Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 4,215,178 | Δ1 bp | 100% | coding (899/930 nt) | metA → | homoserine O‑transsuccinylase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 4,215,178 | 0 | A | . | 97.0% | 707.0 / 9.0 | 162 | coding (899/930 nt) | metA | homoserine O‑transsuccinylase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/3); new base . (83/74); total (84/78) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.50e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.97e-01 |
Only 100 of 162 total aligned reads displayed.
TCCGCAAAATACACCGCGAGCGAGCTGGCGTAGTCACGGTAATTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGATCTACGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGTTAAGCGATTCAGCACCTTACCTCAGGCACCTTCGGGTGCCT > NC_000913/4215083‑4215271 | tCCGCAAAATACACCGCGAGCGAGCTGGCGTAGTCACGGTAATTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACG‑TCTAc > 2:204673/1‑100 (MQ=255) ccGCAAAATACACCGCGAGCGAGCTGGCGTAGTCACGGTAATTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACG‑TCTACg < 2:3902042/100‑1 (MQ=255) cGCAAAATACACCGCGAGCGAGCTGGCGTAGTCACGGTAATTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACG‑TCTACgg < 1:325604/100‑1 (MQ=255) gcgaaaTACACCGCGAGCGAGCTGGCGTAGTCACGGTAATTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACG‑TCTACGGc < 1:1030638/97‑1 (MQ=255) gCAAAATACACCGCGAGCGAGCTGGCGTAGTCACGGTAATTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACG‑TCTACGGc > 1:3057876/1‑100 (MQ=255) cAAAATACACCGCGAGCGAGCTGGCGTAGTCACGGTAATTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACG‑TCTACGGca < 1:11016/100‑1 (MQ=255) aaaTACACCGCTAGCGAGCTGGCGTAGGCACTGTAATTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACG‑TCTACGGcaca < 1:3273320/100‑1 (MQ=255) aaaTACACCGCGAGCGAGCTGGCGTAGTCACGGTAATTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACG‑TCTACGGcaca > 1:3096624/1‑100 (MQ=255) aaTACACCGCGAGCGAGCTGGCGTAGTCACGGTAATTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGATCTACGGcaca < 1:1427293/100‑1 (MQ=255) aTACACCGCGAGCGAGCTGGCGTAGTCACGGTAATTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACG‑TCTACGGCACATg > 1:3374347/1‑100 (MQ=255) aTACACCGCGAGCGAGCTGGCGTAGTCACGGTAATTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACG‑TCTACGGCACATg < 1:353024/100‑1 (MQ=255) acacCGCGAGCGAGCTGGCGTAGTCACGGTAATTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACG‑TCTACGGCACATGaa > 1:3417582/1‑100 (MQ=255) acacCGCGAGCGAGCTGGCGTAGTCACGGTAATTTACTGTTTAACAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACG‑TCTACAGCACATGaa > 2:2579006/1‑100 (MQ=255) cacCGCGAGCGAGCTGGCGTAGTCACGGTAATTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACG‑TCTACAGCACATTAAt > 2:2916580/1‑100 (MQ=255) ccGCGAGCGAGCTGGCGTAGTCACGGTAATTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACG‑TCTACGGCACATGAATcc > 1:1959853/1‑100 (MQ=255) ccGCGAGCGAGCTGGCGTAGTCACGGTAATTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACG‑TCTACGGCACATGAATcc > 1:2033613/1‑100 (MQ=255) gagcTGGCGTAGTCACGGTAATTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACG‑TCTACGGCACATGAATCCAACGCTgg > 1:451732/1‑100 (MQ=255) agcTGGCGTAGTCACGGTAATTTACTGTTTACAAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACG‑TCTCCGGCACATGAATCCAAAGCTGGa > 2:239724/1‑100 (MQ=255) gcTGGCGTAGTCACGGTAATTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACG‑TCTACGGCACATGAATCCAACGCTGGAt < 2:2011719/100‑1 (MQ=255) cTGGCGTAGTCACGGTAATTTACTGTTTACCAACTGGCTAAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACG‑TCTACGGCACATGAATCCAACGCTGGAtt > 1:3860159/1‑100 (MQ=255) ggCGTAGTCACGGTAATTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACG‑TCTACGGCACATGAATCCAACGCTGGATTaa > 1:2104165/1‑100 (MQ=255) ggCGTAGTCACGGTAATTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACACCATACG‑TCTACGGCACATGAATCCAACGCTGGATTaa > 1:36749/1‑100 (MQ=255) aGTCACGGTAATTTACTGTTTACCGACTGGCTTAACTATGAAGTCTACCAGATCACTCCATACG‑TCTACGGCACATGATTCCAACGCTGTATTAAtcttc < 2:3862041/100‑1 (MQ=255) aGTCACGGTAATTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACG‑TCTACGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAAtcttc < 2:2178832/100‑1 (MQ=255) tCACGGTAATTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACG‑TCTACGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCtg < 2:1805670/100‑1 (MQ=255) tCACGGTAATTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACG‑TCTACGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCtg < 1:3563366/100‑1 (MQ=255) tCACGGTAATTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACG‑TCTACGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCtg < 1:1619368/100‑1 (MQ=255) tCACGGTAATTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACG‑TCTACGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCtg < 1:2955510/100‑1 (MQ=255) tCACGGTAATTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACG‑TCTACGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCtg < 1:2059806/100‑1 (MQ=255) cACGGTAATTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACG‑TCTACGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCtgt > 2:1505751/1‑100 (MQ=255) aCGGTAATTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACG‑TCTACGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCtgtg < 1:114816/100‑1 (MQ=255) aCGGTAATTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACG‑TCTACGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCtgt < 2:526269/99‑1 (MQ=255) gTAATTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACG‑TCTACGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATa < 2:763650/100‑1 (MQ=255) tAATTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACG‑TCTACGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAg < 2:282262/100‑1 (MQ=255) aaTTTACTGTTTTCCAACTGGCTCAACTATTACTTCTACCAGATCACGCCATACG‑TCTACGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCGGTGAt < 2:483783/97‑1 (MQ=255) aaTTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACG‑TCTACGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGt > 1:2479565/1‑100 (MQ=255) aTTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACG‑TCTACGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTc < 2:1552280/100‑1 (MQ=255) aTTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACG‑TCTACGGCACATAAATACAACGCTGGATTAATATTCTGTGATAGTc > 1:1904298/1‑100 (MQ=255) aTTTACTGTTTACCAACTGGATCAACTATTACGTCTACCAGAAAAAGCCATACG‑TCTACGGCACATGAATCCAAAGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTc > 2:1148586/1‑100 (MQ=255) tttACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGACTACCAGATCACGCCATACG‑TCTACGGCACATGAATACAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGt > 2:1279813/1‑98 (MQ=255) tttACTGTTTACCAACTGGCTCAAATATTACGTCTACCAGATCACGCAATACG‑TCTACGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCg > 2:1028960/1‑100 (MQ=255) tACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACG‑TCTACGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGAt < 1:3010645/100‑1 (MQ=255) tACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACG‑TCTACGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGAt < 2:1649404/100‑1 (MQ=255) cTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACG‑TCTACGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCg > 2:1446784/1‑100 (MQ=255) cTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACG‑TCTACGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCg > 1:2850621/1‑100 (MQ=255) cTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACG‑TCTACGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAATAGATCg > 1:1338753/1‑100 (MQ=255) tGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACG‑TCTACGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGt < 2:356356/100‑1 (MQ=255) gTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACG‑TCTACGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGtt < 1:1505766/100‑1 (MQ=255) tACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACG‑TCTACGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGTTatg < 1:2648477/100‑3 (MQ=255) aCCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACG‑TCTACGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGTTaa > 1:1265224/1‑98 (MQ=255) aCCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACG‑TCTACGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGTTAAGc < 2:1574358/100‑1 (MQ=255) aCCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACG‑TCTACGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGTTAAGc < 2:3361703/100‑1 (MQ=255) ccAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACG‑TCTACGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGTTAAGCg > 1:1753865/1‑100 (MQ=255) ccAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACG‑TCTACGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGTTAAGCg > 1:2450281/1‑100 (MQ=255) ccAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACG‑TCTACGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGTTAAGCg > 1:1282706/1‑100 (MQ=255) aaCTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACG‑TCTACGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGTTAAGCGAt > 1:2391985/1‑100 (MQ=255) cTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACG‑TCTACGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGTTAAGCGATTc < 1:758588/100‑1 (MQ=255) cTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACG‑TCTACGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGTTAAGCGATTc < 1:3766938/100‑1 (MQ=255) ggCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACG‑TCTACGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGTTAAGCGATTCAg > 1:1896822/1‑100 (MQ=255) ggCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACG‑TCTACGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGTTAAGCGATTCAg > 1:2810451/1‑100 (MQ=255) ggCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACG‑TCTACGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGTTAAGCGATTCAg > 2:591089/1‑100 (MQ=255) ggCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACG‑TCTACGACACATGAATCCAACGCTGTATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGTTAAGCGATTc < 2:1888960/98‑1 (MQ=255) ggCTCAACTATTACGTCTAACAGATCACGCCATACG‑TCTACGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGTTAAGCGATTCAg > 2:1404987/1‑100 (MQ=255) gCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACG‑TCTACGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGTTAAGCGATTCAGc < 2:2713095/100‑1 (MQ=255) gCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACG‑TCTACGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGTTAAGCGATTCAGc < 2:2439149/100‑1 (MQ=255) cTCAACTATTACGTCTACTATATCACGCCATACG‑TCTACGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGTTAAGCGATTCAGCa < 1:1937629/100‑1 (MQ=255) cTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACG‑TCTACGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGTTAAGCGATTCAGCa > 1:1171590/1‑100 (MQ=255) cTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACG‑TCTACGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGTTAAGCGATTCAGCa > 1:683999/1‑100 (MQ=255) cTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACG‑TCTACGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGTTAAGCGATTCAGCa > 1:847542/1‑100 (MQ=255) cTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACG‑TCTACGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGTTAAGCGATTCAGCa > 2:311998/1‑100 (MQ=255) cTCAACTATTACGTCTACCAGATAACGCCATACGA‑CTCCGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTATGTAATAGTCGATAGTTAAACGATTCAGc > 2:876456/1‑99 (MQ=255) aacgagtACGACGACCAGATCAGGCGAGA‑GGTGTACGGGACATGAATGCAACGCGGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGTTAAGCGATTCAGCAcc < 2:3004459/93‑1 (MQ=255) aaCTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACG‑TCTACGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGTTAAGCGATTCAGCACCt > 2:2187978/1‑100 (MQ=255) aTTACGTCTACCAGATCACGCCATACG‑TCTACGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGTTAAGCGATTCAGCACCTTAc > 1:1357984/1‑99 (MQ=255) tACGTCTACCAGATCACGCTATACG‑TCTACGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGTTAAGCGATTCAGCACCTTACCTc < 1:3581507/100‑1 (MQ=255) tACGTCTACCAGATCACGCCATACG‑TCTACGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGTTAAGCGATTCAGCACCTTACCTc < 2:1053072/100‑1 (MQ=255) aCGTCTACCAGATCACGCCATACG‑TCTACGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGTTAAGCGATTCAGCACCTTACCTCa > 2:786716/1‑100 (MQ=255) tCTACCAGATCACGCCATACG‑TCTACGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGTTAAGCGATTCAGCACCTTACCTCAGGc < 2:543090/100‑1 (MQ=255) cTACCAGATCACGCCATACG‑TCTACGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGTTAAGCGATTCAGCACCTTACCTCAGGCa > 1:2497927/1‑100 (MQ=255) cTACCAGATCACGCCATACG‑TCTACGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGTTAAGCGATTCAGCACCTTACCTCAGGCa > 2:527499/1‑100 (MQ=255) tACCAGATCACGCCATACG‑TCTACGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGTTAAGCGATTCAGCACCTTACCTCAGGCAc > 1:3898852/1‑100 (MQ=255) tACCAGATCACGCCATACG‑TCTACGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGTTAAGCGATTCAGCACCTTACCTCAGGCAc > 1:392755/1‑100 (MQ=255) tACCAGATCACGCCATACG‑TCTACGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGTTAAGCGATTCAGCACCTTACCTCAGGCAc > 2:2356947/1‑100 (MQ=255) ccAGATCACGCCATACG‑TCTACGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGTTAAGCGATTCAGCACCTTACCTCAGGCACCt > 2:3548894/1‑100 (MQ=255) aGATCACGCCATACG‑TCTACGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGTTAAGCGATTCAGCACCTTACCTCAGGCACCTTc > 2:222510/1‑100 (MQ=255) aGATCACGCCATACG‑TCTACGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGTTAAGCGATTCAGCACCTTACCTCAGGCACCTTc < 2:3709349/100‑1 (MQ=255) aTCACGCCATACG‑TCTACGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGTTAAGCGATTCAGCACCTTACCTCAGGCACCTTCgg > 1:1572637/1‑100 (MQ=255) tCACGCCATACG‑TCTACGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGTTAAGCGATTCAGCACCTTACCTCAGGCACCTTCggg < 2:1211136/100‑1 (MQ=255) cACGCCATACG‑TCTACGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGTTAAGCGATTCAGCACCTTACCTCAGGCACCTTCGGGt < 2:392740/100‑1 (MQ=255) cACGCCATACG‑TCTACGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGTTAAGCGATTCAGCACCTTACCTCAGGCACCTTCGGGt > 1:3289803/1‑100 (MQ=255) cACGCCATACG‑TCTACGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGTTAAGCGATTCAGCACCTTACCTCAGGCACCTTCGGGt > 2:3061055/1‑100 (MQ=255) aCGCCATACG‑TCTACGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGTTAAGCGATTCAGCACCTTACCTCAGGCACCTTCGGGTg < 2:385940/100‑1 (MQ=255) cGCCATACG‑TCTACGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGCTACTCGATCGTTCAGCGATTCACCACCTTACTTCACGCACCTTCgg > 2:3805378/1‑96 (MQ=255) cGCCATACG‑TCTACGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGTTAAGCGTTTCATCTCCTTACCTCAGGCACCTTCGGGTg < 2:3414045/99‑1 (MQ=255) cGCCATACG‑TCTACGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGTTAAGCGATTCAGCACCTTACCTCAGGCACCTTCGGGTg < 1:2892380/99‑1 (MQ=255) cGCCATACG‑TCTACGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGTTAAGCGATTCAGCACCTTACCTCAGGCACCTTCGGGTGc > 2:3248313/1‑100 (MQ=255) cGCCATACG‑TCTACGGCACATAAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGCTAAGCGATTCCGAACCTTAACTCAGGCATCTTCggg > 2:3622649/1‑97 (MQ=255) gCCATACG‑TCTACGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGTTAAGCGATTCAGCACCTTACCTCAGGCACCTTCGGGTGcc < 1:1953712/100‑1 (MQ=255) gCCATACG‑TCTACGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGTTAAGCGATTCAGCACCTTACCTCAGGCACCTTCGGGTGcc < 2:660700/100‑1 (MQ=255) ccATACG‑TCTACGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGTTAAGCGATTCAGCACCTTACCTCAGGCACCTTCGGGTGCCt < 2:3912126/100‑1 (MQ=255) | TCCGCAAAATACACCGCGAGCGAGCTGGCGTAGTCACGGTAATTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGATCTACGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGTTAAGCGATTCAGCACCTTACCTCAGGCACCTTCGGGTGCCT > NC_000913/4215083‑4215271 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |