C‑C‑CTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTgg < 2:52600/100‑1 (MQ=255) cccTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAA‑TT‑TC‑C‑C‑C‑C‑C‑C‑CTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTgg < 2:2943259/100‑1 (MQ=255) cccTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAA‑TT‑TC‑C‑C‑C‑C‑C‑C‑CTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTgg < 2:3304350/100‑1 (MQ=255) ccTCACGACATCCTGCATAAGGAACACGTTTTACCCTGTGCACCCACGACTAAA‑GT‑T‑‑C‑C‑CTC‑C‑C‑CTTTAAACTTCGCAATAATGTCACCAATTTTCTgg < 1:741227/99‑1 (MQ=255) ccTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAA‑TT‑TC‑C‑C‑C‑C‑C‑C‑CTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGa < 1:2851426/100‑1 (MQ=255) ccTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAA‑TT‑TC‑C‑C‑C‑C‑C‑C‑CTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGa < 2:1448789/100‑1 (MQ=255) ccTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAA‑TT‑TC‑C‑C‑C‑C‑C‑C‑CTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGa < 2:508468/100‑1 (MQ=255) tCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAA‑TT‑T‑‑C‑C‑C‑C‑C‑C‑CTTTAAACTTCTCAATAATGTCCCCAATTTTCTGGAAAt > 2:498835/1‑100 (MQ=255) aCGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAA‑TT‑TC‑C‑C‑C‑C‑C‑C‑CTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTa < 1:202439/100‑1 (MQ=255) cGTCCTGCATATGTAACACGTTGTCCCCAGTGCACCCACGACTAAA‑TT‑TC‑C‑C‑C‑C‑C‑C‑CTTTAACCTTCGCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTat < 1:3739245/100‑1 (MQ=255) cGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAA‑TT‑TC‑C‑C‑C‑C‑C‑C‑CTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTa < 1:2730422/99‑1 (MQ=255) gTCGTGCATAGGTAACACGTTTTCCCCCGTGCACCTACGCCTAAA‑TT‑TC‑C‑C‑C‑C‑C‑C‑CTTTAAGCGTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTatg < 2:3612075/100‑1 (MQ=255) gTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAA‑TT‑TC‑C‑C‑C‑C‑C‑C‑CTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTatg < 1:2885695/100‑1 (MQ=255) gTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAA‑TT‑TC‑C‑C‑C‑C‑C‑C‑CTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTatg > 2:2978463/1‑100 (MQ=255) gTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAA‑TT‑TC‑C‑C‑C‑C‑C‑C‑CTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTatg > 1:2213755/1‑100 (MQ=255) tCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAA‑TT‑TC‑C‑C‑C‑C‑C‑C‑CTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTatga < 1:202014/100‑1 (MQ=255) ccTGCATAGGGAACACCTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAA‑TT‑TC‑C‑C‑C‑C‑C‑C‑CTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTatgat < 1:1566646/100‑1 (MQ=255) tGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAA‑TT‑TC‑C‑C‑C‑C‑C‑C‑CTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGc > 1:1884827/1‑100 (MQ=255) gCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAA‑TT‑TC‑C‑C‑C‑C‑C‑C‑CTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGcc < 2:1274890/100‑1 (MQ=255) cATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAA‑TT‑TC‑C‑C‑C‑C‑C‑C‑CTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCt > 1:2775186/1‑100 (MQ=255) naGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAA‑TT‑TC‑C‑C‑C‑C‑C‑C‑CTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCttt > 1:981812/2‑100 (MQ=255) aGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAA‑TT‑TC‑C‑C‑C‑C‑C‑C‑CTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTc > 1:2147523/1‑100 (MQ=255) ggAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAA‑TT‑TC‑C‑C‑C‑C‑C‑C‑CTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTccc < 2:3796583/100‑1 (MQ=255) ggAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAA‑TT‑TC‑C‑C‑C‑C‑C‑C‑CTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTccc < 2:3690905/100‑1 (MQ=255) ggAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAA‑TT‑T‑‑C‑C‑C‑C‑C‑C‑CTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCg > 2:3785988/1‑100 (MQ=255) taaCACGTTTTTCCCTGTGCACCCACGACTAAA‑TTCC‑‑C‑C‑C‑C‑C‑C‑CTTTAAACTCCCCCATAATGTCACCACTTTTCTGGTAATCCTAAGATGCCTTTCCCg < 1:2045227/99‑1 (MQ=255) gAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAA‑TT‑TC‑C‑C‑C‑C‑C‑C‑CTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCg > 1:1936763/1‑100 (MQ=255) aaCACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAA‑TT‑TC‑C‑C‑C‑C‑C‑C‑CTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCg < 1:3527572/99‑1 (MQ=255) acacGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAA‑TT‑TA‑C‑C‑C‑C‑C‑C‑CTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGt < 1:1961794/100‑1 (MQ=255) cacGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAA‑TT‑TC‑C‑C‑C‑C‑C‑C‑CTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTa < 2:2347726/100‑1 (MQ=255) cGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAA‑TT‑TC‑C‑C‑C‑C‑C‑C‑CTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTaaa < 2:1945113/100‑1 (MQ=255) cGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAA‑TT‑TC‑C‑C‑C‑C‑C‑C‑CTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTaaa > 1:3695051/1‑100 (MQ=255) gTTTTCCGCTGTGCAAACACGACTAAA‑TT‑T‑‑C‑C‑C‑C‑C‑CTCTTTCACCATCCCCATGACGACCCCAATTATCAGGAAATCCTATGCTGCCTTGTCCGGTAAAt > 1:3540854/1‑100 (MQ=255) gTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAA‑TT‑TC‑C‑C‑C‑C‑C‑C‑CTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTAAAt < 2:3713264/100‑1 (MQ=255) ttttCCCCTGTGCACCCACGACTAAA‑TT‑TC‑C‑C‑C‑C‑C‑C‑CTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTAAATg > 2:2006182/1‑100 (MQ=255) ttCCCCTGTGCACCCACGACTAAA‑TT‑T‑‑C‑C‑C‑C‑C‑CTCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTGCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTAAATGGt < 1:1786646/100‑1 (MQ=255) ccccTGTGCACCCACGACTAAA‑TT‑TC‑C‑C‑C‑C‑C‑C‑CTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTAAATGGTGc > 1:2141786/1‑100 (MQ=255) ccccTGTGCACCCACGACTAAA‑TT‑TC‑C‑C‑C‑C‑C‑C‑CTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTAAATGGTGc > 1:2762190/1‑100 (MQ=255) ccccTGTGCACCCACGACTAAA‑TT‑TC‑C‑C‑C‑C‑C‑C‑CGTTAAACGTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATTCCTTTCCCGGTAAATGGt > 1:3731668/1‑98 (MQ=255) ccTGTGCACCCACGACTAAA‑TT‑TC‑C‑C‑C‑C‑C‑C‑CTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTAAATGGTGCtg < 2:2480901/100‑1 (MQ=255) gCACCCACGACTAAA‑TT‑TC‑C‑C‑C‑C‑C‑C‑CTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTAAATGGTGCTGTGAGt < 1:2154973/100‑1 (MQ=255) gCACCCACGACTAAA‑TT‑TC‑C‑C‑C‑C‑C‑C‑CTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTAAATGGTGCTGTGAGt < 2:1158747/100‑1 (MQ=255) aCCCACGACTAAA‑TT‑TC‑C‑C‑C‑C‑C‑C‑CTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTAAATGGTGCTGTGAGTTc < 1:1141070/100‑1 (MQ=255) aCCCACGACTAAA‑TT‑TC‑C‑C‑C‑C‑C‑C‑CTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAAGCCTATGATGCCTTTCCCTGTAAATGGTGCTGTGAGTTc < 1:1724886/100‑1 (MQ=255) cccACGACTAAA‑TT‑TC‑C‑C‑C‑C‑C‑C‑CTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTAAATGGTGCTGTGAGTTCa > 1:1528879/1‑100 (MQ=255) cccACGACTAAA‑TT‑TC‑C‑C‑C‑C‑C‑C‑CTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTAAATGGTGCTGTGAGTTCa < 2:161638/100‑1 (MQ=255) ccACGACTAAA‑TT‑T‑‑C‑C‑C‑CTC‑C‑CTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTAAATGGTGCTGTGAGTTCAg < 1:1663709/100‑1 (MQ=255) cGACTAAA‑TT‑TC‑C‑C‑C‑C‑C‑C‑CTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTAAATGGTGCTGTGAGTTCAGaaa < 2:1459281/100‑1 (MQ=255) cGACTAAA‑TT‑TC‑C‑C‑C‑C‑C‑C‑CTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTAAATGGTGCTGTGAGTTCAGaaa < 2:141915/100‑1 (MQ=255) cGACTAAA‑TT‑TC‑C‑C‑C‑C‑C‑C‑CTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTAAATGGTGCTGTGAGTTCAGaaa > 1:2924537/1‑100 (MQ=255) gACTAAA‑TT‑TC‑C‑C‑C‑C‑C‑C‑CTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAAGTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTAAATGGTGCTGTGAGTTCAGAAAg < 1:1788846/100‑1 (MQ=255) cTAAA‑TT‑TC‑C‑C‑C‑C‑C‑C‑CTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTAAATGGTGCTGTGAGTTCAGAAAGAt > 2:230750/1‑100 (MQ=255) tAAA‑TT‑TC‑C‑C‑C‑C‑C‑C‑CTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTAAATGGTGCTGTGAGTTCAGAAAGAtt > 1:3205323/1‑100 (MQ=255) aaa‑TT‑TC‑C‑C‑C‑C‑C‑C‑CTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTAAATGGTGCTGTGAGTTCAGAAAGATTc > 1:1573001/1‑100 (MQ=255) aaa‑TT‑TC‑C‑C‑C‑C‑C‑C‑CTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTAAATGGTGCTGTGAGTTCAGAAAGATTc > 1:644526/1‑100 (MQ=255) aa‑TT‑TC‑C‑C‑C‑C‑C‑C‑CTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTAAATGGTGCTGTGAGTTCAGAAAGATTCt > 2:1249986/1‑100 (MQ=255) aa‑TT‑TC‑C‑C‑C‑C‑C‑C‑CTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTAAATGGTGCTGTGAGTTCAGAAAGATTCt > 1:1433208/1‑100 (MQ=255) | ATGATATTAACTTGTCCAATATGATCAAATAGCATTAACCCCCCCTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAA‑TT‑T‑‑C‑C‑C‑C‑C‑C‑CTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTAAATGGTGCTGTGAGTTCAGAAAGATTCT > NC_000913/2767401‑2767594 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |