| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,652,855 | (G)6→7 | coding (362/846 nt) | sseA → | 3‑mercaptopyruvate sulfurtransferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,652,849 | 1 | . | G | 95.5% | 464.2 / 13.4 | 134 | coding (356/846 nt) | sseA | 3‑mercaptopyruvate sulfurtransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (4/2); new base G (63/65); total (67/67) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.80e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.75e-01 | |||||||||||
Only 100 of 153 total aligned reads displayed.
AGGATAAGCACCTGATTGTCTATGACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTCT‑G‑G‑GGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTGCCGGAAGGAGAGTTTAACGCCGCGTTTAAT > NC_000913/2652750‑2652943 | aGGATAAGCACCTGATTGTCTATGACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTCt < 1:1419824/100‑1 (MQ=255) gATAAGCACCTGATTGTCTATGACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTCT‑g‑g < 1:701549/100‑1 (MQ=255) tAAGCACCTGATTGTCTATGACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTCT‑g‑g‑gg < 1:1495669/100‑1 (MQ=255) aaGCACCTGATTGTCTATGACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTCT‑g‑g‑ggg < 2:3561416/100‑1 (MQ=255) aGCACCTGATTGTCTATGACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTCT‑g‑g‑gggg > 1:1242133/1‑100 (MQ=255) gCACCTGATTGTCTATGACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTCT‑g‑g‑ggggg < 1:1385646/100‑2 (MQ=255) gCACCTGATTGTCTATGACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTCT‑g‑g‑ggggg > 2:2999428/1‑99 (MQ=255) gCACCTGATTGTCTATGACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTCT‑g‑g‑gggg > 2:14353/1‑99 (MQ=255) cACCTGATTGTCTATGACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTCT‑g‑g‑gggggt > 1:1754286/1‑98 (MQ=255) aCCTGATTGTCTATGACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTCT‑g‑g‑ggggggg > 1:3849229/1‑97 (MQ=255) ccTGATTGTATATGACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTCT‑g‑g‑gggggtgg > 1:3715085/1‑96 (MQ=255) cTGATTGTCTATGACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTCT‑g‑g‑gggggtgga > 1:3117263/1‑95 (MQ=255) tGATTGTCTATGACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTCTGG‑G‑GGGGTGGAc > 2:636777/1‑100 (MQ=255) gATTGTCTATGACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCGTGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTCTGG‑G‑GGGGTGGACt < 1:2577579/100‑1 (MQ=255) gATTGTCTATGACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGAGGCTGCGTACCTTTGGTGTAGAGACAGTGTCGATTCT‑g‑g‑gggggtgg > 1:880950/1‑93 (MQ=255) aTTGTCTATGACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTCTGG‑G‑GGGGTGGACtt > 2:141699/1‑100 (MQ=255) tGTCTATGACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTCTGG‑G‑GGGGTGGACTTGc < 2:3238499/100‑1 (MQ=255) tGTCTATGACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTCTGG‑G‑GGGGTGGACTTGc < 2:3282589/100‑1 (MQ=255) gTCTATGACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTCTGG‑G‑GGGGTGGACTTGCa < 2:3117230/100‑1 (MQ=255) gTCTATGACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTCTGG‑G‑GGGGTGGACTTGCa < 1:2054257/100‑1 (MQ=255) tCTATGACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTCTGG‑G‑GGGGTGGACTTGCAg < 1:689961/100‑1 (MQ=255) cttATGACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTCTGG‑G‑GGGGTGGACTTGCAg < 1:2907752/98‑1 (MQ=255) cTATGACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTCTGG‑G‑GGGGTGGACTTGCAgg < 1:251889/100‑1 (MQ=255) tATGACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTCTGG‑G‑GGGGTGGACTTGCAgag > 2:2907720/1‑98 (MQ=255) tATGACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTCTGG‑G‑GGGGTGGACTTGCAGGc > 1:1624488/1‑100 (MQ=255) aTGACGAAGGTAATCTTTGCTCAGCCCCACTAGCGTGATGGATGCTGCGCACCTCCGGCGTTGAGGAAGGGTCGATTCA‑G‑GCGGGGGGGACTGGCatg > 2:2395316/1‑96 (MQ=255) tGACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTCTGG‑G‑GGGGTGGACTTGCAGGCTg > 1:2235432/1‑100 (MQ=255) tGACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTCTGG‑G‑GGGGTGGACTTGCAGGCTg < 2:4139846/100‑1 (MQ=255) gACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTCTGG‑G‑GGGGTGGACTTGCAGGCTgg < 1:3692399/100‑1 (MQ=255) gACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTCTGG‑G‑GGGGTGGACTTGCAGGCTgg > 1:2092998/1‑100 (MQ=255) aCGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTCTGG‑G‑GGGGTGGACTTGCAGGCTGGc > 2:1708897/1‑100 (MQ=255) aCGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTCTGG‑G‑GGGGTGGACTTGCAGGCTGGc < 1:157773/100‑1 (MQ=255) aCGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTCTGG‑G‑GGGGTGGACTTGCAGGCTGGc > 1:30154/1‑100 (MQ=255) cGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTCT‑G‑G‑GGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAg > 2:4087173/1‑100 (MQ=255) gAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTCTGG‑G‑GGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAg < 1:3388386/100‑1 (MQ=255) ggTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTCTGG‑G‑GGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAgcgc > 2:3271242/1‑100 (MQ=255) ggTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTCTGG‑G‑GGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAgcgc < 1:3106582/100‑1 (MQ=255) gTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTCTGG‑G‑GGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGcgcg > 1:3885060/1‑100 (MQ=255) tAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTCTGG‑G‑GGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCga < 1:2007424/100‑1 (MQ=255) aaTCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTCTGG‑G‑GGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCgat > 2:1514290/1‑100 (MQ=255) aTCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTCTGG‑G‑GGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCgatg < 1:3991942/100‑1 (MQ=255) aTCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTCTGG‑G‑GGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCgatg < 2:2164011/100‑1 (MQ=255) nttCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTCTGG‑G‑GGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATct > 2:155689/2‑100 (MQ=255) ctcAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTCTGG‑G‑GGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATctgct < 1:1734103/100‑1 (MQ=255) ctcAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTCTGG‑G‑GGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATctgct < 2:1309608/100‑1 (MQ=255) tcAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTCTGG‑G‑GGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATctgctg < 2:3914721/100‑1 (MQ=255) cAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTCTGG‑G‑GGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGt > 1:422919/1‑100 (MQ=255) cAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTCTGG‑G‑GGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGt < 1:366794/100‑1 (MQ=255) cAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTCTGG‑G‑GGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGt > 1:1672567/1‑100 (MQ=255) cAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTCTGG‑G‑GGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGt > 2:1847934/1‑100 (MQ=255) cAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTCTGG‑G‑GGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGt < 2:1680757/100‑1 (MQ=255) aGCGCCACGAGCATGGTTGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTCTGG‑G‑GGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCCGCTGtt < 2:2491896/100‑1 (MQ=255) aGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTCTGG‑G‑GGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGtt < 1:1387673/100‑1 (MQ=255) aGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTCTGG‑G‑GGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGtt > 1:2376427/1‑100 (MQ=255) gCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTCTGG‑G‑GGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTa < 2:669902/100‑1 (MQ=255) gCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTCTGG‑G‑GGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTa < 2:667562/100‑1 (MQ=255) gCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTCTGG‑G‑GGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTa > 2:528644/1‑100 (MQ=255) ccccACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTCTGG‑G‑GGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTag < 2:594650/100‑1 (MQ=255) cccACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTCGAGAAAGTGTCGATTCT‑GTG‑GGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAACGCGATGATCTGCTGTTgga > 2:3329943/1‑100 (MQ=255) cccACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTCTGG‑G‑GGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTaga > 1:2073821/1‑100 (MQ=255) ccACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTCTGG‑G‑GGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTagaa > 2:2522583/1‑100 (MQ=255) cACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTCTGG‑G‑GGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTagaag < 2:512597/100‑1 (MQ=255) aCGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTCTGG‑G‑GGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTagaaga > 2:2608545/1‑100 (MQ=255) aCGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTCTGG‑G‑GGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTagaaga < 2:2303406/100‑1 (MQ=255) cATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTCTGG‑G‑GGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTg < 2:1764134/100‑1 (MQ=255) ggggtaTGCTGCGCATGTTTGGTGTAGAGAAAGTGGCGATTCTGG‑G‑GGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAg < 2:3539091/95‑1 (MQ=255) gtggATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTCTGG‑G‑GGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGAAATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTg > 2:3962299/1‑96 (MQ=255) gtggATGCTGCGCACCTTTGGCGTAGAGAAAGTGTCGATTCTGG‑G‑GGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGt < 1:2467484/100‑1 (MQ=255) tggATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTCTGG‑G‑GGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCa > 1:2463813/1‑97 (MQ=255) ggATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTCT‑GTG‑GGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTag < 1:1456086/100‑1 (MQ=255) aTGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTCTGG‑G‑GGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTagag > 2:1371561/1‑100 (MQ=255) aTGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTCTGG‑G‑GGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTagag > 1:3372580/1‑100 (MQ=255) aTGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTCTGG‑G‑GGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTagag < 1:2889629/100‑1 (MQ=255) tgctgcGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTCTGG‑G‑GGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGc < 1:2033700/100‑1 (MQ=255) ctgcGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTCTGG‑G‑GGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTg > 1:567860/1‑100 (MQ=255) gcgcACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTCTGG‑G‑GGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAgctctactgca < 1:3694752/100‑11 (MQ=255) gcgcACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTCTGG‑G‑GGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTGcc < 1:3193045/100‑1 (MQ=255) cgcACCTTTGGTGTCGAGAAAGTGTCGATTCTGG‑G‑GGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTGCCg < 2:2850859/100‑1 (MQ=255) cACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTCTGG‑G‑GGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTGCCGGa < 1:63557/100‑1 (MQ=255) ccTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTCTGG‑G‑GGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTGCCGGAAg < 2:1613175/100‑1 (MQ=255) ccTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTCTGG‑G‑GGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTGCCGGAAg < 2:2930821/100‑1 (MQ=255) ccTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTCTGG‑G‑GGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTGCCGGAAg > 1:3158978/1‑100 (MQ=255) cTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTCTGG‑G‑GGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTGCCGGAAgg < 1:2653559/100‑1 (MQ=255) tgtAGAGAAAGTGTCGATTCTGG‑G‑GGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTGCCGGAAGGAGAGtt < 1:2608573/100‑1 (MQ=255) tgtAGAGAAAGTGTCGATTCTGG‑G‑GGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTGCCGGAAGGAGAGtt > 1:1622004/1‑100 (MQ=255) gtAGAGAAAGTGTCGATTCTGG‑G‑GGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTGCCGGAAGGAGAGttt > 1:1048564/1‑100 (MQ=255) tAGAGAAAGTGTCGATTCTGG‑G‑GGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTGCCGGAAGGAGAGTTTa < 1:1847948/100‑1 (MQ=255) gagaAAGTGTCGATTCTGG‑G‑GGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTGCCGGAAGGAGAGTTTAAc > 2:801513/1‑100 (MQ=255) agaAAGTGTCGATTCTGG‑G‑GGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTGCCGGAAGGAGAGTTTAAcg > 1:121997/1‑100 (MQ=255) gaAAGTGTCGATTCTGG‑G‑GGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTGCCGGAAGGAGAGTTTAAcgc > 2:3822080/1‑100 (MQ=255) gtgtCGATTCTGG‑G‑GGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTGCCGGAAGGAGAGTTTAACGCcgcg > 1:881699/1‑100 (MQ=255) tgtCGATTCTGG‑G‑GGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTGCCGGAAGGAGAGTTTAACGCCGCGt < 1:1607699/100‑1 (MQ=255) gtCGATTCTGG‑G‑GGGGTGGACTTGCAGGCTGGCTGCGCGATGATCTGCTGTTCGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTGCCGGAAGTAGAGTTTAACGCCGCGtt > 2:330623/1‑100 (MQ=255) gtCGATTCTGG‑G‑GGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTGCCGGAAGGAGAGTTTAACGCCGCGtt < 2:3090867/100‑1 (MQ=255) gtCGATTCTGG‑G‑GGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTGCCGGAAGGAGAGTTTAACGCCGCGt < 2:1624476/99‑1 (MQ=255) cGATTCTGG‑G‑GGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGCTGATCTGCTGTTCGAAGCCGCTGCAGGAGAGCTGCCGGCAGGAGAGTTTAACGCCGCGttt > 2:2911953/1‑99 (MQ=255) cGATTCTGG‑G‑GGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGGAGGTGCAGTAGAGCTGCCGGAAGGAGAGTTTAACGCCGCGTTTa > 1:1120797/1‑100 (MQ=255) cGATTCTGG‑G‑GGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTGCCGGAAGGAGAGTTTAACGCCGCGTTTa > 1:1520704/1‑100 (MQ=255) gATTCTGG‑G‑GGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTGCCGGAAGGAGAGTTTAACGCCGCGTTTaa < 2:3749217/100‑1 (MQ=255) aTTCTGG‑G‑GGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTGCCGGAAGGAGAGTTTAACGCCGCGTTTAAt > 1:4047503/1‑100 (MQ=255) | AGGATAAGCACCTGATTGTCTATGACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTCT‑G‑G‑GGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTGCCGGAAGGAGAGTTTAACGCCGCGTTTAAT > NC_000913/2652750‑2652943 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |