| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,767,507:1 | (C)7→8 | 100% | intergenic (+152/‑203) | rnlB → / → yfjP | CP4‑57 prophage; uncharacterized protein/CP4‑57 prophage; 50S ribosome‑binding GTPase family protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,767,500 | 1 | . | C | 83.7% | 348.6 / 63.7 | 123 | intergenic (+145/‑210) | rnlB/yfjP | CP4‑57 prophage; uncharacterized protein/CP4‑57 prophage; 50S ribosome‑binding GTPase family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (5/15); new base C (54/49); total (59/64) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.89e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 133 total aligned reads displayed.
TGATATTAACTTGTCCAATATGATCAAATAGCATTAACCCCCCCTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑T‑‑C‑C‑C‑CC‑CCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTAAATGGTGCTGTGAGTTCAGAAAGATTCTG > NC_000913/2767402‑2767595 | tGATATTAACTTGTCCAATATGATCAAATAGCATTAACCCCCCCTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑T‑‑c < 1:2937303/100‑1 (MQ=255) tatTAACTTGTCCAATATGATCAAATAGCATTAACCCCCCCTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCTACGACTAAATT‑G‑‑c‑c‑c‑c < 2:591115/100‑1 (MQ=255) tatTAACTTGTCCAATATGATCAAATAGCATTAACCCCCCCTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑T‑‑c‑c‑c‑c < 1:2010068/100‑1 (MQ=255) atTAACTTGTCCAATATGATCAAATAGCATTAACCCCCCCTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑T‑‑c‑c‑c‑cc < 2:1442412/100‑1 (MQ=255) ttAACTTGTCCAATATGATCAAATAGCATTAAACAACCCTCCCAACCTCCTTCATAGAAAACACATTTTACCCTGTGCACCCCCGACTAAAGT‑T‑‑c‑c‑a‑cc‑c > 2:3497505/1‑100 (MQ=255) aaCTTGTCCAATATGATCAAATAGCATTAACCCCCCCTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑T‑‑c‑c‑c‑cc‑ccc < 1:1191686/100‑2 (MQ=255) aaCTTGTCCAATATGATCAAATAGCATTAAAACCCCCCCACAAAATACTACATAAGGAACAAGTTATCCCCTGTACACACACAACCCAATC‑T‑‑c‑c‑c‑ccaca > 2:3112266/1‑97 (MQ=255) ttGTCCAATATGATCAAATAGCATTAACCCCCCCTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑T‑‑C‑C‑C‑CC‑CCcttt < 2:279195/100‑2 (MQ=255) ttGTCCAATATGATCAAATAGCATTAACCCCCCCTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAAGT‑T‑‑C‑C‑C‑CC‑CCctt < 2:1180581/99‑1 (MQ=255) tGTCCAATATGATCAAATAGCATTATCCCCCCCTCACAACGTCCTTCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑T‑‑C‑C‑C‑CC‑CCcttta < 1:1164382/100‑3 (MQ=255) tGTCCAATATGATCAAATAGCATTAACCCCCCCTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑T‑‑C‑C‑C‑CC‑CCcttta < 1:3818494/100‑3 (MQ=255) ccAATATGATCAAATAGCATTAACCCCCCCTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑C‑C‑C‑CC‑CCTTTAAAc < 1:2147919/100‑1 (MQ=255) cAATATGATCAAATAGCATTAACCCAAACTCACAACGTACTGCATAGGGAACACGTTTTCCCTTGTCCACAAACAACTAAATA‑T‑‑C‑C‑CACC‑CCTTTaga > 2:182500/1‑96 (MQ=255) aaTATGATCAAATAGCATTAACCCCCCATAAAAACATCCTTCAAAAGGAACACATTTTCCCCTGTGCACCCACCACTAAATT‑T‑‑C‑CTC‑CC‑CCTATAAAc > 2:194339/1‑98 (MQ=255) atatGATCAAATATCATTAACCCCCCCTCACAACGTCCTTCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑C‑C‑C‑CC‑CCTTTAAACTtc < 1:1347598/100‑1 (MQ=255) atatGATCAAATAGCATTAACCCCCCCTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑C‑C‑C‑CC‑CCTTTAAACTtc < 1:743122/100‑1 (MQ=255) atGATCAAATAGCATTAACCCCCCCTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑C‑C‑C‑CC‑CCTTTAAACTtctc < 1:1389322/100‑1 (MQ=255) tcaTCAAATAGCATTAGCGCCCCCTCAGAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTACGTT‑T‑‑C‑C‑C‑CCTCCTTTAAACTTCTCa < 2:895389/98‑1 (MQ=255) tGATCAAATAGCATTAACACCCCCTAACACAGTACTGCATAGGGAACAATTATACCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑C‑C‑C‑CC‑CCTTTATACTcctga > 2:1614346/1‑98 (MQ=255) gATCAAATAGCATTAACCCCCCCTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑C‑C‑C‑CC‑CCTTTAAACTTCTCaa < 1:350681/100‑1 (MQ=255) aTCAAATAGCATTAACCCCCCCTCACAACGTCCTGCATAGCGAACACGTTTTACCCTGTGCACCCACAACTAAATT‑TC‑C‑C‑C‑CC‑CCTTTCAACTTCTCaa > 2:876383/1‑99 (MQ=255) tCAAATAGCATTAGCTCCCCCTTACATTTTTTTTTTTAGTGAATACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑C‑C‑C‑CC‑CCTTTAAACTTCTCaat < 1:1745116/99‑1 (MQ=255) atatCATTAACCCCCCCTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑C‑C‑C‑CC‑CCTTTAAACTTCTCAATAATg < 2:2510927/99‑1 (MQ=255) tAGCATTAACCCCCCCTCACAACGTCCTGCATAGTGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑C‑C‑C‑CC‑CCTTTAAACTTCTCAATAATGTc < 1:1173137/100‑1 (MQ=255) tAGCAATATCCCCCCCTCACCACGTCGTGAATAGGGAACACGTTTTCCCATTTGCACCCACGACTTAATT‑T‑‑CTC‑C‑CC‑ACTTTAAACTTCAAaataa < 2:1472128/96‑1 (MQ=255) gCATTAACCCCCCCTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑C‑C‑C‑CC‑CCTTTAAACTTCTCAATAATGTCAc < 1:2873260/100‑1 (MQ=255) cATTAACCCCCCCTCAAAACGCCCTGCATAGTGAACACATTTTTCACTATGCACCCACGCCTAAATT‑TC‑C‑C‑C‑CC‑CCTTTAAACTACTCtataat > 2:1093319/1‑94 (MQ=255) cATTAACACCCCCTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑C‑C‑C‑CC‑CCTTTAAACTTCTCAATAATGTCAc < 2:224105/99‑1 (MQ=255) aTTAACCCCCACTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTGTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑C‑C‑C‑CC‑CCTTTAAACTTCTCAATAATTTCACCa > 2:2024092/1‑100 (MQ=255) cccccTCACAACGTCCTGCATAGCGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑C‑C‑C‑CC‑CCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCt < 2:3701773/100‑1 (MQ=255) ccccTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑C‑C‑C‑CC‑CCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTg < 1:3008930/100‑1 (MQ=255) ccccTCACAACGTCCTGCATAGGCAACACGTTTTCCCCTATGACCACACGACTAAATT‑T‑‑C‑C‑CACC‑CCTTTAAACTTATACACATTGTCACAAATTTTCt > 2:3464449/1‑99 (MQ=255) atcTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑TCCC‑C‑C‑CC‑CCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTg < 2:2307459/98‑1 (MQ=255) cacaACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑TCCC‑C‑C‑CC‑CCTTTAAACTTCTCAATAATATCACCAATTTTCTgagat > 1:2307481/1‑96 (MQ=255) acaACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑C‑C‑C‑CC‑CCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATc > 1:2356235/1‑100 (MQ=255) acaACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑C‑C‑C‑CC‑CCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATc < 1:1279120/100‑1 (MQ=255) acaACGTCATGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACGAAATT‑T‑‑CAC‑C‑CC‑CCCTTAAACTTCTCAATAATGTCACCACTTTTCTGGAAAt > 2:1247616/1‑99 (MQ=255) caACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑C‑C‑C‑CC‑CCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATcc > 2:3174395/1‑100 (MQ=255) caACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑C‑C‑C‑CC‑CCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATcc < 1:1214180/100‑1 (MQ=255) acttCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑C‑C‑C‑CC‑CCTGTGAACTTCTCAATAATGTCATCGATTTTCTGGAGATCCTa < 2:148490/97‑1 (MQ=255) aCGTCCTGCATATGTAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑C‑C‑C‑CC‑CCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTa < 2:1685803/100‑1 (MQ=255) aCGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑C‑C‑C‑CC‑CCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTa > 1:3170272/1‑100 (MQ=255) cGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑C‑C‑C‑CC‑CCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTat < 2:2631657/100‑1 (MQ=255) gggtgcacaggggAAAACGTGTT‑CCCTATGCACCCACGACTAAATT‑TC‑C‑C‑C‑CC‑CCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTatga > 1:1178995/11‑100 (MQ=21) ccTGCATAGTGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑C‑C‑C‑CC‑CCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTat < 2:2220210/97‑1 (MQ=255) ccTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑C‑C‑C‑CC‑CCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTatgat > 2:3104611/1‑100 (MQ=255) ccTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑C‑C‑C‑CC‑CCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTatgat > 2:2864930/1‑100 (MQ=255) cTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑C‑C‑C‑CC‑CCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTatgatg < 1:3164764/100‑1 (MQ=255) cTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑C‑C‑C‑CC‑CCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTatgatg < 1:2120129/100‑1 (MQ=255) cTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑C‑C‑C‑CC‑CCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTatgatg > 2:104441/1‑100 (MQ=255) tGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑C‑C‑C‑CC‑CCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGc > 1:1978525/1‑100 (MQ=255) cATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑C‑C‑C‑CC‑CCTTTAAAATTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCt > 1:339290/1‑100 (MQ=255) tAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑C‑C‑C‑CC‑CCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCttt > 2:1182584/1‑100 (MQ=255) tAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑C‑C‑C‑CC‑CCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCtt > 1:3301569/1‑99 (MQ=255) gggAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑C‑C‑C‑CC‑CCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTcc > 2:2401064/1‑100 (MQ=255) gggAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑C‑C‑C‑CC‑CCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTcc > 2:2112087/1‑100 (MQ=255) gggAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑C‑C‑C‑CC‑CCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTAAGATGCCTTTcc > 1:828028/1‑100 (MQ=255) ggAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑C‑C‑C‑CC‑CCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTccc < 1:928262/100‑1 (MQ=255) aaaCACGTTTTCCCCTATTCCCCCACCTCTAATTT‑T‑‑C‑C‑C‑CC‑CTTTTAAACTTTTCAATAATTTCACCAATTTTCTGTAAATCCTATTATGCCTTTCCCgg < 2:2928711/99‑1 (MQ=255) aaCACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑C‑C‑C‑CC‑CCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCgg < 1:3514326/100‑1 (MQ=255) aaCACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑T‑‑C‑C‑C‑CC‑CCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGt < 2:716715/100‑1 (MQ=255) cacGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑C‑C‑C‑CC‑CCTTTAAACTTCTCAATATTGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTa < 2:3472953/100‑1 (MQ=255) cacGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑C‑C‑C‑CC‑CCTTTAAACTTCTCAATAATTTCACCAATTTTCAGGAAAACCTATAATGCCTTTCCCGGTa > 1:3558044/1‑100 (MQ=255) cGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑C‑C‑C‑CC‑CCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTaaa > 1:51856/1‑100 (MQ=255) cGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑C‑C‑C‑CC‑CCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTaaa > 2:3745392/1‑100 (MQ=255) ttttCCCCTGTGCACCCACGACTAAATTCC‑‑C‑C‑C‑CC‑CCTTTAAACTTCTCAATAATGTCAACAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTAAATg < 2:2686486/100‑1 (MQ=255) tttCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑C‑C‑C‑CC‑CCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATCATGCCTTTCCCGGTAAATgg < 2:2392263/100‑1 (MQ=255) tttCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑C‑C‑C‑CC‑CCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTCCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGAAAAAt > 1:1636857/1‑98 (MQ=255) cttccgatctcccACGACTAAATT‑TC‑C‑C‑C‑CC‑CCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTAAATGGTGc < 2:197110/90‑1 (MQ=255) ccccTGTTCACCCTCGACTAAATT‑TC‑C‑C‑C‑CC‑CCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTAAATGGTGc < 1:1707954/100‑1 (MQ=255) ccccTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑C‑C‑C‑CC‑CCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTCTCGGTAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTAAATGGTGc < 2:2417899/100‑1 (MQ=255) ccTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑C‑C‑C‑CC‑CCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTAAATGGTGCtg < 1:235217/100‑1 (MQ=255) cTGTACACCCCCGACTAAATT‑T‑‑C‑C‑C‑CC‑CCTTTAAACTTCTCAAGAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCTGTAAAGGGTGCtgtg < 2:523535/100‑1 (MQ=255) tgtgCACCCACGACTAAATT‑TC‑C‑C‑C‑CC‑CCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTAAATGGTGCtgtg < 1:104444/100‑1 (MQ=255) tgtgCACCCACGACTAAATT‑TC‑C‑C‑C‑CC‑CCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTAAATGGTGCtgtg < 1:1182597/100‑1 (MQ=255) gtgCACCCACGACTAAATT‑TC‑C‑C‑C‑CC‑CCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTAAATGGTGCTGTGa < 2:3394537/100‑1 (MQ=255) tgCACCCACGACTAAATT‑TC‑C‑C‑C‑CC‑CCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTAAATGGTGCTGTGAg < 1:3258594/100‑1 (MQ=255) tgCACCCACGACTAAATT‑TC‑C‑C‑C‑CC‑CCTCTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTATGGAAATCCTATAATGCCTTTACCGGTAAAAGGTGATGTGa > 1:1737345/1‑99 (MQ=255) ncgcccACGACTAAATT‑TC‑C‑C‑C‑CC‑CCTTTAAACTTCCTCACAATGTCACCAATATTCTGGAAATCTTACAATGACTTAACCGGTAAAAAGTGCt > 1:1283048/4‑94 (MQ=255) gCACCCACGACTAAATT‑TC‑C‑C‑C‑CC‑CCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTAAATGGTGCTGTGAg > 1:222037/1‑99 (MQ=255) cccACGACTAAATT‑TC‑C‑C‑C‑CC‑CCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATTCCTTTCCCGGTAAATGGTGCTGTGAGTTCa > 2:3117764/1‑100 (MQ=255) cccACGACTAAATT‑TC‑C‑C‑C‑CC‑CCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTAAATGGTGCTGTGAGTTCa > 1:2818087/1‑100 (MQ=255) cccACGACTAAATT‑TC‑C‑C‑C‑CC‑CCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAAACCTATGATACCTTTCCCGGTAAATGGTGcagatcggaa > 1:197115/1‑90 (MQ=255) cACGACTAAATT‑TC‑C‑C‑C‑CC‑CCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTAAATGGTGCTGTGAGTTCAGa > 2:3693514/1‑100 (MQ=255) cACGACTAAATT‑TC‑C‑C‑C‑CC‑CCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTAAATGGTGCTGTGAGTTCAGa > 2:815436/1‑100 (MQ=255) cGACTAAATT‑TC‑C‑C‑C‑CC‑CCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTAAATGGTGCTGTGAGTTCAGaaa < 1:32014/100‑1 (MQ=255) gACTAAATT‑TC‑C‑C‑C‑CC‑CCTTTATACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCGTTCCCGGTAAATGGTGCTGTGAGTTCAGAAAg < 1:1049125/100‑1 (MQ=255) aCTAAATT‑TC‑C‑C‑C‑CC‑CCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTAAATGGTGCTTTGAGTTCAGAAAGa > 1:90187/1‑100 (MQ=255) aCTAAATT‑TC‑C‑C‑C‑CC‑CCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTAAATGGTGCTGTGAGTTCAGAAAGa > 2:2002849/1‑100 (MQ=255) aCTAAATT‑TC‑C‑C‑C‑CC‑CCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTAAATGGTGCTGTGAGTTCAGAAAGa > 1:1076943/1‑100 (MQ=255) aCTAAATT‑TC‑C‑C‑C‑CC‑CCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGATAAATGGTGCTGTGAGTTCAGAAAGa > 1:2517908/1‑100 (MQ=255) cTAAATT‑TC‑C‑C‑C‑CC‑CCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATACTATGATGCCTTTCCCGGTAAATGGTGCTGTGAGTTCAGAAAGAt > 1:1192271/1‑100 (MQ=255) cTAAATT‑TC‑C‑C‑C‑CC‑CCTTTAAACTTATCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTAAATGGTGCTGTAAGTTCAGAAAGAt > 2:2193907/1‑100 (MQ=255) tAAATT‑TC‑C‑C‑C‑CC‑CCTTTAAACTTCTCAATAATGTCCCCAATTTTCTGGAAATCCTATAATGCCTTTCCCGGTAAATGGTGATGTGAGTTCAGAAAGAtt > 1:152221/1‑100 (MQ=255) aaaTT‑TC‑C‑C‑C‑CC‑CCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTAAATGGTGCTGTGAGTTCAGAAAGAtt > 1:696621/1‑99 (MQ=255) aaaTT‑TC‑C‑C‑C‑CC‑CCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTAAATGGTGCTGTGAGTTCAGAAAGATTc > 1:2676348/1‑100 (MQ=255) aaaTT‑TC‑C‑C‑C‑CC‑CCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCATTTCACGGTAAATGGTGCTGTTAGTTAAGAAAGATTc > 2:1061370/1‑100 (MQ=255) aaTT‑TC‑C‑C‑C‑CC‑CCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATTCCTTTCCCGGTAAATGGTGCTATGAGTTAAGAAAGAt > 1:3573092/1‑97 (MQ=255) aaTT‑TC‑C‑C‑C‑CC‑CCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTAAATGGTGCTGTGAGTTCAGAAAGATTCt > 1:2777114/1‑100 (MQ=255) aTT‑T‑‑C‑C‑C‑CCGTCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATTATGCCTTTCCCGTTAAATGGTTCTGTGAGTTCAGAAAGATTCTg < 2:3309049/100‑1 (MQ=255) | TGATATTAACTTGTCCAATATGATCAAATAGCATTAACCCCCCCTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑T‑‑C‑C‑C‑CC‑CCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTAAATGGTGCTGTGAGTTCAGAAAGATTCTG > NC_000913/2767402‑2767595 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |