| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 474269 = | NA (NA) | 16 (0.120) | 9/166 | NT | NA | intergenic (+17/+32) | amtB/tesB | ammonium transporter/acyl‑CoA thioesterase 2 |
| ? | NC_000913 | 474296 = | NA (NA) | intergenic (+44/+5) | amtB/tesB | ammonium transporter/acyl‑CoA thioesterase 2 | |||||
Only 100 of 186 total aligned reads displayed.
GGAGCGAGAAGGGCTGGATGTCAACAGCCACGGCGAGAATGCCTATAACGCGTAACAAGCACTGCAAAAAACAGCCGGACGGTTTTCACCTCCGGCTATTTTTTTAATTGTGATTACGCATCACCCCTTCCTGAACGGTCGAGGCAACCAGTACGCCGTCTTGGGTATAAAACTCACCGCGCACAAAGCCACGTGC > NC_000913/474198‑474393 | tatacccaagacggcgtactggttgcctcgaccgttcaggaaggggtgatgcgtaatcacaattaaaaaaatagccggaggtgaaaaccgtccggctgtt < 2:3085854‑M2/2‑1 (MQ=255)ggAGCGAGAAGGGCTGGATGTCAACAGCCACGGCGAGAATGCCTATAACGCGTAACAAGCACTGCAAAAAACAGCCGGACGGTTTTCACCTCCGGCTAtt > 2:2224305/1‑100 (MQ=255)ggAGCGAGAAGGGCTGGATGTCAACAGCCACGGCGAGAATGCCTATAACGCGTAACAAGCACTGCAAAAAACAGCCGGACGGTTTTCACCTCCGGCTAtt > 1:3216892/1‑100 (MQ=255)ggAGCGAGAAGGGCTGGATGTCAACAGCCACGGCGAGAATGCCTATAACGCGTAACAAGCACTGCAAAAAACAGCCGGACGGTTTTCACCTCCGGCTAtt < 2:1183656/100‑1 (MQ=255) acccaagacggcgtcctggttgcctcgaccgttcaggaaggggtgatgcgtaatcacaattaaaaaaatagccggaggtgaaaaccgtccggctgt > 1:2467711‑M2/96‑96 (MQ=255) acccaagacggcgtactggttgcctcgaccgttcaggaaggggtgatgcgtaatcacaattaaaaaaatagccggaggtgaaaaccgtccggctgttttt > 2:2352300‑M2/96‑100 (MQ=255) cccaagacggcgtactggttgcctcgaccgttcaggaaggggtgatgcgtaatcacaattaaaaaaatagccggaggtgaaaaccgtccggctgtttttt > 2:713933‑M2/95‑100 (MQ=255) cccaagacggcgtactggttgcctcgaccgttcaggaaggggcgatgcgtaatcacacttaaaaaaatagccggaggtgagaaccgtccggctgttttt > 1:606306‑M2/95‑99 (MQ=255) gagaAGGGCTGGATGTCAACAGCCACGGCGAGAATGCCTATAACGCGTAACAAGCACTGCAAAAAACAGCCGGACGGTTTTCACCTCCGGCTAttttttt > 1:1375530/1‑100 (MQ=255) gagaAGGGCTGGATGTCAACAGCCACGGCGAGAATGCCTATAACGCGTAACAAGCACTGCAAAAAACAGCCGGACGGTTTTCACCTCCGGCTAttttttt > 2:2701976/1‑100 (MQ=255) ccaagacggcgtactggttgcctcgaccgttcaggaaggggtgatgcgtaatcacaattaaaaaaatagccggaggtgaaaaccgtccggctgttttt < 2:3730539‑M2/5‑1 (MQ=255) ccaagacggcgtactggttgcctcgaccgttcaggaaggggtgatgcgtaatcacaattaaaaaaaCAGCCGGACGGTTTTCACCTCCGGCTAttttttt > 1:116746‑M1/67‑100 (MQ=255) gaAGGGCTGGATGTCAACAGCCACGGCGAGAATGCCTATAACGCGTAACAAGCACTGCAAAAAACAGCCGGACGGTTTTCACCTCCGGCTATTTTTTTaa < 1:1343117/100‑1 (MQ=255) agacggcgtactggttgcctcgaccgttcaggaaggggtgatgcgtaatcacaattaaaaaaaCAGCCGGACGGTTTTCACCTCCGGCTATTTTTTTAAt > 2:3358822‑M1/64‑100 (MQ=255) gacggcgtactggttgcctcgaccgttcaggaaggggtgatgcgtaatcacaattaaaaaaaCAGCCGGACGGTTTTCACCTCCGGCTATTTTTTTAAtt > 1:1971093‑M1/63‑100 (MQ=255) aGGGCTGGATGTCAACAGCCACGGCGAGAATGCCTATAACGCGTAACAAGCACTGCAAAAAACAGCCGGACGGTTTTCACCTCCGGCTATTTTTTTAAtt > 2:1007679/1‑100 (MQ=255) gggCTGGATGTCAACAGCCACGGCGAGAATGCCTATAACGCGTAACAAGCACTGCAAAAAACAGCCGGACGGTTTTCACCTCCGGCTATTTTTTTAAtt > 1:3109033/1‑99 (MQ=255) gggCTGGATGTCAACAGCCACGGCGAGAATGCCTATAACGCGTAACAAGCACTGCAAAAAACAGCCGGACGGTTTTCACCTCCGGCTATTTTTTTAATtg > 2:1705167/1‑100 (MQ=255) gggCTGGATGTAAACAGCCACGGCGAGAATGCCTATACCGCGTAACAAGCATTGCAAAAAACAGCCGGACGGTTTTCACCTCCGGCTATTTTTTTAATtg < 2:413435/100‑1 (MQ=255) acgttGGCTGTCAACAGCCATGGCGAGAATGCCTATAACGCGTAACACGCACTGCAAGAAGCAGCCGCACGGTTTTCCCCTCCGGCTATTTTTTTAATtg < 1:1416609/96‑1 (MQ=255) acggcgtactggttgcctcgaccgttcaggaaggggtgatgcgtaatcacaattaaaaaaaCAGCCGGACGGTTTTCACCTCCGGCTATTTTTTTAATtg > 1:541709‑M1/62‑100 (MQ=255) ggCTGGATGTCAACAGCCACGGCGAGAATGTCTATAACGCGTAACAAGCACTGCAAAAAACAGCCGGACGGTTTTCACCTCCGGCTATTTTTTTAATtgt < 1:1056768/100‑1 (MQ=255) cggcgtactggttgcctcgaccgttcaggaaggggtgatgcgtaatcacaattaaaaaaaCAGCCGGACGGTTTTCACCTCCGGCTATTTTTTTAATtg > 2:2438315‑M1/61‑99 (MQ=255) ggcgtactggttgcctcgaccgttcaggaaggggtgatgcgtaatcacaattaaaaaaaTAGCCGGACGGTTTTCACCTCCGGCTATTTTTTTAAttgtn > 2:3666182‑M1/60‑99 (MQ=255) gCTGGATGTCAACAGCCACGGCGAGAATGCCTATAACGCGTAACAAGCACTGTAAAAAACAGCCGGACGGTTTTCACCTCCGGCTATTTTTTTAATtgtg < 1:1603468/100‑1 (MQ=255) gCTGGATGTCAACAGCCACGGCGAGAATGCCTATAACGCGTAACAAGCACTGCAAAAAACAGCCGGACGGTTTTCACCTCCGGCTATTTTTTTAATtgtg < 1:3657478/100‑1 (MQ=255) gCTGGATGTCAACAGCCACGGCGAGAATGCCTATAACGCGTAACAAGCACTGCAAAAAACAGCCGGACGGTTTTCACCTCCGGCTATTTTTTTAATtgtg > 2:3531572/1‑100 (MQ=255) gcgttctggttgcctctacctttcatgaagttgtgatgcgtaatcacaattaaaaaaaCAGCCGGACGGTTTTCTCCTCCGGCTATTTTTTTAATtg > 1:2946668‑M1/59‑97 (MQ=255) cTGGATGTCAACAGCCACGGCGAGAATGCCTATAACGCGTAACAAGCACTGCAAAAAACAGCCGGACGGTTTTCACCTCCGGCTATTTTTTTAATTGTGa < 2:2112349/100‑1 (MQ=255) gATGTCAACAGCCACGGCGAGAATGCCTATAACGCGTAACAATCACTGCAAAAAACAGCCGGACGGTTTTCACCTCCGGCTATTTTTTTAATTGTGAtn < 1:2067240/99‑2 (MQ=255) aTGTCAACAGCCACGGCGAGAATGCCTATAACGCGTAACAAGCACTGCAAAAAACAGCCGGACGGTTTTCACCTCCGGCTATTTTTTTAATTGTGATTAc > 1:2969115/1‑100 (MQ=255) tGTCAACAGTCACGGCGAGAATGCCTATAACGCGTAACAAGCACTGCAAAAAACAGCCGGACGGTTTTCACCTCCGGCTATTTTTTTAATTGTGATTACg < 1:2003681/100‑1 (MQ=255) tGTCAACAGCCACGGCGAGAATGCCTATAACGCGTAACAAGCACTGCAAAAAACAGCCGGACGGTTTTCACCTCCGGCTATTTTTTTAATTGTGATTACg > 1:755555/1‑100 (MQ=255) tGTCAACAGCCACGGCGAGAATGCCTATAACGCGTAACAAGCACTGCAAAAAACAGCCGGACGGTTTTCACCTCCGGCTATTTTTTTAATTGTGATTACg > 1:1133045/1‑100 (MQ=255) tCAACAGCCACGGCGAGAATGCCTATAACGCGTAACAAGCACTGCAAAAAACAGCCGGACGGTTTTCACCTCCGGCTATTTTTTTAATTGTGATTACGCa < 2:2794574/100‑1 (MQ=255) cAACAGCCACGGCGAGAATGCCTATAACGCGTAACAAGCACTGCAAAAAACAGCCGGACGGTTTTCACCTCCGGCTATTTTTTTAATTGTGATTACGCAt > 2:1903302/1‑100 (MQ=255) cAACAGCCACGGCGAGAATGCCTATAACGCGTAACAAGCACTGCAAAAAACAGCCGGACGGTTTTCACCTCCGGCTATTTTTTTAATTGTGATTACGCAt < 1:1859916/100‑1 (MQ=255) aaCAGCCACGGCGCGAATGCCTATAACGCGTAACAAGCGCTGCAAAAAACAGCCGGACGGTTTTCACCTCCGGCTATTTTTTTAATTGTGATTACGCATc > 1:2339087/1‑100 (MQ=255) aaCAGCCACGGCGAGAATGCCTATAACGCGTAACAAGCACTGCAAAAAACAGCCGGACGGTTTTCACCTCCGGCTATTTTTTTAATTGTGATTACGCATc > 2:1240844/1‑100 (MQ=255) aCAGCCACGGCGAGAATGCCTATAACGCGTAACAAGCACTGCAAAAAACAGCCGGACGGTTTTCACCTCCGGCTATTTTTTTAATTGTGATTACGCATCa > 1:2832252/1‑100 (MQ=255) cAGCCACGGCGAGAATGCCTATAACGCGTAACAAGCACTGCAAAAAACAGCCGGACGGTTTTCACCTCCGGCTATTTTTTTAATTGTGATTACGCATCAc < 2:650356/100‑1 (MQ=255) gCCACGGCGAGAATGCCTATAACGCGTAACAAGCACTGCAAAAAACAGCCGGACGGTTTTCACCTCCGGCTATTTTTTTAATTGTGATTACGCATCAccc > 2:2297688/1‑100 (MQ=255) gCCACGGCGAGAATGCCTATAACGCGTAACAAGCACTGCAAAAAACAGCCGGACGGTTTTCACCTCCGGCTATTTTTTTAATTGTGATTACGCATCAccc > 1:1487425/1‑100 (MQ=255) cACGGCGAGAATGCCTATAACGCGTAACAAGCACTGCAAAAAACAGCCGGACGGTTTTCACCTCCGGCTATTTTTTTAATTGTGATTACGCATCACCCCt > 1:2374665/1‑100 (MQ=255) cACGGCGAGAATGCCTATAACGCGTAACAAGCACTGCAAAAAACAGCCGGACGGTTTTCACCTCCGGCTATTTTTTTAATTGTGATTACGCATCACCCCt > 2:3045531/1‑100 (MQ=255) aCGGCGAGAATGCCTATAACGCGTAACAAGCACTGCAAAAAACAGCCGGACGGTTTTCACCTCCGGCTATTTTTTTAATTGTGATTACGCATCACCCCtt > 1:2126586/1‑100 (MQ=255) cGGCGAGAATGCCTATAACGCGTAACAAGCACTGCAAAAAACAGCCGGACGGTTTTCACCTCCGGCTATTTTTTTAATTGTGATTACGCATCACCCCTTc < 1:2585294/100‑1 (MQ=255) cGGCGAGAATGCCTATAACGCGTAACAAGCACTGCAAAAAACAGCCGGACGGTTTTCACCTCCGGCTATTTTTTTAATTGTGATTACGCATCACCCCTTc > 2:3267425/1‑100 (MQ=255) gCGAGAATGCCTATAACGCGTAACAAGCACTGCAAAAAACAGCCGGACGGTTTTCACCTCCGGCTATTTTTTTAATTGTGATTACGCATCACCCCTTCCt > 2:1098582/1‑100 (MQ=255) gCGAGAATGCCTATAACGCGTAACAAGCACTGCAAAAAACAGCCGGACGGTTTTCACCTCCGGCTATTTTTTTAATTGTGATTACGCATCACCCCTTCCt < 1:3031086/100‑1 (MQ=255) aaTGCCTATAACGCGTAACAAGCACTGCAAAAAACAGACGGACGTGTTTCACCTCCGGCTATTTTTTTAATTGTGATTACGCATCACCCCTTCCTGAACg < 1:435841/100‑1 (MQ=255) aTGCCTATAACGCGTAACAAGCACTGCAAAAAACAGCCGGACGGTTTTCACCTCCGGCTATTTTTTTAATTGTGATTACGCATCACCCCTTCCTGAACgg > 2:3738034/1‑100 (MQ=255) gCCTATAACGCGTAACAAGCACTGCAAAAAACAGCCGGACGGTTTTCACCTCCGGCTATTTTTTTAATTGTGATTACGCATCACCCCTTCCTGAACGGTc > 2:2505926/1‑100 (MQ=255) gCCTATAACGCGTAACAAGCACTGCAAAAAACAGCCGGACGGTTTTCACATCCGGCTATTTTTTTAATTGTGATTACGCATCACCCCTTACTGAACGTTc > 1:911957/1‑100 (MQ=255) taACGCGTAACAAGCACTGCAAAAAACAGCCGGACGGTTTTCACCTCCGGCTATTTTTTTAATTGTGATTACGCATCACCCCTTCCTGAACGGTCGAGGc < 2:615798/100‑1 (MQ=255) aCGCGTAACAAGCACTGCAAAAAACAGCCGGACGGTTTTCACCTCCGGCTATTTTTTTAATTGTGATTACGCATCACCCCTTCCTGAACGGTCGAGGCaa > 2:2470159/1‑100 (MQ=255) cgcgTAACAAGCACTGCAAAAAACAGCCGGACGGTTTTCACCTCCGGCTATTTTTTTAATTGTGATTACGCATCACCCCTTCCTGAACGGTCGAGGCAAc > 2:166406/1‑100 (MQ=255) cgcgTAACAAGCACTGCAAAAAACAGCCGGACGGTTTTCACCTCCGGCTATTTTTTTAATTGTGATTACGCATCACCCCTTCCTGAACGGTCGAGGCAAc > 2:3724399/1‑100 (MQ=255) gcgTAACAAGCACTGCAAAAAACAGCCGGACGGTTTTCACCTCCGGCTATTTTTTTAATTGTGATTACGCATCACCCCTTCCTGAACGGTCGAGGCAAcc < 2:1371785/100‑1 (MQ=255) gTAACAAGCACTGCAAAAAACAGCCGGACGGTTTTCACCTCCGGCTATTTTTTTAATTGTGATTACGCATCACCCCTTCCTGAACGGTCGAGGCAACCAg > 2:2963728/1‑100 (MQ=255) cAAGCACTGCAAAAAACAGCCGGACGGTTTTCACCTCCGGCTATTTTTTTAATTGTGATTACGCATCACTCCTTCCTGAACGGTCGAGGCAACCAGTACg > 2:3795231/1‑100 (MQ=255) cacaattaaaaaaatagccggaggtgaaaaccgtccggctgTTTTTTTAATTGTGATTACGCATCACCCCTTCCTGAACGGTCGAGGCAACCAGTACGcc > 1:1291391‑M2/42‑100 (MQ=255) gCACTGCAAAAAACAGCCGGACGGTTTTCACCTCCGGCTATTTTTTTAATTGTGATTACGCATCACCCCTTCCTGAACGGTCGAGGCAACCAGTACGCCg > 2:3729091/1‑100 (MQ=255) caattaaaaaaatagccggaggtgaaaaccgtccggctgTTTTTTTAATTGTGATTACGCATCACCCCTTCCTGAACGGTCGAGGCAACCAGTACGCCGt > 1:541709‑M2/40‑100 (MQ=255) aCTGCAAAAAACAGCCGGACGGTTTTCACCTCCGGCTATTTTTTTAATTGTGATTACGCATCACCCCTTCCTGGACGGTCGAGGCAACCAGTACGCCGTc > 2:2750045/1‑100 (MQ=255) attaaaaaaatagccggaggtgaaaaccgtccggctgTTTTTTTAATTGTGATTACGCATCACCCCTTCCTGAACGGTCGAGGCAACCAGTACGCCGTCt > 2:3358822‑M2/38‑100 (MQ=255) gCAAAAAACAGCCGGACGGTTTTCACCTCCGGCTATTTTTTTAATTGTGATTACGCATCACCCCTTCCTGAACGGTCGAGGCAACCAGTACGCCGTCTTg > 1:31255/1‑100 (MQ=255) cAAAAAACAGCCGGACGGTTTTCACCTCCTGCTATTTTTTTAATTGTGATTACGCATCACCCCTTCCTGAACGGTCGAGGCAACCAGTACGCCGTCTTg < 1:1835295/99‑1 (MQ=255) aaaaaaatagccggaggtgaaaaccgtccggctgTTTTTTTAATTGTGATTACGCATCACCCCTTCCTGAACGGTCGAGGCAACCAGTACGCCGTCTTgg > 1:2537651‑M2/35‑100 (MQ=255) aaaaaaatagccggaggtgaaaaccgtccggctgTTTTTTTAATTGTGATTACGCATCACCCCTTCCTGAACGGTCGAGGCAACCAGTACGCCGTCTTgg > 2:1856484‑M2/35‑100 (MQ=255) aaaaaatagccggaggtgaaaaccgtccggctgTTTTTTTAATTGTGATTACGCATCACCCCTTCCTGAACGGTCGAGGCAACCAGTACGCCGTCTTggg > 2:1630727‑M2/34‑100 (MQ=255) aaaaaaCAGCCGGACGGTTTTCACCTCCGGCTATTTTTTTAATTGTGATTACGCATCACCCCTTCCTGAACGGTCGAGGCAACCAGTACGCCGTCTTggg > 2:3216916‑M1/7‑100 (MQ=255) aaaaatagccggatgtgaaaaccgtccggctgTTTTTTTAATTGTGATTACGCATCACCCCTTCCTGAACGGTCGAGGCAACCAGTACGCCGTCTTGGGt > 2:2552120‑M2/33‑100 (MQ=255) aaaaatagccggaggtgaaaaccgtccggctgTTTTTATAATTGTGATTACGCATCACCCCTTCCTGAACGGTCGAGGCAACCAGTACGCCGTCTTGGGt > 1:2028257‑M2/33‑100 (MQ=255) aaaatagccggaggtgaaaaccgtccggctgTTTTTTTAATTGTGATTACGCATCACCCCTTCCTGAACGGTCGAGGCAACCAGTACGCCGTCTTGGGt > 2:1188589‑M2/32‑99 (MQ=255) acagttggATGGTTTTCACCTCCGGCTATTTTTTTAATTGTGATTATGTATTACCCCTTCCTGAACGGTCGAGGCAACTAGTACGTCGTCtt < 1:1358897/86‑1 (MQ=255) cAGCCGGACGGTTTTCACCTCCGGCTATTTTTTTAATTGTGATTACGCATCACCCCTTCCTGAACGGTCGAGGCAACCAGTACGCCGTCTTGGGTATaaa < 1:1623290/100‑1 (MQ=255) cAGCCGGACGGTTTTCACCTCCGGCTATTTTTTTAATTGTGATTACGCATCACCCCTTCCTGAACGGTCGAGGCAACCAGTACGCCGTCTTGGGTATaaa > 2:2807759/1‑100 (MQ=255) gccggaggtgaaaaccgtccggctgTTTTTTTAATTGTGATTACGCATCACCCCTTCCTGAACGGTCGAGGCAACCAGTACGCCGTCTTGGGTATAAAAc > 2:3004998‑M2/26‑100 (MQ=255) gccggaggtgaaaaccgtccggctaTTTTTTTAATTGTGATTACGCATCACCCCTTCCTGAACGGTCGAGGCAACCAGTACGCCGTCTTGGGTATAAAAc > 1:191971‑M2/26‑100 (MQ=255) gCCGGACGGTTTTCACCTCCGGCTATTTTTTTAATTGTGATTACGCATCACCCCTTCCTGAACGGTCGAGGCAACCAGTACGCCGTCTTGGGTATaaaan < 1:142136/100‑2 (MQ=255) gCCGGACGGTTTTCACCTCCGGCTATTTTTTTAATTGTGATTACGCATCACCCCTTCCTGAACGGTCGAGGCAACCAGTACGCCGTCTTGGGTATAAAAc > 1:2220491/1‑100 (MQ=255) cGGACGGTTTTCACCTCCGGCTATTTTTTTAATTGTGATTACGCATCACCCCTTCCTGAACGGTCGAGGCAACCAGTACGCCGTCTTGGGTATAAAACTc < 2:778438/100‑1 (MQ=255) cGGACGGTTTTCACCTCCGGCTATTTTTTTAATTGTGATTACGCATCACCCCTTCCTGAACGGTCGAGGCAACCAGTACGCCGTCTTGGGTATAAAACTc < 1:584825/100‑1 (MQ=255) ggACGGTTTTCACCTCCGGCTATTTTTTTAATTGTGATTACGCATCACCCCTTCCTGAACGGTCGAGGCAACCAGTACGCCGTCTTGGGTATAAAACTc > 2:1790770/1‑99 (MQ=255) ggACGGTTTTCACCTCCGGCTATTTTTTTAATTGTGATTACGCATCACCCCTTCCTGAACGGTCGAGGCAACCAGTACGCCGTCTTGGGTATAAAACTCa > 2:1222145/1‑100 (MQ=255) naCGGTTTTCACCTCCGGCTATTTTTTTATTTTTTTTTACGCATCACCCCTTCCTGAACGGTCGAGGCAACCAGTACGCCGTCTTGGGTATAAAACTCAc > 1:244955/2‑100 (MQ=255) cGGTTTTCACCTCCGGCTATTTTTTTAATTGTGATTACGCATCACCCCTTCCTGAACGGCCGCGGCAACCAGTACGCCGTCTTGCGTATAAACCTCACcg > 2:3225127/1‑100 (MQ=255) gTTTTCACCTCCGGCTATTTTTTTTTTTTTTTTTACGCATCACCCCTTCCTGAACTTTTGTTGCAACCAGTACGCCGTCTTGGGTATAAAACTCACcgcg > 1:328959/1‑100 (MQ=255) gTTTTCACCTCCGGCTATTTTTTTTTTTTTTTTAACGCATCACCCCTTCCTGAACGTTTTAGGCAACCAGGACGCCGTCTTGGGTATAAAACTCACcgc > 1:2281251/1‑99 (MQ=255) tCACCTCCGGCTATTTTTTTAATTGTGATTACGCATCACCCCTTCCTGAACGGTCGAGGCAACCAGTACGCCGTCTTGGGTATAAAACTCACCGCGcaca < 2:2345304/100‑1 (MQ=255) aCCTCCGGCTATTTTTTTAATTGTGATTACGCATCACCCCTTCCTGAACGGTCGAGGCAACCAGTACGCCGTCTTGGGTATAAAACTCACCGCGCACaaa > 1:1385918/1‑100 (MQ=255) aCCTCCGGCTATTTTTTTAATTGTGATTACGCATCACCCCTTCCTGAACGGTCGAGGCAACCAGTACGCCGTCTTGGGTATAAAACTCACCGCGCACaaa < 2:1611875/100‑1 (MQ=255) ccTCCGGCTATTTTTTTAATTGTGATTACGCATCACCCCTTCCTGAACGGTCGAGGCAACCAGTACGCCGTCTTGGGTATAAAACTCACCGCGCACAAAg > 1:1252262/1‑100 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |