| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 381832 = | NA (NA) | 9 (0.070) | 4/166 | NT | NA | noncoding (573/1331 nt) | IS2 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 381859 = | NA (NA) | noncoding (600/1331 nt) | IS2 | repeat region | |||||
TCGCAGGCATACCATCAAGTTCTGCCTGTCTGCGAAGCAGCGCCCATACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGGAGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/381932‑381832‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cggagaGCTGCCAACGTATGGTTATCGTCGGGTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGAT > NC_000913/381859‑381957 TCGCAGGCATACCATCACGTTCTGCCTGTCTGCGAAGCAGCGCCCATACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGGAG < 1:726170/100‑1TCGCAGGCATACCATCAAGTTCTGCCTGTCTGCGAAGCAGCGCCCATACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGGAG < 1:275001/100‑1TCGCAGGCATACCATCAAGTTCTGCCTGTCTGCGAAGCAGCGCCCATACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGGAG < 1:2303422/100‑1TCGCAGGCATACCATCAAGTTCTGCCTGTCTGCGAAGCAGCGCCCATACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGGAG < 1:658618/100‑1TCGCAGGCATACCATCAAGTTCTGCCTGTCTGCGAAGCAGCGCCCATACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGGAG < 1:954664/100‑1TCGCAGGCATACCATCAAGTTCTGCCTGTCTGCGAAGCAGCGCCCATACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGGAG > 2:1477669/1‑100 CGCAGGCATACCATTAAGTTCTGCCTGTCTGCGAAGCAGCGCCCATACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGGAGA > 1:1163878/1‑100 CGCAGGCATACCATCAAGTTCTGCCTGTCTGCGAAGCAGCGCCCATACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGGAGA > 1:1334822/1‑100 CGCAGGCATACCATCAAGTTCTGCCTGTCTGCGAAGCAGCGCCCATACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGGAGA < 1:3163011/100‑1 CGCAGGCATACCATCAAGTTCTGCCTGTCTGCGAAGCAGCGCCCATACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGGAGA < 1:3059384/100‑1 CGCAGGCATACCATCAAGTTCTGCCTGTCTGCGAAGCAGCGCCCATACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGGAGA < 1:2962506/100‑1 CGCAGGCATACCATCAAATTCTGCCTGTATGCGAAGCAGCGCCCATACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGGAGA > 1:2250298/1‑100 GCAGGCATACCATCAAGTTCTGCCTGTTTGCGAAGTAGCGCCCATACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCGCTCCGATAACATGGTGTATACCGAGA > 1:2460550/1‑99 CGAAGCAGCGCCCATACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGGAGAGCTGCCAACGTATGGTTATCGTCGGGTATGG > 1:2232567/1‑100 GCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGGAGAGCTGCCCACGTATGGTTATCGTCGGGTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGC > 2:2750118/1‑100 GCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGGAGAGCTGCCAACGTATGGTTATCGTCGGGTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGC > 1:2536632/1‑100 GCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGGAGAGCTGCCAACGTATGGTTATCGTCGGGTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGC > 1:3458122/1‑100 CAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGGAGAGCTGCCAACGTATGGTTATCGTCGGGTATGGACGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCC > 1:1235442/1‑100 GCTCTCCGATAACATGGTGTATACGGAGAGCTGCCAACGTATGGTTATCGTCGGGTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTG > 1:3677450/1‑100 GCTCTCCGATAACATGGTGTATACGGAGAGCTGCCAACGTATGGTTATCGTCGGGTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTG > 2:2696943/1‑100 GCTCTCCGATAACATGGTGTATACGGAGAGCTGCCAACGTATGGTTATCGTCGGGTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTG > 2:2431345/1‑100 GCTCTCCGATAACATGGTGTATACGGAGAGCTGCCAACCTATGGTTATCGTCGGATATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTG > 1:1043140/1‑100 CGGAGAGCTGCCAACGTATGGTTATCGTCGGGTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTAC > 1:277110/1‑100 CGGAGAGCTGCCAACGTATGGTTATCGTCGGGTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTAC > 2:1211638/1‑100 CGGAGAGCTGCCAACGTATGGTTATCGTCGGGTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTAC > 1:458844/1‑100 GGAGAGCTGCCAACGTATGGTTATCGTCGGGTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACC > 1:1908236/1‑100 GGAGAGCTGCCAACGTATGGTTATCGTCGGGTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACC < 2:1450286/100‑1 GGAGAGCTGCCAACGTATGGTTATCGTCGGGTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACC < 2:262281/100‑1 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GGAGAGCTGCCAACGTATGGTTATCGTCGGGTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGAGGGTATGCCTGCGCTCAATGCCAAACGTGTTTACC > 1:1000570/1‑100 GGAGAGCTGCCAACGTATGGTTATCGTCGGGTATGGGAGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCTATCAATGCCAAACGTGTTTAtc > 1:953880/1‑98 GGAGAGCGGCCAACGTATGGTTAACGTCTGGTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGCTGGTATGCCTGCGATGAATGCCAAACGTGTTTA < 1:665265/98‑1 GAGAGCTGCCAACGTATGGTTATCGTCGGGTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCG < 2:757380/100‑1 GAGAGCTGCCAACGTATGGTTATCGTCGGGTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCG > 2:1121005/1‑100 GAGAGCTGCCAACGTATGGTTATCGTCGGGTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCG < 1:3704750/100‑1 AGAGCTGCTAACGTATGGTTCTCGACGGGTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGTCTGCGATAAATGTCAATCGTGTTTACCGG < 1:1691399/100‑1 AGAGCTGCCAACGTATGGTTATCGTCGGGTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCCATGCCAAACGTGTTTACCGG < 1:2320498/100‑1 AGAGCTGCCAACGTATGGTTATCGTCGGGTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGG < 1:440872/100‑1 AGAGCTGCCAACGTATGGTTATCGTCGGGTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGG < 1:2156665/100‑1 AGAGCTGCCAACGTATGGTTATCGTCGGGTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGG < 1:2098480/100‑1 AGAGCTGCCAACGTATGGTTATCGTCGGGTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGG > 2:3170054/1‑100 AGAGCTGCCAACGTATGGTTATCGTCGGGTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGG < 1:1949866/100‑1 AGAGCTGCCAACGTATGGTTATCGTCGGGTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGG < 2:3707387/100‑1 AGAGCTGCCAACGTATGGTTATCGTCGGGTATGGACGCTGCTTCACAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGGCCAACGTGTTTACCGG > 1:873840/1‑100 GAGCTGCCATCGTATGGTTATCGTCGGGTATGGGCGCTGCGTCGCAGACAGGCAGAACGTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCG < 1:3186051/98‑1 GAGCTGCCAACGTATGGTTATCGTCGGGTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGA < 2:2255040/100‑1 GAGCTGCCAACGTATGGTTATCGTCGGGTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGA > 2:1947610/1‑100 GAGCTGCCAACGTATGGTTATCGTCGGGTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGA < 2:2955383/100‑1 AGCTGCCAACGTATGGTTATCGTCGGGTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGAT < 2:617469/100‑1 TCGCAGGCATACCATCAAGTTCTGCCTGTCTGCGAAGCAGCGCCCATACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGGAGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/381932‑381832‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cggagaGCTGCCAACGTATGGTTATCGTCGGGTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGAT > NC_000913/381859‑381957 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |