| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 4344813 = | NA (NA) | 9 (0.070) | 7/160 | NT | NA | intergenic (+23/+116) | melB/yjdF | melibiose:sodium symporter/DUF2238 family inner membrane protein |
| ? | NC_000913 | 4344842 = | NA (NA) | noncoding (28/95 nt) | RIP327 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 2 REP sequences and 1 IHF site | RIP327 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 2 REP sequences and 1 IHF site | |||||
Only 100 of 195 total aligned reads displayed.
AAATATCGCAAAGTACCGCCCGAGCCTGTTCATGCTGATATTCCGGTCGGTGCAGTGAGTGATGTGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTGGATTTGCAAATTTTGTAGACCGGATAAGGAATTCACGCCGCATCCGGCATC > NC_000913/4344716‑4344912 | aaaTATCGCAAAGTACCGCCCGAGCCTGTTCATGCTGATATTCCGGTCGGTGCAGTGAGTGATGTGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGG < 1:3277643‑M1/100‑1 (MQ=255) ccggataacaacttgcgctttgttgatgccggatgcggcgtgaattccttatccggtctacaaaatttgcaaatccaaagcattacattaagacgTGGcc > 2:3173871‑M1/96‑100 (MQ=255) ccggataacaacttgcgctttgttgatgccggatgcggcgtgaattccttatccggtctacaaaatttgcaaatccaaagcattacattaagacgTGGcc > 2:496750‑M1/96‑100 (MQ=255) cggataacaacttgcgctttgttgatgccggatgcggcgtgaattccttatccggtctacaaaatttgcaaatccaaagcattacattaagacgTGGCCt > 1:41149‑M1/95‑100 (MQ=255) ggataacaacttgcgctttgttgatgccggatgcggcgtgaattccttatccggtctacaaaatttgcaaatccaaagcattacattaagacgTGGCCTg < 2:3150863‑M1/7‑1 (MQ=255) cGCAAAGTACCGCCCGAGCCTGTTCATGCTGATATTCCGGTCGGTGCAGTGAGTGATGTGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGAT > 2:1135022‑M1/1‑100 (MQ=255) ataacaacttgcgctttgttgatgccggatgcggcgtgaattccttatccggtctacaaaatttgcaaatccaaagcattacattaagacgTGGCCTGAt > 2:1559668‑M1/92‑100 (MQ=255) gCAAAGTACCGCCCGAGCCTGTTCATGCTGATATTCCGGTCGGTGCAGTGAGTGATGTGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTG > 1:3081317‑M1/1‑97 (MQ=255) aaaGTACCGCCCGAGCCTGTTCATGCTGATATTCCGGTCGGTGCAGTGAGTGATGTGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCg < 2:1610888/100‑1 (MQ=255) aaGTACCGCCCGAGCCTGTTCATGCTGATATTCCGGTCGGTGCAGTGAGTGATGTGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGa < 2:1778787/100‑1 (MQ=255) aaGTACCGCCCGAGCCTGTTCATGCTGATATTCCGGTCGGTGCAGTGAGTGATGTGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGa < 2:2729242/100‑1 (MQ=255) tACCGCCCGAGCCTGTTCATGCTGATATTCCGGTCGGTGCAGTGAGTGATGTGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGatat < 1:1085487/100‑1 (MQ=255) tACCGCCCGAGCCTGTTCATGCTGATATTCCGGTCGGTGCAGTGAGTGATGTGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGa > 1:3304582/1‑97 (MQ=255) cGCCCGAGCCTGTTCATGCTGATATTCCGGTCGGTGCAGTGAGTGATGTGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGtt > 2:210407/1‑100 (MQ=255) gCCCGAGCCTGTTCATGCTGATATTCCGGTCGGTGCAGTGAGTGATGTGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGttt > 1:2865883/1‑100 (MQ=255) gCCCGAGCCTGTTCATGCTGATATTCCGGTCGGTGCAGTGAGTGATGTGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGttt > 2:2816874/1‑100 (MQ=255) cccGAGCCTGTTCATGCTGATATTCCGGTCGGTGCAGTGAGTGATGTGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTa > 2:2112861‑M2/1‑99 (MQ=255) cGAGCCTGTTCATGCTGATATTCCGGTCGGTGCAGTGAGTGATGTGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTatc < 1:1016159‑M2/100‑4 (MQ=255) gAGCCTGTTCATGCTGATATTCCGGTCGGTGCAGTGAGTGATGTGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTatc > 1:98086‑M2/1‑96 (MQ=255) aGCCTGTTCATGCTGATATTCCGGTCGGTGCAGTGAGTGATGTGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTatca > 1:2906633‑M2/1‑95 (MQ=255) gCCTGTTCATGCTGATATTCCGGTCGGTGCAGTGAGTGATGTGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTatcagg > 2:1080103‑M2/1‑94 (MQ=255) gCCTGTTCATGCTGATATTCCGGTCGGTGCAGTGAGCGATGTGAAAGCCTGACGTGCACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTatcatg < 1:3357644‑M2/100‑7 (MQ=255) gCCTGTTCATGCCGATATTCCGGTCGGTGCAGTGAGTGATGTGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTatcagg > 1:1688296‑M2/1‑94 (MQ=255) ccTGTTCATGCTGATATTCCGGTCGGTGCAGTGAGTGATGTGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATaaacatatcgcatcaggc < 2:3378932‑M1/100‑19 (MQ=255) ccTGTTCATGCTGATATTCCGGTCGGTGCAGTGAGTGATGTGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTatcacgc < 1:3501648‑M2/100‑8 (MQ=255) cTGTTCATGCTGATATTCCGGTCGGTGCAGTGAGTGATGTGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATaaacatatcgcatcaggcc < 2:1684911‑M1/100‑20 (MQ=255) cTGTTCATGCTGATATTCCGGTCGGTGCAGTGAGTGATGTGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTatcaggcc > 2:1823487‑M2/1‑92 (MQ=255) tGTTCATGCTGATATTCCGGTCGGTGCAGTGAGTGATGTGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTatcaggcca < 2:413070‑M2/100‑10 (MQ=255) gatgccggatgcggcgtgaattccttatccggtctacaaaatttgcaaatccaaagcattacattaagacgTGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCa > 2:3789538‑M1/72‑100 (MQ=255) gTTCATGCTGATATTCCGGTCGGTGCAGTGAGTGATGTGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATaaacatatcgcatcaggccat < 1:1910533‑M1/100‑22 (MQ=255) gTTCATGCTGATATTCCGGTCGGTGCAGTGAGTGATGTGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATaaacatatcgcatcaggccat < 2:3528489‑M1/100‑22 (MQ=255) atgccggatgcggcgtgaattccttatccggtctacaaaatttgcaaatccaaagcattacattaagacgTGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCAc > 2:556655‑M1/71‑100 (MQ=255) ttCATGCTGATATTCCGGTCGGTGCAGTGAGTGATGTGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATaaacatatcgcatcaggccatt < 1:3081779‑M1/100‑23 (MQ=255) tgccggatgcggcgtgaattccttatccggtctacaaaatttgcaaatccaaagcattacattaagacgTGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACg > 2:3755885‑M1/70‑100 (MQ=255) tgccggatgcggcgtgaattccttatccggtctacaaaatttgcaaatccaaagcattacattaagacgCGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCAc > 1:679880‑M1/70‑99 (MQ=255) gccggaggcggcgtgaattccttatccggtctacaaaatttgcaaatccaaagcattacattaagacgTGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGt > 2:876784‑M1/69‑100 (MQ=255) cATGCTGATATTCCGGTCGGTGCAGTGAGTGATGTGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTc > 1:2643443/1‑100 (MQ=255) aTGCTGATATTCCGGTCGGTGCAGTGAGTGATGTGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCt < 2:2366756/100‑1 (MQ=255) tGCTGATATTCCGGTCGGTGCAGTGAGTGATGTGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATaaacatatcgcatcaggccattttcg < 2:588040‑M1/100‑27 (MQ=255) tGCTGATATTCCGGTCGGTGCAGTGAGTGATGTGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCtt > 2:2167678/1‑100 (MQ=255) tGCTGATATTCCGGTCGGTGCAGTGAGTGATGTGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCtt > 2:3330346/1‑100 (MQ=255) gCTGATATTCCGGTCGGTGCAGTGAGTGATGTGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTta > 1:3103513/1‑100 (MQ=255) gCTGATATTCCGGTCGGTGCAGTGAGTGATGTGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTta > 2:687269/1‑100 (MQ=255) tGATATTCCGGTCGGTGCAGTGAGTGATGTGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTtaat > 1:3765775/1‑100 (MQ=255) tGATATTCCGGTCGGTGCAGTGAGTGATGTGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTtaat > 1:1050607/1‑100 (MQ=255) gcggcgtgaattccttatccggtctacaaaatttgcaaatccaaagcattacattaagacgTGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTtaatg > 2:3021524‑M1/62‑100 (MQ=255) atTCCGGTCGGTGCAGTGAGTGATGTGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTtaatgtaa > 1:1915450/1‑100 (MQ=255) tCCGGTCGGTGCAGTGAGTGATGTGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTtaatgtaatg > 1:1596368/1‑100 (MQ=255) ccGGTCGGTGCAGTGAGTGATGTGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGCTATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGc > 1:2486998/1‑100 (MQ=255) cggtcggtGCAGTGAGTGATGTGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCt < 1:1634046/100‑1 (MQ=255) ggtcggtGCAGTGAGTGATGTGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCtt > 2:2187644/1‑100 (MQ=255) gtcggtGCAGTGAGTGATGTGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCttt < 1:832440/100‑1 (MQ=255) gtcggtGCAGTGAGTGATGTGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCttt > 1:861890/1‑100 (MQ=255) gtcggtGCAGTGAGTGATGTGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGAAAGGTTTATCACGCCACGTCTTAATGTAATGCttt > 1:1018969/1‑100 (MQ=255) ngtGCAGTGAGTGATGTGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCAACGTCTTAAGGTAATGTTTTGGa > 2:3415716/2‑100 (MQ=255) gtGCAGTGAGTGATGTGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTGGAt < 2:792310/100‑1 (MQ=255) gtGCAGTGAGTGATGTGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTGGAt < 2:2585082/100‑1 (MQ=255) gCAGTGAGTGATGTGGAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTGGAttt > 2:3602164/1‑100 (MQ=255) gCAGTGAGTGATGTGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTGGAttt > 2:2863181/1‑100 (MQ=255) cAGTGAGTGATGTGAAAGCCTGACGTGGACAATATCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTGGATTTg < 1:2000732/100‑1 (MQ=255) cAGTGAGTGATGTGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTGGATTTg < 1:1149963/100‑1 (MQ=255) cAGTGAGTGATGTGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTGGATTTg < 1:1215332/100‑1 (MQ=255) cAGTGAGTGATGTGAAACGCTGACGAGAACATTAGCTAACGAAAATGTCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTGGATTTg < 1:3579030/100‑1 (MQ=255) agtgagtgATGTGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTGGATTTGc > 1:3691550/1‑100 (MQ=255) gtgagtgaTGTGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTGGATTTGCa > 2:2958888/1‑100 (MQ=255) gtgaTGTGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTGGATTTGCAAAtt > 1:3410610/1‑100 (MQ=255) gtgaTGTGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTGGATTTGCAAAtt > 1:1245618/1‑100 (MQ=255) aTGTGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTGGATTTGCAAATTTTg < 1:2164648/100‑1 (MQ=255) aTGTGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTGGATTTGCAAATTTTg < 2:2473159/100‑1 (MQ=255) tgAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTGGATTTGCAAATTTTGTAg < 2:1334317/100‑1 (MQ=255) gcaaGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTGGAGTTGCAAATGTTGTa > 1:1401886/3‑98 (MQ=255) aGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTGGATTTGCAAATTTTGTAGACCg < 1:2657841/100‑1 (MQ=255) gCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTGGATTTGCAAATTTTGTAGACCgg < 2:901984/100‑1 (MQ=255) ccTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTGGATTTGCAAATTTTGTAGACCGGa > 2:2517765/1‑100 (MQ=255) tGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTGGATTTGCAAATTTTGTAGACCGGATa < 1:248572/100‑1 (MQ=255) gACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTGGATTTGCAAATTTTGTAGACCGGATaa > 2:2911333/1‑100 (MQ=255) aCGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATTCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTGGATTTGCAAATTTTGTAGACCGGATAAg < 2:3304606/100‑1 (MQ=255) ggACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCCTTGGATTTGCAAATTCTGTAGACCGGATAAGGaa > 2:1895657/1‑99 (MQ=255) cAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTGGATTTGCAAATTTTGTAGACCGGATAAGGAATTCa > 1:3259743/1‑100 (MQ=255) cattacattaagacgTGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTGGATTTGCAAATTTTGTAGACCGGATAAGGAATTCAc > 2:3455911‑M1/16‑100 (MQ=255) aGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTGGATTTGCAAATTTTGTAGACCGGATAAGGAATTCAcgcc < 1:3641105/100‑1 (MQ=255) aGCTAACGAAAATGGACTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTGGATTTGCAAATTTTGTAGACCGGATAAGGAATTCAcgcc < 2:3742082/100‑1 (MQ=255) gCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTGGATTTGCAAATTTTGTAGACCGGATAAGGAATTCAcgccg < 2:1476498/100‑1 (MQ=255) gCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTGGATTTGCAAATTTTGTAGACCGGATAAGGAATTCAcgccg < 2:151048/100‑1 (MQ=255) tAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTGGATTTGCAAATTTTGTAGACCGGATAAGGAATTCACGCCGCa > 1:492252/1‑100 (MQ=255) aaCGAAAATGGCCTGGTGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTGCTGTATTGTCATGTATTTTCAAATTTCGTAGACAGGCTACGGCATTCAcg > 1:1722163/1‑94 (MQ=255) aaCGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTGGATTTGCAAATTTTGTAGACCGGATAAGGAATTCACGCCGCAt > 1:3014036/1‑100 (MQ=255) aCGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTGGATTTGCAAATTTTGTAGACCGGATAAGGAATTCACGCCGCATc > 1:2472900/1‑100 (MQ=255) cGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTGGATTTGCAAATTTTGTAGACCGGATAAGGAATTCACGCCGCATcc > 2:1803200/1‑100 (MQ=255) gAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTGGATTTGCAAATTTTGTAGACCGGATAAGGAATTCACGCCGCATcc < 1:3143189/99‑1 (MQ=255) aaaTGGCCTGATGCGATATGTTTatcaggccattttcgttagctattgtccacgtcaggctttcacatcactcactgcaccgaccggaatatcagcatga < 2:2017865‑M2/100‑78 (MQ=255) aaaTGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTGGATTTGCAAATTTTGTAGACCGGATAAGGAATTCACGCCGCATCCGGc < 2:2334109/100‑1 (MQ=255) aaaTGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTGGATTTGCAAATTTTGTAGACCGGATAAGGAATTCACGCCGCATCCGGc < 1:2739245/100‑1 (MQ=255) aTGGCCTGATGCGATATGTTTatcaggccattttcgttagctattgtccacgtcaggctttcacatcactcactgcaccgaccggaatatcagcatgaac < 1:3269666‑M2/100‑80 (MQ=255) aTGGCCTGATGCGATATGTTTatcaggccattttcgttagctattgtccacgtcaggctttcacatcactcactgcaccgaccggaatatcagcatgaac < 1:1457957‑M2/100‑80 (MQ=255) tGGCCTGATaaacatatcgcatcaggccattttcgttagctattgtccacgtcaggctttcacatcactcactgcaccgaccggaatatcagcatgaaca > 2:1134653‑M1/1‑9 (MQ=255) tGGCCTGATaaacatatcgcatcaggccattttcgttagctattgtccacgtcaggctttcacatcactcactgcaccgaccggaatatcagcatgaaca < 1:1034230‑M1/100‑92 (MQ=255) tGGCCTGATaaacatatcgcatcaggccattttcgttagctattgtccacgtcaggctttcacataactcactgcaccgcccggaatatcagcat > 1:2349368‑M1/1‑9 (MQ=255) tGGCCTGATGCGATATGTTTatcaggccattttcgttagctattgtccacgtcaggctttcacatcactcactgcaccgaccggaatatcagcatgaaca < 1:640580‑M2/100‑81 (MQ=255) TGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTGGATTTGCAAATTTTGTAGACCGGATAAGGAATTCACGCCGCATCCGGCatn > 1:2830081‑M1/1‑99 (MQ=255) | AAATATCGCAAAGTACCGCCCGAGCCTGTTCATGCTGATATTCCGGTCGGTGCAGTGAGTGATGTGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTGGATTTGCAAATTTTGTAGACCGGATAAGGAATTCACGCCGCATCCGGCATC > NC_000913/4344716‑4344912 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |