| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 308,054 | (C)7→6 | coding (1279/2526 nt) | ecpC ← | ECP production outer membrane protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 308,048 | 0 | C | . | 99.3% | 685.1 / ‑2.4 | 149 | coding (1285/2526 nt) | ecpC | ECP production outer membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/1); new base . (82/66); total (82/67) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.50e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.36e-01 | |||||||||||
Only 100 of 163 total aligned reads displayed.
ACAGCGAACTAAAGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGCCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACTCAATGAGCCGG > NC_000913/307949‑308143 | caGCGAACTAAAGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTCGATCGcc > 2:1749836/1‑100 (MQ=255) gCGAACTAAAGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGcccc < 2:4003862/100‑1 (MQ=255) gCGAACTAAAGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGcccc < 1:638676/100‑1 (MQ=255) gCGAACTAAAGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGcccc < 2:3158381/100‑1 (MQ=255) cGAACTAAAGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGccccc < 1:338730/100‑1 (MQ=255) aaCTAAAGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGcccccca > 2:1353036/1‑99 (MQ=255) cTAAAGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGccccccaag > 2:3876842/1‑97 (MQ=255) tAAAGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGccccccaagc > 1:3056118/1‑96 (MQ=255) aaaGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCg > 2:1358113/1‑100 (MQ=255) aaaGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCg > 2:2111573/1‑100 (MQ=255) aaaGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCg > 1:2927201/1‑100 (MQ=255) gCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCa < 1:2363018/100‑1 (MQ=255) gCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCa > 1:2701221/1‑100 (MQ=255) ccTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAg > 1:214924/1‑100 (MQ=255) ccTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAg > 2:3159106/1‑100 (MQ=255) cTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGc > 2:55015/1‑100 (MQ=255) tAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGAc < 2:1949785/100‑1 (MQ=255) agagTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACg < 1:1668158/100‑1 (MQ=255) gagTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACgg > 2:1848459/1‑100 (MQ=255) gagTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACgg < 1:3021656/100‑1 (MQ=255) gTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACggg > 2:1627510/1‑99 (MQ=255) gTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGt > 2:1750083/1‑100 (MQ=255) tGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGtt < 2:2270864/100‑1 (MQ=255) tGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGtt < 1:2200923/100‑1 (MQ=255) tGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGtt < 1:1713593/100‑1 (MQ=255) ggCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGttt > 1:1092761/1‑100 (MQ=255) ggCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGttt > 2:2996836/1‑100 (MQ=255) ggCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACAGGttt > 1:902329/1‑100 (MQ=255) cgcTGATGCTGCTGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTca < 2:152349/100‑1 (MQ=255) cgatctgctgcCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTcac < 1:248103/95‑1 (MQ=255) cTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTcacc < 1:1003194/100‑1 (MQ=255) tGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTcaccc > 1:315021/1‑100 (MQ=255) tGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTcaccc < 2:1614049/100‑1 (MQ=255) tgctgcCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTcacccacc > 2:3780854/1‑100 (MQ=255) gctgcCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTcacagatcg > 2:248098/1‑94 (MQ=255) gctgcCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCg > 2:43611/1‑100 (MQ=255) ctgcCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGc > 1:451322/1‑100 (MQ=255) tgcCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGcc > 1:1003812/1‑100 (MQ=255) tgcCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGcc > 1:2926765/1‑100 (MQ=255) tgcCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGcc > 1:3228381/1‑100 (MQ=255) tgcCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTCGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGcc > 2:2292922/1‑100 (MQ=255) ccGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCTAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAACCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTg < 2:2513080/100‑1 (MQ=255) cGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGa > 2:411650/1‑100 (MQ=255) cGATGCTGCTCCATGAACTGTCACTGGCAAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGa > 2:1077180/1‑100 (MQ=255) gATGTTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGAt < 1:2962628/100‑1 (MQ=255) gATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGAt > 2:3810492/1‑100 (MQ=255) tgctgcTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTa < 2:2749733/100‑1 (MQ=255) ctgctCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATc > 1:3409207/1‑100 (MQ=255) ctgctCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATc > 2:3591695/1‑100 (MQ=255) ctCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTa < 1:1113678/100‑1 (MQ=255) ccATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATc > 2:2683009/1‑100 (MQ=255) cATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATcc > 1:3194022/1‑100 (MQ=255) aTGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCa < 1:1379380/100‑1 (MQ=255) tGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCat < 2:1873875/100‑1 (MQ=255) gAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCata < 1:3496338/100‑1 (MQ=255) aGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCatat > 1:440296/1‑100 (MQ=255) gCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATc > 1:401057/1‑100 (MQ=255) aCTGGCCAGCAGATTTTGCAGGTTAACGTGGATCG‑CCCCCCAACCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCGTGATTATCGTATCCATATCCCGtt > 2:3128521/1‑99 (MQ=255) tGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGGTTTTCG‑CCCCCTAAGCGGCAGCGTCAGACGGGGTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTgct < 2:2065953/100‑2 (MQ=255) ggCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTgccg < 2:2136928/100‑1 (MQ=255) ggCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTgccg < 2:3038630/100‑1 (MQ=255) ggCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTgccg > 1:3396187/1‑100 (MQ=255) ggCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTgccg > 2:3533750/1‑100 (MQ=255) cAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGccc > 2:2702649/1‑100 (MQ=255) 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< 1:2111593/100‑1 (MQ=255) atTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTaa > 1:3983687/1‑100 (MQ=255) ttttGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAg < 2:1916805/100‑1 (MQ=255) tttGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGc > 2:1059314/1‑100 (MQ=255) tttGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGc < 2:2927169/100‑1 (MQ=255) tGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCAACCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGt > 2:775567/1‑100 (MQ=255) cAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTAc < 1:1574456/100‑1 (MQ=255) cAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTAc > 1:821271/1‑100 (MQ=255) aGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACt > 2:1220806/1‑100 (MQ=255) aGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACt < 1:851685/100‑1 (MQ=255) ggTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACTc > 1:2612699/1‑100 (MQ=255) ggTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACTc > 2:156416/1‑100 (MQ=255) ttAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACTCaa < 1:320518/100‑1 (MQ=255) tAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACTCAAt > 2:2944691/1‑100 (MQ=255) tAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACTCAAt < 2:145728/100‑1 (MQ=255) tAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACTCAAt < 1:3617958/100‑1 (MQ=255) aaCGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACTCAATg < 2:718960/100‑1 (MQ=255) aCGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACTCAATGa > 1:758699/1‑100 (MQ=255) aCGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCAAATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACTCAATGa > 2:2206405/1‑100 (MQ=255) cGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACTCAATGAg > 2:3812162/1‑100 (MQ=255) cGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACTCAATGAg > 2:1430597/1‑100 (MQ=255) gTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTCAGCGTACTCAATGAGc > 2:726100/1‑100 (MQ=255) gTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACTCAATGAGc > 1:40198/1‑100 (MQ=255) ttGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACTCAATGAGcc > 1:3920170/1‑100 (MQ=255) tGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACTCAATGAGcc < 2:586109/99‑1 (MQ=255) gATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTACGCGAACTCAATGAGCCg > 2:2476788/1‑99 (MQ=255) gATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACTCAATGAGCCgg > 2:65561/1‑100 (MQ=255) gATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACTCAATGAGCCgg > 2:2086235/1‑100 (MQ=255) gATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACTCAATGAGCCgg > 1:1222730/1‑100 (MQ=255) | ACAGCGAACTAAAGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGCCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACTCAATGAGCCGG > NC_000913/307949‑308143 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |