| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,533,536 | A→G | 100% | A83A (GCT→GCC) | yjhQ ← | GNAT family putative N‑acetyltransferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,533,536 | 0 | A | G | 96.8% | 502.5 / 2.7 | 153 | A83A (GCT→GCC) | yjhQ | GNAT family putative N‑acetyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (2/3); new base G (85/63); total (87/66) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.52e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.82e-01 | |||||||||||
Only 100 of 157 total aligned reads displayed.
CCGTCTGGCAGCCCATCAACCTCAGGTGCTCGATGCCAGTGCGTATCAACCGTCCTCCCACGCCCATCCCTTGGTATTCCGGTATGACCGCCAGGGGAGCGAGGATGTGCATCAACGGTGAATCCATTTCTCCTTTGAAGGTTGCCCGGGTAAATAAAATATGCCCGACGGCTTTGCCTTCATACCGGGCTAGCAGC > NC_000913/4533439‑4533635 | gTCTGGCAGCCCATCAACCTCAGGTGCTCGATGCCAGTGCGTATCAACCGTCCTCCCACGCCCATCCCTTGGTATTCCGGTATGACCGCCAGGGGAGCGa > 2:501257/1‑100 (MQ=255) gCAGCCCATCAACCTCAGGTGCTCGATGCCAGTGCGTATCAACCGTCCTCCCACGCCCATCCCTTGGTATTCCGGTATGACCGCCAGGGGGGCGAGGAtg < 2:1860358/100‑1 (MQ=255) gCAGCCCATCAACCTCAGGTGCTCGATGCCAGTGCGTATCAACCGTCCTCCCACGCCCATCCCTTGGTATTCCGGTATGACCGCCAGGGGGGCGAGGAtg < 2:1404857/100‑1 (MQ=255) cAGCCCATCAACCTCAGGTGCTCGATGCCAGTGCGTATCAACCGTCCTCCCACGCCCATCCCTTGGTATTCCGGTATGACCGCCAGGGGGGCGAGGAtg < 1:823748/99‑1 (MQ=255) gCCCATCAACCTCAGGTGCTCGATGCCAGTGCGTATCAACCGTCCTCCCACGCCCATCCCTTGGTATTCCGGTATGACCGCCAGGGGGGCGAGGATGTGc > 1:721531/1‑100 (MQ=255) cccATCAACCTCAGGTGCTCGATGCCAGTGCGTATCAACCGTCCTCCCACGCCCATCCCTTGGTATTCCGGTATGACCGCCAGGGGGGCGAGGATGTGCa < 2:1309364/100‑1 (MQ=255) cccATCAACCTCAGGTGCTCGATGCCAGTGCGTATCAACCGTCCTCCCACGCCCATCCCTTGGTATTCCGGTATGACCGCCAGGGGGGCGAGGATGTGCa < 1:742975/100‑1 (MQ=255) cccATCAACCTCAGGTGCTCGATGCCAGTGCGTATCAACCGTCCTCCCACGCCCATCCCTTGGTATTCCGGTATGACCGCCAGGGGGGCGAGGATGTGCa < 1:3763862/100‑1 (MQ=255) cccATCAACCTCAGGTGCTCCATGCCAGTGCGTATCAACCGTCCTCCCACGCCCATCCCTTGGTATTCCGGTATGACCGCCAGGGGGGCGAGGATGTGCa < 2:1498289/100‑1 (MQ=255) ccATCAACCTCAGGTGCTCGATGCCAGTGCGTATCAACCGTCCTCCCACGCCCATCCCTTGGTATTCCGGTATGCCCGCCAGGGGGGCGAGGATGTGCAt > 1:1186719/1‑100 (MQ=255) cATCAACCTCAGGTGTTCGATGCCAGTGCGTATCAACCGTCCTCCCACGCCCATCCCTTGGTATTCCGGTATGACCGCCAGGGGGGCGAGGATGTGCATc > 2:1021190/1‑100 (MQ=255) cATCAACCTCAGGTGCTCGATGCCAGTGCGTATCAACCGTCCTCCCACGCCCATCCCTTGGTATTCCGGTATGACCGCCAGGGGGGCGAGGATGTGCATc < 1:1739765/100‑1 (MQ=255) cATCAACCTCAGGTGCTCGATGCCAGTGCGTATCAACCGTCCTCCCACGCCCATCCCTTGGTATTCCGGTATGACCGCCAGGGGGGCGAGGATGTGCATc > 2:2087261/1‑100 (MQ=255) cATCAACCTCAGGTGCTCGATGCCAGTGCGTATCAACCGTCCTCCCACGCCCATCCCTTGGTATTCCGGTATGACCGCCAGGGGGGCGAGGATGTGCATc < 1:1263924/100‑1 (MQ=255) tCAACCTCAGGTGCTCGATGCCAGTGCGTATCAACCGTCCTCCCACGCCCATCCCTTGGTATTCCGGTATGACCGCCAGGGGGGCGAGGATGTGCATCaa < 2:3402770/100‑1 (MQ=255) aaCCTCAGGTGCTCGATGCCAGTGCGTATCAACCGTCCTCCCACGCCCATCCCTTGGTATTCCGGTATGACCGCCAGGGGGGCGAGGATGTGCATCAACg < 1:1835821/100‑1 (MQ=255) aaCCTCAGGTGCTCGATGCCAGTGCGTATCAACCGTCCTCCCACGCCCATCCCTTGGTATTCCGGTATGACCGCCAGGGGGGCGAGGATGTGCATCAACg > 2:2547295/1‑100 (MQ=255) aCCTCAGGTGCTCGATGCCAGTGCGTATCAACCGTCCTCCCACGCCCATCCCTTGGTATTCCGGTATGACCGCCAGGGGGGCGAGGATGTGCATCAACgg > 2:2729713/1‑100 (MQ=255) ccTCAGGTGCTCGATGCCAGTGCGTATCAACCGTCCTCCCACGCCCATCCCTTGGTATTCCGGTATGACCGCCAGGGGGGCGAGGCTGTGCATCAACGGt > 2:2660577/1‑100 (MQ=255) ccTCAGGTGCTCGATGCCAGTGCGTATCAACCGTCCTCCCACGCCCATCCCTTGGTATTCCGGTATGACCGCCAGGGGGGCGAGGATGTGCATCAACGGt > 2:298280/1‑100 (MQ=255) cTCAGGTGCTCGATGCCAGTGCGTATCAACCGTCCTCCCACGCCCATCCCTTGGTATTCCGGTATGACCGCCAGGGGGGCGAGGATGTGCATCAACGGTg > 2:2046616/1‑100 (MQ=255) cTCAGGTGCTCGATGCCAGTGCGTATCAACCGTCCTCCCACGCCCATCCCTTGGTATTCCGGTATGACCGCCAGGGGAGCGAGGATGTGCATCAACGGTg < 2:1169946/100‑1 (MQ=255) tCAGGTGCTCGATGCCAGTGCGTATCAACCGTCCTCCCACGCCCATCCCTTGGTATTCCGGTATGACCGCCAGGGGGGCGAGGATGTGCATCAACGGTg > 1:704317/1‑99 (MQ=255) tCAGGTGCTCGATGCCAGTGCGTATCAACCGTCCTCCCACGCCCATCCCTTGGTATTCCGGTATGACCGCCAGGGGGGCGAGGATGTGCATCAACGGTGa > 2:872354/1‑100 (MQ=255) cAGGTGCTCGATGCCAGTGCGTATCAACCGTCCTCCCACGCCCATCCCTTGGTATTCCGGTATGACCGCCAGGGGGGCGAGGATGTGCATCAACGGTGaa > 2:1093088/1‑100 (MQ=255) aGGTGCTCGATGCCAGTGCGTATCAACCGTCCTCCCACGCCCATCCCTTGGTATTCCGGTATGACCGCCAGGGGGGCGAGGATGTGCATCAACGGTGAAt < 1:3487335/100‑1 (MQ=255) aGGTGCTCGATGCCAGTGCGTATCAACCGTCCTCCCACGCCCATCCCTTGGTATTCCGGTATGACCGCCAGGGGGGCGAGGATGTGCATCAACGGTGAAt > 1:3125366/1‑100 (MQ=255) aGGTGCTCGATGCCAGTGCGTATCAACCGTCCTCCCACGCCCATCCCTTGGTATTCCGGTATGACCGCCAGGGGGGCGAGGATGTGCATCAACGGTGAAt < 1:947318/100‑1 (MQ=255) aGGTGCTCGATGCCAGTGCGTAGCAACCGTCCTCCCACGCCCATCCCTTGTTATTCCGGTATGACCGCCAGGGGGGCGAGGATGTGCATCAACGGTGAAt < 2:772417/100‑1 (MQ=255) ggTGCTCGATGCCAGTGCGTATCAACCGTCCTCCCACGCCCATCCCTTGGTATTCCGGTATGACCGCCAGGGGGGCGAGGATGTGCATCAACGGTGAATc < 1:1251378/100‑1 (MQ=255) tGCTCGATGCCAGTGCGTATCAACCGTCCTCCCACGCCCATCCCTTGGTATTCCGGTATGACCGCCAGGGGGGCGAGGATGTGCATCAACGGTGAATCCa > 2:906931/1‑100 (MQ=255) tGCTCGATGCCAGTGCGTATCAACCGTCCTCCCACGCCCATCCCTTGGTATTCCGGTATGACCGCCAGGGGGGCGAGGATGTGCATCAACGGTGAATCCa < 1:1464294/100‑1 (MQ=255) gCTCGATGCCAGTGCGTATCAACCGTCCTCCCACGCCCATCCCTTGGTATTCCGGTATGACCGCCAGGGGGGCGAGGATGTGCATCAACGGTGAATCCa > 1:1535605/1‑99 (MQ=255) gCTCGATGCCAGTGCGTATCAACCGTCCTCCCACGCCCATCCCTTGGTATTCCGGTATGACCGCCAGGGGGGCGAGGATGTGCATCAACGGTGAATCCAt < 2:3439122/100‑1 (MQ=255) gCTCGATGCCAATGCGTATCAACCGTCCTCCCACGCCCATCCCTTGGTATTCCGGTATGACCGCCAGGGGGGCGAGGATGTGCATCAACGGTGAATCCAt > 1:1995032/1‑100 (MQ=255) cTCGATGCCAGTGCGTATCAACCGTCCTCCCACGCCCATCCCTTGGTATTCCGGTATGACCGCCAGGGGGGCGAGGATGTGCATCAACGGTGAATCCAtt > 2:1110775/1‑100 (MQ=255) cGATGCCAGTGCGTATCAACCGTCCTCCCACGCCCATCCCTTGGTATTCCGGTATGACCGCCAGGGGGGCGAGGATGTGCATCAACGGTGAATCCATTtc > 2:1033394/1‑100 (MQ=255) cGATGCCAGTGCGTATCAACCGTCCTCCCACGCCCATCCCTTGGTATTCCGGTATGACCGCCAGGGGGGCGAGGATGTGCATCAACGGTGAATCCATTtc > 2:3725182/1‑100 (MQ=255) tGCCAGTGCGTATCAACCGTCCTCCCACGCCCATCCCTTGGTATTCCGGTATGACCGCCAGGGGGGCGAGGATGTGCATCAACGGTGAATCCATTTCTcc > 2:541075/1‑100 (MQ=255) tGCCAGTGCGTATCAACCGTCCTCCCACGCCCATCCCTTGGTATTCCGGTATGACCGCCAGGGGGGCGAGGATGTGCATCAACGGTGAATCCATTTCTcc < 1:1918845/100‑1 (MQ=255) gCCAGTGCGTATCAACCGTCCTCCCACGCCCATCCCTTGGTATTCCGGTATGACCGCCAGGGGGGCGAGGATGTGCATCAACGGTGAATCCATTTCTCCt > 2:1714621/1‑100 (MQ=255) ccAGTGCGTATCAACCGTCCTCCCACGCCCATCCCTTGGTATTCCGGTATGACCGCCAGGGGGGCGACGATGTGCATCAACGGTGAATCCATTTCTCCt > 1:2372081/1‑99 (MQ=255) cAGTGCGTATCAACCGTCCTCCCACGCCCATCCCTTGGTATTCCGGTATGACCGCCAGGGGGGCGAGGATGTGCATCAACGGTGAATCCATTTCTCCttt < 1:3799115/100‑1 (MQ=255) aGTGCGTATCAACCGTCCTCCCACGCCCATCCCTTGGTATTCCGGTATGACCGCCAGGGGGGCGAGGATGTGCATCAACGGTGAATCCATTTCTCCTTTg < 1:264157/100‑1 (MQ=255) gTATCAACCGTCCTCCCACGCCCATCCCTTGGTATTCCGGTATGACCGCCAGGGGGGCGAGGATGTGCATCAACGGTGAATCCATTTCTCCTTTGAAGGt > 2:3303483/1‑100 (MQ=255) tATCAACCGTCCTCCCACGCCCATCCCTTGGTATTCCGGTATGACCGCCAGGGGGGCGAGGATGTGCATCAACGGTGAATCCATTTCTCCTTTGAAGGtt > 1:661257/1‑100 (MQ=255) aTCAACCGTCCTCCCACGCGCATCCCTTGGTATTACCGTCTAACCGCCCGGGGGGCAATGACGTACCTCCACGGTAACTCCATTTCTCCTTTTaaa > 1:3178703/1‑95 (MQ=255) tCAACCGTCCTCCCACGCCCATCCCTTGGTATTCCGGTATGACCGCCAGGGGGGCGAGGATGTGCATCAACGGTGAATCCATTTCTCCTTTGAAGGTTGc < 1:650838/100‑1 (MQ=255) cAACCGTCCTCCCACGCCCATCCCTTGGTATTCCGGTATGACCGCCAGGGGGGCGAGGATGTGCATCAACGGTGAATCCATTTCTCCTTTGAAGGTTGcc < 2:2410521/100‑1 (MQ=255) cAACCGTCCTCCCACGCCCATCCCTTGGTATTCCCGTATGACCGCCCGGGGGGCCAGCCTGTGCCTCAACGGTGAATCCCCTCATCCTTTGAAGGTTGcc > 1:912874/1‑100 (MQ=255) cGTCCTCCCACGCCCATCCCTTGGTATTCCGGTATGACCGCCAGGGGGGCGAGGATGTGCATCAACGGTGAATCCATTTCTCCTTTGAAGGTTGCCCggg > 2:1635859/1‑100 (MQ=255) tcctccCACGCCCATCCCTTGGTATTCCGGTATGACCGCCAGGGGGGCGAGGATGTGCATCAACGGTGAATCCATTTCTCCTTTGAAGGTTGCCCGGGta < 2:721535/100‑1 (MQ=255) tcctccCACGCCCATCCCTTGGTATTCCGGTATGACCGCCAGGGGGGCGAGGATGTGCATCAACGGTGAATCCATTTCTCCTTTGAAGGTTGCCCGGGta < 1:1269991/100‑1 (MQ=255) cctccCACGCCCATCCCTTGGTATTCCGGTATGACCGCCAGGGGGGCGAGGCTGTGCATCAACGGTGAATCCATTTCTCCTTTGAAGGTTGCCCGGGta > 2:1774198/1‑99 (MQ=255) cctccCACGCCCATCCCTTGGTATTCCGGTATGACCACCAGGGGGGCGAGGATGTGCATCAACGGTGAATCCATTTCTCCTTTGAAGGTTGCCCGGGt < 1:98185/98‑1 (MQ=255) tccCACGCCCATCCCTTGGTATTCCGGTATGACCGCCAGGGGGGCGAGGATGTGCATCAACGGTGAATCCATTTCTCCTTTGAAGGTTGCCCGGGtaaat > 1:3787694/1‑100 (MQ=255) ccACGCCCATCCCTTGGTATTCCGGTATGACCGCCAGGGGGGCGAGGATGTGCATCAACGGTGAATCCATTTCTCCTTTGAAGGTTGCCCGGGtaaataa > 1:1085209/1‑100 (MQ=255) cACGCCCATCCCTTGGTATTCCGGTATGACCGCCAGGGGGGCGAGGATGTGCATCAACGGTGAATCCATTTCTCCTTTGAAGGTTGCCCGGGtaaataa > 2:3575372/1‑99 (MQ=255) aCGCCCATCCCTTGGTATTCCGGTATGACCGCCAGGGGGGCGAGGATGTGCATCAACGGTGAATCCATTTCTCCTTTGAAGGTTGCCCGGGTaaataaaa > 1:1385295/1‑100 (MQ=255) cGCCCATCCCTTGGTATTCCGGTATGACCTCCAGGGGGGCGAGGATGTGCATCAACGGTGAATCCATTTCTCCTTTGAAGGTTGCCCGGGTaaataaaat < 1:2643796/100‑1 (MQ=255) cccATCCCTTGGTATTCCGGTATGACCGCCAGGGGGGCGAGGATGTGCATCAACGGTGAATCCATTTCTCCTTTGAAGGTTGCCCGGGTAAATAAAatat > 1:3735966/1‑100 (MQ=255) cATCCCTTGGTATTCCGGTATGACCGCCAGGGGGGCGAGGATGTGCATCAACGGTGAATCCATTTCTCCTTTGAAGGTTGCCCGGGTAAATAAAATATGc < 1:2438932/100‑1 (MQ=255) aTCCCTTGGTATTCCGGTATGACCGCCAGGGGGGCGAGGATGTGCATCAACGGTGAATCCATTTCTCCTTTGAAGGTTGCCCGGGTAAATAAAATATGcc < 1:3387521/100‑1 (MQ=255) ccTTGGTATTCCGGTATGACCGCCAGGGGGGCGAGGATGTGCATCAACGGTGAATCCATTTCTCCTTTGAAGGTTGCCCGGGTAAATAAAATATGCCCGa > 2:11301/1‑100 (MQ=255) ccTTGGTATTCCGGTATGACCGCCAGGGGGGCGAGGATGTGCATCAACGGTGAATCCATTTCTCCTTTGAAGGTTGCCCGGGTAAATAAAATATGCCCGa > 2:296383/1‑100 (MQ=255) ccTTGGTATTCCGGTATGACCGCCAGGGGGGCGAGGATGTGCATCAACGGTGAATCCATTTCTCCTTTGAAGGTTGCCCGGGTAAATAAAATATGCCCGa > 2:2523565/1‑100 (MQ=255) tGGTATTCCGGTATGACCGCCAGGGGGGCGAGGATGTGCATCAACGGTGAATCCATTTCTCCTTTGACGGTTGCCCGGGTAAATAAAATATGCCCGa > 1:3239167/1‑97 (MQ=255) ggTATTCCGGTATGACCGCCAGGGGGGCGAGGATGTGCATCAACGGTGAATCCATTTCTCCTTTGAAGGTTGCCCGGGTAAATAAAATATGCCCGACGGc < 1:1318152/100‑1 (MQ=255) ggTATTCCGGTATGACCGCCAGGGGGGCGAGGATGTGCATCAACGGTGAATCCATTTCTCCTTTGAAGGTTGCCCGGGTAAATAAAATATGCCCGACGGc > 2:1017886/1‑100 (MQ=255) ttCCGGTATGACCGCCAGGGGGGCGAGGATGTGCATCAACGGTGAATCCATTTCTCCTTTGAAGGTTGCCCGGGTAAATAAAATATGCCCGACGGCTTTg < 1:3277825/100‑1 (MQ=255) ccGGTATGACCGCCAGGGGGGCGAGGATGTGCATCAACGGTGAATCCATTTCTCCTTTGAAGGTTGCCCGGGTACATAAAATATGCCCGACGGCTTTGcc > 1:826575/1‑100 (MQ=255) ccGGTATGACCGCCAGGGGGGCGAGGATGTGCATCAACGGTGAATCCATTTCTCCTTTGAAGGTTGCCCGGGTAAATAAAATATGCCCGACGGCTTTGcc < 1:3570560/100‑1 (MQ=255) cGGTATGACCGCCAGGGGGGCGAGGATGTGCATCAACGGTGAATCCATTTCTCCTTTGAAGGTTGCCCGGGTAAATAAAATATGCCCGACGGCTTTGCCt < 2:1134243/100‑1 (MQ=255) cGGTATGACCGCCAGGGGGGCGAGGATGTGCATCAACGATGAATCCATTTCTCCTTTGAAGGTTGCCCGGGTAAATAAAATATGCCCGACGGCTTTGCCt > 1:2331057/1‑100 (MQ=255) ggTATGACCGCCAGGGGGGCGAGGATGTGCATCAACGGTGAATCCATTTCTCCTTTGAAGGTTGCCCGGGTAAATAAAATATGCCCGACGGCTTTGCCtt < 1:285913/100‑1 (MQ=255) ggTATGACCGCCAGGGGGGCGAGGATGTGCATCAACGGTGAATCCATTTCTCCTTTGAAGGTTGCCCGGGTAAATAAAATATGCCCGACGGCTTTGCCtt > 1:1545148/1‑100 (MQ=255) ggTATGACCGCCAGGGGGGCGAGGATGTGCATCAACGGTGAATCCATTTCTCCTTTGAAGGTTGCCCGGGTAAATAAAATATGCCCGACGGCTTTGCCtt < 2:2474669/100‑1 (MQ=255) gTATGACCGCCAGGGGGGCGAGGATGTGCATCAACGGTGAATCCATTTCTCCTTTGAAGGTTGCCCGGGTAAATAAAATATGCCCGACGGCTTTGCCTTc > 2:1872320/1‑100 (MQ=255) gTATGACCGCCAGGGGGGCGAGGATGTGCATCAACGGTGAATCCATTTCTCCTTTGAAGGTTGCCCGGGTAAATAAAATATGCCCGACGGCTTTGCCTTc < 1:765832/100‑1 (MQ=255) gTATGACCGCCAGGGGGGCGAGGATGTGCATCAACGGTGAATCCATTTCTCCTTTGAAGGTTGCCCGGGTAAATAAAATATGCCCGACGGCTTTGCCTTc < 1:356370/100‑1 (MQ=255) gTATGACCGCCAGGGGGGCGAGGATGTGCATCAACGGTGAATCCATTTCTCCTTTGAAGGTTGCCCGGGTAAATAAAATATGCCCGACGGCTTTGCCTTc < 2:1599708/100‑1 (MQ=255) gTATGACCGCCAGGGGGGCGAGGATGTGCATCAACGGTGAATCCATTTCTCCTTTGAAGGTTGCCCGGGTAAATAAAATATGCCCGACGGCTTTGCCTTc < 1:100958/100‑1 (MQ=255) tGACCGCCAGGGGGGCGAGGATGTGCATCAACGGTGAATCCATTTCTCCTTTGAAGGTTGCCCGGGTAAATAAAATATGCCCGACGGCTTTGCCTTCATa > 2:837482/1‑100 (MQ=255) tGACCGCCAGGGGGGCGAGGATGTGCATCAACGGTGAATCCATTTCTCCTTTGAAGGTTGCCCGGGTAAATAAAATATGCCCGACGGCTTTGCCTTCATa < 1:1237249/100‑1 (MQ=255) tGACCGCCAGGGGGGCGAGGATGTGCATCAACGGTGAATCCATTTCTCCTTTGAAGGTTGCCCGGGTAAATAAAATATGCCCGACGGCTTTGCCTTCATa > 1:1405028/1‑100 (MQ=255) tGACCGCCAGGGGGGCGAGGATGTGCATCAACGGTGAATCCATTTCTCCTTTGAAGGTTGCCCGGGTAAATAAAATATGCCCGACGGCTTTGCCTTCATa > 2:1231746/1‑100 (MQ=255) gACCGCCAGGGGGGCGAGGATGTGCATCAACGGTGAATCCATTTCTCCTTTGAAGGTTGCCCGGGTAAATAAAATATGCCCGACGGCTTTGCCTTCATAc < 2:2893310/100‑1 (MQ=255) aCCGCCAGGGGGGCGAGGATGTGCATCAACGGTGAATCCATTTCTCCTTTGAAGGTTGCCCGGGTAAATAAAATCTGCCCGACGGCTTTGCCTTCATAcc > 1:2593165/1‑100 (MQ=255) aCCGCCAGGGGGGCGAGGATGTGCATCAACGGTGAATCCATTTCTCCTTTGAAGGTTGCCCGGGTAAATAAAATATGCCCGACGGCTTTGCCTTCATAcc > 1:1991651/1‑100 (MQ=255) ccGCCAGGGGGGCGAGGATGTGCATCAACGGTGAATCCATTTCTCCTTTGAAGGTTGCCCGGGTAAATAAAATATTCCCGACGGCTTTGCCTTCATACCg > 1:509642/1‑100 (MQ=255) ccGCCAGGGGGGCGAGGATGTGCATCAACGGTGAATCCATTTCTCCTTTGAAGGTTGCCCGGGTAAATAAAATATGCCCGACGGCTTTGCCTTCATACCg > 1:2564678/1‑100 (MQ=255) cagCCAGGGGGGCGAGGATGTGCATCAACGGTGAATCCATTTCTCCTTTGAAGGTTGCCCGGGTAAATAAAATATGCCCGACGGCTTTGCCTTCATACCg > 2:3522007/3‑100 (MQ=255) cGCCAGGGGGGCGAGGATGTGCATCAACGGTGAATCCATTTCTCCTTTGAAGGTTGCCCGGGTAAATAAAATATGCCCGACGGCTTTGCCTTCATACCgg < 2:2255656/100‑1 (MQ=255) gCCAGGGGGGCGAGGATGTGCATCAACGGTGAATCCATTTCTCCTTTGAAGGTTGCCCGGGTAAATAAAATATGCCCGACGGCTTTGCCTTCATACCggg > 1:3617641/1‑100 (MQ=255) ccAGGGGGGCGAGGATGTGCATCAACGGTGAATCCATTTCTCCTTTGAAGGTTGCCCGGGTAAATAAAATATGCCCGACGGCTTTGCCTTCACACCGGGc < 2:1988105/100‑1 (MQ=255) cAGGGGGGCGAGGATGTGCATCAACGGTGAATCCATTTCTCCTTTGAAGGTTGCCCGGGTAAATAAAATATGCCCGACGGCTTTGCCTTCATACCGGGCt < 2:3252309/100‑1 (MQ=255) aGGGGGGCGAGGATGTGCATCAACGGTGAATCCATTTCTCCTTTGAAGGTTGCCCGGGTAAATAAAATATGCCCGACGGCTTTGCCTTCATACCGGGCt < 1:1171047/99‑1 (MQ=255) tggggGCGAGGATGTGCAGCAACGGTTAATCCATTTCTCCTTTGAAGGTTGCCCGGGTAAATAAAATATGCCCGACGGCTTTGCCTTCATACCGGGCTag < 1:1470314/99‑1 (MQ=255) ggggggCGAGGATGTGCATCAACGGTGAATCCATTTCTCCTTTGAAGGTTGCCCGGGTAAATAAAATATGCCCGACGGCTTTGCCTTCATACCGGGCTag > 2:1735519/1‑100 (MQ=255) aGCGAGGATGTGCATCAACGGTGAATCCATTTCTCCTTTGAAGGTTGCCCGGGTAAATAAAATATGCCCGACGGCTTTGCCTTCATACCGGGCTagcagc < 2:3279540/100‑1 (MQ=255) | CCGTCTGGCAGCCCATCAACCTCAGGTGCTCGATGCCAGTGCGTATCAACCGTCCTCCCACGCCCATCCCTTGGTATTCCGGTATGACCGCCAGGGGAGCGAGGATGTGCATCAACGGTGAATCCATTTCTCCTTTGAAGGTTGCCCGGGTAAATAAAATATGCCCGACGGCTTTGCCTTCATACCGGGCTAGCAGC > NC_000913/4533439‑4533635 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |